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Genotipado de SNPs
El ADN se extrajo de las células de la sangre entera
utilizando el mini kit de ADN de Qiagen Blood (Qiagen
China, Shanghai, China). Las sondas TaqMan se obtuvieron
de Applied Biosystems (Beijing, China). Los ID de ensayo
para rs1801198, rs1801394, rs1805087 y rs1801133 fueron
C__325467_10, C__3068176_10, C__12005959_10 y
C__1202883_20, respectivamente. Los genotipos de los SNP
se examinaron utilizando un método de PCR en tiempo real
basado en la sonda TaqMan utilizando el protocolo descrito
en estudios anteriores [ 2 , 24 ].
análisis estadístico
Todos los datos se analizaron utilizando el software SAS
9.3 (SAS Institute Inc., Cary, NC). El equilibrio de
Hardy-Weinberg se examinó mediante la prueba de chi-
cuadrado. La asociación entre los SNP y el riesgo de TEA
se probó mediante el modelo de regresión logística. Los
datos se presentaron como odds ratios (OR) e intervalos de
confianza (IC) del 95%. El valor de AP <0,05 se consideró
estadísticamente significativo.
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Resultados
Nuestros datos revelaron que las distribuciones
genotípicas de TCN2 rs1801198, MTR rs1805087, MTRR
rs1801394 y MTHFR rs1801133 estaban en el equilibrio
genético de Hardy-Weinberg ( Tabla 1 ).
tabla 1
Pruebas de equilibrio de Hardy-Weinberg ( valores de P )
de SNP en grupos de casos y controles.
Tabla 2
Correlación entre los genotipos SNP y las frecuencias
alélicas con ASD infantil.
Tabla 3
Distribuciones de genotipos SNP y evaluaciones de riesgo
correspondientes para TEA utilizando modelos genéticos de
herencia.
Tabla 4
Correlación entre los genotipos de SNP y las frecuencias
alélicas y la gravedad de la ASD infantil.
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Conclusiones
Nuestro estudio revela que TCN2 rs1801198, MTR rs1805087,
MTRR rs1801394 y MTHFR no son factores de riesgo para la
susceptibilidad al TEA infantil o la gravedad de la
enfermedad en la población china Han.