ribozimas

Las ribozimas son ARN con actividad catalítica. El término "ribozima"

es una contracción de las palabras "ácido ribonucleico" y "enzima"

Como la caracteristica prominente de estas moléculas de RNA era clivar otras cadenas de
RNA se les llamó ribozimas.

Características[editar]
Las ribozimas son moléculas de ARN que tienen la capacidad de
actuar como catalizadores, es decir, de acelerar reacciones químicas
específicas. Al igual que las enzimas proteicas, poseen un centro
activo que se une específicamente a un sustrato y facilita su
conversión en un producto. Las ribozimas son menos versátiles que
las enzimas proteicas.
El estudio de catalizadores biológicos se intensificó a mediados de 1800 cuando Louis Pasteur
llamó fermentos a los agentes presentes en las levaduras que convertían azúcar en alcohol. En
1926 se purificó la primer enzima, la "ureasa", a partir de plantas, encontrando que estaba
compuesta por material proteico. Los cientos de enzimas purificadas y analizadas desde entonces
resultaron ser de naturaleza proteica, por lo que se concluyó que todas las enzimas eran proteínas.

Este dogma pareció cambiar cuando en 1982, en el laboratorio de Thomas Cech, (1) estudiando el
procesamiento de RNA en el protozoo ciliado Tetrahymena thermophila se observó que el corte y
empalme (splice) de un intrón del pre-rRNA era autocatalítico. ¡El RNA se escindía por sí mismo
sin ayuda de un catalizador proteico!.

Paralelamente, en el laboratorio de Sidney Altman (2) se investigaban las

propiedades de la enzima ribonucleasa P, que se encuentra en todos los
organismos. Los sustratos de esta enzima son una serie de moléculas precursoras
de tRNA inactivo que son transformadas en tRNA funcional. La ribonucleasa P
consta de una subunidad proteica y un RNA de 377 nucléotidos enlazados en una
sola cadena. Al separar los componentes, la subunidad RNA fue capaz de
catalizar la hidrólisis de tRNA precursor en ausencia completa de la parte
proteica. Como la caracteristica prominente de estas moléculas de RNA era clivar
otras cadenas de RNA se les llamó ribozimas. El descubrimiento de las ribozimas
fortaleció la teoría del "mundo de RNA"

Un intrón es una región del ADN que forma parte de la transcripción

primaria de ARN, pero a diferencia de los exones, son eliminados del
transcrito maduro, previamente a su traducción. La palabra intrón se
deriva del término región intragénica, es decir una región dentro de un
gen. A pesar de ser a veces llamados secuencias interventoras el
término puede referirse a cualquiera de las muchas familias de
secuencias internas de ácidos nucléicos que no están presentes en el
gen final, como lo son las inteínas, las secuencias no traducidas (UTR)
y los nucleótidos eliminados en la edición del RNA.
Clasificacion de intrones

Actualmente se reconocen cuatro clases de intrones:

 Intrones del grupo I

 Intrones del grupo II
 Intrones del grupo III
 Intrones nucleares, spliceosomales o intrones del grupo IV
Los intrones del grupo I, II y III son intrones que sufren
de autosplicing mediante reacciones de transesterificación. La
frecuencia con la que encontramos estos intrones en el genoma es
relativamente rara si la comparamos con la frecuencia de los
intrones spliceosomales.
Los intrones del grupo II y III son muy similares y presentan una
estructura secundaria altamente conservada. De hecho a veces los
intrones del grupo III son identificados como intrones del grupo II
debido a su similitud funcional y estructural.
Los intrones del grupo I están presentes en los genes de ARNr de
algunos eucariotas inferiores y en los genes mitocondriales de hongos.
Se caracterizan por eliminarse mediante un proceso autocatalítico que
requiere de una guanosina o un nucleótido de guanosina libre; así
como por carecer de secuencias consenso en los puntos de empalme,
aunque pueden tenerlas en su interior.
Los del grupo II y III se eliminan mediante un proceso autocatalítico
que requiere de una adenina o de un spliceosoma, respectivamente.
En ambos grupos, durante el proceso de empalme de los exones, se
forma una estructura en lazo característica denominada lariat.
Los del grupo IV están presentes en los ARNt de los eucariotas y se
caracterizan por ser los únicos que se eliminan mediante un corte
endonucleótido seguido de un ligamiento en lugar de la reacción
de transesterificación
Nucleoplasma
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.
El nucleoplasma, cariolinfa, citosol nuclear, hialoplasma
nuclear, jugo nuclear o carioplasma (del griego: ka`ryon nuez, semilla + plasma sustancia
moldeada) es el medio interno semilíquido del núcleo celular, en el que se encuentran
sumergidas las fibras de ADN o cromatinay fibras de ARN conocidas como nucléolos.

Espliceosoma
(Redirigido desde «Spliceosoma»)

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El espliceosoma o complejo de corte y empalme es un complejo formado por

cinco ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP, del inglés small nuclear
ribonucleoproteins) capaz de eliminar los intrones (secuencias no codificantes) de los
precursores del ARNm; este proceso se denomina splicing de ARN.1
Las snRNP son complejos formados por unas diez proteínas más una
pequeña molécula de ARN, rica en uracilo (U), que es la encargada de
reconocer al intrón mediante apareamiento complementario de bases.

Ácido ribonucleico ribosómico

(Redirigido desde «ARNr»)

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Estructura 3D de la subunidad 50S de Haloarcula marismortui. Las proteínas

se muestran en azul, el rRNA 23S en naranja y el 5S rRNA en amarillo.1
El ácido ribonucleico ribosómico o ribosomal (rRNA por sus siglas en inglés) es
un RNA que forma parte de los ribosomas y es esencial para la síntesis proteica en todos los
seres vivos. Los rRNAs forman el armazón de los ribosomas y se asocian a proteínas
específicas para formar las pre-subunidades ribosomales. Es el material más predominante en
el ribosoma, que en peso consiste de aproximadamente 60 % de rRNA y 40 % de proteína.
Los ribosomas contienen dos principales tipos de rRNAs que forman dos subunidades: la
subunidad mayor (LSU por sus siglas en inglés, que es una ribozima que cataliza la formación
de enlaces peptídicos) y la subunidad menor (SSU). El rRNA es el tipo de ARN más
abundante en las células y está formado por una sola cadena de nucleótidos, aunque presenta
regiones de doble hélice intracatenaria. Las secuencias de rRNA son ampliamente utilizadas
para deducir relaciones evolutivas entre organismos puesto que se encuentran en todas las
formas de vida.
Splicing
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Esquema de la formación del ARN mensajero a través de intrones y exones de

un gen. 1. ADN, 2. PreARN mensajero, 3. ARN mensajero, 4. Ribosoma.

Splicing para la formación de ARN mensajero.

Al hablar de splicing, también llamado corte y empalme, empalme o ayuste, podemos
referirnos a:

 Splicing de ARN: Es un proceso co-transcripcional de corte y empalme de ARN. Este

proceso es muy común en eucariotas, pudiéndose dar en cualquier tipo de ARN aunque
es más común en el ARNm. También se ha descrito en
el ARNr y ARNt de procariotas y bacteriófagos.
 Splicing de proteínas: Es un proceso post-traduccional de corte y empalme de
una proteína precursora. Este proceso conlleva la eliminación de una secuencia
de aminoácidos de la cadena polipeptídica para originar una proteína madura.
 Splicing de ADN: Proceso que consiste en la unión covalente de dos fragmentos
de ADN bicatenario, catalizado por una ligasa de ADN.
Las ribozimas aumentan sustancialmente la velocidad de reacción (3,4,5,6). Así las
constantes cinéticas son comparables a las de enzimas proteicas. Pueden usar cofactores
como imidazol y presentar regulación alostérica.