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Biomoléculas I
Autores
aula
14
Governo Federal Revisoras de Língua Portuguesa
Presidente da República Janaina Tomaz Capistrano
Luiz Inácio Lula da Silva Sandra Cristinne Xavier da Câmara
372p. : il
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Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Apresentação
E
sta aula inicia um estudo sobre compostos relacionados diretamente com a química
da vida, as biomoléculas. Neste primeiro momento, nossa atenção será dedicada
aos peptídeos e aos carboidratos. O conteúdo será desenvolvido com base na
aprendizagem das aulas anteriores, uma vez que as biomoléculas reúnem em si funções
já estudadas isoladamente. As estruturas moleculares serão comentadas e relacionadas às
propriedades físicas e químicas importantes para os sistemas biológicos.
Objetivos
Reconhecer e classificar peptídeos e carboidratos.
1
Prever propriedades físicas e químicas dessas
2 biomoléculas.
R O
grupo ácido
H2N CH C
amino carboxílico
O H
Aminoácidos protéicos
Apenas vinte aminoácidos são os mais significativos no mundo biológico por serem
os blocos de construção, as unidades fundamentais, das proteínas. Eles apresentam um
padrão estrutural centralizado no carbono D ao grupo carboxílico, reunindo o grupo amino,
o átomo de hidrogênio e o restante da cadeia (R), denonimada como “cadeia lateral”, com a
quiralidade específica de designação L. Embora a convenção R,S seja também empregada, a
designação D,L é a mais utilizada. Observe nas representações a seguir a quiralidade própria
dos aminoácidos protéicos em torno do carbono D.
(2)
O COOH COOH COOH COOH
Aminoácidos Aminoácidos
Aminoácidos Apolares Aminoácidos Polares
Básicos Ácidos
O
H 2N CH C
O O O O O O H
H2N CH C H2N CH C HN CH C H2N CH C H2N C H C C H2 O
O H O H O H OH O H H 2NCH C
CH2 CH3 C H C H2 O H
H CH3 C H2
OH C H2
OH C
NH HO O
Glicina Alanina Prolina Serina Treonina H 2N C NH
todos
são D-aminoácidos, ou seja, o grupo amino é localizado no carbono D do grupo
carboxílico;
em dezenove deles, o grupo amino é primário; prolina é o único com o grupo D-amino
secundário;
O H O H O íon dipolar
+ + cátion amônio e
N N H N
H O H H O O ânion carboxilato
H D H D H D
Íon dipolar, também denominado zwitterion (do alemão zwitter, híbrido), pode ser
definido como composto neutro com unidades de cargas elétricas formais de sinais opostos,
ou composto com cargas de sinais opostos em átomos não adjacentes. Algumas vezes é
referido como sal interno. Observe que o íon dipolar, apesar de duas cargas, não tem carga
elétrica líquida. Por existirem com íons dipolares, os aminoácidos têm muitas propriedades
associadas com sais. São sólidos cristalinos com pontos de fusão elevados, relativamente
solúveis em água, mas insolúveis em solventes orgânicos apolares.
O H O O
pKa DNH3 = 9,60 H Alanina HO HO
+ +
H N O H H N O H N O
H H H
H+ H+
pKa DCOOH = 2,34
íon dipolar
forma catiônica (zwitterion) forma aniônica
Veja que o ânion carboxilato é básico e neutralizado com ácido. O cátion amônio é ácido
e neutralizado com base.
Solução em
pKa pKa pKa
Classificação Nome Abreviatura Fusão oC água g/100 pl
DCOOH DNH3 DR
mL
Tabela 1 – Classificação, nome, abreviatura, propriedades físicas e acidez dos ácidos protéicos
Você pode concluir, portanto, que o aminoácido apresenta formas estruturais com cargas
elétricas que são determinadas pelo pH do meio. Em um meio fortemente ácido, a estrutura
apresenta carga elétrica positiva do grupo amônio, caracterizando uma forma catiônica.
Em um meio fortemente básico, apresenta carga elétrica negativa do grupo carboxilato,
caracterizando uma forma aniônica. Em um determinado valor de pH, o aminoácido será
íon dipolar e em valores de pH intermediários duas formas estruturais estarão em equilíbrio,
com suas concentrações inversamente proporcionais entre si.
12 O
H2N CH C
pKa = 9,68 -
10 CH3 O
O O
+
H3N CH C H
= 2 N CH C
8 - CH3 O -
ponto CH3 O
isoelétrico
O
pH 6 +
H3N CH C
-
CH3 O
4 O O
pKa = 2,34 +
H3N CH C
+
= H3N CH C
-
2 CH O H
3
CH3 O
O
+
H3N CH C
0,5 1,0 1,5 2,0 CH3 O H
Equivalentes de HO
H + HO-
+
H2O [AH] [AH]
- log [ H ] = - logKa - log pH = pKa - log
+
[ A- ] [A- ]
AH + HO- A- + H2O
[AH]
pH = pKa quando [AH] = [A]- porque =1 e log 1 = 0
[ A- ]
O O
pKa DNH3 = 9,82 H O
pKa DCOOH = 2,10
H O H
+ + +
H N O H HO- H N O- HO- H N O- HO- H N O-
H H H H
O H -H2O O H -H2O O- -H2O O-
pKa R = 3,86
O O O O
pKa = 8,95 O O O O
pKa = 2,18
+ +
H3 N H3 N H2N H2N
O H O- O- O-
HO- HO- HO-
-H2O -H2O -H2O
forma catiônica 2 + forma catiônica 1+ íon dipolar forma aniônica
Empregando o valor de pKa da forma catiônica, que precede o íon dipolar, e aquele do
próprio íon, você chega ao seguinte cálculo: pI = (8,95 + 10,53) / 2 = 9,74.
O
+ O O [A. aspártico]-
H3N O- +
H3N O-
+
H3N
O-
+
O-
[Lisina]
Alanina
O
+
H3N tira de papel umedecida e com pH = 6,0
Atividade 2
Represente o comportamento de uma mistura de ácido glutâmico, arginina e
valina na eletroforese sobre papel com pH 6,0.
Peptídeos
Outra propriedade química importante dos aminoácidos é a capacidade de
polimerização, pela reação de condensação entre o grupo carboxila de um com o amino de
outro, eliminando água e formando a ligação peptídica, que é uma amida! Detalhes dessa
reação são representados a seguir.
aminoácido
N-terminal
aminoácido
H O C-terminal
O + O - H2O
H N +
+ + H3N O
H3N H N
O O
ligação peptídica H O
(uma amida)
Observe que o primeiro aminoácido teve um dos seus átomos de oxigênio substituído
pelo átomo de nitrogênio do segundo, o qual, para tanto, teve átomos de hidrogênio
removidos, por isso no peptídeo ambos são considerados resíduos de aminoácidos.
A condensação sucessiva de aminoácidos forma a cadeia peptídica que pode apresentar 300
resíduos, ou mais em alguns casos. Por convenção, os peptídeos são representados com o resíduo
de aminoácido que tem seu grupo amino livre, aquele que não participa de ligação peptídica, na
extremidade esquerda. Este é denominado aminoácido N-terminal. Na extremidade direita da cadeia
é o C-terminal por ter o grupo carboxílico livre, ou não envolvido em ligação peptídica.
Os peptídeos são classificados em função do número de resíduos de aminoácidos em sua
cadeia, como: dipeptídeos (2), tripeptídeos (3), oligopeptídeos (4 a 20) e polipeptídeos (>20).
Observe na representação a seguir a bradiquinina, um hormônio humano que atua no
controle da pressão sangüínea, ilustrando um oligopeptídeo. Os tracejados estão indicando
as ligações peptídicas, oito delas unindo nove resíduos.
HO
HN Ligações peptídicas HN
Atividade 3
Represente a fórmula estrutural para Lys.Phe.Ala. Indique o aminoácido
N-terminal e o C-terminal. Qual o pI desse peptídeo?
A ligação peptídica
Alguns detalhes da ligação peptídica, muito importantes para as propriedades das
cadeias polipeptídicas, devem ser bem compreendidos por você. Empregando o conteúdo
estudado na aula anterior, considere a conjugação do par de elétrons do átomo de nitrogênio
com o grupo carbonila na ligação peptídica genérica, representada a seguir.
O O O
+ C
C CD C CD + CD
CD CD N CD N
N
maior polarização
H H
H
Veja que para conjugar com a carbonila, o átomo de nitrogênio também adota a
hibridação sp. Como conseqüência dessa interação eletrônica, a ligação peptídica adquire
as seguintes características:
caráter de dupla ligação em 40%, ou seja, não é uma ligação sigma pura;
A maior polarização das duas ligações resulta em ligações hidrogênio fortes entre
resíduos de aminoácidos na cadeia e entre cadeias polipetídicas. Essas ligações definem a
chamada estrutura secundária, a qual descreve como a cadeia se propaga ao longo de um
eixo e que será comentada mais adiante.
Proteínas
roteínas são agentes de função biológica e expressão da informação genética. Entre
P outras funções, podemos citar: estrutural (pele, cabelos, músculos), catalítica (enzimas),
armazenadora de nutrientes e blocos construtivas (albumina da clara do ovo e caseína
do leite), transportadoras (hemoglobina, lipoproteínas), sistemas contráteis e de motilidade
(músculos), regulatória (hormônios), defesa (trombina e fibrinogênio), anticorpos e toxinas.
No ser humano, estima-se em 5 milhões o número de diferentes proteínas, cada uma
com uma função importante; diferentes espécies têm proteínas diferentes.
As proteínas podem ser representadas por uma única cadeia polipeptídica, variando
entre 150 e 300 resíduos em média, ou por um aglomerado destas, iguais ou diferentes.
As proteínas também podem apresentar junto às cadeias polipeptídicas cátions metálicos
ou moléculas como carboidratos, ácidos nucléicos, lipídeos, vitaminas, entre outras. Esses
componentes são denominados grupos prostéticos.
As proteínas são classificadas segundo três critérios.
3. Quanto à conformação:
50
Glo Hs
Lcu Ser Val Phe Thr
Asp
Ala
Aso 100 Val
Ala Glm Thr Pro 41
Val Lys Asn Thr Lya
Can His Lya
De 124 Tyr Cys
40
Ala
Val
He
HOOC Val Ser Ala
Asp
Ala
Arg
55 Val Cya
Cys 120 95 Mp
Ala Phe Asc
Pro Lys
Ser Val Val His
60 Cys
Chr Gly
119 Pro
Gln 110 Aso Tyr Thr
Pro Tyr
Lys Ser Thr Mes
80 90 Leu
Chr Thr Lya
Ser He Gly
Asn Thr Arg Ser Ser Asn
Tyr
Asp Cyr Arg
Val Ser
26 Ser
Ala Glo Cys 30
21 Asn Gen Lys
65 20 Tyr Met Meu
Cys Tyr Ser Ser
Ala Ser Asn
Eye 72
Cys
Ala
Asn
Abh
12 10
Ser Ser Asp
Gly Thr Ser Mel His Gln Arg
Thr 70
Gls 7 Cda
Gla Thr Ala Ala Ala Phe Phe
H2N Lys 1
Estrutura primária
Ses17
x x
Asn18
N
oligassacarídeos (4 a 10);
polissacarídeos (>10).
pelo número de átomos de carbono na cadeia em triose, tetrose, pentose, hexose e heptose;
CH O CH2 OH
CH O
H OH O
CH O H OH
HO H HO H
H OH H OH
H OH H OH
H OH
CH2 OH H OH H OH
CH2 OH
CH2 OH CH2 OH
CH O CH O CH O
H OH H OH HO H
H OH CH2 OH H OH
D-(-)-Eritrose CH2 OH D-(+)-Gliceraldeído CH2 OH D(-)-Treose
CH O CH O CH O CH O
H OH HO H H OH HO H
H OH H OH HO OH HO H
H OH H OH H OH H OH
CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH
D-(-)-Ribose D-(-)-Arabinose D-(+)-Xilose D-(-)-Lixose
CH O CH O CH O CH O CH O CH O CH O CH O
H OH HO H H OH HO H H OH HO H H OH HO H
H OH H OH HO H HO H H OH H OH HO H HO H
H OH H OH H OH H OH HO H HO H HO H HO H
H OH H OH H OH H OH H OH H OH H OH H OH
CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH CH2 OH
D-(+)-Alose D-(+)-Altrose D-(+)-Glicose D-(+)-Manose D-(-)-Gulose D-(-)-Idose D-(+)-Galactose D-(+)-Talose
As cetoses são isômeros constitucionais das aldoses. Suas hexoses têm apenas três
carbonos quirais e portanto oito esteroisômeros, quatro deles com a designação D. Observe
a família das D-cetoses a seguir.
D-D-Frutopiranose ~ 3 % E-D-Frutofuranose ~ 31 %
D-Frutose
HO 5 6 6
6 O HO 5 6 OH HO CH2 O
OH OH HO CH2 O OH
1 OH 1
3 CH2 OH2 H 5 OH 5 OH 2
4 3 2 CH2 OH 2 CH2 OH
2 4 4 4 CH2 OH
OH 3 1 3 1
OH HO 1CH2 OH HO HO
O
2 O
HO 5 6 O HO 3 H 6 1
6 1
HO 5 HO CH2
HO 6 OH H 4 OH HO CH2 OH CH2 OH O CH2 OH
OH 5
4 3 OH H OH 5 OH 5 OH 2
2 H 3 2 O 2 O OH
HO 4 6CH OH 4 4
CH2 OH HO 3
2
HO 3
1 HO CH2 OH
1
E -D-Frutopiranose ~ 57 % D-D-Frutofuranose ~ 9 %
A-D-Glicopiranose OH OH Sacarose
O O
HO HO
HO HO HO ligação
OH HO
HO O + OH HO O O glicosídica
OH - H2O OH
OH OH
HO B-D-Frutofuranose HO
ligação glicosídica
HO OH OH
O O HO OH OH
OH + HO O
HO HO O
HO O
HO OH - H2O HO HO
HO HO OH
B-D-Galactopiranose A,B-D-Glicopiranose
Lactose
Polissacarídeos
olissacarídeos são os carboidratos formados pela condensação de muitos
CH2 OH
O
HO
CH2 OH HO CH2 OH
O O O
HO HO
CH2 OH
HO CH2 OH HO HO O
O O CH2 OH
ligação D 1,4 O ramificação D 1,6
HO O O n
HO HO CH2 OH
HO CH2 HO O O
O O ligação E 1,4 HO
HO OH
HO HO
HO CH2 OH
O O
HO
O
O
amilopectina celulose n = até 3.000
OH OH
O O O O O
HO O HO
O O O O O O O
O OH
O OH
O O HO
O OH
O O
O OH
HO HO
O O O
O O HO O O O
O OH HO O O O O
HO O OH O O
O OH O O OH OH
O O
O O O OH O O O OH
O OH
O O
O O O OH
O
O O
O O O OH OH
O
O OH O
O OH
O O O O
O
OH
HO Glicogênio
sua resposta
1.
2.
Auto-avaliação
Explique as características fundamentais dos aminoácidos protéicos e como estes
1 são classificados.
ALLINGER, Norman L. et al. Química orgânica. 2. ed. Rio de Janeiro: Livros Técnicos e
Científicos, 1976.
BARBOSA, Luiz C. de Almeida. Introdução à química orgânica. 2. ed. São Paulo: Prentice
Hall, 2004.
WADE JÚNIOR, L. G. Organic chemistry. 4. ed. Upper Saddle River: Prentice Hall, 1999.
Química II
Química I