Para controlar una enfermedad es indispensable conocer su agente causal. De lo
contrario cualquier estrategias de control podría ser infructuosa o eventualmente agravar el estado sanitario del cultivo. Si no se conoce el fitopatógeno (causante de la enfermedad en la planta) podría estarse utilizando un mecanismo inapropiado contra algo desconocido. Un correcto diagnostico provee una cantidad considerable de información básica para seleccionar métodos acordes al organismo o condición que está causando el problema. Un diagnóstico preciso se inicia siempre con una muestra representativa y la observación apropiado del entorno de la planta. En el laboratorio la muestra es sometida a diferentes análisis en busca de evidencias, pistas o la identificación definitiva del agente causal. En el procedimiento se incluyen exámenesmacroscópicos, microscópicos, cultivo, pruebas bioquímicas, serólogicas, o patológicas. En muchos casos los simples exámenes preliminares responden a laincógnita, pero a veces se requiere realizar procedimientos específicos para obtener el resultado preciso.