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XII Encontro Nacional de Professores de Química Farmacêutica

Aplicação de QSAR-2D na graduação: exemplo de aula prática

Vinícius de Medeiros Alves1* (PG), Elias Matias Laurentino1 (IC), Carolina Horta
Andrade1 (PQ).
*viniciusm.alves@gmail.com

Laboratório de Modelagem Molecular, Faculdade de Farmácia, Universidade Federal de Goiás,


Goiânia, Goiás.

Palavras Chave: QSAR, graduação, aula prática.

Introdução Coats4. Previamente à aula, o conjunto de


A modelagem molecular (MM) constitui dados foi preparado conforme a metodologia
um conjunto de métodos teóricos e técnicas proposta por Fourches et al.5 Durante a aula
computacionais usadas na modelagem ou prática, os alunos calcularam descritores
mimetização do comportamento e interação DRAGON e removeram variáveis constantes
de moléculas. Atualmente, a MM se tornou e quase constantes (cutoff = 0.9) Os
indispensável no processo de descoberta e modelos foram gerados no pacote R
desenvolvimento de fármacos, assim como utilizando o algoritmo original de Random
estudos do metabolismo e avaliação prévia Forest. Uma floresta foi gerada com 1000
de propriedades farmacocinéticas e árvores, sendo que para cada árvore
toxicológicas.1 classificatória, 75% do conjunto de dados
Os estudos de relações quantitativas estiveram no conjunto treinamento e 25%
entre estrutura e atividade, QSAR no conjunto teste, conseguindo-se um q2 =
(Quantitative Structure-Activity 0,96. Ao final, foi sugerido que os alunos
Relationship) são uma das técnicas de MM desenhassem três análogos de esteroides no
mais utilizadas no planejamento de Marvin Sketch (v.5.11, ChemAxon,
fármacos. Os modelos de QSAR descrevem Budapest, Hungary) e calculassem sua
uma relação matemática entre atributos atividade utilizando os modelos gerados. Por
estruturais e a propriedade biológica de um fim, os alunos fizeram uma avaliação de
conjunto de compostos químicos.2 Por esse como os grupamentos dos análogos
motivo, a utilização de QSAR na disciplina interferiram na atividade.
de Química Farmacêutica Medicinal é de Conclusões
grande valia nos processos de ensino e A aula se mostrou importante no
aprendizagem, para auxiliar o entendimento auxílio do processo de ensino e
do processo de planejamento de fármacos, aprendizagem, através da exemplificação da
assim como na compreensão da relação geração de modelos matemáticos que
entre a estrutura e a atividade de descrevem as relações entre a estrutura e
compostos.3 atividade de compostos bioativos, assim
Dessa maneira, propõe-se uma aula como no processo de planejamento de
prática utilizando o QSAR-2D para auxiliar fármacos.
na compreensão das relações quantitativas Agradecimentos
entre estrutura e atividade de uma classe de CAPES, CNPq, FAPEG.
compostos, assim como para o ____________________
planejamento de novos fármacos a partir de 1
Barcellos, G. B.; Pauli, I.; Caceres, R. A.; Timmers, L.
modificações estruturais propostas.
F. S. M.; Dias, R.; De Azevedo, W. F. Curr. Drug
Resultados e Discussão
Targets 2008, 9, 1084–91.
A geração de modelos de QSAR pode 2
Tropsha, A. Mol. Inf. 2010, 29, 476–488.
ser um processo moroso, tanto pela 3
Nogueira, L. J.; Montanari, C. A.; Donnici, C. L. Rev.
complexidade do conjunto de dados quanto
Virtual Quim. 2009, 1, 227–240.
pelo processo de validação, necessário para 4
Coats, E. A. Perspect. Drug Discovery Des. 1998, 12-
assegurar que os modelos gerados sejam
14, 199–213.
robustos e preditivos.2 O conjunto de dados 5
Fourches, D.; Muratov, E.; Tropsha, A. J. Chem. Inf.
selecionado para o desenvolvimento desta Model. 2010, 50, 1189–204.
aula contém 31 esteroides com afinidade de 6
Breiman, L. E. O. Machine Learning. 2001, 45, 5–32.
ligação pelo receptor CBG, compilado por

XII Encontro Nacional de Professores de Química Farmacêutica- 27 de fevereiro a 01 de março de 2013 - UFG.