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de la vida
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T'r
.Ún el Capítulo5 hicimosreferenciaa AG', la variación zador,y despuésveremos el papel delas enzimascomo ca-
de energíalibre,y vimos su importanciacomo indicador talizadoresbiológicos específicos.Thmbién veremos cómo
de la espontaneidad termodinámica.Concretamente, el Ia velocidad de una reacción catalizadaenzimáticamente se
signode AG' nos dicesi una reacciónesposibleen la di- ve afectada por la concentración del sustrato disponible
recciónindicada,yla magnitudde A,G'indicala cantidad para la reacción. Asimismo, se analizarán algunas de las
de energíaquepuedeserliberada(o quedebesersuminis- formas de regulación de la tasade reaccionesencaminadas
trada),mientrasque la reaccióntienelugar en esadirec- a satisfacerlas necesidadesde la célula.
ción,bajolascondiciones paralascualessecalculóAG'. Al
mismo tiempo,pusimoscuidadoen señalarque el pará-
metro termodinámicoAG' no puede proporcionarnos Energía de activación y el estado
ningunapista.encuantoa si una reacciónfactibletendrá metaestable
lugarrealmente, y a quévelocidad.En otraspalabras, AG'
nos dice si una reacciónpuedetener lugar pero no dice Si se detienea pensarlo,ustedya estáfamiliarizadocon
nadaen absolutosobresi realmentetendrálugar.Paraesta muchasreaccionesque son termodinámicamente facti-
distinción,necesitamos conocer,no sólo la direccióny la bles,aunqueno ocurranmuy a menudo.Un ejemploevi-
energlade la reacción,sino tambiénalgoacercadel meca- dente,consideradoen eI Capítulo5, esla oxidaciónde la
nismoy la velocidad. glucosa(véaseReaccíón 5.9).Estareacción(realmente, se-
Esto nos lleva al tema de la cat¡ílisisenzimática, por- rie de reacciones) es altamenteexergónica(AG'= -686
queprácticamente todaslasreacciones o procesos celulares kcal/mol)¡ sin embargo,no ocurrepor sí misma.De he-
son mediadospor proteínas(o, en ciertoscasos, ARN) ca- cho,la glucosaen forma cristalinao en solución,sepuede
talizadorasllamadasenzimas.Las únicas reaccionesque exponeral oxígenodel aire indefinidamente,y la oxida-
ocurrena unavelocidadapreciable en una célulasonaque- ción serámínima o inclusoinexistente. La celulosadel pa-
llasparalascualeslasenzimasapropiadasestánpresentes y pel sobre el cual estánimpresasestaspalabras,es otro
activas.Así,las enzimascasisiempresignificanla diferen- ejemplo,como lo es ustedmismo, que estáformado por
cia entre<puedetenerlugar>y <tendrálugao en lasreac- un conjuntocomplejode moléculastermodinámicamen-
cionescelulares.Sólo cuandoexploramosla naturalezade te inestables.
las enzimasy suspropiedades catalizadoras,comenzamos No tan cercanas,pero igualmenteimportantespara la
a entenderpor quélasreacciones quesonfactiblesenergé- química celular,son muchasreaccionestermodinámica-
ticamente,tienen lugar realmenteen las célulasy cómo se mentefactibles,pero que no tienenlugarpor sí mismasa
controlala velocidadde talesreacciones. una velocidadapreciable.Como ejemplo,consideremosa
En estecapítulo,consideraremosprimero por qué las la moléculade alta energíaadenosinatrifosfato(AIP),la
reaccionestermodinámicamente espontáneas no tienen cual tiene una AG' altamentefavorable(-7,3 kcal/mol)
lugar normalmentea velocidadesapreciables sin un catali- para la hidrólisis de su grupo fosfatoterminal, durante la
Energía y el estadometaestable
deactivación r39
formación del correspondientedifosfato (ADP) y fosfato moléculasdeATPI HzO alcancenel estadode transición.
inorgánico(P'): AG" mide la diferenciaen la energíalibre entrelos reac-
tivosy los productos(-7,3 kcal/molpara estareacción
AIP + HrO: ADP + Pi (6.1)
en particular),mientrasEo indica el mínimo de energía
Estareacciónesmuy exergónica bajo condicioneses- requeridapara que los reactivosalcancenel estadode
tándare inclusolo esmás en las condicionesque prevale- transicióny, por tanto, seancapacesde dar lugar a los
cenen lascélulas.Sin embargo,a pesarde quela variación productos.
de energíalibre esmuy alta,estareaccióntienelugarpor sí La velocidadreal de una reacciónes siemprepropor-
mismasólolentamente, de maneraqueel ATP permanece cional a la fracción de moléculasque tienen una energía
establedurante varios días cuando se disuelveen agua igualo mayorqueEo.Cuandoen una solucióna tempera-
pura. Estapropiedadpareceser compartidapor muchas tura ambiente,lasmoléculasde ATP y aguasemuevenli-
moléculasy reacciones biológicas. bremente,cadauna poseeuna ciertacantidadde energía
en un momentodado.Como semuestraen la Figura6.ib,
La barrerade aetivaciónenergéticadebeser superada la distribuciónde energíaentrelasmoléculastieneforma
antesde quese puedaverificarunareacciónquimica de campana;algunasmoléculastendránpocaenergía,al-
gunaspodrán tenermucha,y la mayoríaestarácercadel
Lasmoléculasque deberíanreaccionarentresí,a menudo promedio.El hechoa destacares que sólo las moléculas
no lo hacenporquecarecen de energíasuficiente.
Paratoda capacesde reaccionaren un instantedado,son las que tie-
reacción,hay una energíade activación específica(.Eo), nensuficienteenergíaparasuperarla barrerade energíade
definidacomo la cantidadmínima de energíaque los reac- activación(Figura6.1b,líneadiscontinua).
tivos debentener antesde que la colisiónentre ellostenga
éxito,dandoorigena los productos.Más específicamente,
los reactivosnecesitana).canzarun estadocuímico inter-
Elestado metaestable eseilesultado dela barera
medio llamado estadode transiciór, .tryi energíalibre
de activación
es mayor que la de los reactivosiniciales.La Figura6.la La energíade activación es,para la mayoría de las reaccio-
muestrala energíade activaciónrequeridapara que las nes biológicas a temperaturas celularesnormales, lo sufi-
o)
c)
t
A flo'
o
o
o
deben poseerlos reactivos(aquí, ATP y
HrO) para permitir ias colisionesque
c)
c
LU V
I ADP+l E conducen a la formación del producto.
.l
z Cuando los reactivosrebasanla barrera
de energiade activacióny reaccionan,
los productos tienen una energíalibre
(a) Secuenciade reacción
Fnornia ¡inÁtina
/v1 reducidaen una cantidadAG". (b) El
de as moléculas número de moléculasN1,que son lo
N2 suficientementeenergéticaspara
sobrepasarla barrerade energíade
(b) Activacióntermal
activacióny chocarsatisfactoriamente,
sepuede incrementar a N2, elevandola
temperatura de T, a Tr. (c) La energíade
a activación también puede disminuirse
t\ 5 por un catalizador,(d) incrementándose
o
.c) así el número de moléculasde \ a Nr',
E sin que cambie la temperatura.
c c)
c) c
-c) o
q)
c)
LL E
.l
z
(d) Activacióncatalítica
-.--\-
40 Gapítulo
6 Enzimas:
loscatal¡zadores
delavida
cientemente alta para que la proporción de moléculas que
posean mucha energía en un instante dado, sea extrema- Si los reactivospueden
damente pequeña. Por consiguiente, la velocidad de las agruparsesobrealgúntipo de superficieque facilitequelas
reacciones no catalizadasen las células es müy baja, y la porcionespotencialmentereactivasde lasmoléculasadya-
mayoría de las moléculas parecen ser estables,pese a ser centesse yuxtaponganapropiadamente,la interacciónse
reactivos potenciales en reaccionesfavorecidas termodiná- veráfavorecidaenormementey la energíade activaciónre-
micamente. Son, en otras palabras, termodinámicamente ducida de maneraeficaz.
inestables,pero no tienen la energía suficiente para sobre- Latareadeproveerde tal superficiereactivaesla propia
pasar la barrera de la energía de activación. de un catalizador,agenteque aumentalavelocidadde una
Talesmoléculas, aparentemente estables,se dice que es- reacción,disminuyendola energíade activación (Figura
tán en un estado metaestable._P*arp las célgljts¿los- biológi- 6.lc) y asegurandoque una proporción mayorde molécu-
cos celulares,
-'- Ia
-{PGf'?YfFffi-
enereí
gíg de acti-vggióg3lta -y_el..estado las seansuficientementeenergéticaspara experimentarla
' - . - . . . . stabT-e
rn-etae cler loi'b6fi
.-:+,¡:,...-_"^,-..:,,' íftluEt6 cel
ulare s, son cru ciales, reacción sin suministrode calor (Figura6.1d).Una carac-
r, i-e _-_-
porque Ia ?ida, pdr sb'plopia naturaleza,es un sistema terísticaprimordialde un catalizadoresoueno semodifi-
mantenidoen un estadoestacionario lejosdel equilibrio. capermanente_nqeIte.nisg__g9nsl¿rng.¡nienjrailalga$tqr-r
Si no fuerapor el estadometaestable, todaslasreacciones t iene lugatSim plene¡te,plo poLsr! na_u¡ amb_i rnle j-d-e-
tenderíanrápidamenteal equilibrio y la vida seríaimposi- cuado pa¡a Q_c-i!!1adq ¡949qió_q,
ble tal comola conocemos. La vida,por lo tanto,depende Podemosconsiderarla descomposición del peróxido
de quelasenergíasde activaciónseanaltas,evitandoque la de hidrógenoen aguay oxígeno,como un ejemplode ca-
mayoríade las reaccionescelularesocurran a velocidades tálisis:
apreciables en ausenciade un catalizadorapropiado. (6.2)
2 H 2 O 2- - 2 H2O + 02
Éstaesuna reaccióntermodinámicamentefavorecida,pese
superanla banerade la energ¡la
Loscatalizadores
a que el peróxido de hidrógeno existaen un estadome-
de activación
taestabledebido a la alta energíade activaciónde la reac-
La energíade activaciónno es sólo importante para el, ción.Sinembargo,si añadimosun númeropequeñodeio-
mantenimientodel estadometaestable, sino que es taml nes de hierro (Fe") a una solución de peróxido de
bién una barreraquesedebesuperar,paraquelasreaccio- hidrógeno,la reacciónde descomposición tienelugarunas
nesdeseables tenganIugara velocidades adecuadas.Dado 30.000vecesmás úpida quesin los ionesde hierro.Clara-
que el contenidoenergéticode una moléculadadadebe mente,el ion Fe'- esel catalizadoren estareacción,redu-
superarEoantesde que la moléculaseacapazde reaccio- ciendola energíade activación(comosemuestraen la Fi-
nar, la única manerade que puedaverificarseuna reac- gura 6.1c)y, por tanto, asegurandoque una proporción
ción basadaen reactivosmetaestables, a una velocidad significativamentemayor de moléculasde peróxido de hi-
adecuada, es aumentarla proporción de moléculassufi- drógeno(30.000vecesmás) poseanIa energíaadecuada
cientemente energéticas.Estosepuedeconseguir, bien au- paradescomponerse a la temperaturadada,sin necesidad
mentandoel contenidomedio de energíade todaslasmo- de aporteenergético adicional.
léculas,o bien reduciendoel requerimientode energíade En las células,la soluciónpara la descomposición del
activación. peróxidode hidrógenono esla adiciónde ionesférricos,
Una manerade incrementarel contenidode energíadel sino la enzimacatalasa,una proteínaque contienehierro.
sistemaes suministrandocalor.Como muestraIa Figura En presenciade Ia catalasaIa reacciónes 100.000.000 de
6.lb, simplernente incrementandola temperaturadel sis- vecesmásrápidaque en ausenciade catalizador.La catala-
tema desdeT, a T, seaumentarála energiacinéticade las sacontieneátomosde hierro retenidosen estructuras quí-
moléculas,asegurando, por tanto, que hayaun mayor nú- micasllamadasporfirinas.Así,la ventajade la catálisisin-
merode moléculasreactivas(N, lugarde {). Así,lahi- orgánicaseincorporadentro del contextode una molécula
"r
drólisis de AIP podría ser facilitada calentandola solu- proteica.Estacombinaciónda lugar a un catalizadormu-
ción, esdecir,confiriendo a cadamoléculade ATP y agtJa cho más eficazparaladescomposicióndel peróxido de hi-
másenergía.EI problemade usaruna temperaturaelevada drógenoque los ionesde hierro aislados.El incrementode
es que es incornpatiblecon la vida, porque los sistemas la velocidadde, aproximadamente,108vecespanla cata-
biológicosrequierenuna temperaturarelativamentecons- lasa,no es un valor atípico en absoluto;los aumentosde
tante. Las célulasson esencialmentesistemasisotérmicos velocidad de las reaccionescatalizadasenzimáticamente
(temperaturaconstante)y requierenmétodosisotérmicos estánen el rangocomprendidoentre107y 1014, en coÍlpa-
para resolverel problemade la activación. ración con las reaccionesno catalizadas. Estosvaloressu-
La alternativaa un incrementode la temperaturaesre- brayanla importanciaextraordinariade lasenzimascomo
ducir el requerilqlelQ_dcll-ilqlg1a_d9_aclivaqaa.Dc,ese catalizadoresy nos llevan hastael tema principal de este
r-nodo,nos aseguramosde que una proporción mayor de capítulo.
y el estadometaestable 1 4 t
Ener$adeactivación
Enzimas como catalizadores mamosenzimasfue eldefermentos.Sinembargo,hubo que
biológicos esperarhasta\926 para obtenerla primera enzimacristali-
zada,laureasa(apartir delasalubias,por famesB. Sumner),
Independientemente de su naturaleza química, todos los demostrándoseque era una proteína. Incluso, entonces,
catalizadorescomparten tres propiedades básicas:
pasóun tiempo hastaque los bioquímicosy enzimólogos
apreciaranque los <fermentos>que estabanestudiando
1. Un catalizador incrementa la velocidad de una reac- eran,de hecho,proteínascatalíticas,
y queparasu completa
ción disminuyendo el requerimiento de la energíade comprensiónse requeríaentendersu estructuray función
activación y permitiendo que una reacción termodi- comoproteínas, (Enlosprimerosañosde 1980,losbiólogos
námicamente factible, tenga lugar a una velocidad descubrieronque,ademásdelasproteínas,ciertasmoléculas
razonable, sin necesidadde activación térmica. deARN, llamadasr.ubp:wras,tienen tambiénactividadcata-
2. Un catalizador funciona formando complejos tran- lítica.Lasribozimasserándiscutidasen una secciónpróxi-
sitorios con las moléculas de sustrato, ligándolas de ma. Aquí, consideraremos las enzimascomo proteínas,las
manera que se facilite su interacción. cualesson,realmente,la mayoría.)
3. Uncutiliffiad a l a q u es e
consigueeI equilibrio; no tiene efectosobrela posi- El sitio activo. Uno de los conceptosmás importantes
cióndelequilibrio.Esdecir,un catalizador puedein- paraentenderlasenzimascomoproteínas, esel de sitio ac-
crementarIa velocidadde las reacciones exergóni- tivo. Cadaenzima,indepe
cas,perono puede,de ningunamanera,servircomo cataliceo de su estructuraparticular,contienedentro de
motor energéticode una reacciónendergónica. En algunapartede su estructuraterciariaun grupocaracterís-
otraspalabras,los catalizadores no son genioster- tico de aminoácidos queformanel sitio activo,dondeocu-
modinámicos. rre el eventocatalíticodel cual esaenzimaesresponsablg.
Estaspropiedades son comunesa todoslos catalizado- Normalmente, el sitio activoesun surcoo bolsillo real con
res,seanorgánicoso inorgánicos. Refiriéndonos a nuestro propiedades químicas y estructurales quepermitenla aco-
ejemplo,estoseaplicaigualmentea los ionesde hierroy a modación adecua9_tyespeclfica. del sustrato. La Figura6.2
lasmoléculasde catalasa. Sin embargo,los sistemas bioló- muestra los modelos obtenidos por ordenador de lasenzi-
gicosraramenteusancatalizadores inorgánicos.En vezde mas lisozima y carboxipeptidasa A, que ilustran bien el
eso,fundamentalmente todaslas catálisisen las célulasse ajuste preciso de la molécula de sustrato en los bolsillos
llevana cabopor moléculasorgánicas(pr.otelnas en la ma- producidospor el plieguecaracterístico de las cadenasde
yorla de los ce.s_o!)-llamadgs-e¡zimas.
Debido a que las en- polipéptidos. La lisozima es una enzimaque rompe las
zimassonmoléculasorgánicas, sonmuchomásespecíficas qniones glicosídicas en los peptidoglicanos de las paredes
quelos catalizadores inorgánicos, y susactividades sepue- bacterianas. conduciendoa la lisis (ruptura) y muertede
den regularcon muchomáscuidado. las bacterias.La carboxipeptidasa A es una enzima que
modificalos polipéptidoseliminandoun aminoácidocada
vezdesdeel extremoC-terminal del polipéptido.
La mayoríade las enzimasson proteínas
El sitio activode una enzimatípica comprendeun nú-
La capacidadde los extractoscelularespara catalizarreac- mero determinadode aminoácidos, que normalmenteno
cionesquímicasseha conocidodesdelos estudiosde la fer- soncontiguos,a io largodela secuencia primariadela pro-
mentaciónde Eduardy HansBuchneren 1897.De hecho, teína.En todo caso,se mantienenjuntos,en una confor-
uno de los primerosnombresaplicadosa lo que ahoralla- macióncorrecta,graciasal plegamiento tridimensionalca-
Figura6,2 Estructurasmoleculares
Sustrato Sustrato de la lisozimay la caÉoxipeptidasa A.
u n i d oa l u n i d oa l
centroactivo Modelo tridimensional compacto
centroactivo generadopor ordenador de las enzimas
(a) Iisozima y (b) carboxipeptidasaA,
con las respectivasmoléculasde sustrato
unidas a sus sitios activos,un segmento
¡ corto de un peptidoglicano bacteriano,
tr
en el casode la lisozima y un péptido
artificial, en el casode la
carboxipeptidasaA.
(incorpota- tl
Considere,por ejemplo,la hidrogenación n a
,/ "\ ,,,"\
ción de hidrógenoa un enlaceinsaturadoC:C): ! r
N
^
U-U \J-\, n
HH HH o ó
tl tl
R-C:C-R' + Hz ---------) R-Q-q-R (6.3) (a) Fumarato (b) Maleato
PtoNi I I
HH (a) fumaratoy (b) maleato'
Figura6.3 Losestereoisómeros
biológicos t43
comocatalizadores
Enzimas
estaenzimaesaceptaruna gran variedadde polipéptidos ratura no esproblemáticaparalasenzimasde lascélulasde
como sustratos,ya que la utilización de enzimasdistintas mamíferoso aves,porque estosorganismosson homeoter-
paratodoslos enlacespéptidicosdiferentesque tienen que mos,capaces de regularla temperaturacorporal indepen-
serhidrolizadosen la degradaciónpolipeptídica,represen- dientementedel medioambiente.Sinembargo,losanimales
tarla un gastoinnecesariopara la célula. inferiores,lasplantas,los protistasy lasbacterias,funcionan
Sin embargo,las enzimasson generalmentede alta es- a la temperaturade su medio ambiente,la cualpuedevariar
pecificidadcon relación al sustrato,tanto que una célula mucho.Paraestosorganismos,la dependenciade la activi-
puedeposeercasitantasenzimasdiferentes,como reaccio- dadenzimáticade la temperaturaesmuy significativa.
nestiene qtoecatalizar.Parauna célulatípica, son necesa- La velocidad de una reacción cata[zada enzimática-
rias miles de enzimasdiferentespara cumplir con todo su mente aumentacon la temperatura,dentro de unos lími-
programametabólico.En principio, pareceun gastosuper- tes,porque el incrementoen la energíacinéticade las mo-
fluo tener que sintetizartantasproteínas,almacenartanta léculasde la enzimay del sustrato,conducea una mayor
información genéticay tener siemprea mano tantasenzi- frecuenciaen lascolisiones,facilitandola unión correctaal
mas en la célula.Peroestoimplica enormesposibilidades sustrato.Sin embargo.seIlegaa un punto en el que el au-
de regulación,como veremosmás adelante. mento de la temperaturaes contraproducente,porque la
molécula enzimática comienza a desnaturalizarse.Los
Divetsidad enzimát¡ca y nomenclatura,No essorprendente puentesde hidrógenoserompen,las interacciones hidró-
que hayansido identificadasmiles de enzimas,dadasu es- fobascambian.v la integridadestructuraldel sitio activose
pecificidady el amplio número de reaccionesque ocurren interrumpe,causandola pérdidade la actividad.
dentro de una célula.Estaenormediversidadde enzimasy El rangode la temperaturapor encimadel cual una en-
funcionesenzimáticasha dado lugar a una gran variedad zima sedesnaturalizavariamucho de una enzimaa otra y
de combinacionespara nombrarlas,a medida que eran deun organismoa otro.En la Figura6.4asecomparala de-
descubiertas y descritas.Algunassedenominaronsegúnel pendenciade la temperatura de una enzima típica del
sustrato,comopor ejemploribonucleasa, proteasayamila- cuerpo humano, con una enzimatípica de una bacteria
sa.Otras,cbmo la succinatodeshidrogenasayla fosfoglucoi-termófiIa.La velocidadde reacciónde una enzimahuma-
someresa,se nombraronsegúnsusfunciones.Sinembargo, na esm¡íximaalrededorde los 37 oC,que esla temperatu-
otrasenzimastienennombresqueno estánen absolutore- ra corporalnormal.A partir de ahí el descenso bruscoen
lacionadoscon sussustratoso sus funciones.La tripsina, su actividad reflejala progresivadesnaturalizaciónde las
catalasa,y lisozimason enzimasde estaúltima categoria. moléculasenzimáticas.La mavorla de las enzimasde los
La proliferaciónde nombrescomunesparalas enzimas sereshomeotermosse inactivan por la temperatura,por
y la confusiónresultante,hizo que la Unión Internacional nzimas,la inactivación
de Bioquímicadesignarauna ComisiónEnzimática(EC), @ómeno de laboratorio.Sin embar-
encargadade idear un sistemaracional para nombiar las go, algunasenzimasson extraordinariamentesensiblesal
enzimas.El sistemaEC estárepresentado en la Tabla6.1. calor y se desnaturalizane inactivan a temperaturasmás
Lasenzimassedividen dentro de seisclasesprincipalesba- bajas,en algunoscasos,inclusoa temperaturas corporales
sadasen susfuncionesgenerales, con subgruposparadefi- en personascon fiebrealta.
nir susfuncionesmás precisas. Lasseisclasesprincipales En el otro extremodel espectro,algunasenzimascon-
son oxidoreduct*sts,transferasas,hidrolasas,liasas,isome- servanla actividada temperaturasexcepcionalmente altas.
rasasy ligasas.La Tabla 6.1 proporciona un ejemplo de La curvaverdeen la Figura6.4arepresentala dependencia
cadaclase,usandoenzimasque catalizanreaccionessetra- de la temperaturade una enzimapropia de lasarqueaster-
tarán mástarde en el texto. mófilas,ya mencionadasen el Capítulo 4. ¡Estosorganis,
El sistemaCE designatodaslasenzimasconocidascon mos crecenen manantialescalientesácidosa temperaturas
un número separadoen cuatro partes.Por ejemplo,EC tan altascomo 80 oC!Evidentemente, cadauna de lasmiles
3.4.17.I,esel códigode la carboxipeptidasa A. Losprime- de enzimasque estosorganismosnecesitanpara la activi-
ros tresnúmerosdefinenla clase,subclase y sub-subclase, dad celularnormal, debensercapacesde funcionar a tem-
y el número final esel número de serieasignadoala enzi- peraturasa las que sedesnaturalizanlamayorlade las en-
ma cuandofue añadidaa la lista.Así,la carboxipeptidasa A, zimasen las célulasde otros organismos,incluido usted.
esla primera entradaenla 17.usub-subclase de la cuarta
subclase de la clase3 (hidrolasas).
La listade enzimasque al pH. Las enzimastambiénson sensibles
Sensibilidad al
han sido clasificadasde estaforma, crececontinuamente pH. Muchassólo son activasdentro de un rango de pH de
con las quevan siendodescubiertas y caracterizadas. 3-4 unidades.Estadependencia del pH se debe,normal-
mente,a la presenciade uno o más aminoácidoscargados
Sensibilidad a la temperatura.Ademásde por su especifici- en el sitio activo o en el propio sustrato.La actividadde-
dady diverSidad, lasenzimassecaracterízan tambiénpor su pendede cómo esténestosgrupos,cargadoso sin carga.
sensibilidada la temperatura.Estadependencia dela tempe- Por ejemplo, en el sitio activo de la carboxipeptidasaA,
r44 6 Enzimas:
Capítulo loscatalizadores
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comocatalizadores
Enzimas bioló$cos
Temperatura
gra) estápresenteen el estómago,donde el pH normal-
c óptimapara
'o unaenzimahumana típica mentetiene valoresen torno a 2, mientrasque la tripsina
(U (línearoja) essecretada en el intestinodelgado,el cualtie-
c)
c)
ne un pH en torno a 8. Ambas enzimasson activasen un
! rangode casi4 unidadesde pH, pero difierenmucho en su
ñ(g
p pH óptimo, consecuentecon las condicionespropias de
susrespectivas localizacionesdentro del cuerpo.
q)
t46 Capitulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
Durante muchos años,los enzimólogosconsideraronel nas lateralesson grupos ácidos o básicos,que promueven
sitio activo como una estructura rigida. Comparaban el la catálisis.En el casode la carboxipeptidasaA, la unión del
ajuste de un sustrato dentro del sitio activo a una llave den- sustrato atrae a tres residuos aminoacílicos críticos al sitio
tro de una cerradura,analogíasugeridaen 1894por el bio- activo (una arginina, un glutamato y una tirosina).
químico alemán Emil Fischer.Esle modelo de cerraduray Los estudiosde difracción de rayosx de proteínas cris-
llaye, mostrado en la Figura 6.5a, explicó la especificidad talizadashan confirmado que realmentese producen estos
enzimáticapero hizo poco para acrecentarnuestro conoci- cambios, durante Ia unión del sustrato. La cristalografía
miento del evento catalítico. Un punto de vista más útil con rayos X se usa para determinar la forma de una molé-
acercade la interacción enzima-sustrato es el provisto por cula enzimática con o sin sustrato unido al sitio activo. La
el modelo de ajuste inducido, propuesto en 1985 por Da- Figura 6.6 ilustra los cambios conformacionalesque tienen
niel Koshland.Como ilustra la Figura 6.5b,estemodelo su- lugar tras la unión del sustrato ala lisozima,la enzima ya
pone que la unión inicial de la(s) molécula(s) de sustratoal mostrada en la Figura 6.2a,y parala hexoquinasa,una en-
sitio activo deforma la enzima y el sustrato,estabilizandoa zima que podremos encontrar de nuevo más adelante en
las moléculas de sustrato en su estadode transición y per- estecapítulo. En ambos casosse produce un cambio noto-
mitiendo que los enlacescríticos sean más susceptiblesa rio en la conformación de la molécula proteica, como res-
ataquescatalíticos. puesta a la unión del sustrato.En el casode la hexoquina-
La distorsión de ia enzima implica un cambio confor- ,u, po. ejemplo, la unión del sustrato (una molécula de
macional en la misma ¡ por tanto, en la configuración del D-glucosa) provoca que dos de los dominios de la enzima
sitio activo. Este cambio posiciona de forma óptima a los se doblen el uno hacia el otro, cerrando el pliegue del sitio
grupos reactivosapropiados de la enzima, para la reacción de unión alrededor del sustrato (Figura 6.6b).
catalíticaen la cual intervienen, aumentando asíla proba- El cambio conformacional al producirse la unión del
bilidad de que la reacción se produzca. EI cambio confor- sustrato, puede resultar en un desplazamientoextensode
macional aceÍcaal sitio activo a las cadenaslateralesde los grupos de aminoácidos dentro de la molécula proteica.
aminoácidos que son críticos para el proceso catalítico, ¡En el casode la carboxipeptidasaA, por ejemplo, la unión
pero {.ue no estánen las proximidades del sitio activo en la del sustrato hace que el residuo de tirosina de la posición
conformación no inducida. En muchos casos'estascade- 248 se mueva a I,2 nm, ¡una distancia aproximadamente
igual a una cuarta parte del diámetro de la molécula enzi-
q'Yc*e*(.8
mática!
.Y*\U/-
aCtlVO
- F)-[,(:)/
/ /a\ /
@ por Ia unión del inicial sustrato al sitio activo, no
sólo causauna mejor complementariedady un ajus-
(a) Lisozima
(b) Hexoquinasa
148 Capítulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
Q E I s u s t r a t oc o l i s i o ncao n e l
Complejo s r t i oa c t i v o d, o n d ee s m a n t e n i d o
enzima- p o ' e n l a c e ds e b r i e cs o r ^i o sg , u p o sR
sustrato d e o s a r i r o ¿ cr c o so e s i t i oa c t i v o .
L a u n i o nd e l s u s t r a t op r o v o c au n c a m b i o
contorr¡ao c n a e n l a e n z i m a r, e s p o n s a b l e
d e q u e e l s u s t r a t os e au n i d om á s
firmemente ( a l u s t ei n d u c r d o t
:t+ HrO
@ Elsitioacrivo
o<1¡ dicn^nrh é
paraotra
moiecula
de sustrato.
@ Sustrato
e5 colrverti0L)
e¡ pfocjuctos
O L o sp r c c l L r c t o s
5 0 ni o e f a t o s t
Fructosa
Figuta6.7 Cfclocatalíticode unaenzima, En esteejemplo,la enzimasacarasa
catalizalahidrólisis
de sacarosa
en glucosay fructosa.
Cinética
enzimática 149
Anexo
MoNos Y CACAHUETES
Si le parecióde utilidad el ejemplode los frijoles saltarines la puertay permitimos que los ansiososmonos pasena la
mejicanos,para entenderel conceptode energíalibre del Galeríade Cacahuetes.
Capltulo 5, qraá apreciela aproximacióna la cinética
enzimáticabasadaen la analogíacon una habitaciónrepletade el peladode cacahuetes
Comienza
monos (<enzimas>) y una cantidadvariablede cacahuetes Yaestamoslistospara nuestroprimer análisis.Comenzamos
pelados(<sustratos>). Tiate de entendercadapaso,primero en con una concentracióninicial de un cacahuetepor metro
términos de monos pelandocacahuetes, y luegocomo una cuadrado,y asumimosque,con estaconcentración,un mono
'
auténticareacción,catalizadaenzimáticamente. tarda como media9 segundosen encontrarun cacahuete yI
segundoen pelarlo.Estosignificaque cadamono necesita10
LaGaleríadelCacahuete segundospor cacahuete y por tanto puedepelarlosa una
Paranuestromodelo,necesitamosuna tropa de diez monos, velocidadde 0,1 cacahuetes por segundo.Como hay l0 monos
todos igualmenteexpertosen encontrary pelar cacahuetes, en la galería,la velocidadv de peladode cacahuetes para el total
Suponemostambién que los monos son incapacesde comeü de los monos esde 1 cacahuetepor segundo,con esta
siquiera,uno solo de los cacahuetes que pelan,pero pesea concentraciónde cacahuetes (la cual llamanos[S] para recordar
todo, sufrenuna necesidadcompulsivade seguirpelando. que los cacahuetes son el sustratode la acciónde pelar).Todo
(Parahacerel modelo algo más riguroso,podemosinsistir estosepuedetabular como sigue:
que los cacahuetes son una nuevavariedadhíbrida, que se
puederecomponerfácilmente,y que los monos,lo mismo [S] : concentraciónde cacahuetes I
La mayofa de las enzimass¡guenla cinética nes de sustrato cadavez más altas,se llama saturación.
de Michaelis-Menten Estaes una característica fundamentalde las reacciones
catalizadasenzimáticamente. Las reaccionescatalizadas
Desdehacemucho tiempo sesabeque la velocidadde una
siemprellegan a saturacióna concentraciones altas de
reaccióncatahtafiá;éMffiá'fíiáfoénti.aumentacon la con-
sustrato,mientrasqueestono ocurreen lasreacciones no
centraciónde sustrato,pero de tal forma, que cadaincre-
catalizadas.
mento adicional de sustrato,da como resultadoun au-
Gran parte de nuestracomprensiónde la relaciónhi-
mento menor de la velocidadde reacción.De maneramás perbólicaentre [S] y l sedebea los trabajospionerosde
precisa,sepuedeobservarexperimentalmenteque la rela-
dos enzimólogosalemanes,Leonor Michaelisy Maud
ción entre la velocidad inicial de reacción yy la concen- Menten.En 1913,postularonuna teorlageneralde la ac-
tración de sustrato[S] es una hipérbole,.oÁo ,. ilustra ción enzimática,que ha resultadoserla basepara el análi-
en la Figura6.8.Una propiedadimportantede estarela- siscuantitativode casitodoslos aspectosde la cinéticaen-
ciónhiperbólicaesquea medidaque [S]tiendehaciael in- zimática.Paraentendersu enfoque,considereuna de las
finito, y tiende hacia un valor miíximo, que dependedel posiblesreaccionescatalizadas enzimáticamentemás sim-
número de moléculasenzimáticas¡ por tanto, sólo puede ples,en la cual un único sustratoS seconvierteen un úni-
incrementarseañadiendomásenzima. co producto P.
La incapacidadpara aumentarla velocidadde reac-
ción más allá de un valor finito máximo a concentracio- S ---------+ P
Enzlma \El
(6.s)
150 Gapitulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
metro cuadrado.Como la cantidadde cacahuetes seha peladode 0,5 cacahuetes por segundoy mono, o 5 cacahuetes
triplicado,cadamono podrá encontrarun cacahuetetresveces por segundoen total.
másrápidamenteque antes,esdecir,que el tiempo que emplean Ya seempiezaa ver una tendencia.El primer triplicado
en encontrarel cacahuete,ahoraesde sólo 3 segundos.Dado de la concentraciónde cacahuetes aumentóla velocidad
que sesigueempleandoI segundoen pelar cadacacahuete, el 2,5veces,pero el siguientetriplicadosólola dobla.Esdecir,
tiempo total por cacahueteesahorade 4 segundosy la que Ia progresiónno eslineal.Puedever estoclaramentesi
velocidadde peladoes0,25cacahuetes por segundoy mono, es eligeuna concentraciónalgo mayor de cacahuetes y representa
decír,2,5cacahuetes por segundopara el total de los de monos. v en el eje/ (escalasugerida:0- 10 cacahuetes/segundo) y [S]
Estogeneraotra columnade entradaspara nuestratabla de en el ejer (escalasugerida:0-100cacahuetes/m2.¡. Como verá,
datos: los datosgeneranuna curvahiperbólicamuy parecidaa la de
Ia Figura6.8,y si observacuidadosamente susdatos,verápor
lSl = concentraciónde cacahuetes 1 quéla curvacontinúandoblándose,a medidaque [S]
(cacahuetes/m2) incrementa(esdecir,porquela velocidadincrementa
Tiempo requeridopor cacahuete: progresivamentemenosconforme aumentael número de
Paraencontrarlo(segundo/cacahuete) 9
cacahuetes): el tiempo de peladoesfijo y por tanto llegaa ser
3
un componentecadavezmás importante del total del tiempo
Parapelarlo (segundo/cacahuete) 1 I empleadopor cacahuete mientrasque el tiempo para
Total (segundo/cacahuete) l0 4 encontrarlo,escadavezmenor.Esprecisamente estetiempo
Velocidadde pelado: fijo de peladoel que establece el límite superioren la velocidad
Por mono (cacahuete/segundo) 0,10
de procesamiento del cacahuete,porqueinclusosi [S] fuera
infinita (o sea,en un mundo repletode cacahuetes), todavíase
Total (/) 1,0
precisaríaun tiempo finito de I segundoparaprocesarcada
cacahuete.
óQuéocuresi v y [S]cont¡núan
aumentando? Por último, ustedpuededarsecuentade que hay algo
Paradescubrirqué ocurre finalmentecon la velocidadde especialen la concentraciónde cacahuetes a la cual,el tiempo
peladosi Ia concentraciónde cacahuetesen la galeríaescada para encontrarlos,esexactamenteigual al tiempo de pelado
vez mayor,lo único que hay que haceresampliar la tabla de (éstaresultaserde 9 cacahuetes/m'). Esteesel punto de Ia curva
datos,suponiendoun incrementode los valoresde [S] V en el cual la velocidadde procesamientodel cacahuetees
calculandola correspondientey. Por ejemplo,una exactamentela mitad de Ia velocidadmáxima.De hecho,esuna
concentración triplicadade cacahuetes(de 3 a 9 referenciatan importante en la escalade concentración,que
cacahuetes/m2) conducea una reduccióndel tiempo-necesario ustedpodría estartentadode darleun nombre especial,sobre
por cacahuete,que ahoraseráde 2 segundos( 1 segundopara todo si sellamaraMichaelisy ¡estuvierahaciendoel mono con
encontrarloy otro segundoparapelarlo),con una velocidadde enzimasen vezde con cacahuetes!
Segúnla hipótesisde Michaelis-Menten,la enzima E Aquí, IS] esla concentracióninicial de sustrato,y esla velo-
qloecatalizaestareacciónreaccionaprimero con el sustrato cidad inicial de reaccióna esaconcentraciónde sustrato,y
S, formando un complejoenzima-sustrato transitorio,ES, V-o y K- sonparámetroscinéticosimportantesque consi-
que sufreluegola reaccióncatalíticareal,paraformar la en- deraremos enla próximasección. Éstaesla ecuaciónMichae-
zima libre y el productoR como semuestraen la secuencia lis-Menten, la principal de la cinéticaenzimática.(El Pro-
blema6.11al finaldelcapítulole daráunaoportunidadpara
Er+s * tt {ie,+r (6.6)
deducirpor sí mismo la ecuaciónde Michaelis-Menten.)
donde E¡ es la forma libre de lu .rrri-u, S es el sustrato,ES
es el complejo enzima-sustrato,P es el produ cto,y k1,k2,k3
y knson las constantesde velocidad para las reaccionesin- ¿Cuáles ef significado
de V^,y K^?
dicadas. Paravalorarlasconsecuencias de la relaciónentrevy [S] y
Comenzando con este modelo y suponiendo varias examinarel significadodelos parámetrosV-u*y K-, pode-
simplificaciones, Michaelis y Menten llegaron a la siguien- mos considerartres casosespeciales de concentraciónde
te relación entre la velocidad de una reacción catalizada sustrato:concentraciónde sustratomuy baja, concentra-
enzimáticamentey la concentración de sustrato: ción de sustratomuy altay el casoespecial de [S] : K-.
y^""Is]
v: -=------.^: (6.7) de sustratomuyba¡a([S]< K,). A
Caso1: concentración
K- + LSl concentraciónde sustratomuy baja, [S] es despreciable
Cinética
enzimática 1 5 1
Esto nos proporciona una definición de V-*, uno de
los dos parámetros cinéticos de la ecuación de Michaelis-
Menten. V-u" es la velocidad máxima, o el valor límite su-
s perior, al cual tiende la velocidad de reacción inicial v
E cuando la concentracióndel sustrato [S] seacercaal infini-
.O
-c to. En otras palabras,V-",es la velocidad a concentración
ñ 7\/
p
o 2'max saturante de sustrato.En estascondiciones,toda molécula
O
enzímática está ocupada, casi todo el tiempo, en el proceso
a)
real de la catálisis,puesto que Ia concentración de sustrato
es tan alta que, casi alavez que se libera una molécula de
producto, llega otra molécula de sustrato al sitio activo.
Por tanto, el límite superior de V-u, se determina por
Concentración
de sustratoLSI 1) el tiempo necesariopara la reaccióncatalíticareal más la
K
m
liberación subsiguientedel producto desdela superficiede
cadamolécula de enzima,y2) eInúmero de moléculaspre-
Figura6.8 Relaciónentre la velocidadde leaccióny la
sentes.Debido a que la velocidad real de la reacción es li-
concentlaciónde susttato, Parauna ¡eacción catalizada
enzimáticamente, que siguela cinéticade Michaelis-Menten,la mitada, la única manera de que la V-", pueda aumentar es
velocidad inicial tiende hacia un límite superior de velocidad V*u* incrementando la concentración de la enzima. De hecho,
a medida que la concentraciónde sustrato[S] tiende hacia V-u* es linealmente proporcional a la cantidad de enzima
el infinito. La constantede Michaelis-MentenK- corresponde presente,como se muestra en la Figura 6.9.
a la concentraciónde sustratopara la cual la reaccióntiene lugar a
la mitad de la velocidadmáxima.
Caso3: ([S] = l(r). Hasta el momento, hemos visto Ia ra-
zón para Ia cinética de las reaccionesde primer orden a
comparada con Ia constante K. del denominador de Ia concentracionesde sustratobajasy para cinéticasde orden
ecuación de Michaelis-Menten, por lo que podemos es- cero a concentracionesaltas.También hemos formulado la
cribir definición para V-u*, pero todavía tenemos que descubrir
el significado del segundo parámetro cinético, K-. Fíjese
,,_ v."*[S].- v."*[s]
' - (6.8) que con independenciade su significado, K- parecetener
K-+lsl K- algo que ver con la determinación de cuánto de baja debe
Por tanto, a concentración de sustratomuy baja, la ve- ser la concentración de sustrato,para asegurarla cinética
locidad inicial de reacción es más o menos proporcional a de primer orden, o bien, cuánto de alta debe ser,para ase-
la concentración de sustrato.Éstaes,por tanto, la regiónde gurar la cinética de orden cero.De estamanera, K- parece
primer orden de la gráfrcade Michaelis-Menten. Mientras ser un punto de referencia en la escalade concentración
la concentración del sustrato sea mucho más baja que el que determina cuánto de alto es alto y cuánto de bajo es
valor de K-, la velocidad de una reacción catalízada enzi- bajo. Para explorar su significado de manera más precisa,
máticamente, aumenta casi linealmente con la concentra- considere el caso especial en el que [S] es exactamente
ción de sustrato.
r52 Capitulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
iguala K^. Bajoestascondiciones,
la ecuaciónde Michae- V-* también puede usarse para determinar otro pará-
lis-Mentensepuedeescribircomo metro útil llamado número de recambio (K."J, que expre-
y-*[s] sa la velocidad a la cual las moléculas de sustrato se con-
Y: : v_u"[s]: v-* (6.r0) vierten en producto por una única molécula de enzima,
K*+tsl ,rsl 2 cuando ésta está funcionando a su máxima velocidad. La
Estaecuaciónnos proporciona la definición que hemos constante (u, se expresa en unidades de tiempo inverso
(s-', por ejemplo) y se calcula como el cocienteentre V-*
estadobuscando: K- es la concentración de sustrato para
la cual la reacción tiene lugar a la mitad de su velocidad y [E,], la concentración de la enzima en moles/litro:
máxima. Esta concentración es un valor fijo para cada en- t' /m u
r
zima que cataliza una reacción determinada bajo unas '-cat
fl !Ff l I
(6.u)
condiciones específicasy se denomina constante de Mi-
chaelis (de ahí su abreviaturaK-) en honor al enzimólogo El número de recambio varía mucho entre enzimas,
que dilucidó su significado.La Figura 6.8 ilustra el signifi- como se apreciaen los ejemplos dados enlaTabla 6.2.
cado de V-u,y de K-.
La gálicadoblerecíproca
es unaformaútil
¿Porquéson importantesVr.* y Kmpa¡alos Biólogos de representar
losdatoscinéticos
celulares?
La gráfi,ca
clásicade Michaelis-Menten de y frentea [S],tal
Ahora que entendemos lo que significaDV-* y K-, debe-
y como semuestraen Ia Figura6.8,esuna representación
mos preguntarnos por qué estosparámetroscinéticosson
fiel de cómo Ia velocidaddependede la concentración de
importantesparalos biólogoscelulares. El valor de K. es
sustrato,pero no es una herramientaespecialmente útil
útil, porquenos permitecalcularen quéparteen la repre-
paraladeterminacióncuantitativade los parámetrosciné-
sentaciónde Michaelis-Menten de Ia Figura6.9, estáfun-
ticosclavesK^y V^u*.Suforma hiperbólicahacedifícil ex-
cionandouna enzima(suponiendo,por supuesto,que la
trapolarconprecisiónel parámetrocrítico V^^*,a concen-
concentración de sustratoen la célulaesconocida).Pode-
tración infinita de sustrato,y si V.u* no es conocidacon
mos entonces calculara quefracciónde Ia velocidadmáxi-
precisión,K- no se puededeterminar.Esteproblemase
ma esprobableque Ia reaccióncatalizadaenzimáticamen-
apreciaen la Figura6.9,en la que seríadifícil calcularV-u*
te tengalugaren la célula.Además,K- sepuedeconsiderar
si no estuvieraya dibujada,y sin V-u*,K- tampocopuede
como un cálculoaproximadode la <calidad> esuna enzi-
sercalculadafácilmente.
ma, en el sentidode que,cuantomásbajo esel valor K-,
Parasolucionaresteproblemay proporcionarun enfo-
más bajo es el rango de concentraciónde sustratoen el
que gráfico más útil, Hans Lineweavery Dean Burk con-
cual la enzimaeseficaz*.Losvaloresde K- paravariasen-
virtieronla relaciónhiperbólicade la ecuaciónde Michae-
zimasaparecen en la Tabla6.2.
lis-Mentenen una función linealinvirtiendoamboslados
La V-"* de una reacciónparticularnos proporciona
de la Ecuación6.7y simplificandola expresiónresultante
una medidadela tasade reacción.Realmente sonpocaslas
con la forma de una ecuaciónparauna línearecta:
enzimasque se encuentran,in vivo, con concentraciones
saturantesde sustrato,de maneraque las enzimasrara- 1_ K.+[S] K* [S]
_ _,
mentevan a funcionarlejosde susvelocidades miíximas, v V-o[S] Y-*[S] Y.".[S]
en condicionescelulares. Sin embargo,conociendolos va-
lores de V-",, K-, y la concentraciónde sustratoen vivo, 'l
podremosal menosestimarla velocidadprobablede la - K^ lf * I (6.r2)
reacción,en dichascondiciones celulares. v^* \lsl / v_*
del(, y k r, paraalgunas
Tabla6.2 Valores enzimas
Nombre
de la enzima Sustrato ,(' (M) k n(s-")
Acetilcolinesterasa Acetilcolina g x 10-s 1 , 4 9x 1 0 4
Anidrasacarbónica Cot 1 X 10-2 1 X106
Fumarasa Fumarato 5 X 10-Ó g xl02
Triosafosfatoisomerasa Gliceraldehído3-fosfato 5 X 10-4 4,3 x 103
B-lactamasa Bencilpenicilina 2 X 10-s 2 Xl03
* K- se considera a menudo como una medida de la afinidad de una enzima por sus sustratos,es decir, como la constantede disociación para ES.
Sin embargo,
es una relación de las constantesde velocidades:K^ : (k, + k) I h, Para conocer las consecuenciasde estarelación, véaseelPrcblema 6.I I a1final del capítulo.
Cinética
enzimática 1 5 3
La Ecuación6.12 esla ecuaciónde Lineweaver-Burk. Intersección
Cuandoéstaserepresentacomo Ilv frentea l/[S], como con el eje y = V^
*l K^
en la Figura 6.10,la gráfrcadoble recíprocaresultante es
lineal,con una intersecciónde IIV^^ con el ejey, otra de vV^uv -
=
ra1 ,K K
-llK^,con el ejex,yunapendienteK^lV^o. (Puedecon- Lvl .m '.m
154 Gapítulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
naspropiedades especialesque la alejende la cinéticade
püüwwwffiwry
I-'t |--t |-1 t-1 t-1 t-T t-T |-1 t-1
Númerode tubo:
lBll 1ll2ll3ll4ll5ll6ll rllsl Michaelis-Menten.
La curvahiperbólicade Ia Figura6.12ilustrala necesi-
[S]= lglucosal
(mM):
dad de recurrir a un análisislineal, porque no se pueden
v (pmol/min):
obtener,ni V-*, ni K-, a partir de los valoresde la repre-
sentaciónhiperbólica,aunquese dispongade los datos
Bliiii para construir la curva.Sin embargo,la representaciónli-
f
a
nealdoblerecíprocade la Figura6.13,sí lo permite.Para
OE
obtenerlos datosmostradosaquí,se calcularonlos recí-
procosde cadavalorde [S]y v dela Figura6.12.Asi,losva-
-tr loresde [S] de0,05-0,40 mM, generanrecíprocos de20-2,5
'6*
mlullt, y los valoresde v de 2,5-7,3¡.rmol/min,arrojanre-
¡O
,, - /t"" [S] cíprocosde 0,4-0,14min/¡rmol.Dadoquesonvaloresrecí-
K* + [S] procos>el dato del tubo I es el más alejadodel origen,
-oOcA)
mientras que cadatubo sucesivo,alcanzaráun valor más
próximo al origen.
o
- 0: Cuandoestosdatossevan uniendo por medio de una
0,10 0,20 0,30 0,40 línearecta,la interseccióncon el eje7 coincidgcon el valor
[S]= Concentración
de glucosa
(mM) '.
0,1min/mmol, y la del ejex" con -6,7 mluf Desdeestas
Figwa 6.L2 Estudioexpeilmentalde la cinética de la reacciónde la intersecciones con los ejes,podemoscalcularque V-o :
hexoquinasa. Seincubó una seriede tubos de ensayocon 1/0,1 10 prmol/miny K- : -(ll-6,7) : 0,15mM. Si
:
concentracionescrecientesde glucosay una concentración saturada ahora volvemosa la representaciónde Michaelis-Menten
de ATR añadiendo una cantidad estándarde hexoquinasa.La
de la Figura6.12,podremosver queambosvaloressonra-
velocidad inicial de la aparición del producto, v, se representócomo
una función de la concentración del sustrato [S]. La curva es zonablesporquepodemosimaginarfácilmenteque la re-
hiperbólica, acercándosea V-*, a medida que la concentración de presentaciónestá creciendohiperbólicamentehasta un
sustrato escadavez mayor. Parala representacióndoble recíproca miíximo de l0 nmollmin. Más aún, Ia gráfrcaalcanzala
derivadade estosdatos,véaselaFigura 6.13. mitad de su valor a una concentración de sustratode 0,15
Cinética
enzimática 1 5 5
mM que esel datodel tubo 3. Éstaes,por supuesto,
la K- dasy gasesnerviososseantan tóxicos.Estassustanciasse
de la hexoquinasapara la glucosa,generalmenteescrita unen irreversiblemente a la acetiLcolinesterasa,
una enzima
como K-,r1u.oru. queesfundamentalparala transmisióndel impuso nervio-
Además, la enzima tiene una K- para el otro sustrato, so (véaseCapítulo 13).La inhibición de la actividadacetil-
Km,Arp,quesepodría calcularvariando la concentraciónde colinesterasa llevaa una parálisisrápidadelasfuncionesvi-
ATP mientras se mantiene la concentración de glucosa a tales¡ por tanto, a la muerte.Uno de talesgasesnerviosos
un valor alto y fijo. Curiosamente, la hexoquinasa fosfori- esel di-isopropilofluorofosfafo,el cualseune covalentemen-
la, no sólo a la glucosa,sino también a otras hexosas,te- te al grupo hidroxilo de una serinacríticadel sitio activode
niendo un valor distinto para cadauna. La K^para fructo- la enzima,a la cualinactivapermanentemente.
sa,por ejemplo, es 1,5mM 1ocual significa que necesita10 Muchastoxinasnaturalessontambiéninhibidoresen-
vecesmás de fructosa que de glucosa, para mantener la zimáticosirreversibles. Por ejemplo,el alcaloidefsostigmi-
reacción a la mitad de su velocidad miíxima. na,un componente del habade Calabar(Nigeria),estóxi-
Aunque ligeramente simplificada e idealizada,esta es la co paralos animalesporqueinhibe irreversiblemente a la
manera en que los enzimólogos abordan el estudio de las acetilcolinesterasa.El antibióticoDenicilinqesun inhibidor
reacciones catalizadasenzimáticamente. Sus análisis son a irreversibled. tut
menudo más complicadosy casisiempreprecisande un or- de la paredcelularbacteriana. La penicilina,por tanto,es
denador para calculary trazar los datos doblesrecíprocosy eficazen el tratamientode infecciones bacterianas, porque
determinar los valores de K- y de,V-o, pero el enfoque bá- impide la formaciónde las paredescelularesde bacterias.
sico es el mismo que el ilustrado en las Figuras6.12y 6.13. Por contra,un inhibidor reversibleseune a una enzi-
ma de forma disociable, no covalente, de maneraqni lut
formas libres y unidas del inhibidor existenen equilibrio
Losinhibidores actúanirreversible
enz¡máticos o
las unascon las otras.Podemosreplesentartalesuniones
fevefsiblemente
Hastaaquí,hemosasumidoquelasúnicassustancias enlas
E + Ii-EI (6.14)
célulasque afectana las actividadesde lasenzimasson sus
sustratos.Sin embarso,las enzimastambiénestáninflui- siendoE la enzimalibrey activa,Iel inhibidor,y EI el com-
'
daspor productos,sustratosalternativos, sustratosanálo- plejo inactivo enzima-inhibidor.Evidentemente, la frac-
gos,drogas,toxinasy una claseimportantede reguladores ción de la enzimaqueestádisponibleen la célulaen forma
I^ ^aot 4rrtofgt-olgltérir^. Muchas de estassustancias activa,dependede la concentracióndel inhibidor y de la
-tienen un efectoinhibidor en la actividad enzimátíca,re- estabilidad del complejoenzima-inhibidor.
duciendo(o incluso anulando)la velocidadde reacción Lasdosformasmáscomunesde inhibidoresreversibles
con el sustratodeseado. seclasificancomo inhibidorescompetitivos e inhibidoresno
Ebtainliiliiiió:n dé la actividadde la enzimaesimpor- competitivos.
tantepor variasrazones.La primeray principal,esque Ia vo de la ertzimay por lo tanto compite directamentecon
inhibiciónenzimáticadesempeña un papelvital comomé- las moléculasde sustratopor el mismo sitio de la enzima
canismode controlen lascélulas.Comodiscutiremos en el (Figura6.14a),reduciendosu actividad,-hasta el punto de
próximo apartado,muchasenzimasse sometena regula- quelossitiosactivosdelasmoléculasde enzimapuedente-
ción por moléculaspequeñasespecíficas distintasde sus ner unidas,en cuálquiermomento,moléculasdel inhibi-
sustratos.La inhibición enzimáticatambiénesimportante dor,en lugarde moléculasdel sustrato.
en la acciónde drogasy toxinas,Iascualesejercenfrecuen- Un inhibidor no competitivo po-r-g1lglgdq,se une a la
tementesusefectosinhibiendoenzimasespecíficas. Losin- sgegsr"aell sl4ry stlffi{iiió dél-
sitio
hibidorestambiénson útilespara los enzimólogoscomo por
áai ro. talió,nó6lo?frea "Tiñ;Aie
fa;ñiónelsustñió 6iéiin
herramientaspara el estudiode los mecanismosde reac- embargoinhibe la actividadde la enzimaporque la unión
ción. Son especialmente importantesen esteúltimo caso, del inhibidor con su sitio específico,reduceenormemente
los análogosde sustratos,compuestosque se asemejanal o incluso suprime la actividad cataliticaen el sitio activo
sustratorealpero que son químicamenteincapaces de IIe- (Figura6.14b)
var a cabola reacción.
Losinhibidorespuedense¡reversibles o irreyersíbles.Un
inhibidor irreversibleseune a la enzimaconvalentemente, Regulación enzimática
causandouna pérdidairrevocablede la actividadcatalítica.
No sorprendeque los inhibidoresirreversibles seannor- Para entender el papel de las enzimas en la función celular,
malmentetóxicosparalascélulas.Losionesde metalgspe- debemos saber que es muy infrecuente, que la mejor op-
sadosson,a menudo,inhibidoresirreversibles, al igual que ción para una célula,seapermitir funcionar a éstasa velo-
suelenserlolos agentesalquilantesy los gasestóxicosner- cidades indiscriminadamente altas. En su lugar, las veloci-
viosos.Éstaes,de hecho,larazónde quemuchosinsectici- dades de las reacciones catalizadas enzimáticamente y las
156 6 Enzimas:
Capitulo loscatalizadores
delavida
.. Sustrato Productos Productos
.i.l':3l),H"
tí trb
/^\
&\, ,s,
[/ {-t
1lrra,nn,o,oo,,
I -lb Ausenc¡a
r Fr oe rormaoon
\ E J deproductos
\=/
(a) lnnibicióncompetitiva.Tantoei inhibidor,como el sustrato, (b) Inhibiciónno competitiva.El inhibidory el sustratose unen
se unenal sitioactivode la enzima,La uniónde un inhibidor La uniónde un inhibidordeformala
a sitiosdiferentes.
impldeque el sustratose una,inhibiendo,por tanto,la enzima,disminuyendo la probabilidadde la unióndel
actlvidadenzimática. SUSTTAIO.
rutas bioquímicas de las que forman parte, deben ajustarse nectar o desconectara las enzimas o aiustar susvelocidades
continuamente, para mantenerlas sintonizadas,de forma de reacción, modulando apropiadamente las actividades
precisa,con las necesidadesde la célula.Un aspectoimpor- de las enzimas.
tante de ese ajuste reside en la capacidad de la célula de Casi invariablemente,una enzima que se regula por tal
controlar las actividadesde la enzima con especificidady mecanismo, catalizael primer paso de una ruta de múl-
precisión. tiples etapas. La secuencia completa se controla, incre-
Ya hemos visto una variedad de mecanismosregulado- mentando o reduciendo Ia velocidad a la cual funciona la
res,incluyendo cambios en las concentracionesde sustrato primera etapa. Entre las rutas que se regulan así, se en-
(y de producto), alteracionesen el pH, y la presenciade in- cuentran las de ruptura de moléculas grandes (como azú-
hibidores. ta ¡cgulación que depende directamente de las cares,grasaso aminoácidos) y las que conducen a la sínte-
interaccionesentre lg! t@ sis de sustancias necesarias para la célula (como
zima, se llama reg¡la_c_iQn pqr el sustrato..Tal y como se aminoácidosy nucleótidos).Ahora discutiremosla regula-
desprendede la ecuación de Michaelis-Menten, los incre- ción alostéricayla modificación covalentede una manera
mentos en la concentración de sustrato tienen como introductoria. con Ia intención de volver a estosmecanis-
resultado un aumento en la velocidad de reacción (véase mos a medida que encontremos ejemplos específicosen
Figura 6.8). Por el contrario, los incrementos en la concen- capítulosposteriores.
tración de producto reducen la velocidad a la cual el sus-
lrato se convie la Lasenzimas se regulan
alostéricas pormoléculas
concentración de producto es porque vtiene que ser iden- delosreactivos
diferentes y losproductos
tificado como la velocidad de reacción inicial en Ia ecua-
La regulaciónolostéricaes el único mecanismo importante
ción de Michaelis-Menten, tal y como viene dado por la
Ecuación 6.7. Si una cantidad significativa de producto de control, por el cual Ia tasa de las reaccionescatalizadas
esfáya presente,o se acumula durante el curso de Ia reac- enzimáticamente,se aiustaa las necesidadescelulares.Para
ción, la ecuaciónsemelve más compleja que ia forma sim- entender este-modo áé ieguiaciOn,considerela vía por la
ple en que la hemos considerado.) cual una célula convierte un precursor A en un producto
La regulación por el sustrato es un importante meca- final R mediante una serie de intermediarios B, C y D, en
nismo de control en las células,pero no es suficiente para una secuenciade reaccionescatalizadasrespectivamente,
la regulación de]a mayoría de las reacciones o secuencias por las enzimasE1,E2,E3y Ea:
de reacciones.En la mayoria de las rutas, Ias enzimas se re- A --;-t l B --;-F t C --;-L , D --;-+
rc
P (6.1s)
gulan también mediante otros mecanismos. Dos de los
más importantes sonla regulación alostéricav la modirtca' El productoP podríaser,por ejemplo,un aminoácido
ción,covalente.Estosmecanismospermiten a las célulasco- quela célulanecesitaparala síntesisde proteínas,y A po-
Regulación
enzimática t57
l-
.-v;;;;:.
de la reducción de A o una excesivaacumulación de P (o
I
cH.
ambos). Estáclaro que los interesescelularesquedan mejor
satisfechoscuando la ruta no estáfuncionando a su miíxi-
ma velocidad o incluso a una velocidad constante,sino a
-'1
i-
una velocidad,cuidadosamentedeterminadapor la necesi-
dad de P. De alguna manera, las enzimas de estavía deben
ser sensiblesal nivel celular del producto P,al igual que una
calderanecesitaser sensiblea la temperatura de Iashabita-
lntermeo¡a¡á
Á-l
cionesque pretendecalentar.En el último caso,un termos-
I
tato proporciona el vínculo regulador necesario entre la Enzima2
I
calderay su <producto>,el calor. En nuestro ejemplo de la -o V
enzima,la regulación deseadaesposible porque el produc- Intermediario
B
)Qr cú
to P es un inhibidor específicode E,,la enzima que catali- .o.E E
zalaprimera reacción de la secuencia. I E n z i m a3
Este fenómeno es llamado retroinhibición (o inhibi-
' có@
lri
o uc ú
6 c)
t
ción por el producto final) y se representapor la flecha de Intermediarlo
C
;vñE Y
líneasdiscontinuas que conectael producto P con la enzi- v
II
.. 1) -
Enzima 4
ma E1,en la siguientevía: fxx V
A -;- S C -E- D (6.16) oo
-q)
lntermediarlo
D
l- I'P
II E n z i m a5
Retroinhibiciónde El medianteP v
De manera más general, una retroinhibición sucede
o
cadavez que un producto metabólico inhibe a una de las c-o-
enzimasimplicada en la vía por la cual eseproducto sesin- I Productofinal
H -?l+ N - C - H (isoleucina)
tetiza. La retroinhibición es uno de los mecanismos más
comúnmente usadospor las célulaspara asegurarque las H-C-CH"
actividades de las secuenciasde reacción se aiustan a las t"
CH,
necesidadescelulares. t-
La Figura 6. l5 proporciona un ejemplo específicode tal CH^
secuencia-la ruta de cinco pasosen la que el aminoácido
isoleucinase sintetiza a partir del aminoácido treonina-.
En estecaso,la primera enzima en la vía, la treonina des- Figura6.15 Regulación alostéricadela actividadenzimática.La
rutadesíntesisdelaminoácido isoleucinaa partirdetreonlna,es
aminasa,seregulamediante la concentraciónde isoleucina
un buenejemplode retroinhibición. Laprimeraenzimadela
en la célula. Si se estáconsumiendo isoleucina (por ejem- secuencia,
la treorrina
deaminasa, esinhibidaalostéricamente por la
plo, en la síntesisde proteínas),su concentraciónserábaja. isoleucina,
Ia cualseunea la enzimaen un sitio diferente
d,elsitío
En estascondiciones,la treonina desaminasaestá activa y actlvo.
la vía funcionapara producir más isoleucina, de manera
que se satisfacela necesidadreal de esteaminoácido. Si los ción 6.16) ser sensiblea la concentración de una sustancia
requerimientos de isoleucina decrecen, ésta empezará a P que no es ni su sustrato ni su producto inmediato? O,
acumularse en la célula y el incremento de su concentra- volviendo a la Figura 6.15, ¿cómo puede la actividad de la
ción conducirá a una reducción de la actividad de la treo- treonina desaminasaser sensiblea la concentraciónde iso-
nina desaminasay, por ende,de Ia velocidad de síntesisdel leucina, cuando su estructura difiere tanto de la de la treo-
aminoácido. nina, que es improbable que seareconocida por el centro
activo de la treonina deaminasa?
Regülación alostédca. ¿Cómo puede la primera enzima en Esta pregunta fue respondida por primera vez en 1963
una vía (por ejemplo, la enzima E, en Ia secuenciade Reac- por |acquesMonod, Jean-PierreChangeux y Frangois Ja-
158 Capítulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
cob. Aunque basadainicialmente en datos incompletos, su alostérica puede existir en una forma compleja o simple,
modelo fue rápidamente tenido en consideracióny se de- dependiendo de si tiene una molécula efectora unida a ella
sarrolló hastallegar a ser la basede nuestro entendimiento o no. El efector se une a la enzima debido a la presencia en
de Ia regulación alostérica. El término alostéricoderiva del la superficie de ésta de un sitio alostérico (o regulador),
griego <otra forma (o estado)>,indicando, por lo tanto, que es distinto del sitio activo en el cual tiene lugar el even-
que todas las enzimascon capacidadde regulación alosté- to catalítico. Así, una característica distintiva de todas las
rica, pueden existir en dos estadosdiferentes. En una de las enzimas alostéricas(y otras proteínas alostéricas) es la pre-
dos formas, la enzima tiene una afinidad alta por su(s) sus- senciaen la enzima dew sitio activo al que se une el sustra-
trato(s), mientras que en la otra, tiene poca o ninguna afi- to y un sitio alostéricoal que se une el efector. De hecho,
nidad. Las enzimas con estapropiedad se llaman enzimas algunas enzimas alostéricastienen multiples sitios alostéri-
alostéricas. Las dos fognas dife:e-ntes-deuna en-ima alq,s- cos, cada uno capaz de reconocer un efector diferente.
térica qqq fácilmp-q1elntelga¡lyqrtlbl€Ey€sté!-de¡scha.qn Un efector puede ser, o bien un inhibidor alostérico o
equilibrio una con otra. Obviamente, la velocidad de reac- bien un activador alostérico, dependiendo del efecto que
ción es alta cuando la enzima está en la forma de alta afini- ejerza cuando se una al sitio alostérico de la enzima, es
dadybaja,o incluso nula, cuando Ia enzima estáen su for- decir, dependiendo de si la forma compleja es el estadode
ma de baja afinidad. baja afinidad o alta afinidad de la enzima (Figura 6,16).La
El que se favorezcala forma activa o inactiva de una en- unión de un inhibidor alostéricocambia el equilibrio entre
zima alostérica depende de la concentración celular de la las dos formas de la enzima para favorecerel estadode baja
sustanciareguladora apropiada, llamada efector alostérico. afinidad (Figura 6.16a).La unión de una activador alosté-
En el casode la síntesisde isoleucina,la enzima alostéricaes rico, por otra parte, cambia el equilibrio a favor del estado
la treonina desaminasay el efector alostéricoes la isoleuci- de alta afinidad (Figura 6.16b). En cada caso,la unión del
na. De manera más general,un efectoralostéricoes una pe- efector al sitio alostéricoestabilizala enzima en una de sus
queña moléculaorgánica que regula Ia actividad de una enzi- dos formas, incrementando o disminuyendo de esemodo
m6 para Ia cual no esni el sustrato,ni eIproductoinmediato. la probabilidad de unión al sustrato.
Un efector alostérico influye én la actividad de la enzima La mayoría de las enzimas alostéricas son proteínas
uniéndose a una de las dos formas interconvertibles de ésta, grandes,multiméricas y con un sitio activo o un sitio alos-
estabilizándolaen eseestado.En otras palabras,una enzima térico en cada subunidad. De hecho, los sitios activosy los
Sitio Sitlo
activo Sitio activo
",":i:?."
ffsustrato -¿
,.--.t'oxto'
L¡ \
alostérico
al*'h
\--,\-:/
\ -_(jr.-?
r't1x Y
Escasao nula
formación
de producto
Formade altaafinidad Formade bajaafinidad
de la enzima de laenzima
fflI
il.--lnnroroor
arostérico n lk c-mg:l;;
"\l productos
^
lt Escasao nula
formación
de producto
pl^fl"b.€-.4
\-/\-:/
-
[\1/ V
Formade bajaafinidad Formade altaafinidad
de la enzima de la enzima
(a) tnnibiciónalostérica.Una enzimasusceptiblede (b) Activac¡ón alostérica. Una enzimasusceptiblede
inhibiclónalostéricaes act¡vaen la formalibre,la cual activaciónalostéricaes inactlvaen su formalibre,la cual
tieneuna altaafinidadpor sus sustratos(S).La uniónde tieneuna afinidadbaja por su sustrato.La uniónde un
un inhibidoralostérico(en rojo)estabilizala enzimaen su activadoralostérico(en verde)estabilizala enzimaen su
formade baja afinidad,resultando en poca o nula formade baja afinidad,activandoa la enzima.
actividad.
Resulación
enzimática L59
sitiosalostéricosestánnormalmenteen diferentessubuni- procesoinverso,la defosforilación,estácatalizadopor en-
dadesde la proteína,a lasque denominamossubunidades zimas llamadasproteín-fosfatasase implica la elimina-
catalíticas y subunidades reguladoras, respectivamente ción de un grupo fosfatodesdela proteínafosforilada.
(fijeseen lassubunidadesC y R de lasmoléculasde la enzi- Estaforma de regulaciónesla de la glucógeno fosforila-
ma que semuestranen la Figura6.16).Estosignifica,con- sa,rrna enzimaque seencuentraen las célulasmusculares
secuentemente, quela unión delasmoléculasefectorasa los esqueléticas (Figura6.I7).La enzimahidrolizael glucóge-
sitiosalostéricos,
no sólo afectaa la forma de lassubunida- no por eliminacionessucesivas de unidadesde glucosa,en
desreguladoras, sino tambiéna lassubunidadescatalíticas. forma de glucosa-1-fosfato (Figura6.I7a). La regulación
de esta enzimadimérica se consigueen parte por la pre-
Lasenzimasalostéricasman¡f¡estan
interacciones senciaen lascélulasmuscularesde dosformasinterconver-
cooperativas
entresubun¡dades tiblesde la enzima,una forma activallamadafosforilasaay
otra inactiva,llamadafosforilasab (Figura6.17b).Cuando
Muchasenzimasalostéricasposeenuna propiedadconoci-
senecesitahidrolizar glucógenoen las célulasmusculares,
da'comocooperatividad.Estosignificaque,a medidaque
la forma inactiva b de la enzimapasaa la forma activaa,
los múltiples sitios catalíticosunen moléculasde sustrato,
por adición de un grupo fosfatoen una serinaespecífica,
la enzimasufrecambiosconformacionales, queafectana la
en cadauna de las dos subunidadesde la fosforilasa.Esta
afinidad de los restantessitiosde unión del sustrato.Algu-
reacciónsecatalizapor la fosforilasaquinasayel resultado
nasenzimasmuestrancooperatfuidad positiva,en la cual la
esun cambioconformacionalen la fosforilasa.Cuandono
unión de una moléculasustratoa una subunidadcatalítica
senecesitahidrolizar más glucógeno,los gruposfosfatola
incrementala afinidadde otrassubunidadescatalíticaspor
fosforilasaa son éliminadospor la enzimafosforilasafosfa-
el sustrato.Otrasenzimasmuestrancooperativad negativa,
tasa.(La glucógenosintasa,la enzima que añadenueyas
en la cual el sustratounido a una subunidadcatalíticare-
unidadesde glucosaa la cadenade glucógeno,respondede
duce la afinidad de otros sitios catalíticospor el sustrato.
forma opuesta;esinactivaen la forma fosforiladay seacti-
El efectocooperativopermite a las célulasproducir en-
va por defosforilación.)
zimasque son más o menossensiblesa los cambiosen la
concentraciónde sustrato,lo que por otra parte,seríapre- Ademásde la regulaciónpor los mecanismosde fosfo-
deciblepor la cinéticade Michaelis-Menten.La cooperati- rilación/defosforilación dela Figura6.l7,la glucógenofos-
vidad positivahaceque la actividad cataliticade la enzima forilasa es también una enzima alostérica,que se inhibe
se incrementemás rápido de lo normal a medida que la por glucosay ATR y seactivapor AMP. Si una señalhor-
concentracióndel sustratoaumenta,mientrasque la coo- monal provocala fosforilación¡ por tanto,activaciónde la
peratividadnegativasignificaque la actividad enzimática fosforilasaen una célulamuscular,que aún poseesuficien-
aumentamáslentamentede lo esperado. te de glucosa,ésta inhibirá alostéricamentea la enzima,
hastaque searealmentenecesaria. Por otra parte,las célu-
lasmuscularesquetengannivelesbajosde glucosa,podrán
Lasenzimastambiénse puedenregularpor la adiclón
beneficiarseinmediatamentedela conversióndela fosfori-
o eliminaciónde gruposquím¡cos
lasaa la forma activa.
Muchasenzimas,adernásde la regulaciónalostérica,están La existenciade dosnivelesde regulaciónparala glucó-
sometidasa control mediantemodificacionescovalentes. genofosforilasa,ilustraun aspectoimportantede la regula-
En estamanerade regulación,la actividadde una enzima ción enzimática.Muchasenzimasse controlan por dos o
seve afectadapor la adición o eliminaciónde gruposquí- másmecanismosreguladores, y de esemodo,permitena la
micosespecíficos. Lasmodificacionescomunesincluyenla célularesponderadecuadamente frentea variassituaciones.
adición de gruposfosfato,gruposmetilo, gruposacetilo,o
derivadosde nucleótidos.Algunasde estasmodificaciones Ruptutaprcteolítica. Un tipo diferentede activacióncova-
pueden ser reversibles,mientras que otras no. En cada lente de enzimasconsisteen la eliminaciónirreversiblede
caso,el efectode la modificaciónesla activacióno la inac- un fragmento de la cadenapolipeptídica,mediante una
tivación de la enzima,o por lo menosla modulación,hacia enzima proteolítica (que degrada proteínas) adecuada.
arriba o haciaabajo,de su actividad. Estetipo de modificación,llamado ruptura proteolltica,
esel que tiene lugar en las enzimasproteolíticasdel pán-
Fosfodlación/defosforilación.La adición reversiblede gru- creas,tripsina, quimiotripsina y carboxipeptidasa.Estas
pos fosfatoesuna de las modificacionesmás frecuentesy enzimas,sintetizadasen el páncreas,son secretadas al duo-
mejor entendidas.La adición de gruposfosfato,esdecir,la deno,en respuestaa una señalhormonal. Estasproteasas,
fosforilación suele producirse por transferenciade un junto con la pepsinadel estómagoy otras enzimaspro-
grupo fosfatodesdeel ATP al grupo hidroxilo de un resi- teolíticassecretadaspor las célulasdel intestino, pueden
duo de serina,treonina o tirosina de la proteína enzimáti- digerir casi todas las proteínasingeridas,rindiendo ami-
ca.Lasenzimasque catalizanla fosforilaciónde otrasenzi- noácidoslibres,que sepuedenabsorberpor lascélulasepi-
mas (o de otrasproteínas)sellaman proteín-quinasas.El telialesdel intestino.
160 Capítulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
de lavida
cH2oH cH2oH CH2OH Figura6.17 Regulación de la glucógeno
fosfodlasapu fosforilación, (a) La
,.#t"#'"-,{}'"-
OH OH OH
glucógeno fosforilasa esuna enzima
dimérica en las célulasmusculares,que
libera unidades de glucosaa partir del
glucógeno,en forma de glucosa-l fosfato,
utilizable por Ia célula muscular, como
fuente de energía.(b) La glucógeno
Cadenade glucógeno
Restode glucosa fosforilasaestáregulada,en parte, por un
del extremode la mecanismo de fosforilación/defosforilación.
cadenade glucógeno
t99 La forma inactiva de la enzima, la fosforilasa
loo
@ á, puede ser convertida a la forma activa,
fosforilasa a,porla transferenciade grupos
fosfato desdeel AIP a una serina
determinada,en cada una de las dos
OH OH OH
Glucosa-1-fosfato Cadenade glucógeno
con
restode glucosa
menos
(a) Reaccióncatalizadapor la glucógenofosforilasa
'¿ry:RÉ
--slN4.''xl
'@
OH OH
-' qutnasa
FOSrOllasa
w Fosforilasafosfatasa
Glucógeno
fosforilasab
(inactiva)
H2 @ ,@
Glucógeno
fosforilasaa
(activa)
(b) Regulación
de la glucógenofosforilasa
Ribozimas:
moléculas
de RNAconactividad
enzimática 1 6 1
del nucleótidoguanosina- erannecesarias para que
tuvieralugar la reacción.Paranuestrasorpresa, no era
necesarioel extractonuclearqueconteníalasenzimas.
Nosvimosobligadosa concluirque,o Ia actividad
enzimáticaproyeníade unaproteínaunida tan
estrechamente al RNAqueéramosincapaces de
separarlade é1,o queel RNAestabacatalizandosu
propioayuste.Dado lo arraigadaqueestabala ideade
quetodosloscatalizadores eranproteínas,Ia
biológicos
hipótesisde Ia católisispor RNAno erafácil de aceptar.
Procarboxioeotidasa Carboxioeotidasa
/ i ^¡^o^u+ui ,v, a^ ,\ , -->
\il (activa)
t Pesea todo, Ios experimentosadicionalesapuntaron
QuimiotripsinÓoeno-P Quimiotripsina haciala conclusióninicial:la eliminaciónde un intrón de
(inactiva (acriva)
t 4 13-nucleótidosdel pre-rRNA de Tetrahymenaestácatali-
zadaporla propiamoléculade pre-rRNA,siendo,por tan-
to, un ejemplode autocatalisis.
La Figura6.19muestrael procesode escisión,el cual
Células
epiteliales implica O el plegamientode la moléculade pre-RNArno
a¡rstadaparaformar un bucle,@ el ataquepor un grupo
Figura6.18 Activaciónde los zimógenospancreáticospor hidroxilo de una de guanosinaque actúa como cofactor,
ptoteolisis. Lasproteasaspancreáticas son sintetizadas y @ cortey ayustede la moléculade rRNA con la liberación
secretadasen el intestino deigado,como precursoresinactivos del intrón, y @ rotura adicionalautocatalítica del intrón
llamadoszimógenos.La procarboxipeptidasa, el tripsinógenoy el paralaeliminaciónde 19nucleótidosmás.El intrón com-
quimiotripsinógenoson zimógenos.La activacióndel tripsinógeno
pletamenteprocesado esuna ribozima,capazde acortaro
a tripsina requiere la eliminación de un segmentohexapeptídico
por la enteroquinasa, una enzimaduodenalde membrana.La alar garoligonucleótidos pequeños.
tripsina activaluego a otros zimógenos,por ruptura proteolítica.La Sepodría argumentarque la moléculade rRNA de la
procarboxipeptidasa esactivadaen una proteolisisúnica, mientras Figura6.19 no satisface la definiciónde catalizador, que
que la activaciónde quimiotripsinógenoesun procesoalgo más suponeque el propio cafalizadorno sedebealterarduran-
complicado,en dos etapas,cuyosdetallesno semuestranaquí.
te el procesode reacción.Sin embargo,dosañosmástarde
sedescubrióotro catalizador constituidopor RNA en el la-
La primera evidenciallegó en 1981,cuandoThomas boratorio de Sydney Altman en Ia UniversidaddeYale,que
Cechy suscolegasde la Universidadde Coloradodescu- supera esta restricción. La enzima, llamadaribonucleasa P,
rompe precursores de RNA de transferencia (pre-tRNAs)
brieron una excepciónaparentea la regla(todaslasenzi-
mas son proteínas)). Estabanestudiandoel a¡rster de un para producir moléculasde RNA funcionales.(En este
segmentointerno de un precursorde un RNA específico caso,se eliminaun segmentoterminal de la moléculade
(pre-rRNA) in Tetrahymena thermophila,un organismo RNA, en lugar de un intrón, como ocurríaen el procesa-
eucariotaunicelular.(Como veremosen el Capítulo21, mientodel pre-rRNA.)
muchosde los RNAsde eucariotas requierenque seelimi- Sesabíadesdehacíatiempo que la ribonucleasaP tenía
un componente proteicoy otro de RNA,y sesuponíaqueel
nen uno o mássegmentos internosllamadosintrones,an-
tesde quelleguena serfuncionalesen Ia célula.El proceso sitio activo estaba en el componenteproteico.Sin embargo,
Altman y sus colaboradores demostraroninequívocamente,
de corteimplicala escisióndel intrón y la unión de lasdos
partesde la moléculaoriginalen el sitio de escisión.) mediante el aislamiento de los componentesy su estudio
En el
por separado, que eI componenteproteicoaisladoeracom-
cursode su trabajo,los investigadores hicieronla observa-
pletamenteinactivo,mientrasque el componenteribonu-
ción notable de que el procesoiaparentementeavanzaba
cleotídicosi eracapazde catalizarlarupturaespecífica delos
sin la presenciade proteínas!Describiendosu intento de
precursoresdel IRNR y, además,no se alterabadurante el
estudiarla escisiónde intronesin vitro. Ceahescribió:
proceso.Además,la reaccióncatalizadamedianteRNA se-
pequeñas guíala cinéticade Michaelis-Menten, una evidenciamásde
Resultóquealgunasdelasmoléculas
-principalmente ionesde magnesio que erael RNA quien estabaactuandocomo una auténtica
y variasformas
enzima.(El componenteproteicoaumentaIa actividadpero
no esnecesarioparala unión del sustratoo su ruptura.)
t
N. del Z: siguiendo la recomendación de Biólogos Moleculares hispanoha- La trascendencia de estoshallazgos sereconociócon el
blantes,traduciremos como ayusteeI término inglés splicing que hace refe- PremioNobel que Cechy Altman compartieronen 1989
rencia al procesamientode1RNA, consistenteen el corte y empalme de cier-
tos sectoresdel mismo. Segrin el DRAI, a)'uste es un término náutico que por susdescubrimientos de lasribozimas.A partir de estos
refiere a la (costura o unión de dos caboso. descubrimientos iniciales,sehan descritomásejemplosde
r62 Capítulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
Figura6.19 La autocatálisisy el ayuste del intÉn del Pre-rRNAde
Tetrahymena. La molécula precursora del RNA ribosomal (pre-rRNA)
5' r UpCpUpApApAp- r
GPUPAPAP 3' de Tetrahymenacontiene un intrón que es capazde catalizarsu propia
Pre-rRNA escisión.La escisióny el a)'usteocurren en cuatro etapas.O Formación
o de un bucle en la región intrónica de la molécula de pre-rRNA. @ El
bucle del intrón es atacadopor un grupo hidroxilo de un nucleótido de
guanina libre, pG, que funciona como cofactor.@ La molécula de pre-
rRNA esrota en el extremo 5'terminal del segmentodel intrón, con Ia
upcpupoooooo\ GpupApAp- 3, adición de G al intrón. La uridina en el extremo 3' de otro fragmento de
s,-
rRNA atacaluego al extremo 3'del intrón, liberándolo y empalmando
,.)fo las dos piezasde rRNA para formar el rRNA procesado.@ El intrón
sufre una subsiguienteruPtura autocatalítica,eliminando otros 19
nucleótidos en dos etapas,primero libera un segmentode 15
nucleótidos y luego otro de 4.
S'oGon0A0n01
5'PGPAPAPAP-Go" 3'
eliminado
lntrÓn
lo
t
l\
N,u nucleótidos
t\
\ o nucleótidos
I
procesado
Intrón
moléculas
Ribozimas: enzimática 163
de RNAconactividad
Cerrando el círculo, volvemos al tema sustratoIS].El límite superiorde la velo- reaccionesy son proteínasmultiméricas
planteadoen la introducción de esteca- cidad se denominaV^*, y Ia concentra- con variassubunidadescatalíticasy varias
pítulo -a saber,que la termodinámica ción de sustratonecesariapara alcanzar subunidadesreguladoras.Cadauna de Ia
nos permite valorarla factibilidadde una la mitad de la velocidadmáxima,se ex- subunidadescatalíticastieneun sitio acti-
reacción,pero no dice nada sobrela pro- presa como la constantede Michaelis, vo que reconocea los sustratosy a los
babilidadde que esareacciónocurra real- (. La relaciónhiperbólicaenrrey y [S] productos,mientras que cadasubunidad
mente en Ia célula,a una velocidadapre- se puede convertir en lineal, mediante reguladoratiene uno o más sitios alosté-
ciable-. Serequiereun catalizador, que una ecuacióndoble recíproca,en la que ricos,que reconocena lasmoléculasefec-
siempre es una enzima en los sistemas V-* I K- sepuedendeterminar gráfica- toras específicas.Un determinadoefector
biológicos,para asegurarque secumplen mente o analizaren un ordenador. puedeinhibir o activarla enzima,depen-
los requerimientosde energía de acti- La actividad enzimátícaestáinfluida, diendode cuálde lasformasde la enzima
vacíóny que sealcanzael estadode tran- no sólopor la disponibilidaddel sustrato, estéfavorecidapor la unión del efector.
sición. Todaslas enzimasproteicasson sinotambiénpor los productos,suStratos Las modificacionescovalentesmás co-
polímerosde aminoácidoscon una se- alternativos,sustratosanálogos,drogasy munessonla fosforilacióny la desfosfori-
cuencia programada genéticamente,y toxinas,muchasde las cualestienen un lación,como ocurre,por ejemploen la
son sensiblesa la temperaturay el pH. efectoinhibidor. La inhibición puedeser glucógenofosforilasa,y la ruptura pro-
Thmbiénson exquisitamenteespecíficas, reversible o irreversible,
implicandoestas teolítica,como ocurre en la activaciónde
paraun únicosustratoo paraun conjun- últimas la formación de unionescovalen- los zimógenosde las enzimasproteolíti-
to de compuestosestrechamente relacio- tesdel inhibidor a la superficiede la enzi- cassecretadas por el páncreas.
nados.El procesocatalíticotiene lugar en ma. Por otra parte, un inhibidor reversi- Aunque durante mucho tiempo se
el sitio activo, un grupo crítico de ami- ble seune a la enzimade forma reversible. pensóque todaslasenzimaseranproteí-
noácidosresponsables de la unión y la ac- ya seaen el sitio activo (inhibición com- nas,ahorareconocemos las propiedades
tivación del sustratoy de la auténticare- petitiva) o en otro lugar de la superficie catalizadorasde ciertas moléculas de
acciónquímica.La unión de un sustrato de la enzima(inhibiciónno competitiva). RNA llamadasribozimas.Éstasincluyen
apropiadoen el sitio de activo,induce un Las enzimasse pueden regular para algunasmoléculasde rRNA, que son ca-
acoplamientomás.eficazentre la enzima ajustarsusnivelesde actividada lasnece- pacesde catalizarIa eliminación de sus
y el sustrato,facilitando de esemodo Ia sidadesde la célula.La regulaciónpor el propiosintrones,de eliminarlos compo-
activacióndel sustrato. sustratosebasaen los efectosque tienen nentesRNA de enzimasribonucleopro-
Las reaccionescatalizadasenzimátí- Ias concentraciones del sustratoy de los teicasy quizásinclusopartedel nNÁ de
camentetienenlugar a travésde un in- productos,en la velocidadde reacción. ribosomasya ensamblados. El descubri-
termediario enzima-sustrato.Muchas Los mecanismosde control adicionales miento de las ribozomasha cambiadoel
enzimassiguenIa cinéticade Michaelis- incluyenla regulaciónalostéricay lasmo- pensamientosobreel origen de la vida en
Menten, caracterizadapor una relación dificacionescovalentes. La mayoríade las la tierra porque las moléculasde RNA, a
hiperbólicaentre la velocidadde reac- enzimasreguladasalostéricamente catali- diferenciade lasproteínas,son capaces de
ción inicial v y la concentracióndel zan el primer pasoen una secuencia de replicarse a sí mismas.
Problemas
Losproblemas
demayor
dificultad
están conun ..
marcados (c) Una solución alternativa es reducir Ia energía de activación.
6,1 La necesidadde las enzimas.Nos encontramosahoraen ¿Qué significa en términos moleculares decir que un
cataLzador disminuye la energía de activación de una
disposiciónde apreciarla diferenciaentrela factibilidad
reacción?
termodinámicade una reaccióny la probabilidadde que
realmentevayaa tenerlugar. (d) Los químicos orgánicos usan a menudo en sus reacciones,
catalizadores inorgánicos tales como el níquel, el platino, o
(a) Muchasreaccionesque son posiblestermodinámicamente
ciertos cationes,mientras que las célulasusan proteínas
no ocurrena una velocidadapreciable,debido a las denominadas enzimas.¿Cuálesson las ventalasdel uso de
necesidades energéticas
de los reactivospara superarel las enzimas?¿Ylas desventajas?
estadode transición.¿Quésignificaestoen términos
6,2 Energía de activación. Como se muestra en la Reacción
moleculares?
6.2, el peróxido de hidrógeno,H2O2, se descomponeen HrO y
(b) Una forma de cumplir esterequerimientoesmediante Or. La energía de activación, E¡, para la reacción no cataljzadaa
aportaciónde calor,que en algunoscasos,sólo esprecisoal 20'C es de 18 kcal/mol. La reacción se puede catalizarpor iones
inicio. Dé un ejemplo,y expliquelo que significaen de hierro (E¡ : i3 kcal/mol) o por Ia enzima catalasa
términos moleculares. (4: 7 kcal/mol).
r64 Capítulo
6 Enzrmas:
loscatalizadores
delavjda
(a) Dibuje un diagramade energíade activaciónpara esta
reacciónbajo condicionesde catalizacióny no catalización,
y expliquelo que significaque la energíade activaciónbaje E
de 18a 13kcal/mol,cuandoseusanionesde hierroy de 18 .o
.g
a7 kcallmol en presenciade Ia catalasa. c
(s
(b) Sugieradospropiedadesde la catalasaque hagande ella un 'ó
!
Problemas 165
concentraciónde lactosa,el incrementode la velocidades Estareacciónes,como descubriremosen el Capítulo 8, básica
siempremenor que el doble? en el transportedel dióxido de carbonoen los glóbulosrojos,
(c) CalculeIlvy ll[S] para cadaentradaen la tabla de datosy desdelos tejidosdel cuerpoa los pulmones.La anhidrasa
tracellv frentel/[S]. carbónicatiene un pesomolecularde 30.000y un número de
recambio(valorft.",)de I X 106sec-r.SupongaqueseIe da
(d) DetermineK- y V-* a partir de Ia representación
1 mL de una soluciónque contiene2,0 pgde anhidrasa
doble recíproca.
carbónicapura.
(e) En la misma gráficade la parte b, representelos resultados
(a) ¿Aqué velocidad(milimoles de CO, consumidospor
que esperaríasi cadatubo contuvierasólo 0,5 ¡.rgde
segundo)tendrálugar estareacciónen condiciones
enzima.Expliqueel gráfico.
óptimas?
6.7 Más cinéticaenzimática.La galactosaformada en la
(b) Suponiendonormalesla temperaturay la presión,¿cuáles
Reacción6.17sepuedefosforilar mediantela transferenciade
el consumode CO, en mL por segundo?
un grupo fosfatodesdeel AIfl reacciónque escatalizadapor la
enzimagalactoquinasa: 6.9 Inhibidores devarias clases.Conteste,razonandoen cada
caso,cuálesde lassiguientesafirmacionesson verdaderas(V) o
Galactosa* AIP ----------------+
Galactosa-l-fosfato* ADP (6.1S) falsas(F).
galacquinasa (a) El di-isopropil fluorofosfatoseune covalentemente
al
grupo hidroxilo del residuode un aminoácidoespecífico
Supongaque ha aisladola enzimagalactoquinasa y ha de Ia enzimaproblema,siendo,por tanto, casicon toda
determinadosusparámetroscinéticos,variandola certeza,un efectoralostérico.
concentraciónde galactosaen presenciade una concentración
de AIP constantey alta (esdecir,en saturación).La (b) La enzimahexoquinasaseinhibe por su propio producto,
doble recíproca(Lineweaver-Burk)de los datos
representación la glucosa-6-fostato
y, por tanto,esun ejemplode
semuestraen la Figura6.21. retroinhibición.
(a) ¿Cuálesla K. de la galactosidasa,
para la galactosa, (c) La glucógenosintasa,como la glucógenofosforilasa,es
en estas
condicionesde experimentación? activaen la forma fosforiladae inactivaen la forma
¿Quénos dice la K-
acercade la enzima? defosforilada.
(b) ¿Cuálesla V-o de la enzimaen estascondicionesde (d) Esmuy probableque una enzimaque estásujetaa la
experimentación? activaciónalostérica,catalicela primera reacciónde una
¿Quénos dicela V-o acercade la
enzima? vía biosintética.
(c) Supongaque repite el experimento,pero variandoIa (e) Si los investigadores
sostienenque una enzimaesactivada
concentraciónde ATP y manteniendoa la galactosaen alostéricamente por el compuestoA e inhibida
nivelesaltosy constantes. alostéricamente por el compuestoB, una de estas
Asumiendoque lasdemás
condiciones semantienencomoantes,¿esperaría afirmacionesdebeestarequivocada.
obtenerla
misma V-o que en el apartadob? ¿Porqué o por qué no? (0 La tioredoxinaesuna proteina reguladoracon dos grupos
(d) En el experimentodescritoen el apartadoc, el valor de K* sulfhidrilo (-SH) que sepuedenoxidar de manera
esmuy diferenteal del apartadob. ¿Puedeexplicarpor qué? reversible,formando un enlacedisulfuro (-S-S-).
Probablementeafectea la actividadde una enzima
6.8 El número de recambio.La anhidrasacarbónicacatalíza a la que seuna,reduciendolos puentesdisulfurode la
Ia hidrataciónreversibledel dióxido de carbonopara formar enzimaa grupossulfhidrilo,haciendoque la enzima
ion bicarbonato: experimenteun cambio conformacionalque conduzcaa
CO2+ H2O;- HCO; + H- (6.1e) su activación.
.6.10 Relevanciabiológica. Expliquela relevanciabiológica
de cadauna de lassiguientesobservacionesrelativaa la
regulaciónde enzimas.
ñA (a) Cuandoustednecesitaun aportede energía,lashormonas
o adrenalinay glucagónsesecretanhaciasu torrente
-'"
sanguíneoy sedirigen a suscélulasmusculares,donde
C
t66 Capitulo
6 Enzimas:
loscatalizadores
delavida
.6.11 Consecuencias de la ecuaciónde Michaelis-Menten. (d) En su debido momento, se dará cuenta de que la V-* y la
ParaIa reaccióncatalizadaporla enzimaen la cual el sustratoS K- se pueden definir como sigue:
seconvierteen un producto P (véaseReacción 6.5),la velocidad
sepuede definir como la desaparicióndel sustratoo la aparición h* ot
v-*: kr[E] *^: (6.2t)
k1
del producto por unidad de tiempo:
.6.1Íl La ecuaciónde Michaelis-Mentenen forma lineal.
dtst dlPl Ademásde la representación de Lineweaver-Burk(Figura6.10)'
y:----:---:-:+--- (6.20)
elt rlt a vecesseempleanotrasdos formaslinealesde la ecuaciónde
Michaelis-Menten.La representaciónde Eadie-Hofsteeesuna
Partiendode estadefinicióny restringiéndonosa Ia etapainicial
gráficade v/ [ S] frentea v (véaseFigura6.I I ), y la representación
de reacción,cuando [P] esprácticamentecero,derivela
(véaselaEcuación6.7).Los de Hanes-Woolfenfrentaa [S]/vya [S].
ecuaciónde Michaelis-Menten
siguientesapartadospueden ayudarle en su derivación: (a) Demuestre,en amboscasos,que la ecuaciónque se
representagráficamentesepuedeobtenera partir Ia
(a) ComienceexpresandoIa ecuaciónde la velocidadpara
ecuaciónde Michaelis-Menten,con una simple
dlS)ldt, dlp)ldt,y dlBS)ldter términos de concentraciones
manipulaciónaritmética.
y velocidadesconstantes.
(b) En amboscasos,indique cómo sepuedendeterminarK- y
(b) Supongaun estadoestacionarioen el cual el complejo V-o desdeel gráficoresultante.
enzima-sustrato de la Reacción6.6desaparece a la misma
(c) Hagauna representación de Hanes-Woolf,señalandolos
velocidada la que seforma, de forma que Ia tasanetadel puntos de interseccióny la pendientecomo en las
cambio,d[ES]ldt, escero. de Lineweaver-Burky de Eadie-Hofstee
representaciones
(c) Desecuentade que la cantidadtotal de la enzimapresente, (véanseFiguras 6.10y 6.11).¿Puede sugerirpor quéla
E, esla sumade la enzimalibre E¡másla queestáen el representación Hanes-Woolfesla mássatisfactoria,desde
complejoenzimaES:E : Er + ES. el punto de vista estadístico,de lastres?
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