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Aunque hace ya muchos millones de años que las plantas verdes sinteli-
zan compuestos orgánicos a partir del anhídrido carbónico, ninguno de
estos compuestos ha llegado a acumularse en cantidades considerables.
Tan sólo una ínfima fracción se ha conservado en condiciones anaeróbi-
cas en forma de compuestos de carbono fuertemente reducidos presentes
en el petróleo, gas natural y carbones. En condiciones aeróbicas todos los
compuestos formados biosintéticamente son degradables. Para cada com-
puesto, por complicado que sea, existe un microorganismo capaz de
degradarlo total o parcialmente; los fragmentos que surgen de esta forma
son utilizados por otras especies. Los microorganismos se presentan pues
en conjunto como omnipotentes bioquímicamente y se habla de un
"principio de infalibi lidad microbiana''. Recientemente ha resultado nece-
sario limitar dicho principio. Algunos compuestos de bajo peso molecular
creados y sintetizados por el hombre y algunos polímeros sintéticos de
alto peso molecular resisten la degradación microbiana, afirmación que
constituye el resultado de varios años de observaciones y estudios.
El conocimiento de los microorganismos que atacan, degradan y transfor-
man un solo producto natural se basa fundamentalmente en los estudios
realizados con los cultivos de enriquecimiento. Los medios de cultivo
básicos, simples, a los que se les ha añadido como fuente de energía el
compuesto que quiere estudiarse sólo permiten el crecimiento de microor-
ganismos con necesidades nutritivas relativamente sencillas; en los culti-
vos de enriquecimiento líquidos sólo prevalecen además los organismos
con una mayor velocidad de crecimiento en las condiciones dadas. Tiene
pues que ponerse totalmente en duda que dichas formas puedan conside-
rarse como los representantes típicos de los organismos que en la natura-
leza efectúan dichos procesos de degradación. Muchos organismos con
otras características fisiológicas de crecimiento pueden pues no ser reco-
nocidos de esta forma. La degradación de los compuestos orgánicos que
llegan al suelo no se realiza únicamente por las bacterias, sino que tam-
bién están implicados microorganismos eucarióticos y pequeños animales
(helmintos, moluscos e insectos) (Fig. 14.1 ). El aclarar las redes tróficas
aeróbicas es un objetivo de la ecología microbiana.
Degradación bajo condiciones anaer óbicas y a eróbicas. Una gran parte
de la biomasa producida por la fotosíntesis se mineraliza en condiciones
anaeróbicas. Además de los sedimentos de las aguas mencionados en
varias ocasiones, se establecen ecosistemas anaeróbico!> en los arrozales.
454 14. Degradación de los productos naturales
hongos
50%
14.1 Celulosa
La celulosa es el componente básico de los vegetales y su producción
supera a la de los demás productos naturales; aproximadamente la mitad
de la biomasa producida fotosintéticamente es celulosa. Los restos vege-
tales presentes en el suelo están formados por un 45% de celulosa (valor
promedio) - 90% (algodón), por lo que la celulosa ocupa, junto con el
C02, una posición central en el ciclo del carbono (pág. 7).
Eucariotas Procariotas a
a =aeróbico, b =anaerób1co.
14.1 Celulosa 457
La~ do' primera' partes del estómago de lo' rumiante..,, esto cs. panza y redecilla,
con..,tituyen una inmensa cámara de ferrnentacidn de uno~ 100-250 litro' de volu-
men, en la que se dan las condiciones ideale.., pam el crecimiento de numerosos
microorganismos. El animal contribuye a dicha sirnbio'>b: una temperatura cons
tantc de 37º(' a 39ºC. el aporte continuo de un medio mineral (cerca de 70 litros
de saliva por día) bien tamponado (pi 1 5,8 hasta 7,:l) gracias al bicarbonato y fqs-
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _1_4 1 Celulosa 459
14.2 Xilano
Después de la celulosa el xilano es el hidrato de carbono más extendido
cuantitaLivamente en la naturaleza. El heno y el líber contienen hasta un
14.2 Xilano 461
,~~ OH
"~
OH
o-glucosa o-galactosa o-manosa
COOH
"°~°"
HO~o).,_...
(9;º'>-.--oH
~ OH
Hb~
OH OH OH
ácido glucurónico o-xilosa L·arabmosa
La cadena de xilano está formada por b-o-xi losas unidas por enlaces 1,4-glucoi.í-
dicos. Se aparta en cuanto a la fom1a de una cadena de celulosa por la sustitución
de los grupos CH20 H- por átomos H; su grado de poli meriLación es sin embargo
considerablemente inferior (30-100). Los xilanos contienen además arabinosa, glu-
cosa, galactosa y ácido glucurónico. Por tanto, son de estructura compleja y muy
rami ficados. al contrario que la celulosa.
amilosa
(n + 1)
amilosa (n + 2) glucosa-1-P
Las P-amilasas sólo se encuentran en las plantas (cebada, trigo, etc.). Frente a lo
que hace la a-amilasa, la P-amilasa ataca la molécula por el extremo no reductor
y separa maltosas. La acción de dicho enzima sobre el almidón da lugar a una rápi-
da sacarización al tiempo que se mantiene la tineión con el yodo. La hidrólisis se
detiene cuando se ha degradado aproximadamente la mitad de la amilopectina; el
resto que queda es la P-dextrina límite. Si se consigue gracias a la acción de la
amilo- 1,6-glucosidasa la ruptura de las ramificaciones, se produce una degrada-
ción total hasta maltosa. La maltosa puede ser degradada hidrolíticamente en el
exterior de la célula mediante una maltasa. Si existen las penneasas correspon-
dientes la maltosa y los oligómeros de bajo peso molecular pm;an al interior de la
célula y son degradados por fosforolisis.
-
;'
R //
__________
.... ....... B-dextrina límrte ,.,,. , / '
amrlopectrna - - glucoami/asa
- B-ami/asa
- o.-amilasa
)>-------. enzima desramifrcante
amrlosa ll'. extremo reductor
14.4 Fructanos
En algunas familias vegetales se acumulan fructanos (también denomina-
dos polifructosanos) en vez o además del almidón (glucano). Mientras que
la inulina, el fructano de las Compuestas. tiene cuantitativamente una
importancia relativa, los fructanos del tipo de la tleína merecen un trata-
miento más detenido. En los pastos constituyen hasta el 12-15% de la
materia seca. A partir de Aspergillus niger y de bacterias pudieron aislar-
se enzimas hidrolíticos, que parecen hallarse muy extendidos.
Los fructanos (también denominados Jevanos) se presentan como exopo-
lisacáridos (apartado 10.7), y los forman una serie de bacterias cuando el
medio contiene sacarosa. El proceso de formación de levanos es análogo
al de la formación de dextranos
n sacarosa - - t levano + n glucosa
466 14. Degradación de los productos naturales ~~~~~~~~~--
14.5 Manano
Algunas coníferas contienen manano (hasta un 11 % del peso seco). En las
células de levadura se presenta en forma de polisacárido soluble y puede
extraerse de las suspensiones de le\adura por tratamiento con álcalis
hidratados o al poner en el autoclave dicha., su\pensiones. La le\adura
Hc111w1111/a lwlstii segrega cuando crece sobre glucosa un manano soluble
esterificado hasta un 20% con ácido fosfórico.
14.6 Pectina
Las pectinas se presentan como compuesto-. intracelulares en los tejidos
de la-. plantas jóvenes y en especial en las baya.,. drupas y pomos Su
imponancia radica más en su relación con la estabilidad de las planta\ que
en su cantidad. Forman pane de la lámina media que se deposita entre la.,
paredes celulares de do'> células vegetales vecinas.
Las pectina~ son poligalacturónidos. Están formadas por cadenas sin ramificar de
ácido 1>-galacturónico unidos con enlaces gluco<.ídicos a . 1.4. Los grupo~ carho\íli·
cos están esterificados total o parcialmente con metanol F.n la degradación microh1a-
na o enómática de la, pectina' panicipan en1ima., pcctinolíuco:. (esterc11a.1 } der·
polimaams). Las pecti11e~1ac11m rompen el enlace metile\térico y liberan metanol.
La' poli8alac111ro11asas hidrol11an la!> cadena\ de ácido o-galacturónico rcs1dualc')
liberan monómeros de ácido o-galacturónico. Los ácido' pohgalacturónicos 'e utili·
7an en fom1a de sales cálcicas como solidificantes de las gelatinas de frutas.
La capacidad para degradar la pectina es característica de muchos hongos
y bacterias. La patogenicidad para las plantas de diversos organislll<''
( Botrytn cine rea. F11sari11111 O.n'sporum, F. frcoper.sici) se basa en que
segregan en1imas que disuelven la pectina Lnrmia carotm·ora provoca
una di'>olución de los tejidos de la ensalada. 7anahorias, apio y análogos.
En el sucio es extraordinariamente elevado el número de destructores e
la pectina ( 1o~ células/g de suelo). Los formadores de esporas como
Baci/111.1 111acerans y Baci/111.1 polymyxa se encuentran entre los destructo
res mü.., activos de la pectina. También muchos pseudomonas (P f111ort'.\ -
ce11s).bacterias de la pan1a. actmomicetos. clostnd1os tcrmófilo'> y bacte-
rias del úcido láctico. degradan pectinas. Entre los hongos debemos mcn
cionar A.1pergil/11s niger, Penicillium italic11111, /\11reobasidium pullulam,
F11.mri11111 y R/iiz.octo11ia wlani.
Los destructores o degradadores de la pectina tienen una importancia téc-
nica en el enriado del lino) del cáñamo. fate proceso se propone desha-
cer el enmarañado existente en las fibra\ de celulosa que constituyen los
tejido., vegetales. En el enriado aeróbico por rociado panicipan hongos. en
el enriado anaeróbico sumergido en agua participan principalmente bacte
rias. Las más importantes de eMas últimas parecen ser los productores de
pcctinasa y con fermentación butílica Clostridium pectinovorum y C. fel-
.si11e11111. Los en1imas pectolíticos utilizados con fines técnicos, entre otros
para aclarar los zumos de frutas, se obtienen principalmente a partir de
hongos cultivados en medios de cultivo que contengan pectina.
14.7 Agar
A B
Fig. 14.4 Colonias de Cytophaga fennentans var. agarovorans sobre placas de
ligar nutritivo. La degradación del agar se reconoce por el hundimiento de las colonias
A. Los halos de difusión de los exoenz1mas que hidrolizan el agar se han puesto de mani
tiesto recubriendo la placa con lugol B (de VELDKAMP, H.: J . gen Microbio!. 26 [1961] 331).
468 14. Degradación de los productos naturales
mediante enlaces ~-1.4 y 1,3. La agaropectina tiene una constitución más compli
cada y está formada por o-galactosa, 3,6-anhidrogalactosa, los ácidos urónico~
correspondientes y por ~ulfato. La mayor parte de rodofíceas presentan agar; el
agar comercial se obtiene a partir de diversas especies de Gelidium.
14.8 Quitina
La quitina se diferencia estructuralmente de la celulosa por la sustitución del grupo
hidroxilo en el carbono 2 de la glucosa por un grupo amino acetilado (pág. 51 ). 1.a
remarcablc estabilidad de la quitina se debe a los puentes de hidrógeno que se for-
man entre los grupos laterales N-acetilo. fa un compuesto de sostén muy extendi-
do tanto en el reino animal como en el vegetal. Constituye el exoesqueleto de
muchos invertebrados. En el suelo también se produce constantemente quitina, que
es el constituyente principal de la pared celular de muchos hongos en especial de
los basidiomicetos y ascomicctos.
14.9 Lignina
La lignina constituye después de la celulosa y de las hcmicelulosas el
componente cuantitativamente más importante de las plantas. El conteni-
do en lignina del tejido leñoso varía entre el 18 y el 30% del peso seco. La
lignina se halla incrustada en el tejido vegetal: se encuentra en las láminas
secundarias de la pared celular. La lignina es el producto vegetal masivo
que es degradado biológicamente con mayor lentitud. Constituye pues la
fuente principal de la materia orgánica del suelo y en especial <le los áci-
dos húmicos, que se va degradando con gran lentitud.
La lignina no es un com puesto químicamente unitario sino muy complicado
(véase Fig. 14.5). Esta complejidad no se debe a la presencia de gran número de
monómeros distintos: los componentes básicos son derivados de fenilpropano,
especialmente el coniferol. La complejidad se debe mucho más al gran número de
enlaces de distinto tipo, con que pueden unirse entre sí los monómeros. Esta estruc-
tura tan irregular de la lignina concuerda con la idea de que el proceso cn7imático
de síntesis de la lignina se halla limitado a la formación de radicales del coniferol.
Estos radicales entran a formar parte de manera espontánea de compuestos cuyo
tipo y posibilidades es un resultado de la situación mesomérica del radical.
H.COtt
H.COtt 1
1 co
HC f 1
-Z-~Ji-~-
HCO H.c<lH
º f"-4
HC OCHo OH OCH
1 1
14\¡ Hf 1 H.C0tt OH
HC C0 1
4f
'HCOfo4
OH
o
H.COH
1
1- CH HaC0H
1 1
HCOH HC--o
c~IQ4~~
o ,._
OCHo
OH
Ctfo()H
1
CH
11
~6- . .
Hff---o
~:
Ctf,()H
1
CH
11
A
lt.CO~OCHo
OH
~~·
8-cCJ¡ lileo1lco
..
OH
8inllplnol
,, co, co,
i "ij(1_ __
T~~T~--- • •• •
mlCtOOrganiSmos
'
------·
Ción de la lignina y com-
puestos aromáticos
1 JI ~ prod.
'
productos ele transformación
polimefizados
• 1 degradación
de
orgánicos del suelo consisten en parte en los restos vegetales aún no total-
mente destruidos, y en parte en humus. Se denomina humus a la materia
orgánica amorfa existente en el suelo, de color generalmente oscuro, pro-
cedente de organismos. Entran a formar parte del humus compuestos difí-
cilmente atacables por los microorganismos. sobre todo la lignina. pero
también grasas, ceras, hidratos de carbono y componentes proteicos. Se
convierten en polímeros que resultan difíciles de definir químicamente. En
la formación del humus no sólo participan bacterias y hongos sino tam-
bién los protozoos y gusanos inferiores y superiores.
Con la humificación de la materia vegetal se produce un enriquecimien-
to en nitrógeno. Mientras que en los restos vegetales la proporción car-
bono/nitrógeno es de alrededor de 40: 1. en el humus la relación C/N es
aproximadamente 1O: l. Una gran parte del nitrógeno entra a formar parte
de compuestos que no se encontraban en las plantas. La lignina es un
componente que contiene mucho nitrógeno y una fuente de lignoproteína
Y de nitrógeno heterocíclico. El humus presenta en cierta forma un equi-
librio dinámico; por una parte se van introduciendo constantemente res-
tos orgánicos y por otra es parcialmente cndoxidado. La proporción de
humus en el suelo es tanto más elevada cuanto mejores sean las condi-
ciones para su formación y cuanto peores sean las condiciones para la
destrucción del mismo. La proporción tan baja de humus de los sucios
tropicales se debe a la destrucción tan nípida de la materia orgánica pre-
474 14. Degradación de los productos naturales
---
sente en lo'> mismos por lo'> n11croorganismos favorecidos por el din a
tropical. La tierra negra de la-. eqepas se forma en regiones con mv1ern1 s
largos y rigurosos y con veranos .,ecos. La cantidad de humus que se acu.
mula no sólo depende de las condiciones climáticas y cdáficas sino tam.
bién del tipo de vegetales. La paja de las gramíneas y de las plantas de
estepa produce un humus fácilmente degradable mientras que el humus
del follaje de los bosques en especial de los de coníferas. es muy difícil
de degradar (humus crudo)
Durante la humificación 'e pierden o bien se fonnan gran número de grupos car-
boxíhco' en los compues10' org•imcos. Resulta puc' de una importancia decl\1 \a
para la calidad del humw, y para la velocidad de las 1ransformaciones microhian¡¡s,
la presencia o ausencia de bases. en los suelos minera les o básicos (podzolcs, lan-
da,, b<)sques de coníferas) '-C produce un enriquec1m1en10 en ácidos húmico\ pJr·
do' (humu' ácido). Si e:>mlen compuestos mineralc1, en cantidad suficicnie. se for-
man con las bases coloides de humus no saturado que junto con los coloides de
arcilla con,tituyen el llamado complejo de absorc16n del \Uelo. El componente
orgánico de dicho complejo puede ser considerado como un cambiador de iones de
alto peso molecular responsahle del equilibrio iónico de los organismos del \Uelo,
de las plantas y de los microorganismos. La formación de un humus !>uave tiene
como consecuencia una activa vida en el sucio; las hifas de los hongos y las sus-
tancias muco\as mantienen unida\ las partícula!> de suelo y determinan de esta
fonna la deseada estructura 'uelta del \uelo.
14.11 Hidrocarburos
Compuestos químicamente tan estables como la., parafinas, el petróleo y
el caucho son también degradados por los microorganismos. Únicamente
en ausencia de agua, como en 101'. depósitos de petróleo o bien en las con
dicione'> especiales de la., minas de carbón, no ..,e produce una degradacm
digna de \er tenida en cuenta. Son de enom1e importancia la<; pregunta., ui..
.,i. por ejemplo. el crudo de petróleo que va a parar a la tierra o a lo., lag<
es oxidado biológicamente. de si existe una m1croflora que utilice Je
fom1a específica los hidrocarburos y de si de la presencia de gran número
de microorganismos que oxidan los hidrocarburos puede extraerse la con
clusit'in de la presencia de petróleo o de gas natural.
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ 14.11 Hidrocarburos 475
l..ll' hacterias uulizadora' del petróleo están muy extendida.\; pueden a1\lar...c dc
todos Jo-, '>Uelo:. de culuvo, hosqucs o praderas. Adcmá..,, la capacidad de util11ar el
petróleo como fuente energética no está limitada a uno<, )l<)Cos especialista<, entre Jo,
m1croorg<1ni\mos, sino que .,e da en numerosos hongo' y bacterias. Estos resultado.,
e'>tán en concordancia con 'º' nuevos datos analíticos acerca de la composición de
hactena\, plantas y animales. Muchos organismos tienen hidrocarburos y son '1nte·
ti1ado' continuamente por hactenas y plantas; pcneneccn aparentemente a la\ ,u,.
1ancia' céreas, que cubren Ja, hoja' de las planta' No hay que \'era lo\ hidrocar-
buro' t•m 'ólo como reliquia\ !(hile\ de la producción primana de lo\ vegctale\ en
tiempo' remoto\. smo que fonnan parte de los metaholito' -,ecundaríos que aún ho>
día se smtct11.an en cant1dade., con ... iderables por la\ plantas verdes.
14.11 .1 Metano
~l metano adquiere entre lo' hidrocarburo'> una situación especial. Es ut1-
ltzado y o.\ idado por bacterias incapaces de degradar hidratos de carbono
de cadena larga. En las bacterias utilizadoras del metano hay que ver
menos a una utilización de los hidrocarburos que a un grupo de bacterias
especiali1ado en la utilización de compuestos de un solo carbono (C 1). Por
ello se incluye a las bacterias utililadoras del metano junto con todas las
demás bacterias (y levadura•,) que utilizan el metano!, las aminas mctila-
da<,, el dimcliléter. el fonnaldchído y el formiato, entre los organismos
metilotróflcos. En los cultivo-. de enriquec1m1cnto que tienen al metano
c~m10 única fuente de carbono y energía se desarrollan una serie de bacte-
n a., pertenecientes a di\tintos géneros: Methylo111011as, Methylococc11.1,
Methvlosi11us. Alguno~ i.on capaces de crecer solamente con metano.
1_!17tanol y dimetiléter como sustrato, y son incapaces de utililar azúcares,
ac1dos orgánicos u otros alcoholes.
476
~~~
14. Degradación de los productos naturales
~~~~~~~~~~~~
i+XH, t\O
CH•--'-..¡-- CHalH -r
HCH ~ HC 'OH -,.- ~
H, +X 2 (H) 2 [H) 2 (H)
2
3 HC- OH 3 HC- OH ~ 3 HC- OH
1
HC- OH
<D 1
HC-OH
\61 1
HC-OH
1 1 1
CHz- 0 -@ CH2-0-@ CH2- 0 -@
rbuloaa · arabono- lructosa-
5·10$lato 3-hexulosa- 6-loslato
6-losfato
2~
><
'' o, 2 H20
~
2~
2 CH, - (CH 2),. - CH, OH
1-hexade<:anol
(= cetilalcohol)
CH, - (CH,),.-C,
1P -~------j
?'"" -=-:::::::::
palm11aldeh1do H
~ @)
H,O ~ 2 (H]
¡- /¡V
16180
1/2 CH, - (CH,),.- C, /¡
OH
1P
- - - 1CH 3 - (CH,),. - C - O - CH,- (CH,),.- CH
112 CH. - (CH,) ,.-C, cetilpalm1tato
(contiene 75% de ''O y 25% de ''O)
ác. palm1tico OH
Fig. 14.11 Degradación de alcanos (parafinas) por una oxidación terminal me-
diante una mono-oxigenasa y por B-oxidación hasta acetil-CoA. Enzimas impli-
cados: (1) mono-oxígenasa (alcano-1-hídroxílasa); (2) alcohol-deshídrogenasa; (3)
a/dehído-desh1drogenasa; (4) ací/-CoA-síntetasa; (5) acíl-CoA-deshidrogenasa; (6)
3-hídroxiacít-CoA-hidroliasa; (7) 3-hidroxiaci/-CoA-deshidrogenasa; (8) ~-cetotiotasa
14.11 Hidrocarburos 481
o
H
º·
>
XH2
"'\
X
ª
H
OH
OH 7
X """
XH 2
OCº
1
H
OH
O +XH 2 H,O+X
~OH '-..,__ / ,.?yOH
0 mono-oxigenasa ~OH
fenol catecol
Lol. sustiluyentes del anillo ¡u·omat1co son eliminados frecuentemente,
(>ero no siempre. antes de la rotura del ani llo. Los sustituyentes clorados.
los grupos nitro y su lfonato pueden se1 sustituidos por grupos hidroxilo.
Las cadenas laterales alifáticas pueden modificarse y acortarse de muy
diversas maneras, o incluso permanecer intactas.
482 14. Degradación de los productos naturales
Rotura del a nillo. La rotura del anillo aromático viene determinada por
dioxigenasas. En ellas se incorpora oxígeno molecular. La rotura tiene
Jugar o bien entre dos grupos hidroxilo vecinos o entre un átomo de car-
bono hidroxilado y otro vecino no hidroxilado. Los enzimas mejor estu-
diados se han aislado de especies de Pseudomonas. Los tipos principale~
de abertura del anillo aromático están representados en la figura 14.12.
Rotura orto. La rotura entre dos átomos de carbono vecinos hidroxilados
(rotura orto o intradiol) conduce al ácido dicarboxílico. Seguramente tiene
lugar primero la adición de una molécula de 0 2 en los átomos de carbono
vecinos con grupos hidroxilo. con formación de un peróxido cíclico. Por
transposición intramolecular se rompe el enlace C-C, formándose enton-
ces cis,cis-muconato:
OH
P';-(OH
(~/:º
l.:::::)l._OH dl0Xlg6rl8SB
'OH
catecol cis,cis-muconato
~OH HOOCYyOH
~OH VoH
catecol \CD ~ protocatecuato
¡'l'COOH HOOCy0coOH
~COOH ~COOH
cis, cis- @ @/
3-carboxi·cis.
muconato / cis-muconato
r::;::-cooH HOOC~COOH
~c:o ® @ ~C=O
muconolactona ~ r@~~H ....-:=t 4-carboxi-
muconolactona
4-oxoadipato- ~--~
enolactona 1 acetil-CoA 1
o~~OOH
~cooHT
® O~cO-SCoA~coA
® l.___,.cooH
3-oxoadipato 3-oxoad1p1l-
CoA CoA
Fig. 14.12 Rotura orto del anillo aromático y vía del 3-oxoad ipato. Enzimas
implicados: (1) pirocatecasa (catecol-1,2-dioxigenasa); (2) muconato-cicloisomerasa;
(3) muconolactona-isomerasa; (4) protocatecuato-3,4-dioxigenasa; (5) 3-carboximu-
conato-cicloisomerasa; (6) 4-carboximuconolactona-descarboxitasa; (7) 4-oxoadipa-
to-enolactona-hidrolasa; (8) 3-oxoadipato-succinil-CoA-transferasa; (9) 3-oxo-adipil-
CoA-tio/asa.
o:OH
OH
o.
0 fYCC: HOOC'OOHOH
CHO
o.
@
HOOCnOf<
CHO COOH
cahlcol 2-hklroxlmuconato- prolOCa*tlatO 2-hklroxi-
semialdehido 4-caiboxlmuconato
-.iialdehíclo
Fig. 14.13 Rotura meta del anillo aromático. Enzimas implicados: (1) metapiroca-
tecasa (catecol-2,3-dioxigenasa); (2) protocatecuato-4,5-dioxigenasa.
antraceno
ó ó
alquilbenzol mandelato
ó
fenilalanina
OH
looH
=------- ,-}yoH,-}yoH ,-}yNH2 ~
~H ~ R
~- ~ -~-~N.I
H
fenantreno salicilato catecol antranilato tnplólano
QCOOH
Q OH
COOH e,
~H
toluato alquillenol
HO*OH
OH
4-hidroxobenzoato
°'º
OH
shikimato
o
lignina
~ coo /
- ~=-OtOCH,
COOH COOH
h-~-
~ ~OH OH
OH OH OH
benzoato 3-hidroxobenzoato protocatecuato varnllato
14.12 Proteínas
Los organ1.,mo:. están compucstm predominan temente por proteína-;. P.1rJ
la mayoría de organismos el mejor sustrato es un ser muerto. Las proteínas
de los organismos vivos son atacadas y degradada., rápidament e por gran
número de hongos y bacterias. Al igual que otras ... ustancias de elevudo
peso molecular las proteínas se cscmden en varios fragmentos penneable'
en el exterior de la célula mediante exocn1imas . Las proteasas hidroliz¡¡O
las proteínas hasta polipéptido'>. oligopéptid os y aminoácido s. La actividad
enwnas proteohtocos pepttdasas
(exocelulares)
aminoácidos lnlracelulares
de&amtnación y~
degraclacoón del
-j j ~
ubli2ación directa
para la bto61n1es15
esquelelo carbonado prole1ca
La, proteína' \cmidigerida ... se denominan peptonas . Esta denominación poco pre-
c1lo<I'igue utili.tándose para la\ pep1ona' de to ... medio\ de culti\(l bacteriano,. obte-
nida, por tratamiento de proteínas con pepsina y en el que 'e ha hidrol1.t<1do una
Pilrte de lo-, enlaces peptídico .... La peptona está compues1a aprox11nadamcntc en un
30<4 (peso) por aminoácidos libres: el resto contiene dipéptido' y 1ripépt1dos. a<.i
488 14. Degradación de los productos naturales ~~~~~~~~~~~
como polip¿pudo~ solubk.., no prcdp1tables por d calor o por los ácido,. El med io
de wlt1\o. no definido. caldo nutrllÍ\o (nutrien t l>roth, NB) tan utih1ado. CM:í
compuc'to por una me1cla do.: pcptona. e;>..Lracto do.: carne)' o.:\ tracto de levadura k i
la relat:i<ín 7:7:2). contiene, por tanto, además de aminoácidos y oligopéptido
toda una ,críe de aLúcan!s, üc1dos orgánicos. vitaminas y oligoelemento....
HN HN
~ ~
CNH-NH-{CH,),-CHNHz-COOH ------> p-NH-{CH1):rCH2NH2 + co,
/
H,N arg1rnna H,N agmatma
COOH COOH
COOH NAD(P) NAO(P)H 1 H,O 1
1
CH,
1 ~ ¿¿ yH, \\ CH,
1
CH,
+ NH1
CH2 yHz 1
1 c:o
Hf-NH2 C=NH
1 1
COOH COOH
COOH
p1ndoxalfosfato CHr~H-CH2-CO-COOH
CH3
2-oxoísocapronato
CoA..,j
t-2(H)+C02
CHrCH - CH2-CO- SCoA
1
CH3
1sovaleril·CoA
Flg. 14.17 Vía degradativa de la t-2[H)
leucina. La L·leucina se transforma
en primer lugar por transaminación CH3-C =CH-CO - SCoA
1
en un 2-oxoácido. Éste se descarbo· CH3
xila oxidativamente formando el deri·
vado del CoA. Una deshidrogenación 3-meblcrotoml·CoA
conduce a 3-metilcrotonil-CoA. Una
carboxilación dependiente de la bioti·
rco2
na, seguida de una hidroxilación COOH
forma 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA. 1
CH2- C=CH-CO- SCoA
Los productos de escisión aceto-ace- 1
tato y acetil-CoA se transforman a CH3
través de las vías ya conocidas. En el 3-melllgtutaconil·CoA
ejemplo de la degradación de la leu-
cina queda claro que las reacciones r-H20
de carboxilación pueden participar
también en procesos degradativos. COOH OH
1 1:
La disminución en los contenidos de CH2-Ci- CH2-CO - SCoA
anhídrido carbónico del medio bajo ¡ : ... .,
un umbral determinado conduce en CH3j
muchos microorganismos al cese del 3· h1droxi·3· mehlglutaril·CoA
crecimiento.
t
HOOC- CH2-CO-CH3
acetoacetato aoetil..COA
14.12 Proteínas 491