Incubación del lisado para su uso

Una posible forma de aislar el ADN genómico es incubar el lisado crudo a temperaturas entre 90 –
100 ºC y luego usarlo directamente. Es evidente que mediante este método el ADN obtenido es de
muy baja pureza y con aplicaciones muy reducidas. Otra desventaja de este método son las pérdidas
de ADN por acción de las nucleasas y otros componentes de los orgánulos que están en contacto con
el ADN y pueden destruirlo, por lo que no es útil para almacenar el ADN pues los contaminantes
pueden degradar las moléculas de ADN.

Lisis por ruptura mecánica y extracción con disolventes orgánicos

Si se opta por realizar el lisado de las células mediante un proceso mecánico hay que tener en cuenta
la posibilidad de ruptura de las moléculas de ADN que se intentan separar, por lo que este debe
bastar para lograr la lisis de las células pero no ser muy agresivo para proteger el ADN. Este método
puede ser usado para extraer ADN de material crudo, liofilizado o congelado, que puede romperse
con un mortero, por congelación-descongelación o usando ultrasonidos. El lisado de células se puede
extraer con cloroformo, alcohol isoamílico o fenol, siendo las proteínas y otros componentes de la
célula solubles en el disolvente orgánico, por lo que de esta forma se logra la separación de los ácidos
nucleicos. Este método se puede usar para moléculas de ADN de alto peso molecular, obteniendo
buenos rendimientos de moléculas relativamente puras, siempre teniendo en cuenta que hay que
controlar el pH de la fase acuosa y la concentración de sales, que son los factores que aseguran una
buena separación. Las desventajas de este método son el uso de disolventes orgánicos dañinos para
la salud humana y que pueden quedar como trazas en la muestra de ADN y luego actuar como
interferentes en técnicas como el PCR, que es largo, en ocasiones puede dar rendimientos poco
reproducibles y requiere de varios trasvases que aumentan la posibilidad de contaminación de la
muestra.

Lisado y purificación con un detergente iónico. Método del CTAB

Este es un procedimiento básico para extraer ADN de vegetales, donde un detergente aniónico puede
romper la pared celular y así se produce la lisis de las células. El uso de detergentes aniónicos no solo
se restringe a la extracción de ADN vegetal, puede ser usado para ADN genómico de bacterias y otros
tipos de organismos. Un ejemplo de este método, quizás el más conocido, es el uso de CTAB (bromuro
de cetil trimetil amonio) como detergente para lograr la lisis. El CTAB además, en presencia de EDTA
como agente quelatante y TRIS-HCl como tampón, forma complejos insolubles con el ADN. Luego se
extraen los residuos orgánicos con cloroformo, para separar posteriormente el ADN por precipitación
con etanol. Si se quiere evitar el uso de disolventes orgánicos se puede llevar a cabo el método del
CTAB separando directamente los complejos insolubles formados con el ADN del sobrenadante
donde han quedado disueltos el resto de componentes celulares. Estos complejos se resuspenden
en disolución salina y se adiciona posteriormente alcohol y RNAsa, logrando que precipite el ADN con
un grado de pureza aceptable para muchas aplicaciones.

Método de salting-out
A partir de un lisado celular se pueden separar las moléculas de proteínas y otros contaminantes del
ADN mediante la adición de altas concentraciones de sal que hacen que disminuya la solubilidad de
las moléculas orgánicas en la fase acuosa. En este método se utiliza frecuentemente la proteinasa K,
el TRIS-HCl para regular el pH y otros reactivos químicos que aseguren la total inactivación de las
enzimas que pueden actuar sobre las moléculas de ADN. Para la extracción se utilizan sales
inorgánicas como el perclorato de sodio y el cloruro de sodio en concentraciones muy altas que hacen
precipitar a las moléculas orgánicas. El precipitado formado se separa por centrifugacón y luego se
puede extraer el ADN de la disolución acuosa mediante la adición de alcohol, por precipitación.
Este método es sencillo, pero no siempre es eficaz, por lo que el ADN obtenido en muchas ocasiones
debe ser purificado antes de ser usado en posteriores aplicaciones. La ventaja es que se elimina el
uso de disolventes orgánicos.

Uso de la proteinasa K y el dodecilsulfato de sodio

El procedimiento conocido como PK-SDS por sus siglas en inglés proteinase K - sodium dodecyl
sulfate, es uno de los más usados para la extracción de ADN ya que la digestión de la muestra se
puede realizar con proteinasa K que es activada por el dodecil sulfato de sodio. La proteinasa K
inactiva las DNAsas presentes en el lisado celular usando detergente aniónico el SDS. La proteinasa K
también es usada en otros de los métodos descritos en este artículo para la digestión de las proteínas
y otros contaminantes del lisado celular.

Método de extracción de ADN con yoduro de sodio como agente caotrópico en un único tubo
La compañía Wako pone a disposición de los investigadores y empresas varios kit de ADN que usan
yoduro de sodio como agente caotrópico, que tienen la ventaja de que la extracción se realiza en un
único micro tubo de centrifugado. El yoduro de sodio además de provocar la lisis celular rompe la
capa de hidratación que rodea el ADN y logra que las cargas negativas de los grupos fosfatos del ADN
queden más expuestas. En estos kits después del tratamiento de la muestra con yoduro de sodio en
el mismo tubo se adicionan detergentes aniónicos como es el caso del N-lauril sarcosinato de sodio,
proteinasa K y/o otros reactivos que permiten separar las proteínas y lípidos contenidos en las
muestras biológicas del ADN.
Plantas
La extracción de ADN se utiliza en la modificación genética de las plantas. Muchas empresas
agrícolas utilizan la extracción genética para crear el ADN que luego modifican para que una
determinada cepa genética de un cultivo sea resistente a varias sustancias químicas o plagas. Un
ejemplo es el número de líneas de semillas fabricadas por la Corporación Monsanto, que son
inmunes al herbicida Roundup. Al hacer los cultivos (remolacha, por ejemplo) resistentes al
Roundup, el herbicida en cuestión puede ser rociado sobre los campos para matar las malas
hierbas, pero sin afectar la cosecha de remolacha.

Animales
La extracción de ADN es también el primer paso en la ingeniería genética de los animales. La
ingeniería genética de los animales es un tema muy amplio que va desde el cambio de un solo gen
para que, en un ejemplo de un laboratorio de investigación de Taiwán, un cerdo brille en la
oscuridad. En el extremo más complejo de todo el espectro de la ingeniería genética está la
clonación de animales, un proceso del cual se pueden hacer animales idénticos.

Farmacéuticos
La extracción de ADN se utiliza como el paso inicial en la fabricación de un número de productos
farmacéuticos. Los farmacéuticos hechos a través de la genética recombinante, incluyen la
hormona de crecimiento bovina (BVH) y la hormona del crecimiento humana (hGH). Además de un
número de otras hormonas, una de las más utilizadas es la insulina.

Diagnósticos médicos
El diagnóstico de ciertas condiciones médicas a menudo se pueden hacer a partir del ADN extraído
de un paciente. Las condiciones que pueden ser diagnosticadas mediante pruebas genéticas son la
fibrosis quística, anemia de células falciformes, síndrome de X frágil, la enfermedad de Huntington,
el síndrome de hemofilia A Down y la enfermedad de Tay-Sachs. Además de diagnosticar las
enfermedades existentes, también es común probar para ver si una persona es portadora de una
enfermedad en particular, pero sin tenerla.

Verificación de identidad
Un uso bien conocido para la extracción genética es la huella genética, un proceso en el cual el
material genético puede ser emparejado en una escena del crimen, por ejemplo. La verificación
genética ha trabajado tanto para colocar a una persona en la escena de un crimen, como para
exonerar a las personas condenadas erróneamente por un delito.