Secuencia Completa del Genoma de Lactobacillus

rhamnosus Cepa BPL5 (CECT 8800), un Probiótico para el

Tratamiento de Vaginosis Bacteriana

Empar Chenoll, Francisco M. Codoñer, Juan F. Martinez-Blanch, Daniel Ramón, Salvador Genovés,
Marco Menabritoc

Introducción Resultados

La Vaginosis Bacteriana es un trastorno común en La secuenciación proporcionó un total de 150,292 secuencias las cuales fueron filtradas según
mujeres de edad reproductiva caracterizado por su calidad proporcionando un total de 51,060 secuencias con una longitud media de lectura de
disbiosis, donde la microbiota vaginal de lactobacilos
13.408 nucleótidos. La producción total fue de 684 Mb
es abrumada por un crecimiento excesivo de
organismos patógenos.

El Lactobacillus rhamnosis BPL5 (CECT 800) muestra

propiedades funcionales en el tratamiento de
infecciones vaginales y del tracto urogenital causada
por la deficiencia de lactobacilos.

Metodología

-Aislamiento del Lactobacillus rhamnosus Cepa

BPL15 (CECT 8800) de las vaginas de mujeres sanas

Usando la anotación Pokka se predijo la existencia de tRNA, rRNA, mRNA.

Usando los softwares Argorn, RNAmmer, Prodigal y SignaIP se predijo la existencia de péptidos
-Tecnología de secuenciación masiva de señal y la lectura de los genes.
-Plataforma PacBio (Pacific Biosciencies, Menlo Park,
CA) Los genes putativos fueron asignados a los genes codificantes de proteínas (CDS) en función
de su similitud con secuencias en las bases de datos respectivas

Los CDS fueron comparados contra la base de datos MvirDB de factores de virulencia y la base
de datos CARD de genes resistentes a antibióticos.

-Secuenciación de una sola molécula en tiempo real Se obtuvieron términos de Ontología Génica Asociada (GO) combinándolos con las proteínas de
(SMRT) referencia con la base de datos Swiss-Prot

Los resultados generales se muestran en la siguiente tabla:

Elementos ORF Canónico No Canónico RNAs rRNA tRNA

del genoma estructural

-Software Prokka versión 1.11 2,890 2,814 2,292 522 76 15 61

-Software Aragorn
-Software RNAmmer
-Software SignaIP
-Software Prodigal
-Base de datos BLAST
-Base de datos Swiss-Prot Conclusiones
-Base de datos MvirDB El genoma de L. rhamnosus CECT 8800 se comparo con la cepa comercial L. rhamnosus GG
(ATTCC 53103) con la base de datos BLAST.
En esta comparación se detectaron 392 elementos faltantes en la cepa probiótica L.
rhamnosus GG.
El estudio de los resultados del genomas completo de L. rhamnosus CECT 8800 puede ayudar
a comprender mecanismos implicados en su efecto contra la vaginosis bacteriana.

Referencias
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Biología Molecular