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BIOQUIMICA 201103_35

UNIDAD 2: ÁCIDOS NUCLEICOS - FASE 4 TRABAJO COLABORATIVO 1

PRESENTADO POR:
MAIRA ALEJANDRA GALLEGO NARVÁEZ 1.116.238.414
CAMILA ALEJANDRA MENDOZA MONTANO 1.116.264.760
OLGA FERNANDA REYES 1.116.259.779
GLORIA ELSY AGUDELO

PRESENTADO A
ALBERTO GARCIA

UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA - UNAD


ESCUELA DE CIENCIAS BASICAS, TECNOLOGÍA E INGENIERÍA – ECBTI
CEAD PALMIRA
ABRIL 20 DE 2017
INTRODUCCIÓN

En este trabajo se estudiaran conocimientos básicos acerca de las Biomoléculas y su


metabolismo y la utilización de la ingeniería de la genética pruebas, al mismo tiempo de
la importancia de la insulina, cuando el cuerpo humano no son capaces de producir esta
hormona que se fabrica en el páncreas y que permite que la glucosa de los alimentos
pase a las células del organismo, en la ingeniería genética la producción de insulina es
un avance muy importante para la producción de esta en pacientes con La diabetes; La
bioquímica es muy importante ya que esta es la encargada de estudiar la composición
química de los seres vivos.
En espacial para las proteínas, carbohidratos, lípidos y ácidos nucleicos, además de
otras pequeñas moléculas presentes en las células y las reacciones químicas que sufren
estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energía (catabolismo) y
generar biomoléculas propias (anabolismo). Es frecuentemente descrita como el estudio
de la química de la vida e incluye el estudio de todas las formas de vida y utiliza los
conceptos básicos derivados de la biología, química, física y matemáticas. En este
trabajo colaborativo se estudiaran conocimientos básicos acerca de las Biomoléculas y
su metabolismo a través del conocimiento de las interacciones entre ellas, además se
reconocerán los aminoácidos como unidades estructurales de las proteínas y como hace
parte de estas.
OBJETIVOS

 Analizar En términos de bioquímica la composición y su estructura de un ácido


nucleico bacteriano es idéntico o igual a cualquier célula llámese eucariota o
cualquier otro tipo de célula.

 Determinar La importancia de ingeniería genética dado que es técnica que


consiste en la introducción de genes en el genoma de un individuo que carece
cuando carece de estos.

 Demostrar que la ingeniería genética la producción de insulina es un avance muy


importante para la producción de esta en pacientes con La diabetes esta insulina
es la hormona hipoglucemiante lo que hace de reducir la concentración de
glucosa en sangre.
DESARROLLO DE LA ACTIVIDAD

1.1 Situación problema 1

Muchas bacterias poseen además ADN extra cromosómico, también circular y cerrado,
denominado ADN plasmídico por estar contenido en los plásmidos. Éstos, portan
información génica para muchas funciones que no son esenciales para la célula en
condiciones normales de crecimiento. Este plásmido ha sido aprovechado para realizar
la inserción de un gen de interés y en 1978, se logró cultivar bacterias E.coli (Escherichia
coli), la cual contenía un gen humano para producir insulina en gran cantidades y a bajo
costo. Aunque esta alternativa fue contundente dio paso a nuevas aplicaciones
biotécnicas, mejorando la calidad de vida de las personas diabéticas que no pueden
Producir secreción de insulina por las células β del páncreas en respuesta al aumento
de los niveles de glucosa.

 1 Analice En términos bioquímicos la composición y estructura de los ácidos


nucleicos bacterianos e identifique si hay diferencia estructurales con el de otra
célula (p.e eucariotas).

En términos de bioquímica la composición y su estructura de un ácido nucleico


bacteriano es idéntico o igual a cualquier célula llámese eucariota o cualquier otra, pero
hay que recordar que los acidos nucleicos son macromoléculas compuestas de
nucleótidos unidos en forma covalente por medio de enlaces fosfodiester entre los
carbonos de las posiciones 3´ y 5´ de dos residuos de azúcares adyacentes. Estos
forman un esqueleto de azúcar y fosfatos en toda esta macromolécula, la variación entre
los nucleótidos que constituyen la cadena de ácido nucleico y bases nitrogenadas ADN
son: adenina (A), timina (T), citocina (C) y guanina (G) y para el ácido ribonucleico (ARN)
son en lugar de timina, el uracilo (U). La A y G se denominan bases púricas o purinas,
mientras que T, U, y C se denominan bases pirimidínicas o pirimidinas. normalmente las
células se enfrentan a un problema para almacenar cadenas largas como las del ADN y
que en las células eucariotas que poseen histonas asociadas a su genoma las cuales
compactan el ADN en estructuras tipo nucleosomas se da de manera fácil en cualquier
de las células eucariotas, Por lo tanto, deben compactar su ADN de otra manera esta
habilidad con la que no cuentan las células bacterianas, por otra parte solucionan dicho
inconveniente adaptando el ADN a una estructura terciaria denominada
superenrollamiento, el cual consiste en enrollar su propio eje de doble hélice sobre sí
mismo. Este superenrollamiento se dice que tiene sentido negativo porque tiene el
sentido contrario al enrollamiento de una hebra de ADN sobre la otra.

 2 Analice La importancia de ingeniería genética en una técnica que consiste en


la introducción de genes en el genoma de un individuo que carece de ellos, esto
se realiza a través de las enzimas de restricción que son capaces de "cortar" el
ADN en puntos concretos; denominándose ADN recombinante, el que se ha
formado cuando se intercala un segmento de ADN extraño en un ADN receptor.

Se realiza a través de las enzimas de restricción que son capaces de "cortar" el ADN en
puntos concretos. Se denomina ADN recombinante al que se ha formado al intercalar un
segmento de ADN extraño un ADN receptor. Por ejemplo, la integración de un ADN
vírico en un ADN celular, esta tecnología nos permite obtener fragmentos de ADN en
cantidades ilimitadas, que llevará además el gen o los genes que se desee. Este ADN
puede incorporarse a las células de otros organismos (vegetales, animales, bacterias...)
en los que se podrá "expresar" la información de dichos genes. (De una manera muy
simple podemos decir que "cortamos" un gen humano y se lo "pegamos" al ADN de una
bacteria; si por ejemplo es el gen que regula la fabricación de insulina, lo que haríamos
al ponérselo a una bacteria es "obligar" a ésta a que fabrique la insulina. Actuación de
las distintas enzimas de restricción, se pueden separar por tamaños, es decir, según el
número de pares de nucleótidos que llevan, mediante la técnica de electroforesis y así
estudiar los distintos trozos. Según donde se hallen las secuencias de reconocimiento,
un gen determinado puede estar fragmentado en varios trozos, o bien un trozo puede
contener varios genes, posibilidades que hay que confirmar. En el proceso de la
electroforesis se prepara una mezcla de fragmentos de ADN y se ponen en distintas
soluciones. Los fragmentos se desplazan en relación inversa con su tamaño, los
fragmentos más pequeños se mueven rápidamente, mientras que los grandes lo hacen
muy lentamente.

 3 Analice La insulina es como una llave que abre la cerradura de las puertas de
las células del cuerpo para que la glucosa (azúcar en la sangre) pueda entrar y
sea utilizada como energía. La glucosa no puede entrar en las células, se acumula
en la sangre.

Si la glucosa no puede entrar en las células, se acumula en la sangre. Si se deja sin


tratamiento, la acumulación de azúcar en la sangre puede causar complicaciones a largo
plazo. Además, cuando los niveles de azúcar alcanzan cierto nivel, los riñones tratan de
eliminarla por medio de la orina, lo que quiere decir que necesitará orinar con más
frecuencia. Esto puede hacer que se sienta cansado, sediento y hambriento. Puede
también empezar a perder peso. Su cuerpo empezará a formar energía de un azúcar
complejo llamado glucógeno, que se almacena en el hígado y músculos. El hígado
convierte el glucógeno en glucosa y lo libera en el torrente sanguíneo cuando se está en
estrés o cuando se tiene mucha hambre. Cuando la insulina está presente, los músculos
pueden utilizar el glucógeno como energía sin tener que liberarlo al torrente sanguíneo.
Mapa conceptual de la situación 1 “resumen”

Situación 1
En las bacterias poseen además ADN extra cromosómico, también circular
y cerrado, denominado ADN plasmídico por estar contenido en los
plásmidos. Éstos, portan información génica para muchas funciones que
no son esenciales para la célula en condiciones normales de crecimiento.

1 Analice: en términos bioquímicos, 2 Analice: La importancia de 3 Analice: La insulina es como una


diferencia estructural entre los ingeniería genética en una técnica llave que abre la cerradura de las
ácidos nucleicos bacterianos con el que consiste en la introducción de puertas de las células del cuerpo
de otra célula (p.e eucariotas). genes en el genoma de un para que la glucosa (azúcar en la
individuo que carece de ellos. sangre) pueda entrar y sea utilizada
como energía.

 En términos de bioquímica la  Se realiza por medio de enzimas


composición y su estructura de  Si la glucosa no puede entrar en
de restricción que son capaces
un ácido nucleico bacteriano es las células, se acumula en la
de "cortar" el ADN en puntos
idéntico o igual a cualquier sangre puede causar
concretos.
complicaciones a largo plazo ya
célula llámese eucariota.  Con la ingeniería genética por
 Las células enfrenta un problema que alcanza el nivel el más alto
medio de esta tecnología nos
para almacenar cadenas largas y pueda que se sienta cansado,
permite obtener fragmentos de
como las del ADN y que en las sediento y hambriento
ADN en cantidades ilimitadas.
células eucariotas que poseen empezando a formar
histonas asociadas. glucógeno.
2. Situación problema 2 La inhibición enzimática (paso 1)

Gran parte de la farmacoterapia está basada en los conceptos la inhibición enzimática.


Los fármacos se diseñan en la inhibición específica de la ruta metabólica y se puede
destacar fármacos antivíricos, antibacterianos y antitumorales. En el caso de los
envenenamientos irreversible se conoce también como "envenenamiento" del enzima.
Por ejemplo algunos compuestos organofosforados tóxicos llamados venenos nerviosos,
que se utilizan como insecticidas, actúan inhibiendo irreversiblemente al enzima
acetilcolinesterasa, la cual interviene en la actividad del sistema nervioso.

 1 Analice. Los tipos de inhibición que existen y la importancia tanto en la


regulación del metabolismo celular. Igualmente es importante reconocer la acción
de la sustancias extrañas al organismo pueden causar alteraciones en el
funcionamiento celular.

Si bien sabemos la inhibición enzimática es un compuesto que impide que algunas


enzimas se catalicen. De esta forma inhiben el proceso de las enzimas específicas. En
este grupo de inhibidores podemos encontrar fármacos, venenos, antibióticos o
conservantes alimentarios. Un ejemplo de envenenamiento podría ser por toxinas de
origen bacteriano como el (Botulismo : Exoneurotoxinas del Clostridium botulinum, las
cuáles inhiben la secreción del receptor de la acetolcolina a nivel del terminal sináptico.)
o por metales pesados como el (Mercurio: Produce síntomas a nivel del SNC: temblor,
ataxia y alteraciones neuropsiquiatrías; junto con afectación del SNP en forma de poli
neuropatía dolorosa y afectación del sistema nervioso autónomo) En ambos casos
pueden causar la muerte. La inhibición suicida es un tipo común de inhibición irreversible
donde la enzima convierte al inhibidor en una sustancia reactiva en su centro activo. Un
ejemplo de esto es el inhibidor de biosintetizadores de poliaminas α-
difluorometilornitina o DFMO, que es un análogo del aminoácido ornitina, y es usado para
tratar la Tripanosomiasis Africana (enfermedad del sueño). La ornitina
decarboxilasa puede catalizar la descarboxilación del DFMO sustituyendo a la ornitina,
como se muestra en la figura del apartado anterior. Sin embargo, esta reacción de
descarboxilación es seguida por la eliminación del átomo de flúor, lo que convierte a este
intermediario en una imina, una especie altamente electrofílica. Esta forma reactiva del
DFMO reacciona posteriormente con un residuo de cisteína o lisina en el centro activo
para inactivar la enzima irreversiblemente.

 2 Analice Los inhibidores reversibles se combinan transitoriamente con el enzima,


de manera parecida a como lo hacen los propios sustratos. Algunos inhibidores
reversibles no se combinan con el enzima libre sino con el complejo enzima-
sustrato. NOTA-1: La comprensión de están variantes de la actividad enzimática
ha cambiado la industria farmacológica, de alimentos, desarrollos biotecnológicos
y de la industria, de ahí la importancia de su comprensión.

Una inhibición enzimática irreversible es cuando, modifica o destruye el enzima, y


este no puede recuperar su actividad nuevamente. ¿Por qué se dice que es
irreversible?, esto es porque la enzima colisiona con el inhibidor no puede seguir
catalizando debido a la toxicidad de estos compuestos ya que tienen una concentración
muy alta dentro de un sistema viviente, y pueden detener una vía metabólica debido a la
pérdida total de alguna de las enzimas que catalizan esa serie de reacciones. Los
inhibidores reversibles se combinan transitoriamente con el enzima, de manera parecida
a como lo hacen los propios sustratos. Algunos inhibidores reversibles no se combinan
con el enzima libre sino con el complejo enzima-sustrato. Como se ha definido un
inhibidor enzimático son moléculas que se unen a enzimas y disminuyen su actividad,
fueron creados para imitar el estado de transición o intermedio de una reacción
catalizada por una enzima como por ejemplo el Ritonavir que es un inhibidor de la
proteasa, una clase muy efectiva de fármacos antirretrovirales usados para tratar el VIH.

La inhibición enzimática reversible comprende tres tipos:

 Inhibición competitiva: ocurre es cuando el sustrato y el inhibidor no se pueden


unir a la misma enzima al mismo tiempo.
 Inhibición no competitiva: que es cuando el sustrato y el inhibidor se pueden
unir a la enzima al mismo tiempo, sin embargo el inhibidor afecta la unión de
sustrato y viceversa
 Inhibición mixta: ocurre cuando al unirse el inhibidor la enzima, esta reduce su
actividad pero no afecta la unión del sustrato, por lo tanto el grado de inhibición
depende de la concentración del inhibidor

(Paso 2)
Para esta actividad realice el cálculo de la tabla 1. Para dichos cálculos, utiliza el método
de Lineweaver – Burk, Calcule los recíprocos de la actividad enzimática y concentración
de sustrato y grafique 1/v como función de 1/[S].

De esta gráfica, determine los valores para Vmax y Km, determinando los recíprocos de
los interceptos en Y y X de la gráfica. Consulte el documento: Aplicación de las
herramientas informáticas en el tratamiento de la información científico de
Mauricio Restrepo Gallego
El Método de Lineweaver – Burk

[s](Mm) Vo(Mm/min) 1/[s] 1/v0


50 10 0,02 0,1
100 19 0,01 0,052632
160 29 0,00625 0,034483
190 34 0,005263 0,029412
210 44 0,004762 0,022727
240 49 0,004167 0,020408
290 46 0,003448 0,021739
300 51 0,003333 0,019608
400 58 0,0025 0,017241
500 63 0,002 0,015873
720 73 0,001389 0,013699
800 81 0,00125 0,012346
1000 87 0,001 0,011494

Cinetica Enzimatica y = 4.6923x + 0.005


0.12
m b
0.1
4,692306 0,004997
0.08
Cinetica Enzimatica
0.06
Vmax= 200,1174 0.04 Linear (Cinetica
Km= 939,0122 Enzimatica)
0.02
0
0 0.005 0.01 0.015 0.02 0.025

1. Analice las principales características estructurales de las enzimas, sitio activo, la


formación de complejos y la cinética enzimática Modelo de Michaelis y Menten
(Dependencia de la concentración de sustrato).

Siempre y cuando haya sustrato disponible, un aumento en la concentración de la enzima


aumenta la velocidad enzimática hacia cierto límite.
Las reacciones de orden cero, se refieren a aquéllas en las que la velocidad de la
reacción es independiente de la concentración de reactantes. Pará una reacción
catalizada por una enzima, se tiene diferentes órdenes de reacción, dependiendo de la
concentración del sustrato. En el ejemplo de la gráfica se tiene una concentración fija y
constante de enzima que no varía a lo largo del experimento. Lo único que cambia es la
concentración del sustrato. A bajas concentraciones de sustrato, la velocidad de la
reacción depende de la tendencia inherente a reaccionar en la superficie de la enzima y
de la concentración del sustrato, por lo que la velocidad aumenta al aumentar la
concentración del sustrato. En esta parte de la curva se tiene una típica reacción de
primer orden. En el extremo derecho de la gráfica.
EL MODELO CINÉTICO DE MICHAELIS-MENTEN
El planteamiento del modelo se inicia con la suposición de que las reacciones catalizadas
por una enzima proceden en dos pasos. En la primera etapa, la enzima se una al sustrato
para dar el complejo enzima-sustrato [ES] en donde K1 es la constantes de velocidad de
segundo orden que describe la interacción de la enzima con el sustrato; k2 es la
constante de velocidad de primer orden para la disociación del complejo ES y Ks la
constante de equilibrio para la disociación del complejo ES.
En la segunda etapa, el complejo ES forma el producto (P) y lo libera con una constante
de velocidad de primer orden que se llama constante catalítica (K3), debido a que está
asociada al proceso catalítico de la transformación del sustrato en producto. En los
primeros momentos de la reacción la concentración del producto P, es depreciable y se
hace la suposición simplificadora de que puede ignorarse la reacción inversa PS.

2. Analice Significado biológico de Km. En términos prácticos la Km, como una medida de
la afinidad de la enzima por su sustrato, más pequeño es su valor mayor es la afinidad
de la enzima por el sustrato.

3. Analice Las enzimas con una Km muy baja (10-6-10-8M) son importantes en el
metabolismo.
Mapa conceptual de la situación 2 “resumen”

Situación 2
Gran parte de la farmacoterapia está basada en los conceptos la inhibición
enzimática, Los fármacos se diseñan en la inhibición específica de la ruta
metabólica y se puede destacar fármacos antivíricos, antibacterianos y
antitumorales.

2 Analice: Los inhibidores


1 Analice: Los tipos de inhibición que existen y reversibles se combinan
la importancia tanto en la regulación del transitoriamente con el enzima, de
metabolismo celular. Reconocer la acción de manera parecida a como lo hacen
las sustancias extrañas al organismo puede los propios sustratos, algunos no se
causar alteraciones combinan con el enzima libre sino
con el complejo enzima-sustrato.

 la inhibición enzimática es un
compuesto que impide que  La inhibición enzimática irreversible es cuando,
algunas enzimas se catalicen. modifica o destruye el enzima, y este no puede
 En este grupo de inhibidores recuperar su actividad nuevamente y se vuelven
podemos encontrar fármacos, irreversibles porque la enzima colisiona con el
venenos, antibióticos o inhibidor no puede seguir catalizando debido a la
conservantes alimentarios. toxicidad de estos compuestos por sus
 También se puede encontrar concentraciones altas.
 Algunos inhibidores reversibles no se combinan
La inhibición suicida es un tipo
común de inhibición irreversible con el enzima libre sino con el complejo enzima-
donde la enzima convierte al sustrato.
inhibidor en una sustancia.
reactiva en su centro activo
CONCLUSIONES

Gracias a este trabajo colaborativos podemos participar de forma activa discutiendo y


organizando cada uno de los puntos requeridos por la guía y tutor, también pudimos
aprender las técnicas y procedimientos utilizados en la realización de las pruebas
descriptas anteriormente. Todos estos conceptos hacen parte de nuestra formación
como profesionales, ya que nos ayudan a entender de mejor forma el comportamiento
de los distintos nutrientes suministrados en la formación de nuevos bloques de proteínas,
carbohidratos y lípidos, así como también las alteraciones que sufren conllevando a la
alteración del metabolismo y enfermedad del organismo de igual forma el avance que la
tecnología y ciencia ha obtenido a partir de la ingeniería de la genética.
BIBLIOGRAFIA

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I-09_final_copia.pdf

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