El camino de shikimate proporciona una ruta alternativa a los compuestos aromáticos,

particularmente los aminoácidos aromáticos l-fenilalanina, l-tirosina, y-triptófano. Esta vía

es empleada por microorganismos y plantas, pero no por animales; en consecuencia, los
aminoácidos aromáticos presentan entre los aminoácidos esenciales para el hombre y
tienen que ser obtenidos en la dieta. Un intermediario central en el camino es el Ácido
shikímico (Figura 4,1), un compuesto que había sido isolatedfrom plantas de Illiciumspecies
(Japonés ' shikimi ') muchos años antes de que su papel en el metabolismo se había
descubierto. La fenilalanina y la tirosina forman la base de C6C3 fenilpropano unidades
encontradas en muchos productos naturales, por ejemplo, ácidos cinámico, cumarinas,
lignanos, y flavonoids, y junto con el triptófano son precursores de una amplia gama de
estructuras de alcaloides. Además, se encuentra que muchos derivados simples del ácido
benzoico, e.g. ácido galo y ácido p-aminobenzoico (PABA; ácido 4-aminobenzoico), se
producen vía bifurcación en el camino de shikimate. El Ácido shikímico es materia prima
currentlythe para la síntesis del fármaco antiviral oseltamivir (Tamiflu ®), en demanda como
defensa contra la influenza aviar (ave flu) (Figura 4,1); la fuente principal de la planta es
frutas del anís de la estrella (Illicium verum;) (Illiciaceae), aunque los fabricantes están
pasando a cultivos de Escherichia coli modificada genéticamente como una fuente
alternativa.
AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS Y ÁCIDOS BENZOICOS SIMPLES La vía del shikimato comienza
con un acoplamiento de fosfoenolpiruvato (PEP) de la ruta glucolítica y d-eritrosa 4-fosfato
del ciclo de la pentosa fosfato para dar el 3-desoxi-d-arabino-heptulosónico de siete
carbonos ácido 7-fosfato (DAHP, Figura 4.2). Se sabe que esta reacción, que se muestra aquí
como una condensación de tipo aldólico, es mecánicamente más compleja en la versión
catalizada por enzimas; también se ha descubierto que varias de las otras transformaciones
en la ruta son sorprendentemente complejas. AMINOÁCIDOSAROMÁTICOS Y ÁCIDOS
BENZOICOS SIMPLES La ruta del shikimato comienza con un acoplamiento de
fosfoenolpiruvato (PEP) de la vía glucolítica y d-eritrosa 4-fosfato de la pentosa ciclo de
fosfato para dar 7-fosfato de ácido 3-desoxi-d-arabino-heptulosónico de siete carbonos
(DAHP, Figura 4.2). Se sabe que esta reacción, que se muestra aquí como una condensación
de tipo aldólico, es mecánicamente más compleja en la versión catalizada por enzimas;
varias de las otras transformaciones en la ruta también se han encontrado
sorprendentemente complejas. La eliminación del ácido fosfórico de DAHP seguido de una
reacción aldólica intramolecular genera el primer ácido 3-deshidroquinico intermedio
carbocíclico. Sin embargo, esto también es una simplificación excesiva. La eliminación del
ácido fosfórico en realidad sigue a una oxidación dependiente de NAD + del hidroxilo
central, y luego se vuelve a formar en una reacción de reducción dependiente de NADH en
el compuesto de carbonilo intermedio antes de que se produzca la reacción aldólica. Todos
estos cambios ocurren a través de la función de una sola enzima, la 3-dehidroquinato
sintasa. La reducción del ácido 3-dehidroquinico conduce al ácido quínico, un producto
natural bastante común que se encuentra en forma libre, como ésteres, o en combinación
con alcaloides como la quinina (véase la página 381). El propio shikimicacid se forma a partir
del ácido 3-dehidroquinico a través del ácido 3-deshidroxímico a través de pasos de
deshidratación (3-deshidroquinasa) y reducción (shikimate deshidrogenasa). De acuerdo
con el organismo, se reconocen dos tipos distintos de enzimas dehidroquinasa, que
emplean diferentes mecanismos de reacción. Una enzima bifuncional cataliza los dos pasos
en las plantas. Los ácidos fenólicos simples ácido protocatechuico (ácido 3,4-
dihidroxibenzoico) y ácido gálico (ácido 3,4,5trihidroxibenzoico) se pueden formar
mediante reacciones de punto de ramificación del ácido 3-deshidroxímico que implican
deshidratación e enolización, o, en el caso del ácido gálico , deshidrogenación e enolización.
El ácido gálico se presenta como un componente de muchos taninos, que son materiales de
plantas que se han utilizado durante miles de años en el curtido de pieles de animales para
fabricar cuero debido a su capacidad de entrecruzar moléculas de proteínas. Los
galotaninos son ésteres del ácido gálico con un polialcohol, típicamente glucosa, v.g.
pentagaloilglucosa, mientras que los elagitaninos contienen una o más funciones de ácido
hexahidroxidifénico, p. tellimagrandin II (Figura 4.3). Los ésteres de ácido
hexahidroxidifenico se forman por acoplamiento oxidativo fenólico de las funciones de
galloilo catalizadas por una enzima fenol oxidasa tipo lacasa (figura 4.3). La hidrólisis
química de una elagitanina conduce a la formación del ácido elágico dilactona. El éster de
glucosa β-glucogallina es una entidad crucial en la formación de galotaninos, que actúa
como sustrato para la esterificación adicional, y también como el donante de otros grupos
de galloilo (Figura 4.3). β-Glucogallin es una forma activada de ácido gálico y tiene una
reactividad similar a un tioéster CoA. Los taninos también contribuyen a la astringencia de
los alimentos y bebidas, especialmente el té, el café y los vinos, a través de su fuerte
interacción con las proteínas salivales. Además, tienen propiedades antioxidantes
beneficiosas (véase también taninos condensados, página 171).
Un compuesto de punto de ramificación muy importante en la vía del shikimato es el ácido
corísico (Figura 4.4), que ha incorporado una molécula adicional de PEP como una cadena
lateral de éter enol. Una reacción de fosforilación dependiente de ATP simple produce 3-
fosfato de ácido shikímico, y esto es seguido por una reacción de eliminación de adición con
PEP para dar 3-fosfato de ácido 5-enolpiruvilhımico (EPSP). Esta reacción es catalizada por
la enzima EPSP sintasa.
El glifosato derivado de N- (fosfonometil) glicina sintético (Figura 4.4) es un poderoso
inhibidor de esta enzima y se cree que se une al sitio de unión de PEP en la enzima. El
glifosato encuentra un uso considerable como un herbicida de amplio espectro, la planta
muere por su incapacidad para sintetizar aminoácidos aromáticos. La transformación de
EPSP en ácido corórmico (figura 4.4) implica una eliminación 1,4 del ácido fosfórico, aunque
esta no es una simple eliminación concertada.
A pesar de la reacción que no implica un cambio general en el estado de oxidación, la enzima
requiere FMN reducida, que no se consume en la reacción, y se cree que esta coenzima
participa mediante transferencia inversa de un electrón al sustrato. La biosíntesis de ácido
corísico a partir de fosfoenolpiruvato y d-eritrosa 4-fosfato implica siete actividades
enzimáticas. En la mayoría de los procariotas, estas son actividades monofuncionales,
mientras que las plantas utilizan la actividad bifuncional deshidroquinasa-shikimate
deshidrogenasa ya mencionada. Los hongos, sin embargo, poseen un complejo enzimático
multifuncional (denominado AROM) que cataliza cinco transformaciones sucesivas
(reacciones 2-6). El ácido 4-hidroxibenzoico (figura 4.5) se produce en bacterias a partir de
ácido corórmico mediante una reacción de eliminación, perdiendo la cadena lateral de
ácido enolpirúvico recientemente introducida. La estereoquímica de la eliminación es
inusualmente sincronizada, por lo que el mecanismo es tal vez más complejo que a primera
vista. En las plantas, el ácido 4-hidroxibenzoico está formado por una rama mucho más allá
en la ruta a través de la degradación de la cadena lateral de los ácidos cinámicos (véase la
página 157). Los tres ácidos fenólicos encontrados hasta ahora, el 4-hidroxibenzoico, el
protocatecúico y el ácido gálico, demuestran algunos de los patrones de hidroxilación
característicos de los metabolitos derivados del ácido shikímico, es decir, un solo grupo
hidroxi para la función de la cadena lateral, grupos dihidroxi dispuestos en orto para cada
otros, típicamente 3,4- a la cadena lateral, y grupos trihidroxilo también en orto entre sí y
3,4,5- a la cadena lateral. El soltero
la parahidroxilación y los patrones de orto-polihidroxilación contrastan con los típicos meta-
hidroxiactiles característicos de los fenoles derivados a través de la vía del acetato (ver
página 101), y en la mayoría de los casos permiten deducir el origen biosintético (acetato o
shikimato) de un anillo aromático mediante inspección. El ácido 2,3-dihidroxibenzoico y (en
los microorganismos, pero no en las plantas, ver página 161) el ácido salicílico (ácido 2-
hidroxibenzoico) se derivan del ácido corismático a través de su ácido isomorísmico
isomérico (figura 4.5). La isomerización implica un tipo SN2 de reacción, un nucleófilo de
agua entrante que ataca el sistema de dieno y desplaza el hidroxilo. El ácido salicíclico surge
por una reacción de eliminación análoga a la que produce el ácido 4-hidroxibenzoico a partir
del ácido corísico, de nuevo con estereoquímica sin. En la formación de ácido 2,3-
dihidroxibenzoico, la cadena lateral del ácido isocorísmico se pierde primero por hidrólisis,
luego la deshidrogenación del 3-hidroxi a 3-ceto permite la enolización y la formación del
anillo aromático. El ácido 2,3-dihidroxibenzoico es un componente del potente quelante del
hierro (sideróforo) enterobactina (figura 4.6) que se encuentra en Escherichia coli y en
muchas otras bacterias gramnegativas. Tales compuestos juegan un papel importante en el
crecimiento bacteriano al poner a su disposición concentraciones suficientes de hierro
esencial. La enterobactina comprende tres moléculas de ácido 2,3-dihidroxibenzoico y tres
del aminoácido l-serina, en forma de triéster cíclico. Las enzimas implicadas en la biosíntesis
de la enterobactina están codificadas por un clúster de seis genes; algunas enzimas tienen
más de una función. Parte de este clúster codifica para la conversión del ácido isocorísmico
a ácido 2,3-dihidroxibenzoico y el resto para un NRPS modular como se ve en la biosíntesis
no ribosómica de péptidos (véase la página 438), aunque a un nivel mínimo con solo dos
módulos, ya que solo se crea un único enlace peptídico (amida). El ácido 2,3-
dihidroxibenzoico y la serina se activan a través de un mecanismo mediado por ATP antes
de unirse al complejo enzimático a través de un enlace tioéster. También se usa un
enlazador de fosfopanteteína (compare la biosíntesis de ácidos grasos, página 40). Los pasos
de formación de lactona también se catalizan, con una lactonización intramolecular final
para dar el trímero, que se libera de la enzima. Los análogos amino simples de los ácidos
fenólicos se producen a partir del ácido corórmico mediante transformaciones relacionadas
en las cuales el amoníaco, generado a partir de la glutamina, actúa como un nucleófilo
(Figura 4.5). El ácido chorísmico puede aminarse en C-4 para dar ácido 4-amino-4-
desoxicorísmico y luego ácido p-aminobenzoico (PABA), o en C-2 para dar el análogo de
ácido isocorísmico que dará ácido 2-aminobenzoico (antranílico). Se ha encontrado que la
aminación en C-4 ocurre con la retención de la configuración, por lo que tal vez se trate de
un mecanismo de inversión doble. La eliminación de syn que transforma el ácido 4-amino-
4-desoxicodósmico en PABA requiere el cofactor piridoxal fosfato y procede a través de la
imina a través del grupo aminogrupo. El PABA forma parte de la estructura del ácido fólico
(vitamina B9; figura 4.7) [Recuadro 4.1]. La estructura del ácido fólico se construye (Figura
4.7) a partir de un dihidropterin difosfato que reacciona con PABA para dar ácido
dihidropteroico, un paso enzimático para el cual los antibióticos sulfonamida son
inhibidores. El ácido dihidrofólico se produce a partir del ácido dihidropteroico mediante la
formación de amidas que incorpora ácido glutámico, y la reducción produce ácido
tetrahidrofólico. Este paso de reducción también es necesario para la regeneración
continua de ácido tetrahidrofólico, y forma un sitio de acción importante para algunos
fármacos antibacterianos, antipalúdicos y anticancerígenos.
El ácido antranílico (figura 4.5) es un intermediario en la ruta biosintética del aminoácido
aromático que contiene indol l-triptófano (figura 4.11). En una secuencia de reacciones
complejas, que no se considerarán en detalle, el sistema del anillo del indol se forma al
incorporar dos átomos de carbono del difosfato de fosforribosilo, con la pérdida del
antranilato carboxilo original. Los átomos de carbono ribosílicos restantes se eliminan luego
mediante una reacción aldólica inversa, para ser reemplazados en una forma unida de indol
por los de la l-serina, que luego se convierte en la cadena lateral de l-triptófano. Los dos
últimos pasos que se muestran están catalizados
por el complejo multi-enzima triptófano sintasa. Aunque es un precursor del l-triptófano, el
ácido antranílico también puede ser producido por el metabolismo del triptófano. Ambos
compuestos se presentan como bloques de construcción para una variedad de estructuras
alcaloides (ver Capítulo 6). Volviendo al curso principal de la vía del shikimato, se produce
un proceso de reordenamiento singular, transformando el ácido corismático en ácido
prefenico (figura 4.12). Esta reacción, una reordenación de Claisen, transfiere la cadena
lateral derivada de PEP para que se una directamente al carbociclo y así construye el
esqueleto de carbono C6C3 básico de fenilalanina y tirosina. La reacción es catalizada en la
naturaleza por la enzima corismato mutasa, y aunque también puede ocurrir térmicamente,
la velocidad aumenta aproximadamente 106 veces en presencia de la enzima. La enzima
logra esto uniendo el confórmero pseudoaxial de ácido corísico, lo que permite que se
desarrolle un estado de transición con una geometría similar a la de una silla. Las rutas hacia
los aminoácidos aromáticos l-fenilalanina y l-tirosina a través del ácido prefenico pueden
variar de acuerdo con el organismo y, a menudo, más de una ruta puede operar en una
especie particular de acuerdo con las actividades enzimáticas disponibles (Figura 4.13). En
esencia, solo participan tres reacciones, la aromatización descarboxilada, la transaminación
y, en el caso de la biosíntesis de tirosina, una oxidación, pero el orden en que ocurren estas
reacciones diferencia las rutas. La aromatización descarboxilada del ácido prefenético
produce ácido fenilpirúvico y la transaminación dependiente de PLP conduce a la l-
fenilalanina. En presencia de un
La enzima deshidrogenasa dependiente de NAD +, la aromatización descarboxilada se
produce con la retención de la función hidroxilo, aunque hasta ahora no hay evidencia de
que esté involucrado ningún análogo de carbonilo intermedio del ácido prefenético. La
transaminación del ácido 4-hidroxifenilpirúvico resultante da posteriormente l-tirosina. El
ácido l-Arogénico es el resultado de la transaminación del ácido prefenético que se produce
antes de la aromatización descarboxilada, y puede transformarse tanto en l-fenilalanina
como en l-tirosina dependiendo de la ausencia o presencia de una actividad enzimática
deshidrogenasa adecuada. En algunos organismos, se sabe que las enzimas de actividad
amplia son capaces de aceptar ácido prepénico y ácido arogénico como sustratos. En
microorganismos y plantas, la l-fenilalanina y la l-tirosina tienden a sintetizarse por
separado, como en la figura 4.13, pero en animales que carecen de la vía del shikimato, la
hidroxilación directa de l-fenilalanina a l-tirosina y de l-tirosina a Se puede lograr l-
dihidroxifenilalanina (l-DOPA) (Figura 4.14). Estas reacciones son catalizadas por enzimas
hidroxilasa dependientes de tetrahidropterina, derivando el oxígeno hidroxílico del oxígeno
molecular. l-DOPA es un precursor de las catecolaminas, p. el neurotransmisor
noradrenalina y la hormona adrenalina (ver página 335). La tirosina y la DOPA también se
convierten mediante reacciones de oxidación en una melanina polimérica heterogénea, el
principal pigmento en la piel, el cabello y los ojos de los mamíferos. En este material, el
sistema de indol no se forma a partir de triptófano, sino que surge de DOPA mediante la
ciclación de DOPAquinona, el nitrógeno de la cadena lateral que luego ataca la ortoquinona
(figura 4.14). En la ruta biosintética de la melanina, la enzima tirosinasa, monofenol
monooxigenasa dependiente de O2, es responsable de la hidroxilación de tirosina, la
oxidación de DOPA a DOPAquinona y otros pasos más allá de DOPAchrome Algunos
organismos son capaces de sintetizar una variante inusual de l-fenilalanina, el derivado
aminado l-p-aminofenilalanina (l-PAPA, figura 4.15). Se sabe que esto ocurre por una serie
de reacciones paralelas a las de la Figura 4.13, pero utilizando el precursor de PABA ácido
4-amino-4-desoxicodósmico (Figura 4.5) en lugar de ácido corísico. Por lo tanto, se elaboran
derivados amino de ácido prepénico y ácido pirúvico. Aunque las enzimas no se han
caracterizado, se han identificado genes apropiados. Un metabolito importante
se sabe que se forma a partir de l-PAPA es el antibiótico cloranfenicol, producido por
cultivos de Streptomyces venezuelae [Cuadro 4.2]. Las últimas etapas de la vía (figura 4.15)
han sido formuladas mediante análisis genético para involucrar a un sistema no ribosómico
sintasa relacionado con las NRPS (vea la página 438). La enzima contiene un dominio de
adenilación, un dominio de portador de peptidilo y un dominio que es homólogo a una
deshidrogenasa dependiente de NAD +. Se propone que la activación y la unión a la enzima
va seguida de β-hidroxilación y N-acilación en la cadena lateral, y la última reacción
probablemente requiera un éster de la coenzima A del ácido dicloroacético. Esto es seguido
por la oxidación del grupo 4-amino a un nitro, un sustituyente bastante raro en las
estructuras de productos naturales; el último paso es la liberación reductiva del producto
de la enzima.