Resistencia

Bacteriana en el
Ecuador

Simposio interdisciplinar de investigación,

Postgrados y vinculación con la comunidad

Iliana Alcocer Negrete, Dra.

Pontificia Universidad Católica del Ecuador
Escuela de Ciencias Biológicas
Laboratorio de Microbiología
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas

Año 2004
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
 Interdisciplinaridad
ESCUELA DE
FACULTAD DE
CIENCIAS
MEDICINA
BIOLÓGICAS

Iliana Alcocer Jeannete Zurita

Año 2009
Confianza
Apoyo mutuo
Grupos de trabajo
Apoyo de la PUCE
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
Biología
Bioanálisis Biología
Medicina
Biología
Biología
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
Chef DRIII System
Para análisis de clonalidad
bacteriana por electroforesis de
campo pulsado

1. PUCE
2. San Francisco
3. INH
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
Sistema de fotodocumentación
Molecular Imager Gel Doc XR+ BioRad
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
 Laboratorio de Microbiología
Escuela de Ciencias Biológicas
 Antimicrobianos

• Los antimicrobianos son compuestos

relativamente sencillos, producidos por
bacterias u hongos que atacan
específicamente a las bacterias.
• Tienen capacidad, en baja concentración,
de inhibir el crecimiento bacteriano
• Pueden ser naturales, sintéticos o
semisintéticos.
Antimicrobianos
 1940

Alexander Fleming, 1928

Desde el descubrimiento de la
penicilina, se han descubierto
una docena de nuevos tipos de
antimicrobianos y optimizado o
sintetizado cerca de una
centena.
 Resistencia bacteriana

Cepas resistentes
raras
Exposición a
antimicrobianos

Cepas resistentes
predominantes
 Resistencia

 Introducción en la terapia

 Aislamiento de cepas resistentes

 Capacidad adaptativa de las células

bacterianas

 Alta tasa de diseminación por transferencia

horizontal de genes de resistencia
 Resistencia bacteriana

Patógeno Resistente
Patógeno
Prevención de la Prevención de
transmisión la infección

Infección
Resistencia a los
antimicrobianos
Diagnóstico
y tratamiento
Uso eficaces
acertado
Uso de
antimicrobianos
 Preocupación mundial

• Resistencia a betalactámicos:
–BLEEs
–AMP-C
–Carbapenemes
• Resistencia a quinolonas
• Resistencia a aminoglucósidos
 Diseminación de la
Resistencia bacteriana
Beta lactamasas de espectro extendido
BLEE
Enzimas capaces de conferir a la bacteria
resistencia a penicilinas, cefalosporinas
de primera, segunda, tercera e inclusive
cuarta generación y a los
monobactámicos como el aztreonam, pero
no a cefamicinas ni carbapenémicos
 Diseminación de la
Resistencia bacteriana
Enzimas modificadoras de aminoglucósidos
EMAs

1. acetiltransferasa (AAC),
2. fosfatidil transferasa (APH) y
3. adenil transferasa (ANT o AAD).
 Resistencia Adquirida

Klebsiella Pseudomonas AMIKACINA

GENTAMICINA
pneumoniae aeruginosa ESTREPTOMICINA
TOBRAMICINA

Serratia Pseudomonas IMIPENEM

marcenses aeruginosa MEROPENEM

Pseudomonas Klebsiella IMIPENEM

aeruginosa pneumoniae MEROPENEM
 Carbapenemasas

Tipo Serin-β-lactamasas Metalo-b-lactamasas

(Cationes divalentes tipo Zinc)

(Residuo de Serina en el sitio activo)

Clase A Clase A Clase B

Clase D
SME KPC IMP
OXA VIM
NMC GES
SFC IMI Acinetobacter SPM
baumannii GIM Acinetobacter
E. cloacae baumannii
K. pneumoniae SIM S. marcescens
S. P. aeruginosa
marcenscens
NDH P. aeruginosa
Especies patógenas:
Klebsiella pneumoniae

- Infecciones de
tracto respiratiorio
- Infección de vías
urinarias
- Sistema nevioso
osteoraticular
- Sepsis
Especies patógenas:
Escherichia coli

- Infección de vías
urinarias
- Sepsis
- Meningitis
- Enfermedad
diarreica
Especies patógenas:
Serratia marcescens

- Infecciones de
tejidos
- Sepsis
 Especies patógenas:
Pseudomonas aeruginosa

- patógeno
oportunista
principalmente en
ambientes
hospitalarios
Materiales y
métodos
Hospitales participantes de la REDNARBEC y
laboratorios interesados
1. Carlos Andrade Marín
12. Vicente de Paúl 2. De las Fuerzas Armadas
13. IESS Ibarra 3. De la Policía
14. Centro Médico Ibarra 4. Baca Ortiz
5. Enrique Garcés
6. Solca Quito
7. Vozandes Quito
15. Rodríguez Zambrano 22. Patronato San José
23. Clínica la Merced
16. Icaza Bustamente 24. Clínica Guadalupe
17. Guayaquil
18. Roberto Gilbert
19. Luis Vernaza
20. De infectología
21. Alcívar

8. Vozandes Shell

9. Homero Castañer

10. Solca Cuenca

11. Clínica Santa Ana
25. Clínica del Río Cuenca
 Población bacteriana

•2792 bacterias de origen clínico

– Escherichia coli
– Klebsiella pneumoniae
– Serratia marcescens
– Enterobacter cloacae
– Enterobacter aerogenes
– Proteus mirabilis
– Citrobacter freundii
– Staphylococcus aureus
– Pseudomonas aeruginosa
– Shigella spp.
 IIdentificación genotípica

Identificación de genes de resistencia y

determinantes genéticos relacionados
en aislados entéricos de la Colección
Bacteriana Quito Católica CB-QCA

Identificación de genes por PCR

Secuenciamiento
DETECCIÓN DE GENES POR PCR
Y SECUENCIAMIENTO

 BLEE: blaSHV, blaTEM, blaPER, blaCTX-M y AmpC

 CARBAPENEMASAS: blaKPC, blaGES, blaVIM, blaIMP

blaSPM

 EMAs: aac(3)-IIa, aac(6’)-Ib, ant(2”)-Ia,,

 Resistencia a quinolonas: qnr

 IntI y RV de integrones clase I

 Diseño de primer y padronización para
detección de genes

María Fernanda Yauri David Ortega Pedro Barba

 Genotipaje de la
resistencia a
antibióticos en
aislados clínicos de
Klebsiella pneumoniae
productores de β-
lactamasas de
espectro extendido
(BLEE)

David Ortega Paredes

Confirmación fenotípica de producción de β-lactamasas de
espectro extendido (BLEE)

• Prueba confirmatoria de producción de BLEE: Positivo aumento < 5 mm en el

halo de inhibición de cefalosporina de tercera generación / clavulanato
 Detección de genes en
Klebsiella pneumoniae

•blaSHV cromosómico
100.0

•Componente de ADN cromosómico en ADN

plasmidial

0.0
 Detección de genes en
Klebsiella pneumoniae

Primer lugar en la categoría pregrado universidades el área Ciencias de la Salud y el

Segundo lugar dentro de todas las áreas en la categoría Pregrado Universidades en la
IX Feria Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación (FENACYT 2008)
Búsqueda de BLEE y carbapenemasas
en enterobacterias

Diana Muñoz Gabriela Yépez Ana María Gómez

 Número de aislados

1000
1200

0
200
400
600
800
Carlos Andrade Marín

382
General De Las

301
Fuerzas Armadas No.1

Solón Espinosa, Solca

124
Quito

De Niños Baca Ortiz

233

Vozandes
1075

Gineco-Obstétrico
232

Isidro Ayora

De La Policía Nacional
107

Pablo Arturo Suárez

212

69

Enrique Garcés
5

Castañier en Azogues
Bacterias entéricas de origen clínico
60 Comunitarias

Hospitalarias
49 49
50

40
33 34 34

30

19
20 17 16 15
13
11
8 9
10 7
5 4
2 1
0

12,1 / 2693/325
 Porcentaje

10,0
15,0
20,0
25,0

0,0
5,0
Carlos Andrade

17,3
Marín

General De Las
Fuerzas Armadas
18,9

No.1

Solón Espinosa,
19,4

Solca Quito

De Niños Baca Ortiz

18,9

Vozandes
6,3

Gineco-Obstétrico
entéricas

3,0

Isidro Ayora

De La Policía
13,1

Nacional

Pablo Arturo Suárez

15,1

Enrique Garcés
23,2
Porcentaje de BLEE en bacterias
738 pb
Control positivo

Primer caso
Azogues

Segundo caso
Guayaquil

Tercer caso
Cuenca

Control negativo
Identificación molecular de KPC
Pseudomonas aeruginosa

RESISTENCIA A RESISTENCIA A
CARBAPENEMES AMINOGLUCÓSIDOS

37% 61%
48/12
78/129
9

Aislados Resistentes a
Aislados Resistentes a
Carbapenemes
Aminoglucósidos
Identificación de blaGES en
aislados de Pseudomonas
aeruginosa

31% (44/129)
Identificación de blaKPC en
aislados de Pseudomonas
aeruginosa

5,4% (7/129)
 Identificación de blaVIM y blaIMP en
aislados de Pseudomonas aeruginosa

INTEGRONES

3,1%

7,8%(10/129)
22,5% (29/129) blaIMP
blaVIM
Amplificación de genes EMAs en
Pseudomonas aeruginosa

27/129 21/129 13/129 6/129

(20,9%) (16,3%) (10,1%) (4,7%)
Integrones Clase I

Total Presentan Porcentaje

Aislados Integrón
Clase I

129 79 61,2%

% genes productores de carbapenemasas

presentes Integrones
Clase I

21,7%
 Búsqueda de carbapenemasas en
enterobacterias

Camila Cilveti Andrea León Nathaly Espinel

 Identificación molecular de BLEE
TEM SHV CTX-M

862pb
858pb

585pb
 Identificación molecular de
carbapenemasas: serin-beta-lactamasas
blaKPC blaGES

864 pb
738 pb

A
 Identificación molecular de
carbapenemasas: metalo-beta-lactamasas

blaVIM blaIMP

A
 Número de aislamientos entéricos
positivos para los genes de análisis
300
281
Total
Número de aislamientos

250
Hospitalarios
200
Total
162
Comunitarios
150
125

101 98
100

51
50
27
16
9 5 4
0 0 0 0 1 0 0
0
Total blaCTX blaTEM blaSHV blaPER bla KPC bla GES bla IMP bla VIM
Total blaCTX blaTEM blaSHV blaPER blaKPC blaGES blaIMP blaVIM
 Casos
con
Quito
6
7 10
8
11

blaKPCn
14-22

Guayaquil
2 9

12

Azogues
1 5
4
3
Cuenca
13
Klebsiella pneumoniae
Serratia marcescens
Klebsiella oxytoca
Enterobacter aerogens
Enterobacter cloacae
Genotipificación de KPC por campo pulsado
 Casos
con
Quito
8
11 14
15

blaGESn

Cuenca
Klebsiella pneumoniae

Klebsiella oxytoca
 Casos
con
Quito

blaIMPn

Cuenca

Serratia marcescens
 Casos
con
Quito
16

19 17

blaVIMn

Klebsiella pneumoniae
Cuenca
Morganella morganii

Serratia marcescens
Conclusiones
 CONCLUSIONES

• Dentro de la población de estudio se encontró alta

resistencia a betalactámicos, aminoglucósidos y
carbapenemes y no registraron resistencia a
polimixina B, colistina, tigeciclina ni fosfomicina.
• Los resultados confirman que en nuestro medio hay
una evidente asociación entre producción de BLEE
y resistencia a otras familias de antibióticos, en
especial quinolonas, aminoglicósidos y
carbapenemes.
• Existe una relación entre la presencia de plásmidos
y de integrones con la alta resistencia
antimicrobiana.