Biotecnología e Informatica Oxford

B B I OT EC N OLOG Í A
BIOINF O RMÁTI CA
Y
C E L L BIOLO GY
Introducción
La biotecnología es el uso de organismos, la biotecnología para prevenir y mitigar la
especialmente microorganismos, para llevar contaminación de residuos industriales, agrícolas
a cabo procesos industriales. Los organismos y urbanos. La biotecnología también puede
utilizados se pueden modificar genéticamente emplearse para el diagnóstico y el tratamiento de
para hacerlos más útiles. Los cultivos pueden enfermedades. La bioinformática consiste en el
modificarse para aumentar el rendimiento y uso de computadores para analizar secuencias de
obtener productos novedosos. Se puede usar datos en investigaciones biológicas.
B.1 Microbiología: organismos en la industria

Comprensión Aplicaciones
➔➔ Los microorganismos presentan una gran
➔➔ Fermentación por lotes en tanques profundos
diversidad metabólica. para la producción a gran escala de penicilina.
➔➔ Muchos microorganismos pueden utilizarse en ➔➔ Producción de ácido cítrico en un fermentador
la industria debido a su pequeño tamaño y a su continuo mediante Aspergillus niger y su uso
rápida velocidad de crecimiento. como conservante y aromatizante.
➔➔ La ingeniería de rutas metabólicas optimiza los ➔➔ En fermentadores se produce biogás mediante
procesos genéticos y regulatorios que tienen bacterias y arqueas (arqueobacterias) a partir
lugar en los microorganismos. de materia orgánica.
➔➔ La ingeniería de rutas metabólicas es utilizada
en la industria para producir metabolitos
de interés. Habilidades
➔➔ Los fermentadores permiten una producción ➔➔ Tinción de Gram de bacterias Gram positivas y
a gran escala de metabolitos por parte de Gram negativas.
microorganismos.
➔➔ Experimentos que muestren la zona de
➔➔ La fermentación se lleva a cabo por lotes o inhibición del crecimiento bacteriano mediante
mediante un cultivo continuo. bactericidas en cultivos bacterianos estériles.
➔➔ Los microorganismos presentes en los ➔➔ Producción de biogás en un fermentador a
fermentadores se ven limitados por sus propios pequeña escala.
productos de desecho.
➔➔ Se emplean sondas para controlar las
condiciones dentro de los fermentadores. Naturaleza de la ciencia
➔➔ Las condiciones se mantienen en niveles ➔➔ La serendipia (descubrimiento o hallazgo
óptimos para el crecimiento de los afortunado e inesperado) ha conducido a
microorganismos cultivados. descubrimientos científicos: el descubrimiento
de la penicilina por parte de Alexander Fleming
puede considerarse un suceso azaroso.
1
B BIOT E C NOLOGÍA Y BIOIN FORMÁTIC A
Diversidad metabólica
Los microorganismos presentan una gran diversidad
metabólica.
Los microorganismos realizan una serie de funciones clave en los
ecosistemas. Para desempeñar su función ecológica, requieren ciertas
rutas metabólicas específicas.
▲ Figura 1 Moho Penicillium creciendo en una Los saprótrofos liberan nutrientes atrapados en los detritos y los ponen
naranja. El antibiótico penicilina se deriva de a disposición de los ecosistemas. Como saprótrofos, las bacterias y los
este microorganismo. hongos compiten entre sí por las fuentes de alimentos. Muchos hongos
liberan antibióticos antibacterianos al entorno con el propósito de limitar
la competencia interespecífica.
Otros microorganismos actúan como productores. Las cianobacterias
(algas verdeazules) y los protoctistas, como las algas y Euglena, son
fotosintéticos. Producen glúcidos mediante la fijación de dióxido de
carbono en el ciclo de Calvin.
Otros microorganismos actúan como heterótrofos. Las levaduras como
Saccharomyces cerevisiae realizan la respiración anaeróbica, produciendo
alcohol y dióxido de carbono mediante una ruta metabólica conocida
como fermentación alcohólica.
Las bacterias Rhizobium y Azotobacter pueden fijar el nitrógeno y
convertirlo en una forma que pueden utilizar los seres vivos. Las
bacterias como Nitrobacter y Nitrosomonas pueden utilizar productos
químicos inorgánicos como fuentes de energía; se les denomina
quimioautótrofos.
▲ Figura 2 Producción de microalgas como

Los seres humanos han sido capaces de aprovechar las rutas metabólicas
biocombustibles: estanques utilizados para de los microorganismos en aplicaciones biotecnológicas.
cultivar microalgas Chlorella vulgaris como
fuente de biocombustible. Se bombea dióxido
de carbono en los estanques para favorecer la Ventajas de usar microorganismos
fotosíntesis y, así, el crecimiento de las algas. en biotecnología
Muchos microorganismos pueden utilizarse en la
industria debido a su pequeño tamaño y a su rápida
velocidad de crecimiento.
Los seres humanos han explotado el metabolismo de los microorganismos
a lo largo de la historia, por ejemplo, para producir alimentos como el
yogur, el pan, el vino y el queso.
Más recientemente, la biotecnología industrial ha aumentado el número
de rutas metabólicas aprovechadas para producir medicamentos y
combustibles, así como para aplicaciones adicionales que implican el uso
de microbios modificados genéticamente.
La biotecnología industrial aprovecha que los microorganismos son
pequeños y se reproducen a gran velocidad. Se pueden cultivar en una
variedad de sustratos nutritivos y pueden producir una variedad de
productos. Las condiciones pueden controlarse fácilmente en un entorno
industrial y mantenerse a niveles óptimos.
2
B .1 M i c r o b i o l o g í a : o r g a n i s m o s e n l a i n d u s t r i a
Ingeniería de rutas metabólicas

La ingeniería de rutas metabólicas es utilizada en la
industria para producir metabolitos de interés.
Tradicionalmente, los microorganismos utilizados en aplicaciones
biotecnológicas se seleccionaban mediante el cultivo selectivo o la
modificación genética porque eran las variedades que proporcionaban el
máximo rendimiento de un metabolito deseado. Lo que no se tenía en
cuenta era que en la ruta metabólica podía haber puntos que limitaban
los resultados hasta el punto de que los rendimientos reales eran muy
inferiores a los rendimientos teóricos.
Lo que distingue a la ingeniería de rutas metabólicas de los métodos
tradicionales es que utiliza conocimientos y análisis detallados de las
reacciones metabólicas del sistema celular. Esto permite a los científicos
introducir cambios en múltiples puntos para mejorar la producción de
los metabolitos de interés, por ejemplo, ampliando la gama de sustratos,
eliminando subproductos que ralentizan el proceso e incrementando la
gama de productos.
La ingeniería de rutas metabólicas utiliza el

conocimiento de las rutas metabólicas para
aumentar los rendimientos
La ingeniería de rutas metabólicas optimiza los procesos
genéticos y regulatorios que tienen lugar en los
microorganismos.
La ingeniería de rutas metabólicas es una técnica que analiza la ruta
metabólica de un microorganismo particular para determinar los
puntos de la ruta en que se forman “cuellos de botella” que limitan
la producción del compuesto deseado. Así, los investigadores pueden
eliminar estas limitaciones mediante modificaciones genéticas.
Por ejemplo, la levadura Saccharomyces cerevisiae se produce ▲ Figura 3 Micrografía electrónica de barrido
naturalmente en la piel de las uvas. La fermentación de las uvas se coloreada de células de levadura (rojo)
realiza con S. cerevisiae, siendo el etanol el producto final deseado. presentes naturalmente sobre la piel de una
uva. La presencia de la levadura es esencial
En la producción de vino es importante mantener el pH correcto.
para la fermentación de las uvas que es parte
El malato es un metabolito que aparece durante la producción del
del proceso de elaboración del vino.
vino y cuya degradación es esencial para la desacidificación de las
uvas. Sin embargo, la malato permeasa, una proteína de membrana
necesaria para el transporte del malato al interior de las células,
no está presente en S. cerevisiae. Además, aunque S. cerevisiae tiene
una enzima que puede degradar el malato, se ha demostrado que es
relativamente ineficaz.
El gen para MAE2, una enzima de Lactococcus lactis muy eficaz en la
degradación del malato, se introdujo en S. cerevisiae junto con el gen
de la malato permeasa de la levadura Schizosaccharomyces pombe. Así se
consiguió una variedad transgénica de S. cerevisiae que degrada el malato
más eficazmente.
3
Teoría del Conocimiento Fermentadores en la industria

¿Hasta qué punto los
Los fermentadores permiten una producción a gran escala
avances científicos de metabolitos por parte de microorganismos.
dependen de los Técnicamente, la fermentación es la generación anaeróbica de ATP
“accidentes afortunados”? a partir de glucosa que origina productos finales característicos
En 1897, Hans y Eduard como el alcohol y el ácido láctico. En el ámbito de la biotecnología,
Buchner investigaban los microbiólogos interpretan el término fermentación de manera
extractos de levadura como amplia para referirse, por ejemplo, a los procesos de cultivo de
fuente de medicamento. microorganismos a gran escala con el fin de producir metabolitos
Molieron células de levadura de interés.
con sílice y arena y utilizaron Con frecuencia, los fermentadores son tanques grandes de acero
una prensa hidráulica inoxidable con un medio nutritivo estéril al que se inocula el
para crear un extracto de microorganismo deseado. Un impulsor es un sistema de paletas que
levadura, empleando altas mezcla el medio para evitar que se formen sedimentos. Cuando el
concentraciones de azúcar proceso metabólico deseado es aeróbico, se introducen burbujas de gas.
como conservante. Se Un sensor de presión detecta la acumulación de gas y permite la salida
sorprendieron cuando este de los gases residuales. Las condiciones en el interior del recipiente se
sistema sin células empezó controlan con sondas. Los tanques donde se produce la reacción están
a fermentar el azúcar. Eduard recubiertos por una camisa de refrigeración con agua fría para evitar que
Buchner recibió el Premio aumente la temperatura por la acumulación de calor como producto de
Nobel por su descubrimiento desecho metabólico. Cuando el medio se agota, se puede añadir medio
de la fermentación sin nuevo. También se pueden extraer los productos del tanque.
células. Wilhelm Kühne
ya había realizado este antiespumante ácido/base
motor
descubrimiento en 1878, vapor sensor de presión
pero no había podido aislar nutriente o inóculo
con éxito el elemento
químico como hicieron los gases residuales filtrados
hermanos Buchner. Kühne medio nutritivo estéril salida de agua fría
había dado nombre al
impulsor
elemento de la levadura que
sonda de concentración de sonda de pH
causaba la fermentación sonda de temperatura
sin células: creó el término oxígeno
“enzima” a partir de las camisa de refrigeración
palabras griegas en (en) y
zume (levadura).
entrada de agua fría aspersor
aire comprimido
vapor
salida de productos
▲ Figura 4 Un fermentador
Dos formas de fermentación industrial

La fermentación se lleva a cabo por lotes o mediante un
cultivo continuo.
El cultivo de microorganismos a gran escala en la industria se lleva a
cabo de dos maneras.
4
El cultivo por lotes se utiliza para producir metabolitos secundarios,

es decir, aquellos que no son esenciales para el crecimiento del
cultivo. En este caso, después de inocular el medio, el cultivo pasa por
todas las etapas de la curva de crecimiento sigmoideo. Para iniciar el
proceso, se añade una cantidad fija de medio de cultivo al tanque de
fermentación cerrado. Después de la inoculación, no se añaden más
nutrientes o microorganismos durante todo el período de incubación.
Los productos solo se extraen una vez que alcanzan una concentración
suficientemente alta.
En el cultivo continuo, los nutrientes se añaden y los productos se recogen
de manera constante. Las condiciones se controlan cuidadosamente para
mantenerlas a un nivel constante a fin de que el proceso pueda continuar
durante un largo período de tiempo.
Factores que limitan la fermentación industrial

Los microorganismos presentes en los fermentadores
se ven limitados por sus propios productos de
desecho.
Una serie de factores abióticos limitan la actividad de los
microorganismos en los tanques de fermentación. Esta limitación puede
deberse al consumo de materias primas por el microorganismo o a la
producción de productos de desecho en sus actividades.
●● La producción de dióxido de carbono puede reducir el pH, afectando
a la actividad enzimática.
●● La producción de gas puede causar un aumento de la presión, que
puede afectar a las tasas de reacción.
●● La fermentación alcohólica puede producir niveles de alcohol que
tienen un efecto osmótico en las células.
●● El oxígeno puede agotarse debido a la respiración celular.
●● El calor como producto de desecho del metabolismo puede elevar la
temperatura del tanque de reacción.
Las sondas controlan las condiciones dentro de

los fermentadores
Se emplean sondas para controlar las condiciones dentro
de los fermentadores.
La figura 5 muestra sondas de la concentración de oxígeno, el pH, el
volumen, los niveles de espuma y la temperatura. Estas son las variables
más comunes que se controlan en los tanques de fermentación. Las
sondas proporcionan datos acerca de estas condiciones continuamente.
En la fermentación por lotes, pueden indicar en qué etapa se encuentra
el proceso de producción. En la fermentación continua, pueden indicar ▲ Figura 5 Un sistema de sondas está
a los técnicos qué acciones deben tomar para mantener las condiciones conectado al fermentador para controlar las
dentro de los parámetros favorables. condiciones dentro del tanque.
5
Mantenimiento de las condiciones óptimas

dentro de los fermentadores
Las condiciones se mantienen en niveles óptimos para el
crecimiento de los microorganismos cultivados.
El control de las condiciones y su mantenimiento en niveles óptimos
es más común en los cultivos continuos. Tales condiciones incluyen el
contenido de agua, la temperatura, el pH, los niveles de macronutrientes
y micronutrientes, los niveles de productos de desecho, la densidad
celular, el contenido de dióxido de carbono disuelto, el contenido de
oxígeno disuelto, el volumen del cultivo y la mezcla del cultivo. El nivel
óptimo de cada condición depende de la especie.
El nivel de las condiciones se ve a menudo influido por una serie de
variables y, por tanto, es importante realizar un control constante.
Consideremos el ejemplo del oxígeno. Las especies difieren en su
tolerancia a niveles bajos de oxígeno. Penicillium es menos tolerante a
niveles bajos de oxígeno que Saccharomyces. Cuando las concentraciones
de oxígeno disuelto caen por debajo de un nivel crítico, se convierten en
un factor limitante. La concentración de oxígeno disuelto se ve afectada
por la temperatura y por los nutrientes que oxida el organismo. No es
fácil añadir oxígeno a un cultivo mediante aireación porque genera
espuma que puede limitar la producción. Por eso, a menudo se añaden
antiespumantes al tanque de reacción.
Fermentación en tanques profundos

Fermentación por lotes en tanques profundos para la producción a gran escala
de penicilina
A principios del siglo XX, se concertaron los obtiene cocinando maíz en agua a cerca de 50 °C
esfuerzos para hallar formas de producir grandes durante dos días.
cantidades de penicilina. Los experimentos
Los antibióticos son metabolitos secundarios en
iniciales demostraron que Penicillium notatum
el sentido de que se producen en un momento
crecía mejor en recipientes poco profundos
determinado del ciclo de vida del microbio bajo
debido a la necesidad de aireación. Sin embargo,
ciertas condiciones. En el caso de la penicilina, las
este sistema no producía suficiente penicilina
condiciones óptimas son alrededor de 24 °C, un pH
para satisfacer las demandas de tratamiento de
ligeramente básico y una buena concentración
los heridos de la Segunda Guerra Mundial. La
de oxígeno. El producto normalmente empieza a
producción a gran escala fue posible mediante la
formarse unas 30 horas después de iniciar el lote de
fermentación en tanques profundos. Este sistema
cultivo, cuando las concentraciones de nutrientes
introducía burbujas de oxígeno en el tanque y
comienzan a reducirse, y dura unos seis días
empleaba unas paletas para distribuir el oxígeno.
después de los cuales hay que vaciar el fermentador
La fuente de nutrientes utilizada con Penicillium
y filtrar el líquido. Se usan disolventes para generar
es un líquido de maceración del maíz, que se
un precipitado cristalino a partir del líquido filtrado.
6
Producción industrial de ácido cítrico

Producción de ácido cítrico en un fermentador continuo mediante Aspergillus niger
y su uso como conservante y aromatizante
El ácido cítrico es un aditivo alimentario una temperatura de unos 30 °C. El ácido cítrico
importante, como potenciador del sabor y como se produce en el ciclo de Krebs y, por tanto, se
conservante. Para la producción industrial de considera un metabolito primario. Si el medio
ácido cítrico se utiliza el hongo Aspergillus niger. de cultivo tiene niveles insuficientes de ciertos
Aunque la mayor parte del ácido cítrico producido minerales como el hierro, se acumula ácido cítrico
industrialmente se obtiene mediante fermentación en el tanque de reacción.
por lotes, se ha intentado producir también
Después de filtrar el contenido del tanque de
mediante fermentación continua. Las condiciones
fermentación, se le añade hidróxido de calcio.
óptimas para la producción del ácido cítrico
Esto genera un precipitado de citrato de calcio
son altas concentraciones de oxígeno disuelto,
sólido a partir de la solución que puede tratarse
altas concentraciones de azúcar, un pH ácido y
químicamente para producir ácido cítrico.
Tinción de Gram
Tinción de Gram de bacterias Gram positivas y Gram negativas
Una manera tradicional de clasificar las bacterias es une a la membrana externa de las bacterias
determinar si son Gram negativas o Gram positivas, Gram negativas y cuando se añade alcohol,
en función de su reacción a la tinción de Gram. La este elimina la membrana externa y, con ella,
pared celular de las bacterias Gram positivas consta la tinción violeta cristal. Permitiendo que la
de una capa gruesa de peptidoglicano (un polímero bacteria pueda ser coloreada luego por fucsina
compuesto de aminoácidos y azúcares). La mayor o safranina (dándole el típico color rosado a
parte de la pared celular de las bacterias Gram las Gram negativas). En el caso de las bacterias
positivas se compone de peptidoglicano. Gram positivas, el violeta cristal se une a las
múltiples capas que forman la capa gruesa de
La pared celular de las bacterias Gram negativas
peptidoglicano; el alcohol no consigue eliminar
es mucho más fina: consta solo de un 20% de
esta capa y, por tanto, tampoco la tinción.
peptidoglicano (figura 6). El violeta cristal se
membrana externa rica

en lipopolisacáridos
polisacáridos ácidos
capa gruesa de
peptidoglicano capa fina de
peptidoglicano
membrana plasmática membrana plasmática
(a) bacteria Gram positiva: pared celular (b) bacteria Gram negativa: pared celular
gruesa, sin membrana externa más fina, con membrana externa
▲ Figura 6
7
Actividad:
Procedimiento para la tinción de Gram
1 Prepara un frotis de Bacillus cereus, Streptococcus bacterias Gram positivas bacterias Gram negativas
fecalis, Escherichia coli y Micrococcus luteus. Fija
estas preparaciones con calor utilizando un mechero fijación
de Bunsen.
2
Tiñe con violeta cristal durante unos 30 segundos.
violeta cristal
3
Enjuaga con agua y luego cubre con lugol (disolución
de yodo). Espera unos 30 segundos a que actúe
el colorante. tratamiento con lugol
4
Enjuaga con agua y luego decolora con alcohol de
95% durante 10–20 segundos.
5
Enjuaga con agua y luego tiñe con el colorante de decoloración
contraste safranina durante 20–30 segundos.
6
Enjuaga con agua y seca. Las bacterias Gram colorante de contraste
negativas serán rosas. Las bacterias Gram positivas safranina
serán azules o violetas.
7
Dependiendo de si hay restricciones locales, puedes
optar por examinar muestras ya preparadas de
bacterias Gram negativas y Gram positivas.
Producción de biogás
En fermentadores se produce biogás mediante bacterias y arqueas
(arqueobacterias) a partir de materia orgánica.
El biogás es el gas combustible producido por la CH3COOH → CH4 + CO2
descomposición anaeróbica de materia orgánica
(fraccionamiento del ácido acético para formar
como el estiércol, residuos vegetales de cultivos y
metano y dióxido de carbono)
los residuos orgánicos domésticos. Dependiendo
de la construcción del fermentador, el biogás es
SALIDA
principalmente metano con algo de dióxido de • metano para
ENTRADA
carbono, aunque puede haber presentes otros gases. • aguas residuales humanas cocinar, calentar
• estiércol de animales o refrigerar
Se requieren tres grupos diferentes de microbios
• desechos agrícolas
anaerobios. El primer grupo convierte los
• desechos de jardín
residuos orgánicos crudos en una mezcla de
ácidos orgánicos, alcohol, hidrógeno y dióxido SALIDA
de carbono. El segundo grupo utiliza los ácidos • estiércol líquido,
que puede usarse
orgánicos y el alcohol de la primera etapa para como fertilizante
producir acetato, dióxido de carbono e hidrógeno.
Estos dos primeros grupos son eubacterias. El
último grupo son arqueas llamadas metanógenos;
los metanógenos producen metano mediante una
de las dos reacciones siguientes:
CO2 + 4H2 → CH4 + 2H2O
▲ Figura 7 Generador de metano. Las condiciones
(reducción de dióxido de carbono a metano) en el interior deben ser anaeróbicas.
8
Producción de biogás en el aula

Producción de biogás en un fermentador a pequeña escala
La figura 8 muestra un ejemplo de composición podrían comparar cantidades relativas de residuos
de un generador de biogás. Los globos Mylar® son orgánicos y agua.
los que se suelen llenar de helio como globos de
tubo de goma el extremo de este
fiesta. La botella que contiene la materia prima
tubo debe quedar
debe ser de plástico, no de vidrio, debido al riesgo abrazaderas del tubo por encima del nivel
de explosión. Las abrazaderas del tubo pueden de la materia prima
m ate
ri a p ri m a
utilizarse para evitar fugas de gas cuando se va a globo Mylar®
desconectar el globo del tubo. El globo debe estar
sellado al tubo de vidrio con cinta aislante.
tubos conectores de vidrio
Puede compararse la cantidad de biogás generado
sellar el globo Mylar® al tubo de vidrio con cinta aislante
por diferentes materias primas. A este efecto, se
▲ Figura 8
La serendipia y el descubrimiento de la penicilina

La serendipia (descubrimiento o hallazgo afortunado e inesperado) ha conducido
a descubrimientos científicos: el descubrimiento de la penicilina por parte de
Alexander Fleming puede considerarse un suceso azaroso.
La serendipia se define como un accidente de que una de sus placas bacterianas estaba
afortunado o una situación en la que se descubre contaminada con un hongo; alrededor del hongo
algo bueno o útil que no se estaba buscando no parecía haber ninguna bacteria, mientras que sí
específicamente. Sin embargo, solo es útil si el las había en las partes de la placa más alejadas del
observador reconoce su valor. hongo. Fleming fue lo suficientemente perspicaz
como para conectar esta observación inesperada con
Alexander Fleming fue un médico y científico escocés
sus estudios anteriores de agentes antibacterianos.
que dedicó la primera parte de su carrera a buscar
agentes antibacterianos. En 1928, estaba investigando Procedió a cultivar el moho en cultivo puro. Luego
las propiedades de la bacteria Staphylococcus. Cuando lo probó con diversas bacterias patógenas y descubrió
regresó de unas largas vacaciones, se dio cuenta que tenía un efecto antibiótico en varias especies.
Las zonas de inhibición como medida de la eficacia bactericida

Experimentos que muestren la zona de inhibición del crecimiento bacteriano
mediante bactericidas en cultivos bacterianos estériles
Las bacterias se cultivan a menudo en medios
nutritivos en placas de vidrio o plástico llamadas
placas de Petri. Las placas se incuban en
condiciones de laboratorio y se las cubre con
tapas para evitar contaminaciones. Las bacterias
se dividen y forman colonias; si toda la superficie
del medio nutritivo está expuesta a la bacteria, se
formará un “césped” bacteriano.
Lo que Fleming observó se conoce como zona
de inhibición, es decir, una zona del césped
bacteriano donde un efecto antibacteriano impide ▲ Figura 9
9
que crezcan bacterias. El resultado suele ser una las personas sanas, pero es una causa importante
región circular con forma de disco. El diámetro de infecciones en los hospitales.
de la zona de inhibición es una medida de la
Los alumnos pueden modificar esta técnica
potencia del agente antibacteriano. En la figura 9,
para investigar la eficacia de diversos agentes
se colocaron discos con varios tipos de antibióticos
antibacterianos. Se puede cortar discos de papel
en la superficie de una placa a la que se había
de filtro absorbente con una perforadora de
inoculado la bacteria Pseudomonas aeruginosa para
papel y, por ejemplo, empapar los discos con
determinar cuál es el antibiótico más eficaz. Esta
desinfectantes y colocarlos en una placa a la que
es una especie de bacteria que rara vez infecta a
se hayan inoculado bacterias.
B.2 Biotecnología en agricultura

➔➔ Los organismos transgénicos producen
➔➔ Uso del plásmido inductor de tumores (Ti) del
proteínas que no formaban parte previamente Agrobacterium tumefaciens para introducir
del proteoma de su especie. resistencia al glifosato en cultivos de soja.
➔➔ La modificación genética puede usarse para ➔➔ Modificación genética del virus del mosaico del
superar la resistencia ambiental con el fin de tabaco para permitir la producción masiva de
aumentar las producciones de los cultivos. vacunas de hepatitis B en plantas de tabaco.
➔➔ Las plantas de cultivo modificadas genéticamente ➔➔ Producción de la papa “Amflora” (Solanum
pueden usarse para obtener productos novedosos. tuberosum) para industrias papeleras y
➔➔ La bioinformática desempeña un papel importante de adhesivos.
en la identificación de los genes objetivo.
➔➔ El gen objetivo está ligado a otras secuencias
que controlan su expresión.
➔➔ Un marco abierto de lectura es una longitud Habilidades
significativa del ADN desde un codón de inicio ➔➔ Evaluación de datos sobre el impacto ambiental
hasta un codón de terminación. de la soja tolerante al glifosato.
➔➔ Los genes marcadores se usan para indicar una ➔➔ Identificación de un marco abierto de lectura. 
captación satisfactoria.
➔➔ El ADN recombinante debe insertarse en la célula
vegetal y ser captado por su ADN cromosómico o
su ADN del cloroplasto. Naturaleza de la ciencia
➔➔ El ADN recombinante puede introducirse en plantas ➔➔ Evaluación de riesgos y beneficios asociados a
enteras, en discos foliares o en protoplastos. la investigación científica: los científicos deben
➔➔ El ADN recombinante se puede introducir evaluar la posibilidad de que los genes de
por métodos directos físicos y químicos o resistencia a los herbicidas puedan propagarse
indirectamente por medio de vectores. a las poblaciones silvestres.
10
B . 2 B i ot e c n o l o g í a e n a g r i c u lt u r a
Organismos transgénicos
Los organismos transgénicos producen proteínas que no
formaban parte previamente del proteoma de su especie.
El conjunto de todas las proteínas que puede producir una célula o
un organismo se denomina proteoma. Las proteínas son componentes
clave de la estructura celular y realizan la mayoría de las funciones
celulares. A veces los ingenieros genéticos buscan ampliar el proteoma
de un organismo para alguna aplicación biotecnológica. Si la adición
al proteoma se debe a que se ha añadido un gen de un organismo
diferente, se dice que el organismo modificado es transgénico.
▲ Figura 1
La figura 1 muestra peces fluorescentes (GloFish©), el primer organismo
modificado genéticamente que se ha vendido como mascota. Se ha
añadido al genoma de estos peces transgénicos el gen para la producción
de la proteína verde fluorescente. El organismo original del que se
extrajo el gen es Aequorea victoria, una medusa.
La proteína SRY es un factor de transcripción que activa la expresión
de los genes que causan el desarrollo de los caracteres masculinos.
La figura 2 muestra una ratona transgénica (a la derecha) que ha
sido modificada genéticamente para expresar la proteína SRY en su
proteoma. Como resultado, la ratona ha desarrollado los mismos órganos
genitales que el macho de la izquierda.
Plantas de cultivo modificadas genéticamente

Las plantas de cultivo modificadas genéticamente
pueden usarse para obtener productos novedosos. ▲ Figura 2
Un producto novedoso se refiere a la presencia de una proteína o
fenotipo que no formaba parte previamente de una especie.
La producción del “arroz dorado” supuso la adición de tres genes al
arroz, dos de plantas narciso y uno de una bacteria, para producir el
pigmento naranja β-caroteno en los granos de arroz. El β-caroteno
es un precursor de la vitamina A. El arroz dorado se desarrolló como
una solución al problema de la deficiencia de vitamina A, que es una
importante causa de ceguera en niños de todo el mundo.
El maíz ha sido modificado genéticamente para producir la toxina CRY
añadiéndole un gen de Bacillus thuringiensis. Como resultado, la planta
resulta indigestible para el taladro del maíz, un insecto plaga que reduce
significativamente la producción de los cultivos.
Superación de la resistencia ambiental en

los cultivos
La modificación genética puede usarse para superar
la resistencia ambiental con el fin de aumentar las
producciones de los cultivos.
Los factores que limitan el crecimiento de los cultivos pueden ser
biológicos o no biológicos.
11
Los factores bióticos incluyen la competencia de las malas hierbas, la

depredación por insectos y la infección por patógenos.
La resistencia al herbicida glifosato se ha introducido en cultivos como
la soja como parte de una estrategia para reducir la competencia de las
malas hierbas.
La adición de genes al maíz para producir la toxina Bt es parte de una
estrategia para reducir la depredación por insectos como el gusano
de la raíz del maíz. Las plagas dañan considerablemente las raíces
no transgénicas, mientras que las raíces transgénicas apenas sufren
daños, ya que tienen resistencia al gusano de la raíz porque expresan
la toxina Bt.
En Hawái, los investigadores modificaron genéticamente plantas de
papaya para que fuesen resistentes al virus de la mancha anular de la
papaya. Hicieron que la planta expresara el gen que codifica la formación
de la cápsula del virus y desencadenaron así una respuesta protectora
ante el virus.
Los factores abióticos que limitan el crecimiento de los cultivos incluyen
las sequías, las heladas, los bajos niveles de nitrógeno en el suelo y la alta
salinidad del suelo.
El maíz DroughtGard© contiene el gen de la “proteína B de choque frío”
(cspB) extraído de la bacteria Bacillis subtilis, que le permite retener el
agua durante períodos de sequía.
El gen AtNHXI del berro Arabidopsis codifica la producción de una
proteína de membrana que acumula el exceso de sodio en las vacuolas
de la planta. Se han modificado genéticamente plantas del cacahuete
para expresar este gen, lo que les permite crecer en suelos salinos que
normalmente limitarían la producción de los cultivos.
Componentes de la construcción genética

El gen objetivo está ligado a otras secuencias que
controlan su expresión.
Para llevar a cabo la modificación genética se debe añadir algo más que
un gen: se necesitan secuencias adicionales que controlan la expresión
del gen.
Normalmente, se deben agregar secuencias promotoras eucarióticas a la
parte inicial de la construcción y secuencias terminadoras eucarióticas a
la parte final. A menudo la construcción también contiene un segundo
gen llamado secuencia de reconocimiento que permite a los ingenieros
▲ Figura 3 Ovejas transgénicas a la espera confirmar que se ha captado en el ADN del receptor y está siendo
de ser ordeñadas. Son crías de ovejas que expresada.
tienen incorporado en su ADN un gen humano
En algunos casos, hay que añadir secuencias específicas adicionales.
responsable de la producción de la proteína
alfa-1-antitripsina (A1AT). La A1AT se produce Consideremos el ejemplo de las ovejas modificadas genéticamente para
en las células mamarias y se segrega a la expresar proteínas humanas como la alfa-1-antitripsina en la leche
leche de la oveja. Así puede ser aislada y usada de oveja. En este caso, al crear la construcción genética es necesario
para tratar la deficiencia de A1AT hereditaria en añadir una secuencia promotora específica que garantice la expresión
seres humanos, que causa la enfermedad del del gen en la leche. Además, se tiene que añadir una secuencia señal
enfisema pulmonar. para garantizar que la proteína se produzca en los ribosomas del retículo
12
endoplasmático en lugar de los ribosomas libres del citoplasma. Así se

asegura que la proteína alfa-1-antitripsina será segregada por las células
mamarias en lugar de liberarse intracelularmente.
Genes marcadores
Los genes marcadores se usan para indicar una captación
satisfactoria.
Además del gen objetivo, a menudo se añade un gen adicional que
indique de alguna forma que se ha captado satisfactoriamente el gen
objetivo. Algunos genes marcadores se basan en la selección artificial: se
les llama marcadores seleccionables. El gen marcador a menudo confiere ▲ Figura 4
resistencia a los antibióticos. Aquellas bacterias que han captado el gen
marcador y el gen objetivo sobrevivirán a los antibióticos y podrán
cultivarse por separado.
El gen que codifica la producción de la proteína verde fluorescente
también se utiliza como marcador. La figura 4 muestra mosquitos
que han sido modificados genéticamente para no albergar el parásito
de la malaria. El gen añadido se ha asociado al gen de la proteína
verde fluorescente para poder así identificar con un microscopio los
mosquitos transgénicos.
ADN recombinante
El ADN recombinante debe insertarse en la célula vegetal
y ser captado por su ADN cromosómico o su ADN del
cloroplasto.
El ADN recombinante es una molécula que ha sido manipulada de forma
que contiene secuencias de dos o más fuentes.
Para crear un organismo transgénico, el ADN recombinante debe ser
captado por la célula receptora.
Para que el gen se pueda expresar, tiene que ser incorporado a un
cromosoma. En las células vegetales también se puede incorporar a un
cloroplasto. Este proceso de captación y expresión del ADN se llama
transformación. Los nuevos genes pueden insertarse en el ADN de los
cloroplastos. La gran ventaja de insertarlos en los cloroplastos es que el
ADN del cloroplasto no se transmite por medio del polen, lo que impide
que los genes de la planta modificada genéticamente pasen a otras
plantas. La transformación generalmente requiere el uso de un vector.
Diferentes objetivos de la transformación

genética
El ADN recombinante puede introducirse en plantas
enteras, en discos foliares o en protoplastos.
Una vez que se ha introducido el transgén en la célula receptora, se debe
producir una planta entera a partir de la célula transformada.
13
Los protoplastos son células vegetales cuyas paredes celulares se han

eliminado. La transformación por Agrobacterium se probó inicialmente
en protoplastos y, aunque tuvo un cierto éxito, la dificultad de
obtener suficientes protoplastos de calidad, junto con la dificultad de
producir plantas enteras a partir de protoplastos, llevó a la búsqueda
de otros métodos.
Los métodos con discos foliares implican la incubación de recortes de
hojas con Agrobacterium que contienen un plásmido con el gen objetivo y
un gen de resistencia a los antibióticos. Los discos foliares se transfieren
después a una placa que contiene dos antibióticos diferentes, lo que
garantiza que solo crecerán las células transformadas. Posteriormente,
las células transformadas se cultivan y se tratan de manera que crezcan
raíces y tallos a partir de los discos.
Diferentes métodos de transformación genética

El ADN recombinante se puede introducir por métodos
directos físicos y químicos o indirectamente por medio
de vectores.
Los genes pueden introducirse en las plantas de diversas formas, como
la microinyección, la electroporación, la infección viral, la biolística y la
incubación con Agrobacterium tumefaciens.
Uno de los métodos químicos originales para transformar las células
fue incubar las células receptoras en una solución de cloruro cálcico a
temperaturas frías y después aplicar un choque de calor a la solución.
La electroporación es un método físico que consiste en aplicar un
campo eléctrico externo que hace que se formen poros temporales en la
membrana celular por los que el ADN recombinante entra en la célula.
La microinyección es otro método físico de introducción de genes. Se
utiliza una pipeta para aspirar una célula y mantenerla en una posición
fija mientras se usa una aguja para inyectar los genes de interés.
En biolística, se disparan partículas metálicas recubiertas con el gen de
interés a una planta entera.
Un vector es un virus, un plásmido o algún otro agente biológico que
transfiere material genético de una célula a otra. A continuación se
explica el uso del plásmido Ti como vector, y más adelante se explica
también el uso de un virus como vector.
Uso del plásmido Ti como vector

Uso del plásmido inductor de tumores (Ti) de Agrobacterium tumefaciens para
introducir resistencia al glifosato en cultivos de soja
Una forma de introducir transgenes en las plantas El gen de resistencia al glifosato se inserta en
es usando Agrobacterium tumefaciens, una especie el plásmido Ti junto con un gen de resistencia
bacteriana que posee un plásmido llamado Ti que a los antibióticos. Esta construcción genética se
produce tumores en las plantas que infecta. inserta después en una bacteria de A. tumefaciens.
14
Las células vegetales son expuestas a la bacteria que crecen son las que han captado el plásmido;
transgénica y cultivadas en una placa que las demás mueren a causa del antibiótico.
contiene antibiótico. Las únicas células vegetales
gen de célula célula transferencia

resistencia al glifosato bacteriana vegetal genética
plásmido ADN
suspensión
gen de resistencia a los bacteriana célula muerta callo
antibióticos
medio con antibiótico

1 Se corta la 2 Se expone la hoja a la 3 Se expone la hoja a un 4 Se deja que el callo 5 Las plantas
hoja. bacteria que porta el antibiótico para matar desarrolle brotes y se transfieren al
gen de resistencia al las células que no han raíces. suelo, donde pueden
glifosato y el gen de captado los nuevos desarrollarse hasta
resistencia a los genes. Se espera a que ser plantas adultas
antibióticos. Se deja las células transgénicas completamente
que la bacteria transfiera se multipliquen y formen diferenciadas resistentes
estos genes a las células un callo. al glifosato.
de la hoja.
▲ Figura 5
Virus comestibles
Modificación genética del virus del mosaico del tabaco para permitir la producción
masiva de vacunas de hepatitis B en plantas de tabaco
Los programas de vacunación a menudo
gen de la hepatitis B que
se ven afectados por no poder acceder a codifica el antígeno que
áreas remotas, así como por la dificultad estimulará una respuesta
de mantener refrigeradas las vacunas. inmunológica
+
Una iniciativa ha sido desarrollar vacunas gen de la cápside del virus
comestibles, incorporando los antígenos en del mosaico del tabaco
materia vegetal. En uno de estos casos, se fusión de los dos genes
e inserción en el virus
modificó genéticamente el virus del mosaico
del tabaco con antígenos del virus de la
hepatitis B y luego se infectaron plantas gen de la hepatitis B
gen de la cápside
de tabaco.
infección de
la planta la planta expresa
el antígeno
anticuerpos alimento para los animales,

cuyo sistema inmunológico
responde creando anticuerpos
del virus de la hepatitis B
▲ Figura 6
15
Papas (patatas) modificadas para producir almidón que solo

contiene amilopectina
Producción de la papa “Amflora” (Solanum tuberosum) para industrias papeleras
y de adhesivos
Las papas se utilizan en la industria como fuente diferentes de polímeros de almidón (véase la
de almidón. El almidón puede usarse con diversos figura 7). El 80% de la fécula de la papa se
fines, incluso como adhesivo. Normalmente, compone de amilopectina de cadena ramificada
la fécula de las papas se compone de dos tipos y el 20% restante de amilosa de cadena recta.
HO
O O OH
HO HO OH
O O OH O
O OH
HO HO HO
O O HO O
HO O
HO HO HO HO
amilosa O
O O O
HO HO
O O OH
HO HO
O O
HO HO
amilopectina O
▲ Figura 7
Cuando se calienta una mezcla de almidón y

luego se enfría, tiende a formar un gel no deseado
para algunas aplicaciones como la producción de
cadena antisentido digestión papel y de adhesivos. Para evitarlo, los métodos
convencionales utilizan un tratamiento químico
que elimina la amilosa.
ribonucleasa
La compañía BASF produjo una papa modificada
genéticamente en la que se había desactivado
uno de los genes involucrados en la producción
de amilosa. El producto genético era “almidón
trascripción sintasa”. El método utilizado fue la técnica
antisentido, que consiste en insertar una versión
traducción invertida del gen que produce el ARNm. Como
ADN resultado, se producen tanto la cadena de
formación sentido normal como la cadena antisentido. Las
dúplex dos cadenas se unen y la molécula de ARNm
ARNm bicatenario se degrada en lugar de ser traducida
▲ Figura 8 para formar una proteína (figura 8).
16
Evaluación de los riesgos de propagación de los transgenes a las

poblaciones silvestres
Evaluación de riesgos y beneficios asociados a la investigación científica: los
científicos deben evaluar la posibilidad de que los genes de resistencia a los
herbicidas puedan propagarse a las poblaciones silvestres.
El flujo génico es la transferencia de genes o de malas hierbas en un área de cultivo. Si el
material genético de una población a otra. En transgén es de resistencia a insectos, el equilibrio
poblaciones de plantas, puede ocurrir por la ecológico podría verse afectado.
transferencia de polen entre especies relacionadas.
Evaluar el riesgo requiere estimar con qué
Los cultivos modificados genéticamente para frecuencia se produce el flujo génico, determinar
resistir a los herbicidas son el tipo más común de si se expresa el transgén e identificar los cambios en
cultivo transgénico. el fenotipo de la planta. Una estrategia para reducir
el riesgo es incorporar genes “atenuadores” junto
La posibilidad de que los transgenes de cultivos
con el transgén para reducir el éxito de cualquier
modificados genéticamente se propaguen a
planta híbrida que pudiera crearse accidentalmente.
cultivos no modificados y a poblaciones de malas
Otra estrategia consiste en transformar el ADN de
hierbas es un problema económico. Si el transgén
los cloroplastos en lugar del ADN nuclear, ya que el
llega a expresarse en la población silvestre,
ADN de los cloroplastos no se expresa en el polen.
resultaría difícil controlar el efecto de la población
Evaluación del impacto ambiental de un cultivo modificado

genéticamente
Evaluación de datos sobre el impacto ambiental de la soja tolerante al glifosato
Las malas hierbas reducen la producción de los riesgo de reducir la producción de los cultivos porque
cultivos, pues compiten con las plantas de cultivo las plantas de cultivo son resistentes al herbicida.
por el espacio, la luz solar, el agua y los nutrientes. Además, la cantidad de herbicida que se necesita
El glifosato es una sustancia química que mata aplicar es menor (tabla 1) a la que se necesitaba
una amplia variedad de plantas. La soja, así como antes de la introducción de los cultivos modificados
otras especies de cultivo, han sido modificadas genéticamente. Aunque hay desacuerdos con
genéticamente para resistir al glifosato, lo que respecto a los datos, muchos investigadores sostienen
permite a los agricultores utilizar un único que el glifosato es uno de los pesticidas menos
herbicida de amplio espectro. tóxicos que se utilizan en la agricultura.
Hay que considerar dos posibles aspectos
ambientales: los riesgos ambientales de la % de reducción en el uso de
modificación genética de una planta de cultivo y herbicidas en comparación con
Región geográfica
los riesgos ambientales del uso generalizado del los cultivos no modificados
glifosato como herbicida dado el predominio de genéticamente en 1997
los cultivos modificados genéticamente. Centro -23%
Existe un amplio consenso en el ámbito académico Cuadrante norte -15%
de que los cultivos modificados genéticamente para Mississippi Portland -11%
resistir al glifosato comportan al menos algunas Costa sur -51%
ventajas ambientales con respecto a otros sistemas
anteriores para combatir las malas hierbas. La ventaja ▲ Tabla 1 Reducción en la cantidad de herbicida aplicado en
de esta modificación es que se pueden controlar las cultivos modificados genéticamente en comparación con los
malas hierbas de los cultivos con un herbicida sin cultivos tradicionales en diversas regiones de Estados Unidos
17
Arar consiste en remover el suelo y ha sido una Un estudio realizado por la Unión Europea
parte habitual de las estrategias de eliminación en 2002 concluyó que había pocos datos que
de malas hierbas. La pérdida de la capa superior respaldaran las afirmaciones sobre el impacto
del suelo y la erosión es una de las consecuencias del glifosato en la salud de las personas. Algunos
del arado. El glifosato y los cultivos resistentes al estudios sugieren que otros componentes de la
glifosato han permitido reducir significativamente el mezcla de herbicidas que se usan en combinación
arado y, por tanto, ayudan a conservar la fertilidad con el glifosato tienen impactos ambientales.
del suelo. Esto ha reducido el uso de combustibles El gobierno australiano ha prohibido el uso de
fósiles para el cultivo, así como la necesidad de algunas formulaciones con glifosato cerca del agua.
añadir fertilizantes al suelo. La figura 9 muestra el
crecimiento del área cultivada con soja modificada soja modificada
genéticamente en Argentina y el correspondiente 18 25
soja modificada genéticamente

genéticamente
crecimiento de la agricultura sin arado. 16
agricultura sin arado 20
agricultura sin arado

14
(millones de ha)
(millones de ha)
La resistencia al glifosato está bajo una intensa 12
presión de selección, teniendo en cuenta el uso 15
10
generalizado de estos cultivos y el uso reducido de 8 10
otros herbicidas. Las consecuencias ambientales 6
de que las malas hierbas desarrollen resistencia 4 5
incluirían una disminución de la producción de 2
0 0
los cultivos para la misma cantidad de herbicida y 1996 1998 2000 2002 2004
la necesidad de incrementar el arado del suelo y años
utilizar otros herbicidas. ▲ Figura 9
Marcos abiertos de lectura

Un marco abierto de lectura es una longitud significativa del
ADN desde un codón de inicio hasta un codón de terminación.
Una vez que se ha secuenciado el ADN de un organismo, los
investigadores buscan la localización de los genes. El punto de partida
para esta búsqueda es identificar marcos abiertos de lectura (ORF, siglas
de Open Reading Frame).
La búsqueda de marcos abiertos de lectura se basa en los siguientes
conceptos:
●● Hay 64 tripletes de bases que se denominan codones.
●● Se utilizan 61 codones para codificar aminoácidos.
●● Hay 3 codones de terminación (TAA, TAG y TGA) que indican el final
de un marco abierto de lectura.
●● Hay un codón de inicio (ATG) que indica el comienzo de un marco
abierto de lectura y también codifica un aminoácido.
Los marcos abiertos de lectura se identifican en el ADN mediante la
búsqueda de secuencias de bases suficientemente largas como para
codificar los aminoácidos de un polipéptido entre un codón de inicio
y uno de los tres codones de terminación. En otras palabras, se buscan
secuencias donde no haya codones de terminación. Los investigadores
buscan generalmente una secuencia de bases lo suficiente larga como
para codificar unos cien aminoácidos. El tamaño medio de un marco
abierto de lectura en E. coli es de 317 aminoácidos.
18
Identificación de marcos abiertos de lectura

Identificación de un marco abierto de lectura
A continuación se muestra una corta secuencia 2 Los investigadores tienen que distinguir
de bases: entre los marcos abiertos de lectura que
codifican polipéptidos y las secuencias de bases
AATTCATGTTCGTCAATCAGCACCTTTGTGGTTC
aleatorias en el genoma que, por casualidad,
TCACCTCGTTGAAGCTTTGTACCTTGTTTGCGGT
tienen un codón de inicio seguido de una larga
GAACGTGGTTTCTTCTACACTCCTAAGACTTAA
secuencia sin un codón de terminación.
TAGCCTGGTG
a) Calcula el porcentaje de probabilidad
1 Halla el primer codón de inicio y el primer
de encontrar un codón de inicio en un
codón de terminación en esta secuencia.
fragmento de ADN con una secuencia
a) Indica cuántas bases hay antes del codón aleatoria de diez pares de bases. [2]
de inicio. [1] b) Si el codón de inicio se encuentra en
b) Indica cuántos codones hay en el una secuencia de bases aleatoria, calcula
marco abierto de lectura que has el porcentaje de probabilidad de que el
encontrado.[1] siguiente triplete de bases codifique un
c) Calcula cuántos aminoácidos están aminoácido.[1]
codificados en este marco abierto de c) Calcula el porcentaje de probabilidad de
lectura. Muestra cómo has llegado a que los siguientes 100 tripletes codifiquen
tu respuesta. [3] todos algún aminoácido. [2]
Preguntas basadas en datos: Identificación de un marco abierto de lectura

Una vez determinada la secuencia de bases en un 2 Determina el número de codones del
fragmento de ADN, un investigador puede querer código genético que son codones de
localizar un gen. Para ello, utilizará un programa terminación.[2]
informático con el que buscar marcos abiertos
3 En la tabla 2, los codones podrían comenzar
de lectura en la secuencia. Los marcos abiertos
por la primera, segunda o tercera base.
de lectura no tienen codón de terminación y,
Corresponden a tres marcos de lectura
por tanto, pueden codificar la producción de una
diferentes (RF1, RF2 o RF3). Determina cuál
proteína. Los codones de terminación son UGA,
de los marcos de lectura, RF1, RF2 o RF3,
UAA y UAG.
podría ser un marco abierto de lectura. [2]
1 Indica el número de codones del código
genético.[1]
ADN 3’ A T T A A C T A T A A A G A C T A C A G A G A G G G C T A G T A C
ARNm 5’
RF1 U A A U U G A U A U U U C U G A U G U C U C U C C C G A U C A U G
RF2 A A U U G A U A U U U C U G A U G U C U C U C C C G A U C A U G
RF3 A U U G A U A U U U C U G A U G U C U C U C C C G A U C A U G
▲ Tabla 2
19
Actividad
Alcanivorax borkumensis es una bacteria en forma de desplegable. Haz clic en FASTA para identificar el
bastón que utiliza el petróleo como fuente de energía. Es número GI de la bacteria, que aparece en la parte
relativamente infrecuente, pero domina rápidamente el superior de la página (GI 110832861). Mira el genoma.
ecosistema microbiano marino después de un vertido Ve al buscador de marcos abiertos de lectura disponible
de petróleo. Los científicos secuenciaron el genoma de en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/. Introduce
esta bacteria con el propósito de identificar los aspectos el número GI y especifica el rango de bases en el que
genéticos de su capacidad de digerir el petróleo. Se quieres buscar.
puede consultar el genoma completo de esta bacteria en
la base de datos GenBank. Como actividad para toda la clase, se podría dividir
el genoma en fragmentos de 2000 pares de bases y
Visita la base de datos GenBank y busca el genoma compartir con los compañeros información acerca de los
de esta bacteria seleccionando Genome en el menú marcos abiertos de lectura identificados.
Teoría del Conocimiento Identificación de genes objetivo

¿Qué cuestiones de
La bioinformática desempeña un papel importante en la
conocimiento surgen por identificación de los genes objetivo.
el rápido aumento en la La bioinformática es el uso de computadores para investigar un
cantidad de información y fenómeno biológico. Para identificar marcos abiertos de lectura, se
datos disponibles? buscan largas secuencias sin codones de terminación en la información
La tecnología de sobre el genoma almacenada en una base de datos.
secuenciación del ADN Una vez identificado un marco abierto de lectura, pueden realizarse
y la bioinformática han búsquedas con el software BLAST. Las búsquedas con BLASTn examinan
evolucionado a un ritmo una serie de bases de datos para determinar si existe un marco abierto
acelerado. En 2009, el de lectura con una secuencia de nucleótidos similar en otra especie.
mayor problema para Las búsquedas con BLASTx examinan una base de datos de proteínas
los investigadores era basándose en la secuencia traducida del marco abierto de lectura.
desarrollar soluciones que
mejoraran la secuenciación Por otra parte, si un investigador ha encontrado una proteína y quiere
del ADN. El tiempo y costo determinar la localización de un gen, puede realizar una búsqueda
limitaban la producción con tBLASTn usando la secuencia traducida para identificar en varios
de información sobre las genomas posibles genes que se podrían haber transcrito para producir
secuencias del ADN. En el dicha proteína. Los tres métodos sirven para identificar genes objetivo.
año 2013, los investigadores
ya podían secuenciar todo
un genoma humano en un
solo día. El desafío ha pasado
de ser la secuenciación del
ADN a la gestión y el análisis
del extraordinario volumen
de datos de secuencias que
se está produciendo. Se ha
estimado que se necesitan
cinco meses para analizar los
datos generados en un mes.
20
B . 3 P r ot e c c i ó n a mb i e n ta l
B.3 Protección ambiental

➔➔ Las respuestas a los incidentes de
➔➔ Degradación del benceno mediante bacterias
contaminación implican técnicas de halófilas, como Marinobacter.
biorremediación combinadas con
➔➔ Degradación del petróleo mediante Pseudomonas.
procedimientos físicos y químicos.
➔➔ Conversión mediante Pseudomonas del
➔➔ En la biorremediación se usan
metilmercurio en mercurio elemental.
microorganismos.
➔➔ Uso de biopelículas en lechos con filtros de
➔➔ Algunos contaminantes son metabolizados por
goteo para el tratamiento de aguas residuales.
microorganismos.
➔➔ Los agregados cooperativos de
microorganismos pueden formar biopelículas.
➔➔ Las biopelículas presentan propiedades Habilidades
emergentes. ➔➔ Evaluación de datos o informes de los medios
➔➔ Los microorganismos que crecen en una sobre problemas ambientales causados por
biopelícula son altamente resistentes a los biopelículas.
agentes antimicrobianos.
➔➔ Los microorganismos presentes en las
biopelículas cooperan mediante la detección Naturaleza de la ciencia
de quórum. ➔➔ Las mejoras en equipos y aparatos conllevan
➔➔ Para la desinfección de sistemas acuáticos se avances en la investigación científica: el uso
usan bacteriófagos. de herramientas tales como el microscopio
de exploración láser ha conducido a
los investigadores a comprender más
profundamente la estructura de las biopelículas.
Métodos utilizados para solucionar incidentes de

contaminación
Las respuestas a los incidentes de contaminación
implican técnicas de biorremediación combinadas con
procedimientos físicos y químicos.
Cuando se liberan sustancias químicas al ambiente por accidente o por
descuido, el resultado pueden ser perturbaciones ecológicas significativas.
La biorremediación es el uso de microbios para eliminar contaminantes
ambientales del agua o del suelo. En este subtema, consideraremos
estrategias de biorremediación para eliminar contaminantes como el
benceno, el petróleo, los metales pesados y las aguas residuales.
No todos los incidentes de contaminación pueden resolverse únicamente
mediante biorremediación. En el caso de los metales pesados, la
21
biorremediación puede no ser recomendable porque es necesario

eliminarlos de la cadena alimentaria. En tales casos puede emplearse
la fitorremediación, que depende de las plantas. Los metales pesados
pueden bioacumularse en la biomasa de los cultivos. Después, los
cultivos pueden incinerarse para concentrar el metal y este puede ser
luego reciclado o bien almacenado adecuadamente.
Hay una serie de procedimientos físicos y químicos que pueden combinarse
con la biorremediación para responder a incidentes de contaminación.
●● Los procedimientos físicos en caso de vertidos de petróleo incluyen el
uso de depuradores, detergentes y dispersantes.
●● Los suelos contaminados con sustancias químicas pueden retirarse e
incinerarse para degradar las sustancias orgánicas volátiles.
●● El suelo se puede retirar, compactar, tamizar y luego suspender en
agua con algunos productos químicos que ayudan a disolver las
sustancias químicas en el agua. El agua contaminada con sustancias
químicas puede después purificarse por separado.
●● Para acelerar la destrucción de los compuestos orgánicos tóxicos, a veces
se inyectan en el suelo oxidantes químicos como el ozono y el peróxido.
Los microorganismos tienen propiedades que los

hacen útiles para la biorremediación
En la biorremediación se usan microorganismos.
Las bacterias y las arqueas son útiles para la biorremediación porque
pueden multiplicarse muy rápidamente por fisión binaria y tienen
una variedad de metabolismos. Llevan a cabo una mayor variedad
de reacciones químicas que ningún otro grupo de organismos,
especialmente reacciones inorgánicas. A menudo hay alguna especie
procariótica capaz de llevar a cabo la reacción necesaria para un proceso
de biorremediación.
▲ Figura 1 Suelos en proceso de
biorremediación en una refinería La figura 1 muestra una biopila, un método para controlar la
petrolífera y planta química. contaminación del suelo. Se añade material orgánico como abono, heno
u otra fuente nutritiva al suelo y se riega constantemente. La comunidad
microbiana que crece digiere los contaminantes.
La biorremediación depende del metabolismo de

los microorganismos
Algunos contaminantes son metabolizados por
microorganismos.
Los microorganismos pueden utilizar los contaminantes como fuentes
de energía, fuentes de carbono y aceptadores de electrones en la
respiración celular.
La bacteria Dehalococcoides ethenogenes (en rojo en la figura 2) se ha usado
para descomponer disolventes clorados en el suelo. Utiliza los compuestos
de cloro como aceptadores de electrones en la respiración celular.
▲ Figura 2
22
La bacteria Geobacter sulfurreducens usa el uranio como aceptador de

electrones, transformándolo de una forma soluble a otra insoluble que se
sedimenta y se puede recoger.
La figura 3 muestra la bacteria Acidovoranx sp. (en amarillo) parcialmente
cubierta de hierro (naranja). Esta bacteria es capaz de precipitar y
ligar el hierro y el arsénico que hay en el suelo, por lo que está siendo
investigada como un medio para reducir la cantidad de arsénico presente
en los campos de arroz.
Los microorganismos pueden formar ▲ Figura 3
biopelículas
Los agregados cooperativos de microorganismos pueden
formar biopelículas.
Una biopelícula es una colonia que recubre una superficie como
consecuencia de la cooperación entre células. Los miembros de la colonia
de una biopelícula segregan moléculas de señalización que atraen células
independientes o planctónicas a la colonia. También segregan moléculas
que ayudan a los agregados a adherirse a la superficie y ayudan a las
células a pegarse entre sí. Las células crean en sus membranas celulares
canales de proteínas que facilitan el intercambio de materiales con otros
miembros de la colonia. Las biopelículas normalmente se forman en
superficies sólidas, pero también pueden formarse en superficies líquidas.
Pueden estar compuestas de una variedad de microorganismos, incluidas
bacterias, arqueas, protozoos, algas y hongos. La placa dental es una
biopelícula que puede contener microorganismos de hasta 500 taxones,
mientras que la biopelícula que se forma en los pulmones de las personas
afectadas por fibrosis quística a menudo se compone de una sola especie:
Pseudomonas aeruginosa.
La figura 4 muestra una ampliación de una cerda de un cepillo de
dientes usado. La superficie de la cerda está cubierta de una biopelícula
de bacterias cooperativas. La figura 5 muestra una biopelícula dentro de ▲ Figura 4 Biopelícula en la cerda de
un catéter. Un catéter es un tubo utilizado en tratamientos médicos para un cepillo de dientes usado
drenar la orina o mantener una conexión con la corriente sanguínea.
La parte central debe estar hueca, pero en este caso está cubierta de una
biopelícula de color blanco.
Propiedades emergentes
Las biopelículas presentan propiedades emergentes.
Las propiedades que resultan de la interacción entre los miembros
de un colectivo y que no se aprecian en los individuos se denominan
propiedades emergentes.
En las biopelículas, la capacidad de las células para organizarse y
formar una estructura compleja es una propiedad emergente. Los
miembros de la colonia segregan una sustancia química conocida como
exopolisacárido que forma una matriz que mantiene unida la colonia y ▲ Figura 5 Biopelícula formada en el
la protege. Esta matriz es una propiedad emergente. interior de un catéter
23
El aumento de la resistencia a los antibióticos, la señalización entre los

miembros de la colonia, el aumento de la virulencia, la formación de
canales para el flujo de agua dentro de la colonia y la capacidad de las
células para moverse usando la matriz, que hace que se mueva toda la
colonia, se consideran propiedades emergentes.
Las biopelículas resisten a los agentes

antimicrobianos
Los microorganismos que crecen en una biopelícula son
altamente resistentes a los agentes antimicrobianos.
Las infecciones contraídas en un hospital, o infecciones nosocomiales,
suelen ser causadas por biopelículas. Las biopelículas a veces aumentan
su resistencia a los antibióticos, y esto es motivo de preocupación para
los encargados del control de infecciones en los hospitales.
Hay una serie de mecanismos que explican la resistencia a los
antibióticos de las biopelículas. En parte, la resistencia se debe a la
matriz de exopolisacárido, que actúa como barrera física a la entrada del
antibiótico en la colonia.
A menudo los antibióticos actúan sobre los mecanismos que inhiben
la división celular. En algunas biopelículas, un suministro limitado
de nutrientes puede reducir la tasa de división de la colonia, lo que
minimiza el efecto de los antibióticos. Particularmente, este puede
ser el caso de los miembros de la colonia que se encuentran más en
el interior.
Detección de quórum
Los microorganismos presentes en las biopelículas
cooperan mediante la detección de quórum.
La detección de quórum es un sistema de comportamientos que se
desarrollan en función de la densidad de la población. Se observa en una
amplia gama de organismos.
En las bacterias que forman biopelículas, la expresión génica puede verse
afectada por la densidad de la población. Las moléculas de señalización
que libera una célula se unen a las moléculas receptoras de otra célula y
conducen a la expresión de genes que pueden facilitar el desarrollo de la
biopelícula. Cuando la densidad de población es baja, la concentración de
la molécula de señalización es baja y no es suficiente para desencadenar
comportamientos coordinados. Cuando la población sobrepasa un
nivel umbral (es decir, cuando se logra el quórum), la concentración
de la molécula de señalización alcanza una concentración crítica que
desencadena comportamientos coordinados.
El patógeno Pseudomonas aeruginosa utiliza la detección de quórum para
coordinar el movimiento, la producción de exopolisacárido, la agregación
celular y la formación de biopelículas.
24
concentración alta de moléculas

de señalización
matriz de
exopolisacárido
molécula de
señalización
segregada
metabolismo
modificado
molécula de
señalización
concentración relativamente baja de receptores de segregada
moléculas de señalización de moléculas de
otras células señalización
Forma libre Biopelícula
▲ Figura 6
Uso de virus para matar bacterias en sistemas

acuáticos
Para la desinfección de sistemas acuáticos se usan
bacteriófagos.
Cuando las bacterias producen una biopelícula, puede ser difícil eliminarlas.
El control de biopelículas en los sistemas acuáticos es esencial.
Algunos de los daños que pueden producir las biopelículas son:
●● Las bacterias anaeróbicas reductoras de sulfatos producen ácido ▲ Figura 7 Bacteriófagos (rosa) infectando una
sulfúrico que puede corroer las tuberías. población de bacterias (verde)
●● Las biopelículas pueden afectar al intercambio de calor en sistemas
donde es importante liberar calor residual al ambiente.
●● La proliferación de una biopelícula puede reducir el diámetro de
una tubería, causando una resistencia por fricción que disminuye la
presión del agua y hace necesaria una mayor potencia de bombeo.
Las bacterias pueden ser difíciles de matar cuando forman una biopelícula.
Se puede matar con desinfectantes a las bacterias que ocupan la capa
externa de una biopelícula, pero las bacterias interiores están protegidas.
Los virus son la solución a este problema, pues se propagan por toda
la colonia de la biopelícula. Los virus que atacan a las bacterias se
denominan bacteriófagos y son específicos para ciertas bacterias.
Un estudio logró los mejores resultados en la eliminación de biopelículas
usando una combinación de bacteriófagos y cloro. Un tratamiento inicial
con virus seguido de cloro eliminó el 97% de las biopelículas en los cinco
días posteriores a la exposición, mientras que un tratamiento solo con
cloro únicamente eliminó el 40%.
Además, en la colonia puede haber bacterias patógenas específicas como
las bacterias coliformes. Pueden añadirse bacteriófagos específicos del
patógeno para asegurar su reducción. El bacteriófago T4 es específico
para E. coli.
25
Biorremediación en condiciones salinas

Degradación del benceno mediante bacterias halófilas, como Marinobacter
La extracción de petróleo en ambientes marinos Algunas arqueas están adaptadas para vivir en
genera grandes cantidades de aguas residuales ambientes extremos como las aguas muy salinas
salinas que están contaminadas con hidrocarburos (figura 9). Se denominan halófilas. Esta adaptación
como el benceno y el tolueno. El benceno ha sido muy útil para la biorremediación de aguas
(figura 8) es motivo de especial preocupación residuales salinas. Una especie de arquea halófila,
porque puede permanecer en el ambiente durante Marinobacter hydrocarbonoclasticus, ha demostrado
mucho tiempo, es moderadamente soluble en ser capaz de degradar completamente el benceno.
agua y es cancerígeno. La biorremediación es
difícil en este caso, ya que el contenido de sal de
las aguas residuales puede ser tan alto que mata a
la mayoría de las poblaciones de bacterias.
H H
C C
H C C H
C C
H = hidrógeno H H
C = carbono
benceno
▲ Figura 9 El color de esta laguna salada es indicativo de la
▲ Figura 8 Molécula de benceno presencia de una población de bacterias halófilas.
Biorremediación de vertidos de petróleo

Degradación del petróleo mediante Pseudomonas
En ambientes naturales, existen algunas filtraciones
de petróleo a través de grietas y respiraderos en el
fondo del océano. Algunos miembros del género
Pseudomonas prosperan en estas comunidades,
ya que pueden utilizar el petróleo como fuente
de energía y de carbono. La limpieza de vertidos
de petróleo a menudo conlleva la siembra de
Pseudomonas en la zona del vertido. Estas bacterias
también necesitan sustancias como el potasio
y la urea como nutrientes para metabolizar el
petróleo a un ritmo más rápido. Con frecuencia
estos nutrientes son rociados en el área del vertido
para facilitar la labor de las bacterias. La figura 10
muestra una población de bacterias degradando ▲ Figura 10
una gota de petróleo suspendida en agua.
26
Biorremediación del metilmercurio

Conversión mediante Pseudomonas del metilmercurio en mercurio elemental
El mercurio termina en los vertederos de basura La bacteria Pseudomonas putida es capaz de
porque es un componente de algunas pinturas, convertir el metilmercurio en metano y un ion de
electrodomésticos y algunos tipos de bombillas. En mercurio. Después otras bacterias usan el ion de
este ambiente, la bacteria Desulfovibrio desulfuricans mercurio soluble como aceptador de electrones,
convierte el mercurio elemental en metilmercurio lo que produce la reformación de mercurio
orgánico muy tóxico. Esta forma del mercurio elemental insoluble.
entra en las cadenas alimentarias más fácilmente
En un biorreactor, se puede separar este mercurio
porque se adhiere a las membranas celulares y se
elemental de las aguas residuales porque es
puede disolver en ellas. Puede bioacumularse en
insoluble y se hunde debido a su densidad.
la biomasa de los organismos y biomagnificarse a
lo largo de la cadena alimentaria.
Uso de biopelículas en lechos con filtros de goteo

Uso de biopelículas en lechos con filtros de goteo para el tratamiento de
aguas residuales
La consecuencia de no tratar las aguas residuales que es necesario para que las bacterias aeróbicas
y dejar que fluyan hasta las corrientes de agua es digieran el contenido de las aguas residuales.
un enriquecimiento en nutrientes o eutrofización
de las aguas, que favorece el crecimiento de
algas. Cuando las algas mueren, disminuye la
concentración de oxígeno debido a la actividad
bacteriana en la materia orgánica muerta. Esto se
denomina demanda biológica de oxígeno.
Muchas plantas de tratamiento de aguas residuales
usan biopelículas para abordar la eutrofización.
Los sistemas de filtros de goteo tienen lechos de
rocas de hasta 2 metros de profundidad. Las rocas
son colonizadas por una biopelícula de bacterias
aeróbicas. Se pulverizan aguas residuales sobre las
rocas. El proceso de pulverización añade oxígeno ▲ Figura 11
Informes de los medios sobre biopelículas

Evaluación de datos o informes de los medios sobre problemas ambientales
causados por biopelículas
Las biopelículas aparecen frecuentemente en los Científicos de la universidad estadounidense
medios porque tienen una serie de propiedades Virginia Tech han aportado nuevas pruebas
novedosas e interesantes, y se emplean como de que las biopelículas (bacterias que se
soluciones innovadoras a algunos problemas. Al adhieren a las superficies y construyen capas
mismo tiempo, se las ha relacionado con una serie protectoras) favorecen la supervivencia del
de problemas ambientales: patógeno humano Salmonella.
27
Según los Centros para el Control y la ambientes secos, deja de reproducirse, pero
Prevención de Enfermedades, cada año activa genes que producen una biopelícula
uno de cada seis estadounidenses enferma que los protege del ambiente perjudicial.
por comer alimentos contaminados y
Los investigadores estudiaron la resistencia
más de un millón de casos se deben a la
de la biopelícula de Salmonella secándola
bacteria Salmonella. Descubrir qué hace
y almacenándola en leche en polvo hasta
que Salmonella sea resistente a agentes
30 días. En varios momentos, se probó en un
antibacterianos podría ayudar a contener los
sistema gastrointestinal simulado. Grandes
brotes.
cantidades de Salmonella sobrevivieron en
Investigadores de Fralin Life Science Institute estas condiciones de almacenamiento a largo
descubrieron que las biopelículas, además plazo, pero la biopelícula de Salmonella fue
de proteger al patógeno Salmonella frente más resistente que las células individuales en
a tratamientos térmicos y desinfectantes las mismas condiciones.
como la lejía, lo mantienen en condiciones
La respuesta de las bacterias al estrés de
extremadamente secas y también lo protegen
las condiciones secas también las hizo
en procesos digestivos normales.
más propensas a causar enfermedades.
Los brotes de Salmonella en alimentos Las biopelículas permitieron a Salmonella
secos como los cereales, las especias, sobrevivir en el ambiente hostil y ácido del
los frutos secos, la leche en polvo y la estómago, aumentando sus probabilidades
comida de mascotas han causado más de de llegar a los intestinos, donde la infección
900 enfermedades en los últimos cinco años. produce los síntomas asociados con la
Antes se pensaba que estos alimentos eran intoxicación alimentaria.
seguros porque, al ser secos, detienen el
Esta investigación puede influir en las
crecimiento microbiano.
directrices de la administración de alimentos
“La mayoría de la gente esperaría encontrar y medicamentos de EE. UU. (FDA), pues
Salmonella en las carnes crudas, pero no pone de manifiesto la necesidad de mejorar
piensa que también puede estar presente el saneamiento y desarrollar nuevas
en las frutas, las verduras o los productos estrategias para reducir la formación de
secos, que no siempre se cocinan”, afirmó biopelículas en equipamientos, con miras a
M. Ponder (Virginia Tech). disminuir las probabilidades de otro brote.
Salmonella prospera y se reproduce Fuente: Cecilia Elpi: ‘Biofilm helps salmonella survive hostile
abundantemente en condiciones húmedas. En conditions’, Abril 2013, www.vtnews.vt.edu.
Actividad ●● La formación de biopelículas en equipamientos

Elige uno o varios de los siguientes problemas y tuberías en la industria (por ejemplo, en las
ambientales relacionados con las biopelículas. Crea instalaciones de fabricación de papel)
un breve informe de investigación sobre el alcance ●● La formación de biopelículas en tuberías de agua
del problema, y asegúrate de indicar el efecto de las limpia en las instalaciones de tratamiento de aguas
biopelículas. Evalúa posibles soluciones a los problemas ●● La unión de metales pesados con carga positiva a
causados por las biopelículas. biopelículas con carga negativa
●● El aumento de la demanda biológica de oxígeno en ●● La captura de toxinas dentro de la biopelícula
aguas eutróficas a causa de las biopelículas
28
Los microscopios de exploración láser han mejorado nuestros

conocimientos de las biopelículas
Las mejoras en equipos y aparatos conllevan avances en la investigación
científica: el uso de herramientas tales como el microscopio de exploración láser
ha conducido a los investigadores a comprender más profundamente la estructura
de las biopelículas.
Los biopelículas tienen una estructura compleja.
La posición de cada célula en relación con el
resto y con la matriz de exopolisacárido influye
en las funciones. La visualización tridimensional
de células vivas que desempeñan diferentes
funciones es posible con colorantes y un
microscopio de exploración láser. Esta técnica
permite observar la biopelícula directamente
sin alterar su estructura.
La figura 12 muestra un fragmento de biopelícula
extraído de líquido amniótico. La imagen se
obtuvo con un microscopio de exploración láser.
Los puntos rojos indican el exopolisacárido, los
puntos verdes indican las bacterias y los puntos
grises representan las células del huésped. ▲ Figura 12
29
B.4 Medicina (TANS)

➔➔ La infección causada por un patógeno puede
➔➔ Uso de la PCR para detectar distintas cepas del
detectarse mediante la presencia de su virus de la gripe.
material genético o sus antígenos.
➔➔ Rastreo de células tumorales mediante
➔➔ La predisposición a una enfermedad genética transferrina ligada a sondas luminiscentes.
puede detectarse mediante la presencia de
➔➔ Uso de técnicas de biopharming para obtención
marcadores.
de antitrombina.
➔➔ Se pueden usar chips de ADN para comprobar
➔➔ Uso de vectores virales en el tratamiento de
la predisposición genética o para diagnosticar
inmunodeficiencia combinada grave (SCID).
enfermedades.
➔➔ Los metabolitos que indican la enfermedad en
cuestión pueden detectarse en sangre y en orina. Habilidades
➔➔ Los experimentos de rastreo de trazas se ➔➔ Análisis de un chip (microarray) simple.
usan para obtener información acerca de la ➔➔ Interpretación de los resultados de una prueba
localización e interacción de la proteína deseada. diagnóstica ELISA.
➔➔ En biopharming (obtención mediante
transgenia, generalmente de sustancias de
interés farmacéutico), se emplean plantas y Naturaleza de la ciencia
animales modificados genéticamente para ➔➔ Las mejoras tecnológicas conllevan avances
producir proteínas con fines terapéuticos. en la investigación científica: la innovación
➔➔ En terapia génica se pueden usar vectores en tecnología ha permitido a los científicos
virales. diagnosticar y tratar enfermedades.
Innovaciones en las técnicas de diagnóstico

Las mejoras tecnológicas conllevan avances en la investigación científica: la
innovación en tecnología ha permitido a los científicos diagnosticar y tratar
enfermedades.
Para ser útiles, los nuevos métodos de diagnóstico de microscópicos para detectar la presencia del
enfermedades deben ser precisos y preferiblemente microorganismo o pruebas de su actividad.
fáciles de usar. Deben proporcionar resultados en
El diagnóstico de infecciones bacterianas se
un momento oportuno que permita administrar
ha basado tradicionalmente en la obtención
el tratamiento lo antes posible, de manera que no
de muestras de orina o heces, o muestras
haya complicaciones a largo plazo. En el caso de las
del sitio infectado. Si existe una infección
enfermedades infecciosas, un diagnóstico más rápido
bacteriana, la muestra puede cultivarse para
y preciso puede permitir aplicar un tratamiento que
ver si crecen colonias bacterianas características
evite la propagación del patógeno.
de una enfermedad determinada. La limitación
Con frecuencia, las infecciones por parásitos de este procedimiento es que diferentes
han sido diagnosticadas mediante análisis microorganismos a veces tienen el mismo
30
B . 4 M e d i c i n a ( TANS )
aspecto. Además, algunos patógenos son difíciles búsqueda de altos niveles de metabolitos inusuales
o lentos de cultivar. en la orina o en la sangre.
El diagnóstico de enfermedades genéticas se Las mejoras en los métodos de diagnóstico han
ha realizado tradicionalmente mediante una aumentado la especificidad, la rapidez y la fiabilidad
combinación de observaciones clínicas y la del diagnóstico.
Altos niveles de metabolitos pueden indicar

enfermedad
Los metabolitos que indican la enfermedad en cuestión
pueden detectarse en sangre y en orina.
“Errores innatos del metabolismo” es un término aplicado a un amplio
grupo de enfermedades hereditarias que afectan al metabolismo. La
mayoría de estas enfermedades se deben a mutaciones en genes que
codifican enzimas, lo que da como resultado enzimas no funcionales. Esto
produce una acumulación de sustancias tóxicas o una escasez de moléculas
necesarias para un funcionamiento normal y acarrea síntomas secundarios.
La tabla 1 muestra tres de estas enfermedades y los metabolitos que se
detectan en la sangre y en la orina de las personas afectadas.
Los recién nacidos son sometidos a la prueba del talón para detectar
fenilcetonuria; esta prueba consiste en una punción del talón para tomar
una muestra de sangre. Si el bebé está afectado, presentará altos niveles
de fenilpiruvato en la sangre que indican que carece de una enzima para
convertir el aminoácido fenilalanina en tirosina. Si se diagnostica con
suficiente rapidez, una modificación de la dieta puede prevenir graves
consecuencias para el niño.
Enfermedad Ruta metabólica que no funciona Metabolito que se detecta

Síndrome de Producción de purinas Cristales de ácido úrico en la orina
Lesch-Nyhan
Alcaptonuria Descomposición del aminoácido tirosina Altos niveles de ácido homogentísico en la sangre
y en la orina detectados mediante cromatografía
en capa fina y cromatografía en papel
Síndrome de Formación de peroxisomas (orgánulos Altos niveles de ácidos grasos de cadena larga
Zellweger esenciales para la descomposición de en la sangre
ácidos grasos de cadena larga)
▲ Tabla 1
Indicadores de infección por un patógeno

La infección causada por un patógeno puede detectarse
mediante la presencia de su material genético o sus antígenos.
Los métodos moleculares modernos tienen la ventaja de diferenciar mucho
mejor entre patógenos. Pueden automatizarse para acelerar el proceso y no
presentan la limitación de tener que cultivar el patógeno por separado.
31
ELISA (acrónimo de Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) es

una prueba diagnóstica para detectar la presencia de anticuerpos
contra patógenos. La desventaja de esta prueba es que generalmente
solo es eficaz una vez que el paciente ha desarrollado una respuesta
inmunológica contra el patógeno mediante la producción de anticuerpos.
Las versiones más recientes de ELISA detectan directamente el antígeno
(por ejemplo, el antígeno p24 del virus VIH).
Se puede utilizar la PCR para detectar el material genético de un patógeno.
Si a la muestra del paciente se añaden cebadores que tengan la misma
secuencia de nucleótidos que el material genético del patógeno, solo habrá
amplificación si el material genético del patógeno está presente.
Otra forma de detectar la presencia de un patógeno es utilizar sondas
de ADN en un chip (microarreglo). Así pueden detectarse secuencias de
ARNm complementarias al patógeno en muestras de un paciente.
La prueba ELISA
Interpretación de los resultados de una prueba diagnóstica ELISA
La prueba ELISA puede utilizarse para detectar solución. En un resultado negativo, este enjuague
una infección causada por un patógeno. La prueba eliminaría la molécula de captura libre. En un
consiste en detectar la presencia de anticuerpos resultado positivo, la molécula de captura libre
contra los antígenos del patógeno. También puede se une a la molécula objetivo y no se elimina. El
detectar directamente el antígeno. último paso es agregar el sustrato de la enzima,
que cambia de color por la acción de la enzima.
La figura 1 muestra la base de un resultado
Por tanto, una solución coloreada indica un
positivo en la prueba de detección del VIH.
resultado positivo (véase la figura 2).
Se fija una molécula de captura a una superficie. En
La figura 2 muestra una bandeja de celdas que
la figura 1, las moléculas de captura son anticuerpos
contienen suero sanguíneo de diferentes personas
contra la proteína p24 de la cápside del VIH.
para detectar anticuerpos contra el virus de
La muestra que se va analizar se expone a la la hepatitis C. Las celdas incoloras indican un
superficie de captura. Las moléculas objetivo, resultado negativo. Las que cambian de color a
que están presentes en una prueba con resultado amarillo/naranja indican un resultado positivo
positivo, se unen a las moléculas de captura. A y confirman que el paciente tiene anticuerpos
continuación se añade una molécula de captura contra el virus de la hepatitis C.
libre que está ligada a una enzima. Se enjuaga la
+ +
cambio de
color por
la acción de
sustrato la enzima
+
anticuerpo de captura anticuerpo de detección

antígeno la enzima unida al anticuerpo de detección
hace que el sustrato cambie de color ▲ Figura 2 Resultados de varias pruebas ELISA para detectar el
▲ Figura 1 Pasos de una prueba ELISA con resultado positivo virus de la hepatitis C
32
Actividad 2
La figura 3 muestra una curva estándar que relaciona
densidad óptica
la cantidad de antígeno presente en el suero con la
densidad óptica, una medida del color de la solución. 1
Cuanto más oscuro es el color, mayor es la densidad
óptica.
1 Explica cómo podría utilizarse la curva estándar. [2] 0
0 100 200 300 400 500
2 Determina la concentración de antígeno presente concentración de antígeno/pg mL-1
para una densidad óptica de 1,0. [1] ▲ Figura 3
La PCR como herramienta de diagnóstico

Uso de la PCR para detectar distintas cepas del virus de la gripe
Hay una serie de indicadores y pruebas clínicas Si las secuencias cebadoras se unen a secuencias
para identificar una infección causada por un en el cADN, esto significa que el ARNm que se está
virus de la gripe. En algunas personas, como buscando estaba presente en la muestra original
las mujeres embarazadas, las personas mayores y el cADN se amplificará. Una modificación
o aquellas cuyo sistema inmunitario está reciente consiste en añadir a la muestra colorantes
comprometido, la infección con cepas más graves fluorescentes que se unen específicamente al ADN
(por ejemplo, la gripe porcina) debe diagnosticarse bicatenario. A medida que aumenta la cantidad de
rápidamente, pues puede causarles la muerte. ADN bicatenario, se detectará fluorescencia, lo que
Asimismo, algunas cepas del virus de la gripe indica un resultado positivo.
pueden producir efectos secundarios más graves.
Además, la detección temprana puede prevenir ARNm
una epidemia grave. Con la prueba de la PCR es transcriptasa inversa
muy probable identificar la cepa concreta del virus ARNm
que infecta a una persona.
cADN
Como el virus de la gripe es un virus ARN, ribonucleasa
se utiliza una variante de la PCR llamada
cADN
transcripción inversa de la reacción en cadena de
la polimerasa. La transcriptasa inversa utiliza una cebador 3
molécula de ARN como molde para sintetizar una
molécula de ADN complementario llamada cADN. + polimerasa Taq
El primer paso consiste en purificar el ARNm de cADN bicatenario

las células de una persona infectada. El ARNm (objetivo)
extraído se convierte en cADN. A continuación
amplificación
se añaden secuencias cebadoras específicas de la
cepa del virus de la gripe que se está buscando. ▲ Figura 4
Marcadores genéticos
La predisposición a una enfermedad genética puede
detectarse mediante la presencia de marcadores.
Los marcadores genéticos son alelos específicos a los que se asocia
una predisposición a padecer una enfermedad genética. Pueden ser
33
cromosoma 17 cromosoma 13 polimorfismos de un solo nucleótido o repeticiones en tándem. Los

marcadores pueden detectarse mediante métodos tales como la PCR y los
análisis de ADN.
Los marcadores pueden ser parte de una secuencia codificante o no
BRCA 2
codificante; es decir, pueden contribuir a la enfermedad o pueden estar
genéticamente vinculados al gen que influye en la enfermedad. Para
BRCA 1 ser útiles, los marcadores no codificantes tienen que estar cerca del gen
defectuoso para no separarse como resultado del sobrecruzamiento. El
marcador debe ser un alelo para el cual la población es polimórfica; es
decir, debe haber una variedad de genotipos posibles para ese locus. Los
investigadores buscan alelos que son más frecuentes en las personas
afectadas por la enfermedad de lo que cabría esperar por azar.
Por ejemplo, las mutaciones en los genes BRCA 1 y BRCA 2 indican
un mayor riesgo de cáncer de mama y cáncer de ovario en las mujeres
▲ Figura 5 Localización de los genes
y el propio gen contribuye a la aparición del cáncer. Estos genes se
BRCA 1 y BRCA 2 en los cromosomas
encuentran en el cromosoma 17 y el cromosoma 13 respectivamente.
Hay diferentes alelos de mutaciones de los genes BRCA. La figura 6
muestra la separación de proteínas mediante electroforesis. En este
caso, durante la síntesis de las proteínas se añadieron aminoácidos
marcados radiactivamente; los productos se separaron por electroforesis
y se fotografiaron usando una película sensible a la radiactividad. Las
flechas indican los diversos tipos de proteínas marcadoras producidas por
diferentes mutaciones del gen BRCA 1. La presencia de estas proteínas
marcadoras indicaría una predisposición al cáncer.
En el caso de las enfermedades que están ligadas a un solo gen, el marcador
tiene una mayor capacidad de predicción. En el caso de las enfermedades
▲ Figura 6 que están fuertemente influenciadas por el ambiente o son poligénicas, los
marcadores tienen una menor capacidad predictiva, aunque recientemente
se han realizado avances considerables en la determinación de las
probabilidades estadísticas de patrones de herencia más complejos.
Chips de ADN
Se pueden usar chips de ADN para comprobar
la predisposición genética o para diagnosticar
enfermedades.
Un chip o microarreglo de ADN es una pequeña superficie que tiene
adheridas una gran variedad de sondas de ADN. Los chips pueden
utilizarse para comprobar la expresión de un gran número de secuencias
de ADN simultáneamente.
La muestra que se comprueba es el ARNm expresado por una célula. Se
usa transcriptasa inversa para formar cADN a partir del ARNm. Durante la
síntesis se añaden colorantes fluorescentes al cADN. Se expone el chip a la
muestra de cADN durante un tiempo suficiente para que, si hay secuencias
complementarias, estas se puedan acoplar a las sondas fijas. Luego se
▲ Figura 7 Se introduce un cartucho con enjuaga el chip. A continuación, se expone el chip a una luz láser que
un chip de ADN en una máquina que se hace que las sondas fluorescentes emitan luz en aquellas regiones donde
usará para analizar los resultados de haya habido hibridación entre el cADN y las sondas de ADN. Cuanto más
esta prueba. brillante es la luz, mayor es el nivel de expresión génica en esa región.
34
1,28 cm A
A
A
T A
A
T C A T
A T C A A C A T A
T
1,28 cm T
C
C A A
A T T
T
C
T
A
G C
A
A A
T T
T
C A
C
A
A
T
T
C
A T C G
G
A T T C AG A T T C A
G
tamaño real del T
G
A
T
T
G
C
A
G AT
TC
T
G
C
A
A
T
T
G
GeneChip® G
T
G
GA T G
T G
G
ADN no híbrido
millones de cadenas ADN

en cada punto
6,5 millones de puntos en
cadena = 25 pares ADN híbrido
cada GeneChip®
de bases
▲ Figura 8
Interpretación de un chip
Análisis de un chip (microarray) simple
Como ejemplo, un experimentador puede tenga lugar la hibridación. Luego enjuagará el
usar un chip para evaluar el alcance y el nivel chip para eliminar el cADN no híbrido y expondrá
de expresión génica en una célula cancerosa. el chip a una luz fluorescente. La parte del chip
Extraerá el ARNm de las células de control y, a donde se observe luz verde indicará secuencias
partir de este, producirá cADN y lo marcará con que solo se expresan en el control. La parte del
un colorante fluorescente verde. Luego extraerá chip donde haya luz roja indicará secuencias que
el ARNm de las células cancerosas, producirá solo se expresan en las células cancerosas. La luz
cADN y lo marcará con un colorante rojo. A amarilla, que es una combinación de la luz verde
continuación, expondrá el chip a ambas muestras y roja, indicará las regiones donde ambos tipos de
durante un tiempo suficiente como para que células están expresando la secuencia.
1 Se colocan fragmentos del ADN en la 2 Se aísla el ARNm de las células.

lámina de vidrio para crear el chip.
normales cancerosas
3 Se usa el ARNm para producir cADN

estable y se marca con colorantes.
Amarillo: actividad igual en ambos 4 Se expone y se enjuaga el chip. Se

tipos de células ilumina con un láser y se identifican los
niveles de unión/expresión mediante la
Verde: mayor actividad genética detección de fluorescencia.
en las células normales
Rojo: mayor actividad genética
en las células cancerosas
▲ Figura 9
35
Experimentos de rastreo de trazas de proteínas

Los experimentos de rastreo de trazas se usan para
obtener información acerca de la localización e
interacción de la proteína deseada.
Las proteínas que circulan en la sangre pueden rastrearse si se les añaden
sondas radiactivas. Estos experimentos de rastreo pueden permitir a los
investigadores detectar los patrones de distribución y localización de las
proteínas, además de determinar cómo interactúan las proteínas con el
tejido objetivo.
Se pueden añadir átomos o moléculas radioactivas a las proteínas y
rastrear su distribución mediante tomografías por emisión de positrones.
Experimentos de rastreo con transferrina

Rastreo de células tumorales mediante transferrina ligada a sondas luminiscentes
La transferrina es una molécula que se une
el hierro y es absorbida más por las células
tumorales que por las células circundantes.
La figura 10 muestra una secuencia de
fotografías tomadas después de añadir colorantes
fluorescentes a las moléculas de transferrina. En
este experimento se estudia la endocitosis mediada
por receptores en las células de un linfoma. Al
inicio del experimento, la transferrina aparece
ligada a receptores en la superficie de las células.
Los puntos representan el colorante fluorescente.
La imagen inferior muestra que algunos de los
complejos formados por receptor y transferrina se
han introducido en las células. Una vez que han
entregado su carga de hierro, los complejos de
receptor y transferrina vuelven a la membrana de ▲ Figura 10
la superficie celular (arriba a la derecha).
Biopharming
En biopharming (obtención mediante transgenia,
generalmente de sustancias de interés farmacéutico), se
emplean plantas y animales modificados genéticamente
para producir proteínas con fines terapéuticos.
Hay tres categorías principales de proteínas utilizadas con fines
terapéuticos: los anticuerpos, las proteínas humanas y las proteínas
víricas o bacterianas (utilizadas en las vacunas).
Se ha logrado producir proteínas recombinantes humanas simples,
como la insulina y la hormona del crecimiento, con fines terapéuticos
en bacterias modificadas genéticamente. Sin embargo, es más difícil
36
producir proteínas terapéuticas más complejas en estos organismos vivos.

Los procariotas no realizan modificaciones necesarias, como la adición de
azúcares, después de la traducción. A veces solo las células de mamíferos
son capaces de realizar estas modificaciones.
La producción de estas proteínas en animales de granja transgénicos
resuelve el problema de las modificaciones posteriores a la traducción.
Algunas variedades domésticas de vacas, ovejas y cabras han sido criadas
selectivamente para producir grandes cantidades de leche. Las hembras
han sido tratadas genéticamente para segregar proteínas recombinantes
en su leche. La combinación de estos dos factores significa que un
pequeño rebaño de animales puede producir una cantidad relativamente
grande de proteínas terapéuticas.
Se han producido proteínas terapéuticas usando plantas enteras y cultivos
de células vegetales. En mayo de 2012, la administración de alimentos
y medicamentos de EE. UU. (FDA) aprobó el uso de la primera proteína
humana producida con plantas como terapia enzimática sustitutiva para
tratar los síntomas de la enfermedad de Gaucher en seres humanos.
Biopharming para producir ATryn

Uso de técnicas de biopharming para obtención de antitrombina
La deficiencia de antitrombina es una enfermedad secuencias
que conlleva el riesgo de coágulos de sangre reguladoras
específicas
durante el parto y la cirugía. ATryn es el nombre
de las
comercial de una forma de antitrombina que se glándulas gen de aislamiento de ovocitos
ha producido en las glándulas mamarias de cabras mamarias interés y eliminación del núcleo
modificadas genéticamente.
+
transferencia
Para lograr esta modificación genética, se del embrión
tiene que añadir el gen de interés y algunas reconstruido
secuencias adicionales específicas. Al crear la a la hembra
construcción genética es necesario añadir una receptora
secuencia promotora específica que garantice la
expresión del gen en la leche. Además, se tiene
que añadir una secuencia señal para garantizar vector de expresión fusión de la célula
que la proteína se produzca en los ribosomas de la proteína objetivo transgénica con el
verificación de
del retículo endoplasmático en lugar de los ovocito sin núcleo
transfección selección la presencia
ribosomas libres del citoplasma. Así se asegura de células de una célula del transgén
que la proteína antitrombina será segregada
por las células mamarias en lugar de liberarse
intracelularmente. ▲ Figura 11
Terapia génica
En terapia génica se pueden usar vectores virales.
Algunas enfermedades hereditarias son causadas por un gen defectuoso
que provoca la carencia de una enzima o proteína específica. La
fibrosis quística es una de estas enfermedades, causada por la carencia
de la proteína transmembrana de la fibrosis quística. Esta proteína
37
vector retroviral vector adenoviral normalmente extrae iones cloruro de las células y los
cápside envoltura transporta hasta la mucosidad. Los iones cloruro extraen
transcriptasa agua de las células y hacen que la mucosidad sea acuosa.
inversa Los pacientes con fibrosis quística sufren de mucosidad
genoma de ADN espesa que se acumula en las vías respiratorias.
genoma de ARN
La terapia génica puede ofrecer una cura para enfermedades
hereditarias como la fibrosis quística. En la terapia génica,
se insertan copias funcionales del gen defectuoso en el
membrana genoma de una persona. Para ello, se necesita un sistema
celular
de transmisión de genes o vector. La figura 12 muestra dos
formas diferentes de usar virus como vectores. Se modifica el
genoma viral de modo que las partículas no sean virulentas.
Después, se inserta el gen terapéutico en el virus.
proteína
terapéutica Los virus que tienen ADN bicatenario, como el adenovirus,
no pueden causar los problemas que sí causan los retrovirus
porque el ADN viral no se introduce en el genoma. Sin
ribosoma embargo, el gen terapéutico no se transmite a la siguiente
ARN/ADN
generación de células, así que el tratamiento tiene que
repetirse con más frecuencia. Uno de los retos de la
membrana utilización de virus como vectores es que el receptor puede
nuclear desarrollar inmunidad al virus.
ADN
Los tratamientos descritos arriba se conocen como terapias
gen poro
génicas somáticas porque las células que se modifican son
terapéutico nuclear somáticas (del cuerpo). Un método alternativo es inyectar
gen terapéutico
los genes terapéuticos en óvulos. Así, el gen que falta se
expresa en todas las células del organismo. Este método se
▲ Figura 12 Dos técnicas de terapia génica diferentes
denomina terapia génica germinal.
que usan vectores virales
Terapia génica para tratar SCID

Uso de vectores virales en el tratamiento de inmunodeficiencia combinada
grave (SCID)
La deficiencia de la enzima adenosina desaminasa ●● Extracción de linfocitos deficientes en ADA de
(ADA) produce la acumulación de desoxiadenosina pacientes con SCID
en las células, que es particularmente tóxica ●● Cultivo de los linfocitos in vitro
para los linfocitos T y B. La ausencia de células
inmunológicas funcionales causa el síndrome de ●● Infección de los linfocitos cultivados con
inmunodeficiencia combinada grave (SCID), que retrovirus modificados genéticamente que
se caracteriza por la incapacidad de combatir las contenían el gen de producción de ADA
infecciones más simples. La deficiencia de ADA funcional
fue la primera enfermedad tratada con éxito con ●● Transferencia de los linfocitos modificados al
terapia génica. paciente por transfusión
La terapia exitosa incluyó los siguientes pasos: En un paciente, el efecto duró cuatro años desde
el comienzo de la terapia génica.
38
B . 5 B i o i n f o r m á t i c a ( TANS )
B.5 Bioinformática (TANS)

➔➔ Las bases de datos facilitan a los científicos un
➔➔ Uso de tecnología de bloqueo de genes (gene
sencillo acceso a la información. knockout) en ratones para determinar la
➔➔ El cuerpo de los datos almacenados en las función del gen.
bases de datos aumenta exponencialmente. ➔➔ Descubrimiento de genes mediante
➔➔ Las búsquedas con software BLAST pueden prospección de datos EST.
identificar secuencias similares en organismos
diferentes.
➔➔ La función de los genes puede estudiarse usando Habilidades
organismos modelo con secuencias similares. ➔➔ Exploración del cromosoma 21 en bases de
➔➔ El software de alineamiento de secuencias permite datos (por ejemplo en Ensembl).
comparar secuencias de distintos organismos. ➔➔ Uso de software para alinear dos proteínas.
➔➔ El software BLASTn permite un alineamiento ➔➔ Uso de software para elaborar cladogramas
de secuencias de nucleótidos, mientras que y filogramas sencillos de organismos
el software BLASTp permite una alineación de relacionados usando secuencias de ADN.
proteínas.
➔➔ Se pueden realizar búsquedas en las bases
de datos para comparar secuencias recién Naturaleza de la ciencia
identificadas con secuencias que tienen
➔➔ Cooperación y colaboración entre grupos de
funciones conocidas en otros organismos.
científicos: las bases de datos en Internet
➔➔ El alineamiento de secuencias múltiples se usa facilitan a los científicos acceso libre a la
en estudios de filogenética. información.
➔➔ Un EST es un marcador de secuencia expresada
que se puede usar para identificar genes
potenciales.
El papel de las bases de datos en la investigación

genética
Las bases de datos facilitan a los científicos un sencillo
acceso a la información.
Una base de datos es un conjunto estructurado de información
almacenada en un computador. Puede incluir datos en una variedad
de formatos, incluidos artículos, imágenes, información cualitativa o
información cuantitativa.
Los tipos de bases de datos utilizadas en bioinformática incluyen:
●● Bases de datos de secuencias de nucleótidos, como EMBL
(Laboratorio Europeo de Biología Molecular).
●● Bases de datos de secuencias de proteínas, como SwissProt.
39
Bases de datos de estructuras tridimensionales, como PDB

Teoría del Conocimiento
●●
(Protein Data Bank).

¿En qué medida es necesario regular la ●● Bases de datos de chips, como ArrayExpress, que contienen
investigación científica? Si es necesario información sobre el nivel y el tipo de ARNm expresado en
regularla, ¿quién debe administrar los diferentes células.
reglamentos?
●● Bases de datos de rutas metabólicas que contienen información
En 1999, una persona murió como consecuencia sobre enzimas y reacciones y pueden usarse para crear modelos
de haber participado en un ensayo clínico de de rutas metabólicas. Un ejemplo es KEGG (Kyoto Encyclopedia
terapia génica. Padecía un trastorno metabólico of Gene and Genomes).
conocido como deficiencia de ornitina
transcarbamilasa, una enfermedad del hígado que Cada vez más, es posible comprobar hipótesis extrayendo
se caracteriza por la incapacidad de metabolizar el información de una base de datos, sin que el investigador tenga que
amoníaco. El amoníaco es un producto de desecho obtener los datos directamente por sí mismo.
del metabolismo de los aminoácidos. La persona Los investigadores pueden emplear bases de datos para una serie
en cuestión había sobrevivido hasta ese momento de tareas:
gracias a la medicación y a una modificación de
●● Añadir los resultados de sus investigaciones para que otros
su dieta. El ensayo clínico en el que participó
puedan verlos
comportaba inyectar adenovirus portadores del
gen para la transcarbamilasa. Murió pocos días ●● Extraer subgrupos de datos
después a consecuencia de una fuerte respuesta ●● Buscar datos específicos
inmunitaria al vector viral. Una investigación
concluyó que los científicos que llevaron a cabo el
ensayo habían violado varias normas de conducta.
Aumento de la información almacenada en
●● Otros cuatro pacientes que habían recibido
bases de datos
el tratamiento tuvieron reacciones El cuerpo de los datos almacenados en las bases de
consideradas tan fuertes que se debería
haber concluido el ensayo clínico.
datos aumenta exponencialmente.
Los avances tecnológicos han acelerado la creación y publicación
●● Los formularios de consentimiento
de datos. Los avances en las tecnologías de secuenciación del
informado no mencionaban que habían
genoma, los chips, los programas de creación de modelos en 3D
muerto primates en ensayos similares.
y la capacidad de los computadores han dado lugar a una serie
●● La persona en cuestión tenía niveles tan de proyectos de investigación colaborativa a gran escala que han
altos de amoníaco que se le debió haber aumentado exponencialmente los datos almacenados en bases
excluido del ensayo. de datos. Un informe de investigación acerca del aumento de la
●● Uno de los investigadores principales tenía información disponible en bases de datos bioinformáticas concluyó
un interés especial en los resultados del que la cantidad de datos que contienen se duplica cada 12-24 meses.
ensayo porque era titular de patentes sobre
el tratamiento de esta deficiencia.
Fuente: De Salle, R.; Yudell, M. Welcome to Problemas de acceso a la información
the Genome: A User’s Guide to the Genetic Past,
Present, and Future.
en bioinformática
1 Explica qué se entiende por consentimiento Cooperación y colaboración entre grupos de
informado. científicos: las bases de datos en Internet facilitan a
2 a) Sugiere qué reglamentos se podrían los científicos acceso libre a la información.
instaurar para evitar tales incidentes. La mayoría de la gente presupone que la actividad científica
b) ¿Quién debe administrar estos se caracteriza por la colaboración y la cooperación entre
reglamentos: los gobiernos, otros investigadores. La mayoría de las principales bases de datos
científicos o las instituciones de bioinformáticas son públicas y facilitan acceso libre a todos los
investigación? investigadores. A menudo, cuando se añade información a una
40
base de datos, inmediatamente se sincroniza con información de

otras bases de datos. Tal sincronización y acceso libre facilitan la
colaboración y el espíritu de cooperación.
Hay quienes sostienen que la comercialización de las bases de datos
bioinformáticas amenaza este espíritu de cooperación.
Algunos investigadores que trabajan en empresas privadas no
publican su información sobre secuencias porque necesitan
obtener beneficios. Algunas bases de datos que antes eran públicas
han pasado a manos de empresas con fines lucrativos que han
comenzado a cobrar por acceder a la información sobre secuencias;
dos ejemplos son las bases de datos de Saccharomyces cerevisiae
(levadura) y Caenorhabditis elegans (lombriz de tierra), dos de los
organismos eucarióticos modelo más estudiados. Este cambio fue
polémico porque parte de la información en dichas bases de datos
procedía de estudios publicados y comunicaciones personales.
La revista académica Science generó polémica en dos ocasiones
debido a los intereses enfrentados de la ciencia pública y privada.
En 2001, publicó la versión de la secuencia del genoma humano
de la empresa Celera, pero dejó que la empresa guardara la
secuencia en su propia base de datos. De nuevo, en 2002, publicó
una versión del genoma del arroz, pero dejó que la empresa
Syngenta guardara esta información en su propia base de datos
privada. Ambos artículos rompieron con la tradición de los
20 años anteriores de publicar la información en la base de datos
pública GenBank. También rompieron con una segunda tradición
de publicación aún más antigua: tradicionalmente, siempre
se había supuesto que todos los datos que fundamentaban los
artículos publicados eran públicos y, por tanto, de acceso libre para
la comunidad científica, para que al menos se pudiesen verificar
los resultados.
Bioinformática
Las búsquedas con software BLAST pueden identificar
secuencias similares en organismos diferentes.
Una vez que un investigador ha identificado una secuencia de interés
mediante la secuenciación de una proteína, la detección de un
marco abierto de lectura o el descubrimiento de altos niveles de un
determinado tipo de ARNm en una célula, el siguiente paso es realizar
una búsqueda con el software BLAST.
Este software identifica secuencias similares, comparando secuencias de
proteínas o de nucleótidos almacenadas en bases de datos y realizando
cálculos estadísticos para determinar coincidencias con otras secuencias.
Existen tres bases de datos principales de secuencias de nucleótidos:
GenBank, EMBL y DDJB. Dos de las bases de datos más importantes de
secuencias de proteínas son PIR International y SwissProt.
41
Búsquedas con BLASTn y BLASTp

El software BLASTn permite un alineamiento de
secuencias de nucleótidos, mientras que el software
BLASTp permite una alineación de proteínas.
Los investigadores pueden identificar marcos abiertos de lectura en las
secuencias de nucleótidos. Una vez que se identifica un marco abierto
de lectura, se puede realizar una búsqueda con BLASTn en bases de
datos de nucleótidos para identificar si existe un marco abierto de
lectura similar en otra especie.
Con BLASTp, se utilizan secuencias de
proteínas para buscar en una base de datos
de proteínas.
Con BLASTx, se utiliza la secuencia traducida
de un marco abierto de lectura para buscar
en una base de datos de proteínas.
Por otra parte, si un investigador ha
encontrado una proteína y quiere determinar
la localización de un gen, con tBLASTn puede
utilizar la secuencia traducida para buscar
en varios genomas los genes que se podrían
haber transcrito para producir la proteína.
La figura 1 muestra una búsqueda que
está a punto de realizarse con BLASTn.
Se ha introducido una secuencia de
▲ Figura 1 ADN mitocondrial humano para buscar
secuencias similares en el ADN de ratón.
Comparación de nuevas secuencias con otras

secuencias en bases de datos
Se pueden realizar búsquedas en las bases de datos para
comparar secuencias recién identificadas con secuencias
que tienen funciones conocidas en otros organismos.
Si un investigador tiene una secuencia cuya función se desconoce, puede
buscar en una base de datos para determinar si se ha identificado una
secuencia similar en otro organismo.
Si se trata de la secuencia de una proteína, puede realizar una búsqueda
con BLASTp. El resultado le permitirá determinar si existe una proteína
con una secuencia similar en otro organismo y cuál es su función.
Si se trata de la secuencia de un nucleótido, puede realizar una búsqueda
con BLASTn para determinar si existe una secuencia similar con una
función conocida en otro organismo, o bien una búsqueda con BLASTx
para ver si se ha identificado un producto génico con una secuencia
similar en otro organismo.
42
Ratones con genes bloqueados

Uso de tecnología de bloqueo de genes (gene knockout) en ratones para
determinar la función del gen
Un método para determinar la función de un La figura 2 muestra un ratón silvestre a la derecha
gen consiste en modificar genéticamente ratones y un ratón obeso (ob/ob) con el gen bloqueado a
para bloquear dicho gen. Esto implica sustituir la la izquierda. Esta es una de las pruebas de que la
secuencia funcional con una secuencia no funcional leptina desempeña una función en la regulación de
en células madre y luego fusionar las células madre la deposición de grasa y el metabolismo energético.
con un embrión. El ratón resultante se denomina
quimera. Las quimeras se cruzan con ratones
normales, y los heterocigotos se cruzan entre sí hasta
obtener un ratón de raza pura con el gen bloqueado.
La inactividad del gen a menudo conllevará un
cambio perceptible en el fenotipo del ratón; este
cambio permite a los investigadores determinar
cuál es la función probable del gen.
Se bloqueó el gen para la producción de la
hormona leptina mediante una mutación puntual. ▲ Figura 2
Organismos modelo
La función de los genes puede estudiarse usando
organismos modelo con secuencias similares.
Un organismo modelo es una especie que ha sido ampliamente estudiada
sobre la base de que los descubrimientos realizados en ese organismo modelo
se aplican también a otros organismos. Algunos de los organismos modelo
más estudiados son Caenorhabditis elegans (lombriz de tierra), Mus musculus
(ratón doméstico), Drosophila melanogaster (mosca de la fruta), Arabidopsis
thaliana (berro), Escherichia coli y Saccharomyces cerevisiae (levadura).
Se han secuenciado los genomas de estos organismos, al igual que el
genoma de los seres humanos. En toda la diversidad biológica, existen
algunas rutas metabólicas conservadas y algunas secuencias genéticas
conservadas. Los organismos modelo se pueden utilizar como modelos
vivos (in vivo) de enfermedades relacionadas con estas rutas conservadas,
o como modelos de enfermedades asociadas a mutaciones en las secuencias.
Este tipo de estudios podrían no ser viables o éticos con seres humanos.
Alineamiento de secuencias por computador

El software de alineamiento de secuencias permite
comparar secuencias de distintos organismos.
La existencia de secuencias similares entre organismos sugiere que
están relacionados evolutivamente. Cuanto mayor sea la similitud, más
cercana será la relación. Es posible comparar visualmente dos secuencias
relativamente cortas, pero la comparación de secuencias más largas o
secuencias múltiples requiere usar algoritmos informáticos.
43
Hay una serie de programas informáticos para alinear secuencias, como

ClustalW y MUSCLE. Cada vez más, es posible realizar alineamientos usando
interfaces en Internet. Por ejemplo, el sitio web de National Centre of
Biotechnology Information (NCBI) utiliza BLAST para alinear dos secuencias
y el sitio web de ClustalOmega permite alinear secuencias múltiples.
La figura 3 muestra secuencias de ADN de nueve organismos diferentes
alineadas con el programa ClustalX.
▲ Figura 3
Por defecto, las herramientas de alineamiento de secuencias a menudo

empiezan buscando relaciones globales a lo largo de toda la secuencia.
Sin embargo, si lo que interesa son las funciones, dos proteínas podrían
tener algunas partes comunes que estén estrechamente vinculadas a
una función común y otras partes con pocas coincidencias o ninguna.
Por esta razón, las herramientas de alineamiento ofrecen la opción de
realizar un alineamiento local o global.
Uso de BLAST para alinear dos proteínas

Uso de software para alinear
dos proteínas
Hay una serie de aplicaciones de
software para alinear dos secuencias
de proteínas. Las siguientes
instrucciones son para el uso de
la herramienta de alineamiento
de secuencias BLAST disponible
en el sitio web de NCBI (http://
www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/).
En este ejemplo, vamos a realizar un
alineamiento de secuencias utilizando
la proteína citocromo oxidasa (cox1)
de dos especies de primates llamados
tarseros. El tarsero de Horsfield
(clasificado como Cephalopachus ▲ Figura 4 Tarsero de Horsfield ▲ Figura 5 Tarsero de Filipinas
bancanus o Tarsius bancanus) es una
especie amenazada que habita en Borneo y una cierta incertidumbre sobre la clasificación del
Sumatra. Se comparará la secuencia del gen cox1 tarsero de Horsfield; para resolver esta clase de
de este tarsero con la secuencia del mismo gen incertidumbres, a menudo se utiliza este tipo de
del tarsero de Filipinas (Tarsius syrichta). Existe comparación de secuencias.
44
En el sitio web de NCBI,

selecciona Protein en el
menú desplegable y escribe
“cox1 tarsius” en el campo
de búsqueda.
En la siguiente pantalla,
haz clic en FASTA para ver la
secuencia de la proteína.
Como alternativa, copia los
dos números de orden:
NP_148740.1 y
YP_002929466.1.
Ve a la página de inicio de
BLAST (http://blast.ncbi.
nlm.nih.gov/Blast.cgi)
y haz clic en protein blast.
En la sección Enter
Query Sequence, marca
la casilla Align two or
more sequences,
copia los números de
orden y haz clic en
el botón BLAST.
Desplázate hacia abajo

para ver las diferencias
entre las secuencias
de esta proteína en las
dos especies.
▲ Figura 6 Uso de BLAST para alinear dos proteínas
45
Alineamiento de secuencias múltiples

El alineamiento de secuencias múltiples se usa en
estudios de filogenética.
La filogenia es la historia evolutiva de una especie o un grupo de
especies. Un árbol filogenético es un diagrama que describe la filogenia.
Cuando se comparan secuencias múltiples, a menudo se identifica una
secuencia consenso basada en el aminoácido o el nucleótido que aparece
con más frecuencia en una posición determinada en las secuencias
alineadas. Por ejemplo, si se alinean seis secuencias y los nucleótidos
de la posición 10 son G, A, G, G, C y G, la secuencia consenso para la
posición 10 en este caso será G.
Las semejanzas entre las secuencias pueden deberse a relaciones
evolutivas reales, en cuyo caso se dice que son homólogas. Por su parte,
las secuencias que son iguales por casualidad se llaman análogas.
La mayoría de las secuencias homólogas tienen muchas posiciones en las
cuales se han producido mutaciones varias veces. Sin embargo, no todas
las mutaciones tienen el mismo efecto: una mutación en una región de
codificación que produce un cambio en la secuencia de aminoácidos
es menos probable que se propague en una población. La probabilidad
de una coincidencia por casualidad es mayor en las secuencias de ADN
que en las secuencias de proteínas. No obstante, se han desarrollado
algoritmos informáticos que pueden sugerir relaciones evolutivas a partir
de secuencias alineadas.
Elaboración de cladogramas y filogramas usando aplicaciones

informáticas
Uso de software para elaborar cladogramas y filogramas sencillos de organismos
relacionados usando secuencias de ADN
Un cladograma es un árbol filogenético que se 1 Ve al sitio web de NCBI y selecciona Gene en
crea usando los métodos cladísticos explicados en el menú desplegable.
el subtema 5.4. Este tipo de árbol solo muestra un
2 Escribe “cox1 primate” en el campo de
patrón de ramificación, y la longitud de las ramas
búsqueda.
no representa el tiempo o la cantidad relativa
de cambios que se producen a lo largo de ellas. 3 Elige las especies que quieres incluir en el árbol.
Un filograma es un árbol filogenético con ramas 4 En la sección Genomic regions, transcripts
cuyas longitudes son proporcionales a la cantidad and products, haz clic en FASTA.
de cambios que se producen en los caracteres
(véase la figura 8). Selecciona toda la secuencia de ADN, incluido el
título (por ejemplo: > gi|196123578:5667-7670
La siguiente actividad está basada en una Homo sapiens neanderthalensis).
actividad desarrollada por el Museo de Historia
Natural de EE. UU. Requiere usar dos tipos de 5 Abre el Bloc de notas en tu PC o TextEdit en
software, ClustalX y PhyloWin, para alinear las un Mac.
secuencias del gen de la citocromo oxidasa de 6 Pega la secuencia en el Bloc de notas o TextEdit.
varias especies de primates.
46
▲ Figura 7 Captura de pantalla de una imagen generada en PhyloWin
7 Repite los pasos anteriores con otras 17 En la sección TREE BUILDING, marca la
secuencias de diferentes organismos. casilla MAX.PARSIMONY. Hay una serie
de posibilidades por las que las secuencias
8 Edita los títulos, pero recuerda incluir el
han llegado a ser como son. Por ejemplo, una
símbolo “ >” y separar las palabras del
citosina pudo haber cambiado a timina, después
título con un guión bajo. Por ejemplo:
otra vez a citosina y otra vez a timina, pero la
>Homo_sapiens_neanderthalensis.
máxima parsimonia presupone que solamente
9 Cuando termines el documento, hay un hubo un cambio de citosina a timina. Esto
paso adicional si utilizas un Mac. En el significa que el árbol creado representa el menor
menú Formato, selecciona Convertir en número de cambios evolutivos. La figura 8 es
texto normal. un árbol filogenético posible que muestra la
10 Guarda el documento con el nombre siguiente: relación evolutiva de los nueve primates.
secuencias.fasta.
11 Abre el software ClustalX.
12 En el menú File, selecciona Load sequences.
13 Busca el documento “secuencias.fasta” y ábrelo.
14 Una vez que se hayan cargado las secuencias,
selecciona Do complete alignment en el
menú Alignment. Toma nota de donde se
guarda el archivo “secuencias.fasta.aln” creado.
15 Abre PhyloWin.
16 Busca el archivo “secuencias.fasta.aln” y ábrelo. ▲ Figura 8 Un filograma
Marcadores de secuencias expresadas

Un EST es un marcador de secuencia expresada que se
puede usar para identificar genes potenciales.
Si un gen está expresado, el ARNm transcrito a partir de ese gen estará
en el interior de la célula. Así, puede utilizarse el ARNm para buscar el
gen que lo produce usando marcadores de secuencias expresadas (EST).
Los científicos usan el ARNm conjuntamente con la enzima
transcriptasa inversa para producir cADN; este cADN no tiene intrones.
Los científicos usan el cADN para sintetizar marcadores de secuencias
47
expresadas: secuencias cortas de ADN, de 200 a 500 nucleótidos de

Uso de EST para longitud, que se generan desde el extremo 5′ y desde el extremo 3′.
El extremo 5′ tiende a tener una secuencia conservada en distintas
localizar genes especies y en familias de genes. El extremo 3′ es más probable que sea
Descubrimiento de genes exclusivo de ese gen.
mediante prospección de La localización del gen dentro del genoma se puede identificar después
mediante técnicas de mapeo físico o buscando en bases de datos de
datos de EST EST conocidos.
Por su utilidad y por la facilidad
con que se generan, se ha creado
una gran cantidad de EST. Las Exploración del cromosoma 21
secuencias de estos EST han sido
almacenadas en una base de
Exploración del cromosoma 21 en las bases de datos
datos específica, llamada bdEST. (por ejemplo en Ensembl)
Esta base de datos contiene El proyecto Ensembl recopila información del genoma de
EST de más de 300 organismos. 75 organismos y permite explorar detalladamente las secuencias
Cuando los científicos tienen un codificantes y no codificantes de cada uno de los cromosomas de
EST, pueden realizar búsquedas estos organismos.
con BLAST para determinar si
coincide con una secuencia de El cromosoma 21 es el cromosoma humano más corto, y es quizás más
ADN de un gen conocido con conocido por el síndrome de Down o trisomía 21.
una función conocida.
Actividad
Para ver la información disponible acerca del
cromosoma 21, visita el sitio web de la base de
datos en línea Ensembl (www.ensembl.org).
La primera columna muestra la posición del
centrómero como “acrocéntrico”, que significa
que no está en el medio.
1 Haz clic en una barra roja para ver con
detalle esa región de codificación.
2 Haz clic en tres regiones de codificación
de proteínas para determinar el gen que
codifican.
La búsqueda se puede delimitar viendo las
regiones de codificación de proteínas para
determinar qué genes tienen un locus en el
cromosoma.
Visualmente, se aprecia que en este caso se
han descubierto muchas más secuencias
codificantes por unidad de longitud en el brazo “q”
(el brazo más largo).
48
P REGUNTAS
Preguntas
1 El vertido de aguas residuales en aguas marinas c) En el caso de un vertido accidental de
es una práctica común, pero puede contaminar aguas residuales, sugiere, aportando
el agua con patógenos. Se realizaron una una razón, cuál de los dos microbios
serie de experimentos para comparar las tasas puede ser más útil como indicador
de inactivación de dos grupos diferentes de fecal dos días después del vertido. [1]
microbios con distintas exposiciones a la luz
solar. Un grupo eran bacterias coliformes fecales
y el otro eran virus colifagos. Los experimentos 2 Las aguas residuales de las fábricas de fibras de
se realizaron al aire libre usando 300 litros de poliéster contienen altas concentraciones del
una mezcla de aguas residuales y agua marina compuesto químico tereftalato de polietileno
en tanques abiertos por arriba. (PET). Es posible eliminar este compuesto
usando ciertas bacterias. El gráfico siguiente
Se realizó un experimento de dos días añadiendo muestra la relación entre la descomposición de
aguas residuales no tratadas a agua marina. tereftalato y su conversión en metano por parte
Ambos días fueron soleados sin nubes. La de estas bacterias en un reactor experimental.
figura siguiente muestra la inactivación de los
microbios en el agua marina en función de la 4 100
cantidad acumulada de luz solar y del tiempo. concentración de tereftalato
Se han trazado las curvas de supervivencia de producción de metano 80
los dos microbios en relación con la exposición 3
a la luz solar (eje x inferior) durante el día y en concentración/mg dm-3
relación con el tiempo durante la noche (eje 60
metano/ml
x superior). El eje y representa el número de 2
bacterias y virus por cada 100 ml. 40
horas después de añadir aguas residuales no tratadas 1

0 5 10 15 20 25 30 20
105
número de bacterias y virus/100 ml-1
Día 1 Día 2
0 0
4 8 12 16 20
104
tiempo/días
Fuente: Wu, J. H.; Liu, W. T.; Tseng, I. C.; Cheng, S. S. “Characterization
103
of microbial consortia in a terephthalate-degrading anaerobic
granular sludge system”. Microbiology. 2001. Vol. 147, p. 373–382.
102 © Society for General Microbiology. Reproducido con autorización.
10 a) El reactor tiene un volumen de

noche 12 litros. Calcula la cantidad inicial de
<1 tereftalato en el reactor. [1]
5 10 15 20 25 30 35
b) Describe la relación entre la
cantidad acumulada de luz solar/MJ m-2
concentración de tereftalato y la
virus colifagos producción de metano. [2]
bacterias coliformes fecales c) Sugiere qué bacterias pueden utilizarse
Fuente: adaptación de Sinton, L. W. et al. Applied and Environmental para degradar el tereftalato. [1]
Microbiology. 1999. Vol. 65, n.º 8, p. 3605–3613. d) Evalúa la eficiencia de la descomposición
a) Identifica el momento en el que el de tereftalato en metano. [2]
número de bacterias coliformes fecales
cae por debajo de 1 unidad por 100 ml. [1]
b) Deduce, basándote en los datos del
gráfico, el efecto de la luz solar en:
(i) Bacterias coliformes fecales [2]
(ii) Virus colifagos [2]
49
3 Se ha estudiado ampliamente la evolución de a) Indica cuántos años hace que la

las moléculas de hemoglobina comparando las hemoglobina se dividió en las cadenas
secuencias de aminoácidos de la hemoglobina α y β.[1]
y la mioglobina. La mioglobina se utiliza b) Estima el número de duplicaciones génicas
para almacenar oxígeno, mientras que la que ha habido desde la globina simple. [1]
hemoglobina se utiliza para transportar
c) Usando la figura B, compara la relación
oxígeno. Los animales prehistóricos tenían
filogenética de la mioglobina con la
una sola cadena de globina simple para
hemoglobina de los vertebrados y de los
almacenar y transportar oxígeno. Hace unos
invertebrados.[1]
500 millones años, se produjo una duplicación
génica: una copia se convirtió en la mioglobina d) Sugiere una razón de que la hemoglobina
existente hoy en día y la otra evolucionó hasta tenga una función diferente en las plantas y
convertirse en una proteína transportadora de en los animales. [1]
oxígeno que dio origen a la hemoglobina actual. e) Explica por qué los cambios observados
en la secuencia de aminoácidos pueden
Las siguientes figuras son los árboles filogenéticos
hacernos subestimar el número real de
de la hemoglobina en diferentes organismos.
mutaciones.[2]
Figura A Nota: cada área sombreada de los cromosomas siguientes representa un gen.
cromosoma 22 cromosoma 16 cromosoma 11
Mo ζ ψζ ψα1 α2 α1 ε γα γA ψz β
0 primates mamíferos
superiores
millones de años atrás
200 mamíferos
cadenas α cadenas β
400 peces óseos mioglobina
lampreas hemoglobina
600
800 globina simple

1000
Fuente: adaptación de Mathews, C. K. et al. Biochemistry. 2000. 3ª ed. Benjamin Cummings. P. 241.
Figura B
Taxón Proteína Función Inducido por
vertebrado hemoglobina transporte de O2 bajo O2
vertebrado mioglobina almacenamiento de O2
invertebrado hemoglobina transporte de O2 bajo O2?

planta hemoglobina almacenamiento de O2 bajo O2?
protista hemoglobina transferencia de luz (alga)

electrones
bacteria hemoglobina transferencia de bajo O2
electrones
cianobacteria ficocianina captura de luz luz
Fuente: Hardison, R. American Scientist. 1999. 87, p. 126–137.
50

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agricultura sin arado

Marcos abiertos de lectura

Identificación de marcos abiertos de lectura

Preguntas basadas en datos: Identificación de un marco abierto de lectura

Teoría del Conocimiento Identificación de genes objetivo

B.3 Protección ambiental

Métodos utilizados para solucionar incidentes de

biorremediación puede no ser recomendable porque es necesario

Los microorganismos tienen propiedades que los

La biorremediación depende del metabolismo de

La bacteria Geobacter sulfurreducens usa el uranio como aceptador de

Los microorganismos pueden formar ▲ Figura 3

El aumento de la resistencia a los antibióticos, la señalización entre los

Las biopelículas resisten a los agentes

concentración alta de moléculas

Uso de virus para matar bacterias en sistemas

Biorremediación en condiciones salinas

Biorremediación de vertidos de petróleo

Biorremediación del metilmercurio

Uso de biopelículas en lechos con filtros de goteo

Informes de los medios sobre biopelículas

Actividad ●● La formación de biopelículas en equipamientos

Los microscopios de exploración láser han mejorado nuestros

B.4 Medicina (TANS)

Innovaciones en las técnicas de diagnóstico

Altos niveles de metabolitos pueden indicar

Enfermedad Ruta metabólica que no funciona Metabolito que se detecta

Indicadores de infección por un patógeno

▲ Figura 2 Producción de microalgas como

Los microorganismos pueden formar ▲ Figura 3

Búsquedas con BLASTn y BLASTp

▲ Figura 6 Uso de BLAST para alinear dos proteínas

Elaboración de cladogramas y filogramas usando aplicaciones

▲ Figura 7 Captura de pantalla de una imagen generada en PhyloWin

expresadas: secuencias cortas de ADN, de 200 a 500 nucleótidos de