Sei sulla pagina 1di 10

UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA

ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA


CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

INFORME DE PRCTICA # 1
EXTRACCION DE ADN DE TEJIDOS VEGETALES Y ANIMALES

David Arturo Lpez Nio Cd.: 74084457. Ana Mile Robayo. Cod:. Patricia Bautista. Laura
Martnez. Cod: 1030649608
Universidad Nacional Abierta y a Distancia. Escuela de Ciencias Bsicas, Tecnologa e
Ingeniera - ECBTI. Reacciones qumica Naturales.
.

OBJETIVOS
Aplicar la teora en el proceso de extraccin de ADN de tejidos animal y vegetal y
en la determinacin de la calidad del mismo.

Observar experimentalmente la estabilidad del ADN con la temperatura y


relacionarla con los procesos biolgicos y sintticos que se han desarrollado.

Comprender las aplicaciones y el impacto que el desarrollo del ADN ha tenido para
el desarrollo de la vida e investigacin.

MARCO TEORICO

xxxxxxxxxxxxxxx

PROCEDIMIENTO

EXTRACCION DE ADN

CARACTERIZACION DE ADN
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

BAO DE MARIA

HCL

REACTIVO BIURET

ANALISIS

Extraccin de ADN de tejidos


vegetales y animales

Al tomar muestras de 5cm3 de tejidos


vegetales (cebolla y banano) y animales
(Hgado), y licuarlo en intervalos intermitentes
se busca realizar una homogenizacin del
tejido consistente en romper la uniones
ayudando a liberar el material gentico

Con el fin de precipitar el ADN se adiciona


Etanol permitiendo que se unan los grupos Para nuestra prctica se logros observar un
fosfatos, permitiendo que el ADN se pliegue anillo violenta en la fase superior para las
sobre si mismos hacindolo insoluble. El muestras de hgado y banano siendo positivo
paso sobre la centrifugacin permite que el la presencia pptidos y protenas.
ADN, permanezca en el fondo en el tubo
DESNATURALIZACIN
mientras que el etanol es desechado ya sea
por evaporacin. La desnaturalizacin la pudimos observar
cuando pusimos los ADN a un cambio de
Caracterizacin del ADN
temperatura en el bao de mara. La
Reaccin de Biuret con el ADN desnaturalizacin sucede cuando la protena
pierdes las estructuras de orden superior
La reaccin de Biuret es una reaccin (secundaria, terciaria y cuaternaria),
coloreada (violeta) debida a la formacin de quedando la cadena polipeptdica reducida a
un complejo de Cu en un medio alcalino en un polmero estadstico sin ninguna
compuestos que poseen ms de un enlace estructura tridimensional fija. Producida por
peptdico, como las protenas un agente fsico como es el calor.

PREGUNTAS Y EJERCICIOS

1. Por qu se emplea detergente accin del detergente mediante un


lquido para lavar loza en la solucin dibujo
buffer carbonatada?, explique la
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

Para provocar una lisis celular o rompimiento permanezcan intactos y mantengan la


que implica la inactivacin de las nucleasas mayora de las propiedades bioqumicas
celulares y la separacin de los cidos originales, lo cual depende en gran parte del
nucleicos de los restos de clula. Es posible tiempo de licuado ya que si no es suficiente
romper la membrana celular e inactivar las no se rompen las membranas celulares, pero
nucleasas intracelulares al mismo tiempo si se realiza durante un tiempo prolongado,
utilizando soluciones que contengan se daan estas pequeas vesculas y se
detergentes que solubilicen las membranas rompe el ADN5. Los mtodos fsicos ms
celulares y sales caotrpicas fuertes que utilizados son el choque osmtico,
inactiven las enzimas intracelulares. En el ultrasonidos y homogenizacin (trituracin
caso de este laboratorio se utiliz una mecnica), que en nuestro caso fue la
solucin buffer carbonatada, que se prepar utilizacin de la licuadora.
disolviendo 0.75 gramos de NaCl, 2.5 gramos
de NaHCO3 y 1 mL de detergente lquido de 3. Por qu se sugiere un mayor tiempo
lavar la loza en 60 mL de agua destilada (pH de licuado para la cebolla que para el
8). Tras la lisis celular y la inactivacin de las hgado?, Explquelo estructuralmente.
nucleasas, los restos de clulas se eliminan Tanto la clula vegetal como la animal
fcilmente por filtracin o precipitacin poseen membrana celular, pero la clula
vegetal cuenta, adems, con una pared
celular de celulosa, que le da rigidez. La
clula vegetal presenta esta pared que est
formada por celulosa rgida, en cambio la
clula animal no la posee, slo tiene la
membrana citoplasmtica que la separa del
Figura 2. Accin del detergente medio6 , por esta razn el licuado debe ser
ms prolongado con los tejidos vegetales, ya
que se requiere romper dicha pared celular.

4. Por qu el etanol precipita el ADN?

El etanol limpia el ADN de otras biomolculas


por un proceso llamado "precipitacin", en el
Figura 3. Ruptura de la membrana celular y extraccin cual el etanol hace que el ADN se deshidrate,
del ADN es decir, pierda contacto con las molculas
de agua que lo rodean, aislndolo de la
2. Para qu licua los tejidos y que
solucin acuosa para dejarlo libre de
sucede si los licua por mucho tiempo?
impurezas, esto sucede debido a la atraccin
Para romper la mayora de las membranas elctrica entre los grupos fosfato y los iones
celulares (membrana plasmtica y positivos presentes en la solucin se vuelven
membranas del retculo endoplasmtico) en lo suficientemente fuertes como para formar
fragmentos que se cierran inmediatamente enlaces inicos estables y por tanto la
formando vesculas pequeas, cerradas. El precipitacin del ADN.
objetivo es realizar el procedimiento
5. Qu tan puro se obtiene el ADN en esta
cuidadosamente de tal forma que los
prctica?, explique qu impurezas puede
orgnulos que se liberan del interior celular
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

tener y que procedimiento podra seguir para tales como cuantificacin de productos de
obtenerlo ms puro. ADN implicados y deteccin de molculas de
ADN en preparaciones que contienen
De acuerdo a las pruebas de caracterizacin drogas..
el ADN obtenido fue de buena calidad porque
no se detectaron protenas que son una de 7. Por qu el tubo que contiene el ADN
las principales impurezas que se, pueden tratado con calor se ve translcido, mientras
encontrar sin embargo la cantidad de ADN es que el tubo que contiene la clara de huevo se
muy bajo. Por ello para mejorar tanto la ve blanco?
cantidad como la calidad del ADN extrado se
puede lograr con modificaciones en: En el tubo con clara de huevo se observa la
desnaturalizacin de protenas, ya que al
Tcnicas de homogenizacin de las encontrarse la albmina en agua, cuando es
muestras sometida al calor se torna opaca y blanca,
Temperaturas formando una masa slida. As, en el tubo
Cantidad de muestra que contiene el ADN, debido a la ausencia de
Tiempo de centrifugacin. protena, que finalmente era lo que se
comprobaba, el tubo se observa translucido
6. Qu mtodos podra emplear para porque aun cuando el ADN se desnaturaliza
cuantificar el ADN obtenido? Nombre por lo este no contena protenas
menos dos y explique su fundamento.
8. Qu diferencias observ entre el tubo que
Espectrofotomtrica de absorcin UV: contiene el ADN tratado con 1 ml de HCL
debido a que los nucletidos poseen 0.1M y el tubo que contiene la clara de
mximos de absorcin alrededor de 260 nm. huevo? explique a que se deben estas
El mtodo requiere pureza de la muestra, sin diferencias.
contaminacin significativa de protenas o
solventes orgnicos que absorben a El tubo con clara de huevo adquiere un color
longitudes de onda cercanas. La desventaja blanco, en forma de un gran granulo, debido
est en que se generan interferencias por a la desnaturalizacin que sufre la protena
contaminantes o en la inhabilidad para albumina. Nuevamente se comprueba que en
distinguir entre ADN y ARN y la insensibilidad el tubo que contiene ADN no hay protena por
relativa del ensayo. la coloracin que mantuvo la solucin.

El ensayo Quant-It PicoGreen dsDNA, un 9. Qu diferencias observo entre el ADN y la


colorante ultra-sensible, para teir cidos clara de huevo al reaccionar con el reactivo
nucleicos y cuantificar DNA de doble cadena de Biuret?, Desde el punto de vista qumico,
en solucin. La deteccin y cuantificacin de a qu se debe esta diferencia?
pequeas cantidades de DNA es El Reactivo de Biuret detecta la presencia de
extremadamente importante en una amplia protenas, pptidos cortos y otros
variedad de aplicaciones biolgicas. Aquellas compuestos con enlaces peptdicos con el
incluye tcnicas de biologa molecular cambio de coloracin a violeta o coloracin
estndar, tales como sntesis de ADNc (ADN rosada cuando hay polipptidos de cadena
copia), para la produccin de libreras y
corta, por ello la solucin del tubo de ensayo
purificacin de fragmentos de ADN para sub- que contiene la clara de huevo se torn
clonaje, as como tcnicas de diagnstico violeta mientras que la del tubo de ensayo
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

con el extracto de ADN se mantuvo de tono Existen varias forma de provocar una lisis en
azul. la membrana celular de las clulas
eucariotas, en forma mecnica o en forma
Se usa normalmente como un mtodo qumica y cuyo objetivo es exponer los
colorimtrico que permite determinar la contenidos del ncleo en los que se
concentracin de protenas de una muestra encuentran lo cidos nucleicos.
mediante espectroscopia ultravioleta-visible a
una longitud de onda de 560 nm (Para La temperatura y el pH son factores
detectar el ion Cu2+). fundamentales a tener en cuenta al aislar el
ADN ya que al someterlo al pH muy bajos y
Est hecho de hidrxido potsico (KOH) y altas temperaturas se provoca una
sulfato cprico (CuSO4), junto con tartrato de desnaturalizacin o rompimiento de los
sodio y potasio (KNaC4H4O6*4H2O). El enlaces entre los nucletidos.
reactivo, de color azul, cambia a violeta en
presencia de protenas, y vira a rosa cuando La reaccin de Biuret es un procedimiento
se combina con poli pptidos de cadena utilizado para evaluar la concentracin de
corta. El hidrxido de potasio no participa en protenas y se facilita gracias a los enlaces
la reaccin, pero proporciona el medio peptdicos que se producen con la misma
alcalino necesario para que tenga lugar. frecuencia por cada aminocido en el
pptido.

CONCLUSIONES

A pesar de que el ADN se encuentra en todas


las clulas de los seres vivos, un correcto
proceso de extraccin consiste en separar
suavemente el ADN de sustancias no
deseadas que se encuentran en las clulas,
evitando que el ADN se desnaturalice o se
rompa y es considerado el primer paso para
muchos procedimientos que estn
relacionados con la biologa y la bioqumica.
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

INFORME DE PRCTICA # 2

EFECTO HIPERCROMICO

David Arturo Lpez Nio COD: 74084457, xxxxxx

Universidad Nacional Abierta y a Distancia. Escuela de Ciencias Bsicas, Tecnologa e Ingeniera -


ECBTI. Reacciones qumica Naturales.

OBJETIVOS

Observar el comportamiento del ADN con la temperatura y relacionar el mismo con la


estabilidad.
Relacionar la estabilidad del ADN directamente con la variacin en la temperatura.

Mediante la prctica observar el comportamiento del ADN con la temperatura.

Lograr relacionar de manera dinmica y prctica el desarrollo de la practica con los conceptos
asimilados en procesos biolgicos y sintticos.

MARCO TEORICO

xxxxxx

ANALISIS Y RESULTADOS

PREGUNTAS Y EJERCICIOS 2. Cmo es el comportamiento del


ADN con el calor? Explquelo
1. Qu le sucede al ADN cuando se mediante una grfica
calienta?
La grafica muestra el estado nativo de color
Cuando se calienta al ADN de doble hebra se azul y rosado en forma de doble hebra,
rompen las fuerzas los puentes de hidrogeno seguidamente por accin del calor se obtiene
que mantienen apareadas a las bases las hebras separadas.
nitrogenadas y por ende unidas las hebras,
por tanto el ADN esta desnaturalizado, similar La desnaturalizacin trmica del ADN, se
resultado se da cuando la disoluciones de puede observar experimentalmente por
ADN es sometido a pH cido o alcalino, cuyo absorcin de luz ultravioleta debido a que las
resultado es la prdida de viscosidad, bases nitrogenadas absorben luz de longitud
aumento de la absorbancia a 280 nm y de la de onda cercana a 280 nm y a medida que se
alteracin de las interacciones hidrofbicas. calienta el ADN y las cadenas se separan,
aumenta la cantidad de luz absorbida, es
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

efecto se conoce como hipercromicidad. Un desnaturalizacin, pero muestran una mayor


par de bases G-C tiene tres puentes de estabilidad frente a la variacin de la
hidrgeno, mientras que un par A-T slo tiene temperatura. La temperatura de fusin de una
dos. Cuanto mayor sea el porcentaje de cadena de ARN a pH=7 difiere en ms de 20
pares de bases G-C, ms alta ser la con respecto a las de ADN, siendo
temperatura de fusin de la molcula de ADN intermedias las de los dplex de ADNARN

La estabilidad de la doble hlice del ADN, y


por consiguiente su Tm, dependen de varios
factores, como por ejemplo, la naturaleza del
solvente, las identidades y las
concentraciones de los iones en solucin y el
pH. El Tm tambin aumenta de manera lineal
con la fraccin molar de los apareamientos
de bases G-C, aunque esto no se debe,
como podra esperarse exclusivamente a que
los apareamientos G-C contienen un enlace
Figura 2. Curva de desnaturalizacin del ADN
de hidrgeno ms que los apareamientos A-T
3. A qu hace referencia la
4. Prediga el impacto que tendran las
temperatura de fusin del ADN?
siguientes condiciones sobre la
La temperatura de fusin (Tm) se define temperatura de fusin de una
como la temperatura a la que se ha muestra de ADN nativo
desnaturalizado la mitad del ADN de la
Buffer pH 13 permitira alcanzar la tm
muestra que estamos calentando. Por tanto,
con mayor velocidad
cuanto mayor es la densidad del ADN, mayor
es su contenido en G-C y mayor es su Agua destilada por la fuerza inica
temperatura de fusin (Tm). No todas las reducida, se produce la separacin de
molculas de ADN experimentan el fenmeno las hebras que se debe a que la fuerte
de la desnaturalizacin de igual manera repulsin entre las cargas negativas
de los grupos fosfato no es
La temperatura de fusin del ADN, en la
contrarrestada por los
mayora de las especies, vara linealmente
correspondientes contraiones (Na+ ,
entre 70-100, cuando la proporcin de G-C
Mg+2).
sobre el total de nucletidos aumenta entre el
20%-80%. La explicacin a este SDS 10% tanto los puentes de
comportamiento se encuentra en la mayor hidrgeno como las interacciones
estabilidad de las uniones G-C con tres hidrofbicas cooperan para formar
puentes de hidrgeno, frente a las de A-T que una estructura estable. Si se reduce o
poseen dos. De ello se deduce que las elimina cualquiera de estas
regiones en la cadena de ADN, ricas en interacciones, la estabilidad disminuye
pares A-T, son las primeras en y la Tm es menor
desnaturalizarse.
5. A qu se debe la diferencia en
Las dobles cadenas de ARN o hbridas ADN- absorcin a 280 nm de las
ARN experimentan el fenmeno de la muestras de ADN tratadas?
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

La diferencia en los niveles de absorcin de la solucin a temperatura


absorbancia de luz ultravioleta por parte ambiente
del ADN se debe a las bases
nitrogenadas. La absorcin aumenta 7. Qu impacto tiene el
cerca del 40% al desnaturalizarse como descubrimiento del
consecuencia de la desestabilizacin de comportamiento del ADN con la
las interacciones electrnicas, para el temperatura en el desarrollo de la
caso por exceso de temperatura, lo cual investigacin en el campo de la
indica que es un fenmeno cooperativo gentica?
en el que el colapso de una parte de la El estudio de dicho comportamiento ha
estructura desestabiliza al resto.
permitido ampliar las aplicaciones frente a La
manipulacin y uso del ADN en diversas
aplicaciones relacionadas con la reaccin en
cadena de la polimerasa (PCR) que permite
amplificar ms de un milln de veces un ADN
obtenido a partir de una regin seleccionada
del genoma, siempre y cuando se conozca
una parte de su secuencia de nucletidos.
Para la PCR se utilizan dos oligonucletidos
sintticos de unos 15-20 nucletidos, estos
oligonucletidos actan como cebadores para
la sntesis in vitro de ADN la cual est
6. En qu muestra se debe presentar habitualmente catalizada por una enzima
la mayor absorcin a 280 nm y por llamada Taq polimerasa, enzima a que en
qu? altas temperaturas es capaz de mantener una
media de extensin de ms de 60 nucletidos
El menor grado de absorcin se produce en
por segundo en regiones ricas en uniones G-
estado de doble hlice, pero cuando se
C.
produce la desnaturalizacin pasando a
estado de hlice sencilla (efecto Esta tcnica se utiliza en aplicaciones como
hipercrmico) que implica aumento de la la medicina forense el estudio de material
absorbancia. Este proceso de bilgico.
desnaturalizacin es hasta cierto punto
reversible, para el caso de la CONCLUSIONES
desnaturalizacin por temperatura el efecto
Existe una relacin muy estrecha entre la
se revierte dejando que la solucin se enfre
temperatura y la absorbancia en el ADN,
a temperatura ambiente, sin embargo este
presentndose una mayor absorbancia al
efecto reversible se perturba si el
trabajar a una mayor temperatura, en este
enfriamiento se lleva a cabo por un choque
caso 90C, en la cual se desnaturaliza el
termino. Los resultados de la tabla 2 permiten
ADN rompindose la doble hlice.
observar que la absorcin UV de la solucin
del tubo enfriado en bao de hielo es mayor BIBLIOGRAFIA
que la del tubo que se enfra a temperatura
ambiente y como era de esperarse la 1. M. Somma. Anlisis de la Presencia
absorcin de ambos es mayor que la de Organismos Genticamente
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

Modificados en Muestras de PDF. C Consultado el 30 Octubre


Alimentos Sesin n 4: Extraccin y 2017. Disponible en
Purificacin de ADN. Consultado el 30 http://ibcmunq.files.wordpress.com/20
Octubre 2017. Disponible en 10/03/tp5.pdf Universidad tcnica de
http://gmocrl.jrc.ec.europa.eu/capacity Loja.
building/manuals/Manual%20ES/Sesi
%C3%B3n4.pdf 3. Cuantificacin de muestras de ADN
mediante el kit Quant. Consultado el
2. Cuantificacin de ADN y electroforesis 30 Octubre 2017.. Disponible en
en gel de agarosa. Universidad http://www.slideshare.net/andrec392/c
nacional de Quilmes. Introduccin a la uantificacion-demuestras-de-dna-
Biologa Celular y Molecular. Formato mediante-el-kit-quant.
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA
ZONA CENTRO BOGOT CUNDINAMARCA
CEAD JOS ACEVEDO y GMEZ

Potrebbero piacerti anche