Fitomejoramiento Molecular

Quines participan?
AlianzaGlobalparalaCienciadelArroz(GRiSP,porsusiglaen
ingls)CentroInternacionaldeAgriculturaTropical(CIAT),
InstitutodeInvestigacinparaelDesarrollo(IRD)yelInstituto

deInvestigacinAgrcolaparaelDesarrollo(CiradFrancia)

Objetivo
Desarrollarydifundirnuevasmetodologasdemejoramientoparaacelerarlagananciagentica
delosprogramasdemejoramientoanivelglobal.

Resumen de resultados obtenidos

ConbaseenlassecuenciascompletasdecientosdelneasdelprogramadefitomejoramientodelCIAT,se
identificaron marcadores moleculares tipo SNP (sigla de Single nucleotide polymorphisms) para el
desarrollodeungrupodemarcadorestilesenlacaracterizacindeladiversidadgenticadentrodecada
subespeciedearroz(ndicayjapnica).
Sedesarrollaronvariaspoblacionessegregantesconelfindemapeargenes/QTLasociadosacaracteres
de inters tales como la resistencia a virus de hoja blanca (RVHB) (Romero et al. 2014), tolerancia a
Burkholderiaglumae(Mosqueraetal.,enproceso),potencialderendimientoyotrascaractersticas,para
serposteriormenteutilizadosenlosprogramasdemejoramientoporseleccinasistidapormarcadores
(SAM). Aprovechando el desequilibrio de ligamiento ancestral en arroz, se realiz un mapeo por
asociacinenungrupodelneasdearrozopaneldediversidad,paracaractersticasdearquitecturade
pancula, potencial de rendimiento y RVHB. Estos estudios lograron la identificacin de marcadores
molecularesrelevantesparalosprogramasdemejoramiento(Rebolledoetal.,yCruzetal.,nopublicado).
El clonaje de genes de inters ha permitido identificar SNP funcionales para ser usados en SAM. En
asociacinconungrupojapons,elCIAThacontribuidoalaidentificacindeunmarcadorasociadoauna
caractersticaradiculardeseableparaconferirresistenciaalestrshdrico(Ugaetal.,2013).Elclonajedel
gen de esterilidad macho (gen usado en los programas de seleccin recurrente), fue realizado para
facilitar la identificacin de plantas estriles dentro de una poblacin por SAM y as poder acelerar la
conversindelaslneasextradasdelapoblacin(Frouinetal.,2014).Paralosesquemasdeintrogresin
degenesdeintersvaretrocruces,senecesitabuscarmarcadoresdiagnsticosdelgen/QTLpresenteen
elparentaldonante,comotambinmarcadoresdiagnsticoparalarecuperacindelgenomadelparental
recurrente.Deestamanera,apartirdelainformacindelasecuenciadelgenoma,unaherramientapara
ladeteccindelosSNPfuedesarrolladapermitiendoidentificargruposdemarcadoresrelevantespara
diferentescruzamientos(Duitamaetal.,2014).
Estudiossobrelacaracterizacindeloscontrolesgenticosparacaractersticasdeintersenarrozhan
permitidoidentificarmarcadoresmolecularesparafacilitarlasetapasdeseleccinconelfinde:
1. Identificarlneasparentalesconlosgenes/QTLfavorables
2. Enriquecercongenesdeinterspoblacionessegregantesengeneracionestempranasdentrode
programasdeavancerpidodegeneracin.
3. Facilitaryacelerarlaintrogresindecaracteresdeintersenlneaselitefaltandotalcarcter.


PosterioralosestudiosdegenticayconlasherramientasmolecularesdisponiblesenCIAT,serealizla
identificacindeprogenitoresyeficienteintrogresindegenesparaRVHB,pyriculariaycalidaddegrano
(amilosa).

Recientementeseinicilaseleccingenmicaenpoblacionesdeseleccinrecurrenteconelfindepoder
predecirelvalorenmejoramientodelaslneasenlasgeneracionestempranas(Grenieretal.,2015).Este
mtododeSAMnorequiereconocimientopreviodeloscontrolesgenticosdeloscaracteresdeinters
ypermiteconsiderarmodelosgenticoscomplejos,comodominancia,epistasiseinteraccingenotipo
porambientedentrodelprogramadefitomejoramiento.

Prximos pasos
La caracterizacin de la diversidad gentica de las colecciones de
Foto:CIAT

trabajodearrozesunaetapaimportanteparaidentificarparentales
con alto potencial, estudiar la evolucin allica dentro de los
materiales de mejoramiento y constituir grupos heterticos en el
casodepoblacionesdedicadasaldesarrollodehbridos.
Elaumentodelossitiosdeevaluacindelgermoplasmadedicadoal
mapeo gentico es siempre deseable para estimar mejor las
interacciones genotipo por ambiente e identificar marcadores
asociados a la caracterstica de inters. Luego de la deteccin de marcadores, una etapa importante
consiste en validar dichos marcadores para ser utilizados de manera rutinaria en los programas de
fitomejoramiento. Una vez validados, los marcadores con asociaciones significativas a caracteres de
interssernreportadosenbasesdedatosyutilizadoscomomarcadoresdiagnsticoenlaplataformade
SNP,yasfacilitarelpremejoramiento,vaidentificacindeparentalesyusodeSAMenlosesquemasde
cruzamiento.
El desarrollo y fenotipificacin de poblaciones de calibracin para estudios de seleccin genmica en
mltiplesambientespermitirdesarrollarmodelosdeprediccinparaunavariedaddecaractersticasy
deambientes.Poblacionesdeseleccinrecurrente,coleccionesdetrabajoogruposheterticosparael
desarrollodehbridossonmaterialesparaloscualeslaseleccingenmicatienemuchousopotencial.

Informacin de contacto
CcileGrenier,PhD,FitomejoradoraGenetistadeArrozCirad/CIATcecile.grenier@cgiar.org
MathiasLorieux,PhD,GenetistadeArrozIRD/CIATm.lorieux@cgiar.org
FernandoCorrea,PhD,LderdelProgramadeArrozCIATf.correa@cgiar.org
JorgeDuitama,PhD,BioinformticoCIATj.duitama@cgiar.org