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UNIVERSIDAD DE CIENCIAS MDICAS

VILLA CLARA

FACULTAD DE MEDICINA

Guas de Clase Taller, Prcticas de Laboratorio y Seminarios

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BSICAS FISIOLGICAS.

BASES BIOLGICAS DE LA MEDICINA

BIOLOGA MOLECULAR.

CURSO 2016-2017

1
Autores: Colectivo Profesores de Bioqumica Clnica.

ndice

Clases Taller Pgina

Clase Taller 1 Precursores de Macromolculas4


Clase Taller 2 Protenas....8
Clase Taller 3 cidos Nucleicos.....17
Clase Taller 4 Lpidos.......27
Clase Taller 5 Cintica Enzimtica....33
Clase Taller 6 Reg. Act. Enzimtica..39
Clase Taller 7 Replica. Transcripc. ADN..44
Clase Taller 8 Traduccin y Reg. Exp. Gentica54
Clase Taller 9 Papel de los Recept. en la Comunicacin..63

Prcticas de Laboratorio
Clase Prctica 170
Clase Prctica 274

Seminarios
Seminario 1..79
Seminario 2..84
Seminario 3..86
Seminario 4..88
Seminario 5..90
Seminario 6..93
Seminario 7..95
Seminario 8..97

LEYENDA:
Practica Laboratorio 1: Identificacin de macromolculas
Practica Laboratorio 2: Determinacin de indicadores cinticos de la actividad
enzimtica de la alfa amilasa salival.

Seminario 1: Significado de los aminocidos en la estructura y propiedades de las


protenas
Seminario 2: Los cidos Nucleicos. Estructura y funcin.
Seminario 3: Membranas biolgicas.
Seminario 4: Cintica Enzimtica.
Seminario 5: Regulacin de la actividad enzimtica.
Seminario 6: Replicacin, Transcripcin y Reparacin del ADN.
2
Seminario 7: Cdigo Gentico, Traduccin y Regulacin de la expresin de la
informacin gentica.
Seminario 8: Papel de los receptores en la comunicacin intercelular.

GUAS DIDCTICAS CLASES TALLER

3
CLASE TALLER 1

TEMA II: BIOMOLCULAS.

Titulo: LO CONSTANTE Y LO VARIABLE EN LOS PRECURSORES DE LAS


MACROMOLCULAS. FUNCIONES.

OBJETIVOS.

1. Comparar las estructuras constantes y variables en los precursores de


macromolculas.

2. Clasificar los diferentes precursores atendiendo a las fuentes de variacin de


los precursores de macromolculas.

3. Justificar la presencia de diferentes especies inicas de un aminocido segn el


pH del medio.

4. Describir las caractersticas estructurales y las propiedades de los enlaces que


se forman en la polimerizacin de los precursores de macromolculas.

5. Justificar el principio de multiplicidad de utilizacin.

SUMARIO:

1. LO CONSTANTE Y LO VARIABLE EN LOS PRECURSORES DE


MACROMOLCULAS.

2. CLASIFICACIN ATENDIENDO A LA FUENTES DE VARIACIN DE LOS


PRECURSORES DE

MACROMOLCULAS.

3. PROPIEDADES ELCTRICAS DE LOS AMINOCIDOS.

4. FORMACIN DE LOS ENLACES POLIMERIZANTES.

5. FUNCIONES DE LOS PRECURSORES DE MACROMOLCULAS.

PREGUNTAS

1. De las frmulas que se te presentan a continuacin:

a) Seala y nombra las agrupaciones funcionales presentes en cada caso.

b) Identifica el tipo de precursor.

4
c) Seale las estructuras constante y variable.

d) Menciona qu tipo de enlace se establece entre los precursores de cada grupo.

Represntalos.

Figura I

Figura II

5
Figura III

El docente puede al finalizar realizar un resumen parcial donde concluya con los
aspectos ms importantes de los contenidos tratados.

En un segundo momento el docente orientar a partir de los precursores


propuestos en la pregunta anterior, que clasifique los mismos y que profundicen
en las interacciones dbiles que se pueden formar entre los precursores.
Proponemos que se desarrolle en conjunto con todos los grupos la pregunta
siguiente:

Menciona las interacciones que pueden establecerse entre las cadenas laterales
de los siguientes grupos de aminocidos.

a) histidina / cido asprtico.

b) serina / tirosina.

c) valina / leucina.

d) arginina / treonina.

e) leucina / alanina.

Revise el Captulo 6 de Bioqumica Mdica de Cardell pgina 98, incluyendo el


valor del pK para cada uno de los grupos ionizables en la estructura de los
aminocidos.

1. Cul ser la especie inica predominante de la alanina a un valor de pH de


8,5? Escriba la estructura de la especie, seale su carga neta y prediga su
comportamiento electrofortico.

2. Cul ser la especie inica predominante de la histidina a un valor de pH de


7,2? Escriba la estructura de la especie, seale su carga neta y prediga su
comportamiento electrofortico.
6
3. Cul ser la especie inica predominante del cido glutmico a un valor de pH
6,0? Escriba la estructura de la especie, seale su carga neta y prediga su
comportamiento electrofortico.

Otras preguntas:

Por qu los aminocidos presentan propiedades elctricas?

Qu es el punto isoelctrico de un aminocido?

Calcule el punto isoelctrico de la fenilalanina si usted sabe que su pK 1 = 1.83 y


su pK 2 = 9,13?

Si se realiza una electroforesis a una mezcla de aminocidos hipotticos A (PI=


3,00), B (PI = 6,00) y C (PI = 9,00) utilizando un medio de pH = 6,00. Cul ser el
comportamiento electrofortico de cada aminocido y por qu? Asuma que todos
los aminocidos tienen similar peso molecular.

Qu nombre recibe la tcnica que permite la separacin de los aminocidos que


forman parte de una mezcla de ellos? En que se fundamenta la misma?

BIBLIOGRAFA:

1. Bioqumica Mdica, Cardell y autores Tomo I, Cap. 5Estructura y Funcin de


las Biomolculas: Enlaces qumicos, interacciones dbiles, agrupaciones o
grupos funcionales en las biomolculas, Isomera.

2. Bioqumica Mdica, Cardell y autores Tomo I, Cap. 6 Aminocidos

3. Bioqumica Mdica, Cardell y autores Tomo I, Cap. 7 Monosacridos

4. Bioqumica Mdica, Cardell y autores Tomo I, Cap.8 Nucletidos

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CLASE TALLER 2

TEMA II: BIOMOLCULAS.

Titulo: Estructura, propiedades y funciones de los lpidos de membrana y TAG.

Sumario:
Concepto de Lpidos. Clasificacin.
Estructura y funcin de los diferentes tipos de lpidos.
Contenido:
Estructura general de los cidos grasos. Clasificacin. Triacilglicridos. Estructura
general. Funciones. Fosftidos de Glicerina. Estructura general. Funciones.
Esfingolpidos. Estructura general. Funciones. Lpidos anfipticos: Relacin
estructura funcin. Colesterol. Estructura general. Funciones.
Introduccin: Los lpidos son un grupo de compuestos complejos que no son
considerados como macromolculas. Son compuestos de gran importancia
mdica debido a la gran cantidad de funciones que cumplen y adems de que
estn relacionados con fenmenos como la obesidad y la arteriosclerosis.

Objetivo 1
. Analizar la complejidad y diversidad estructural de los lpidos.

1. Analice la estructura de los compuestos representados arriba. Existe alguna


semejanza estructural entre ellos? Qu tipo de propiedad comparten todos los
lipidos en mayor o menor grado?

8
Objetivo 2

Interpretar la influencia que ejercen sobre los lpidos complejos, el tipo de cido
graso presente en los mismos.
2. Analice cuidadosamente la estructura de los siguientes cidos grasos.
Clasifquelos en relacin a su grado de instauracin.
a) Despus de leer cuidadosamente la pgina 222 del Tomo I del Texto
Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell, clasifique los cidos grasos B y C
segn la serie omega ()

A. B.

C.

3. Analice las consecuencias que para la orientacin espacial de la cadena


hidrocarbonada del cido graso representado en B, tiene la presencia de dobles
enlaces en configuracin Cis. Teniendo en cuenta lo anterior y el acpite
propiedades fsicas de los cidos grasos en la pg. 226 del Tomo I del Texto
Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell, responda la siguiente pregunta.
c) La mantequilla, la grasa animal (mantecas) y el aceite de oliva, tienen diferente
consistencia a temperatura ambiente. La solidez de la primera a temperatura
ambiente es relativamente ligera mientras que las mantecas son ms solidas y los
aceites son lquidos bajo las mismas condiciones. Analice la composicin de los
cidos grasos en los compuestos A, B y C e identifique en cada uno de ellos la
manteca, aceite de oliva y la mantequilla.

9
A B C
Nota: Para una mejor comprensin de esta pregunta remtase al captulo 5 Tomo I
del mencionado texto especficamente lo relacionado con isomera geomtrica,
pg. 74
Objetivo 3
. Identificar los cidos grasos insaturados de mayor importancia biolgica.
4. Lea el prrafo 5 de la pg. 227, cap. 13 Tomo I del texto Cardell y responda
cules se consideran cidos grasos esenciales.
5. Realice un cuadro resumen en el que se reflejen el nombre trivial, nmero de
tomos de carbono, nmero de doble enlaces y ubicacin del primer doble enlace
a partir del carbono omega de cada uno de los a. g. insaturados ms abundantes
en el organismo.
6. Lea detalladamente el acpite eicosanoides pgs. 1032-4. Cap. 59 del Tomo III
del texto Cardella y cols. Responda las preguntas 3, 4, 5 y 6 del acpite Ejercicios
pagina 238 Tomo I del Texto Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell.
Objetivo 4
Interpretar la relacin entre estructura y funcin en los casos de los
triacilglicridos.
7. Lea detenidamente el acpite relacionado con los acilgliceroles en la pgina 228
del Texto de Bioqumica Mdica.

10
a) Responda la pregunta 7 pg. 238 Tomo I del texto Bioqumica Mdica de
Cardell y Col.
b) Basado en la estructura y propiedades de estos compuestos diga por qu no
pueden formar parte de las membranas biolgicas.
Objetivo 5

. Interpretar la relacin estructura-funcin en el caso de los lpidos anfipticos.


8. Compare la estructura de los fosftidos de glicerina (fosfoglicridos) con la de
los triacilgliceroles o triacilglicridos y establezca semejanzas y diferencias
estructurales.
9. Analice cuidadosamente la estructura de los fosftidos de glicerina en las pgs.
230-31 del Tomo I del Texto Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell y
complete los espacios en blanco en el siguiente cuadro.

Fosftido de Elemento Elemento Regin Regin


Glicerina estructural estructural hidrofbica hidroflica
constante variable
Fosfatidilserina

Glicerol +2 Etanolamina
cidos grasos
+grupo
fosfato.
Fosfatidilinositol Glicerol +2
cidos grasos
Grupo fosfato
+ alcohol
colina.

11
10. Analice el modelo espacial de fosfatidil-serina representado a continuacin.

a) Complete los espacios en blanco en relacin a la fosfatidil serina.


. El acido graso insaturado es ____
. El acido graso saturado es ____
. La regin hidrofbica comprende ____ y ____
. La regin hidroflica (fosfo-alcohol) es ____
11. Responda las preguntas 11 y 12 del acpite Ejercicios pagina 238 Tomo I del
Texto Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell.
12. Analice cuidadosamente la estructura de los Esfingolpidos en las pgs. 232-
33 del Tomo I del Texto Bioqumica Mdica de la autora Lidia Cardell y
complete los espacios en blanco en el siguiente cuadro.
Tipo de Elemento Elemento Regin Regin
Esfingolpido estructural estructural hidrofbica hidroflica
constante variable
Galactocerebrsido Ceramida Galactosa
(esfingosina
+acido
graso).
Grupo Ceramida Grupo fosfato
fosfato + +
etanolamina. etanolamina.
Ganglisido Ceramida Oligosacrido.
(esfingosina
+acido
graso).

12
13. Responda la pregunta 15 de la pgina 239 del Texto Bioqumica Mdica de la
autora Lidia Cardell y colaboradores.

14. Analice y compare las estructuras del colesterol y un ster de colesterol en la


conferencia en relacin a los lpidos. Puede este ltimo formar parte de las
membranas biolgicas? Justifique.

15. Responda la pregunta 16 de la pgina 239 del Texto Bioqumica Mdica de la


autora Lidia Cardell y colaboradores.

PREGUNTAS DE AUTOEVALUACIN:

16. La saponificacin es el proceso que produce jabones a partir de la reaccin de


determinados lpidos con bases fuertes. Los lpidos saponificables contienen
cidos grasos de cadena larga esterificados a un ncleo que puede ser glicerol
o esfingosina.

a) Basado en sus conocimientos sobre la estructura de los lpidos, establezca


cual de los siguientes lpidos no son considerados como saponificables.

__ cido Araquidnico

__Triacilglicridos

__Esfingomielina

__ Ester de colesterol

__ Vitamina D

__ Fosfatidilcolina.

__Colesterol.

17. En relacin al compuesto representado a continuacin, responda las


siguientes preguntas.

CH3-CH2-CH=CH-CH2-CH=CH-CH2-CH=CH-CH2-(CH2)6-COOH

a) Identifquelo y justifique brevemente.

b) Clasifquelo en relacin a la serie omega.

c) Clasifique este compuesto segn el grado de insaturaciones. .

d) Explique basado en la estructura de este compuesto como el mismo puede


influenciar en la fluidez de compuestos ms complejos en los cuales se encuentra
presente.
13
18. Analice la estructura del siguiente compuesto y responda:

a) Que clase de lpido es el compuesto anterior.

b) Lea la pgina 229 del Texto Cardell y cols. Tomo I y diga cuales son las
principales funciones de este tipo de lpidos.

c) Analice otra vez la estructura de este lpido y diga por qu no puede formar
parte de los lpidos de membrana.

19. Analice la estructura que mostramos a continuacin:

a) Clasifique al cido araquidnico en relacin al carbn omega.

b) Como se denomina al cido araquidnico y sus derivados representados en el


esquema a continuacin?

14
c) Mencione alguna de las funciones realizadas por los compuestos derivados del
cido araquidnico.

d) Los leucotrienos entre otros efectos provoca constriccin de las vas areas as
como edema (inflamacin) de las mismas, dos fenmenos comunes en la crisis de
asma. Por qu la aspirina y otros antiinflamatorios como el ibuprofeno, eliminan
la fiebre y la inflamacin pero no tienen efecto en la crisis de asma aguda?
Explique brevemente.

20. Las enzimas fosfolipasas (FLpasas) son compuestos muy comunes en los
venenos de muchas serpientes. Estas enzimas pertenecen a un amplio grupo que
catalizan la ruptura de enlaces covalentes introduciendo una molcula de agua en
los mismos. En el caso especifico de la fosfolipasa-D, rompe el enlace covalente
entre el grupo fosfato y el amino alcohol en la estructura de los fosftidos de
glicerina.

a) En el caso especifico de la Fosfatidilcolina, establezca los productos finales de


la ruptura hidroltica realizada por la fosfolipasa D. b) Basado en la estructura de
la Fosfatidilcolina, diga cul es la funcin mas importante que realiza este
compuesto y explique brevemente su respuesta.

En relacin con los compuestos representados a continuacin, responda:

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a) Basado en su estructura, clasifique los compuestos anteriores y justifique
su respuesta.

b) Cul de ellos se desempeara como lpido estructural de membranas?


Justifique.

c) Qu importancia biolgica tienen los compuestos como los anteriores?

BIBLIOGRAFIA: Bioqumica Mdica Cardell y Colaboradores. Tomo I. Cap. 13.

16
CLASE TALLER 3
TEMA II
Biomolculas

Titulo: Protenas

Sumario
Los niveles estructurales y funciones de las protenas.
El carcter informacional.
Desnaturalizacin y renaturalizacin.
Objetivo 1:

Aplicar el principio de organizacin de la macromolculas al estudio de las


protenas
El principio de organizacin de las macromolculas se manifiesta a travs de
caractersticas generales, que se encuentran en el libro de texto Bioqumica
Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 9, pginas de la 128 a la 130 y de la 135 a la
137. Estas caractersticas son:

Elevado peso molecular.

Carcter polimrico.

Carcter uniforme.

Carcter lineal.

Carcter tridimensional. Este aspecto comprende los llamados


niveles de organizacin de las macromolculas

Carcter informacional.

Relacin estructura funcin.

Tendencia a la agregacin.

Tarea No.1
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. La hidrlisis de una glicoprotena produce aminocidos y monosacridos.
Contradice este resultado el carcter uniforme de las macromolculas?
Explica tu respuesta.

17
2. Qu significa que las protenas tienen carcter:
Polimrico.
Uniforme.
Lineal.
Tridimensional.
Informacional
3. Cules son los tipos de informacin molecular?
4. A cul de los niveles estructurales de las macromolculas est
vinculado cada uno?
5. En qu consiste el fenmeno de reconocimiento molecular?
Las protenas participan en casi todos los procesos que ocurren en las clulas y se
forman por la unin de los aminocidos mediante enlace peptdico. Con respecto a
las mismas:
Resume estos contenidos de la siguiente forma:
Concepto de protena: est determinado por los elementos montonos presentes
en su estructura. Diferencia los conceptos de pptido y protena. Esto aparece en
el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I captulo 12, pgina 195.
Clasificacin, determinada por los elementos diversos. Esto aparece en el libro de
texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 12, pginas 198 y 199.
Funciones que desempean en la clula. Esto aparece en el libro de texto
Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 12, pgina 197. Como
observaste, cumplen con el principio de multiplicidad de utilizacin
Tarea No.2
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Qu es una protena?
2. A que tipo de biomolculas pertenecen las protenas?
3. Cules caractersticas de ls protenas pueden anticiparse dada la
anterior relacin de pertenencia?
4. Explique (utilice ejemplos) las diferentes funciones que pueden llevar a
cabo las protenas

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5. Ser aplicable al caso de las protenas el principio de multiplicidad de
utilizacin?
Objetivo 2
Explicar la organizacin por niveles de las protenas y las propiedades que de
ellas se derivan
En esta macromolcula se ponen de manifiesto los cuatro niveles de organizacin
estructural mencionados al estudiar las caractersticas generales de las
macromolculas. Este contenido se encuentra en el libro de texto Bioqumica
Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 12, en las
pginas de la 199 a la 207 y la 211.
Resume este contenido de la siguiente forma:
Estructura primaria: concepto, importancia y fuerza que la mantiene. Ten en
cuenta que est mantenida por el enlace peptdico, que por ser covalente le
confiere estabilidad.
Estructura secundaria: concepto, tipos, fuerza que las mantienen.
Ten en cuenta que los diferentes tipos de estructura secundaria son mantenidos
por una sola fuerza, puentes de hidrgeno, que le brinda estabilidad a pesar de
ser una interaccin dbil.
Estructura terciaria: concepto, fuerzas que la mantiene y ejemplos de protenas.
Este nivel de organizacin determina la estructura tridimensional de la protena.
Est mantenido por varias interacciones dbiles y en ocasiones por el puente
disulfuro que es un enlace covalente.
Estructura cuaternaria: concepto, fuerzas que la mantienen y ejemplos de
protenas.
Te dars cuenta de que la estructura tridimensional de las protenas est
determinada por la secuencia de aminocidos y es lo suficientemente fuerte como
para ser estable y a la vez flexible, lo que le permite interactuar con estructuras
tridimensionales especficas, esta es una manifestacin del fenmeno de
reconocimiento molecular.
Lea todo el contenido orientado, incluyendo las figuras, sin tratar de retener ningn
elemento, solo para tener una idea general, en una segunda lectura vaya
precisando los siguientes aspectos:

19
Tarea No.3
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. A qu llamamos estructura primaria
2. Qu diferencia existe entre composicin aminoacdica y secuencia de
aminocidos?
3. Cul de estos aspectos es determinante en la estructura primaria?
4. Cmo se logra la estabilidad de esta estructura?
5. Cules son las conclusiones generales que se derivan del estudio de las
estructura?
6. A que llamamos estructura secundaria?
7. Cules son las fuerzas que la mantienen?
8. Cules son los requisitos para las estructuras secundarias formulados por
Pauling y Corey?
9. Describa la estructura en hoja plegada
10. Describa la estructura en alfa hlice
11. A qu llamamos estructura terciaria?
12. Cules son las fuerzas que la mantienen?
13. Cules son las generalizaciones derivadas del estudio de la estructura
terciaria de varias protenas?
14. A qu llamamos estructura cuaternaria?
15. Cules son las fuerzas que las mantienen?
16. Qu factor es determinante en las unin de las subunidades?
17.El siguiente esquema representa un sector de una cadena polipeptidica.
Considerando las posibles interacciones entre los AA, deduzca que AAS
pueden ser: Q, X, Y, Z

20
18, Cmo es la estructura cuaternaria de la hemoglobina?
Objetivo 3

Explicar el significado biolgico de la relacin estructura funcin


La relacin conformacin-transconformacin expresa la posibilidad de cambios
estructurales ajustndose a las caractersticas particulares del entorno, los que
pueden ser favorables o desfavorables y son la base molecular de muchos
mecanismos de regulacin. Para el estudio de este contenido resume lo siguiente:

Desnaturalizacin de las protenas: concepto y agentes desnaturalizantes. Esto


lo puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I,
captulo 12, pgina 211.

Tarea No.4
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Una protena globular constituida por una sola cadena polipeptdica se someti
a 100 C en una solucin de HCL 10 N, que contiene agentes reductores, durante
24 horas. De este modo se rompieron en la macromolcula las interacciones
dbiles y los enlaces covalentes.

a) Mencione los niveles estructurales que se afectaron en la protena

b) Explique cmo se afect el carcter informacional de la protena

c) Despus de finalizado el proceso, explique si es posible obtener de nuevo la


conformacin nativa de la protena

2, Explique la importancia de la coccin de los alimentos para el proceso digestivo.

Objetivo 4
Explicar las aplicaciones clnicas de la electroforesis de protenas

21
Un importante proceso de gran utilidad en el laboratorio clnico para la separacin
de protenas es la electroforesis, de la misma:

Resume lo siguiente:

Concepto.

Principios del mtodo.

Importancia para el diagnstico mdico.

Esto lo puedes encontrar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo


I, captulo 12, pginas 214 y 215.

Tarea No.5
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Por qu las protenas presentan carga elctrica?

2. Cules factores deben tenerse en cuenta para predecir el comportamiento


de una protena en un campo elctrico?

3. Como influye el valor del punto isoelctrico de una protena y el pH del


medio de disolucin en el comportamiento de una protena sometida a un
campo elctrico?

Ejercicios de Autoevaluacin

En todos los casos justifique su respuesta

1- Cul de las siguientes interacciones es la que ms contribuye al


plegamiento de las protenas?

El enlace peptdico.

Los puentes de hidrgeno.

Interacciones salinas.

Interacciones hidrofbicas

22
2.- Cul de las siguientes interacciones es la ms fuerte en la estructura
terciaria de las protenas?

Puentes de hidrgeno.

Enlace disulfuro.

Interacciones salinas.

Interacciones hidrofbicas

3.- En ocasiones el cambio de una aminocido por otro en la estructura


primaria de una protena determina la prdida de su funcin. Con cul de
las caractersticas generales de las macromolculas relaciona usted este
hecho?

Carcter uniforme.

Relacin entre la estructura y la funcin.

Carcter polimrico.

Carcter tridimensional

4.- Cul de los niveles estructurales de las protenas se mantiene gracias a


interacciones entre los grupos qumicos de las cadenas laterales de los
aminocidos?

Estructura primaria.

Estructura secundaria.

Estructura supersecundarias.

Estructura terciaria

5.- Cul de los fenmenos estudiados con relacin a las protenas


proporciona una evidencia ms firme acerca de la relacin entre la
estructura tridimensional y la funcin?

La hidrlisis. La dilisis.

La desnaturalizacin. La electroforesis.

23
6.- Cul es la fuerza fundamental que mantiene la estructura secundaria de
las protenas?

El enlace peptdico.

El enlace disulfuro.

Puentes de hidrgeno entre enlaces peptdicos.

Interacciones hidrofbicas

7.- Cul es el mecanismo que permite la expresin de la informacin


conformacional?

Reconocimiento molecular.

Relacin estructura y funcin.

Renaturalizacin de protenas.

Interacciones dbiles.

8.- Cul de las siguientes caractersticas NO se corresponde con un sitio de


reconocimiento molecular?

Posee una conformacin tridimensional complementaria a la de su ligando.

Presenta grupos que permiten interacciones especficas con grupos del


ligando.

Est ubicado profundamente en la estructura de la macromolcula.

Tienen grupos que incrementan la fortaleza de las interacciones dbiles

muy difcil el acceso del ligando y eso sera un obstculo pra la realizacin del
mecanismo de reconocimiento molecular

9.- Cul de los niveles estructurales de las protenas se mantiene por el


enlace peptdico?

Estructura primaria. Estructura secundaria.

Estructura terciaria. Estructura cuaternaria


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10.- Cul de los niveles estructurales de las protenas se mantienen por la
formacin de puentes de hidrgeno entre los elementos del enlace
peptdico?

Estructura primaria.

Estructura secundaria.

Estructura terciaria.

Estructura cuaternaria

11- Al analizar dos muestras de protenas, una aislada de hgado de pollo y otra
aislada de hgado de pavo, se comprueba que ambas tienen la misma
composicin de aminocidos.

Podemos concluir que ambas protenas son idnticas? Explica.

12-La hemoglobina es una protena formada por cuatro subunidades: dos alfa y
dos beta. Ambos tipos presentan gran semejanza en su estructura terciaria con la
mioglobina, protena muscular formada por una sola cadena. Una diferencia
destacable est en que la posicin de algunos aminocidos hidrofbicos en las
subunidades de la hemoglobina se corresponden con aminocidos hidroflicos en
la mioglobina.

a) Cmo puede interpretarse esta informacin con la generalizacin conocida en


cuanto a la distribucin hacia el interior y hacia el exterior de los aminocidos
hidrofbicos e hidroflicos respectivamente, en las molculas de protenas?

13- Los anticuerpos poseen sitios de reconocimiento a los cuales se une la


molcula del antgeno. Ya que tanto el anticuerpo como el antgeno suelen ser
protenas, cules sern las caractersticas de los aminocidos que intervienen en
la fuerte unin que se establece en el complejo antgeno-anticuerpo?

14- El trasplante de rganos se complica generalmente por el rechazo al nuevo


tejido que se introduce en el organismo. Las posibilidades de xito son mayores
cuando el donante tiene relacin de parentesco muy cercana con el paciente (por
ejemplo hermanos gemelos). Los rechazos son mayores si el rgano proviene de
un animal. Sugiere la base molecular que justifica esta observacin.

15- Una protena se une a su ligando por medio de los grupos de las cadenas
laterales de Ser-64, His-109 y Asp-143. Para lograr un 50% de saturacin se
requiere una concentracin del ligando [L]= 0.01 M. Si se hace el cambio Ser64Tre

25
esa saturacin se logra con [L]= 0.06 M, para el cambio Asp143Glu con [L]= 0.08
M y para His109Arg debe emplearse [L]= 0.8 M. Sin embargo, si se realiza el
cambio His87Ala se produce una abolicin total de la unin del ligando. Cmo
pueden explicarse estos resultados?

16-Se purifica una protena de hgado de rata y al correrla en una electroforesis a


pH=7 y [NaCl]= 0.01 M se obtiene una sola banda que se corresponde con una
masa molecular de 180 kD. Sin embargo, si la corrida se hace a pH=8.6 y [NaCl]=
0.1 M se obtienen dos bandas que corresponden a masas moleculares de 36 kD y
57 kD respectivamente. Qu informacin puede derivarse de estos resultados
acerca de la estructura de esta protena?

BIBLIOGRAFA

1. Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 9, Caractersticas generales


de las macromolculas

2. Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 12, Protenas

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CLASE TALLER 4
TEMA II
Biomolculas
Titulo: cidos Nuclecos

Sumario:
Estructura general.
Tipos principales: ADN y ARN.
Funciones.
Estructura primaria y secundaria del ADN: Modelo de Watson y Crick.
ARN: tipos. Caractersticas estructurales y funcionales de cada tipo.
.
Objetivo 1:

Mencionar algunas de las caractersticas generales de la estructura de los cidos


nucleicos.
Los cidos nucleicos constituyen una macromolcula muy importante, con relacin
a los mismos:

Resume estos contenidos de la siguiente forma:

Concepto de cido nucleico: est determinado por los elementos montonos

presentes en su estructura. Esto aparece en el libro de texto Bioqumica Mdica


de Cardell, Tomo I, captulo 11, pgina 163.

Clasificacin, determinada por los elementos diversos. Esto aparece en el libro de


texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 11, pgina 164.

Funciones que desempean en la clula. Esto aparece en el libro de texto

Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 11, pgina 164. Como


observaste, cumplen con el principio de multiplicidad de utilizacin.

Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes


preguntas
Tarea No.1
1. Aplique el principio de Organizacin de las MM. al ADN
2. Cul es la diferencia en composicin entre el ADN y el ARN?

3. Cmo se manifiesta en los cidos nucleicos el carcter polimrico?

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4. Cul es el carcter que permite diferenciar los dos grandes tipos de cidos
nucleicos?

Objetivo 2:

Describir las caractersticas estructurales del ADN.

Estructura primaria: concepto, importancia y fuerza que la mantiene. Ten en


cuenta que est mantenida por el enlace 3-5 fosfodister, que por ser covalente
le confiere estabilidad; tambin tiene polaridad. Esto aparece en el libro de texto
Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 11, pgina 165.

Estructura secundaria: modelo de Watson y Crick, caractersticas, fuerzas que la


mantienen, importancia del modelo. Este modelo tiene una gran importancia ya
que explica como se conserva la informacin contenida en la secuencia de bases
nitrogenadas para su posterior transmisin y expresin. Esto aparece en el libro de
texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 11, pginas de la 169 a la
172. Fjate que las dos cadenas tienen la misma informacin, pero no son iguales.

Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes


preguntas
Tarea No.2
1. Por qu se asegura que el modelo de Watson y Crick permiti explicar el
fundamento de las reglas de Chargaff?

2. Compruebe si en los ADN que se relacionan en la tabla 11.1(del Libro de


texto) hay alguno donde no se cumplan las reglas de Chargaff.

3. Cite los postulados del modelo de Watson y Crick y cual puede


considerarse como el de mayor trascendencia? Por qu?
4. Se tiene un fragmento de ADN humano al que se le quiere determinar su
composicin en bases y solo se le pudo determinar Adenina, que se
encuentra en un 20 %. Con ese resultado podra UD. completar la
composicin en base del fragmento.

5. Durante la replicacin del ADN se requiere desenrollar la doble hlice. Se


conoce que este proceso ocurre con mas velocidad en regiones del ADN
donde predomina lo pares de bases A y T. Que explicacin puede darle a
este hecho?

28
6. Dado los siguientes fragmentos de molculas de ADN :

---------------------

AAGTTCT

TTCAAGA (A)

---------------------

-------------------- --------------------

AG T C G T C GGACCG

T C A G C AG (B) C C T G G C (C)
-------------------- --------------------

Ordnelos de menor temperatura de desnaturalizacin al de mayor marcando


con una cruz (X) la respuesta correcta: Justifique

___ BCA
___ ACB
___ BAC
___ ABC
___ CBA
___ CAB

7. Se sabe que la protena A se une al ADN por la secuencia 5-TTCGGA-3,


mientras la protena B lo hace por 5-TCCGAA-3 Cmo pueden las
protenas A y B diferenciar una secuencia de otra?
8. Qu tipo de informacin molecular contiene bsicamente el ADN?

9. En la cromatina el ADN est asociado fuertemente a protenas bsicas


llamadas histonas que tienen un alto contenido en arginina y lisina.
Basndose en la estructura del ADN y de las histonas, cules sern las
interacciones responsables de esta fuerte asociacin?

10. Cree Usted que la informacin secuencial tiene el mismo sentido en el


ADN que en las protenas?

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Objetivo 3
Describir las caractersticas estructurales generales de los ARN.

Los ARN. Tipos, caractersticas estructurales y funcionales de cada uno. Esto lo


puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I,
captulo 11, pginas de la 169 a la 172.

Estructura primaria, secundaria y terciaria del ARN de transferencia. Esto lo


puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I,
captulo 11, pginas de la 187 a la 189.

Tarea No.3
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Cmo est compuesto el eje covalente de la molcula de ARN?

2. Argumente como se manifiesta la relacin Estructura Funcin en los ARN


de transferencia.

Ejercicios de Autoevaluacin

Siempre que sea posible justifique su respuesta

1.- Cul de los siguientes compuestos es caracterstico de los ARN?

Adenina.

Guanina.

Ribosa.

Timina.

2.- Cul de los siguientes compuestos es caracterstico de los ADN?

Desoxiribosa. Adenina.

Guanina. Timina.

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3.- Cuando se afirma que las molculas de ADN son las ms grandes que existen
en las clulas A cul de las caractersticas generales de las macromolculas se
est haciendo referencia?

Carcter polimrico.

Carcter tridimensional.

Carcter macromolecular.

Carcter lineal

4.- Cul de los tipos de ARN es el que presenta una gran heterogeneidad en su
tamao?

ARN de transferencia.

ARN ribosomal.

ARN mensajero.

ARN pequeo nuclear.

5.- En 1965, Robin Holliday describi la estructura secundaria de un ARN de


transferencia en levaduras. Este investigador se aventur a decir que todos los
ARN de transferencia deban tener una estructura secundaria similar. En cul de
las caractersticas generales de las macromolculas se bas Holliday para hacer
semejante afirmacin?

Carcter polimrico.

Carcter tridimensional.

Tendencia a la agregacin.

Relacin entre la estructura y la funcin.

7.- Al analizar la composicin de bases de una segmento de ADN humano se


encuentra que contiene un 28% de adenina. Cul ser la composicin de bases
total del segmento analizado?

Adenina 28%, Guanina 22%, Citosina 28% y Timina 22%.

Adenina 28%, Guanina 22%, Citosina 22% y Timina 28%.


31
Adenina 28%, Guanina 28%, Citosina 22% y Timina 22%.

Adenina 28%, Guanina 28%, Citosina 28% y Timina 22%.

BIBLIOGRAFIA:

Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 11, Estructura de los cidos


Nuclecos

32
CLASE TALLER 5

TEMA III Biocatalizadores


Titulo: Cintica Enzimtica.

Sumario:
Factores que afectan la velocidad de reaccin:
Concentracin de enzima, sustrato, cofactores, pH, temperatura, activadores e
inhibidores

INTRODUCCIN.

Las enzimas constituyen el componente activo del metabolismo celular, pues


todas las reacciones qumicas que integran los procesos metablicos dependen
de la existencia de un biocatalizador, bien porque ellas mismas sean catalizadas,
bien porque su sustrato proviene de una reaccin catalizada o bien porque su
producto es utilizado en una reaccin catalizada. Es por ello que la bio-catlisis se
considera una categora bioqumica.

La intervencin de las enzimas en el metabolismo permite que ste funcione con


intensidad variable de acuerdo con las condiciones celulares y permite la
adaptacin de las clulas a los cambios de sus condiciones de vida. El
fundamento molecular de esa adaptacin est representado por los mecanismos
que hacen posible la regulacin de la actividad de las enzimas.
Precisamente, esos mecanismos de regulacin descansan en la variacin de la
fraccin de centros activos tiles en una poblacin de enzimas. Es por estas
razones que estos temas han sido seleccionados para ser discutidos
Pero si esto no bastara, es bueno conocer que un buen nmero de enfermedades
se debe a la deficiencia de una enzima o a fallas en su mecanismo de regulacin

Objetivos.
Explicar vinculado a la prctica mdica- los factores que modifican las
velocidades de las reacciones enzimticas, destacando el significado de los
parmetros Km y Vm, as como su comportamiento frente a los inhibidores
competitivos y no competitivos.

Cintica enzimtica.
La funcin fundamental de las enzimas es aumentar la velocidad de las reacciones
que ocurren en los seres vivos, el comportamiento de esa velocidad y su
modificacin debido a la presencia de diferentes agentes fsicos o qumicos,
constituye el objeto de estudio de la cintica enzimtica. Con respecto a este
contenido:

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Puntualiza los siguientes aspectos:

Objetivo 1.
Mencionar los factores que influyen en la velocidad de reaccin
Conceptos de velocidad de reaccin y velocidad inicial. Factores que influyen en la
velocidad de una reaccin catalizada por una enzima.
Este tpico lo puedes encontrar en el libro de Bioqumica Mdica de
Cardell, tomo I,captulo 16, pginas 284-285

Tarea No.1
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Cules son las razones por las que en los estudios cinticos debe siempre
medirse las velocidades iniciales?
2. Mencione 7 de los factores que pueden modificar la velocidad de las
reacciones enzimticas

Objetivo 2. Explicar los factores que influyen en la velocidad de las reacciones


catalizadas enzimticamente con las formas grficas de cada uno de ellos.

Tarea No. 2
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. a) Identifique a qu factor modificador de la velocidad de la reaccin
enzimtica corresponde la curva que se le muestra a continuacin:

b) Explique a qu se debe la forma de la curva y compruebe en el texto, la


validez de su explicacin
Este tpico lo puede estudiar en el libro de Bioqumica Mdica de Cardell, tomo
I,captulo 16, pginas de la 284-285

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2. a) Identifique a qu factor modificador de la velocidad de la reaccin
enzimtica corresponde la curva que se le muestra a continuacin, teniendo
en cuenta las forma de hiprbole rectangular que presenta
b) Seale los componentes que se indican para completar , as como el
orden de la reaccin en los diferentes momentos de la curva
c) Explique a qu se debe la forma de la curva y compruebe la validez de su
explicacin en el texto.

3. A continuacin se presenta una grfica que recoge el comportamiento de


una enzima frente a dos sustratos diferentes. Estudie las grficas y seale:
a) La Vm de cada reaccin.
b) La Km frente a cada sustrato.
c) Por cul de los dos sustratos tiene la enzima mayor afinidad?
d) Con cul exhibe mayor capacidad cataltica?

Este tpico lo puede estudiar en el libro de Bioqumica Mdica de Cardell, tomo


I,captulo 16, pginas de la 285 a la 290
Lea todo el contenido orientado, incluyendo las figuras, sin tratar de retener ningn
elemento, solo para tener una idea general, en una segunda lectura vaya
precisando los siguientes aspectos
Que es el orden de reaccin. Identifque el orden en cada sector (F, G y H)
del grfico anterior.
Defina la Constante de Michaelis (KM) y observe en cual eje de
coordenadas se determina.
Defina la Velocidad Mxima (VM) y observe en cual eje de coordenadas se
determina.
35
Observe siempre que en el eje (y) va la velocidad inicial y en el eje (x) va la
variable objeto de estudio. En este caso anterior es la concentracin de
enzima.
Revise el concepto de KM y VM y destaque el significado o importancia de
cada uno.

4. Si dos enzimas actan sobre el mismo sustrato con K M de 4 x 10-4 y 7 x 10-6


respectivamente. Qu conclusiones pueden derivarse de estos valores?
Nota. Tenga en consideracin cual es el significado o importancia de la
determinacin de KM

a) Identifique a qu factor modificador de la velocidad de la reaccin enzimtica


corresponde la curva que se le muestra a continuacin:

b) Explique como influye el pH sobre el centro activo de la enzima.


Este tpico lo puede estudiar en el libro de Bioqumica Mdica de Cardell, tomo I,
captulo 16, pgina 291

5. Identifique a qu factor modificador de la velocidad de la reaccin


enzimtica corresponde la curva que se le muestra a continuacin

Explique a qu se debe la forma de la curva y compruebe la validez de su


explicacin en el texto Bioqumica Mdica de Cardell, tomo I, captulo 16, pgina
292

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Objetivo 3.Mencionar las caractersticas de la inhibicin competitiva y la no
competitiva.
Tarea No. 3.

6. a) La influencia de la concentracin de sustrato en la velocidad de reaccin


enzimtica puede expresarse mediante el grfico de Lineweaver Burk. A
continuacin se presenta ese grfico con el sustrato normal y en presencia
de un inhibidor (lnea azul) Complete los aspectos sealados en el grfico.

b) Un inhibidor X produce el efecto indicado por la lnea azul en el grfico de


Lineweaver Burk representado. Diga a qu tipo de inhibicin corresponde.
Explique.
Este tpico lo puede estudiar en el libro de Bioqumica Mdica de Cardell, tomo
I,captulo 16, pgina 292-296
Lea todo el contenido orientado, incluyendo las figuras, sin tratar de retener ningn
elemento, solo para tener una idea general, en una segunda lectura vaya
precisando los siguientes aspectos
Concepto de inhibicin competitiva y no competitiva
Representacin grfica
Diferencias entre ambos tipos de inhibicin, en cuanto a estructura del
sustrato e inhibidor, la constante de Michaelis, la velocidad mxima y la
unin a la enzima (si es por el centro activo o prximo a este).

Ejercicios de Autoevaluacin
En todos los casos justifique su respuesta

1. Seleccione la respuesta correcta en cada caso:


Temperatura
pH
Concentracin de enzima.
Concentracin de sustrato.
a) ___ Aumenta la energa cintica de las molculas, por lo que favorece la unin
de la enzima con el sustrato.
b) ___ Modifica la distribucin de cargas del centro activo.
c) ___ Su incremento implica un mayor nmero de centros activos tiles, por lo
que se produce un incremento proporcional de la velocidad de la reaccin.
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d) ___ A medida que aumenta, se incrementa la velocidad de la reaccin
enzimtica hasta que se alcanza la VM.

2. La carboxipeptidasa es una enzima que elimina secuencialmente los


residuos de aminocidos del extremo carboxilo terminal de sus sustratos
peptdicos y est formada por una sola cadena de 307 aminocidos. Los
dos grupos catalticos del centro activo son proporcionados por la arginina
de la posicin 145 y el glutmico de la posicin 270. A pH fisiolgico la
enzima es activa (pH= 7.35-7.45) pero a pH menores o mayores disminuye
considerablemente su actividad. Cmo explica usted estos resultados?
3. El ibuprofeno es un inhibidor de la enzima prostaglandina endoperxido
sintasa. El ibuprofeno reduce la inflamacin y el dolor mediante la inhibicin
de la sntesis de prostaglandinas. El anlisis cintico de este frmaco arroj
el siguiente resultado.

Qu tipo de inhibicin ejerce el ibuprofeno sobre la enzima. Explique.

4. El suero sanguneo humano contiene una clase de enzimas denominadas


fosfatasas cidas que hidrolizan steres fosfato biolgico en condiciones
ligeramente cidas (pH= 5): Las fosfatasas cidas son producidas por los
eritrocitos, hgado, bazo, rin y glndula prosttica. La enzima de la
glndula prosttica es importante en clnica porque un incremento de su
actividad en la sangre es con frecuencia un indicador de cncer de la
glndula prosttica. La fosfatasa de la prstata es fuertemente inhibida por
el ion tartrato mientras que las fosfatasas de los otros tejidos son
insensibles al mismo. Cmo se puede utilizar esta informacin para
desarrollar un procedimiento especfico para medir la actividad de la
fosfatasa cida de la glndula prosttica en el suero sanguneo humano?

Una vez estudiado todo lo propuesto anteriormente estars listo para preparar lo
que ser tu primer seminario sobre biocatalizadores, lee y estudia la siguiente gua
y aclara tus dudas en la clase taller

38
CLASE TALLER 6

TEMA III Biocatalizadores

Titulo: Ttulo: Mecanismos de regulacin enzimtica.

SUMARIO:

Concepto de Regulacin
La modificacin alostrica: Modelo simtrico o concertado.
La modificacin covalente. Caractersticas. El modelo de la glucgeno
fosforilasa.
El fenmeno de amplificacin
INTRODUCCIN.
La intervencin de las enzimas en el metabolismo permite que ste funcione con
intensidad variable de acuerdo con las condiciones celulares y permite la
adaptacin de las clulas a los cambios de sus condiciones de vida. El
fundamento molecular de esa adaptacin est representado por los mecanismos
que hacen posible la regulacin de la actividad de las enzimas.
Precisamente, esos mecanismos de regulacin descansan en la variacin de la
fraccin de centros activos tiles en una poblacin de enzimas. Es por estas
razones que estos temas han sido seleccionados para ser discutidos
Pero si esto no bastara, es bueno conocer que un buen nmero de enfermedades
se debe a la deficiencia de una enzima o a fallas en su mecanismo de regulacin.

Objetivo.
Explicar los mecanismos bsicos de regulacin enzimtica tomando como
modelos el simtrico concertado, para la regulacin alostrica y la fosforilacin-
desfosforilacin, para la regulacin por modificacin covalente.

Cuando un sistema o proceso es capaz de variar su comportamiento como


respuesta a cambios que se produzcan en su entorno, de forma que la respuesta
directa o indirectamente tiende a modificar el estmulo para volver a la situacin
inicial, se dice que este sistema o proceso est regulado.
Todo organismo requiere regular la actividad cataltica de sus componentes
enzimticos para coordinar los procesos metablicos, responder a los cambios del
entorno y para su crecimiento y diferenciacin. Esto lo realiza en dos formas
generales, las cuales son:
Controlando la cantidad de las enzimas
Controlando la actividad de las enzimas.
Aunque existen diferencias notables entre un sistema de regulacin y otro, todos
contienen un grupo de componentes que son esenciales para su funcionamiento.

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Con respecto a este contenido:
Puntualiza los siguientes aspectos:
Objetivo 1.
Enunciar el concepto de regulacin enzimtica.
Mencionar las dos formas bsicas generales de regulacin enzimtica
Mencionar los componentes bsicos de un sistema de regulacin.
Este tpico lo puedes encontrar en el libro de Bioqumica Mdica de
Cardell, tomo I,captulo 17, pginas 299-300. Estudiar la Fig 17.1

Tarea No.1
Despus de revisar la bibliografa antes sealada conteste las siguientes
preguntas
1. Defina el concepto de regulacin enzimtica.
2. Mencione las dos formas bsicas de regulacin enzimtica y plantee en que
se diferencian esencialmente ambas.
3. Describa mediante un esquema los componentes esenciales de un sistema
de regulacin.
Objetivo 2.
Explicar las caractersticas fundamentales de la regulacin alostrica.
Explicar el mecanismo de regulacin alostrica tomando como modelo el
simtrico o concertado.
Caractersticas de las enzimas alostricas, conformaciones que pueden adoptar,
grado de afinidad de los inhibidores o estimuladores por las conformaciones que
adopta la enzim. Cooperatividad. Comportamiento cintico y su grfico.
Mecanismo simtrico o concertado que explica la regulacin alostrica. Esto
aparece en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 17
pginas 301-304 (no estudiar el modelo secuencial).
Tambin debe estudiar las caractersticas generales de las enzimas alostricas
que aparece en la pgina 305

Tarea No 2
Despus de revisar la bibliografa orientada conteste las siguientes preguntas.
1. La isocitrato deshidrogena es una enzima alostrica reguladora del ciclo de
Krebs (una va que obtiene la energa de la oxidacin de los combustibles
metablicos para la generacin del ATP a partir del ADP, por tanto el ATP
puede considerarse como uno de los productos finales de esta va. Cuando
la concentracin de ATP empieza a aumentar en las clulas, la
concentracin de ADP empieza a disminuir. Ambos son reguladores
alostricos de esta enzima; el ADP es un estimulador y el ATP es un
inhibidor alostrico. Plantee en el grfico que se muestra a continuacin a
cual curva (letras A; B; C) corresponde, la adicin del ADP, a cual
corresponde la adicin del ATP y a cual la reaccin sin moduladores
40
alostricos. Explique cada una de las respuestas que usted seleccione
tomando en consideracin las caractersticas de las enzimas alostricas.

2. El grfico siguiente muestra el efecto de la concentracin de sustrato sobre


la velocidad de una reaccin catalizada por una enzima alostrica y otra
que no lo es: a) Identifquelas. Explique en que se fundamenta usted para
dicha seleccin. (Pista: Tome en consideracin las caractersticas de las
enzimas alostricas para la explicacin).

3. Explique las siguientes afirmaciones sobre la regulacin alostrica:

El fenmeno se caracteriza por una variacin en el nmero de centros


activos tiles disponibles
El efecto cooperativo puede explicarse grficamente a travs del
comportamiento sigmoidal de la curva vo versus [S].
Las enzimas alostricas pueden manifestar un efecto homotrpico

41
4. Explique el mecanismo de regulacin alostrica segn el modelo simtrico
o concertado.
5. Seleccione dentro de las opciones dadas la correcta para cada complejo

6. Cul es la razn de que los modelos que tratan de explicar el


comportamiento de las enzimas alostricas (Ej el modelo simtrico o
concertado), supongan que estas presentan estructura cuaternaria?
7. Haga un esquema que explique la regulacin de una enzima (E) activada
por el ADP e inhibida por el ADP segn el modelo simtrico
Objetivo 3.

Explicar las caractersticas fundamentales de la regulacin covalente


Explicar el fenmeno de la amplificacin.

Caractersticas de las enzimas con modificacin covalente, conformaciones que


pueden adoptar. Diferencias con relacin a las enzimas alostricas. La
modificacin covalente por fosforilacin-desfosforilacin tomando como ejemplo la
degradacin del glucgeno (catabolismo del glucgeno). . Esto aparece en el libro
de texto Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 17 pginas 306-309.

42
Tarea No 3
Despus de revisar la bibliografa orientada conteste las siguientes preguntas.
1. En el siguiente esquema sobre la regulacin por Modificacin Covalente,
relacione las diferentes siglas con los distintos componentes del mecanismo
de fosforilacin-desfosforilacin:

2. Plantee 3 diferencias entre la modificacin covalente y la modificacin


alostrica.
3. Dos procesos metablicos se regulan por modificacin covalente y por
fosforilacin-desfosforilacin, si en uno hay 3 quinasa intermedias con una
kcat de 120 min-1 y en el otro 4 con kcat de 80 min-1. Calcule el grado de
amplificacin para cada uno de ellos.
4. La cafena inhibe a la enzima AMPc fosfodiesterasa, una enzima que
cataliza la transformacin del AMPc en AMP. Cmo puede esta reaccin
afectar la modificacin covalente de la enzima glucgeno fosforilasa?
5. Explique como una cascada enzimtica aporta una enorme amplificacin de
una pequea seal inicial.
Una vez estudiado todo lo propuesto anteriormente estars listo para preparar
lo que ser tu primer seminario sobre biocatalizadores, lee y estudia esta gua
y aclara tus dudas en la clase taller.
BIBLIOGRAFIA:
1. Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo I, captulo 17, Regulacin de la
Actividad Enzimtica

43
Clase Taller 7.

Tema V: Gentica molecular.

Titulo: Replicacin y transcripcin del ADN.

Sumario:

- Componentes y ciclo celular: Caractersticas morfofuncionales de sus


componentes. Ciclo celular. Concepto. Fases. Categoras celulares y su
relacin con el ciclo celular.
- Replicacin del ADN: Significacin biolgica, desnaturalizacin del ADN.
Organizacin del genoma en eucariontes. Reparacin y recombinacin.
- Transcripcin del ADN: Significacin biolgica. Cambios postranscripcionales
del ARN.

Objetivo 1.

Explicar las caractersticas del ciclo celular, teniendo en cuenta sus etapas y
particularidades en las diferentes categoras celulares.

Orientacin al contenido:

Entre las propiedades fisiolgicas de la clula, est la capacidad de reproducirse.


El resultado final de este evento da lugar a una serie de procesos que comienzan
con la formacin de la nueva clula y culmina con la reproduccin de la misma,
todos estos fenmeno sucesivos de divisin celular y etapas en que la clula no se
divide recibe el nombre de ciclo celular, donde el final de un evento es el inicio de
otro y consta de dos etapas generales, la divisin y la interfase.

A continuacin se representan estas etapas en un grfico, observa cul es la


secuencia de fenmenos, adems puedes apreciar las etapas de la interfase. De
ellas debes resumir:

44
De la etapa de divisin. Busca los tipos de divisin. Destaca la mitosis, y de ella
los eventos que caracterizan a la profase, metafase, anafase y telofase. Apyate
del texto Histologa Bsica, Junqueira y Carneiro 4ta edicin, captulo 3
pginas de la 46 a la 50, figuras 3-8, donde se representan los cambios
fundamentales de las etapas de la mitosis y las figura 3-9, 3-10 y 3-11 donde
observan las diferentes etapas de la mitosis.

Observa el siguiente esquema tomado del Texto de Histologa de Junqueira y

Carneiro 6ta edicin donde se representan los principales eventos de cada fase de
la mitosis.

De la etapa de Interfase: resume de sus fases, los eventos ms caractersticos e


importancia.

Recuerda que cada etapa tiene una finalidad por lo que debes precisar de cada
una su importancia para el mantenimiento de las poblaciones celulares y las
funciones de los diferentes grupos celulares.

Todo este contenido lo puedes estudiar por:

Bioqumica Mdica de Cardell, captulo 23 del tomo II. Pgs. 419-421.

45
Las etapas del ciclo celular y la transferencia de informacin gentica tienen una
estrecha relacin, revisa en Bioqumica Mdica de Cardell. Tomo II, captulo
24 y haz una breve referencia a los mecanismos moleculares que regulan la
progresin del ciclo celular.

Como habrs podido apreciar las clulas somticas en el organismo se clasifican


en dependencia de la actividad mittica que demuestren, teniendo un ciclo de vida
caracterstico, lo que da lugar a las diferentes categoras celulares. Estas son:

1) Categoras de clulas permanentes o estticas.

2) Categora de clulas lbiles o constantemente renovables.

3) Categoras de clulas estables o potencialmente renovables

De estas categoras debes:

- Buscar y resumir las caractersticas del ciclo celular de las clulas que la
forman.
- Ejemplos de localizacin de estas clulas en los tejidos del organismo.

Organizacin del genoma en eucarionte

En todas las clulas el material gentico est constituido por ADN de doble banda,
aun cuando su estructura general es muy similar y est compuesta por las mismas
bases nitrogenadas, existen notables diferencias entre las organizaciones
particulares de los genomas en procariontes y eucariontes. Con relacin a estos
contenidos:

Resume los siguientes aspectos:

Genes y cromosomas.

Cuando estudies este aspecto, debes darte cuenta que el nmero y la forma de
los cromosomas son caractersticos de cada especie, adems que existen 2 tipos
de clulas en cuanto al nmero de cromosomas que poseen, las somticas y las
sexuales. Esto lo puedes encontrar en el libro de texto Bioqumica Mdica de
Cardell, tomo II, captulo 26, pginas de la 461a la 464.

46
Estructura del gen.

Un gen est constituido por uno o ms segmentos especficos de ADN, cuya


secuencia de bases contiene la informacin necesaria para la sntesis de
protenas especficas. Puntualiza que contiene secuencias codificantes
denominadas exones, que alternan con otras no codificantes, llamadas intrones.
Esto lo puedes encontrar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell,
tomo II, captulo 26, pginas de la 466 a la 468.

Comprenders que en los organismos eucariontes existe una gran cantidad de


material gentico que no codifica protenas, y que cumple funciones reguladoras.

Objetivo 2.

Explicar los aspectos moleculares del proceso de replicacin del ADN, haciendo
nfasis en su significacin biolgica.

Orientacin al contenido:

El estudio de estos contenidos te permitir comprender las bases moleculares de


los procesos de conservacin y transmisin de la informacin gentica, que
garantizan la perpetuacin de las especies.

Replicacin del ADN.

La transferencia de la informacin gentica de padres a hijos es el fenmeno ms


importante de la materia viva, esto no solo garantiza la sucesin de la vida sino
adems, constituye el mecanismo bsico de conservacin de las especies. Esta
transferencia tiene su fundamento molecular en la duplicacin o replicacin del
ADN. En relacin a estos contenidos:

Resume los siguientes aspectos:

Concepto.
Requerimientos.
Importancia biolgica del proceso.
Caractersticas generales.
Factores que garantizan su fidelidad.

47
Estos contenidos puedes estudiarlos en el libro de texto Bioqumica Mdica de
Cardell, tomo II, captulo 25, pginas de la 439 a la 456.

Cuando realices esta actividad, no es necesario memorizar los detalles de las


diferentes etapas en que ocurre la replicacin, debes lograr una idea general del
transcurso del proceso de manera que puedas comprender las caractersticas
generales. Al final de cada etapa aparece un resumen en el libro de texto que
plantea los eventos ms sobresalientes de cada una.

Reparacin y Recombinacin.

Respecto a la recombinacin gentica debes resumir los siguientes aspectos:

Concepto.
Enzimas que participan.
Importancia biolgica.

La recombinacin tiene una doble funcin, de garantizar la diversidad de la


descendencia y de reparar el ADN en determinadas circunstancias.

La reparacin del ADN tiene importancia para la conservacin de la informacin


gentica, por lo que el fallo de estos mecanismos provoca enfermedades.

De la reparacin puntualiza:

Daos que se producen al ADN.


Sistemas de reparacin, enfatizando en el tipo de escisin y las enzimas
que participan en el mismo.

Esto se encuentra en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II,


captulo33, pginas de la 549 a 558.

Objetivo 3.

Explicar los aspectos moleculares del proceso de transcripcin del ADN, haciendo
nfasis en su significacin biolgica.

48
Orientacin al contenido:

El estudio de estos contenidos te permitir comprender las bases moleculares de


los procesos de conservacin y transmisin de la informacin gentica, que
garantizan la perpetuacin de las especies.

Transcripcin.

La transcripcin constituye la etapa crucial en el mecanismo de la expresin de la


informacin gentica. De la misma:

Puntualiza los siguientes aspectos:

Concepto.
Requerimientos.
Importancia biolgica del proceso.
Caractersticas generales.

Este contenido lo puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica de


Cardell, tomo II, captulo 27, pginas 475 y 476.

Es importante que profundices en la estructura del promotor, que aparece en la


pgina 478, ya que el mismo es fundamental en los mecanismos de regulacin de
la expresin de la informacin gentica.

Tambin debes revisar los inhibidores del proceso que estn en la pgina 493,
porque varios de ellos se utilizan como antibiticos.

Bibliografa: Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo II, Captulos 24, 25, 26, 27,
31, 32 y 33.

Ejercicios de Autoevaluacin:

Ejercicios.

1. Defina que es el ciclo celular. Explique sus etapas y la importancia de las


mismas.
2. Mencione los factores que intervienen en la divisin celular (mitosis).
3. Explique los eventos principales que ocurren durante las diferentes fases de la
mitosis.
4. A partir de cuales sustratos es polimerizado el ADN?
5. Qu significado tienen los trminos primer y templete (molde)?
6. Qu propiedades comparten todas las ADN polimerasas?
49
7. Explique como la replicacin es semiconservativa, bidireccional y
semidiscontinua.
8. Cul es el grupo qumico (3OH o 5P) en los los puntos sealados por a, b y
c.?

5-P

a
b

c
9. Resuma el rol del ARN en la replicacin de la hebra conducida.

10. La velocidad de movimiento de una horquilla de replicacin en la E. Coli es


aproximadamente 10 000 pares de bases por minuto. En eucariontes la
velocidad vara entre 500 y 5 000 pares de bases por minuto. Cada clula de
tejido animal contiene aproximadamente 50 veces el ADN de la bacteria, por lo
que el tiempo de replicacin sera aproximadamente 1000 veces mayor, esto
es, en 30 das. Sin embargo, la replicacin en eucariontes dura apenas unas
horas. Cmo puede explicarse esta situacin?

11. Cmo explicara Ud. la necesidad de las topoisomerasas I en el proceso


replicativo?

12. Diferencie la accin de la ADN polimerasa I y polimerasa III en la replicacin.

13. Por qu la actividad exonucleasa 5- 3 es esencial para la replicacin?

14. La velocidad de replicacin en clulas carentes de helicasas es mucho ms


lenta que en las clulas normales. A qu cree usted se deba esta situacin?

15. Existen clulas mutantes que no contienen ADN polimerasa I. Cules de los
procesos relacionados con el ADN se afectan y por qu?

16. Observe el video sobre el proceso de replicacin y conteste.


Que impide una nueva unin de las hebras de la doble cadena del ADN una
vez que ha sido separada por la helicasa?

Que necesitan las ADN polimerasas para comenzar a ejecutar su funcin?


50
Explique porque el carcter semidiscontinuo de este proceso.

17. Cules son las fuentes de alta fidelidad que tiene la replicacin?

18. Mencione y explique los daos que pueden producirse en el ADN.

19. Qu repercusin tendra sobre la replicacin del ADN el tratamiento de las


clulas con mitomicina C?

20. Una de las alteraciones de bases mejor estudiada es la formacin de dmeros


de pirimidinas, especialmente de timina, provocada por la luz ultravioleta. Por
qu esta alteracin puede causar la inhibicin de la replicacin y de la
transcripcin?

21. La enzima fotoliasa interviene en la reparacin de los dmeros de timina que se


producen como resultado de la exposicin prolongada a la luz ultravioleta.
Cmo se le llama a este mecanismo de reparacin? Qu consecuencias
traera la ausencia de la enzima?

22. En ausencia de luz no es posible la activacin de la enzima fotoliasa. Cmo


pueden entonces eliminarse los dmeros de timina que se produzcan?

23. Por qu cree usted que los daos por rotura en las 2 bandas del ADN casi
nunca pueden ser separados?

24. El Xeroderma Pigmentosum es una enfermedad que se produce por una falla
en uno de los mecanismos de reparacin del ADN. A que mecanismo se refiere
en este caso y que consecuencias trae la alteracin de este para el paciente.
25. Qu importancia tiene para el mdico el conocimiento de los diferentes
mecanismos de reparacin del ADN.

26. Qu se entiende por recombinacin gentica?

27. Por qu puede afirmarse que la recombinacin gentica ha desempeado


una importante funcin en el proceso evolutivo de los seres vivos?

51
28. Transcripcin es el proceso por el cual:
(A) ADN es copiado de forma tal que una molcula de dos cadenas origina dos
molculas hijas.

(B) Molculas de ARNm, ARNt y ARNr son sintetizadas.

(C) ARN es modificado para que pueda ser traducido.

(D) Protenas son sintetizadas.

29. Acerca del proceso de transcripcin responda:


Cules son los sustratos para la sntesis de ARN?

Qu enzima?

Se requiere un primer?

30. Cules de los siguientes eventos ocurre durante la sntesis de ARN?


a. Unin de ADN polimerasa a ADN.
b. Unin de ARN polimerasa a ADN
c. Unin de un factor a ARN polimerasa
d. Unin de un factor a ADN polimerasa.

31. De los siguientes ARN, cul es transcripto y traducido?

(A) ARNm

(B) ARNt

(C) Intrones

(D) ARNr

32. Dnde es el sitio de unin de RNA polimerasa?


(A) Siempre es a la izquierda del gen (upstream)

(B) A un sitio llamado UAS

(C) A un sitio llamado caja CAAT.

(D) A un sitio llamado promotor.

52
33. Cul de los siguientes complementos describe mejor la funcin de la
subunidad sigma () en la ARN polimerasa de E. coli?

(A) Es esencial para la elongacin del ARN transcripto.

(B) Es esencial para el reconocimiento de y la unin a la secuencia promotor.

(C) Incrementa la unin de ARN polimerasa a cualquier molde de ADN.

(D) Es requerida para la terminacin de la transcripcin

(E) Contribuye a la disociacin del ncleo de la enzima

34. ARN polimerasa no presenta la actividad nucleasa de ADN polimerasa.


Mencione dos actividades presentes en la ARN polimerasa y no en ADN
polimerasa.

35. Mencione las modificaciones post-transcripcionales del ARNm eucariote.


36. Cules secuencias son nombradas intrones? Qu es ARN splicing?
37. Justifica el siguiente planteamiento: no existen mecanismos de reparacin o
rectificacin en la sntesis del ARN.

38. Pudieran existir inhibidores de la transcripcin que no afectaran la


replicacin? Describa cmo deben actuar para lograrlo.

39. Un plsmido es preparado por ingeniera gentica para contener un gen que es
la copia de un ARNm que codifica el producto de un gen particular. El ADN del
plsmido es aislado, denaturalizado e hibridizado con el primario transcripto del
gen. La micrografa electrnica, dibujada esquemticamente en la figura que se
muestra abajo, es obtenida. Finas y gruesas lneas representan cido nucleico
de simple y doble hebra, respectivamente. Cuntos intrones hay en el gen?

BIBLIOGRAFA: Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo II, Captulos 24, 25, 26, 27,
31, 32 y 33.

53
Clase Taller 8.

Tema V: Gentica molecular.

Titulo: Traduccin y regulacin de la expresin de la informacin gentica.

Sumario:

- Traduccin gentica.
- Cdigo gentico y sntesis de protena.
- Principios generales de la regulacin de la expresin de la informacin
gentica, papel de los genes y de sus interacciones con el ambiente (pre y
postnatal).
- Ingeniera gentica. Aspectos conceptuales.
- Cncer. Mecanismo molecular de la transformacin cancerosa. Caractersticas
de las clulas cancerosas.
- Enfermedades moleculares. Concepto y tipos.

Objetivo

1.Explicar el proceso de traduccin, teniendo en cuenta los mecanismos


moleculares que participan, haciendo nfasis en su significacin biolgica como
expresin de la informacin gentica.

Traduccin.

Este es uno de los procesos que permite la expresin de la informacin gentica,


se efecta en los ribosomas, es importante que te remitas al tema donde
estudiaste los componentes de la clula y revises lo referido a los ribosomas,
organito que participa de forma importante en la sntesis de protenas para la
clula. Este contenido lo puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica
de Cardell, tomo II, captulo 29, pginas de la 509 a la 512.

De la traduccin debes resumir:

Concepto.
Requerimientos.
Importancia biolgica del proceso.
Caractersticas generales y factores que garantizan su fidelidad.

Es importante que profundices en la primera etapa del proceso, que se denomina


activacin de los aminocidos, ya que es la que garantiza la fidelidad de la
traduccin. Tambin debes revisar los inhibidores del proceso que estn en la

54
pgina 535, porque varios de ellos se utilizan como antibiticos. Este contenido lo
puedes estudiar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II,
captulo 30, pginas de la 521 a la 529.

Cdigo gentico.

El cdigo gentico permite conocer como la informacin contenida en el ADN y


transcrita en el ARN puede dirigir la sntesis proteica. Con relacin a estos
contenidos:

Puntualiza los siguientes aspectos:

Concepto.
Caractersticas.

El conocimiento del cdigo gentico permite encontrar un equivalente entre el


lenguaje de bases nitrogenadas presentes en la secuencia del ARN mensajero y
el de aminocidos que se encuentra en las protenas a sintetizar. Debes enfatizar
en el carcter degenerado del mismo, por su importancia como mecanismo de
proteccin ante las mutaciones. Este contenido lo puedes estudiar en el libro de
texto Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, captulo 28, pginas de la 497 a
la 503.

Regulacin de la expresin gentica.

Los mecanismos de regulacin de la expresin de la informacin gentica,


permiten a los organismos adaptarse a las condiciones cambiantes del medio. Con
relacin a este contenido:

Resume los siguientes aspectos:

Necesidad de los mecanismos de regulacin de la expresin de la


informacin gentica.
Modelo del opern: componentes y funciones de cada uno de ellos.
Mecanismo de induccin de la sntesis proteica, el opern lac.
Mecanismo de represin de la sntesis proteica, el opern trip.

55
Solo debes estudiar la induccin y la represin cuando domines la estructura del
opern y sus funciones. Comprenders que ambos casos son particularidades de
un mismo mecanismo bsico en el cual la protena represora cambia de
conformacin de acuerdo a la sustancia presente. En el caso del opern lac y el
trip, no es necesario memorizar sus componentes, sino solo interpretar su
funcionamiento. Estos aspectos puedes estudiarlos en el libro de texto
Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, captulo 34, pginas de la 573 a la
580.

Objetivo 2.

Explicar la importancia de la ingeniera gentica para la biologa y la medicina a


partir de los procedimientos bsicos implicados.

Ingeniera gentica.

Este tema slo pretende informarte de los procesos fundamentales de esta


novedosa biotecnologa. Las alteraciones del material gentico como fuente
productora de enfermedades cierran el tema y te demuestra la importancia de
estos conocimientos para el mdico actual y futuro.

Debes puntualizar los siguientes aspectos

Concepto de ingeniera gentica y su importancia para el desarrollo de las


investigaciones.
Enzimas de restriccin.
Principios bsicos de la clonacin in vitro.

Esto lo puedes encontrar en el libro de texto Bioqumica Mdica de Cardell,


tomo II, captulo 35, pginas de la 590 a la 597.

Objetivo 3.

Explicar el origen de las enfermedades moleculares y el cncer a partir de las


alteraciones que se producen en el material gentico por accin de agentes
externos e internos, haciendo nfasis en el mecanismo molecular de la
transformacin cancerosa y las caractersticas de las clulas afectadas,
vinculndolos con la prctica mdica.

Cncer.

El cncer tiene una especial relevancia en la prctica mdica por su incidencia


cada vez ms alta y la elevada mortalidad que lo caracteriza.

56
Con respecto al mismo debes resumir:

Concepto.
Caractersticas de las clulas cancerosas.
Mecanismo de la transformacin cancerosa.

En este aspecto debes estudiar en las pginas 1407 y 1408 del libro de texto, los
experimentos por los cuales se lleg a este conocimiento, solo tienen carcter
informativo.

Este contenido lo encontrars en el libro de texto Bioqumica Mdica de


Cardell, tomo IV, captulo 80, pginas de la 1401 a la 1403, 1407 y 1408.

Enfermedades moleculares.

Te sugerimos precisar los siguientes aspectos:

Concepto de enfermedad molecular.


La Drepanocitosis como modelo de enfermedad molecular.

En esta enfermedad debes precisar e integrar como las afectaciones a nivel


molecular (en este caso el gen que codifica la cadena beta de la hemoglobina)
puede acarrear consecuencias a nivel celular (hemates), de mltiples rganos y
del organismo en su conjunto, provocando alteraciones graves.

Este contenido aparece en el texto de Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV,


captulo 76, pginas 1322 y 1323 y de la 1326 a la 1329.

Ejercicios de Autoevaluacin:

1. Respecto a la traduccin responda marcando con una X la respuesta correcta:

A. Localizacin celular:

a. ___ Mitocondria.

b. ___ Ribosoma.

c. ___ Lisosoma.

57
B. Es el proceso de:

a) ___ Sntesis de protenas.

b) ___ Duplicacin del ADN.

c) ___ Sntesis de ARN.

C. Requiere de:

a) ___ Un iniciador o cebador.

b) ___ De la enzima ADN polimerasa.

c) ___ De un molde de ARN mensajero.

2. El segmento de ADN que se presenta a continuacin pertenece a la hebra


codificante de una unidad de transcripcin y est en fase con la traduccin.

5--TTTATTCTCCTAGCGGTACTGGGATTGATA--3

Para contestar las siguientes preguntas puede auxiliarse del cdigo gentico.

a) El pptido sintetizado ser soluble en agua?

b) Se afectar el pptido si la T de la posicin 3 se cambia por C?

c) Cmo se afectar el pptido si se inserta una G entre las posiciones 11 y 12?

d) Cmo se afectar por una delecin de la base 9?

e) Qu pasara si la T de la posicin 26 cambia por A?

f) Pudiera una mutacin simple provocar la aparicin de histidina en el pptido?

3. Cules de los siguientes son pasos en la sntesis de protenas en procariotas?


(A) Unin de tRNAiMet a una subunidad ribosomal 30S .
(B) Unin de un tRNA cargado a una subunidad ribosomal 70S .
(C) Acoplamiento de un aminocido al ribosoma por una aminoacil sintetasa
(D) Separacin del ribosoma 70S para formar partculas 30S y 50S.

4. Cules de los siguientes planteamientos, referidos a ARNt son verdaderos?


a. Son necesarios porque los aminocidos no pueden adherirse a ARNm
b. Son sintetizados sin necesidad de un ARNm intermediario.
c. Unen aminocidos sin necesitar enzimas que catalicen esa reaccin.

58
5. Los ribosomas estn involucrados en todos los eventos que a continuacin se
plantean, EXCEPTO:
(A) Formacin del enlace peptdico

(B) Aminoacilacin de tRNA

(C) Unin de factores proteicos durante elongacin

(D) Unin de aminoacil-tRNA a mRNA

(E) Unin de mRNA a un codn de iniciacin

6. En algunas especies de rana, huevos fertilizados son producidos pero no


forman nucleolos. Cul pudiera ser la consecuencia de la ausencia del
nucleolo?

7. Con cul polaridad son sintetizadas las protenas en los ribosomas?

8. Con cul polaridad es ledo mRNA?

9. En una clula bacteriana, una mutacin en una aminoacil-tRNA sintetasa


conduce a cargar todas las molculas de tRNASer con alanina. Cul de los
siguientes complementos describe el resultado de usar estos aminoacil-tRNA
para la sntesis de protenas en la clula?

(A) Alanina- tRNASer no funcionar en la sntesis de protena.

(B) Protenas sintetizadas usando Alanina- tRNASer no contendrn serina ni


alanina.

(C) Protenas sintetizadas usando Alanina- tRNASer contendrn slo serina


donde normalmente aparecera alanina.

(D) Protenas sintetizadas usando Alanina- tRNASer contendrn slo alanina


donde normalmente aparecera serina.

(E) Protenas sintetizadas usando Alanina- tRNASer contendrn azarosamente


alanina o serina donde normalmente aparecera serina.

59
10. Respecto al cdigo gentico diga:

a) Concepto.

b) Caractersticas.

11. Dos investigadores reportan haber obtenido un mutante de una protena cuyo
aminocido 34 es normalmente fenilalanina. Uno dice que el mutante en esa
posicin contiene leucina, en tanto el otro asegura que el suyo contiene histidina.
Cul de los dos es ms probable que est en lo cierto? Utiliza para responder el
cdigo gentico.

12. El 70% de los pacientes con fibrosis qustica presentan un borramiento del
codn 508 (UUC) del gen que codifica un canal de Cl-. Cul ser la anormalidad
que presenta la protena?

13. Con respecto a la regulacin de la expresin gentica responda marcando con


una X la respuesta correcta:

A. En la estructura del opern se encuentra:

a. ___ Gen regulador.

b. ___ Gen estructural o cistrn.

c. ___ Protena represora.

B. La induccin de la sntesis proteica se caracteriza porque el:

a) ___ Represor se une al ADN bacteriano.

b) ___ Correpresor se une a la protena represora.

c) ___ Inductor se une al represor.

C. La represin de la sntesis proteica se caracteriza por:

a) ___ La unin del correpresor al represor.

b) ___ La activacin de la sntesis proteica.

c) ___ La modificacin de la actividad de las enzimas.

60
14. Cul de las siguientes secuencias de eventos ocurre cuando E. coli es
liberada de la represin por catabolito por transferencia a un medio de baja
concentracin de glucosa?

(A) Concentracin de cAMP se incrementa, cAMP se une a CAP. El complejo cAMP-


CAP se une a un sitio del DNA y se activa la transcripcin.

(B) Concentracin de cAMP se incrementa, cAMP se une a CAP. El complejo cAMP-


CAP se une a un sitio del DNA y la transcripcin disminuye.

(C) Concentracin de cAMP se incrementa, cAMP se une a CAP. El complejo cAMP-


CAP es removido de un sitio del DNA y se activa la transcripcin.

(D) Concentracin de cAMP disminuye, cAMP es removido de CAP. CAP se une a un


sitio del DNA y se activa la transcripcin.

(E) Concentracin de cAMP disminuye, cAMP es removido de CAP. CAP se une a un


sitio del DNA y la transcripcin disminuye.

15. En una experiencia se hace crecer E. Coli en un medio con 15N en ausencia
de lactosa. Despus de un tiempo se transfieren a un medio que contiene 14N y
lactosa. Se analiza la enzima b-galactosidasa y se ve que sus aminocidos
contienen 14N y no 15N.

a) Por qu se dice que esta experiencia apoya la idea de la induccin


enzimtica?

b) Qu esperara usted encontrar si la bacteria se hiciera crecer primero en 14N


y despus en 15N? Si lo que se hubiera analizado hubiera sido el ARNm
correspondiente, cules seran los resultados obtenidos?

16. Respecto al cncer responda:

a) Concepto.

b) Caractersticas de las clulas cancerosas.

17. Explique el mecanismo molecular de la transformacin cancerosa.

18. Qu ventaja representa la utilizacin de protenas producidas por Ingeniera


Gentica a partir de genes humanos sobre el empleo de esas mismas protenas
obtenidas de una fuente animal?

19. Por qu en las enfermedades moleculares se afecta fundamentalmente la


estructura y funcionamiento de una protena?
61
20. La hemoglobina S contiene valina en vez de glutmico en la posicin 6 de la
cadena b. Proponga un posible evento mutacional que la pueda haber originado.
Cuntas cadenas b diferentes en esa misma posicin pueden obtenerse por una
mutacin simple?

21. Cmo pudiera Ud. explicar el hecho de que si todas las clulas humanas
tienen el mismo genoma, solamente las clulas hepticas y las renales pueden
sintetizar la enzima glucosa 6-fosfatasa?

BIBLIOGRAFIA:

1. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, captulo 29,30,34, Ribosomas,


Traduccin

2. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, capitulo 30 Traduccin

3. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, capitulo 34, Regulacin de la


expresin gentica

4. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV, capitulo 76, Enfermedades


Moleculares

62
CLASE TALLER 9.
TEMA VI. Organismos pluricelulares.
Titulo: Sistema de seales. Papel de los receptores en la comunicacin celular y
en los sistemas de transduccin de seales.
Sumario:
Tipos de seales.
Comunicacin a corta distancia.
Comunicacin a distancia.
Tipos de receptores.
Contenido:
Caractersticas generales de los organismos pluricelulares. Las uniones
intercelulares. Tipos de comunicacin. Papel de los receptores en la
comunicacin. Modelos de receptores de membranas e intracelulares.
Introduccin:
Una de las caractersticas que distinguen a los organismos pluricelulares de los
unicelulares es la comunicacin entre las clulas que los componen. La
comunicacin es imprescindible para que el organismo pluricelular responda como
un todo nico ante estmulos internos y externos. En el fenmeno de la
comunicacin celular juegan un papel clave los receptores en la captacin de la
seal y en la transduccin de la misma.

Objetivo1
. Definir las caractersticas generales de los organismos pluricelulares as como el
concepto de diferenciacin y especializacin celular.
1. Lea detenidamente el folleto del material de apoyo a la docencia sobre
organismos pluricelulares y defina el concepto de diferenciacin y especializacin
celular as como las caractersticas generales de los organismos pluricelulares.
Objetivo2
. Definir los componentes de un sistema de comunicacin celular.

63
2. Lea detenidamente la pg. 1 del Material Complementario de Comunicacin
Celular y complete los cuadros en blanco en el siguiente esquema.
a) Resuma las caractersticas de cada componente de un sistema de
comunicacin intercelular.

Objetivo 3:

. Establecer una comparacin entre los diferentes tipos de seales intercelulares.

3. Luego de revisar en la pgina 1010 tomo III del texto Cardell de Bioqumica
Medica de, los tipos de seales qumicas que se liberan durante la comunicacin
celular, establezca una comparacin entre cada uno de ellas que contemple los
siguientes aspectos: tipo de clula que la sintetiza y libera y si dicha seal ejerce
su accin a corta o larga distancia.

Objetivo 4:

. Caracterizar los diferentes tipos de comunicacin a corta distancia.

4. Analice el folleto MATERIAL DE APOYO y establezca una comparacin entre


la comunicacin directa o tipo Gap y la sealizacin por contacto que incluya tipo
de protenas que interviene en cada una de las comunicaciones y entre qu tipo
de clulas se establece la misma (del mismo tipo o clulas diferentes).

Objetivo 5:

. Caracterizar los diferentes tipos de comunicacin a distancia.

6. Lea detenidamente el acpite de comunicacin a distancia del material de


apoyo sobre organismos pluricelulares puesto a su disposicin y llene los
espacios en blanco en el siguiente cuadro.

64
TIPO de TIPO de LUGAR HACIA CLULA DIANA
COMUNICACIN SEAL DONDE SE LIBERA
LA SEAL
Espacio intersticial La misma que
elabora y libera la
seal
Paracrina

Hormona Clula distal

6. Analice el acpite comunicacin telecrina o endocrina que aparece en el folleto


de material de apoyo sobre el tema organismos pluricelulares y confeccione un
resumen en el que aparezcan la clasificacin de las hormonas segn su
composicin qumica y algunos ejemplos de las mismas pertenecientes a cada
grupo.

Objetivo 6:

. Conocer el papel de los receptores en la comunicacin celular.

7. Responda la pregunta 4 pg. 1035 Tomo III del texto Bioqumica Mdica de
Cardell y colaboradores

8. Analice el acpite Receptores que aparece en el folleto de material de apoyo


sobre el tema organismos pluricelulares y clasifique los receptores segn su
localizacin celular. Luego realice una comparacin entre ambas clases de
receptores que incluya tipo de seal u hormona segn su composicin qumica
que se une a cada uno de ellos y mecanismos de accin hormonal en cada uno de
ellos.

9. Haga un esquema que muestre todos los eventos que se desencadenan cdo
una seal se une a los receptores acoplados a la protena Gs.

10. Analice detalladamente el folleto complementario de material de apoyo sobre


organismos pluricelulares y diga cuales son los puntos de regulacin en el caso
del modelo del receptor del glucagn y diga cul es la importancia de los mismos.

11. Analice el acpite receptores que tienen actividad tirosin quinasa pg. 1027
Tomo III del texto Cardell y cols. y realice una caracterizacin estructural y
funcional de este tipo de receptor.

65
12. Luego de analizar el material de apoyo sobre organismos pluricelulares realice
una comparacin entre los receptores acoplados a la protena G trimrica y
aquellos con actividad tirosin quinasa intrnseca en cuanto a:

Tipo de Seales q se Protenas Quinasas Segundos Mecanismo


Receptor unen al mismo activadas por la mensajero de accin
unin seal- s
receptor liberados.
Acoplado a la AMPc
Protena Gs
trimrica.

Hormona Protena Quinasa Acta por


Insulina, B, protena varios
factores de Quinasa C, mecanismos*
crecimiento. ISPK.
* Explique el por qu del planteamiento anterior.

13. Lea detenidamente el capitulo 59, Tomo III del Texto Cardell y responda la
pregunta 3 al final de dicho capitulo.

14. Realice un resumen sobre receptores intracelulares que incluya: clasificacin


de los receptores intracelulares segn su localizacin, tipo y ejemplos de seales
que se unen a cada uno de ellos.

Ejercicios de Autoevaluacin.

15. Qu semejanzas y diferencias existen entre la especializacin y


diferenciacin celular? Exprese con sus palabras la importancia de estos
fenmenos en la comunicacin intercelular.

16. Diga si son verdaderos (V) o (F) los siguientes planteamientos. Justifique los
falsos.

__ En un sistema de comunicacin, la clula emisora es la que presenta el


receptor que capta la seal.

__En la comunicacin tipo Gap, la clula receptora no requiere de receptores para


la sustancia producida en la clula emisora.

__En la comunicacin por contacto, dos clulas intercambian informacin a travs


de molculas ancladas a la superficie externa de la membrana celular.

__En la comunicacin autocrina la clula diana es una clula adyacente.

__La sinapsis neuromuscular se considera un tipo de comunicacin paracrina.

66
__Las hormonas son los tipos de seales en la comunicacin endocrina.

__Las hormonas se caracterizan por tener muy baja especificidad por clulas
dianas.

__Las hormonas hidrofbicas o apolares tiene su receptor en la membrana


plasmtica.

__Las hormonas que contengan su receptor intracelularmente actan


predominantemente por un mecanismo de aumento o disminucin de la sntesis
proteica (induccin o represin).

__La naturaleza qumica de todos los receptores es lipdica.

__El neurotransmisor Acetilcolina ejerce poco tiempo sus efectos debido a su


inactivacin casi inmediata por la enzima acetilcolinesterasa.

__Cuando la Acetilcolina reacciona con su receptor, produce una entrada de iones


Cloruros al interior de la clula postsinptica.

__Cuando el glucagn interacta con su receptor, la subunidad alfa de la protena


G de forma permanente siempre va a contener GTP en su interior.

__El glucagn y las catecolaminas elevan intracelularmente el segundo mensajero


AMPc.

__El AMPc inhibe a la enzima Protein Quinasa A.

__El mecanismo de accin del glucagn es alterar la cantidad de las enzimas


intracelulares.

__El receptor de la Insulina es del tipo transmembranal con actividad tirosin-


quinasa en su dominio intracelular.

__El mecanismo de accin de la Insulina es alterar la cantidad de enzimas.

__La Insulina provoca en sus clulas dianas la liberacin de AMPc.

__La insulina inhibe la Protein Quinasa A al activar la enzima fosfodesterasa.

__Una alteracin en la unin de la insulina a su receptor (insulino-resistencia)


provocara la no activacin en sus clulas diana de las protein quinasa B y C.

__El receptor para las hormonas tiroideas es de tipo intracelular citoslico.

__ Las hormonas tiroideas actan por un mecanismo de induccin-represin de la


sntesis enzimtica.

67
BIBLIOGRAFA:

1. Cap. 4, Tomo I pgs. 44-9. Texto Bioqumica Mdica de Cardell y


colaboradores.

2. Cap. 59, Tomo III Texto Bioqumica Mdica de Cardell y colaboradores.

3. Folleto complementario Material de Apoyo sobre Organismos Pluricelulares.

68
GUAS PARA PRCTICAS LABORATORIO

69
PRACTICA LABORATORIO 1
TEMA II. Biomolculas.
Ttulo: Identificacin de macromolculas

Actividad: 11

Duracin: 90 min.

Bibliografa: Bioqumica Mdica Tomo I. Estructura del glucgeno, pag 154-155.


Punto isoelctrico de las protenas pag 213-214.Electroforesis pag 214-215.

Objetivos especficos:

1. Identificar experimentalmente de la presencia de polisacridos y protenas en una


muestra problema.
2. Identificar la fraccin de protenas del suero humano normal presente en la
muestra problema mediante tcnica de electroforesis de zona en acetato de
celulosa.
3. Determinar experimentalmente del punto isoelctrico de la casena.
Sumario:

1. Presentacin del problema a resolver.


2. Procedimientos para resolver el problema planteado.
3. Realizacin de las tcnicas correspondientes
4. Discusin de los resultados

Habilidades a desarrollar
Identificar diferentes macromolculas, fracciones de protenas del suero humano
mediante la tcnica de electroforesis y punto isoelctrico de una protena.
Desarrollar habilidades manuales en el empleo de la cristalera, utensilios y equipo
de electroforesis
Interpretar resultados experimentales
Desarrollar habilidades comunicativas en idioma espaol mediante la exposicin
oral de los resultados de los experimentos.
Aspectos tericos de la prctica de laboratorio que debes dominar previo a su
desarrollo y que sern objeto de una pregunta inicial que junto a los
resultados que obtengas y la interpretacin acertada de los mismos
conformaran la evaluacin de la practica.

70
Comienza por revisar la bibliografa indicada: Bioqumica Mdica Tomo I.
Estructura del glucgeno, pag 154-155. Punto isoelctrico de las protenas pag
213-214.Electroforesis pag 214-215.

Reacciones generales de identificacin de macromolculas:


Cuando se le aade el reactivo de Lugol a una solucin acuosa donde est presente
el glucgeno, la misma adquiere una coloracin carmelita rojiza o caoba. El reactivo
de Lugol contiene una mezcla de yodo y de yoduro de potasio en solucin alcohlica
y la coloracin al ponerse en contacto con el glucgeno se debe a que se forma un
complejo de inclusin del yodo dentro de la molcula del polisacrido que le hace
adoptar la coloracin caracterstica antes sealada.

La presencia de protenas en una disolucin puede ponerse de manifiesto por un


gran nmero de ensayos. Entre los mtodos ms utilizados se destaca la prueba de
Biuret, el que ser utilizado en esta prctica. Compuestos con ms de un enlace
peptdico producen un cambio de la coloracin del reactivo, de azul a purpura,
cuando reaccionan con el Cobre (II) en medio alcalino que contiene. El compuesto
que se obtiene de la reaccin es el Biuret, un dmero de laurea que da el nombre al
ensayo.

La identificacin de los cidos nucleicos se realiza teniendo en cuenta uno de los 3


componentes: el azcar, las bases nitrogenadas o el cido fosfrico.

Propiedades fsico qumicas de las protenas: punto isoelctrico.


Las interacciones electrostticas de los grupos qumicos en las cadenas laterales de
los aminocidos que pueden cargarse (carga negativa en los cidos y positivas en
los bsicos) dependen de la concentracin de hidrogeniones del medio (pH),
existiendo un valor de pH para el cual la carga neta de la protena es cero y la
solubilidad de la protena se ve reducida hasta el punto de producirse la
precipitacin. En estas condiciones la protena adopta una conformacin
filamentosa, la capa de molculas de agua no recubre completamente a las
molculas proteicas, las cuales tienden a unirse entre s dando lugar a grandes
partculas que precipitan.

Electroforesis de protenas:
La electroforesis es un mtodo fsico de separacin de macromolculas,
especialmente protenas, mediante la accin de un campo elctrico utilizando la
carga elctrica neta de la macromolcula.

Las protenas pueden adoptar cargas elctricas diferentes en dependencia del pH


del medio en que se encuentren. Estas cargas son conferidas por los grupos
qumicos ionizables de las cadenas laterales de los aminocidos, el amino y el
carboxilo terminal en estrecha relacin con el pH del medio. Si tenemos una
71
solucin de diferentes protenas a un mismo pH las diversas protenas adquieren
cargas elctricas diferentes en virtud de su composicin aminoacdica.

Cuando estas protenas son sometidas a un campo elctrico uniforme entonces


migrarn de forma diferencial en correspondencia con su carga neta y la atraccin
ejercida por el nodo o ctodo. Si la carga neta proteica es positiva, la protena
migrar hacia el ctodo (polo negativo), y hacia el nodo (polo positivo) si la carga
que adquieren es negativa, si la carga neta es cero no migrara.

En esta prctica se realizara una electroforesis separando protenas del plasma


humano. En este caso al pH utilizado todas las protenas del suero estn cargadas
negativamente. El revelado permite darle coloracin a las diferentes fracciones de
protena una vez realizado el procedimiento y se efecta con rojo ponceau.

Problema a resolver:
Cada equipo de estudiantes recibir en el primer momento de la prctica tres
muestras problema, cada una con un nmero que la identifica. Una de las
muestras es una protena perteneciente a una de las fracciones del suero humano,
la otra es una solucin de glucgeno y la tercera de un cido nucleico. El primer
experimento te permitir confirmar cual es el tubo que contiene el glucgeno, en el
segundo tienes que determinar de las dos muestras restantes cual es una
protena y cual un cido nucleico. En el tercer experimento tienes que determinar
mediante electroforesis a que fraccin del suero pertenece la protena identificada.
Finalmente recibirs la cuarta muestra, que en todos los casos contiene una
solucin de casena, una fosfoprotena abundante en la leche y que se precipita
cuando esta es acidificada. Esto se debe a que la casena a cierto valor de pH
alcanza su punto isoelctrico y es ese valor el que precisamente debes averiguar
en esta cuarta experiencia.

Procedimientos para resolver el problema planteado


EXPERIMENTO 1: Identificacin de polisacridos.
Tomar 3 tubos de ensayos, identificar cada tubo con el nmero correspondiente a
las 3 muestras problemas. Agregar a cada tubo 0.5 ml de cada muestra problema.
Aadir en cada uno 3 gotas de reactivo de Lugol. Agitar suavemente. Observar la
coloracin. En el tubo en que se obtenga una coloracin caoba, similar al patrn
de la mesa del profesor, la muestra contiene el glucgeno. Anota el nmero de la
muestra donde encontraste el glucgeno y tu interpretacin de los resultados
obtenidos.
EXPERIMENTO 2: Identificacin de protenas.
Tomar 2 tubos de ensayos, identificar cada tubo con el nmero correspondiente a
las muestras problemas que dieron negativo para el glucgeno. Agregar a cada
tubo 0.5 ml de cada muestra problema y 0.5 ml de reactivo de Biuret. Agitar
suavemente y dejar en reposo por 15 minutos. Observa la coloracin. En el tubo

72
que encuentres un color azul violeta, similar al patrn que tiene el profesor en su
mesa, esa muestra es una protena, y la que se mantiene de color azul, ser
entonces la de cidos nucleicos. Anota el nmero de la muestra donde
encontraste la protena y en cual el cido nucleico. Escribe tambin tu
interpretacin de los resultados obtenidos.

EXPERIMENTO 3: Electroforesis de protenas.


Este procedimiento, dada su complejidad y recursos necesarios se har de forma
demostrativa por el profesor.
El profesor tendr preparado para su comparacin una tira de acetato de celulosa
con la diferentes fracciones de las protenas del suero humano, a una de las
cuales pertenece la protena que usted tiene identificada en una de las muestras
problema. El orden de mayor a menor migracin es albumina, alfa 1 globulinas,
alfa 2 globulinas, beta globulinas y gamma globulinas.
Se Introduce una tira de acetato de celulosa en buffer veronal pH 8.6.
Se extrae la tira y sobre papel de filtro se seca.
Se coloca la tira en la cmara electrofortica y se aplica tu muestra, al lado de una
muestra de suero humano que servir de patrn de referencia de las diferentes
fracciones.
Se enciende el equipo y se espera que transcurra la migracin mediante la
electroforesis.
Observa el grado de migracin de tu muestra de protena y comprala con la
migracin de las diferentes fracciones del suero humano para comprobar a cual
pertenece. Podrs de esta forma saber si la protena de tu muestra corresponde a
la albumina, alfa 1, alfa2, beta o gamma globulinas. Anota tus resultados y la
interpretacin de los mismos.

EXPERIMENTO 4: Determinacin del punto isoelctrico de la casena.


Recibirs por parte del profesor de 3 tubos de ensayo con los siguientes valores
de pH: Tubo 1 pH 4.4, Tubo 2 pH 5.3, Tubo 3 pH 6,0. Agrega a cada tubo 1 ml de
casena. En el tubo que encuentres mayor turbidez, similar al patrn que tiene el
profesor, tiene un pH que se corresponde con la casena y de esta forma lo has
logrado identificar. Anota tus resultados y la interpretacin de los mismos.
Esperamos que te prepares cuidadosamente siguiendo esta gua. Cualquier
duda debes consultarla con tu profesor.
Te deseamos xitos en esta, tu primera prctica de laboratorio
Colectivo de profesores de Biologa Molecular.

73
PRCTICA DE LABORATORIO NO. 2

Tema IV: Biocatalizadores

Actividad: 22

Ttulo: Determinacin de indicadores cinticos de la actividad enzimtica de


la alfa amilasa salival.

FOD: Prctica de laboratorio

Duracin: 90 min.

Elaborado por: Dr. Alfredo Gutirrez Maydata. Profesor Auxiliar.

Bibliografa: Bioqumica Mdica Cardell Tomo I Cap Cintica Enzimtica. Pag


285-292

Objetivos especficos:

1. Identificacin de la influencia del pH sobre la actividad enzimtica.


2. Identificacin de la influencia de la temperatura sobre la actividad enzimtica.
3. Identificacin de la influencia de la concentracin de enzima sobre la actividad
enzimtica.

Sumario:

1. Presentacin del problema a resolver.


2. Procedimientos para resolver el problema planteado.
3. Realizacin de las tcnicas correspondientes
4. Discusin de los resultados
Habilidades a desarrollar
1. Identificacin experimental de la influencia de diferentes factores sobre la
actividad de la enzima alfa amilasa salival.
2. Desarrollar habilidades manuales en el empleo de la cristalera, utensilios y
equipos de laboratorio
3. Interpretar resultados experimentales
4. Desarrollar habilidades comunicativas en idioma espaol mediante la
exposicin oral de los resultados de los experimentos.
Aspectos tericos de la prctica de laboratorio que debes dominar previo a su
desarrollo y que sern objeto de una pregunta inicial que junto a los
resultados que obtengas y la interpretacin acertada de los mismos
conformaran la evaluacin de la misma.

74
Las enzimas son protenas que catalizan una gran cantidad de reacciones
biolgicas. Como cualquier catalizador, las enzimas aumentan la velocidad de la
reaccin que facilitan, pero no afectan la constante de equilibrio de esta. Su accin
se produce por una disminucin en la energa de activacin de las sustancias
reaccionantes.

Por su naturaleza proteica y a diferencia de otros catalizadores inorgnicos, las


enzimas son sensibles a condiciones extremas de pH, temperatura etc., y
catalizan las reacciones biolgicas en condiciones suaves, semejantes a las que
se encuentran en clulas y fluidos biolgicos. Las condiciones drsticas
desnaturalizan a lasenzimas dada su naturaleza proteica, lo que conlleva a una
prdida de su poder cataltico.

La cintica enzimtica tiene por objeto el estudio de la velocidad de las reacciones


catalizadas por enzimas, as como los factores que en ella influyen y los
mecanismos por los cuales transcurren.

La velocidad de las reacciones enzimticas se puede medir:

-Por la cantidad de sustrato que desaparece en la unidad de tiempo.

-Por la cantidad de producto que aparece en la unidad de tiempo.

En esta prctica de laboratorio se comprobara la influencia de la concentracin de


la enzima, el pH y la temperatura en la cintica de la enzima alfa amilasa de la
orina en su accin sobre los enlaces alfa 1-4 del almidn. Para ello nos basaremos
en la desaparicin del almidn en la unidad de tiempo mediante el seguimiento de
la reaccin de Lugol.

Basndote en las reacciones anteriores podrs estudiar el efecto que provocan en


la cintica enzimtica la variacin de los factores que en ella influyen:
Concentracin de enzimas, pH y temperatura. La influencia de la concentracin de
enzimas podremos estudiarla midiendo la velocidad de la reaccin de la forma ya
descrita, pero utilizando diferentes concentraciones de enzimas y manteniendo
constante los dems factores. En el caso del estudio de la influencia del pH y la
temperatura, se ensayara la actividad de la enzima a diferentes valores de pH y
temperatura, con la reaccin de Lugol.

Es importante que revises los contenidos referidos a cintica enzimtica, en


particular como los 3 factores arriba sealados afectan la velocidad de las
reacciones catalizadas por enzimas utilizando la bibliografa arriba recomendada
del captulo "Cintica Enzimtica" pag 285-292 Tomo I de Cardell.

75
1. Problema a resolver :
Obtendrs una muestra de orina de ms de un compaero de tu equipo de trabajo
colectada en un beaker que te ofrecer tu profesor. A continuacin hars un pool
de ellas mezclando cierta cantidad de cada una en un beaker mayor, y ser esta
mezclala que utilizars como fuente de la enzima alfa amilasa pancretica para tus
experimentos. Debes determinar entonces la temperatura ms adecuada de
trabajo y el pH ptimo de la enzima. Con esto se concluye la primera parte de la
actividad prctica. En tu mesa de trabajo aparecen 3 frascos enumerados que
constituyen tus muestras problemas y en la segunda parte de la prctica debes
determinar cual tiene mayor concentracin de la enzima y cual la menor.

1. Procedimientos para resolver el problema planteado


EXPERIMENTO 1: Estudio de la influencia de la temperatura.

Toma 3 tubos de ensayos y aade a cada uno 0.5 ml de la orina recolectada en tu


mesa de trabajo.

Agregarle a cada tubo 0.5ml del tampn que est rotulado en tu mesa de trabajo
como pH ptimo. Incubar durante 5 minutos a cada temperatura investigada, un
tubo a 100 grados centgrados, otro a 37 y el tercero en un bao de hielo.

A ese tiempo exacto agrgale 0.5 ml de solucin de almidn a los 3 tubos de


ensayo. Incubar de nuevo cada tubo a la temperatura correspondiente.

A los 5 minutos agregar a todos los tubos 0.5ml del reactivo de Lugol. Para
observar con ms claridad los resultados agregar 7 ml de agua destilada.

Con los datos obtenidos concluye cual es la temperatura adecuada para estudiar
la alfa amilasa y esa ser la que utilizars en los restantes experimentos. Apyate
en los colores que toma el blanco y el patrn que estn en la mesa del profesor.

Describe y anota los resultados en la hoja que entregars al profesor.

EXPERIMENTO 2: Estudio de la influencia del pH sobre la actividad de la alfa


amilasa salival.

Toma 3 tubos de ensayos. Agrega a cada uno 0.5 ml del pool de orina recolectada
y 0.5 ml de la solucin de tampn del pH que ser investigado en la prctica: a un
tubo el tampn de pH 3,5 , al segundo tubo el tampn de pH 7,0 y al tercer tubo el
tampn rotulado como pH 10,5.

Incuba durante 5 minutos a la temperatura comprobada por ti como adecuada.

76
A ese tiempo exacto agrgale 0.5ml de solucin de almidn a los 3 tubos de
ensayo y vuelve a incubar a la temperatura adecuada. A los 5 minutos exactos
agrgale a todos los tubos 0.5 ml del reactivo de Lugol.

Para observar con ms claridad los resultados adele a todos los tubos de
ensayo 7 ml de agua destilada.

Con los datos obtenidos concluye cual es el pH ptimo de la alfa amilasa y ese
ser el que utilizaras en los restantes experimentos. Apyate en los colores que
toma el blanco y el patrn que estn en la mesa del profesor.

Describe y anota los resultados en la hoja que entregars al profesor.

EXPERIMENTO 3: Estudio de la influencia de la concentracin de enzimas.

Toma 3 tubos de ensayo y aade a cada uno 0.5 ml de la muestra problema 1, de


la muestra problema 2 y de la muestra problema 3 respectivamente. Debes de
anotar el nmero que identifica en tu mesa esas concentraciones.

Agrega a cada tubo 0.5 ml del tampn seleccionado por ti como el de pH ptimo.

Incuba durante 5 minutos a la temperatura comprobada por ti como adecuada.

Al cabo de ese tiempo agregar 0.5 ml de solucin de almidn a los 3 tubos de


ensayo.

A los 5 minutos de nueva incubacin agregar 0.5ml del reactivo de Lugol. Para
observar con ms claridad los resultados adele a todos los tubos 7 ml de agua
destilada.

Con los datos obtenidos concluye cul es tu muestra problema ms concentrada y


cul es la ms diluida. Apyate en los colores que toma el blanco y el patrn que
estn en la mesa del profesor.

Describe y anota los resultados en la hoja que entregars al profesor.

Esperamos que te prepares cuidadosamente siguiendo esta gua. Cualquier


duda debes consultarla con tu profesor.
Te deseamos xitos en esta, tu segunda prctica de laboratorio
Colectivo de profesores de Biologa Molecular.

77
GUAS PARA SEMINARIOS

78
Seminario No 1.

Titulo: Significado de los aminocidos en la estructura y propiedades de las

protenas.

Gua del estudiante

Objetivos especficos.

1. Explicar la contribucin de la estructura y propiedades de los a.a.s a la


estructura de las protenas.
2. Interpretar la importancia de la estructura primaria de las protenas.
3. Analizar las caractersticas estructurales de los diferentes niveles de
organizacin conformacional de las protenas.
4. Explicar las propiedades de los pptidos y protenas en base a su
composicin aminoacdica.
SUMARIO.

1. Clasificacin e interacciones.
Su influencia en las secuencias.

2. Niveles de organizacin.
3. Propiedades.
4. Estereoespecificidad conformacional.

PROBLEMA A RESOLVER
Usted ha seleccionado al azar 10 aminocidos que, en ese orden, constituyen
el pptido A. Transcriba en su hoja de trabajo el nombre de los 10 aminocidos
en el orden sealado y deje bien claro la clave que aparece al dorso de la
tarjeta escogida. Conteste todas las preguntas que se le hagan en relacin a los
siguientes tpicos..

I. LOS AMINOCIDOS DEL PPTIDO A.


II. CARACTERSTICAS Y PROPIEDADES DEL PPTIDO A
III. EL PPTIDO A SE COMPARA CON OTROS.
IV. RECONOCIMIENTO MOLECULAR

PREPARACIN INDIVIDUAL

LOS AMINOCIDOS
Es importante que Ud. sea capaz de reconocer las caractersticas estructurales
generales de los aminocidos y su fuente de variacin (cadenas laterales) y cmo
influyen estas sobre las propiedades y funciones. Agrupe los aminocidos segn
la clasificacin estudiada en clases y dentro de estos grupos, analice los grupos
funcionales qumicos que caracterizan sus cadenas. Es importante que domine

79
las cadenas laterales de los aminocidos antes de proseguir su estudio.
Posteriormente, debe estudiar las interacciones dbiles que pueden establecerse
entre las cadenas laterales de diferentes aminocidos. Cambios en la
concentracin de iones, especialmente de protones, tienen repercusiones
profundas en la estructura de los aminocidos y, por tanto, en sus propiedades,
por lo que debe detenerse a analizar las especies inicas a diferentes pH. Por
ltimo, debe detallar la formacin del enlace peptdico y las propiedades del
mismo.

Ejercicios
1. Represente las posibles interacciones que pueden establecerse entre las
cadenas laterales de los siguientes aminocidos con ellos mismos:
a) Serina
b) Isoleucina
c) Cistena
d) Glutamina
e) Valina
2. Represente esquemticamente las interacciones que pueden establecerse
entre las cadenas laterales de los siguientes grupos de aminocidos:
a) Histidina / asprtico
b) Serina / tirosina
c) Valina / leucina
d) Arginina / treonina
e) Leucina / alanina
f) Glutmico / asprtico
3. Analice la estructura de los siguientes aminocidos y diga:
a) las caractersticas comunes
b) las caractersticas diferenciales de cada uno con respecto al otro
c) cmo se clasifican de acuerdo con su polaridad

COO -
COO - COO -
+ NH3 - C - H
+ NH3 - C - H
+ NH3 - C - H
CH2
CH2 CH2
CH2SH
COO- CH2
CH2
COO - COO - CH2

+ NH3 - C - H NH3+
+ NH3 - C - H

CH2 CH3
OH 80
4. Represente esquemticamente el enlace que hace posible la
polimerizacin de los aminocidos.
5. La serina es un aminocido neutro
Represente la especie inica del aminocido cuando se encuentra en un
medio con un pH = P.I.
Represente la especie inica cuando se encuentra en un medio con un pH
=2
Represente la especie inica cuando se encuentra en un medio con un pH
= 12

LAS PROTENAS

La estructura primaria
Ud. debe encaminar el estudio de este aspecto de manera tal que lo capacite para
interpretar la importancia de la estructura primaria de las protenas. Lo primero que
deber precisar son las caractersticas generales de las macromolculas objeto de
estudio: las protenas. Quiere esto decir que en todo momento deber tener
presente el carcter macromolecular y polimrico de las mismas.
Ejercicios
1. Escriba con frmulas la siguiente secuencia polipeptdica:

GLUTMICO- ALANINA SERINA LISINA CISTENA

a) Tendr estabilidad en agua? Por qu?


b) Cules son los grupos qumicos que no estn en la cadena y
forman parte de los aminocidos aislados?
c) Cules son los grupos qumicos que se mantienen presentes?
d) Destaque la estructura que se mantiene repetitivamente a lo largo de
la cadena.
e) Destaque los grupos qumicos que aportan diversidad a la estructura
de la cadena.
f) Presentar carga elctrica la cadena? Cul o cules?
g) Con los mismos aminocidos, construya ahora una cadena diferente.
Cul fue el mtodo empleado para formar la nueva cadena?

81
ESTRUCTURAS DE ORDEN SUPERIOR
El contenido de este aspecto debe desglosarlo para su estudio de la siguiente
forma:

a) Estructura secundaria: qu es?; cules son las fuerzas que la


mantienen?; cmo son sus formas en el espacio?; cul es la relacin con
la estructura primaria?
b) Estructura terciaria: qu es?; cules son las fuerzas que la mantienen?;
cmo son sus formas en el espacio?; cul es la relacin con la estructura
primaria y la secundaria?
c) Estructura cuaternaria: qu es?; cules son las fuerzas que la
mantienen?; qu relacin tiene con los otros niveles estructurales? Qu
posibilidades presentan las protenas con estructura cuaternaria que no
tienen en la estructura terciaria? Qu implicaciones tiene la
transconformacin de una subunidad sobre las otras y sobre la protena en
su conjunto?

Ejercicios
1. Considere un segmento de una cadena polipeptdica capaz de
adoptar una estructura espacial en alfa hlice. Analice la estabilidad
de la misma en un medio acuoso y en un medio apolar. Explique.

2. Represente esquemticamente una cadena de poliglutmico


a Ph fisiolgico. Datos: Considerar que a pH fisiolgico el grupo
carboxilo est disociado
3. Cul de las molculas polialanina o acido poliasprtico sufrir
cambios en su estructura tridimensional por cambios en el pH del
medio. Explique

4. Discuta si la siguiente afirmacin es verdadera o falsa: La


distribucin espacial de una cadena polipeptdica est determinada
solamente por el tipo de aminocidos que la componen.

5. La hemoglobina es una protena formada por cuatro subunidades


(tetramrica): dos alfa y dos beta. Ambos tipos presentan gran
semejanza en su estructura terciaria con la mioglobina, protena
muscular formada por una sola cadena (monomrica). Una diferencia
destacable est en que la posicin de algunos aminocidos
hidrofbicos en las subunidades de hemoglobina se corresponde con
aminocidos hidroflicos en la mioglobina.

a) Cmo puede interpretarse esta informacin con la


generalizacin conocida en cuanto a la distribucin hacia el

82
interior y hacia el exterior de los aminocidos hidrofbicos e
hidroflicos, respectivamente, en las molculas de protenas?

b) Puede obtenerse de la informacin dada, elementos que


permitan explicar la formacin espontnea de estructuras
cuaternarias en algunas protenas?

6. Al analizar dos muestras de protenas, una aislada de hgado de


pollo y la otra aislada de hgado de pavo, se comprueba que ambas
tienen la misma composicin de aminocidos. Podemos concluir
que ambas protenas son idnticas. Explique.

RELACIN ESTRUCTURA - FUNCIN


Durante su estudio debe dar respuesta a las siguientes preguntas: existe alguna
relacin entre la estructura de las protenas y la funcin que ellas realizan?; cmo
puede demostrarse esto?. Debe analizar cmo repercuten los cambios de la
estructura primaria en la estructura tridimensional y si cualquier cambio afectar
de la misma forma. Asimismo, analizar si todas las protenas sern sensibles
igualmente a los cambios en las condiciones del medio (pH, temperatura). Se
debe resaltar el Reconocimiento Molecular como forma bsica de expresin de
la informacin conformacional.

Ejercicios
1. Cmo puede explicarse que si la estructura primaria de
las protenas no depende del medio de disolucin, su
funcionamiento s?
2. Los anticuerpos son molculas de protenas que poseen
sitios de unin que se complementan con las
caractersticas estructurales de las molculas de antgeno.
Cules sern las caractersticas del antgeno y el
anticuerpo para establecer dicho reconocimiento
molecular?

Basndose en los conocimientos adquiridos sobre el reconocimiento molecular y


los cambios conformacionales de las protenas, justifique la posibilidad de las
molculas de hemoglobina como transportadoras sanguneas de oxgeno de los
pulmones a las clulas y de bixido de carbono desde las clulas hacia los
pulmones

83
Seminario No 2.

Titulo: Los cidos Nuclecos. Estructura y funcin.

Gua del estudiante

BIBLIOGRAFIA:

Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Capitulo 11 Estructura de los


cidos Nuclecos

Objetivo General:
. Explicar las propiedades estructurales y funcionales de los cidos nuclecos.

Sumario:
1. Estructura general de los cidos Nuclecos.
2. Tipos principales: ADN y ARN.
3. Funciones.
4. Estructura primaria y secundaria del ADN: Modelo de Watson y Crick.
5. ARN: tipos. Caractersticas estructurales y funcionales de cada tipo.
6. ARN de transferencia: estructuras secundaria y terciaria. Relacin Estructura-
Funcin.
7. ARN ribosomal. Propiedades y funciones.
PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA
PARA EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

a. Definir los tipos principales de cidos Nuclecos.


b. Diferenciar desde el punto de vista estructural ambos tipos de cidos
Nuclecos.
c. Definir las funciones del ADN.
d. Definir la estructura primaria del ADN.
e. Interpretar el concepto de Informacin Gentica
f. Describir la estructura secundaria del ADN, modelo del ADN B de
Watson y Crick.
g. Definir las reglas de Chargaff.
h. Explicar la relacin Estructura-Funcin en el ADN.
i. Definir la estructura terciaria del ADN: Complejo ADN-Protenas.
j. Definir las caractersticas generales de los ARNs.
84
k. Explicar la relacin estructura-funcin del ARN de transferencia
basado en su estructura secundaria.
l. Explicar la relacin estructura-funcin del ARN ribosomal.

Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la


encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la
bibliografa del contenido.

El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a estudiantes


previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de rebote y se realizar
una pregunta escrita inicial a todos
.

85
Seminario No 3.

Titulo: Cintica Enzimtica.

Gua del estudiante

BIBLIOGRAFA:
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 16, Cintica
Enzimtica Tomo I.

Objetivo General:
. Explicar a nivel molecular, los efectos que sobre la Velocidad de Reaccin
catalizadas por enzimas, ejercen diferentes factores.
Sumario:
1. Condiciones para los estudios cinticos.
2. Efecto de la concentracin de Enzima.
3. Efecto de la concentracin de sustrato.
4. Efecto de la concentracin de cofactores.
5. Efecto de la temperatura.
6. Efecto del pH.
7. Efectos de los inhibidores.
El estudio de los cambios en la Velocidad de reaccin de las enzimas bajo
condiciones controladas, ha sido muy beneficioso para comprender entre otros
aspectos los mecanismos de accin enzimtica adems del estudio de los efectos
de sustancias o compuestos que afectan la actividad cataltica de las enzimas y el
uso de estos ltimos como frmacos.

PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA PARA


EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

1. Definir el concepto e importancia de Velocidad Inicial (Vo)

2. Explicar a nivel molecular el efecto de la concentracin de Enzima en la


Velocidad de Reaccin.

3. Interpretar el significado de los parmetros cinticos KM y Vmax.

4. Explicar a nivel molecular el efecto de la temperatura y cambios en pH en la


Velocidad de Reaccin catalizada por enzimas.

5. Explicar a nivel molecular el efecto de los inhibidores competitivos en la


Velocidad de la Reaccin.
86
6. Explicar a nivel molecular el efecto de los inhibidores no competitivos en la
Velocidad de la Reaccin.

7. Definir los parmetros cinticos que se alteran ante la presencia de cada uno
de los inhibidores.

Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la


encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la bibliografa del
contenido.

El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a estudiantes


previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de rebote y se realizar
una pregunta escrita inicial a todos

87
Seminario No 4.

Titulo: Regulacin de la Actividad Enzimtica. .

Gua del estudiante

BIBLIOGRAFA:
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 17, Cintica
Enzimtica Tomo I.

Objetivo General:
. Interpretar a nivel molecular los diferentes mecanismos que regulan la actividad
enzimtica.

SUMARIO

1. La modificacin alostrica: Modelo simtrico o concertado.


2. La modificacin covalente. Caractersticas. El modelo de la glucgeno
fosforilasa.
3. El fenmeno de amplificacin, su importancia.

En el seminario anterior estudiaron como influyen la variacin de ciertos factores


en la actividad de las enzimas, reflejados en cambios en su Velocidad de reaccin.
El estudio en condiciones controladas en el laboratorio del comportamiento
enzimtico ante estos factores es de mucha importancia pero vale sealar que en
las condiciones reales en el organismo, salvo excepciones, la concentracin del
sustrato y cofactores es constante, mantenemos una temperatura corporal
constante y regulada al igual que el pH en los diferentes compartimentos y los
inhibidores enzimticos son sustancias fabricadas artificialmente en algn
laboratorio. Existen enzimas que pueden variar su comportamiento, entindase
Velocidad de Reaccin, ante cambios producidos en su propio entorno, ya sea
intracelular o cambios en el organismo. Estas enzimas regulables son de
extremada importancia para mantener la homeostasia en el organismo y logran
cambiar su actividad cataltica mediante dos mecanismos fundamentales:
Regulacin alostricas y modificacin covalente.

PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA PARA


EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

1. Definir las formas bsicas de regulacin enzimtica.

2. Describir los componentes de un sistema de regulacin.

3. Definir las caractersticas de las enzimas alostricas.


88
4. Interpretar a nivel molecular el fenmeno de la cooperatividad.

5. Explicar el modelo simtrico o concertado.

6. Relacionar la presencia del sitio alostricos en la estructura de las enzimas con


su comportamiento cintico.

7. Describir las generalidades del mecanismo por modificacin covalente.

8. Explicar la importancia de la presencia de otras enzimas en el mecanismo de


regulacin covalente.

9. Explicar la importancia del mecanismo de amplificacin que se observa en


algunas de las enzimas sujetas a mecanismo de modificacin covalente.

Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la


encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la bibliografa del
contenido.

El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a estudiantes


previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de rebote y se realizar
una pregunta escrita inicial a todos
BIBLIOGRAFA:
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 17, Cintica
Enzimtica Tomo I.

89
Seminario No 5.

Titulo: Relacin estructura funcin y propiedades de los componentes de las


membranas biolgicas.

Gua del estudiante

BIBLIOGRAFA:
Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 20, Tomo II.
Objetivo General:

Interpretar la relacin entre las caractersticas estructurales de los


componentes de las membranas y las funciones que ellos desempean.

Sumario:
1. Caractersticas generales de las membranas biolgicas.

2. Componentes de las membranas biolgicas.

a) Relacin estructura funcin en los lpidos

b) Relacin estructura funcin en las protenas

c) Relacin estructura funcin en los glcidos

3. Receptores de membranas.

La interpretacin actual de la estructura y organizacin molecular de la membrana


plasmtica se fundamenta en el modelo del mosaico fluido modificado, donde la
estructura caracterstica, es una bicapa lipdica compuesta fundamentalmente por
molculas de fosfolpidos y colesterol en la cual se insertan molculas de
protenas que pueden actuar como protenas estructurales o integrales,
trasportadoras y como receptores de membrana, todos en interrelacin
permitiendo cierto movimiento de lateralizacin y rotacin debido a su estructura y
a su composicin molecular fundamentalmente a las interacciones no covalentes,
lo que explica las propiedades fsicas, qumicas y biolgicas de las membranas y
que es hoy aceptado universalmente.
Debes comenzar revisando la videoconferencia, luego realiza una lectura rpida
de las pginas indicadas del texto Bioqumica Medica Cardell. Vers que luego
del concepto general de sistemas de membrana comienzan a abordar sus
componentes ms abundantes.
En el caso de los lpidos de membrana te recomendamos que observes bien sus
estructuras y leas su composicin y funciones, pero no es necesario que
memorices todo, sino que resumas cuales son los lpidos que componen la
membrana, que caractersticas tienen en comn y algunas otras funciones que
estos desempean. Por qu los que aparecen en la membrana se organizan en
forma de bicapas?

90
En las protenas es fundamental resaltar que son las responsables de la
diversidad funcional de la membrana, por eso en el texto est bastante escueto al
inicio y luego se profundiza al tratar cada una de las funciones inherentes a las
membranas. Puedes profundizar sobre esto en el texto de Bioqumica de Cardell
tomo II captulo 20. Sobre los glcidos debes destacar su papel funcional y
localizacin asimtrica.

Finalmente el modelo del mosaico fluido te permitir una visin de conjunto sobre
la estructura de la membrana.

Es importante destacar que en esta organizacin se guarda cierta asimetra, pues


existen diferencias entre las superficies internas y externas, o sea hay distribucin
desigual de los componentes moleculares que forman parte de la membrana
pudindose encontrar los mismos formando parte de la cara citoplasmtica y en
otros casos de la cara extracelular. A pesar de esta particularidad de forma
general se mantiene similar organizacin y composicin de todas las membranas
de la clula, lo que justifica la utilizacin del trmino unidad de membrana. Para
resumir cules son las propiedades fisiolgicas y en que consiste cada una, debes
basarte tambin en el texto bsico.
Por su naturaleza apolar la bicapa lipdica de las membranas acta como barrera
impermeable para los iones y las molculas polares con excepcin del agua.

PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA PARA


EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

1. Explicar relacin estructura-funcin en los lpidos de membrana.


2. Interpretar los factores que regulan la fluidez de la membrana.
3. Enunciar los factores que propician asimetra de las membranas.
4. Clasificar las protenas de membrana segn su interaccin con los dems
componentes estructurales de la misma.
5. Definir las funciones de las protenas de membrana.
6. Enunciar las funciones de los glcidos de membrana.
7. Describir el modelo de membrana de mosaico fluido.
9. Definir las funciones de las membranas biolgicas.
10. Definir la naturaleza qumica y las funciones de los receptores de membrana.
11. Interpretar la relacin estructura-funcin en el caso de las aquaporinas.

Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la


encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la bibliografa del
contenido.

91
El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a estudiantes
previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de rebote y se realizar
una pregunta escrita inicial a todos

BIBLIOGRAFA:
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 20, Membranas
Biolgicas Tomo II.

92
Seminario No 6.

Titulo: Replicacin y transcripcin del ADN..

Gua del estudiante

BIBLIOGRAFA:
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 24 Flujo Celular de
Informacin: Ciclo Celular y su Regulacin, pgs. 429-37, Tomo II.
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 25 Replicacin del
ADN Tomo II
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 26 Organizacin del
Genoma Eucarionte Tomo II
. Cardell-Hernndez y autores Bioqumica Mdica. Captulo 27 Transcripcin del
ADN Tomo II

Objetivo General:
. Interpretar a nivel molecular los eventos que ocurren durante el ciclo celular as
como su regulacin.
. Interpretar a nivel molecular los eventos que ocurren durante la Replicacin y
Transcripcin del ADN.

Sumario:

- Componentes y ciclo celular: Caractersticas morfofuncionales de sus


componentes. Ciclo celular. Concepto. Fases. Categoras celulares y su
relacin con el ciclo celular.
- Replicacin del ADN: Significacin biolgica. Desnaturalizacin del ADN.
Organizacin del genoma en eucariontes. Reparacin y recombinacin.
- Transcripcin del ADN: Significacin biolgica. Cambios postranscripcionales
del ARN.

Este es el primer seminario del Tema Gentica Molecular. Antes de comenzar el


estudio de este Tema debes tener presente aspectos estudiados anteriormente que
son importantes que recuerdes como por ejemplo, la relacin estructura-funcin de
los cidos nuclecos.

Debes al comenzar el estudio de este tema conocer el concepto de Informacin


Molecular, formas de Informacin Molecular y la transferencia de la Informacin
Molecular. En relacin al acpite ciclo celular y su regulacin, debes conocer
primeramente el concepto del mismo, as como las etapas que lo componen y los
eventos ms importantes que ocurren en cada una de ellas. El estudio del ciclo
celular culmina con la regulacin del mismo y para ello debes definir el papel clave
de las ciclinas y CDK (Quinasas dependiente de ciclinas) en su regulacin. Todo lo
anterior lo puedes encontrar en el captulo 24, Tomo II del texto Cardell y autores.
93
A continuacin pasaras a desarrollar el aspecto nmero 2 del sumario basndote
en el objetivo general 2. En relacin a la replicacin debes conocer su significacin
biolgica, debes explicar cada una de sus caractersticas generales, debes definir
los requerimientos de este proceso. Luego debes resumir los aspectos ms
importantes de cada una de las etapas de la Replicacin del ADN. Un aspecto
muy importante en la Replicacin constituye explicar en qu consiste la fidelidad
del proceso de Replicacin del ADN as como definir su importancia biolgica.
Para culminar con esta parte del estudio debes conocer algunos de los inhibidores
de la Replicacin del ADN as como su mecanismo de accin.

En relacin a la Reparacin del ADN y el fenmeno de Recombinacin debes


resumir los siguientes aspectos: concepto, enzimas que participan e importancia
biolgica de cada uno de ellos. Esto se encuentra en el libro de texto Bioqumica
Mdica de Cardell, tomo captulo 33, pginas de la 549 a 558.

Por ltimo culminamos el estudio de este tema con a Transcripcin.


Primeramente debes conocer el concepto de promotor, su estructura y funcin.
Luego debes definir el concepto de transcripcin y para continuar con el estudio de
dicho proceso debes resumir los requerimientos, caractersticas generales y los
eventos ms relevantes que ocurren en cada etapa de este proceso. Para
culminar el estudio de los contenidos de este seminario debes definir los
inhibidores de la Transcripcin, conocer sus aplicaciones clnicas y el mecanismo
de accin de forma general.

Bibliografa: Bioqumica Mdica de Cardell, Tomo II, Captulos 24, 25, 26, 27,
31, 32 y 33.

94
Seminario No 7.

Titulo: Traduccin y regulacin de la expresin de la informacin gentica..

Gua del estudiante

Objetivo General:

. Conocer la importancia biolgica de los fenmenos de Traduccin y regulacin

de la expresin de la informacin gentica.

BIBLIOGRAFA:

1. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, captulos 28, 29, 30, 34 y 35.

2. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV, captulo 80 Cncer.

3. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV, captulo 76 Enfermedades


Moleculares

Este es el ltimo seminario sobre el tema Gentica Molecular. Se evaluarn


aspectos importantes como la regulacin de la expresin de la informacin
gentica a nivel procariotico, las enfermedades moleculares y el cncer.

PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA PARA


EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

1. Explicar la relacin estructura-funcin en los ribosomas.

2. Definir el concepto de cdigo gentico asi como interpretar cada una de sus
caractersticas.

3. Definir el concepto de Traduccin, sus requerimientos e importancia biolgica


de este proceso.

4. Resumir los aspectos ms relevantes de cada una de las etapas del proceso de
Traduccin.

5. Interpretar la importancia de la enzima Aminoacil-ARNt sintetasa en la fidelidad


del proceso de traduccin.

6. Describir el papel de los inhibidores de la Traduccin y sus aplicaciones en la


Medicina.
95
7. Explicar la organizacin estructural y funcional del operon.

8. Interpretar a nivel molecular los eventos que ocurren durante la induccin de la


sntesis enzimtica.

9. Interpretar a nivel molecular los eventos que ocurren durante la represin de la


sntesis enzimtica.

10. Definir el concepto de ingeniera gentica y su importancia para el desarrollo


de productos biofarmacuticos.

11. Describir el mecanismo de accin de las enzimas de restriccin.

12. Interpretar los principios bsicos de la clonacin in vitro.

13. Describir las caractersticas de las clulas cancerosas.

14. Explicar el mecanismo de transformacin cancerosa.

15. Definir el concepto de enfermedades moleculares.

16. Interpretar a nivel molecular la patogenia de la Drepanocitosis o Sicklemia.

Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la


encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la bibliografa del
contenido.

El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a estudiantes


previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de rebote y se realizar
una pregunta escrita inicial a todos
BIBLIOGRAFA:

1. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo II, captulos 28, 29, 30, 34 y 35.

2. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV, captulo 80 Cncer.

3. Bioqumica Mdica de Cardell, tomo IV, captulo 76 Enfermedades


Moleculares

96
Seminario No 8

Tema VI: Organismos pluricelulares.

Ttulo: Comunicacin intercelular. Papel de los receptores en la transduccin de


seales. Clasificacin de los receptores: Modelos de cada tipo.

Bibliografa:

-Folleto complementario material apoyo a la docencia organismos pluricelulares.

-Bioqumica Mdica T-I Cardell. Captulo 4 Pginas 44-9

-Bioqumica Mdica T-III Cardell. Captulo 59

-Bioqumica Mdica T-IV Cardell. Captulo 64 pg. 1150 Receptor de la


Acetilcolina.

-Fisiologa Mdica Guyton Capitulo 76 Hormonas Metablicas Tiroideas.

Objetivos especficos:

. Definir los tipos de comunicacin celular.


. Interpretar el papel de los receptores en la comunicacin intercelular.
Sumario:

1. Caractersticas generales de los organismos pluricelulares. Concepto de


diferenciacin y especializacin celular.
2. Tipos de comunicacin intercelular.
3. Modelos de receptores de membranas: receptor de acetil colina, receptor del
glucagn, receptor de la insulina.

4. Receptor de hormonas tiroideas como modelo de receptor intracelular.

Esta actividad est programada para realizarse en forma de ponencias por parte
de los estudiantes. Se dividir el grupo en 5 equipos los cuales deben ser
informados en la semana 15 en el seminario No 6. Los profesores designaran un
responsable por cada equipo y le entregara los temas a desarrollar por cada uno
de ellos. Se les informara a los estudiantes que TODOS LOS INTEGRANTES DEL
EQUIPO deben dominar todos los tpicos a desarrollar porque el profesor
seminarista va a seleccionar al azar el mismo da de la exposicin a los
estudiantes que el entienda deben desarrollar los diferentes tpicos. El seminarista
97
debe seleccionar en cada caso a los estudiantes que el crea hayan tenido ms
dificultad durante el semestre y debe tener asignados a dichos estudiantes antes
de comenzar la actividad evaluada. Se debe aclarar que la nota final del equipo,
ser un compendio entre las calificaciones obtenidas por los que van a exponer el
tema y las respuestas de otros integrantes en caso de que el profesor se vea en la
necesidad de hacerlas. El profesor har intervenciones cortas en los casos que
sea necesario y si el estudiante no desarrolla el tpico con suficiente profundidad o
lo desarrolla con errores, el profesor puede hacer preguntas DIRECTAS al resto
de los integrantes del equipo recordando que la nota de todos los integrantes es
COLECTIVA. Es recomendable dar las notas al final de la actividad explicando en
detalles el porqu de cada una de ellas.

TEMAS A DESARROLLAR POR CADA EQUIPO.


EQUIPO 1. GENERALIDADES DE LA COMUNICACIN INTERCELULAR.
Breve resea sobre la importancia de la comunicacin intercelular en el caso de
los organismos pluricelulares. Conceptos de diferenciacin y especializacin
celular. Componentes de un sistema de comunicacin intercelular y una breve
descripcin de cada uno de ellos. Tipos de comunicacin intercelular. En el caso
de la comunicacin a corta distancia debe incluirse los siguientes aspectos: tipo de
protenas que interviene en cada una de las comunicaciones, tipo de clulas se
establece la misma (del mismo tipo o clulas diferentes), tipo de sustancias que se
intercambian en este tipo de comunicaciones. En el caso de la comunicacin a
distancia, no debe faltar el tipo de seales que participan en cada una de ellas,
lugar hacia donde la clula emisora libera dicha seal y la localizacin de la clula
diana (tarea No. 5 gua didctica). Comparacin entre los diferentes tipos de
seales: neurotransmisores, mediadores qumicos locales y hormonas.
EQUIPO 2. RECEPTORES DE MEMBRANA QUE SON CANALES INICOS:

RECEPTOR DE LA ACETILCOLINA.
Este equipo har una pequea introduccin que incluya la localizacin del receptor
segn la naturaleza qumica de la seal. Inmediatamente despus el profesor
debe realizar la siguiente pregunta: Un trabajador agrcola, no cumpli las medidas
98
pertinentes de proteccin mientras utilizaba insecticidas en una plantacin. Llega
al cuerpo de guardia con vmitos, fiebre elevada, sudoraciones, deshidratacin
severa, etc. Se diagnostica intoxicacin por rganos fosforados, principales
compuestos en los insecticidas. Estos rganos fosforados, se unen de manera
irreversible a la enzima acetilcolinesterasa. Que consecuencias traera para los
eventos intracelulares desencadenados por este neurotransmisor en la clula
diana? Nota: El estudiante no debe a este nivel manejar alteraciones clnicas,
estas solamente se mencionan para motivar al estudiante y vincularlos con el rea
clnica. Solo debe deducir las alteraciones que se producen en el sistema de
transduccin de seales pero sin profundizar mucho en las complicaciones desde
el punto de vista clnico y mucho menos en su patogenia. Esta pregunta no se
responder en ese momento y el profesor debe aclarar que para conocer las
alteraciones que acarrea este tipo de fenmeno debe conocerse primero como
funcionan de forma normal los receptores de membrana que son canales inicos.

Se pasa ahora a discutir cmo funcionan este tipo de receptores. No debe faltar en
esta discusin la descripcin de este receptor desde el punto de vista estructural,
as como los cambios que se producen en el mismo cuando interacta con el
neurotransmisor y que procesos se activan en la clula despus que se une el
ligando al receptor.
Una vez concluido esta exposicin, los estudiantes deben ser capaces de
responder a la pregunta inicial.

EQUIPO 3. RECEPTORES DE MEMBRANA ACOPLADOS A LA PROTEINA G


TRIMERICA.
Antes que exponga el primer estudiante asignado por el profesor se debe lanzar la
siguiente pregunta: En el caso de la infeccin por el agente causal del clera, este
libera una toxina que produce inactivacin permanente de la actividad ATP asa de
la subunidad alfa de la protena G trimrica. Qu consecuencias trae para la
clula este fenmeno? Esta pregunta no se responder en ese momento y el
profesor debe aclarar que para conocer las alteraciones que acarrea este tipo de
fenmeno debe conocerse primero como funcionan de forma normal los
99
receptores de membrana acoplados a la protena G trimrica. Nota: El estudiante
no debe a este nivel manejar alteraciones clnicas, solo debe deducir las
alteraciones que se producen en el sistema de transduccin de seales pero sin
profundizar mucho en las complicaciones desde el punto de vista clnico.
Se pasa ahora a desarrollar el tpico sobre cmo funcionan este tipo de
receptores. No debe faltar en esta exposicin el tipo de seales que se unen a
este tipo de receptor pero se debe hacer hincapi al mecanismo de accin del
glucagn, el cual es actuar sobre la actividad de las enzimas. Es importante para
responder la pregunta problmica, que el estudiante interprete la actividad GTP
asa de la protena G trimrica as como el tipo de segundo mensajero que se
libera por la unin Glucagn-Receptor y la enzima quinasa activada por este
segundo mensajero.
Una vez concluido esta exposicin, los estudiantes deben ser capaces de
responder a la pregunta inicial.

EQUIPO 4 RECEPTORES DE MEMBRANA QUE SON ENZIMAS EN SU


DOMINIO INTRACELULAR: RECEPTOR TIROSIN QUINASA DE LA INSULINA.
Se comienza con la exposicin del profesor acerca de la existencia de la Diabetes
Mellitus Tipo 2, el cual es un desorden que se caracteriza por resistencia de los
rganos diana a la hormona insulina Qu consecuencias trae en el mecanismo
de accin de dicha hormona, este tipo de desorden en esos pacientes? Para
responder esta pregunta debe conocerse en detalles todos los fenmenos que
comienzan con la unin de la Insulina a su receptor de membrana. No deben faltar
en esta exposicin la caracterizacin funcional y estructural del receptor de la
insulina, descripcin general de los sistemas de transduccin de seales activados
por esta hormona, segundos mensajeros liberados por este mecanismo, protenas
quinasas activadas por esta hormona y los mecanismos de accin de la insulina.
Una vez transcurrida con xito esta exposicin el estudiante del equipo debe ser
capaz de responder la pregunta problmica del inicio de la exposicin.

100
EQUIPO 4 RECEPTORES INTRACELULARES: RECEPTOR DE HORMONAS
TIROIDEAS.
Antes de comenzar las exposiciones, se realiza la siguiente pregunta: Qu
consecuencias para el mecanismo de accin hormonal de las hormonas tiroideas
tendr una sntesis disminuida de su receptor en sus clulas diana? Para dar
respuesta a esta pregunta deben conocer las respuestas que se originan
normalmente en la clula luego que la hormona se une a su receptor.
Esta es quizs la nica situacin hipottica de todas y quizs es incompatible con
la vida debido a la importancia de estas hormonas en todas las etapas del
desarrollo humano. No debe faltar en esta exposicin el tipo de hormonas que se
unen a receptores intracelulares, caracterizacin en cuanto a su localizacin y en
relacin a su estructura de los receptores de hormonas tiroideas, mecanismo de
accin bsico de estas hormonas y alguno de las respuestas que se producen en
las clulas dianas como consecuencia de la activacin de este mecanismo de
accin hormonal.
Una vez concluida con xito la exposicin el estudiante es capaz de responder la
pregunta problmica al inicio de la misma.

PARA EL ESTUDIO DE ESTE TEMA Y SU PREPARACIN ADECUADA PARA


EL SEMINARIO SE RECOMIENDA AL ESTUDIANTE SABER.

Objetivos especficos:

EQUIPO 1.
1. Definir los conceptos de diferenciacin y especializacin celular asi como la
importancia de la comunicacin intercelular en los organismos pluricelulares.
2. Describir las caractersticas de los componentes de un sistema de
comunicacin celular.
3. Comparar los diferentes tipos de comunicacin celular a corta distancia con
aspectos que incluyan tipo de protenas que interviene en cada una de las
comunicaciones, tipo de clulas se establece la misma (del mismo tipo o clulas
diferentes), tipo de sustancias que se intercambian en este tipo de
comunicaciones.

101
4. Comparar los diferentes tipos de comunicacin a distancia teniendo en cuenta
los siguientes elementos: el tipo de seales que participan en cada una de ellas,
lugar hacia donde la clula emisora libera dicha seal y la localizacin de la clula
diana.
5. Realizar una comparacin entre los diferentes tipos de seales que participan
en la comunicacin intercelular.

EQUIPO 2
1. Vincular la localizacin celular del receptor segn la naturaleza qumica de las
seales.
2. Explicar a nivel molecular la relacin estructura-funcin en los receptores que
son canales inicos (receptor de Acetilcolina)
EQUIPO 3
1. Caracterizar estructural y funcionalmente el receptor de la hormona Glucagn.
2. Definir el mecanismo de accin de la hormona glucagn, mediado por su
receptor.
3. Caracterizar estructural y funcionalmente a la protena G trimrica.
4. Definir el segundo mensajero que se libera mediante la interaccin de la
hormona glucagn con su receptor y explicar cmo se produce el mismo.
5. Definir la importancia de la activacin de la Protein Quinasa A en el mecanismo
de accin de la hormona glucagn.
6. Explicar a nivel molecular el mecanismo de amplificacin de la seal tomando
como ejemplo la hormona glucagn y la enzima glucgeno fosforilasa. EQUIPO 4.
1. Caracterizar estructural y funcionalmente el receptor de la hormona Insulina.
2. Interpretar a nivel molecular el mecanismo de accin de la hormona Insulina.

EQUIPO 5.
1. Interpretar a nivel molecular el mecanismo de accin de hormonas con
receptores intracelulares tomando como ejemplo el receptor de las hormonas
tiroideas.
Para lograr estos objetivos recuerde que toda esta informacin la
encontrar revisando detalladamente la gua de la clase taller y la
102
conferencia orientadora donde se orienta adecuadamente la bibliografa del
contenido.

El seminario se realizar por el mtodo de preguntas y respuestas a


estudiantes previamente seleccionados, no sern evaluadas las preguntas de
rebote y se realizar una pregunta escrita inicial a todos
Bibliografa:

-Folleto complementario material apoyo a la docencia organismos pluricelulares.

-Bioqumica Mdica T-I Cardell. Captulo 4 Pginas 44-9

-Bioqumica Mdica T-III Cardell. Captulo 59

-Bioqumica Mdica T-IV Cardell. Captulo 64 pg. 1150 Receptor de la


Acetilcolina.

-Fisiologa Mdica Guyton Capitulo 76 Hormonas Metablicas Tiroideas.

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