Microbiologa Ambiental

Ms.C- Blg Mara Teresa Valderrama Rojas

SEMANA 1:
Generalidades. Introduccin: Conceptos bsicos en Microbiologa Ambiental, importancia de los
Microorganismos en los seres vivos, industria y ambiente. La Ecologa microbiana y su desarrollo histrico.
Principios de la Microbiologa. La ecologa microbiana en el siglo XX

LOS MICROORGANISMOS Y EL AMBIENTE

Los hbitats naturales de los microorganismos son extremadamente diversos.

Cualquier habitad que sea adecuado para el crecimiento de organismos superiores, tambin
lo es para el crecimiento de los microorganismos. Pero, adems, hay muchos hbitats donde,
debido a las extremas condiciones fsicas o qumicas, no se encuentran organismos
superiores; sin embargo, en ellos pueden existir microorganismos que, en algunos casos,
incluso crecen mejor all. Los microorganismos habitan las superficies de organismos
superiores y algunos pueden incluso vivir en el interior de las plantas y animales. En dichos
hbitats sus poblaciones pueden ser muy numerosas y ser muy beneficiosas para la planta o
el animal con relacin a su nutricin.

EL MICROORGANISMO Y SU MICROAMBIENTE.
El crecimiento de los microorganismos en la naturaleza depende de los recursos. En la tierra
existen incontables nichos microbianos. Al ser los microorganismos muy pequeos, sus hbitats
tambin lo son. Un microbilogo debe por tanto aprender a pensar en pequeo cuando considere
los microorganismos en su medio natural. Por ejemplo, para una bacteria con forma de bacilo tpico
de 3 micras de longitud, una distancia de 3mm en su hbitat es lo mismo que para una persona una
distancia de 2 Km. y a lo largo de esa distancia de 3mm pueden darse gradientes fsicas y qumicas
que afecten mucho al organismo. Por tanto, deberemos precisar mas en nuestra caracterizacin del
hbitat de un microorganismo, y los eclogos microbianos utilizan el termino microambiente para
referirse exactamente al lugar del hbitat en el que un microorganismo vive y lleva a cabo su
metabolismo. En una partcula de suelo de 3mm por ejemplo, pueden existir varios tipos de
microambientes con caractersticas qumicas y fsicas muy diferentes.
Esto puede imaginarse considerando la distribucin en una partcula de suelo de un
nutriente microbiano importante, como es el oxgeno. Por medio de electrodos es posible medir la
concentracin de oxgeno a lo largo de pequeas partculas de suelo. Como se ve en los datos de un
experimento real las partculas de suelo no son homogneas en lo que respecta al contenido de
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oxgeno. La parte externa de una partcula de suelo puede ser completamente xica, mientras que el
centro, que se encuentra a una distancia muy corta, puede permanecer completamente anxico esta
comprobacin indica que pueden darse diferentes nichos a lo largo de una dimensin espacial muy
pequea y explica como pueden coexistir microorganismos de varios tipos fisiolgicos en un espacio
muy pequeo.
Los organismos anaerbicos podran desarrollar su actividad cerca del centro de la partcula;
los microaerofilos podran actuar ms hacia el exterior; y los aerbicos estrictos desarrollaran su
actividad metablica en los 2 o 3mm externos de la partcula. Las bacterias aerbicas facultativas
podran hallarse distribuidas por toda la partcula.

En un microambiente, las condiciones fisicoqumicas pueden cambiar rpidamente en

cuanto al tiempo y al espacio. Las concentraciones de oxigeno representan nicamente medidas
instantneas; las tomadas a lo largo de un periodo de respiracin microbiana, o despus de aumentar
el contenido de agua en el suelo, presentaran un gradiente completamente distinto a lo largo del
microambiente. Hay que decir, por tanto, que los microambientes son heterogneos, y que las
condiciones en un determinado microambiente pueden cambiar muy deprisa. Esto explica que en
un espacio fsico relativamente pequeo pueda darse una gran diversidad microbiana.

SINTROFA EN LOS MICROORGANISMOS

En vez de competir por el mismo nutriente, algunos microorganismos colaboran para llevar
a cabo una transformacin determinada que ninguno de los organismos que intervienen en el
proceso podra realizar por si mismo. Este tipo de interacciones microbianas, que se denomina
Sintrofa, es crucial para el xito competitivo de algunas bacterias anaerbicas, Las relaciones
sintrficas generalmente requieren que los dos o mas organismos que participan convivan en mismo
microambiente, ya que el producto del metabolismo de uno de ellos debe ser de fcil acceso al
segundo. Tambin se ve cooperacin metablica en las actividades de grupos de organismos que
llevan a cabo metabolismos complementarios. Como por ejemplo las transformaciones metablicas
en las que participan dos grupos distintos de microorganismos, como son las bacterias nitrosificantes
y las bacterias nitrificantes, que se combinan para oxidar el NH3 a NO3, proceso que ninguno de los
2 grupos podra realizar por separado

REVISIN DE CONCEPTOS
Los microorganismos son muy pequeos y los ambientes naturales que ocupan son
igualmente pequeos. El microambiente es el lugar donde viven los microorganismos. En la
naturaleza llevan con frecuencia una vida en la que a veces se sacian y otras mueren por una
inanicin, de manera que solo las especies ms adaptadas sobreviven en un nicho determinado. La
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cooperacin entre los microorganismos es tambin muy importante en numerosas interrelaciones

microbianas.

METABOLISMO:
Es el conjunto de reacciones qumicas que tienen lugar dentro de las clulas de los
organismos vivos, las cuales transforman energa, conservan su identidad y se reproducen.
Hay dos grandes procesos metablicos: anabolismo o fase biosinttica y catabolismo o fase
degradativa.
Anabolismo, o metabolismo constructivo, al conjunto de las reacciones de sntesis necesarias
para el crecimiento de nuevas clulas y el mantenimiento de todos los tejidos. Las reacciones
anablicas incluyen la biosntesis enzimtica de los cidos nucleicos, los lpidos, los polisacridos y
las protenas; todos estos procesos necesitan la energa qumica suministrada por el ATP.
Catabolismo o metabolismo degradativo, es un proceso continuo centrado en la produccin
de la energa necesaria para la realizacin de todas las actividades fsicas externas e internas. Engloba
tambin el mantenimiento de la temperatura corporal e implica la degradacin de las molculas
qumicas complejas (glcidos, lpidos y protenas) en sustancias ms sencillas (cido actico,
amonaco, cido lctico, dixido de carbono o urea), que constituyen los productos de desecho
expulsados del cuerpo a travs de los riones, el intestino, los pulmones y la piel.

Nutriente, sustancia qumica que utilizan los seres vivos como fuente de energa,
metabolizan algunos compuestos .Dentro de ello tenemos los nutrientes esenciales, los que se
clasifican en cinco grupos principales: protenas, hidratos de carbono, grasas, vitaminas y minerales

1.- Protenas
La funcin primordial de la protena es producir tejido corporal y sintetizar enzimas, algunas
hormonas como la insulina, que regulan la comunicacin entre rganos y clulas, y otras sustancias
complejas, que rigen los procesos corporales.
Las protenas animales y vegetales no se utilizan en la misma forma en que son ingeridas,
sino que las enzimas digestivas (proteasas) deben descomponerlas en aminocidos que contienen
nitrgeno. Las proteasas rompen los enlaces de pptidos que ligan los aminocidos ingeridos para
que stos puedan ser absorbidos por el intestino hasta la sangre y reconvertidos en el tejido concreto
que se necesita

2.- Hidratos de carbono

Los alimentos ricos en hidratos de carbono suelen ser los ms baratos y abundantes en
comparacin con los de alto contenido en protenas o grasa, aportan gran cantidad de energa en la
mayora de las dietas humanas Los hidratos de carbono se queman durante el metabolismo para
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producir energa, liberando dixido de carbono y agua. Los seres humanos tambin obtienen
energa, aunque de manera ms compleja, de las grasas y protenas de la dieta, as como del alcohol

3.- Grasas
Aunque son ms escasas que los hidratos de carbono, producen ms del doble de energa.
Por ser un combustible compacto, se almacenan muy bien para ser utilizadas despus en caso de que
se reduzca el aporte de hidratos de carbono. Los animales necesitan almacenar grasa para abastecerse
en las estaciones fras o secas, lo mismo que los seres humanos en pocas de escasez de alimentos
4.- Minerales
Los minerales son nutrientes inorgnicos necesarios para la reconstruccin estructural de
los tejidos corporales, participan en procesos tales como la accin de los sistemas enzimticos,
contraccin muscular, reacciones nerviosas y coagulacin de la sangre. Estos deben ser
suministrados en la dieta, se dividen en dos clases:
- macro elementos, como calcio, fsforo, magnesio, sodio, hierro, yodo y potasio; y
- micro elementos, como cobre, cobalto, manganeso, flor y cinc

5.- Vitaminas
Se clasifican en dos grupos: liposolubles e hidrosolubles. Las liposolubles: A, D, E y K , son
compuestos orgnicos que actan sobre todo en los sistemas enzimticos para mejorar el
metabolismo de protenas, hidratos de carbono y grasas. Sin estas sustancias no podra tener lugar
la descomposicin y asimilacin de los alimentos. Algunas participan en la formacin de las clulas
sanguneas, hormonas, sustancias qumicas del sistema nervioso y materiales genticos. Entre las
hidrosolubles se incluyen la vitamina C y el complejo vitamnico B.

OBTENCIN DE LA ENERGIA
Mediante el empleo del calormetro, los cientficos han podido determinar las cantidades de
energa de los combustibles del cuerpo:
Hidratos de carbono, grasas y protenas. Un gramo de hidrato de carbono puro o de protena
pura producen 4 caloras; 1 gramo de grasa pura produce unas 9 caloras.
En nutricin la kilocalora (kcal) se define como la energa calorfica necesaria para elevar la
temperatura de 1 kilo de agua de 14,5 a 15,5 C.
Los hidratos de carbono son el tipo de alimento ms abundante en el mundo, mientras que
las grasas son el combustible ms concentrado y ms fcil de almacenar.
El alcohol es tambin una fuente de energa que produce 7 caloras por gramo.
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LA MICROBIOLOGIA EN LA INDUSTRIA

Comercialmente se producen enzimas, proceden tanto de bacterias como de hongos. El

proceso de produccin es usualmente aerbico, y los medios de cultivo similares a los empleados en
las fermentaciones para producir antibiticos. Generalmente la enzima se forma en pequeas
cantidades durante la fase activa de crecimiento, pero se acumula en grandes cantidades durante la
fase estacionaria del crecimiento, las enzimas inducidas se producen solamente cuando en el medio
esta presente un inductor adecuado.

Proteasas y amilasas
Las enzimas microbianas que se producen en mayor cantidad industrialmente son las
proteasas bacterianas, utilizadas como aditivos en los detergentes para lavar la ropa. La mayora de
estos detergentes para la ropa contienen hoy da enzimas, especialmente proteasas, pero tambin
amilasas, lipasas, reductasas y otras. Muchas de estas enzimas se aslan de bacterias alcalofitalas.
Otras enzimas importantes fabricadas comercialmente son las amilasas y glucoamilasas que
se usan para la produccin de glucosa a partir del almidn.
la enzima -amilasa
la enzima glucoamilasa
la enzima glucosa isomerasa
Las tres enzimas se producen industrialmente por fermentacin microbiana.

FERMENTACIN DE LA ACETONA BUTANOL

Biosntesis
Durante la primera guerra mundial el producto de inters era la acetona, utilizada para la
fabricacin del explosivo trinitrotolueno(TNT), pero despus de la guerra resulto ms importante el
butanol, utilizado para la produccin de lacas de nitrocelulosa.
El cido butrico, el butanol, la acetona y el isopropanol se obtienen a partir de la
fermentacin de almidn, melazas, sacarosa, hidrolizados de madera y pentosas por clostridios. Las
proporciones relativas de cada uno de estos productos en la fermentacin dependen de la cepa
bacteriana utilizada y de las condiciones de fermentacin. Tres tipos de fermentacin pueden ser
reconocidos de acuerdo con sus productos de fermentacin:
Fermentacin de la acetona-butanol con Clostridium acetobutylicum.
Fermentacin del butanol-isopropanol con Clostridium butylicum
Fermentacin del actico-butrico con Clostridium butyricum.
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ACIDOS ORGANICOS

CIDO ACTICO
Aunque el cido actico es producido por muchas bacterias fermentativas, solo los miembros
de un grupo especial, las bacterias del cido actico se utilizan en la produccin comercial. Las
bacterias del cido actico pueden ser divididas en dos gneros, Gluconobacter y Acetobacter, el
primer grupo, que oxida etanol solamente a cido actico, y el segundo grupo (las superoxidantes)
capaces de oxidar el etanol primero a cido actico y luego adicionalmente a CO2 y H2O. Los
miembros del genero Acetobacter son bacterias Gram negativas y cido-tolerantes. Las cepas
utilizadas comercialmente pertenecen a las especies Acetobacter aceti, A. pasteurianus o A. peroxidans.
Los miembros del genero Gluconobacter oxydans (previamente Acetomonas oxydans) y varias
subespecies de esta especie, se utilizan comercialmente.

Bacterias del cido actico

Las bacterias del cido actico (Acetobacter y Gluconobacter) presentan las caractersticas
comunes del grupo de bacterias similares a Pseudomonas. Viven en la superficie de las plantas
donde constituyen una microflora secundaria que utiliza los productos de desecho de la microflora
primaria (bacterias lcticas y levaduras). Esto es as porque presentan la capacidad de utilizar
alcoholes como fuente de carbono y energa produciendo su oxidacin a cido (bacterias
suboxidantes como Gluconobacter) o a CO2 y H2O (bacterias superoxidantes como Acetobacter). La
produccin de cido actico por estas bacterias las hace extremadamente acidfilas.

Las bacterias suboxidantes carecen de un ciclo de los cidos tricarboxlicos completo por lo
que oxidan de forma estequiomtrica el etanol a actico. Las bacterias superoxidantes realizan una
primera oxidacin a actico; pero la presencia de ciclo de cidos tricarboxlicos permite la oxidacin
total mucho ms lenta. Otra particularidad del grupo es que la utilizacin de azcares se produce
nicamente por la ruta de las pentosas.

Adems de por su diferente capacidad de oxidacin de alcoholes las dos bacterias del cido
actico pueden diferenciarse por su flagelacin polar en Gluconobacter y peritrica en Acetobacter.

Ciertos grupos de Acetobacter son capaces de producir una gran cantidad de celulosa
extracelular que llega a formar verdaderas pelculas de este polmero.

Proceso industrial de fabricacin del vinagre

Las bacterias del cido actico tienen una aplicacin industrial importante en la fabricacin
del vinagre, aunque tambin intervienen de forma relevante en la produccin de cido ascrbico
(vitamina C) por oxidacin del sorbitol y de la sorbosa.
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La produccin del cido actico tiene lugar por un proceso estrictamente aerobio en el que
se suministra alcohol etlico (etanol) a bacterias del cido actico fijadas sobre soportes diversos. Las
bacterias van oxidando el alcohol y se recoge finalmente el cido.

Aunque el cido actico puede prepararse por oxidacin qumica del etanol, el vinagre es un
producto distinto porque su sabor depende de otros compuestos que acompaan la bebida
fermentada de la que se parte para la produccin del mismo.

Hay tres mtodos de produccin industrial del vinagre:

Mtodo Orleans

En este mtodo se llena la cuarta parte de una barrica con vinagre fresco elaborado
recientemente que proporciona el inculo de Acetobacter y Gluconobacter y, a continuacin, se aade
la bebida fermentada de la que se desea preparar vinagre. La barrica se deja abierta para que pueda
producirse un intercambio de oxgeno suficiente. El proceso dura varias semanas y la eficiencia
depende de la disponibilidad de oxgeno.

Mtodo de goteo

En este mtodo se permite el contacto de las bacterias con el alcohol haciendo circular ste
por una cmara de madera rellena con viruta de madera laxamente empaquetada. El proceso se
desarrolla en continuo y el aparato se conoce como generador de vinagre. La aireacin se consigue
mediante la entrada de aire por la parte inferior del generador. La vida til de un generador de
vinagre puede ser muy larga.

El producto final carece de bacterias porque stas quedan fijadas al lecho de virutas.

Mtodo de burbujeo

Se trata de un proceso de fermentacin sumergida en el que el oxgeno se suministra

mediante un proceso de burbujeo de aire. La velocidad de adicin del alcohol se regula de manera
que se permite una conversin muy eficiente del alcohol al cido (llega a 98%). Este proceso presenta
la desventaja frente al anterior de que es necesario filtrar el vinagre para eliminar las bacterias.

Biosntesis
La produccin de cido actico es una oxidacin incompleta ms que una autentica
fermentacin, debido a que el poder reductor que se produce se transfiere al oxgeno.
www.unavarra.es/.../17-bacterias%20gram-positivas%20aerobias.htm -
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ACIDOS CTRICOS
Actualmente ms del 99% de la produccin mundial de cido ctrico se produce
microbiolgicamente.
Se han producido microbiolgicamente las siguientes cantidades de cido ctrico:
1929 5,000 toneladas.
1953 50,000 toneladas.
1976 200,000 toneladas
1979 220,000 toneladas
1982 350,000 toneladas

La mayor parte del cido ctrico (60% del total) se utiliza en las industrias de alimentos y
bebidas. El sabor de los jugos de frutas, extractos de jugos de fruta, caramelos, helados y mermelada
se aumenta o se preserva por adicin de cido ctrico.
La industria farmacolgica (10 % de la utilizacin total) utiliza citrato de hierro y cido
ctrico como preservativos de la sangre almacenada, en tabletas, pomadas y en preparaciones
cosmticas. En la industria qumica (25% del uso total) el cido ctrico se utiliza como agente
antiespumante, como reblandecedor y para el tratamiento de textiles. En la industria metalurgica
los metales puros de producen como citratos metlicos.

El cido ctrico esta siendo utilizado cada vez ms en la industria de detergentes porque
puede reemplazar a los polifosfatos.

Cepas para la produccin de cido ctrico

Muchas cepas excretan trazas de cido ctrico como producto del metabolismo primario.
Como ejemplos estn Aspergellius nger, A. wentii, A. clavatus, Penicillium luteum, P. citrinum,
Mucor piriformis, Paecelomyces divaricatum, Citromyces pfefferianus, Candida guillermondii,
Saccharomysis copsis lipolytica, Trichoderma viridae, Arthrobacter paraffineus y Corynebacterium
sp. Sin embargo, para la produccin comercial solo se utilizan mutantes de Aspergillus nger.
Comparado con las cepas de Penicillium, los aspergillus producen mas cido ctrico por unidad de
tiempo. Adems la formacin de productos laterales no deseados, como cido oxcilo, cido
isoctrico y cido glucnico puede ser mas fcilmente suprimida en estos mutantes.

PROCESOS MICROBIOLOGICOS PARA LA PRODUCCION DE ACIDOS ORGANICOS

Acido En produc. Proceso Rendimiento Usos del

Organismo Substrato Referencias
orgnico comercial das, C % producto
Ac. Rhizopus Glucosa - 3 R Buc
Si 65
fumrico sp. Candida Alcanos , 33C esina hta, 1983b
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Pro Lactosa
Ac. 8-12 Perfumes Buchta,
pioni- Si glucosa 60
propinico 30C fungicida 1983b
bacterium almidn
Leu
Ac.fumri
conostoc Alimento Buc
Ac. mlico No co n- 1 99 72
brevis, s hta, 1983b
Alcanos
Candida

ACIDO ITACONICO
En 1931 se mostr que el cido itaconico era el principal producto metablico de
Aspergillus itaconicus. En la misma dcada se descubri que algunas cepas de A. terreus tambin
excretaban cido itaconico. Actualmente se utilizan mutantes de ambas cepas para la produccin
comercial.
En el presente existen solo unos pocos sistemas comerciales que producen cido itaconico:
2 en Europa Occidental y uno en cada una, America, la URSS y Japn. El cido itaconico forma
copolmeros con sus esteres y otros monmeros; estos se utilizan en la industria del papel para
el empapelado de paredes y otros productos del papel y en la produccin de adhesivos. Un
copolmero de cido itaconico y acrilonitrilo es ms facial de teir que algunos otros polmeros.

L-Lisina
La lisina es un aminocido esencial para la nutricin humana y animal. Existe en
las protenas de plantas slo en bajas concentraciones; la adicin de lisina puede aumentar
por consiguiente la calidad de los alimentos producidos a partir de plantas. El mercado para
lisina esta aumentando. La lisina se produce hoy solamente por procesos microbianos y se
estn desarrollando una variedad de mtodos para su produccin.
Produccin de Lisina va cido diaminopimelico
Mutantes dobles lisina-histidina de E. coli (ATCC 13002) producen cido
diaminopimelico (DAP) sobre un medio con melazas, con un rendimiento de 19-24 g/l. La
solucin entera de fermentacin, incluyendo el material celular es incubado
subsecuentemente con Aerobacter aerogenes(ATCC 12409) a 35 grados C. Despus de 20
horas el DAP ha sido descarboxilizado cuantitativamente a L-lisina. Una complicacin de
este proceso es que el DAP formado durante la fermentacin es una mezcla de formas meso
y LL; puesto que solo el meso por raceminacin antes de la etapa de descarboxilacin.
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ECOLOGIA:
El trmino ecologa fue acuado por el bilogo alemn Ernst Heinrich Haeckel en 1869;
deriva del griego oikos (hogar) y comparte su raz con economa. Es decir, ecologa significa el
estudio de la economa de la naturaleza.
En cierto modo, la ecologa moderna empez con Charles Darwin. Al desarrollar la teora de
la evolucin, hizo un gran aporte Alexander von Humboldt, profundamente interesados en el cmo
y el porqu de la distribucin de los vegetales en el mundo.

Importancia:
Debido a los diferentes enfoques necesarios para estudiar a los organismos en su medio
ambiente natural, la ecologa se sirve de disciplinas como la climatologa, la hidrologa, la fsica, la
qumica, la geologa y el anlisis de suelos.
Para estudiar las relaciones entre organismos, la ecologa recurre a ciencias tan dispares
como el comportamiento animal, la taxonoma, la fisiologa y las matemticas.
Aunque se trata de una disciplina cientfica diferente, la ecologa contribuye al estudio y la
comprensin de los problemas del medio ambiente.