AMINOCIDOS

1. Estructura de los aminocidos

Fuente: Wade L. G. Qumica Orgnica

Enlace peptdico
El enlace C-N posee un grado elevado de carcter de doble enlace por deslocalizacin, lo
que reduce la basicidad del N y restringe la rotacin en torno al enlace C-N, esto tiene un
importante efecto en la estructura tridimensional de las protenas.

Fuente: Wade L. G. Qumica Orgnica

La sucesin en enlaces amida en AAs forman una cadena polipetidica.

2. Clasificacin
2.1. Aminocidos proteinognicos
Aunque existen en la naturaleza ms de 700 aminocidos diferentes, los 20 recogidos en la
siguiente tabla son los que estn presentes en las protenas normalmente.

Todos son -aminocidos, y todos excepto uno, contienen un grupo amino primario.
Excepcin es la prolina, una amina secundaria cclica.

Aminocidos esenciales
Que tienen que estar presentes en la dieta de los mamferos para un desarrollo normal del
crecimiento pues no son sintetizados en sus procesos metablicos.
Lista de aminocidos proteinognicos presentes en las protenas
3. Estereoqumica
A excepcin de la glicina, son molculas quirales encontrndose que todos los de orgenes
naturales constituyentes de las protenas tienen la misma configuracin absoluta.

Al igual que en los carbohidratos es tradicional utilizar en los aminocidos la nomenclatura D

y L, perteneciendo los proteinognicos a la serie L. Sin embargo existen aminocidos
naturales de la serie D, como la D-alanina que forma parte de las clulas bacterianas.
4. Propiedades de los aminocidos
Debido a su naturaleza de iones dipolares (sal interna) son sustancias muy polares en las
que las fuerzas de atraccin electrosttica intermoleculares dan lugar a estructuras
reticulares cristalinas bastante fuertes.
Constantes fsicas (ej.: p.f.) elevadas

4.1. Propiedades cido base de los aminocidos

Los aminocidos presentan tanto propiedades cidas como bsicas, es decir, son anfteros.
En disolucin acida en aminocido est totalmente protonado y existe como el cido
conjugado.

A pH bajo posee una carga positiva, a pH bajo posee una carga negativa. En un pH
intermedio el aminocido existe en forma de zwitterin sin carga. Este pH se denomina punto
isoelctrico, pI.

Fuente: Wade L. G. Qumica Orgnica

Los distintos valores de los pI de los aminocidos, dependientes de la naturaleza de la
cadena, permiten la separacin de los mismos mediante electroforesis

5. Sntesis de aminocidos
Muchos L-aminocidos son disponibles por aislamiento desde fuentes naturales. Los
aminocidos racmicos sintticos pueden separarse aplicando diversos procedimientos. Por
resolucin o separacin de racematos es posible disponer de los aminoacidos L- y su
enantimeros D-.

Mtodos:
a) Animacin de -halocidos

No es un mtodo satisfactorio para preparar aminas debido a la sobrealquilacin. Sin

embargo la reaccion produce mejores resultados cuando se aplica a la obtencion de
aminoacidos por que el grupo amino de los aminocidos que resultan es menos bsico que
la propia amina.

b) Alquilacion de steres aminomalnicos N-sustituidos (Sintesis malnica de

Gabriel)
 c) Sntesis de Strecker
Hidrolisis de aminonitrilos obtenidos tratando aldehdos con amoniaco y HCN.

El mecanismo:
6. Reacciones de los aminocidos
Reacciones tpicas de las aminas alqulicas primarias, de los cidos carboxlicos y de los
otros grupos funcionales presentes en las cadenas laterales.

La reaccin ms importante es la formacin de amidas: el enlace peptdico. Los pptidos

(polipptidos): polmeros de aminocidos (2 a 50 AAs individuales)
 PPTIDOS Y PROTENAS

1. Introduccin
Las protenas son las molculas orgnicas ms abundantes en los animales, y juegan un
papel importante en todos los aspectos de la estructura y funciones de las clulas. Las
protenas son biopolmeros de -aminocidos, denominados as porque el grupo amino est
enlazado al tomo de carbono a, tomo ms prximo al grupo carbonilo. Las propiedades
fsicas y qumicas de las protenas se determinan a partir de los aminocidos que las forman.
Las subunidades de aminocidos individuales estn unidas mediante enlaces amida,
conocidos como enlaces peptdicos.

Las protenas tienen un amplio intervalo de estructuras y propiedades catalticas debido a su

diferente composicin en aminocidos. Debido a su versatilidad, las protenas tienen una
gran variedad de funciones en los seres vivos.

2. Formacion del enlace peptidico.

La formacion del enlace peptidico es la reacion mas importante de los aminoacidos.
3. Nomenclatura de pptidos
Por convenio, las estructuras peptdicas se escriben siempre con el resto N-terminal a la
izquierda y el C-terminal a la derecha y se nombran anteponiendo el nombre del aminocido
C-terminal los nombres de los residuos de los otros AA integrantes, comenzando por el N-
terminal, y se utiliza el sistema de notacin abreviado con los cdigos de tres letras.

4. Importancia biolgica

4.1. Oxitocina humana

La oxitocina es un nonapptido con dos residuos de cistena (en las posiciones 1 y 16) que
unen parte de la molcula formando un gran anillo.
Una unin disulfuro obliga a parte de la molcula a formar un gran anillo

Es un polipptido que solo se encuentra en el gnero femenino de una especie y estimula las
contracciones uterinas durante el parto.

4.2. Vasopresina
Es un polipptido presente tanto en el gnero masculino como en el femenino de una
especie.

Provoca la contraccin de los vasos sanguneos perifricos y por tanto aumenta la presin
sangunea.

Su mayor utilidad es como un antidiurtico, la llaman la hormona antidiurtica oxitocina y

vasopresina son muy parecidas estructuralmente, donde la oxitocina tiene leucina, la
vasopresina tiene arginina, y donde la vasopresina tiene fenilalanina la oxitocina tiene
isoleucina. Sin embargo tienen dos funciones muy distintas
 4.3. Insulina
Se compone de dos cadenas polipeptdicas unidas entre s por puentes disulfuro
Hormona responsable de la regulacin del metabolismo de la glucosa. Se compone de dos
cadenas polipetdicas unidas entre s por puentes de sulfuro.

5. Sntesis de pptidos

a) Sntesis qumica de pptidos en disolucin

Comienza por el extremo N-terminal y finaliza en el extremo C-terminal

Para prevenir las reacciones colaterales se protege el grupo amino para hacerlo no
nuclefilico y se activa el grupo carboxilo
 b) Sntesis qumica de pptidos en fase slida
Bruce Merrifield en 1963 public la primera sntesis en fase slida. Por ello, recibi el Premio
Nobel de Qumica en 1984

De manera esquemtica, la sntesis en fase slida se basa en combinar

Comparacin de ambos mtodos de sntesis

6. Conformacin y estructuras de pptidos y protenas

Los pptidos, al igual que las protenas estn presentes en la naturaleza y son los
responsables de un gran nmero de funciones, muchas de las cuales todava no se conocen.
La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido.
Oligopptido: nmero de aminocidos < 10
 Polipptido: nmero de aminocidos > 10
Protena: nmero de aminocidos > 100

Los pptido se diferencian de las protenas en que son mas pequeos que las protenas
(tienen menos de diez mil o doce mil Daltons) y pueden estar formadas por la unin de varios
polipptidos y a veces de 55 aminocidos y se conoce como una hormona de acuerdo a la
funcin que tiene en el organismo de los seres humanos.

Las protenas son macromolculas formadas por aminocidos.

La naturaleza rgida de los enlaces de amida hace que los pptidos y protenas adopten
conformaciones caractersticas. Todos los AAs tienen la misma configuracin, lo que da
regularidad estereoqumica en las cadenas

a) Primaria del pptido (protena) secuencia de los AAs

b) Secundaria: conformacin de la cadena peptdica

Las conformaciones ms comunes son la hlice y las lminas . Tambin puede darse
plegamiento al azar.
Ordenamiento -helicoidal:
Cada grupo carbonilo peptdico se une mediante un enlace de hidrgeno a un hidrgeno del
grupo N-H de la siguiente vuelta de la hlice. Los radicales R quedan de forma radial y las
espiras tienen de 3 a 6 aminocidos.

Fuente: Wade D. L. Qumica Orgnica

Hlices

Fuente: Nelson, D. L.; Cox M.M, Lehninger, Principios de la Bioqumica

 La prolina rompe la hlice a debido a su rigidez
Los aminoacidos polares Lys y Glu, desestabilizan la hlice por repulsiones
electrostticas

La hlice a se estabiliza mediante puentes de hidrogeno.

Laminas

Fuente: Wade, L. G. Qumica Orgnica

 Laminas

c) Terciaria: es su conformacin tridimensional completa

La estructura de un pptido o una protena se refiere al plegamiento en el espacio de la
cadena.

Fuente: Wade, L. G. Qumica Orgnica

Este plegamiento afecta tanto a las propiedades fsicas de una protena como a su funcin
biologa.
 d) Cuaternaria
Algunas protenas son agregados de dos o ms cadenas polipeptdicas que se organizan en
lo que se llama estructura cuaternaria

Fuente: Wade, L. G. Qumica Orgnica

 Fuente: Wade, L. G. Qumica Orgnica

7. Coenzimas
Los enzimas son proteinas o polipptidos. A veces, su estructura contiene adems un
fragmento no proteico, denominado cofactor o coenzima, que es esencial para el
desarrollo de su funcin. La unin del cofactor con la parte proteica (apoenzima)
suele ser de naturaleza no covalente (puentes de hidrgeno, interacciones
electrostticas, fuerzas de Van der Waals, etc.).
Estas molculas auxiliares conocidas como coenzimas, cofactores, o grupos
prostticos, interaccionan tanto con el enzima como con el sustrato para producir los
procesos qumicos.
Ej.: Coenzima A o CoASH (ver su estructura enTema 15, D-9)

Las protenas en general, pueden participar a travs de sus cadenas laterales en un

nmero de procesos qumicos bastante limitado, destacando la donacin o
abstraccin de protones y la adicin nuclefila a grupos carbonilo.
 En muchos procesos biolgicos se requiere una reactividad ms rica, y entonces las
protenas actan en conjuncin con molculas orgnicas no proteicas para llevar a
cabo las reacciones qumicas deseadas, originando lo que se denominan protenas
conjugadas. As, pueden catalizar oxidaciones y reducciones biolgicas en presencia
de la coenzima adecuada.
Ej.: Grupo Hemo de la hemoglobina

LIPIDOS

1. Introduccin y clasificacin
Son sustancias que se extraen con disolventes apolares (cloroformo o ter etlico) de
cualquier tejido animal o vegetal.

Caracterstica general de los lpidos

Escasa polaridad
Definidos por la operacin fsica que utilizamos para aislarlos

(Al contrario ocurre con carbohidratos y protenas, que se definen en trminos de sus
estructuras)

Hay tres tipos de lpidos:

Lpidos saponificables
cidos grasos
Lpidos insaponificables
Los lpidos son solubles en disolventes orgnicos apolares. Los lpidos tienen una gran
variedad estructural.
Lipidos complejos y lpidos simples:

Los lpidos son importantes componentes de las membranas celulares

2. Ceras
Las ceras son esteres de los cidos grasos con alcoholes de peso molecular elevado, es
decir, son molculas que se obtienen por esterificacin de un cido graso con un alcohol
monovalente lineal de cadena larga.

3. Glicridos (aceites y grasas)

Las grasas saturadas se encuentran en productos animales tales como la mantequilla, el

queso, la leche entera, los helados, la crema y las carnes grasosas, al igual que en los
aceites como el de coco, de palma y de semilla de palma.
Modificaciones industriales
Hidrogenacin industrial de triacilgliceroles. Aceites vegetales lquidos se pueden hidrogenar
para dar grasas solidas comestibles.

La hidrogenacin parcial tambin puede isomerizar los enlaces cis a trans. Las grasas trans
se han asociado con el riesgo de enfermedades cardiovasculares.

4. cidos grasos
Estructuras y puntos de fusin de algunos cidos grasos
Flexibilidad y estereoqumica
cidos grasos insaturados ms importantes

cidos grasos esenciales no biosintetizados por el hombre ni por muchos mamferos. Debe
estar presente en nuestra dieta.

Importancia fisiolgica: cido araquidnico es precursor de las prostangladinas, entre otras

molculas.
Las grasas son ricas en cidos grasos saturados: alto empaquetamiento de molculas,
slidos (alto punto de fusin)

Los aceites son ricos en cidos grasos insaturados: bajo empaquetamiento de molculas,
lquidos (bajo punto de fusin)

Jabones y detergentes
Cadena apolar muy larga, soluble en grasas, y un extremo polar, soluble en agua.
Los detergente o jabones biodegradables contienen cadenas carbonadas rectas, anlogas
a las grasas naturales. Se metabolizan mediante bacterias en plantas de tratamiento de
aguas residuales.

Las sales de cidos carboxlicos de cadena larga se llaman jabones. En agua, los jabones se
encuentran formando clusters esfricos llamados micelas (emulsin de una grasa en una
disolucin acuosa de un jabn)

En las micelas, el carboxilato del cido graso se posiciona hacia la parte exterior expuesta al
agua. La parte de la cadena de hidrocarburo no polar e hidrofobia se sita hacia el interior.
5. Fosfolpidos
Fosfolpidos mayoritarios en las clulas eucariotas

6. Prostaglandinas
Pertenecen a un conjunto de lpidos llamados eicosanides. Tienen su origen comn a partir
de cidos grasos poliinsaturados C20, los cidos eicosaenoicos, en especial el cido
araquidnico, que el cido cis-5,8,11,14-eicosatetraenoico.

Las prostaglandinas son lpidos cuya molcula bsica est constituida por 20 tomos de
carbono que forman un anillo ciclopentano y dos cadenas alifticas. Se caracterizan por sus
potentes propiedades fisiolgicas.

Interviene en muchas funciones reguladoras:

La secrecin de cido en el estomago
La relajacin y la contraccin del musculo liso
El control de la permeabilidad vascular, la inflamacin y la temperatura corporal.
Tienen un gran potencial como agentes teraputicos:
Aliviar el asma y la congestin nasal
Regulacin de la menstruacin y la fertilidad
Para evitar la fecundacin e inducir la labor del parto.

7. Biosntesis
A partir de los cidos grasos insaturados de 20 tomos de carbono (cido linoleico y
araquidnico). Es una d las importantes funciones que tienen los cidos grasos insaturados
en la naturaleza.

En los mamferos el cido linoleico y araquidnico se obtienen a partir de los aceites

vegetales ingeridos en la dieta. Una de sus funciones es proporcionar las materias primas
para la biosntesis de las prostaglandinas.
Biosntesis de la PGF2 o PF2

Biosntesis de las prostaglandinas

Tiene lugar en el retculo endoplsmico
Se producen en tres fases:
1. Liberacin de cido araquidnico, a partir de los fosfolpidos de la membrana.
2. Oxigenacin de araquidonado, para que producir PGH2, un endoperxido de
prostaglandina que acta como precursor de otras prostaglandinas.
3. En funcin de las enzimas existentes en la clula, la conversin de la PGH en otras
prostaglandinas o en TxA2
PG = Prostaglandina
(A-I) indica la naturaleza de los sustituyentes del anillo
El nmero de dobles enlaces en las cadenas alifticas se indica por un subndice.
REFERENCIAS BIBLIOGRFICAS
L. G. Wade (1993) "QUMICA ORGNICA", Prentice Hall, 5a Ed.
Vzquez, Juan (2003) QUMICA ORGNICA AVANZADA, Cursos de OCW,
Universidad de Sevilla.