Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
Bioelementos y Biomolculas
Bioelementos
De los ms de 100 elementos encontrados en la Tabla peridica, la materia viva est
constituida por unos 70 elementos y solo alrededor de 21, son esenciales para el desarrollo y
conservacin de la vida. Estos elementos se llaman bioelementos o elementos biognicos.
Bioelementos Primarios
Estn formados por: C, H, O, N, P y S, los cuales constituyen alrededor
del 96.2% de la materia viva en base seca. Son los componentes
fundamentales de las biomolculas. Son iimprescindibles para formar:
carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos.
Bioelementos Secundarios
Clasificacin de Grupo comprendido por los iones: Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Cl-. Estos
los bioelementos elementos aunque se encuentran en menor proporcin que los
primarios, tambin son indispensables para los seres vivos. En medio
acuoso (solvente presente en clulas tejidos y rganos), siempre se
encuentran ionizados.
Oligoelementos
Son aquellos bioelementos que se encuentran en los seres vivos en un
porcentaje menor del 0.1%. Algunos, los indispensables, se encuentran
en todos los seres vivos, mientras que otros, variables, solamente los
necesitan algunos organismos. En este grupo se encuentran: Fe, Cu,
Zn, Mn, I, Ni y Co (que aparecen en la mayora de los organismos) y Si,
F, Cr, Li, B, Mo y Al (slo estn presentes en grupos concretos).
Constituyen menos del 0.1% y son esenciales para desempear
procesos bioqumicos y fisiolgicos.
6
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Bioelementos Oligoelementos
Primarios Secundarios Indispensables Variables
C Na+ Mn B
H K+ Fe Al
O Mg2+ Co V
N Ca2+ Cu Mo
P Cl- Zn I
S Si
El hecho de que los bioelementos primarios sean tan abundantes en los seres vivos se debe a
que presentan ciertas caractersticas que los hacen idneos para formar las biomolculas que
constituirn las estructuras biolgicas y llevarn a cabo las funciones vitales.
El C y el N presentan la misma afinidad para unirse al oxgeno o al hidrgeno, por lo que pasan
con la misma facilidad del estado oxidado al reducido. Esto es de gran importancia, pues los
procesos de oxidacin-reduccin son la base de muchos procesos qumicos muy importantes y
en particular de los relacionados con la obtencin de energa como la fotosntesis y la
respiracin celular.
Pueden incorporarse a los seres vivos desde el medio externo (en forma de: CO2, H2O, NO3, N2,
etc).
El tomo de carbono es la base de la qumica orgnica y por lo tanto de la qumica de los seres
vivos. Sus propiedades son nicas ya que tiene la capacidad de unirse con otros tomos de
carbono a travs de enlaces sencillos, dobles y/o triples, formando estructuras lineales,
ramificadas y cclicas.
Biomolculas
Los elementos biognicos se unen por enlaces qumicos para formar las molculas
constituyentes de los organismos vivos, que se denominan biomolculas.
7
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
8
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
El agua
El agua es el componente ms abundante en los seres vivos. Existe tanto en forma intracelular
como fuera de las clulas. En general Se dice que los seres vivos contienen un promedio un
70% de agua. Aunque no todos tienen la misma cantidad. En general los vegetales tienen ms
agua que los animales. Hay tejidos que tienen ms agua que otros por ejemplo, el tejido
adiposo se estima que contiene alrededor de 15%, mientras que tejido nervioso, contiene
aproximadamente el 90%. El contenido tambin vara con la edad del tejido, por ejemplo en la
carne de becerros es ms tierna que la de las vacas, por tener mayor cantidad de de agua.
9
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Propiedades Fsicas
Estructura
Como es del conocimiento general, la molcula de agua est formada por dos tomos de H,
unidos covalentemente a un tomo de O. En la figura de abajo se muestran las distancias de las
variables estructurales de la molcula, medidas en Amstrongs (1 m = 10 000 000 000 de ).
En la siguiente figura se puede observar que los orbitales sp3 forman una estructura tetradrica
(parecida al tomo de carbono en la molcula de metano), de tal forma que quedan dos
orbitales con un par de electrones cada uno. Esta geometra angular de la molcula de agua
tiene enormes implicaciones biolgicas en los seres vivos, tales como la polaridad y la
capacidad para formar puentes de hidrgeno.
Como consecuencia de su geometra, en cada molcula de agua los enlaces covalentes entre
el oxgeno y los dos tomos de hidrgeno forman un ngulo de 104.5. Adems debido a que el
tomo de O es ms electronegativo que el H, atrae ms hacia su ncleo al par de electrones
compartidos y dado que cuenta con sus dos orbitales electrnicos no apareados, en total queda
con una carga parcial negativa de -0.66 e, mientras que cada tomo de H una de +0.33, donde
e es la carga de un electrn. Esta condicin hace que se puedan dar atracciones electrostticas
entre las molcula de agua, as como entre el agua y otras molculas polares o cargadas.
10
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Al ser las molculas de agua dipolos elctricos, pueden formar entre s, las interacciones
llamadas puentes de Hidrgeno que se dan entre el tomo de oxigeno de una molcula y los
tomos de hidrogeno de las molculas vecinas. Estos puentes de hidrogeno se forman y se
rompen a gran velocidad, y su estabilidad disminuye al elevarse la temperatura.
La cohesividad y por lo tanto las interacciones por puentes de H son responsables del elevado
calor especfico del agua (definido como la cantidad de calor necesaria para elevar la
temperatura de una unidad de masa, en un grado). El calor especfico del agua, le permite
ganar o liberar una gran cantidad de calor por cada grado en que vare su temperatura que al
calentarse o al enfriarse.; lo que permite que el agua acte como amortiguador trmico,
evitando bruscas alteraciones de la temperatura y evitando de esta forma que, por ejemplo,
algunas molculas como las protenas, muy sensibles a los cambios trmicos, se alteren.
Por otro lado el agua necesita una gran cantidad de calor para su evaporacin (539 cal/g), lo
cual depende tambin de la cohesividad, pues para pasar del estado lquido al gaseoso es
necesario romper los puentes de H entre las molculas de agua. Esta propiedad tambin es de
gran importancia para la regulacin de la temperatura corporal en muchos seres vivos (por
ejemplo por medio de la sudoracin).
11
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Solubilidad
Debido a su alta polaridad, el agua es un buen disolvente para los compuestos polares e
inicos. Como se puede ver en la siguiente figura, en el estado cristalino los iones de NaCl
permanecen altamente ordenados, mientras que en solucin, las molculas de agua se
disponen alrededor de los iones positivos (Na+) con la parte negativa de su molcula hacia
ellos; por su parte, los iones negativos (Cl-) enfrentan la carga parcial positiva del agua.
La esfera de molculas de agua que rodea a cada in se llama esfera de solvatacin y con
frecuencia contiene varias capas de agua de solvatacin. A las molculas que se pueden
disociar y formar iones en solucin acuosa, se les llama electrolitos. La ionizacin ocurre porque
uno de los tomos gana uno o ms electrones y mientras que el otro se los cede. Los
electrolitos no son las nicas sustancias hidroflicas que son solubles en agua. Toda molcula
polar, tambin tendr tendencia a solvatarse por
molculas de agua. Adems la solubilidad de
muchas sustancias orgnicas aumenta por la
capacidad que tengan sus grupos funcionales
para formar puentes de H con las molculas de
agua.
Algunas sustancias tienen una parte de su molcula que es soluble en agua (hidrfila) y otra
parte insoluble (hidrfoba). Estas sustancias se dice que son anfipticas. Este es un hecho
comn en el caso de molculas de cadenas hidrocarbonadas con un extremo cargado, como
fosfolpidos y esfingolpidos. Cuando las molculas de un compuesto anfiptico estn presentes
en un medio acuoso, se ordenan y orientan para dar lugar a la formacin de micelas o bicapas,
tal y como ocurre en las membranas celulares y en las vesculas, o simplemente en monocapas
al estar presentes en la superficie acuosa.
Las molculas de gran tamao como los polisacridos y las protenas, cuando son solubles en
agua, forman un tipo especial de disoluciones denominadas coloides. Las disoluciones
coloidales pueden existir en los estados: sol y gel. En el estado de sol predomina la fase
dispersante, el agua, por ejemplo, sobre la fase dispersa y la solucin es ms fluida. En estado
de gel predomina la fase dispersa, por ejemplo: la protena, sobre la fase dispersante, y la
solucin es ms viscosa.
El paso de un estado a otro es reversible y diversos factores fsicos y qumicos pueden hacer
que una solucin pase de un estado a otro sin necesidad de variar la concentracin de soluto.
Estos factores pueden ser: el pH, la temperatura o una alteracin en la concentracin de
determinados iones presentes en el medio. Las soluciones coloidales pueden separarse por
13
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
dilisis por medio de membranas cuyos poros slo permiten pasar las molculas de pequeo
tamao y no las partculas coloidales.
Como puede verse en la figura de abajo, en el sentido inverso de la reaccin, los iones hidronio
pueden actuar como cidos (donadores de protones) cediendo su protn hacia el in hidroxilo
formando nuevamente dos molculas de agua (H2O). En este caso el in hidroxilo acta como
base (ganando protones).
La doble flecha de la reaccin de ionizacin del agua indica que ambas reacciones se llevan a
cabo continuamente, es decir se trata de una reaccin reversible. Continuamente molculas de
agua estn formando iones a la vez que esos iones estn regenerndose en molculas de
agua, hasta alcanzar un estado de equilibrio, estado en el cual la concentracin molar de iones
hidronio e hidroxilo, as como la de las molculas de agua sern constantes. Como puede
observarse sin embargo la flecha de reaccin en sentido hacia la ionizacin es menor que la
flecha en sentido inverso hacia la regeneracin de las molculas de agua. Esto indica que en el
equilibrio tendremos una concentracin mayor de molculas de agua que la concentracin de
los iones.
14
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
O bien:
Si se sabe que la densidad del agua es de 1000 g/L y su peso molecular es de 18 g/mol, es
posible calcular la molaridad del agua, sabiendo que:
15
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Ese valor se conoce como producto inico del agua y como es constante ms precisamente se
la llama constante de producto inico del agua. Como en el agua pura al ionizarse se producen
cantidades estequiomtricamente iguales de H+ y OH-:
Y tambin:
Dado lo anterior, se dice que el agua pura es neutra porque existe igual nmero de cargas
positivas (H+) y negativas (OH-).
Existen varios procesos bioqumicos que estn controlados por la concentracin de H+ (ms
exactamente sera por la de H3O+), entre ellos podemos citar: el transporte de O2 en la sangre,
la fotosntesis, la respiracin y la catlisis enzimtica.
Entonces se concluye que las soluciones neutras tienen un valor de pH igual a 7.0. Las
soluciones cidas, dado que tienen un soluto donador de H+ al medio acuoso, tienen valores de
pH por debajo de 7.0. As por ejemplo una solucin de HCl a 0.01 M (igual a 1 x10 -2 M) como es
un cido fuerte se ioniza completamente por lo que la concentracin de iones H+ en la
solucin ser tambin de 1 x10-7 M y el valor del pH es 2.0. As mientras mayor sea la
concentracin de H+ en la solucin, el valor del pH ser ms bajo.
Las soluciones acuosas tambin pueden tener concentraciones de H+ menores que la del agua.
Esto ocurre cuando se agrega al agua un compuesto bsico (que gana protones), por ejemplo
NaOH. El NaOH es una base fuerte que se ioniza completamente en solucin acuosa, en este
16
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
caso los iones OH- de la base se combinarn con los H+ del agua y formarn nuevas molculas
de agua. Por ejemplo si se tiene una solucin de NaOH a 0.01 M (1 x10-2). En este caso la
concentracin de H+ se modifica de la siguiente manera:
En la figura de ms abajo se
muestran los valores de pH
para diferentes lquidos
cidos y alcalinos.
17
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Por lo poco prctico de manejar los valores de Ka, al igual que en el caso del pH, se prefiere
manejar su valor logartmico negativo.
En la tabla de enseguida se pueden observar los valores de las constantes de disociacin (Ka)
de algunos cidos dbiles y sus respectivos valores de pKa, al ionizarse parcialmente en
solucin acuosa.
En los cidos dbiles Ka es < 1, mientras que en los cidos fuertes Ka es >>1.
El pH de una solucin est determinado por las concentraciones relativas de cidos bases. La
relacin de pH de una solucin y la concentracin de un cido y su base conjugada se calcula
fcilmente mediante la ecuacin de Ka:
18
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Despejando [H+]:
Y como:
Entonces:
Y como:
Entonces:
Cuando las concentraciones de ambas especies qumicas sean iguales, el valor de pH ser
exactamente igual al valor de pKa. La figura de la pgina siguiente muestra la curva de
titulacin del cido actico (CH3COOH) en solucin acuosa, con una base (OH-) tambin en
solucin acuosa.
19
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Para comprender como se amortiguan los cambios de pH en un sistema biolgico, hay que
considerar lo que ocurre durante la titulacin de un cido dbil con una base fuerte. En la figura
de enseguida se puede observar como varan los valores de pH de soluciones de cido actico,
In H2PO4- y amonio (NH4+) a medida que se les agrega NaOH (iones OH-).
Cuando los iones de OH- reaccionan con las molculas de HA, los productos son A- y H2O:
1.- Las curvas de titulacin de las soluciones de la figura anterior tienen formas similares pero
corridas verticalmente a lo largo del eje de pH, es decir cada una de ellas tiene valores de pK a
diferentes. .
2.- El valor del pH en el punto medio de cada titulacin es igual numricamente al valor de pKa
dado que en dicho punto, la concentracin molar del la molcula sin disociar es igual a la
concentracin molar del in hidrgeno:
20
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
3.- Las pendientes de cada curva de titulacin son mucho menores cerca de su punto
medio que en loes extremos; es decir cuando [HA] [A-], el pH de la solucin es relativamente
estable al estar agregando una base fuerte. Igualmente ocurre si se agrega un cido fuerte.
Estas soluciones se conocen como amortiguadoras o buffers cido-base, debido a que resisten
los cambios de pH al aadir pequeas cantidades de cido o base fuerte, debido a que los
iones H+ y OH- reaccionan con A- y HA respectivamente, sin modificar en gran medida la
relacin:
Por lo tanto:
cidos poliprticos
Algunas sustancias tienen la
particularidad de poder perder o ceder ms
de un protn, se conocen como cidos
poliprticos; tal es el caso del cido fosfrico
(H3PO4) y del cido carbnico (H2CO3). Un
cido poliprtico tiene varios valores de pKa,
uno para cada paso de ionizacin.
21
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Muchas molculas biolgicas actan como cidos poliprticos pudiendo ceder 2 o ms iones
hidrgeno al medio (por ejemplo los aminocidos) y por lo tanto tambin pueden tener efecto
amortiguador del pH.
El plasma sanguneo de los mamferos es un ejemplo de una solucin con una excelente
capacidad amortiguadora del pH a nivel biolgico, ya que su pH ( 7.4) se mantiene constante
en diversas circunstancias fisiolgicas. La tabla de abajo indica la capacidad de
amortiguamiento del pH del plasma sanguneo con respecto al agua o a un suero fisiolgico que
contiene 0.15 M de NaCl.
El pH de la sangre se
regula principalmente por
el sistema amortiguador:
Dixido de carbono/cido
carbnico/Bicarbonato.
En la grfica de al lado se
observan los porcentajes
relativos de cido
carbnico y sus bases
conjugadas en funcin del
pH. Ntese que a pH 7.4
las concentraciones de
cido carbnico (H2CO3) y
bicarbonato (HCO3-) son apreciables, mientras que la de in carbonato (CO3-2) son
prcticamente nulas.
22
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Ya en el interior de las clulas, las protenas, pptidos, aminocidos libres y las especies
qumicas de fosfatos inorgnicos son los que realizan el amortiguamiento del pH. Como se dijo
antes, las especies H2PO4- y HPO4-2 porque su pKa es de 7.2.
cidos fuertes.
1.- Cul es el pH de una solucin acuosa que contiene 10-4 moles de HCl por litro?
23
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Esto es porque:
cidos dbiles.
Primero se debe calcular la concentracin molar del cido actico y del acetato en la
solucin, usando la frmula:
Despejando:
Entonces:
24
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
A partir de la tabla de Ka y pKa, se sabe que la constante de disociacin del cido actico
es 1.74 x10-5 M.
Como el cido actico se disocia en el agua para formar los iones acetato e hidrgeno,
para encontrar el pH de la solucin se requiere determinar la concentracin molar de
iones hidrgeno ([H+]). Si representamos a la concentracin molar desconocida de
hidrgeno con el valor x y si sabemos que en el equilibrio la concentracin molar de
ambos iones es igual, tendramos:
Despejando y multiplicando:
Reordenando:
-bb -4ac
x=
a
25
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
Sustituyendo:
Resolviendo:
Como:
Por lo que:
Resolviendo:
Calculando el pH:
26
Temas Selectos de Bioqumica General
Material para uso educativo y no de lucro
Elaborado por: Sergio F. Moreno Salazar
4.- Calcular los volmenes de cido actico 0.1 M y de acetato de sodio 0.1 M que se
requieren para preparar un litro de solucin amortiguadora a un pH de 5.8.
Esta ltima relacin indica que la concentracin molar del acetato en la solucin debe ser 10
veces mayor que la del cido actico. En este caso, como se est partiendo de iguales
soluciones iniciales de igual concentracin para ambas especies qumicas (0.1 M, en cada
caso), la relacin de concentraciones puede transformarse directamente a una relacin de
volmenes, por lo que para formar un litro de solucin buffer se requieren un volumen de
acetato y diez volmenes de cido actico:
27