Dra. Ktia R. P.

de Arajo Sgrillo
katiasgrillo@uesc.br
 (alfabeto da bioqumica)
Todas as protenas so formadas por um conjunto de 20
aminocidos covalentemente ligados em uma seqncia linear
caracterstica.
Aminocidos Nas protenas, os aminocidos
das protenas possuem um grupo carboxlico
e um grupo amino ligados ao
H mesmo tomo de carbono,
diferindo um do outros pelas
H3N C COOH cadeias laterais, que variam de
Grupo amino
Grupo carboxila estrutura, tamanho e carga
(pK2)
(pK1) eltrica. Seus nomes so
abreviados em 3 letras e
cadeia lateral - diferente
para cada aminocido
simbolizados por uma letra.
(pK3)
 1.Amonocidos 2.Amonocidos
no polares polares

4. Amonocidos 5. Amonocidos
carregados polares no
positivamente carregados
positivamente
3.Amonocidos
aromticos
1.
pK1 pK2 pK3

Glicina (Gly) [G] 2,4 9,8 -

Frmula estrutural
Alanina (Ala) [A] 2,4 9,9 -

Valina (Val) [V] 2,2 9,7 -

Leucina (Leu) [L] 2,3 9,7 -

Isoleucina (Ile) [I] 2,3 9,8 -

Prolina (Pro) [P] 2,0 10,6 -

 2.
pK1 pK2 pK3

Serina (Ser) [S] 2,2 9,2 ~13

Frmula estrutural
Treonina (Thr) [T] 2,1 9,1 ~13

Cistena (Cys) [C] 1,9 10,8 8,3

Metionina (Met) [M] 2,1 9,3 -

Asparagina (Asn) [N] 2,1 8,8 -

Glutamina (Gln) [Q] 2,2 9,1 -

3.
pK1 pK2 pK3
Fenilalanina (Phe) [F] 2,2 9,2 -

Tirosina (Tyr) [Y] 2,2 9,1 10,1

Triptofano (Trp) [W] 2,4 9,4 -

Frmula estrutural
4.
pK1 pK2 pK3
Arginina (Arg) [R] 1,8 9,0 12,5

Lisina (Lys) [K] 2,2 9,2 10,8

Histidina (His) [H] 1,8 9,3 6,0

Frmula estrutural
5.
pK1 pK2 pK3
cido aspartico (Asp) [D] 2,0 9,9 3,9

cido glutmico (Glu) [E] 2,1 9,5 4,1

Frmula estrutural

c. aspartico c. glutmico
 dos Aminocidos

1. Primeira letra
especial - se somente
um aminocido inicia com
determinada letra, ela ser
usada como smbolo.
3. Semelhante a
pronuncia inglesa
Alguns dos smbolos de uma
letra tem som semelhante ao
nome dos aminocidos que eles
representam.

2. Ocorrncia mais 4. Letra prxima

comum- Se mais de um a letra inicial
aminocido inicia com Para os aminocidos
determinada letra, o mais restantes, e escolhido um
comum destes recebera esta smbolo de uma letra o
letra como seu smbolo. mais prximo possvel no
alfabeto a inicial do
aminocido.
Os aminocidos em soluo aquosa, so
ionizados e podem agir como cidos e bases, e
potencialmente podem agir como
tampes
A caracterstica cido/bsica dos aminocidos o que determina
as propriedades fsicas e biolgicas das protenas.

A relao quantitativa entre a concentrao de um

cido fraco (HA) e sua base conjugada (A-)
descrita pela equao de Henderson-Hasselbach.

pH = pK + log [A-]
[ HA]
 Tem curvas de titulao caractersticas que
fornecem 3 informaes importantes:

Medida quantitativa
de pK para cada um
dos 2 ou 3 grupos
ionizantes

Comportamento pI - a carga eltrica

como tampo liquida dos aminocidos e
sua relao com o pH da
soluo
 pH isoeltrico o pH mdio entre os valores de
pK de cada lado das espcies isoeltricas. NH3+

O-

O
pH isoeltrico
Estrutura isoeltrica ou
Estruturas isoeltricas que embora Zwitterinica da alanina
carregados eletricamente, o on hbrido no
apresenta uma carga efetiva, e portanto no
migra em um campo eltrico.
Quando o
pI = pK1 + pK2 aminocido tem 2
grupos dissociveis
2
pI = pK1 + pK3 pI = pK2 + pK3
Quando o
aminocido tem 3
ou
grupos dissociveis 2 2
 Os valores de pK expressam a fora dos cidos fracos (logaritmico da
constante de dissociao, Ka).
E, a carga lquida (soma algbrica de todos os grupos carregados negativamente
presentes) de um aminocido depende sobretudo do pH, ou concentrao protnica da
soluo em que est contido.

A habilidade para alterar a carga sobre os aminocidos pelo

monitoramento do pH facilita a separao fsica de
aminocidos, peptdeos e protenas.
 sofrem
caractersticas
dos seus grupos funcionais

usada para detectar e quantificar

aminocidos.
Quando aminocidos so
aquecidos com excesso de
ninidrina, todos aqueles
contendo um D-amino grupo
livre produzem um produto
de colorao prpura.

Reagente mais sensvel, detecta

nanogramas de aminocidos