Sntesis de protenas

La sntesis de protenas se lleva a cabo en dos etapas: la primera etapa (transcripcin) ocurre
dentro del ncleo de las clulas eucariotas, aqu la secuencia se transcribe en una molcula de
ARN, el cual es denominado ARN mensajero (ARNm) y la segunda etapa (traduccin - sntesis de
protena propiamente dicha) el ARNm pasa del ncleo al citoplasma donde el mensaje es
traducido por los ribosomas que arman una protena.

La informacin gentica del ADN debe descodificarse para poder ser utilizada por la clula, ya que
el ADN como tal tiene una escasa accin sobre el funcionamiento de los organismos: los genes no
transportan oxgeno, no catalizan reacciones para obtener energa, ni destruyen a los grmenes
invasores lo hacen las protenas que se sintetizan a partir de dichos genes.

Los genes que formarn protenas se denominan genes estructurales, se transcriben y se traducen,
produciendo ARNm. No obstante, no todos los genes almacenan informacin para sintetizar
protenas, algunos se transcriben pero no se traducen dando lugar a molculas de ARNr y ARNt,
colaboradores del proceso de biosntesis proteica. Adems, existen secuencias gnicas
reguladoras, que ni se transcriben ni se traducen, pero son de gran importancia ya que actan
como signos de puntuacin, indicando donde se debe comenzar a transcribir el gen y dnde debe
finalizar la lectura.

Los avances en las distintas ramas de la biologa permitieron a Francis Crick enunciar en 1970 el
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR:

De manera que la informacin gentica contenida en el ADN se mantiene mediante su capacidad

de replicacin. La informacin contenida en el ADN se expresa dando lugar a protenas, mediante
los procesos de transcripcin, paso por el que la informacin se transfiere a una molcula de ARN
mensajero y, mediante el proceso de la traduccin el mensaje transportado por el ARN-m se
traduce a protena.
 Este esquema central de flujo de la informacin pronto fue modificado, ya que en algunos virus
cuyo material hereditario es ARN, la informacin se mantiene mediante replicacin del ARN.
Adems, tambin se comprob que la informacin no va siempre del ADN hacia el ARN
(ADNARN), en algunos casos se puede sintetizar ADN tomando como molde (ARNADN), es
decir, teniendo lugar el fenmeno de la transcripcin inversa.

Los priones (partcula proteincea infecciosa) son protenas, carentes, por tanto, de informacin
gentica codificada por medio de cidos nucleicos. Interaccionan con otras protenas similares a
l, cambindoles de forma externa, las induce a adoptar la forma anmala del prin, mediante un
mecanismo todava desconocido. Todo ello en una accin en cadena que acaba por destruir la
operatividad de todas las protenas sensibles.

CARACTERSTICAS DE LA EXPRESIN GNICA

En lneas generales, la expresin de los genes es un proceso universal caracterstico de todos los
seres vivos, pero existen algunas diferencias entre clulas eucariotas y procariotas:

EL ADN de procariotas tiene bajo grado de empaquetamiento siendo de fcil acceso para la
transcripcin, mientras que en eucariotas est asociado a histonas para formar la cromatina y
debe desempaquetarse para acceder a l, por lo tanto es de difcil acceso.
En procariotas hay un solo tipo de ARN polimerasa para la sntesis de las tres clases de ARN. Sin
embargo, en eucariontes hay diferentes polimerasas encargadas de sintetizar los distintos tipos
de ARN.

Las ARN polimerasas, a diferencia de lo que ocurre con las ADN polimerasas, carecen de funcin
"correctora de pruebas". Esta diferencia se debe, en primer lugar, a que los transcritos son cortos
y la probabilidad de que uno de los ARN posea una alteracin es baja, y en segundo lugar, a que la
vida media de los ARN es corta y pronto se vuelve a sintetizar otro ARN nuevo. Por consiguiente el
que exista un ARN con una alteracin no es grave ya que durar poco y ser remplazado pronto
por otro nuevo sin la alteracin. Sin embargo, un error en la replicacin del ADN puede
transmitirse a todas las clulas que deriven por divisin de la clula afectada.
 Los procariotas carecen de ncleo, por lo
que la transcripcin y la traduccin
tienen lugar en el citoplasma bacteriano
y al mismo tiempo, son simultneas. Sin
embargo, en eucariotas la transcripcin
tiene lugar en el ncleo y despus en el
citoplasma sucede la traduccin.

Casi todos los genes de procariotas son

policistrnicos, de manera que se
transcriben en una larga cadena de
ARNm que contiene informacin para la
sntesis de varios polipptidos distintos.
En eucariontes los ARN-m son
monocistrnicos, de manera que un
ARN-m contiene informacin para
sintetizar un solo polipptido.

Los genes procariotas son unidades continuas que

contienen toda la informacin necesaria para la
sntesis de las protenas; sin embargo en los
eucariotas, los genes se encuentran fragmentados:
cada gen consta de segmentos con informacin
llamados exones (se transcriben y se traducen) y
segmentos sin informacin llamados intrones (se
transcriben pero no se traducen).
Herencia y replicacin del ADN

El ADN posee la informacin necesaria para transmitir los caracteres de una especie de generacin
en generacin y conseguir la supervivencia de la especie. Por lo tanto la molcula de ADN
constituye la base qumica de la herencia. La mayora de las molculas de ADN se encuentran en
los cromosomas del ncleo de las clulas. El nmero de cromosomas depende de la especie, as
por ejemplo, las bacterias poseen un nico cromosoma, mientras que las clulas humanas poseen
46 (23 de cada progenitor). La informacin gentica en forma de ADN se organiza
estructuralmente dentro del cromosoma arrollndose alrededor de ciertas protenas (histonas)
constituyendo asociaciones ADN-protena denominadas nucleosomas.

Las cadenas de ADN de cada especie difieren en longitud y en la secuencia de las bases
nitrogenadas, de tal manera que esta secuencia contiene la informacin gentica caracterstica de
cada especie. La informacin gentica debe reproducirse exactamente cada vez que la clula se
divide. El proceso por el que las molculas de ADN se copian a si mismas en el ncleo de las clulas
recibe el nombre de replicacin del ADN. La replicacin pretende a partir de una cadena de ADN
obtener dos iguales.
Principales caractersticas de la replicacin

Las caractersticas principales del proceso son: su carcter semiconservador, la realizacin

simultanea en ambas hebras, de forma secuencial y con carcter bidireccional y origen monfocal
(procariotas) o multifocal (eucariotas).

Semiconservador. Es decir cada hebra sirve como molde para la sntesis de una nueva cadena,
produciendo dos nuevas molculas de ADN, cada una con una de las hebras viejas y una nueva
hebra hija. Esta hiptesis fue propuesta pro Watson and Crick poco despus de la publicacin del
modelo de la doble hlice, y fue probado definitivamente por los ingeniosos experimentos
diseados por Meselson and Stahl en 1957.

Solo caben tres posibles hipteisis para explicar el mecanismo de la repiclacin: conservadora (las
dos hebras se copiaran para dar una nueva molcula, de forma que el ADN progenitor permanece
intacto y el ADN hijo tendra dos hebras nueva), dispersante (el ADN progenitor se rompera antes
de que se sintetizaran los nuevos fragmentos de ADN, estos luego se uniran a los fragmentos
originales para dar ADN hijos con fragmentos tanto nuevos como de las dos hebras del progenitor)
y semiconservadora (Las dos nuevas molculas de ADN formadas tienen cada una una hebra vieja
y una hebra nueva).

Meselson and Stahl cultivaron clulas de E.coli en medio con N15 (istopo pesado de N14) durante
muchas generaciones, hasta que todo el ADN de E. coli estuviera marcado con N15. El ADN aislado
de estas clulas tena una densidad un 1% mayor que el ADN normal con N14. Esta pequea
diferencia puede apreciarse en una centrifugacin en gradiente de densidad CsCl.

Las clulas de E. coli cultivadas con N15 se transfierieron a medio fresco con N14, y se dejaron
crecer durante el tiempo suficiente para que la poblacin se duplicara. El ADN aislado de estas
clulas formaba una sola banda en la centrifugacin en gradiente. Esto eliminaba al hiptesis de la
replicacin conservadora. Si las clulas de E. coli se dejaban en el medio fresco con N14 durante
dos generaciones se observaban en la centrifugacion en gradiente dos bandas. Una con la
densidad correspondiente al ADN ligero y otra con la densidad del ADN mixto obtenido en la
primera generacin. Esto descartaba tambin la hiptesis dispersante y confirmaba la replicacin
semiconservativa como la nica hiptesis posible.

Bidireccional. La separacin de las hebras progenitoras que comienza en cada origen de

replicacin progresa en ambas direcciones. Los puntos de transicin entre la doble hebra y las
hebras sencillas se llaman horquillas de replicacin y van alejndose entre si. Estos datos se
obtuvieron utilizando el marcaje isotpico del ADN con Titrio H3. El ADN marcado, aislado y
expuesto a una emulsin fotogrfica durante semanas poda fotografiarse. Si el titrio se aadia
durante un corto perodo de tiempo y la reaccin se paraba observando los autoradiogramas
poda observarse que el ADN marcada apareca a ambos lados de la horquilla de replicacin.

El inicio de la replicacin en procariotas es monofocal, comienza siempre en un punto

determinado del cromosoma circular denominado origen (ORI). La replicacin progresa formando
dos horquillas de replicacin. Por el contrario en eucariotas la replicacin es multifocal, pues en
cada cromosoma existen mltiples orgenes de replicacin (cientos o miles) que dan lugar a un
nmero doble de horquillas de replicacin. Esto permite completar la replicacin de los
cromosomas en un tiempo razonable. Esto puede visualizarse mediante microscopia electrnica.
Vemos como la replicacin de un cromosoma circular se inicia un punto en concreto y es
simultanea (las dos hebras se replican a la vez).

Semidiscontinuo. Como veremos ms adelante la sntesis de la nueva cadena tiene siempre lugar
en el sentido 5`-3`, siendo el grupo 3`OH el punto por el cual el ADN es elongado. Esto es vlido
para todas las polimerasas tanto la ADN como las ARN polimerasas. Si las dos hebras son
antiparalelas, como pueden las dos hebras ser sintetizadas de manera continua mientras progresa
la horquilla de replicacin. La solucin que la clula adopta ante este problema fue descubierta
por Okazaki. Que descubri que una de las hebras era sintetizada en pequeos fragmentos
llamados fragmentos de okazaki. Por lo tanto una de las hebras es sintetizada de forma continua, y
la otra de forma discontinua. La longitud de los fragmentos de okazaki puede variar desde unos
cientos de nucletidos hasta unos miles, segn el tipo de clula.

Pasos de la replicacin del ADN en eucariotas

La replicacin se lleva a cabo gracias a la ADN polimerasa III, esta enzima cataliza la unin de los
desoxinucletidos trifosfato que son abundantes en el fluido del ncleo celular. Estos
desoxinucletidos trifosfato se desplazan hacia la parte desenrollada de la molcula de ADN y se
colocan por complementariedad enfrente de la base que les corresponde (A=T; C=G) de la cadena
que acta como molde, y una vez que estn en el sitio adecuado se unen entre si por accin de la
polimerasa III. La adicin de dos unidades nucletidicas consecutivas tiene lugar mediante la unin
del grupo hidroxilo del carbono 3`de un nucletido con el grupo fosfato del extremo 5`del
siguiente. El mecanismo por el que se produce esta unin es un ataque nucleoflico del grupo 3`-
OH de un nucletido al 5`-trifosfato del nulcetido adyacente, eliminndose el pirofosfato y
formndose un enlace fosfodister. La polimerasa lee la hebra que hace de molde en el sentido
3` 5` y sintetiza la nueva hebra en el sentido 5` 3`. Esta enzima necesita para iniciar la sntesis
un pequeo fragmento de nucletidos que denominamos cebador. En la sntesis del cebador
interviene un tipo de ARN polimerasa denominado primasa.

Durante el proceso de replicacin, una de las cadenas madre se lee bien (en sentido 3` 5`) y,
por lo tanto, la nueva cadena se sintetiza de corrido (hebra conductora), pero la otra est
dispuesta en sentido contrario al que la polimerasa puede leer (hebra retardada). La solucin a
este problema es sintetizar la cadena en pequeos fragmentos en el sentido 5` 3`. Los cebadores
son luego eliminados por la accin exonucleasa de la ADN polimerasa tipo I y los nuevos
fragmentos resultantes son unidos por la accin de la ligasa, que elimina las mellas que quedan
entre fragmentos. La secuencia de pasos implicados la replicacin del ADN puede resumirse como
sigue (Figura 2):
- Apertura de la doble hlice del ADN por accin de las helicasas

. - Sintesis de los cebadores para que la ADN polimerasa pueda actuar. Las enzimas implicadas
denominan primasas.

- Se inicia la polimerizacin por accin de la ADN polimerasa III

- Cuando se alcanza el cebador del fragmento sintetizado anteriormente la Polimerasa I sustituye a

la Pol III y, haciendo uso simultneo de sus actividades exonucleasa (degradadadora de
nucletidos) y polimerasa, va sustituyendo los cebadores por el ADN correspondiente.

- Las ligasas cierran las mellas que hay entre cada dos fragmentos.
TRANSCRIPCIN
La transcripcin consiste en la sntesis de ARN tomando como molde ADN y significa el paso de la
informacin contenida en el ADN hacia el ARN. La transferencia de la informacin del ADN hacia el
ARN se realiza siguiendo las reglas de complementaridad de las bases nitrogenadas y es semejante
al proceso de transcripcin de textos, motivo por el que ha recibido este nombre. El ARN producto
de la transcripcin recibe el nombre de transcrito.

En las bacterias la transcripcin y la traduccin tienen lugar en el citoplasma bacteriano y al mismo

tiempo, son simultneas. Sin embargo, en eucariontes la transcripcin tiene lugar en el ncleo y la
traduccin en el citoplasma.

Mediante experimentos de pulso y caza, se suministran precursores radiactivos que marcan

especficamente el ARN (uridina tritiada) a las clulas durante un breve perodo de tiempo (pulso).
Una vez que las clulas han incorporado la uridina tritiada se transfieren a un medio con
precursores sin marcar (caza). De este forma es posible seguir el destino del ARN marcado durante
el pulso, ya que la sntesis del nuevo ARN se produce con precursores sin marcar (uridina normal).
Las muestras de clulas tomadas despus de la caza, mostraban marcaje en el ncleo, indicando
que ARN se sintetiza all, sin embargo, las muestras de clulas tomadas despus de la caza
mostraban el marcaje radiactivo en el citoplasma. Por tanto, parece que el ARN se sintetiza en el
ncleo y se transporta posteriormente al citoplasma.

Volkin y Astrachan (1957) demostraron que despus de la infeccin de E. coli por el fago T2
aumenta la sntesis de ARN y que este ARN inducido por la infeccin de T2 tiene una vida media
muy corta. Infectaron bacterias con el fago T2 en un medio que contena uridina tritiada, base
nitrogenada especfica del ARN (pulso), y despus las pasaron a un medio con uridina normal no
marcada (caza). El ARN recuperado despus del pulso estaba marcado, pero el obtenido despus
de la caza no lo estaba, lo que indicaba que el ARN tena una vida media muy corta. Por ltimo
cuando se compar el porcentaje de los diferentes tipos de nucletidos del ARN sintetizado
inmediatamente despus de la infeccin por T2 y del ADN del fago, se observ que era muy
parecido, sugiriendo este resultado que el ARN sintetizado despus de la infeccin por T2 proceda
del ADN del fago.
Este proceso lo realiza una ARN polimerasa que tienen los siguientes requerimientos:

Une nucletidos mediante enlace fosfodister, en sentido 5 3.

Utiliza nucletidos trifosfato
Se fija a regiones especficas del ADN, llamadas regiones promotoras, para comenzar su
accin a partir de ese punto.
Necesitan una molcula de ADN que utilizar como molde para realizar la sntesis de ARN.
La hebra molde ser siempre la hebra de direccin 3 5, a la otra (5 3) se le
denomina hebra informativa.

LAS ARN POLIMERASAS Y LOS DISTINTOS TIPOS DE ARN

El ARN suele tener una sola hlice o cadena de nucletidos pudiendo formar una amplia gama
estructuras tridimensionales diferentes. El ARN contiene como azcar a la ribosa y las bases
nitrogenadas mayoritarias que posee son adenina (A), guanina (G), citosina (C) y uracilo (U). Por
tanto, el uracilo (U) es caracterstico del ARN. Tambin se han encontrado bases poco frecuentes
que forman parte del ARN, como son: la pseudouridina (), metilguanosina (mG),
dimetilguanosina (m2G), metilinosina (mI) y dihidrouridina (DHU, UH2).

En las clulas existen diferentes tipos de ARN. Por un lado estn los ARN funcionales, o ARN que
tienen una funcin o actividad en la clula y que no se traducen a protena. Dentro de esta
categora estn el ARN ribosmico (ARN-r) que forma parte de los ribosomas que intervienen en la
traduccin, los ARN transferentes (ARN-t) cuya funcin es transportar a los aminocidos durante el
proceso de traduccin, los ARN nucleares pequeos (ARN-np) que interaccionan con protenas
formando los complejos de ribonucleoprotenas necesarios para el procesamiento de los
transcritos en el ncleo y los ARN citoplsmicos pequeos (ARNcp) que intervienen en el trasporte
de los polipptidos en las clulas eucariticas.

Por otro lado, estn los ARN informativos que son los que se van a traducir a protenas. Estos ARN
informativos son los ARN mensajeros (ARN-m). En bacterias el transcrito primario, tal y como se
sintetiza ya es el ARN-m maduro que se traduce a protenas. En eucariontes, el ARN recin
transcrito se denomina ARN heterogneo nuclear (ARN-hn) y es un pre-ARN-m que es procesado
antes de convertirse en el ARN-m maduro que posteriormente se traducir a protena.

En bacterias, existe solamente una ARN polimerasa que es capaz de sintetizar todos los tipos de
ARN, el ribosmico, el transferente y los mensajeros. La ARN polimerasa de E. coli est formada
por varios polipptidos, el ncleo central del enzima tiene dos cadenas de tipo (peso molecular
de 40.000), una (peso molecular de 155.000) otra ' (peso molecular de 165.000). Adems, la
enzima completa u holoenzima tiene la subunidad o factor (peso molecular de 95.000)que es
necesario para iniciar la transcripcin. La subunidad una vez inciada la transcripcin se libera y el
ncleo central prosigue con la elongacin del ARN.

En bacterias, con mucha frecuencia, los ARN-m son polignicos o policistrnicos, de manera que
un solo ARN-m contiene informacin para la sntesis de varios polipptidos distintos.
Habitualmente se trata de genes que comparten un sistema comn que controla su expresin
(opern).

Sin embargo, en eucariontes hay diferentes polimerasas encargadas de sintetizar distintos tipos de
ARN

La ARN polimerasa I sintetiza los precursores del ARN ribosmico (ARN-r).

La ARN polimerasa II produce ARN heterogneo nuclear (ARN-hn) que tras el
procesamiento da lugar a los ARN mensajeros (ARN-m) que se traducen a protenas.
La ARN polimerasa III transcribe los precursores de los ARN transferentes (ARN-t), los ARN
nucleares y citoplsmicos de pequeo tamao y los genes para el ARN 5S que forma parte
de la subunidad grande de los ribosomas.

Las ARN polimerasas eucariticas son bastante ms complejas que las de E. coli, poseen
subunidades semejantes o correspondientes a las de E. coli y otras que no lo son.

Las ARN polimerasas o trasncriptasas, a diferencia de lo que ocurre con las ADN polimerasas,
carecen de funcin "correctora de pruebas". Esta diferencia se debe en primer lugar a que los
transcritos son cortos y la probabilidad de que uno de los ARN posea una alteracin es baja, y en
segundo lugar a que la vida media de los ARN es corta y pronto se vuelve a sintetizar otro ARN
nuevo. Por consiguiente el que exista un ARN con una alteracin no es grave ya que durar poco y
ser remplazado pronto por otro nuevo sin la alteracin. Sin embargo, un error en la replicacin
del ADN puede transmitirse a todas las clulas que deriven por divisin de la clula afectada.

En eucariontes los ARN-m son monognicos o monocistrnicos, de manera que un ARN-m

contiene informacin para sintetizar un solo polipptido.

TRANSCRIPCIN EN PROCARIOTAS

Como hemos mencionado anteriormente, en las clulas procariotas existe una nica ARN
polimerasa. sta, para poder reconocer a la secuencia promotora del ADN, donde debe comenzar
la trascripcin tiene que unirse al factor1 sigma, tras lo cual cambia de conformacin y puede
unirse a la regin promotora, una secuencia rica en bases de T y A (TATAATG). Una vez realizada la
unin, el factor se separa, listo para volver a comenzar.

La ARN polimerasa fijada en el ADN produce el desenrollamiento de una vuelta de la hlice y

comienza la sntesis de ARN en direccin 5 3. La sntesis termina cuando la ARN polimerasa
llega a una zona del ADN denominada seal de terminacin, que tienen una secuencia rica en G y
C. En esta fase intervienen el factor rho, una enzima con actividad ATPasica, que reconoce esta
secuencia.

La transcripcin tiene lugar en los procariotas en el citoplasma, y una vez formado este ARNm
puede comenzar la traduccin, de hecho, antes de que termine la transcripcin puede comenzar la
traduccin, ya que el ARNm no necesita maduracin y el compartimento de sntesis es el mismo.

CARACTERSTICAS DE LA TRANSCRIPCIN:
COMPLEMENTARIDAD, DIRECCIN Y
ASIMETRA
Seguidamente vamos a ver las principales caractersticas de la transcripcin.

Complementaridad: El parecido entre el ADN y el ARN sugiere que la transcripcin

probablemente esta basada en las reglas de complementaridad de las bases nitrogenadas
al igual que la replicacin del ADN. De manera que la ARN polimerasa o enzima encargada
de llevar a cabo la transcripcin toma como molde el ADN para sintetizar ARN y sigue las
reglas de complementaridad, la A del ADN empareja con U del ARN, la G con C, la C con G
y la T con A. Existen experimentos que demuestran que la proporcin (A+U)/G+C) del ARN
es similar a la proporcin (A+T)/(G+C) del ADN. En la siguiente tabla se muestra la
proporcin de nucletidos de diferentes ADNs y de sus correspondientes transcritos:

En la siguiente figura, se ilustra que la secuencia de bases en el ARN es complementaria a

la secuencia de la hlice codificadora e igual a la secuencia de la hlice estabilizadora,
cambiando T por U.
 La secuencia de bases del ARN es complementaria a la secuencia de la hlice codificadora

Otra manera de comprobar que existe complementaridad entre el ADN y el ARN es realizar
experimentos de hibridacin, de manera que el ADN se desnaturaliza y se mezcla con el ARN que
se sintetiza en su presencia, cuando se lleva a cabo la renaturalizacin (mediante un enfriamiento
lento), se producen hbridos ADN-ARN. Las molculas hbridas ADN-ARN se pueden distinguir
mediante centrifugacin en gradiente de CsCl ya que presentan una densidad diferente a la de las
dobles hlices ADN-ADN. La aparcicin de molculas hbridas ADN-ARN solo es posible si existen
segmentos largos de complementarios, por tanto estos resultados indican que el transcrito es
complementario del ADN parental.

La direccin en la que las ARN polimerasas sintetizan ARN es siempre 5'P3'OH, es decir
el ARN producto de la transcripcin crece solamente en esta direccin. Recuerde que la
direccin en la que las ADN polimerasas sintetizan ADN es tambin la misma 5'P3'OH.
Asimetra de la transcripcin: la asimetra de la transcripcin significa que solamente se
transcribe para cada gen una de las dos hlices de ADN, la hlice que se toma como molde
para producir el ADN se la denomina hlice codificadora o hlice con sentido y la otra
hlice de ADN, la que no se transcribe, se la denomina hlice estabilizadora o hlice sin
sentido.
TRANSCRIPCIN EN EUCARIOTAS
INICIACIN.

El inicio de la transcripcin necesita que el factor est unido al ncleo central de la ARN
polimerasa. Existen unas secuencias de ADN especficas y necesarias para que la holoenzima
reconozca el lugar de comienzo de la transcripcin, dichas secuencias especficas se denominan
secuencias promotoras. Pribnow (1975) aisl y secuenci las regiones de ADN que quedaban
protegidas por la ARN polimerasa despus de someterlas a digestin con ADNasa pancretica.
Siguiendo este mtodo se secuenciaron los primeros promotores de fagos como el T7 y l, y del
promotor del opern lactosa. Pribnow observ una secuencia de unos 7 pares de bases que se
encontraba 10 bases antes de la primera que se transcribe y que apareca en la mayora de los
fragmentos protegidos por la ARN polimerasa. Esta secuencia se la denomin Caja de Pribnow y
es: 5' TATPuATPu 3'.
Cuando se analizan las secuencias de las regiones anteriores a la primera base que se transcribe
aparecen dos regiones cortas que muestran un parecido o similitud bastante grande, la primera
regin se encuentra 10 bases antes de la primera que se transcribe (Caja de Pribnow) y la segunda
se localiza 35 bases antes. El estudio de muchas regiones promotoras de diferentes genes permite
determinar las secuencias que aparecen con mayor frecuencia y establecer lo que se denomina las
secuencias promotoras consenso o ideales.

El factor sigma es el responsable de que la ARN polimerasa reconozca estas secuencias y se una a
ellas. La holoenzima recorre el ADN hasta encontrar las regiones -10 y -35 (secuencias promotoras)
y se une a ellas, posteriormente comienza a separar las dos hlices por la regin -10 (rica en pares
AT). Cuando la holoenzima ha reconocido y separado las dos hlices se forma lo que se denomina
"complejo abierto con el promotor".
La actividad de los promotores puede modificarse por la presencia de otras secuencias
estimuladoras o "enhancers" que aumentan la tasa de transcripcin o por secuencias atenuadoras
que disminuyen la tasa de trasncripcin. Estas secuencias estimuladoras y/o atenuadoras suelen
estar cerca de las promotoras pero no a una distancia fija de estas y pueden ejercer su funcin
sobre varios promotores diferentes.

En eucariontes la iniciacin de la transcripcin es ms compleja que la de E. coli y depende de la

presencia de Factores proteicos de transcripcin (TF). La mayora de las secuencias promotoras
eucariticas se encuentran antes (o "aguas arriba") de la primera base transcrita, aunque algunos
promotores de la ARN Pol III se localizan despus de la primera base transcrita ("aguas abajo"). Los
TF interaccionan con las ARN polimerasas para iniciar la transcripcin, los promotores de la ARN
pol II son los que muestran mayor variacin en su secuencia, motivo por el que hay muchos TF
diferentes que interaccionan con la ARN pol II para iniciar la transcripcin. Existen tres tipos de
Factores proteicos de transcripcin (TF):

Factores basales: necesarios para el comienzo de la sntesis de ARN.

Factores que actan aguas arriba: reconocen secuencias consenso cortas situadas antes
del punto de iniciacin cuya actividad no est regulada, de manera que se unen a
cualquier promotor que contenga estas secuencias.
 Factores inducibles: reconocen secuencias consenso cortas o elementos de respuesta
situadas antes del punto de iniciacin cuya actividad si est regulada. Estos factores
inducibles son sintetizados o activados en diferentes tejidos y momentos del desarrollo
controlando los patrones de transcripcin en diferentes lugares (tejidos) y momentos del
desarrollo en los organismos.

Los promotores que tienen secuencias que solamente son reconocidas por factores basales y
factores que actan aguas arriba, corresponden a genes que se expresan de manera constitutiva
(se expresan siempre) en todos los tejidos. Se trata de los genes encargados del metabolismo
bsico de la clula involucrados en el buen funcionamiento celular. A estos genes se les ha
denominado genes ("Housekeeping genes"), es decir, los genes que guardan o mantienen la casa.

Los promotores de la ARN pol I (transcribe los precursores del ARN ribosmico) tienen dos
secuencias ricas en pares GC y que muestran una homologa del 85%, una secuencia de 65 pb
denominada ncleo que incluye la primera base que se transcribe (de -45 a +20) y una segunda
secuencia unos 70 pb antes (aguas arriba) que acta como elemento de control y que va desde la
posicin -107 a la -180.

Los promotores de la ARN pol III (transcriben ARN-t, ARN-5S y ARN de tamao pequeo) contienen
secuencias de reconocimiento situadas despus de la primera base que se transcribe (aguas
abajo), a este tipo de promotores se les denomina promotores internos (estn dentro del gen). Se
han encontrado en los promotores de ARN-t y ARN-5S pero no se han descrito en ARN de tamao
pequeo.

Los promotores de la ARN pol II son ms variables que los de las ARN pol I y pol III pero a pesar de
esta variacin tienen una estructura general bastante conservada, de manera que se han
reconocido al menos tres secuencias cannicas o consenso situadas en las regiones -25 (caja TATA,
con la secuencia TATAAAA), -75 (caja CAAT con la secuencia GGCCAATCT) y -90 (caja GC con la
secuencia GGGCGG). La caja TATA es equivalente a la caja de Pribnow de los promotores de
bacterias y se la denomina caja de Hogness.

El punto de iniciacin de la transcripcin en eucariontes suele ser una adenina flanqueada por
pirimidinas, aceptndose la existencia de una regin iniciadora (Inr) con el siguiente tipo de
secuencia: Pir-Pir-C-A-Pir-Pir-Pir-Pir-Pir.

Elongacin
El proceso de sntesis contina en sentido 5 3. Al cabo de 30 nucletidos transcritos se aade al
extremo 5 una caperuza de 7-metilguanosn-trifosfato, que protege al ARNm de su degradacin y
es lugar de reconocimiento para el inicio de la traduccin. La

Terminacin
La fase de finalizacin de la sntesis del ARNm parece ser que est relacionada con la secuencia
TTATTT. A continuacin interviene la enzima poli.A-polimerasa que aade al extremo final 3 un
segmento de unos 200 ribonucletoidos de adenina, denominado cola de poli-A. Interviene en la
maduracin posterior y en su transporte desde el ncleo.

MADURACIN.
Se debe producir la eliminacin de los intrones y la posterior unin de los exones. En este 5
proceso intervienen un conjunto de ribonucleoprotenas pequeas nucleares (RNPpn),
denominadas en su conjunto, espliceosoma. Reconocen a los intrones que suelen empezar por GU
y acabar por AG, los corta y los retira. A continuacin actan ARN ligasas que empalman exones.
Puede darse la unin de los exones consecutivos como se encontraban en el gen, o hacerlo en una
ordenacin alternativa. Asimismo, puede producirse la eliminacin o introduccin de bases, o
transformacin de unas bases en otras. Todo ello produce una amplificacin de la expresin
gnica, ya que un solo gen puede dar lugar a protenas distintas segn la maduracin post-
transcripcional que se lleve a cabo.
 PROCESAMIENTO ALTERNATIVO
Tambin se ha observado que en diferentes tejidos de un mismo individuo o en el mismo tejido en
diferentes momentos del desarrollo se pueden producir procesamientos distintos del mismo
ARNhn, como consecuencia en cada tejido o momento del desarrollo se produce un ARN-m
maduro diferente que da lugar a una polipptido distinto. Un ejemplo de procesamiento
alternativo es lo que sucede en el tiroides y en el hipotlamo en los que el mismo ARNhn da lugar
con procesamientos diferentes al pptido de calcitonina en el tiroides y al pptido CGRP en el
hipotlamo. Otro ejemplo de procesamiento alternativo es el caso del transcrito primario del gen
de la -tropomiosina en msculo estriado, msculo liso, cerebro y fibroblasto. En los dos ejemplos
citados de procesamiento alternativo se mantiene el orden relativo de los exones.

AUTOPROCESAMIENTO
Existen muchos ejemplos de molculas de ARN que pueden realizar el autoprocesmiento de sus
intrones sin necesidad de la ayuda de protenas. Estas molculas de ARN que pueden actuar como
una enzima con propiedades catalticas se han denominado ribozimas. Esta capacidad de
autoprocesamiento de algunos molculas de ARN fue descubierta por Cech y colaboradores en
1981 estudiando el ARN 35S precursor del ARN-r 26S de Tetrahymena thermophila (ciliado). La
molcula del ARN-r 26S contiene un intrn de 400 bases que se autoprocesa. T. Cech recibi en
1989 el Premio Nobel por el descubrimientos de los ARN con propiedades catalticas.

Existen dos tipos de intrones que se autoprocesan, los del grupo I en los que el producto de
eliminacin del intrn es una molcula lineal y los del grupo II en los que el producto de
eliminacin del intrn es una molcula en forma de lazo. En el grupo I se encuentran los
transcritos primarios de algunos virus que infectan a E. coli, los transcritos primarios de
Tetrahymena, en mitocondrias y cloroplastos, y en algunos ARN-t primarios de bacterias. En el
grupo II se encuentran algunos ARN-t primarios y algunos transcritos primarios de mitocondrias y
cloroplastos.

EDICIN O CORRECCIN DEL ARN

Cuando se estudi la secuencia de bases del ARN-m de cox II que codifica para la subunidad II de la
citocromo c oxidasa mitocondrial del Tripanosoma brucei encontraron que en la posicin 520
haba cuatro uracilos que no se encontraban presenten en la secuencia de bases del gen. Por
tanto, estos cuatro uracilos haban sido aadidos despus de la trasncripcin (Benne y col. 1986).
La edicin o correccin de los ARN se ha descrito en diferentes especies (protozoos, hongos,
plantas y mamferos), en orgnulos (mitocondrias y cloroplatos) y en el ncleo. Adems se
produce tanto en regiones codificantes (exones) como no codificantes (intrones). La correccin o
edicin del ARN puede producirse por adicin de bases nitrogenadas, prdida de bases
nitrogenadas o por sustitucin de bases despus de la transcripcin.