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Liceo N1 Javiera Carrera Gua Complementaria 4 medio:

Dpto. Biologa Transcripcin o Sntesis de ARN.


IV Medio Comn.
Prof. Javier Martnez
Prof.Coordinadora Nivel Marta Ruiz C.
TRANSCRIPCIN O SNTESIS DE ARN

Relacin Gen Protena.

El ADN es la molcula que contiene la informacin gentica, tanto en organismos procariontes como
eucariontes. Dicha informacin se encuentra secuenciada en genes que son las unidades fsicas bsicas de la
herencia (genotipo) y se transmiten de los padres a la descendencia. Los genes estn dispuestos, uno tras otro,
en estructuras llamadas cromosomas, que es una nica molcula larga de ADN asociado a protenas y de la
cual slo una parte de la cual corresponde a un gen individual. Los seres humanos tienen aproximadamente
20.000 genes organizados en sus cromosomas y en ellos se encuentra la informacin que codifica (que se
expresa) en la produccin regulada de enzimas y protenas estructurales permiten controlar las reacciones
bioqumicas y la forma de los organismos (fenotipo).Desde aqu surgen las siguientes interrogantes: Cmo
estn codificadas las instrucciones celulares en la molcula de ADN? y Cmo se traduce sta informacin a
protenas?

Los estudios que han propiciado las respuestas a estas preguntas tienen sus inicios en un concepto que
propuso en 1908 el mdico ingls Archibald Garrod, quin defini un nuevo concepto de enfermedad humana a
la que denomin errores congnitos del metabolismo. Garrod postulaba que ciertas enfermedades eran
causadas por la incapacidad de realizar correctamente ciertos procesos qumicos, de naturaleza hereditaria. Su
gran visin del problema le hizo sentar la hiptesis de que stas enfermedades se originaban debido a
deficiencias enzimticas. En esta hiptesis est implcita la idea de que los genes actan influyendo la
produccin de enzimas.

Del ADN a la protena: La funcin del ARN

Producto de diversos estudios se acord que el ADN deba contener un mensaje codificado con las
instrucciones para la estructura y funciones biolgicas. Tambin se sabe que la secuencia lineal de
aminocidos en una cadena polipeptdica determina la estructura tridimensional de la molcula de protena y, es
la estructura tridimensional la que a su vez determina la funcin de la misma. Entonces, el problema que surge
es Cmo puede el orden de las bases del ADN especificar la secuencia de aminocidos en la molcula de
protena? La bsqueda de una respuesta a esta pregunta apunta hacia el Acido Ribonucleico (ARN), un
compuesto qumico muy prximo al ADN. Existen muy pocas diferencias entre el ARN y el ADN, las que se
detallan a continuacin.

ADN ARN

Cantidad de cadenas Dos (Bicatenario) Una (Monocatenario)

Azcar Desoxirribosa Ribosa

Bases Nitrogenadas Adenina: A Adenina: A


Citosina: C Citosina: C
Guanina: G Guanina: G
Timina: T Uracilo: U

Cuadro 1: Comparacin ADN / ARN

Experimentos de Pulso y Caza

Cuando se descubri el ARN, de inmediato se apunt a que l poda ser el intermediario entre la
informacin gentica (ADN) y los ribosomas (sntesis de protenas). ste hecho se confirm luego de realizar un
experimento de Pulso y Caza, dnde en un medio de cultivo con uracilo (base exclusiva del ARN) radioactivo.
Como la radiacin del uracilo marcado se detecta con pelculas fotogrficas, fue posible determinar el camino
que seguan estas partculas en la clula. As se determin que el uracilo era incorporado por las clulas hacia
el ncleo donde era utilizado para producir molculas de ARN, el que migra luego hacia el citoplasma, por lo
que se determin que sta era la molcula intermediaria que llevaba el mensaje de la informacin entre el ADN
y los ribosomas y se denomin ARN mensajero (ARNm)
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Figura 1: Experimentos de Pulso y Caza.
Flujo de la informacin gentica.

Inicialmente, el flujo de la informacin gentica fue explicado por Crick en lo que se conoce como el
Dogma Central de la Biologa Molecular, acorde al cul la informacin flua desde el ADN (en el ncleo) hasta
las protenas (en el citoplasma) en una nica direccin. De sta forma, se deduce que las protenas (fenotipo)
estn reguladas segn la informacin que se encuentra en el ADN (genotipo).

Figura 2: Dogma central de la biologa molecular.

Investigaciones posteriores determinaron que el proceso tambin poda ocurrir en sentido inverso
gracias a la accin de una enzima presente en virus denominada Transcriptasa inversa presente en algunos
retrovirus que implica que la informacin que se encuentra como ARN se puede retrotranscribir a ADN, esto es
sintetizar ADN utilizando como molde una cadena de ARN, por lo que se critica el uso del trmino dogma que
es una afirmacin cierta e incuestionable.

Debido a lo anterior, hoy el flujo de la informacin gnica se presenta como la Hiptesis central de la
Biologa Molecular:

Figura 3: Hiptesis central de la biologa molecular.

Figura 4: Flujo de la informacin gentica en eucariontes.

Transcripcin del ARN (Sntesis ARN)

La necesidad de una informacin para la sntesis de una protena radica en que su actividad biolgica depende
de su estructura tridimensional, la cual, a su vez, depende de la secuencia u ordenamiento de los distintos
aminocidos que la componen. Dado que la clula dispone normalmente de los veinte tipos de aminocidos en
cantidad suficiente para sintetizar sus protenas, la exigencia principal es poseer los datos que le indiquen la
secuencia en que debe unirlos. Las estructuras encargadas de esta polimerizacin son los polirribosomas, uno
de cuyos componentes, el ARN mensajero (ARNm), es el que seala con precisin qu aminocido ocupa cada
lugar en el largo filamento proteico.
Sin embargo, no es el ARNm el depositario original de esa informacin. En realidad, es
slo un intermediario operativo que comanda la sntesis. La informacin debe obtenerla previamente de una
macromolcula madre, el ADN, que posee todos los programas para la constitucin de las protenas.
El ADN se encuentra principalmente en el ncleo y no sale de l. Para que se pueda
realizar la sntesis citoplsmatica, el ADN transfiere su informacin al ARNm, y adems origina otros dos tipos
de ARN que colaborarn en la traduccin del mensaje:
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El ARN de transferencia (ARNt) que ubica a cada aminocido en su lugar correspondiente segn las
indicaciones del ARNm, y
El ARN ribosmico (ARNr) que integra (junto con protenas asociadas) el ribosoma, que es asiento
celular del proceso.
La sntesis de estos distintos ARN a partir de determinados segmentos de ADN se
denomina transcripcin. Cada sector del ADN cuya transcripcin da como resultado una molcula de ARN se
llama gen estructural. Esta denominacin, sin embargo, suele encontrarse en los textos ligada casi
exclusivamente con los segmentos de donde se transcriben ARNm, que luego se traducirn dando protenas
con alguna actividad celular (cataltica, estructural, mecnica, de transporte, etc).

Adems de los genes estructurales, el ADN presenta otros segmentos relacionados con
la regulacin de la expresin gnica; por este motivo, tales genes son llamados reguladores e incluyen:

Sectores del ADN que no se transcriben, sino que funcionan como "conmutadores" que "prenden"
(permiten) o "apagan" (impiden) la transcripcin de una protena o varios genes estructurales;
Sectores del ADN que se transcriben y se traducen posteriormente originando protenas llamadas
represoras, capaces de bloquear la transcripcin de genes estructurales.

Para abordar la transcripcin, es necesario sealar algunas consideraciones:


i. La enzima que cataliza la transcripcin de denomina RNA polimerasa que puede iniciar
cadenas y no es autocorrectora.
ii. La direccin de la transcripcin siempre es 5 3.
iii. La transcripcin ocurre por complementariedad de bases, sin embargo cuando la RNA
polimerasa lee una A no sintetiza una T, sino que sintetiza una U.
iv. Existen importantes diferencias en la transcripcin de eucariontes y procariontes.
v. En la transcripcin se copia la informacin contenida en una de las hebras de la molcula de
ADN (proceso asimtrico) y es un proceso continuo durante toda la vida de la clula.
vi. Muy selectiva, menos del 10% del ADN ser transcrito a ARN y todo no ser funcional

Durante el proceso de transcripcin, slo una de las cadenas de


ADN se usa como molde. Por lo tanto, la doble hlice se escinde temporalmente. Sobre la cadena molde se van
uniendo los ribonucletidos complementarios por apareamiento de las bases nitrogenadas.
Posteriormente, la ARN polimerasa cataliza la unin entre los ribonucletidos
adyacentes, con prdida del grupo pirofosfato (PPi).
Cuando termina de polimerizarse, la nueva molcula de ARN se separa de la cadena
que le sirvi de molde, y se restaura la doble hlice del ADN.
Luego de su sntesis, las molculas de ARNr, ARNt, y ARNm sufren en el ncleo
algunas modificaciones por las cuales adquieren su estructura definitiva. Posteriormente salen al citoplasma.
ARN ribosmico: en eucariontes existen cuatro variedades de este ARN, cuyas
velocidades de sedimentacin son de 5S, 6S, 18S y 28S (entre 125 y 3.000 nucletidos aprox.). Las tres
ltimas derivan de una molcula precursora de gran tamao, que es sintetizada en el nuclolo y se fragmenta
posteriormente. El ARN de 5S no se forma en el nuclolo.
Todos los ARNr son filamentos sumamente plegados, sobre los cuales se asocian
protenas especficas, constituyendo las subunidades mayor y menor del ribosoma. Este ensamble tiene lugar
en el nuclolo. Las subunidades ribosmicas salen luego por los poros de la envoltura nuclear.

ARN de transferencia: Son ARN relativamente pequeos; presentan unos 80


nucletidos cada uno. Constituyen una estructura llamada "hoja de trbol", plegada en L, con segmentos en los
cuales hay un apareamiento entre bases complementarias, es decir, sectores con doble hlice intracadena. Son
ARN de vida metablica prolongada.

ARN mensajero: Estos ARN presentan tamaos sumamente variables, que dependen
de la longitud de la protena que codifican. Adems, puede ocurrir que una nica protena de ARNm lleve
informacin para sintetizar varias protenas, que suelen estar relacionadas con un proceso metablico comn.
En general, los ARNm pueden presentar desde 300 hasta varios miles de nucletidos.
El sector del ADN a partir del cual se transcribe el ARNm para una protena particular se
denomina gen (o gen estructural). Pero el ARNm recin transcripto no es la molcula definitiva que sale al
citoplasma. En realidad, se produce una molcula precursora de tamao mayor, compuesta por regiones con
informacin para formar la protena, interrumpidas por sectores de ARN sin informacin. Posteriormente, se
eliminan estos sectores intercalados, y las regiones informativas se sueldan para construir la molcula de
ARNm definitiva.
Esta particularidad en la formacin del ARNm refleja las caractersticas del gen a partir
del cual se origin. Se ha encontrado que la informacin en el ADN no es contnua, sino que se halla en forma
fragmentada.

Ahora se describir el mecanismo de la transcripcin, como un paso previo a la sntesis de protenas


Para explicar el proceso de transcripcin, se har en cuatro etapas:
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a) Iniciacin:

El proceso de transcripcin comienza cuando a una hebra de ADN se le acoplan un conjunto de protenas
denominadas factores de transcripcin que son zonas asociadas al inicio de los genes que se deben
transcribir. Posterior a ese evento, la RNA polimerasa se asocia una hebra de ADN y comienza a leer la hebra
de ADN hasta que se encuentra con dos zonas denominadas promotoras que son secuencias conservadas de
ADN y que indican el lugar donde se iniciar la transcripcin y cul de las hebras va a ser transcrita (llamada
hebra molde o templado). Dichos promotores son la caja TTGACA, ubicada a -35 bases del inicio de la
transcripcin y la caja TATATT (caja TATA) ubicada a -10 bases de inicio de la transcripcin. Los promotores
solo inducen la transcripcin, no la comienzan; ya que para que comience, en el sitio de inicio, la RNA
polimerasa debe leer la secuencia TAC.

Cuando la ARN polimerasa se une al promotor de un gen, cambia de forma obligando al ADN a
desenrollarse parcialmente en el punto de inicio del gen.

ADN
-35 -10 0
TTGACA TATATT TAC

Caja TATA Inicio transcripcin

Figura 5: Promotores y sitio de inicio de la transcripcin.

Figura 6: Iniciacin de la transcripcin.

b) Elongacin:

Una vez que se abre la cadena de ADN, la ARN polimerasa avanza a lo largo de la cadena de ADN
molde, sintetizando una cadena individual de ARN complementaria respecto del ADN y, adems, antiparalela,
en sentido 5 3. Es importante sealar que durante el proceso de transcripcin el ARN forma los mismos
pares de bases complementarias, cambiando la Timina por Uracilo. Cuando se han agregado aproximadamente
10 nucletidos al ARN en crecimiento, stos se separan de la cadena molde, lo que permite que el ADN forme
nuevamente la doble hlice original. Entonces podemos resumir diciendo que: mientras la transcripcin continua
alargando la molcula de ARN, un extremo de esta se desva del ADN, y el otro permanece unido a la cadena
molde de ADN por medio de la ARN polimerasa. Cabe destacar que la velocidad de transcripcin es de 30
nucletidos por segundo aproximadamente (a 37C).

Figura 7: Elongacin de la transcripcin.


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c) Terminacin:

El proceso de transcripcin concluye cuando la polimerasa lee una secuencia de trmino en la hebra de
ADN, que puede ser: ATT, ACT o ATC. Una vez que se lee la secuencia de trmino, se escinde (separa) la
ARN polimerasa y el ARN originado producto de la transcripcin, que se llama transcrito primario.

Figura 8: Elongacin de la transcripcin.

d) Maduracin:

En esta etapa surgen importantes diferencias en el procesamiento de las molculas, el que vara acorde
al tipo de organismos, por lo que se analizar por separado el proceso en procariontes y eucariontes.

Procariontes:

- El ARN es traducido a cadena polipeptdica (protenas) antes de finalizar la transcripcin, por lo que
en la prctica no existe maduracin del mismo, es por esto que se denomina policistrnico
(Policistrnico: una molcula de ARN codifica varios genes que generalmente estn relacionados).

Figura 9a: ARNm Policistrnico.

- El proceso de maduracin como tal corresponde a rupturas de la cadena y agregacin de


nucletidos (-CCA) en el extremo 3.

- Existe solo un tipo de RNA polimerasa que permite transcribir todos los tipos de ARN y que adems
es distinta a la de eucariontes.

Eucariontes:

- Cada gen se transcribe individualmente, por lo tanto se genera un ARN monocistrnico (contiene la
informacin de un nico gen).
-

Figura 9b: ARNm Monocistrnico.

- Cada gen posee su propio control transcripcional.

- Existen cuatro tipos de RNA polimerasa, cada una transcribe un tipo distinto de ARN con una
funcin determinada:
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Tipos de RNA polimerasa Funcin

RNA polimerasa I - Transcribe ARN ribosomal (ARNr)


- Forma parte de los ribosomas y cataliza la unin de los aminocidos a los
ribosomas.

RNA polimerasa II - Transcribe ARN mensajero (ARNm).


- Transporta la informacin gentica desde el ADN (ncleo) a los ribosomas
(citoplasma)

RNA polimerasa III - Transcribe ARN de transferencia (ARNt)


- Traduce el mensaje del ARNm a pptidos (protenas), uniendose segn su
secuencia de nucletidos del ARNm

RNA polimerasa mitocondrial - Transcribe ARN mitocondrial (ARNm)


- Participa de la sntesis de protenas mitocondriales.

Cuadro 2: Tipos de ARN polimerasa y sus funciones.

Una vez que concluye el proceso de transcripcin, el ARN obtenido, denominado transcrito primario
para por tres etapas para madurar:

i. Capping adicin CAP-5


El transcrito primario sufre un proceso denominado capping, donde un complejo enzimtico
capping (CEC) acopla un nucletido modificado de guanina metilada llamado caperuza-5 o CAP-5
al extremo 5 del mismo, que protege al ARN de la degradacin.

Figura 10: Capping

ii. Poliadenilacin adicin de Cola poli-A


En el extremo 3 existe una caja AAUAA a la que se le unen factores especficos y una enzima
llamada poliA-polimerasa, la que escinde de 10 a 35 nucletidos del extremo 3 y agrega una cola
de 200 a 250 nucletidos de adenina, la que aporta estabilidad y mejora la capacidad de traduccin
del ARNm en el citoplasma.
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Figura 11: Cola Poli A.

iii. Splicing corte y empalme de exones


Al RNA inmaduro se le acoplan unas protenas denominadas snRNP (small nucelar
ribonucleoprotein partices), que se ubican en secuencias cortas ubicadas entre las zonas
codificantes del transcrito (exones) y las zonas no codificantes (intrones); posteriormente se van
acoplando ms y ms protenas para formar un complejo llamado spleisosoma, que realiza el corte
y empalme de exones, dejando de lado los intrones.

Figura 12: Splicing.

Existe tambin un empalme alternativo, donde el transcrito primario puede ser procesado va
splicing de diversas maneras, lo que permite obtener distintos ARNm, dando lugar a distintas
protenas, cada una con estructura y funciones especficas. Es por esto que se entiende que un
mismo gen puede originar a una protena en un tipo celular y una distinta en otro tipo celular
distinto, ya que algunos genes producen molculas pre-ARNm con mltiples patrones de empalme.
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Eventualmente se presentan segmentos que pueden ser intrn o exn, dependiendo de la protena
que se vaya a sinettizar.

Figura 13: Ejemplo de splicing alternativo.

Figura 14: Maduracin del ARN.


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ACTIVIDADES: RESPONDA
LAS SIGUIENTES PREGUNTAS:

1.- En la representacin del experimento de pulso y caza ( Fig.1) qu molcula representan los puntos rojos?
Explica.
2.- A partir de la siguiente secuencia de nucletidos de una cadena en la molcula de ADN, cual seria la
secuencia de una cadena de ARN mensajero que se transcribira de este segmento de ADN?
TACTTTGGTTAAATT
3.- Cus es la funcin de las enzimas girasa,helicasa y ARN polimerasa II en la transcripcin?
4.- Cul es la diferencia entre promotor y sitio de inicio?
5.- Compara al menos en tres aspectos la transcripcin en procariontes y eucariontes
6.- Describe las etapas de iniciacin,elongacin y terminacin de la transcripcin.
7.- Explique la importancia del capping, la poliadenilacin y splicing en la maduracin del ARN mensajero.
8.- Seale las caractersticas del ARNm , ARNr y ARNt.

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