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Un punto en comn con estas hiptesis es el papel clave que la formacin de los Andes
tropicales habra tenido en la diversificacin histrica de la flora neotropical (15). Recientes
estudios filogenticos han demostrado que el levantamiento andino actu tanto como una va
de dispersin para los linajes boreotrpicos (16, 17) como un motor para promover una
diversificacin rpida, mediante especiacin aloptrica y desplazamiento ecolgico, en tierras
altas (16-19) y montanas (11) ) Hbitats. Menos estudios, sin embargo, han documentado el
impacto del levantamiento andino en la flora amaznica de tierras bajas. Claramente, el
levantamiento debe haber afectado a estos taxa formando una nueva barrera bitica y
cambiando profundamente la hidrologa y el clima de la regin (20). Adems, los estudios
biogeogrficos previos sobre las radiaciones andinas han considerado tpicamente la orogenia
andina como un evento nico y limitado en el tiempo, generalmente en conexin con el
levantamiento final de los Andes (Mioceno al Pleistoceno) (11,19). Esto contrasta con las
reconstrucciones geolgicas que indican que el levantamiento tuvo lugar en perodos discretos,
progresando de sur a norte y de oeste a este y afectando diferentes regiones en diferentes
momentos (2, 3, 21, 22). Las incursiones marinas episdicas, relacionadas con el nivel global
del mar, aumentan durante las fases tectnicas extensionales que siguieron a perodos de
levantamiento mayor, tuvieron un impacto dramtico en los patrones de drenaje de la regin,
como lo demuestran las pruebas paleogeogrficas y paleontolgicas (1,2,23-28) . Estas
incursiones marinas han sido discutidas en relacin a su papel como va en la transicin
evolutiva de hbitats marinos a hbitats de agua dulce de peces neotropicales (24, 29), pero
tambin podran haber actuado como barreras a la dispersin o como eventos de vicariancia
que fragmentan los rangos de Animales y plantas terrestres. Parece sorprendente que, a pesar
de las cada vez ms detalladas reconstrucciones geolgicas (2, 24, 26-28), hasta el momento
ningn estudio ha intentado documentar el efecto de estos eventos sobre la evolucin de la
flora neotropical. En general, las reconstrucciones detalladas se han visto obstaculizadas por la
falta de resolucin en muchos clados ricos en especies andinas (19). Los mtodos
biogeogrficos actuales requieren filogenias bien resueltas y la incertidumbre en las relaciones
filogenticas dificulta la reconstruccin de la secuencia especfica de sucesos geolgicos de
vicariancia y especiacin.
Grupo de estudio La familia del caf (Rubiaceae) es la cuarta familia ms grande de plantas con
flores, con unas 13.100 especies en 611 gneros y 3 subfamilias (30, 31). Aunque cosmopolita
en la distribucin, su diversidad ms alta se confina claramente a los trpicos. La subfamilia
Rubioideae est pantropically distribuida y comprende algunos grupos altamente diversos en el
Neotropics (por ejemplo, Palicoureeae y Spermacocae), pero se concentra de otra manera al
viejo mundo donde se origin probablemente (32, 33). La subfamilia Ixoroideae muestra un
patrn similar, ya que comprende un clado neotropical rico en especies (la alianza ''
Condaminae-Calycophylleae ''), pero de otra manera se concentra en los paleotrpicos.
Contrastando, excepto para la tribu Naucleeae, la subfamilia grande Cinchonoideae es
predominantemente Neotropical. En la Sudamrica tropical, Cinchonoideae est representada
por las tribus hermanas Cinchoneae e Isertieae, que han demostrado construir un clado
fuertemente apoyado (34) y algunas veces se trata como una sola tribu (30). Comprendiendo
unas 130 especies de pequeos rboles y arbustos divididos en 11 gneros [ver informacin de
apoyo (SI) Tabla S1], las Cinchoneae e Isertieae son componentes ecolgicos importantes de
una amplia gama de hbitats. Algunas especies son tambin econmicamente importantes
como fuente de quinina. La distribucin de Isertieae se concentra en las tierras bajas de la
cuenca del Amazonas y la Guayana oriental, mientras que las Cinchoneae se concentran
principalmente en los hbitats montaosos de los Andes septentrionales y centrales,
alcanzando los 3.300 m (Fig. S1 y S2).
Resultados y discusin
Gentry (35), siguiendo a Raven y Axelrod (36), enumer las Rubiaceae neotropicales como un
grupo derivado de Gondwana, evolucionando en aislamiento desde la separacin de Amrica
del Sur de frica. Este origen hipottico predice que (i) el grupo tiene una edad mnima de 100
Ma (37), y (ii) los linajes Viejo y Nuevo Mundo son recprocamente monofilticos (6). En
contraste, la hiptesis de origen boreotrpico predice que i) los grupos sudamericanos se
derivan de parientes del norte con tboros del Viejo Mundo como grupos hermanos, ii) la
divergencia entre los grupos Viejo y Nuevo Mundo ocurri entre 40 y 50 Ma, es decir,
Alrededor del Eoceno climtico ptimo, que favoreci el intercambio de elementos florsticos
tropicales entre estas masas terrestres (38), y (iii) los fsiles terciarios tempranos se han
encontrado en Norteamrica, Europa o Asia (6). Nuestra reconstruccin biogeogrfica (Fig. I y
II) corrobora un origen boreotropical en las tres predicciones: (i) nuestra filogenia muestra las
tribus hermanas neotropicales Cinchoneae e Isertieae anidadas dentro de un clado de tribus
principalmente centroamericanas y antillanas, Hermana de la tribu esencialmente africana
Naucleeae y de la subfamilia paleotropical Ixoroideae; (Ii) nuestras estimaciones de tiempo de
divergencia sitan al ancestro comn ms reciente (MRCA) de las Rubiaceae en el Paleoceno
Temprano (66.1 Ma, 63.0-68.8, vase la Tabla S2), mientras que la edad mnima de
Cinchonoideae se estima como 51.3 (47.8- 54.6) Ma, mucho despus de que la ltima cadena
de islas conocida entre frica y Amrica del Sur posiblemente existiera [Cretcico Superior,? 88
Ma (37)]; Y finalmente, (iii) varios fsiles de Cephalanthus indican la presencia de la tribu
Naucleeae en Europa desde el Eoceno Tardo (39) (vase Texto SI).
Lago Pebas. Hasta el final del Oligoceno (? 24 Ma), un sistema fluvial denominado paleo-
orinoco dominaba el drenaje del noroeste de la Amazona y las cuencas andinas del cabo hacia
el lago Maracaibo, en la costa caribea. Luego, en el Mioceno Temprano (? 23 Ma) los cambios
geotectnicos en la Cuenca del Amazonas asociados con el levantamiento continuo de la
Cordillera Oriental en los Andes Centrales (28) hicieron que la Amazonia occidental se
sumergiera gradualmente, de sur a norte y de oeste a este . Este proceso cre un sistema
enorme (> 1 milln de km2) de lagos de larga duracin y humedales de al menos 17 a 11 Ma,
conocidos como "Lake Pebas" o "Pebas Sea" (24-28). Si se trata de un sistema puramente
fluvio-lacustre (de agua dulce) o si los marinos estn presentes tambin es un tema de debate
(24, 27, 28). Sin embargo, la mayora de los autores coinciden en que la Amazonia occidental
estaba completamente inundada por algn tipo de sistema de humedales desde al menos el
Medio a Mioceno Superior y que este sistema estaba conectado a la incursin marina del
Caribe en el norte. A partir del Mioceno Superior (11-7 Ma), hubo un nuevo perodo de
elevacin rpida de las montaas, afectando principalmente a las Cordilleras Andinas
Orientales (a veces denominadas fases quechuas II y III). Esto supuestamente provoc el
surgimiento del margen occidental del Escudo Guayans, que cerr la conexin caribea del
paleo-orinoco, desplaz el drenaje de la Cuenca Amaznica hacia el este y condujo a la
desaparicin del Lago Pebas (27,28) (Fig. 2V ). Las condiciones acuticas, sin embargo, parecen
haber persistido en la Amazona occidental occidental hasta al menos 7 Ma, cuando el sistema
Amazonas moderno entr en vigor (28).
Estudios previos han proporcionado indicaciones para el papel potencial que desempea el
lago Pebas como una va para que los organismos marinos se dispersen en biotopos de agua
dulce, basados en sucesiones fsiles de moluscos y filogenias de ADN de peces neotropicales
(23, 24, 26). Por otro lado, si este sistema de humedales fuera tan grande e interconectado
como se sugiri, tambin debera haber actuado como una barrera bitica a la dispersin de
organismos terrestres entre los Andes y las regiones orientales de la Amazonia y la Guayana.
De hecho, la existencia de una barrera de dispersin entre los Andes y las tierras bajas de la
Amazona durante el Mioceno Medio es corroborada por nuestras reconstrucciones
biogeogrficas (Figura 1IV). Hasta el lmite Mioceno Temprano / Medio, se infiere que varios
antepasados de la tribu Cinchoneae se han extendido en ambas reas. Pero despus de eso,
coincidiendo con el tiempo en que se propone que el lago Pebas haya existido, todos los linajes
ancestrales de Cinchoneae e Isertieae parecen haber ocupado los Andes o la Amazonia, pero
no ambos. La mayora de las especies endmicas de Isertieae se encuentran actualmente en la
Guiana y en las tierras bajas del Amazonas oriental (Figura S1A), mientras que las
distribuciones de la amazonia occidental y central estn representadas principalmente por
especies muy extendidas, lo que sugiere que estas distribuciones son el resultado de la
expansin reciente del rango probablemente despus del secado de Lago Pebas. Del mismo
modo, varios nodos ancestrales en Remijia se reconstruyen como ocurriendo en ambos lados
de la barrera (Fig. 1V), pero estos nodos se datan despus de la frontera Mioceno / Plioceno (?
5.3 Ma, Fig. S4) y as posdata el cierre de la barrera Pebas. El restablecimiento final de las
conexiones terrestres entre los Andes y la Amazonia se evidencia por al menos 7 eventos de
colonizacin independientes en Cinchoneae e Isertieae desde el Mioceno Superior (Figura 1V).
Finalmente, el surgimiento de nuevas tierras en Centroamrica despus del cierre del istmo de
Panam (3,5Ma) (21, 52) proporcion reas adecuadas para la dispersin hacia el norte de los
linajes sudamericanos. Especies tales como Joosia umbellifera e Isertia haenkeana, que ahora
estn muy extendidas en Centroamrica, probablemente se dispersaron poco despus del
establecimiento de esa conexin terrestre (Fig. 2V).
Materiales y mtodos
Se definieron once reas (Fig. 1 Inset) para el anlisis biogeogrfico basado en los patrones de
distribucin existentes de Rubiaceae y en la historia geolgica (3, 21). Siempre que fue posible,
intentamos maximizar la congruencia con otros estudios biogeogrficos en Amrica del Sur (59,
60). Se utiliz el anlisis de dispersin-vicariancia [DIVA (61, 62)] para inferir distribuciones
ancestrales y eventos histricos involucrados en la historia biogeogrfica de Rubiaceae. Para
superar la incertidumbre asociada con la estimacin filogentica, se utiliza un enfoque que las
medias DIVA reconstrucciones biogeogrficas y temporales sobre una muestra bayesiana de
rboles altamente probables (en este caso n? 1.000), generando credibilidad apoyo valores
para las relaciones filogenticas alternativas. La integracin sobre la distribucin posterior de
los rboles a menudo revela la preferencia por un solo conjunto o ms restringido de
soluciones, lo que reduce la incertidumbre en las optimizaciones DIVA (63). El muestreo
incompleto de taxones puede causar problemas en los mtodos de inferencia histrica, ya que
reduce la precisin de las reconstrucciones de los estados ancestrales (vase la referencia 64
para una vista diferente). Esto es particularmente problemtico en una familia grande como
Rubiaceae, que abarca casi todos los continentes. Para superar este problema, utilizamos reas
abarcadoras fuera de los Neotrpicos, donde se encuentran la mayora de Ixoroideae (as como
el primer clade divergente en Cinchonoideae, la tribu Naucleeae). Tambin estimamos el sesgo
geogrfico en nuestra muestra para las tribus neotropicales Cinchoneae e Isertieae, el enfoque
principal de este artculo. Los resultados mostraron que nuestro muestreo de taxones es
bastante representativo de la distribucin real de las especies dentro de cada gnero y tribu
(ver Tabla S4, Figura S6 y Texto SI para una discusin detallada de los patrones de distribucin
en estas tribus). Adems, para probar la sensibilidad de nuestras reconstrucciones DIVA a
taxones que faltan, se realiz una serie de simulaciones heursticas en las que se aadieron
taxones hipotticos de reas subrepresentadas a nodos clave en la filogenia de estas dos tribus.
Las reconstrucciones ancestrales DIVA demostraron ser muy estables a la adicin de taxa
faltantes, al menos para los nodos involucrados en el escenario WAP y Lake Pebas (Figura S7).
Tambin examin el efecto de los taxones que faltaban en las estimaciones de tiempo de
divergencia mediante la eliminacin aleatoria de taxones de la muestra original y el clculo de
los tiempos de divergencia en estos conjuntos de datos reducidos. Como Linder et al. (65), PL
demostr ser en gran parte insensible al muestreo de taxones, y para la mayora de los nodos
las edades estimadas estaban dentro del intervalo de confianza del 95% del conjunto completo
de datos (ver SI Text para ms detalles sobre simulaciones). Esto nos da confianza en que el
escenario biogeogrfico presentado aqu (Fig. 2) no sera significativamente alterado por la
adicin de taxones que faltan.