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AMINOCIDOS
-Son unidades monomricas de los pptidos y protenas
-Tiene funciones como neurotransmisores, biosntesis de porfirinas, purinas, pirimidinas, urea.
LOS PPTIDOS
Tienen funciones como hormonas, neuromoduladores, neurotrasmisores
Existen especialmente en microorganismos, antibiticos, bacitrauna, gramicidina
Selenosisteina: el ultimo aminocido que fue encontrado, el numero 21
Alfa aminocido
L= izquierdo
D= derecho
- En el organismo existe 8 aminocidos esenciales ,2 semiesenciales, 10 no esenciales.
Esencial: que el organismo necesita, pero no lo sintetiza. Los 8 AA esenciales no lo fabrica el cuerpo sino
que lo ingerimos en alimentos (la quinua es un alimentos que contiene los 8 aminocidos esenciales para el
cuerpo).
Los AA no esenciales el cuerpo los fabrica, y los semiesnciales lo fabrica parcialmente.
- 21 AA el ltimo la selenocisteina (SeC) se clasifican de acuerdo a la cantidad R.
- Los no esenciales el organismo los fabrica.
- Sufren modificaciones post-traduccionales :hidroxilacion , carboxilacion, metilacin, fosforilacion;
ejemplo: OH pro,OHlis,COOH glu.
Existen aminocacios(AA)no proteicos :
Ornitina, es un derivado de un aminocido que est en circulacin.
Cirtrulina derivado de la ornitina.
Arginilsuccinato derivado de la ornitina.
Delta alanina
D selina son aminocidos que no estn
D aspartato presentes en las protenas
D alanina
D glutamato
- Pueden regularizarse
-Pueden ionizarse y pueden regular el pH
-Cuando los aminocidos se disuelven se cargan elctricamente.
-El aminocido (es dipolo con carga negativa o positiva)
- El grupo amino se puede disociar por una constante K, en hidrogenin y un grupo amino.
NH2
Un tomo de hidrogeno tiene cuatro carbonos, entonces si los tomo son distintos, si los cuatro son
distintos se los dice asimtricos
todo molcula que tiene carbono asimtrico son los que dan lugar al ismero
Ejemplo: la glicina no tiene ismeros
La alanina tiene carbonos asimtricos
BIOQUIMICA DR. JULIO PERES
UNIV. : SOLINA MAMANI FECHA -1-04-2014
BQM PEPTIDOS
O
H3N-G- K W - V T Y L P D E R C M K V - C extremo carboxilo
O
T T T
Extremo amino O
H3N-G- K W - V T Y L P D E R C M K V - C
O
P P P P
Q Q
O
H3N-G- K W - V T Y L P D E R C M K V - C
O
DEFINICION:
Los pptidos son un tipo de molculas formadas por la unin de varios aminocidos mediante enlaces
peptdicos, o enlace triple con una conjugacin de ADN (cido desoxirribonucleico)
Los pptidos, al igual que las protenas, estn presentes en la naturaleza y son responsables por un gran
nmero de funciones, muchas de las cuales todava no se conocen.
La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido:
- Oligopptido: 2 -9 AA
- Polipptido: 10-99 AA LPA= 91 AA GH = HORMONA 191 AA
- Protena: ms de 100 AA MSH= 13 AA PTH = 84 AA
ADH= 9 AA CALCITONINA = 32 AA
OXITOCINA= 9 AA ENSEFALINA = 5 AA
INSULINA = 51 AA PROLACTINA = 142 AA
ESTRUCTURA PRIMARIA DE LOS PEPTIDOS
TRH = 3 AA Neurotransmisores y
GLUCOCAGON = 39 AA neuromoduladores
ACTH = 39 AA Endorfinas
.Todo pptido tiene una estructura primaria.
.Tiene un numero de aminocidos 3# AA
.Tiene orden y estructura
.Tiene estructura
-Reactivo de Sanger (DNFB)= dinitro flour benceno (1998 PREMIO NOVEL) primera en secuenciar
la insulina.
Este al aplicar el extremo amino de una cadena separaba por hidrolisis acida al primer amino
acido y lo ubicaba en una cromatografa
- Reactivo de Edman (FITC) = fluorisotiocianato. Identifica extremos aminos de cadena lateral.
El numero de enlaces peptidicos es igual a los aminocidos menos 1
Ejemplo :
O
H3N - G- K W - V T Y L P D E R C M K V C
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 O
Son 15 aminocidos menos 1 sern 14 lo cual indica que hay 14 enlaces peptidicos.
1 Poli electrolitos
2 PH PK determina sus cargas
3 El enlace pptidos les da rigidez
Mtodos de aislamiento Hidrolisis (Fragmentacin)
Endopeptidaza
La estructura Primaria est dada por la secuencia de los Aminocidos en la Cadena Polipeptdica, es decir, el
orden, y ubicacin especfica de cada uno de los tipos de Aminocidos en dicha cadena, junto al enlace,
Peptdico que mantiene unidos covalentemente a los Aminocidos.
LA PEPSINA:
La pepsina es una proteasa, una enzima digestiva que degrada las protenas en el estmago; las otras enzimas
digestivas importantes son la tripsina y la quimotripsina. Fue la primera enzima animal en ser descubierta,
por Theodor Schwann en 1836.
La pepsina se produce en el estmago, acta sobre las protenas degradndolas, y proporciona pptidos y
aminocidos en un ambiente muy cido. El pepsingeno es un precursor de la pepsina, cuando acta el cido
clorhidrico (HCL) sobre el pepsingeno, ste pierde aminocidos y queda como pepsina, de forma que ya
puede actuar como proteasa.
La pepsina es ms activa con un pH cido. Se desactiva permanentemente con un pH superior a 6.
Pepsina utiliza un par de residuos aspartato para llevar a cabo la divisin de protenas. Corta a los
aminocidos Fenilalanina(F), Tirosina(Y) y al Triptofano(Thr)en los grupos aminos.
La pepsina acta donde estan los aminocidos Leucina, Aspartato, Glutamato.
PROTENAS
La Proteinemia total.- Es el reflejo del estado nutricional de una persona. Su valor normal es de 6-8 g/dL. Si
el valor de Proteinemia total es menor a 6 es bajo por lo que se denomina proteinemia, y si es mayor a 8 es
alto.
Protenas en la sangre
6-8 g/dL
La mayora de las protenas en la sangre tienen la funcin de transporte como por ejemplo:
- Sndrome de ehelers danlos o fibroelastosis, es una alteracin en el colgeno (el colgeno es una
molcula fibrosa de tejido conjuntivo, presente en todo el cuerpo excepto el cabello). La alteracin
molecular en el colgeno afecta a las articulaciones, como por ejemplo existe personas demasiados
flexibles que pueden hacer que sus articulaciones se doblen, esto es una alteracin del colgeno, a lo
que se llama hiperlaxitud en las articulaciones.
- Escorbuto, se refiere a la deficiencia de vitamina C, la cual es muy importante para la sntesis de
colgeno.
- Priones, que son protenas con alteraciones en su estructura. A causa de los priones se dan la siguiente
enfermedad: Creutzfeldt Jakob o scrapie o enfermedad de vacas locas, causando encefalopata
esponquiforme.
La cual podra estar en una membrana, sintetizada en el hgado, circulando, o dentro de una clula.
1. Sntesis.- La vida de una protena comienza con la sntesis de una cadena polipeptidica dentro de un
ribosoma que esta dictada por mRNA.
2. Plegado.- Son plegados por fenmeno fsico qumico.
3. Procesamiento.- Donde algunos forman enlaces di sulfuro y se procesan en el retculo endoplsmico.
4. Modificacin covalente.- Donde generalmente participan otros compuestos y pasan al aparato de
Golgi donde unas se acetilan (acetilacin) ingreso de cidos grasos, otros se glucosidan entran
azucares, otros se prenilan - grupo prenilo, otras fosforilan grupo fosfato, otras se sulfatan - grupo
sulfato.
5. Translocacin.- Las protenas se transportan a distintas partes, como ser a la membrana, mitocondrias,
o al ncleo, etc. Todas las protenas cuentan con un
pptido de seal el cual es una secuencia de aminocidos que los dirige.
6. Activacin.- algunas protenas se activan y otras necesitan de otro factor para activarse, necesitan
captar energa ATP, esto ocurre en enzimas. Se denomina proenzimas a aquellas enzimas inactivas
que luego se transformaran en activas.
7. Catlisis.- La vida media de una protena es el tiempo o periodo en que estos estn activos o
desempean su funcin.
8. Envejecimiento.- como por ejemplo la oxidacin, desamidacion, desnaturalizacin.
9. Ubiquitinacion.
10. Degradacin.
- 1 cuchara es 10 mL - Soya 36 g
- 1 tasa es 200 mL - Leche en polvo 27 g
- 1 vaso es 120mL - Quinua 13,60 g
ENVEJECIMIENTO
En primer lugar todas las protenas van a pasar por el estadio en que tienen que envejecer, hay muchos
factores que evitan que nuestras protenas lleguen a este estadio pudiendo mencionar la mala alimentacin,
los vicios fumar beber, etc. El promedio de vida en Bolivia es 62 -63 vivos
UBIQUITINACION
Ubiquitina: Es una protena que identifica a las protenas viejas y las degrada el beso de la muerte, al
fragmentar esta protena vieja la deja dispersa en aminocidos sueltos, que luego pueden volver a ser
capturados por los RNAt y volver a formar protenas nuevas.
Actual mente la vida media del aminocido es muy variable por lo que no podemos dar un nmero exacto.
Espectro fotmetro: es un instrumento usado en el anlisis qumico que sirve para medir, en funcin de la
longitud de onda, la relacin entre valores de una misma magnitud fotomtrica relativos a dos haces de
radiaciones y la concentracin o reacciones qumicas que se miden en una muestra. Tambin es utilizado en
los laboratorios de qumica para la cuantificacin de sustancias y microorganismos. (Espectrometra de
Bases)
CLASIFICACION:
- Por su composicin:
Simples: solo formado por aminocidos
1. Albumina: Soluble en agua, solucin salina, acida, alcalina, diluida
2. Globulina: Insoluble en agua, soluble en solucin salina y alcalina
3. Gluteina: Soluble en alcohol
4. Prolaminas: Insoluble en agua, soluble en acidos, bases diluidas y alcohol
5. Escleroproteinas: solubilidad muy limitada
6. Histonas: soluble en cualquier solvente (rico en aminocidos basicos)
7. Rotaminas: rico en aminocidos bsicos
Suero
Anticoagulante
ANTICOAGULANTES:
EDTA = Acido etilediamintetracetico
Sulfato de Amonio
Reactante de fase aguda Agentes Quelantes
se activa cuando hay dao
en la clula
*Proteinemia viene de Proteina y ema sangre. Por tanto Proteinemia es la cantidad de proteinas en sangre.
Existe una prueba analitica (analisis de sangre) que se denomina Proteinas Totales, que se realiza en suero (el liquido
que resulta despues de coagularse la sangre) y que determina la proteinemia o cantidad de proteinas totales en
sangre.
Si se detecta una alteracion de la cantidad o se sospecha una anomalia cualitativa de las proteinas en sangre, siempre
puede realizarse un Proteinograma, en el cual se pueden ver las cantidades correspondientes a diferentes tipos de
proteinas que suelen encontrase en la sangre, com Albumina (la mas abundante), Alfa globulinas, Beta Globulinas y
Gamma Globulinas.
Por ejemplo despues de una infeccion virica se puede observar un aumento de gamma globulinas homogeneo. En un
Mieloma Multiple, se puede observar un aumento de una fraccion de Gammaglobulinas o gammapatia monoclonal.
Proteinuria sera lo mismo pero para la orina. Las proteinas en orina han de ser practicamente negativas en un
individuo normal. La electroforesis proteica
Dimensiones Relativas y Masas de las protenas:
ALBUMINA 69000 daltons, HEMOGLOBINA 64000 daltons, B1 GLOBULINA 90000 daltons, Y GLOBULINA 156000
daltons (+ pesada), ALFA LIPOPROTEINA 200000 daltons, B1 LIPOPROTEINA 1300000 daltons, FIBRINOGENO 340000
daltons.
Funciones de la sangre:
- Respiracin: transporte de oxigeno desde los pulmones hasta los tejidos y el CO2 desde los tejidos hasta los
pulmones
- Nutricin: Transporte de materiales alimenticios absorbidos
- Excrecin: Transporte de desechos metablicos a riones, pulmones, piel e intestinos para su evacuacin
- Mantenimiento del equilibrio acido-base normal en el organismo
- Regulacin del equilibrio hdrico a travs de los efectos de la sangre sobre el intercambio de agua entre el
liquido circulante y el liquido tisular
- Regulacin de la temperatura corporal mediante la distribucin de calor corporal
- Defensa contra infecciones a travs de leucocitos y anticuerpos circulantes
- Transporte de hormonas y regulacin del metabolismo
- Transporte de metabolitos
- Coagulacin
Curva electrofortica de protenas: es un mtodo de separacin de protenas mediante la aplicacin de un campo
elctrico.
Tcnica de Densimetra: En la tcnica de biologa molecular llamada western blot, la densitometra se utiliza para
cuantificar la cantidad de protena que se encuentra en una determinada banda.
El rgano productos de mas protenas plasmticas es el hgado (20-25g/da produce un hgado normal)
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PROTEINAS PLASMATICAS E INMUNOGLOBULINAS
1- IMPORTANCIA BIOMEDICA
- La sangre tejido fundamental para la homeostasis
- Fcilmente accesible parta la determinacin de bioqumica clnica
- Puede determinarse la concentracin de protenas plasmticas e inmunoglobulinas
- Puede cuantificarse los niveles plasmticos de enzimas para el diagnostico de laboratorio
2- FUNCIONES DE LA SANGRE
- Respiracin (transporte)
- Nutricin (transporte de nutrientes)
- Excrecin (molculas de desecho)
- Equilibrio acido-base
- Equilibrio Hidroelctrico
- Regulacin de temperatura corporal
- Defensa
- Transporte de hormonas
- Transporte de metabolitos
- Coagulacin
4- ALBUMINA
- Pm = 69 kD
- 3,4 a 4,7 g/dl (hgado produce: 12 g/da)
- Se produce como una pre albumina y tiene un pptido seal de 6 AA
- Tiene una forma elipsoide Desarrolla a 75 a 80 % de la PO
- La ausencia gentica se denomina ANALBUMINEMIA
- Constituye el 60% de la proteinemia (40% Plasma y 60% LEC)
- 585 AA y 17 Enlaces S-S 3 dominios
- Puede unir a varios LIGANDOS. cidos grasos, Hormonas, Ca, antibiticos, etc
5- HAPTOGLOBINA: Hp
- Estructuralmente es una glucoproteina
- Se une a la Hb extra corpuscular Hb Hp 40 a 180 mg/dl
- HP = 90kD + Hb = 654kD = 155 kD
- Tiene tres ISOFORMAS: Hp 1-1, Hp 2-1 y Hp 2-2
- Ocurren cambios en la concentracin Z < en ANEMIAS HEMOLITICAS > en INFLAMACIONES
10- INMUNOGLOBULINAS
- Ig G: Fija complemento, Atraviesa Placenta. Opzoniza Bacterias
- Ig A: En secreciones: Evita fijacin de bacterias y virus en mucosas
- Ig M: Fija complementos, no atraviesa placenta, Receptor de Ag en celula B
- Ig D: Localizada en la superficie de las clulas B
- Ig E: Media la Hipersensibilidad, protege de parsitos
MECANISMO DE ACCION
Cada citocina se une a un RECEPTOR DE SUPERFICIE CELULAR ESPECIFICO generando cascadas de sealizacin celular
que alteran la funcin celular. Esto incluye la regulacin positiva o negativa de diversos genes y sus factores de
transcripcin que resultan en la produccin de otras citocinas o un aumento en el numero de receptores de superficie
para otras molculas, ola supresin de su propio efecto mediante retro regulacin.
CITOCINAS DE LA INFLAMACION
Interleucina 1 (IL-1), factor de Necrosis Tumoral Alfa (TNF - Alfa), Interleucina 8 (IL-8), Interleucina 12 (IL-12),
Interleucina 16 (IL-16) e Interferones. Todas ellas son pro inflamatorias. IL-6 e IL-12, adems, actan en la inmunidad
especfica: IL-6 es un factor autocrino de linfocitos B7 mientras que IL-12, estimula la inmunidad celular citotoxica.
BIOQUIMICA DR. PEREZ
Univ. SHIR. FECHA: 14 / 04 / 2014
CINETICA ENZIMATICA
Las enzimas para desarrollar su accin necesitan condiciones, por eso llamamos factores que
afectan la velocidad de reaccin o la velocidad catlisis agregando el factor tiempo, en segundos o
microsegundos aunque tambin existen enzimas que actan en horas solamente. Entonces una
molcula A para transformarse en B necesita de una enzima, porque ella acelera esa conversin.
Las enzimas hacen que la velocidad de reaccin sean ms rpidas (catlisis o actividad de la
enzima)
ENZ O INHIBIDORES
A B
TIEMPO
B CHOQUE DE MOLECULAS
A
C D
CALOR
- La aplicacin de calor en un sistema acelera el movimiento o la cintica de las
molculas
- El movimiento es mayor, cuanto mayor es la colisin.
ATOMO.- tiene un ncleo y electrones que giran a su alrededor. Ahora bien a qu temperatura
dejan de moverse la materia? R. a -273 K
La barrera energtica se explica como el factor energtico que impide la transformacin de las
molculas, entonces esa barrera energtica debe ser rebasada para permitir la transformacin de
molculas. La enzima afecta y hace que la barrera energtica sea destruida. Las enzimas
modifican la barrera energtica y esto se demuestra en la teora del tnel (las enzimas ocasionan
un camino para que el sustrato en un tiempo corto sea transformado) y la finalidad es acelerar el
movimiento.
En reacciones donde no hay enzima, una molcula X que se va a transformar en una molcula Y,
puede hacerlo por varios caminos y se llega a topar con barreras, sin embargo existe:
Actividad de modelo tnel o tunelo.- Esta una reaccin en la que la velocidad de catlisis se
hace mayor gracias a la participacin de una enzima. Las enzimas modifican la barrera energtica.
ENZ
(S) (P)
X Y
VELOCIDAD DE REACCION
CINETICA QUIMICA
X+Z Z o 2X Z
Reaccin 3.- en esta la velocidad de reaccin es el producto de la concentracin de
tres reactantes
- Reaccin Mixta.- la combinacin de las anteriores
Catal 1 mol/ s
EFECTOS DE LA INHIBICIN
Vo = Vmax * (S)
Km + (S)
(E) (S) (E) (P) + (E)
Y = ax + b
(S) (I)
1 Km 1 1
(S) (I) (S) + (I) V Vmax * (S) + Vmax
Ejemplo: la aspirina sintetiza de prostaglandina (ciclo oxigenasa)
E = enzimas S = sustrato
I = inhibidor P = producto
- Reversible donde el inhibidor puede unirse y luego soltarse. Luego la enzima se despeja y puede volver a
trabajar.
- Irreversible cuando el inhibidor se une a la enzima y no se suelta ms. A esto tambin se lo llama veneno de
la actividad enzimtica.
Ejemplos:
Una enzima tiene muchos aminocidos si ocurre un cambio en su secuencia puede alterar la constitucin de una
enzima.
Va metablica
-
E1 E2 * E3 E4 E5
A B C D E F
CINETICA ENZIMATICA
1. FACTORES QUE AFECTAN A LA VELOSIDAD DE REACCION O CATALISIS:
Las enzimas para liberar su accin necesitan condiciones, los denominados factores que afectan la vellosidad
de reaccin o de catlisis (agregando el factor tiempo) y entre estos tenemos:
Colisin (cinemtica)
Barrera energtica
Calor
Qu es catlisis?
Se llama catlisis cuando una enzima acelera la accin de una determinada reaccin.
B D
ENZIMA
A B
TIEMPO
C
A
2. BARRERA ENERGETICA:
En este grafico de coordenada de reaccin
podemos observar una molcula X que se va
a transformar en una molcula Y. Sucede que
cuando participa una enzima en una reaccin,
hay un momento donde se llama de
transicin donde no es X ni Y momento
Energa libre
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CINETICA QUIMICA
Dependiendo del tiempo de la concentracin de los reactantes sobre la velocidad de reaccin, las reacciones
qumicas no catalizadas por enzimas pueden ser de: orden cero, primer orden, segundo orden, tercer orden y de
orden mixto.
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UNIDAD DE ACTIVIDAD ENZIMATICA:
Se defina la unidad de actividad enzimtica (U) como la cantidad de enzima que cataliza la concentracin de un mol
de sustrato en un minuto.
La actividad especfica es el nmero de unidades de enzima por miligramo de protena (U/mg protena X U/ml de
disolucin)
El sistema internacional de unidades ha definida la unidad de actividad enzimtica como la cantidad de enzima que
transforma 1 mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama Katal (Kat).