INTRODUCCIN

El nombre protena proviene de la palabra griega protein, que significa lo

primero. Este nombre est bien elegido. Entre todos los compuestos qumicos,
ciertamente hay que considerara las protenas como las ms importantes
puesto que son las sustancias de la vida. 2

Las protenas son las molculas mas abundantes en los animales que
desempean funciones importantes tanto en estructura como en la funcin de
las clulas.3

Las protenas se encuentran en todos los organismos vivos, son de muchos

tipos diferentes y desempean muchas funciones biolgicas distintas. La
queratina de la piel y uas de los dedos, la fibrona de la seda y las telaraas, y
el estimado de 50 000 a 70 000 enzimas que catalizan las reacciones
biolgicas en nuestros cuerpos son todas protenas. 4

Los pptidos y las protenas son los polmeros de los aminocidos1 tambin
conocidos como biopolmeros de los -aminoacidos3. Los aminocidos

estn unidos entre s por un enlace tipo amida. Un aminocido es un acido

carboxlico que tiene un grupo amino en el carbono . A las unidades
1
respectivas se les llama residuos de aminocidos.

Una sola molcula protenica contiene cientos, e incluso miles, de unidades de

aminocidos, que pueden ser de unos 20 tipos diferentes. El nmero de
combinaciones distintas, es decir, el nmero de molculas protenicas
diferentes que pueden existir, es casi infinito. 2

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Su valor como bloques de construccin para formar protenas se deriva del
hecho de que los aminocidos pueden asociarse entre s en cadenas largas
formando enlaces amida entre el NH 2 de un aminocido y el CO2H de otro. Para
propsitos de clasificacin, las cadenas con menos de 50 aminocidos con
frecuencia se llaman pptidos, mientras que el trmino protena se utiliza
para cadenas ms grandes.4

Las subunidades individuales de los aminocidos se unen por medio de enlaces

amida llamados enlaces peptdicos. 3

NOMENCLATURA Y CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS.

Casi siempre los aminocidos se conocen

por sus nombres comunes. Con
frecuencia el nombre indica algo acerca
del aminocido. Por ejemplo, la glicina
tiene su nombre como resultado de su
sabor dulce (glykos, dulce en griego), y
la valina, como el acido valrico, tiene
cinco tomos de carbono. La asparagina
se encontr por primera vez en los
esprragos (asparagus en ingles) y la
tirosina se obtuvo del queso (ryros, queso en griego).1

Los aminocidos se clasifican en clases que facilitan su estudio. Los

aminocidos de cadena lateral aliftica, los aminocidos hidroxilados, los
aminocidos sulfurados, aminocidos cidos, amidas de aminocidos cidos,
aminocidos bsicos, aminocidos con benceno y aminocidos heterocclicos.
Cada uno de los aminocidos se designa con una abreviatura de tres letras (en

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
la mayor parte de los casos, las tres primeras letras de sus nombres) y con una
sola letra.1

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Diez aminocidos son aminocidos esenciales. Los humanos debemos obtener
esos 10 aminocidos esenciales en nuestra dieta porque no podemos sintetizar
o al menos en las cantidades adecuadas. Por ejemplo se debe contar con una
fuente de fenilalanina en nuestras dietas porque los humanos no podemos
sintetizar anillos de benceno. Sin embargo, no necesitamos tirosina en nuestras
dietas porque podemos sintetizar las cantidades necesarias a partir de la
fenilalanina.1

Los diez aminocidos esenciales son los siguientes:

Aginina (Arg) Valina (Val) Metionina (Met) Leucina (Leu)

Treonina (Tre) Fenilalanina (Fen) Histidina (His) Isoleucina (Ilc)
Lisina (Lis) Triptfano (Trp)
A las protenas que proveen todos los aminocidos esenciales en las
proporciones casi correctas para la nutricin humana se les llama protenas
completas. A las protenas que son bastante deficientes en uno o ms de los
aminocidos esenciales se les llama protenas incompletas. 3

ESTRUCTURA Y ESTEREOQUMICA DE LOS AMINOCIDOS.

El termino aminocido podra significar cualquier

molcula que contenga un grupo amino y cualquier
tipo de grupo acido; sin embargo, el termino casi
siempre se usa para referirse a un acido carboxlico
-amino. El -aminocido mas sencillo es el

cido aminoactico, llamado glicina.3

Los aminocidos solo difieren en el sustituyente R unido al carbono . La

gran variacin de estos sustituyente (llamados cadenas laterales) es lo que

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
le da su gran diversidad estructural a las protenas y en consecuencia, su gran
diversidad funcional.1

Con excepcin de la glicina, todos los dems -amincidos son quirales. En

todos los aminocidos quirales, el centro de quiralidad es el tomo de carbono

asimetrico. La mayor parte de los aminocidos que se encuentran en

forma natural tiene la configuracin (S) en el tomo de carbono .3

Los carbonos de los aminocidos son centros quirales. Por lo tanto, son
posibles dos enantimeros de cada uno, pero la naturaleza slo utiliza uno para
construir protenas.4

La notacin D y L que se usa en los monosacridos tambin se usa para los

aminocidos. Un aminocido representado por las proyecciones de Fischer, con
el grupo carbonillo arriba y el grupo R abajo en el eje vertical es un D-
aminocido, si el grupo amino esta a la derecha y es un L-aminocido si el
grupo amino esta a la derecha. 1

Debido a que la estereoqumica es similar a la del L-(-)-gliceraldehdo, los (S)-

aminocidos de estado natural se clasifican como un L-aminocido.3

A diferencia de los monosacridos, donde el ismero D es el que se encuentra

en la naturaleza, la mayor parte de los aminocidos naturales tienen la
configuracin L. Hasta hoy solo se han encontrado residuos de D-aminocido
en unos pocos antibiticos peptdicos y en algunos pptidos pequeos unidos a
las paredes celulares.1

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Los aminocidos estndar son los 20 .aminoacidos comunes que se

encuentran en casi todas las protenas. Los aminocidos estndar difieren

entre su en la de estructura de las cadenas laterales unidas a sus tomos de
carbono .3

Adems de los 20 aminocidos que se encuentran comnmente en las

protenas, otros dos selenocistena y pirrolisina se encuentran en algunos
organismos, y tambin se encuentran en la naturaleza ms de 700
aminocidos no protenicos. Por ejemplo, el cido
-aminobutrico (GABA) se encuentra en el cerebro y acta como un
neurotransmisor; la homocistena se encuentra en la sangre y se le asocia a las
enfermedades cardiacas coronarias; y la tiroxina se encuentra en la glndula
tiroide, donde acta como una hormona. 4

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
CARACTERSTICAS DE LOS AMINOCIDOS.

Aunque corrientemente se indican los aminocidos como estructuras que

contienen un grupo amino y otro carboxilo, H 2NCR-COOH ,ciertas propiedades,
tanto fsicas como qumicas, no concuerdan con dichas estructuras:

a) A diferencia de las aminas y cidos carboxlicos, los aminocidos son

slidos cristalinos no voltiles que se funden con descomposicin a
temperaturas relativamente elevadas.
b) Son insolubles en disolventes no polares, como ter de petrleo,
benceno o ter; son apreciablemente solubles en agua.
c) Sus soluciones acuosas se comportan como soluciones de sustancias de
elevado momento dipolar.
d) Las constantes de acidez y basicidad son extremadamente pequeas
para grupos COOH y NH2.La glicina, por ejemplo, tiene Ka=1. 6x10-10 y
K=2,5x10-12 mientras que la mayora de los cidos carhoxilicos tienen Ka
del orden de 10-5 y la mayora de las aminas alifticas una Kb de
aproximadamente 10-4.2

Todas estas propiedades concuerdan bien con una estructura de ion dipolar
para aminocido (I) .2

PROPIEDADES CIDO-BASE DE LOS AMINOCIDOS

En los aminocidos un grupo carboxilo se desprotona y existe como el anin

carboxilato a un pH fisiolgico de 7.3, mientras que un grupo amino se protona
y existe como el catin amonio. Por esta razn, los aminocidos existen en
disolucin acuosa principalmente en la forma de un ion dipolar, o zwitterion
(del alemn zwitter, que significa hbrido). 4

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Los zwitteriones de los aminocidos son sales internas y, por lo tanto, tienen
muchas de las propiedades fsicas asociadas con las sales. Tienen momentos
dipolares grandes, son solubles en agua pero insolubles en hidrocarburos y son
sustancias cristalinas con puntos de fusin relativamente altos. Adems, los
aminocidos son anfteros, ya que pueden reaccionar como cidos o como
bases, dependiendo de las circunstancias. En disolucin cida acuosa, un
zwitterion de aminocido es una base que acepta un protn para producir un
catin; en disolucin bsica acuosa, el zwitterion es un cido que pierde un
protn para formar un anin.4

Hay pocos aminocidos que cuenten con cadenas laterales que disponen de
hidrgenos ionizables. Por ejemplo la cadena lateral con imidazol protonado en
1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin
2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
la histidina tiene un pKa de 6.04. por consiguiente la histidina puede existir en
cuatro formas diferentes y que predomine depender del pH de la disolucin

EL PUNTO ISOELCTRICO

Lo que suceda con una solucin de un aminocido cuando se le coloca en un

campo elctrico, depender de su acidez o alcalinidad. En solucin muy
alcalina, hay ms aniones que cationes, por lo que hay una migracin neta del
aminocido hacia el nodo. En soluciones acidas, en cambio, se encuentran los
cationes en exceso, por lo que hay migracin neta del aminocido hacia el
ctodo. Si los aniones y cationes se equilibran exactamente, no hay migracin:
en estas condiciones existe cualquiera de las molculas como ion positivo y
negativo durante el mismo lapso, de modo que cualquier movimiento pequeo
en direccin de uno de los electrodos es anulado por uno igual y contrario
hacia el otro electrodo. La concentracin de ion hidrgeno de la solucin para
la cual un aminocido determinado ni migra en un campo elctrico se
denomina punto isoelctrico de dicho aminocido. 2

El punto isoelctrico de un aminocido depende de su estructura, Los 15

aminocidos neutros tienen puntos isoelctricos cercanos a un pH neutro, en el
intervalo de pH de 5.0 a 6.5. Los dos aminocidos cidos tienen puntos
isoelctricos en pH ms bajos por lo que la desprotonacin del CO 2H de la
cadena lateral no ocurre en su pI, y los tres aminocidos bsicos tienen puntos
isoelctricos a pH ms altos, por lo que la protonacin del grupo amino de la
cadena lateral no ocurre en su pI. 4

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
SEPARACIN DE AMINOCIDOS

La Electroforesis

La Electroforesis usa las diferencias en los puntos isoelctricos para separar

mezclas de aminocidos. Se coloca una banda de la mezcla de aminocidos en
el centro de la capa de gel de acrilamida o de una pieza de papel filtro mojado
con una disolucin reguladora. Se colocan dos electrodos en contacto con los
bordes del gel o papel y se aplica una potencia de varios miles de volts a
travs de los electrodos. Los aminocidos con carga positiva (catinicos) son
atrados al electrodo negativo (el ctodo) y los aminocidos con carga negativa
(aninicos) son atrados al electrodo positivo (el nodo). Un aminocido en su
punto isoelctrico no tiene carga neta, por lo que no se mueve. 3

SNTESIS DE AMINOCIDOS

Los aminocidos de estado natural se pueden obtener hidrolizando protenas y

separando la mezcla de aminocidos. Aun asi, con frecuencia es mas
econmico sintetizar el aminocido puro., en algunos casos, se necesita un
aminocido inusual o un enantimero no natural y debe sintetizarse. 3

Reaccin de Hell-Volhard-Zelinski

Los -aminocidos pueden sintetizarse en el laboratorio utilizando diversas

reacciones. Uno de los mtodos ms antiguos de sntesis de -aminocidos
comienza con la bromacin en de un cido carboxlico cuando se trata con Br 2
y PBr3.4. El acido -bromoccarboxlico que se forma se hace reaccionar con
1
amoniaco por medio de una reaccin SN2 para formar el aminocido.

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Sntesis del amidomalonato

Un mtodo ms general para preparar -aminocidos es la sntesis del

amidomalonato, una extensin directa de la sntesis del ster malnico. La
reaccin comienza con la conversin del acetamidomalonato de dietilo en un
ion enolato cuando se trata con una base, seguida por la alquilacin S N2 con un
haluro de alquilo primario. La hidrlisis del grupo protector amida y de los
steres ocurre cuando el producto alquilado se calienta con un cido acuoso, y
despus ocurre la descarboxilacin para producir un -aminocido. Por ejemplo,
el cido asprtico puede prepararse a partir del bromoacetato de etilo,
BrCH2CO2Et.4

Otra variante de esta sntesis y que obtiene buenos rendimientos en la

formacin de aminocidos es la sntesis del ster N-ftalimidomalnico, un
mtodo donde se combina la sntesis del ster malnico y la sntesis de
Gabriel. El mecanismo se presenta a continuacin: 1

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
 El ster -bromomalonico y la ftalamina de potasio reaccionan a

travs de una reaccin SN2.

Un protn se elimina con facilidad del carbono del ster N-
Ftalimidomalnico porque esta unido a dos grupos ster
El carbanin que resulta reacciona con un haluro de alquilo a travs de
una reaccin SN2.
Al calentar en disolucin acuosa acida se hidrolizan los dos grupos ster
y los dos grupos amida, y se descarboxila el acido 3-oxocarboxilixo.

Evidentemente, estos aminocidos sintticos son pticamente inactivos ,y

debern ser resueltos si se quieren comparar los materiales activos con los
cidos naturales, o si se desean para sintetizar pptidos. 2

Aminacin reductiva

la Aminacin reductiva de cetonas y aldehdos es uno de los mejores mtodos

para la sntesis de aminas. Tambin forma aminocidos. Cuando se trata un
-cetocido con amoniaco, la cetina reacciona para formar una imina. La

imina se reduce a una amina por el hidrogeno y un catalizador de paladio. El

acido carboxlico no se reduce.3

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
Llamamos a la Aminacin reductiva sntesis biomimtica (que imita el
proceso biolgico), debido a que se asemeja a la sntesis biolgica de los
aminocidos. La biosntesis comienza con la aminacin reductiva de un acido
-cetoglutrico (un intermediario en el metabolismo de los carbohidratos),

usando el ion amonio como el agente de aminacin y el NADH como el agente

reductor. El producto de esta reaccin catalizada por una enzima es el
enantimero L puro del acido glutnico. 3

La biosntesis de otros aminocidos usa el acido L-glutmico como la fuente del

grupo amino. A tal reaccin, que mueve un grupo amino de una molcula a
otra se le llama transaminacin. Y a las enzimas que catalizan estas
reacciones se les llama transaminasas.3

Sntesis enantioselectiva

La sntesis de un -aminocido a partir de un precursor aquiral por

cualquiera de los mtodos descritos, produce una mezcla racmica, con

cantidades iguales de enantimeros S y R. Sin embargo, para utilizar un
aminocido en la sntesis en el laboratorio de una protena de origen natural,
debe obtenerse el enantimero S puro. 4

En la prctica se utilizan dos mtodos para obtener aminocidos

enantiomricamente puros y una forma es resolver la mezcla racmica en sus
enantimeros puros. Sin embargo, una aproximacin ms directa es utilizar una
sntesis enantioselectiva para slo preparar directamente el enantimero S
deseado. la idea detrs de la sntesis enantioselectiva es encontrar un

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
catalizador quiral de la reaccin que sostendr temporalmente una molcula
del sustrato en un ambiente asimtrico. Mientras est en el ambiente quiral, el
sustrato puede estar ms abierto a la reaccin en un lado que en el otro, lo que
conduce a un exceso de un producto enantiomrico sobre el otro. 4

Hace algunos aos en la compaa Monsanto, William Knowles descubri que

los -aminocidos pueden prepararse enantioselectivamente por
hidrogenacin de un cido (Z)-enamido con un catalizador quiral de
hidrogenacin.

Los catalizadores ms efectivos para la sntesis enantioselectiva de

aminocidos son los complejos de coordinacin de rodio (I) con 1,5-
ciclooctadieno (COD) y una difosfina quiral como el (R,R)-1,2-bis(o-
anisilfenilfosfino)etano, el llamado ligando DiPAMP. El complejo debe su
quiralidad a la presencia de los tomos de fsforo trisustituidos. 4

Sntesis de Strecker

La primera sntesis conocida de una aminocido ocurri en 1850 en el

laboratorio de Adolph Strecker en Tubingen. Alemania. Strecker adiciono
acetaldehdo a una disolucin acuosa de amoniaco y HCN. El producto fue un
-aminopropionitrilo, el cual Strecker hidrolizo a alanina racmica. 3

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin
 3
y sigue el siguiente mecanismo:

1. Paula Yurkanis Bruice; Qumica Orgnica; quinta edicin

2. Robert Thornton Morrison ; Robert Neilson Boyd; Qumica Orgnica; quinta
edicin.
3. LG. Wade Jr.; qumica orgnica ; volumen 2.
4. John McMurry: qumica orgnica ; sptima edicin