Cedillo Gonzlez Brayan Raziel Fecha de entrega: 16 de mayo del 2017

Psicrofilos y regiones polares.

(Jody W Deming)

Los estudios, en su mayora, sobre la vida microbiana en ambientes fros

comienzan con un lamento por lo poco que se sabe acerca de los psicrfilos o sus
adaptaciones especficas al fro.
Esta situacin ha cambiado gracias a las nuevas investigaciones que se han
enfocado empleando nuevos puntos de vista genticos moleculares, etc. por el
conocimiento del cambio ambiental acelerado en las regiones polares y por el
inters en la habitabilidad de los ambientes congelados en otras partes del
sistema solar. Se destacan los descubrimientos recientes en la adaptacin
molecular, la biodiversidad y la dinmica microbiana en el fro, junto con el
concepto de eutectophiles , organismos que viven en la interfaz crtica inherente
al cambio de fase de agua a hielo.
INTRODUCCIN
Se entiende, en aspectos generales, que los microorganismos adaptados al fro
logran sus xitos fisiolgicos y ecolgicos en ambientes con esas cualidades,
como resultado de caractersticas nicas tanto en sus protenas, como en sus
membranas y sus respuestas genticas a los cambios trmicos. Una enzima fra
tiende a tener una energa de activacin reducida, lo cual da lugar a una alta
eficacia cataltica. Lo anterior lo que puede atribuirse a una mayor flexibilidad local
o total de la estructura de la protena. Para mantener la fluidez y la capacidad
crtica para transportar sustratos y nutrientes a bajas temperaturas (rigidificadoras)
las membranas incorporan, a su estructura, componentes lipdicos especficos.
Las protenas de choque en fro que permiten actividades continuadas especficas
como las gotas de temperatura se inducen en psicrfilos.
Estos temas potencialmente universales para definir la adaptacin al fro se han
adoptado con cautela en la literatura, debido a la limitada informacin conocida de
un pequeo nmero de organismos.
Destacan los avances a nivel molecular, junto con los avances paralelos
realizados en los hbitats naturalmente fros a nivel de microorganismos,
poblaciones y comunidades enteras. En este ltimo caso, el foco principal est en
ambientes acuticos muy fros. Las regiones polares de la Tierra, especialmente el
rtico, estn sufriendo un cambio medioambiental relativamente rpido de modo
que los habitantes dependientes del ambiente helado parecen amenazados de
extincin en este siglo.
Los candidatos ms probables para albergar la vida microbiana en nuestro
sistema solar son Marte, y la luna cubierta de hielo de Jpiter. Ambos cuerpos nos
presentan superficies congeladas para su evaluacin y muestreo.

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Avances en el nivel gentico molecular

La mayora de las investigaciones a nivel gentico molecular en microorganismos
adaptados al fro continan centrndose en las enzimas. Las primeras xilanasas y
laminarasas, valina deshidrogenasa, chitobiasa y quitinasas, y pectato liasa se
unen a las lista de enzimas ya conocidas y al menos parcialmente caracterizadas
a partir de bacterias adaptadas al fro. El trabajo cada vez ms sofisticado con
algunas de estas y con enzimas previamente caracterizadas ha reforzado los
temas generales de la actividad fra, especialmente que las adaptaciones clave en
forma de residuos de aminocidos especficos se encuentran en el dominio del
sitio activo o, la flexibilidad conformacional requerida del sitio para la reactividad
en el fro.
La expresin de genes para enzimas a partir de microorganismos adaptados al fro
se ha avanzado mediante el uso de vectores convencionales (Escherichia coli),
incluyendo la primera protena recombinante producida en un husped bacteriano
antrtico. El enfoque tradicional de la utilizacin de mutantes para comprender la
expresin gnica se ha puesto en ventaja en la evaluacin de la cantidad de pasos
evolutivos que pueden haber sido necesarios para lograr la actividad fra en una -
amilasa. Se ha dirigido a la comprensin de cmo una enzima extracelular se
comporta en un ambiente muy fro, una vez liberado por el organismo productor, y
por lo tanto la importancia de la vida de la enzima en el fro. Tambin se ha
reconocido la posibilidad de procesos coevolutivos que contribuyen al
comportamiento enzimtico en un ambiente fro, en forma de control de la
produccin de enzimas bacterianas.
Los avances con protenas distintas de las enzimas incluyen un nuevo trabajo con
protenas del factor 2 de elongacin de un metangeno antrtico, que abordan
algunas de las caractersticas de actividad fra de la maquinaria de sntesis de
protenas, e investigaciones adicionales sobre protenas de choque en fro. En
este ltimo caso, los vnculos entre las protenas de choque en fro y la
supervivencia notablemente mejorada de la bacteria productora bajo presin
hidrosttica elevada refuerzan los vnculos esperados entre la psicrfilia y la
barofa en general.
El descubrimiento ms reciente de los genes bacterianos para las protenas de
choque en fro en algunas Archaea contribuye a la discusin de las transferencias
de genes impulsadas por el medio ambiente a travs de los dominios filogenticos.
Las adaptaciones al estrs salino, a travs de la produccin de carotenoides,
sugieren que la investigacin sobre carotenoides en bacterias de las bolsas
salobres de hielo marino puede revelar nuevos vnculos entre psicrfilia Y halofilia
(o halotolerancia). De hecho, en el hielo marino, una disminucin de la
temperatura (como ocurre durante el invierno), necesariamente, significa un
aumento de la concentracin de sal en el resto del lquido de la matriz de hielo.

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En cuanto al constituyente celular esencial, los investigadores del Instituto de

Investigacin Genmica ha completado casi la secuenciacin y la anotacin del
primer genoma completo para un organismo adaptado al fro, la protobacteria
obligatoriamente psicrfilas Colwellia psychrerythraea cepa 34H. Organismo
aislado originalmente de los sedimentos marinos rticos. La disponibilidad de este
genoma proporciona una nueva base de datos importante y una gama de
enfoques para analizar un amplio espectro de adaptaciones al fro, especialmente
en el mbito marino.
Diversidad microbiana en ambientes de aguas profundas polares y fros.
El estudio de la biodiversidad basado en la secuencia del gen rRNA 16S se inici
gracia a la filogenia molecular y los mtodos para la evaluacin de
microorganismos incultivables en el medio ambiente. Se ha observado en estudios
que las bacterias dominan y estn presentes en mayor diversidad que las Archaea
en ambientes fros y polares. Las excepciones importantes son el interior fro y las
aguas profundas del ocano, muy por debajo de la capa superior mixta. All, las
Archaea aparecen en nmeros elevados sobre sus homlogos en aguas
superficiales o en realidad ms altas que las Bacterias a las mismas
profundidades.
Las Archaeas puede ser rastreadas en el tiempo y el espacio no slo por el gen
ribosomal 16S, sino tambin a travs de sus firmas de lpidos nicos.
Estas caractersticas han hecho posible la puntuacin de la expansin de
Crenarchaeota de los ambientes de alta temperatura al mar profundo y frio.
Expansin que parece haber ocurrido durante el perodo del Cretcico medio,
hace ms de 100 millones de aos, sobre la base de anlisis de istopos de
carbono estables, ha estado dominado por un estilo de vida quimiolitotrfico. Dada
esta informacin y la naturaleza quimiolitotrfica de los nitrificadores cultivables, la
documentacin de los genes nitrificantes bacterianos en los ocanos fros es la
prueba de la transferencia lateral de genes entre las bacterias y las
Crenarchaeotas contemporneas del ocano fro.
La Crenarchaeota fra entrar en el centro del escenario, no slo por su elevado
nmero en aguas fras, sino por su participacin en el proceso de ciclaje de
nitrgeno considerado responsable de la produccin primaria continua en todo el
ocano.
Los mtodos convencionales de cultivo cuantitativo, recientemente aplicados a
organismos tolerantes a la sal en aguas profundas fras han producido muchos
aislamientos con nuevas secuencias de ARNr 16S que crecen a -1 C.
Dinmica microbiana en regiones polares
Se espera que los mtodos moleculares permitan una evaluacin de la dinmica
microbiana as como la diversidad en un ambiente dado, la comprensin de los

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roles funcionales de los microorganismos en el ciclo de carbono, nitrgeno y otros

elementos.
Para medir la actividad microbiana en las regiones polares, o nuevas evaluaciones
de datos previamente publicados, han tendido a centrarse en la cuestin de la
respiracin bacteriana.
La respiracin parece disminuir de acuerdo con el crecimiento a temperaturas
cada vez ms fras.
Aumento de la eficiencia del crecimiento bacteriano en altas latitudes se traduce
en una mayor disponibilidad de materia orgnica en partculas (POM) para la
exportacin a profundidad, colocando los patrones de metabolismo microbiano en
circuito cerrado directamente en la arena mundial del secuestro de carbono y el
cambio climtico.
El control de las actividades microbianas heterotrficas por la temperatura puede
rara vez, o nunca, entenderse separadamente de la cuestin de los alimentos
disponibles en forma de materia orgnica disuelta (DOM). Se han hecho algunos
avances en cuanto a las fuentes, los tipos y el destino microbiano tanto de DOM
como de POM en el medio marino polar.
Los polisacridos lbiles derivados de la floracin del fitoplancton antrtico en
aguas casi heladas parecen ser Fcilmente consumido por el bacterio-plancton,
aunque despus de la primera acumulacin no degradada durante la floracin.
Este patrn est en consonancia con el concepto de un requisito de umbral ms
alto para DOM por las bacterias que operan a temperaturas subptimas de
crecimiento [31]. Se observ que el POM, la fuente ltima de DOM, disminuy
estacionalmente en su contenido de nitrgeno en una polynya rtica,
probablemente debido a las acciones hidrolticas de las proteasas extracelulares
producidas por la fraccin de Bacterias asociadas a las partculas que respiraban
activamente.
Estudios raros que combinan mtodos moleculares y medidas tradicionales de
abundancia y actividad revelan un importante papel de los virus en la produccin y
el destino de los DOM y la dinmica sucesional de las bacterias del rtico en el
Mar de Chukchi, al norte de Alaska. Recientemente se ha obtenido un sistema de
virus-hospedador marino, nico en su adaptacin al fro y generalizado en
ocurrencias regionales.
Su disponibilidad es un buen presagio para futuros avances no slo en la
comprensin de la dinmica de los ecosistemas microbianos polares y ciclos de
carbono, sino tambin en la exploracin de la transferencia lateral de genes a
temperaturas fras.
La quimiotaxis permite que un microorganismo se posicione favorablemente para
el crecimiento competitivo y la supervivencia. Aunque la temperatura de la vasta

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porcin del ocano global, y prcticamente todas las aguas en latitudes altas, se
encuentra por debajo de 5 C, y mucho se hace de la importancia de la
quimiotaxis en el mar sobre la capacidad de las bacterias para adoptar la
quimiotaxis como una estrategia de supervivencia en el fro.
Un ambiente frio o polar proporciona sin duda el entorno ms selectivo para la
adaptacin al fro que los cuerpos de agua o sedimentos no congelados ms
leves. El proceso estacional de encasamiento de las comunidades microbianas
marinas en el hielo marino, la exposicin a condiciones severas de invierno y la
liberacin de nuevo en verano, se postula para sembrar el ocano global con
psicrfilos anualmente y citas en l.
La actividad continuada durante el invierno garantizara un proceso de seleccin
positivo para la adaptacin al fro, en lugar de una accin destructiva contra los
organismos intolerantes a la congelacin.
De hecho, el lmite de temperatura ms bajo para la actividad metablica (en
contraposicin a la vida preservada) se busca en varias formas de hielo,
particularmente formas de agua dulce.
Las consideraciones tericas de las matrices glaciales profundas y del hielo del
lago implican recursos energticos adecuados para las bacterias y espacio para
su movimiento en las venas entre los cristales de hielo que permanecen llenos de
lquido a las temperaturas in situ relevantes para estos ambientes (hasta -5 C).
Los experimentos de incubacin utilizando timidina tritiada y leucina con muestras
de hielo de nieve antrtica, que experimentan temperaturas atmosfricas ms
fras, han indicado actividad metablica a -17 C. Otras investigaciones con
muestras congeladas de tundra siberiana, primero en suspensin (ligeramente
calentada) para enmendar con acetato, han empujado el lmite inferior para la
actividad detectable a -20 C.
Hasta hace poco tiempo, el inters en el hielo marino como medio natural para
explorar los lmites de temperatura ms bajos para la actividad microbiana ha sido
limitado por comparacin. Sin embargo, los investigadores estn desarrollando
nuevos mtodos microscpicos para examinar las bacterias directamente dentro
de la matriz del hielo marino invernal (sin fundir) por primera vez, documentar la
actividad respiratoria y presumiblemente una maquinaria competente para la
sntesis de protenas (reflejada por el fluorescente in situ Hibridacin, mtodo para
cuantificar la diversidad microbiana) a -20 C, y descubrir nuevos medios de
crioproteccin en forma de altas concentraciones de sustancias exopolmeras.
Tambin es evidente, sin embargo, la ausencia de una necesidad de compuestos
anticongelantes especficos cuando el espacio habitable dentro del hielo se limita
al tamao de la propia bacteria. En ese punto, el comportamiento de ordenamiento
conocido, la carga superficial y la polaridad de las molculas de agua en el
espacio confinado solo pueden explicar la persistencia de la fase lquida.

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La inevitable presencia de algn lquido incluso dentro de las ms fras

formaciones de hielo naturales promete ms sorpresas con respecto al lmite de
temperatura ms bajo para la vida microbiana y los mecanismos que lo soportan.
Eutectophiles: la vida en el cambio de fase de agua a hielo
El campo recientemente definido de la astrobiologa ha estimulado a muchos
investigadores a pensar en nuevas maneras sobre los lmites posibles de la vida.
En lugar de restringir la teora y los experimentos a la naturaleza de los hbitats
existentes en la Tierra, las condiciones ambientales ms extremas en otros
lugares estn bajo consideracin.
Un extremo inevitable en la bsqueda de vida en otro lugar es el de una
temperatura muy fra. Incluso las formas ms fras de hielo retienen el agua lquida
dentro de sus matrices, entre los cristales de hielo individuales, mojando cada
superficie cristalina. Las formas de hielo ms fras hasta ahora examinadas (hielo
marino a -20 C) contienen bacterias vivas dentro de esta fase lquida del hielo.
Las formas de hielo que no se encuentran en la Tierra, como el hielo VI, pero que
se pueden crear en el laboratorio bajo presiones enormemente altas (y
sorprendentemente temperaturas clidas) se observan ahora para apoyar
bacterias vivas tan comunes como E. coli. Para el caso de la vida en hielo-VI (en
el cual la fase slida del agua es ms pesada que la fase lquida), como en el caso
del hielo terrestre, los microorganismos se observan microscpicamente al La
interfaz entre el cristal y el lquido.
Esta interfaz eutctica entre las fases slida y lquida del agua es cualquier cosa
menos una zona muerta y bien puede ser un crisol bioqumico para la vida.
Recientemente se ha demostrado que la congelacin mejora la estereoseleccin
(amplificacin del enantimero L) en el caso de la co-oligomerizacin de L- y DL-
leucina, as como aumenta la velocidad o el rendimiento de otras reacciones
biomoleculares. Las fases eutcticas de hielo -la matriz de hielo con su
concentracin de solutos en los espacios entre cristales de hielo- se han utilizado
con xito como medio de reaccin para sintetizar oligonucletidos de forma no
enzimtica. Se propone una nueva terminologa para los organismos que
aprovechan esta interfaz crtica entre las fases slida y lquida del agua: se
propone "eutectofilo". El trmino es inusual en que no clasifica artificialmente a un
organismo por un solo parmetro, pero es ms realista, por cualquier combinacin
conocida y an no examinada de temperatura, presin y soluto Concentraciones
que proporcionan un hbitat donde tanto las fases slida y lquida del agua, como
las reacciones qumicas y biomoleculares que se producen en ese espacio, estn
disponibles para el organismo para la continuacin de sus procesos de vida.
Conclusiones
El aumento constante de las caracterizaciones de enzimas, otras protenas y
constituyentes de la membrana y los mecanismos reguladores genticos que

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permiten que un organismo viva en el fro ha prestado peso a los principios ya

establecidos, si es tentativo, para la adaptacin al fro. Estos principios,
especialmente el favorecimiento de residuos de aminocidos especficos que
imparten flexibilidad al dominio activo de una molcula de enzima, se hacen
avanzar por la disponibilidad de la primera secuencia de genoma completo para
una bacteria obligatoriamente psicrfila, C. psychrerythraea cepa 34H. La
capacidad de buscar otros constituyentes y caractersticas celulares,
especialmente protenas no catalticas y pigmentos para sobrevivir a los choques
de fro, sal y presin, parece particularmente prometedora.
El aumento de la aplicacin de las tcnicas moleculares basadas en los genes
16S rRNA a los ambientes de aguas profundas polares y fros ha dado como
resultado una base de datos sustantiva sobre la diversidad de Bacterias y Archaea
y subgrupos dentro de cada dominio que habitan aguas muy fras, sedimentos y
hielo. La respuesta a la cuestin central de la diversidad microbiana a bajas
temperaturas se ha movido con bastante rapidez de "no dirigido" a "relativamente
limitado" a "diverso".
El enfoque especial en los ambientes naturales congelados ha producido nuevos
mtodos para examinar microorganismos no perturbados en sus hbitats nativos
congelados y nuevas formas de pensar sobre los lmites de la vida microbiana.
El sorprendente concepto de formacin de hielo a altas temperaturas de la Tierra y
el apoyo de termfilos ahora parece estar dentro del campo de las posibilidades.
El nuevo campo de la astrobiologa, por lo tanto, ha requerido avanzar la
terminologa ms all de los psicrfilos y otras clasificaciones de un nico
parmetro a los eutectofilo, reconociendo la interfaz crtica entre el agua slida y
lquida, dondequiera que se forme, para la vida microbiolgica.

Referencia Bibliogrfica.

Deming J. W. (2002). Psychrophiles and polar regions. Curr Opin Microbiol. Vol. 3.

301-309.

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