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Ruta del cido shikmico

La ruta del cido shikmico es un conjunto de reacciones metablicas de gran relevancia en


la biosntesis de metabolitos secundarios. El cido shikmico es precursor de diversos
intermediarios metablicos aromticos, tales como los taninos, el cloranfenicol, el cido 4-
aminobenzoico, los fenilpropanoides, los lignanos, los aminocidos aromticos
(tirosina, fenilalanina y triptfano), as como sus derivados: glucsidos
cianognicos aromticos, aminas bigenas aromticas, catecolaminas, betalanas, melaninas,
bisindoles, los flavonoides, las fenazinas y diversos alcaloides tales como
los tetrahidroisoquinolnicos, los alcaloides del ergot y los morfinanos, entre otros. El
intermediario principal es el cido shikmico, un compuesto originalmente aislado de plantas
del gnero Illicium. En compuestos aromticos derivados del cido shikmico, las posiciones
oxigenadas son de tipo catecol (orto) o pirogalol (diorto), y en el caso de los fenoles
monooxigenados son generalmente p-hidroxi-compuestos.1 2 3
Esta ruta es empleada por bacterias, algas, plantas y algunos hongos pero no
por animales y protozoarios. Sin embargo, los tres aminocidos aromticos
son esenciales para la vida.4

Principales rutas[editar]
Ruta del 3-deshidroquinato[editar]
El cido shikmico se biosintetiza originalmente del fosfoenol piruvato y la eritrosa 4-
fosfato para formar el precursor denominado cido 3-deshidroqunico. ste cido puede
formar varios metabolitos, como el cido glico, el cido protocatecuico, el cido qunico y
el cido shikmico:5
Ruta de biosntesis del cido shikmico y otros precursores

El cido glico es precursor de los denominados taninos hidrolizables


(Galotaninos y Elagitaninos)6 7

El cido qunico es precursor de varios metabolitos secundarios, como el cido


clorognico.
El cido protocatecuico es un antimicrobial presente en muchas plantas.
Ruta del 4-heterociclico[editar]
El acido ciclico es el que une los puentes de hidrogeno, por esto Lo que cada
puente O corte de Ribosoma requiere Esto significa que No se pueden editar cada
sistema Aminoacidrico.
Ruta del corismato[editar]
El cido shikmico puede producir por una va enzimtica de 3 pasos uno de los
metabolitos intermedios ms importantes de la ruta del cido shikmico, el cido corsmico:

Biosntesis del cido corsmico


En esta ruta se llevan a cabo 3 reacciones:

Fosforilacin del shikimato, en donde se forma el cido 3-fosfoshikmico por accin


de la shikimato quinasa y ATP;

Conjugacin con una molcula de fosfoenol piruvato por accin de la 3-


fosfoshikimato 1-carboxiviniltransferasa, en donde se forma el cido 5-
enolpiruvilshikmico 3-P (EPSP)

Eliminacin del fosfato catalizada por la corismato sintasa.


El cido corsmico puede producir metabolitos de gran diversidad qumica:
Rutas del cido corsmico.

El cido 4-hidroxibenzoico es un compuesto encontrado en muchas plantas. Es


precursor de las ubiquinonas.

El cido antranlico es precursor del triptfano, las quinolonas, las acridonas y


algunos polictidos que utilizan al antranilato como unidad de iniciacin.
El cido 4-aminobenzoico, el cual es requerido en la biosntesis del cido flico.

El cido isocorsmico, precursor del cido saliclico y el cido 2,3-


dihidroxibenzoico, componente de la enterobactina.

El cido prefnico, precursor de los aminocidos fenilalanina y tirosina.


Ruta del prefenato: Biosntesis de los aminocidos
aromticos[editar]
Las rutas de los aminocidos aromticos L-fenilalanina y L-tirosina a partir del
cido prefnico pueden variar de acuerdo al organismo, y en muchos casos
puede operar ms de una ruta en una especie. En esencia, tres tipos de reaccin
estn implicadas: Transaminacin, aromatizacin descarboxilativa e
hidroxilaciones, pero lo que cambia en los organismos es el orden en el que se
llevan a cabo. As, en algunos organismos se pueden producir tanto sustratos del
cido arognico como del prefnico. Muchas bacterias y plantas tienden a
sintetizar la fenilalanina y la tirosina por separado.
Rutas del cido prefnico
Los animales, en cambio, carecen de la ruta del cido shikmico, por lo que la
fenilalanina resulta esencial, no as la tirosina, la cual se puede obtener por
la para-hidroxilacin de la fenilalanina:

Biosntesis de la L-Tirosina a partir de la L-Fenilalanina.

Ruta de los fenilpropanoides[editar]


La L-fenilalanina y la L-tirosina son bloques de construccin para una amplia
gama de metabolitos secundarios: los fenilpropanoides (Compuestos tipo C6C3).
En plantas, el primer paso es la eliminacin del nitrgeno de la fenilalanina en
forma de amoniaco para generar el cido trans-cinmico (En el caso de la tirosina
se forma cido p-coumrico) Todas las plantas pueden desaminar fenilalanina por
medio de la fenilalanina amoniaco liasa (PAL), pero la desaminacin de tirosina
parece ser ms restringida a miembros de la familia Poaceae. La tirosina
amoniaco liasa (TAL) ha sido encontrada en plantas y bacterias. Aquellos
organismos que no pueden desaminar la tirosina obtienen el cido p-coumrico
por hidroxilacin del cido cinmico.

Ruta de los fenilpropanoides

Rutas de los arilpiruvatos[editar]


Los productos de transaminacin de aminocidos aromticos son el cido
fenilpirvico y el cido p-hidroxifenilpirvico, los cuales pueden ser
interconvertibles en algunos organismos via prefenato. El cido fenilpirvico
puede reducirse para formar cido 3-fenil lctico, el cual puede transformarse por
transposicin en cido trpico, componente de la hiosciamina. El cido
fenilpirvico puede dimerizarse por medio de una condensacin aldlica doble
para formar cido poliprico, el cual es precursor de varios terfenilos, por
ejemplo atromentina, volucrisporina, leucomelona, muscafurina, cido
telefrico y xileritrina. El cido poliprico puede escindirse oxidativamente para
formar cido pulvnico y sus derivados.
El cido 4-hidroxifenilpirvico es precursor de la 4-hidroxifenilglicina, aminocido
componente de pptidos no ribosomales, como en el caso de la vancomicina.
El cido homogentsico es un catabolito de la tirosina. Tambin es precursor en la
biosntesis de las plastoquinonas.
Ruta de los arilpiruvatos

Rutas de la DOPA[editar]
La 3,4-dihidroxifenilalanina (DOPA) es un precursor relevante en el metabolismo
de la tirosina y la fenilalanina. Se produce por la hidroxilacin de la tirosina y
produce varios metabolitos secundarios tales como las melaninas,8 las
catecolaminas,9 las betalanas,10 las higroaurinas,11 los alcaloides
tetrahidroisoquinolnicos12 y otros alcaloides.
Rutas de la DOPA

Glucsidos cianognicos y glucosinolatos de aminocidos


aromticos[editar]
Los aminocidos aromticos pueden formar glucsidos
cianognicos y glucosinolatos. Ambos siguen las mismas rutas generales para
ambos tipos de compuestos, en donde la formacin de la aldoxima es el
metabolito intermediario que puede formar el glucsido cianognico o el
glucosinolato, dependiendo de la especie. A continuacin se ilustra como ejemplo
la biosntesis de los derivados de la tirosina, durrina y sinalbina.
La mirosinasa hidroliza de manera general a todos los glucosinolatos cuando la
planta presenta un dao fsico.13 14
Biosntesis del glucsido cianognico y del glucosinolato de la tirosina (durrina y sinalbina)

Rutas del cido antranlico[editar]


Acridinas y quinolinas[editar]
El cido antranlico es precursor de varios metabolitos secundarios por
condensacin o conjugacin con molculas provenientes de otras rutas.

Cuando el cido antranlico se esterifica con una molcula de coenzima A,


puede participar como unidad de iniciacin en la formacin de
un polictido mixto con 2 unidades. Mediante los mismos mecanismos de los
polictidos se pueden formar sistemas aromticos policclicos fusionados,
tales como los alcaloides quinolnicoss. La prenilacin con pirofosfato de
dimetilalilo (DMAPP) puede generar alcaloides con esqueleto de furo[2,3-
b]quinolina. La N-metilantraniloil-Coenzima A puede formar un trictido, el cual
es precursor de los alcaloides acridnicos, tales como la rutacridona,
la acronicina y la melicopicina.

La antraniloil coenzima A puede condensarse en una reaccin tipo


Mannich con el catin pirrolinio (derivado de la ornitina) para producir
alcaloides del tipo 1,2,3,9-tetrahidropirrolo[2,1-b]quinazolina, por ejemplo
la peganina. Se ha homologado esta ruta con otras quinazolinas, tales como
la febrifuguina.

Metabolitos del antranilato

Indol y triptfano[editar]
El indol es biosintetizado a partir de cido antranlico y pirofosfato de 5-fosfato-
1-ribosilo. Se forma el fosfato de 3-indolilglicerol como intermediario, el cual
elimina una molcula de alanina para formar indol ligado a la enzima (No se
encuentra libre). Este indol realiza una SEA con una molcula de serina para
formar el triptfano. Este aminocido puede seguir las siguientes rutas: 15
Descarboxilacin: El producto de descarboxilacin del triptfano es
la triptamina, la cual puede seguir varios caminos:
- Alquilaciones: La triptamina puede alquilarse o hidroxilarse, formando as
los alcaloides indoliletil amnicos o triptaminas. Un ejemplo clsico es
la psilocibina aislada de los hongos alucingenos Psilocybe.
- Ciclizacin por radicales libres: Se forman alcaloides pirroloindolicos, tales como
la fisostigmina.
- Reaccin de Mannich: La amina forma primero una imina con un carbonilo. La base
de Schiff formada reacciona con el anillo aromtico en una reaccin tipo Mannich para
dar una heterociclizacin que forma alcaloides -carbolnicos. Los compuestos
carbonlicos ms comunes son el cido pirvico, el cual forma 1-metil -carbolinas
(como la harmina) o la secologanina (V. ms adelante).
- Transaminacin: Esta ruta puede formar auxinas o escatol.

Transaminacin: El producto es el cido 3-indolilpirvico. Este


intermediario es una alternativa para formar auxinas.

Eliminacin de piruvato: A partir de la triptofanasa, el triptfano elimina


piruvato para producir indol libre. Este indol se puede hidroxilar para
formar indoxilo. Este intermediario puede formar el glucsido indicano,
pigmentos bisindlicos (como el colorante ndigo o la prpura de Tiro)
o isatinas (Via N-acetil isatina.

5-Hidroxilacin: Se forma el intermediario 5-hidroxitriptfano. Este


compuesto es precursor de aminas biolgicamente activas, tales como
la serotonina y la melatonina.

Prenilacin: La SEA de una unidad de pirofosfato de dimetilalilo forma el


intermediario L-4-Dimetilalil triptfano. Este es el precursor de los
alcaloides del ergot.

Escisin oxidativa: Por una ruptura oxidativa del anillo heterocclico del
indol, se forma la quinurenina, un intermediario catablico que puede
formar cido 3-hidroxiantranlico, el cual puede
formar isofenoxazinas y cido nicotnico. Otro producto posible es el cido
5-(2'carboxietil)-4,6-dihidroxipicolnico.
El triptfano tambin puede formar glucosinolatos, por ejemplo,
la glucobrasicina (V. Biosntesis de glucosinolatos)
Glucobrasicina, glucosinolato del tripfano
Existen otros compuestos que proceden del triptfano o el cido
antranlico cuyas biosntesis se revisarn en sus artculos
correspondientes, tales como la camalexina, brassilexina,
la estaurosporina, la piocianina, la violacena, las benzoxazinas,
las criptolepinas, la luciferina.

Catabolismo de los derivados del cido


shikmico16 [editar]
Degradacin de fenilalanina y tirosina[editar]
Se ha encontrado que los seres vivos pueden catabolizar la tirosina,
la fenilalanina y los fenilpropanoides. La L-fenilalanina puede
degradarse por descarboxilacin (con catlisis de la Descarboxilasa
de los aminocidos aromticos, EC 4.1.1.28) para
producir feniletilamina, o por transaminacin para dar el cido
fenilpirvico.
La fenetilamina puede transaminarse para dar el fenilacetaldehdo.
Este compuesto se oxida a cido fenilactico por accin de
una aldehdo deshidrogenasa (EC 1.2.1.5). Posteriormente
una monooxigenasa hidroxila el anillo aromtico en posicin meta.
Una vez ms, se puede hidroxilar por la accin otra monooxigenasa
en la posicin 4. El producto intermediario es el cido
homoprotocatecuico. El cido fenilactico se puede esterificar con
la Coenzima A.
Por otro lado, el cido fenilpirvico sufre una descarboxilacin
oxidativa para formar fenilacetaldehdo, el cual se puede incorporar a
la ruta anteriormente descrita.
De modo anlogo, la tirosina puede descarboxilarse o transaminarse,
como se indic en el inciso anterior. El producto de transaminacin
(cido p-hidroxifenilpirvico) puede ser epoxidado en la posicin 1,2
con transposicin para dar el cido homogentsico. Si el producto de
transaminacin se descarboxila con oxidacin, se forma el 4-
hidroxifenilacetaldehdo. El producto de descarboxilacin de la
tirosina (la tiramina) al transaminarse forma tambin el 4-
hidroxifenilacetaldehdo. Este compuesto se oxida a su
correspondiente cido carboxlico, el cual se puede oxigenar por
accin de la 4-hidroxifenilacetato 1-monooxigenasa (EC 1.14.13.18).
El producto por accin de esta enzima produce tambin cido
homogentsico. Otra ruta que puede tomar el cido 4-
hidroxifenilactico es oxigenarse por accin de otra enzima, la 4-
hidroxifenilacetato-3-monooxigenasa de cadena larga (EC 1.14.14.9).
El producto de esta reaccin es el cido homoprotocatecuico.
La degradacin de los aminocidos tirosina y fenilalanina puede
producir, dependiendo el organismo, 3 compuestos intermediarios:

cido homogentsico

cido homoprotocatecuico

Fenilacetil Coenzima A
Cada uno de estos intermediarios tiene distintas formas de
catabolizarse, lo cual deja ver la gran diversidad metablica que
existe en los seres vivos para el aprovechamiento energtico de
varios compuestos aromticos.
Degradacin preliminar de la tirosina y la fenilalanina: Los tres
principales catabolitos son el cido homoprotocatecuico, el cido
homogentsico y fenilacetil Coenzima A
La degradacin del cido homoprotocatecuico procede por los
siguientes pasos:
Escisin oxidativa del anillo aromtico en presencia de oxgeno y NADPH por
accin de la 3,4-dihidroxifenilacetato 2,3-dioxigenasa (EC 1.13.11.15). El producto
es el semialdehdo del cido 2-hidroxi-5-carboximetilmucnico.

Oxidacin del semialdehdo al cido carboxlico por accin de la 5-carboximetil-2-


hidroximucnico-semialdehdo deshidrogenasa (EC 1.2.1.60). Una enzima
diferente que realiza la misma reaccin en organismos distintos es la 2-hidroxi-4-
carboximuconato semialdehdo hemiacetal deshidrogenasa (EC:1.1.1.312)

Tautomera ceto con mettesis de doble ligadura, catalizada por la 5-carboximetil-


2-hidroximuconato isomerasa (EC 5.3.3.10 HpaF).

Descarboxilacin catalizada por la 5-oxopent-3-eno-1,2,5-tricarboxylato


decarboxilasa (EC 4.1.1.68). El producto es el cido 2-hidroxihepta-2,4-
dienodioico.

Tautomera ceto con mettesis de doble ligadura, catalizada por la 2-


hidroximuconato isomerasa (EC 4.1.1.68 HpaG).

Hidratacin del alqueno catalizada por una hidratasa (HpaH).

Condensacin aldlica inversa, para producir cido pirvico y semialdehdo


succnico. Esta reaccin es catalizada por una aldolasa (HpaI)

Degradacin del cido homoprotocatecuico


La fenilacetil-Coenzima A puede degradarse por dos vas:
1- Va benzoato: la fenilacetil-Coenzima A se oxida en posicin benclica para formar
fenilglioxil-Coenzima A (Con participacin de la fenilacetil-CoA deshidrogenasa, EC
1.17.5.1 y una quinona). El ster de la coenzima A se hidroliza (La enzima es la
fenilacetil-CoA hidrolasa, EC 3.1.2.25) y se descarboxila con oxidacin por accin de la
fenilglioxilato deshidrogenasa (EC 1.2.1.58).
2- Via 3-oxoadipil-CoA: Ocurren 7 reacciones, todas catalizadas por enzimas:
epoxidacin del anillo aromtico en la posicin 1,2 (1,2-fenilacetil-CoA epoxidasa de
anillo, subunidad PaaA); expansin de anillo por una reaccin electrocclica inversa (2-
(1,2-epoxi-1,2-dihidrofenil)acetil-CoA isomerasa; EC 5.3.3.18); hidrlisis de la oxepina
(Sistema oxepina-CoA hidrolasa / 3-oxo-5,6-deshidrosuberil-CoA semialdehdo
deshidrogenasa;EC:3.7.1.16 y EC 1.17.1.7); condensacin de Claisen inversa (acetil-
CoA acetiltransferasa); hidratacin del alqueno (enoil-CoA hidratasa EC:4.2.1.17) y
oxidacin del alcohol (3-hidroxibutiril-CoA deshidrogenasa EC 1.1.1.157). Los
catabolitos formados son acetil coenzima A y 3-oxoadipil-Coenzima A (Este
intermediario puede formar acetil couenzima A y butiril-Coenzima A).

Degradacin de la fenilacetil Coenzima A


La degradacin del cido homogentsico tiene dos
posibles rutas:
Va a) Por descarboxilacin del cido homogentsico. Se produce primero
gentisaldehdo, el cual se oxida a su cido correspondiente, el cido
gentsico (Enzima: aril-aldehdo deshidrogenasa, EC 1.2.1.29). El cido m-saliclico (el
cual se forma durante la degradacin del benzoato) puede hidroxilarse para formar
cido gentsico. El cido gentsico puede descarboxilarse (Gentisato
descarboxilasa EC 4.1.1.62) para formar dihidroquinona (El cual se degrada de
acuerdo a lo mostrado ms adelante en la degradacin del cido benzoico) o puede
sufrir escisin oxidativa del anillo aromtico (Gentisato 1,2-dioxigenasa, EC 1.13.11.4)
para formar el cido 3-maleilpirvico. ste se isomeriza a su
forma trans (Maleilpiruvato isomerasa, EC 5.2.1.4), el cido 3-fumarilpirvico. Por
medio de una condensacin de Claisen inversa (acilpiruvato hidrolasa EC 3.7.1.5) se
obtienen cido fumrico y cido pirvico.
Va b) El cido homogentsico sufre directamente la escisin oxidativa (Enzima:
homogentisato 1,2-dioxigenasa EC 1.13.11.5) para formar cido 4-maleilacetoactico,
se isomeriza a la forma trans (maleilacetoacetato isomerasa EC 5.2.1.2) y sufre una
condensacin de Claisen inversa para formar cido acetoactico y cido
fumrico (fumarilacetoacetasa EC 3.7.1.2).
Catabolismo del cido homogentsico

Degradacin del cido


benzoico[editar]
El cido benzoico es un metabolito de
degradacin de compuestos aromticos en
plantas y bacterias17 . Este compuesto es
un xenobitico que puede resultar txico
para animales y hongos, por lo que los seres
vivos han desarrollado distintas rutas
complejas para la degradacin del cido
benzoico o sus sales. El esquema general es
la hidroxilacin del cido benzoico (la cual se
puede efectuar en distintas posiciones) para
dar intermediarios que pueden escindirse
oxidativamente para dar derivados del cido
mucnico. Estos compuestos pueden
seguirse oxidando para producir molculas
que pueden incorporarse en el ciclo de cido
ctrico:18
Degradacin del cido benzoico
Muchos mamferos herbvoros eliminan el
cido benzoico por la formacin del cido
hiprico. La benzoil Coenzima A puede
funcionar como unidad de iniciacin en
la ruta de los polictidos.

Degradacin de la benzoil Coenzima A

Degradacin de
fenilpropanoides[editar]
Ruta de degradacin de fenilpropanoides

Referencias[editar]
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