Bioqumica 1.

Tema 1.

Objetivos:

Comprender la existencia de la base de la bioqumica comn para entender la

vida y relacionarla con la lgica molecular.

Importancia del s enzimas y rutas metablicas.

Importancia de la bioqumica como ciencia que se interconecta con otra ciencia

(en el desarrollo y progreso de la biomedicina).

Esta es la base de otras materias.

Esta se sirve del estudio de la biologa y qumica del organismo vivo,

especficamente conociendo las propiedades de este organismo vivo.

Un organismo vivo es aquel que tiene:

Replicarsereproducirse (dependiendo de la complejidad ser asexual o

sexual).
Catlisis capacidad de reaccin (PJ: reacciones qumica de degradacin
que estn conectadas a otras reacciones de sntesis).

Pero claro las enzimas que dirigen estas reacciones son llamadas catalizadores.

Las reacciones de interaccin entre las molculas dentro de las clulas tienen
que estar comandadas por una molcula que promueva ese metabolismo.

Mutar es un cambio en la secuencia del genomas, que puede darse por

mutacin puntal o por seleccin duplicacin, traslocacin.

Que va traducirse en una funcin.

Bioqumica estudia, las estructuras qumicas, su metabolismo y la

regulacin de los metabolismos (esta es estricta, compleja y armnica)
dada por hormonas.

PJ: la insulina adems de permitir la entrada de glucosa a la clula tambin

promueve: la sntesis de protenas, almacenamiento de lpidos.

Hay hormonas que se sintetizan a diario que tienen un ciclo de secrecin

definido como el cortisol, que juega un papel en la regulacin de la
adrenalina, noradrenalina, etc.

Dentro de la clula hay una regulacin ms fina o delicada, si la clula tiene

el sustrato para ese metabolismo, es decir, la acumulacin de sustrato
puede promover la sntesis de la enzima que la va a sintetizar.
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La regulacin fina a nivel molecular dentro de la clula que depende de

metabolitos intra celulares y de sustratos o productos que pudieron ser
influenciados por la hormona.

Ejemplo dela insulina.

- En la sangre se lleva la glucosa

- Esa elevacin de glucosa es una seal metablica de abundancia de
sustrato.
- Esta seal entra primero a la celas beta pancreticas y dispara la
secrecin de insulina inactiva en el jugo pancrtico.
- Esta insulina va a los rganos blancos a travs de la sangre

Este nivel molecular se sirve para el estudio de muchas ciencias:

Biologa.
Gentica
Qumica orgnica: porque todos estos compuestos que estn en las
clulas, son molculas orgnicas que presentan grupos funcionales que
les permitirn interactuar con otros.
Biofsica. Porque hay interaccin molecular y fuerzas fsicas que
permiten la relacin y formacin de enlaces, la formacin de uniones
electroestticas.
Nutricin: metabolismo de lpidos y carbohidratos y protenas
Micro biologa: porque la bioqumica se ha fundamentado en el estudio
de los organismos sencillos para comparar el metabolismo de estos con
los de los ms complejos.
Biologa celular.
Fisiologa.
Fisiopatologa.
Biomedicina: ciencia que agrupa varias especialidades medicas para el
estudio de la biologa de la clula.

EL origen de la vida.

Ciertas caractersticas bioqumicas son comunes para todos los organismos. PJ:
la forma en que se codifican y expresa la informacin hereditaria, y la manera
en que las molculas biolgicas se construyen y degradan para obtener
energa.

Esto y mucho ms indican que venimos de ancestros similares.

A. El mundo prebitico.
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La atmosfera en los primeros das estaba formada por compuestos pequeos y

simples como:

H2O
N2
CO2
Monxido de carbono.
Cianuro.
Amoniaco.
H2

Y en menores cantidades:

CH4.
NH3.

Estas molculas estaban formadas por elementos de la tabla peridica que en

la actualidad forman parte de la materia viva.

La materia viva est formada por un nmero relativamente pequeo de

elemento. PJ:

C: 61.7
N: 11.0
O:9.3
H:5.7
Ca:5.0 Todos a ecepcion de K, me forman el 97 porciento del
peso seco
P: 3.3
K:1.3
S:1.0
Cl: 0.7
Na:0.7
Mg:0.3

Muchos de estos elementos Metlicos como Zinc, cobre, hierro magnesio

forman parte de las enzimas y son elementos claves en el funcionamiento
enzimtico, porque ellos a pH fisiolgico tienen cargas potentes, son pibalentes
o epibalentes, es decir son altamente reactivos y pueden romper enlaces o
formarlos lo que es necesario para la catlisis.

Tenemos elementos bsicos que son aquellos que conseguimos en mayor

cantidad en todas las biomoleculas: carbono, nitrgeno, oxgenos, el fosforo, el
azufre, Hidrogeno.
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Existen tambin otros elementos (oligoelementos) que aunque en menor

proporcin son los protagonistas de las reacciones, estos son elementos
metlicos, que estn cargados a pH fisiolgico: hierro

Estos en menor proporcin y cumpliendo funciones claves de reacciones

qumicas o formando macromolculas, que por ejemplo transportan ciertos
elementos como la hemoglobina con el hierro.

La evidencia fsil de vida ms temprana data de 3.5 millones de aos.

La radiacin ultravioleta del sol o las descargas de los relmpagos haban

causado que estas molculas inorgnicas dispersas en la atmosfera (no
exista una unin carbono con carbono) reaccionaran para formar compuestos
orgnicos simples a partir de una sntesis rudimentaria o inorgnica que no
posey un catalizador.

PJ: aA y otros compuestos importante para la bioqumica.

Otra teora sugiere que Sucedi en las fumarolas hidrotermales, que emiten
soluciones de sulfuro metlico a temperaturas de 400C, junto a los
componentes del mar.

En fin lo importante es que pudieron haber interactuado por energa elctrica o

calrica hasta formar ciertos aA simples.

Evolucin qumica.

Es un periodo que se considera, molculas orgnicas simples a partir de la

reaccin de CONDENSACION formaron otras ms complejas y generaron
polmeros

Esas primeras reacciones de condensacin se pierde (forma) una molcula de

agua y se establece un enlace, en este caso entre el grupo amino y el grupo
carboxilo que interactuaron para formar los pptidos.

Hidrolisis: adicin de agua para romper el enlace cuya tasa era menor que la
de condensacin en esas pocas.

Se cree que minerales como a arcilla pudieron haber catalizado esta reaccin
de polimerizacin.

La combinacin de diferentes grupos funcionales en una sola molcula

aumenta la versatilidad qumica de esta.

Cuando esas molculas lograron compartimentalizarce en estructuras que no

permitieran su degradacin, que permitiera la disponibilidad de sustrato y diera
el medio idneo para una reaccin qumica, se inicio la vida como tal.
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Sintesis de lpidos:

*Ac. Grasos.

*Acetil co A de la degradacin de la glucosa.

El metabolismo de los carbohidratos se realaciona con el los lpidos.

Sntesis de nucletidos.

El metabolismo de los nucletidos se relaciona con todos los dems, ya que de

este se sintetizan las enzimas necesarias para la ocurrencia de los dems
metabolismos.

Metabolismo de las vitaminas.

Tienen funciones metablicas que intervienen en la de los dems.

Grupos funcionales.

Son los que en ultima instancia determinan la actividad biolgica de la

molcula que los posee

Capacidad de reaccionar, compuesto por: carbono oxigeno hidrogeno,

nitrgeno y azufre (bsicos no hay metal as que no son oligoelementos)

Muchos de ellos tienen cargas, enlaces dobles, y eso les da cierta inestabilidad
a todos, cierta resonancia y esto le permite que el grupo este cargado y
reaccione y pasarse a al sustrato y enlazarse el sustrato con el grupo funcional,
cuando la enzima esta hagarrando al sustrato

*aminos Aminoacidos.

*Alcoholes carbohidratos.

Diolicos (azufre) aminocidos.

Eter lpidos.

Aldehidos CC

Cetonas CC

Nota recordar que los carbohidratos son aldehiods o cetonas con gran
cantidad de grupos alcoholes.
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Ac. Carboxcilicos Aa.

Ester lipidos
Tioester uniones intramoleculares
Amida Aa (es la estructura fundamental de la catalices de ciertas
enzimas).

Enzimas transaminasas metabolisadores de Aa.

Conjunto de enzimas del grupo de las transferasas, pues transfieren grupos

amino desde un metabolito a otro, generalmente aminocidos.

Disulfuro: enlaces di sulfuro de las protenas que permiten mantener su

estructura.
Fosfo Ester y Ester di fosfo presentes en las molculas energticas, en
estos enlaces se almacena energa potencial, que al romperse
promueven otras reacciones necesaria para la vida.

Es decir los grupos funcionales presentes en las biomoleculares, se encargan

de las funciones bsicas de dicha molcula.

El apareamiento especfico entre grupos funcionales complementarios permite

que un miembro del par determine la identidad y la orientacin del otro.

Esta complementariedad hace posible que las molculas se repliquen o hagan

copia de si.

Es decir la Replicacin mediante complementariedad, un polmero sirve como

molde para el ensamblaje de una molcula complementaria, que, debido a la
complementariedad intermolecular, es una copia exacta del original.

Biomoleculas.

1. Protenas.

EnzimasCatalizadores.

Estructuras celulares forman parte de las membranas en forma integral,

perifrica, etc., para que esta sea una estructura funcional, porque si solo fuera
lpido solo pasara lo soluble en lpidos

Hormonas tienen estructuras proteicas o peptidicas como la insulina, la

hormona del crecimiento.

Contrctil tanto en los msculos como en el cito esqueleto.

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2. Carbohidratos.
Reserva Energtica o mejor dicho Principal fuente energtica PJ: la
glucosa.
Sntesis de otras molculas:

Grupos sanguneos: anclados a la membrana del eritrocito estn una secuencia

de carbohidratos, esta se ha identificado como el antgeno A (7 carbohidratos)
B (8 carbohidrato) o (carecen de estos).

Antgeno molcula que genera una respuesta inmunolgica.

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3. Lpidos:
Membrana celular.

Dependiendo de la calidad del lpido esta podr o no ser ms rgida y exista

lisis celular, para poder interactuar con otras membranas.

Reserva Energtica reservamos fcil y eficiente de almacenar.

El carbohidratos tiene muchos OH, lo cuales son solubles en agua, por lo que si
hay demasiado en la clula (sto), entrara mucha agua para que exista un
equilibrio.

Lo que ya no se puede almacenar ni en las clulas hepticas ni en las

musculares, se transforma en lpido.

El cual es hidrfobo, y no hay peo en almacenarlo dentro de una clulas.

Otra gran diferencia es que mientras que los carbohidrato solo pueden ser
almacenas en los hepatocito y miocitos.

Los adiositos pueden encontrarse en diversos sitios anatmicos, es decir no

presentan una limitacin anatmica por presentar mochos nichos para
desarrollarse como los hidratos de carbono, por ejemplo:

Debajo de la piel, alrededor de los rganos.

Esto es muy importante para que a la hora de carencia de molculas que

puedan suministrarle energa a la clula, este tejido adiposo expulsa los lpidos
al torrente sanguneo donde llega al hgado y puede sintetizar para sintetizar
ATP.

Hormona:

Po r tal razn es importante el consumo de grasa saludable o de buena calidad

para su sntesis.
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PJ: Hormonas sexuales, suprarrenales.

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4. Ac. Nucleicos.
Almacenan la Informacin Gentica.
Presenta funcin Enzimtica:

Existen Molculas de ARN que son Auto catalticas, es decir puede hacer
ruptura de sus enlaces. Que se piensa que se desarrollo al principio de la
evolucin y que como las protenas que evolucionaron ha enzimas, el Ac.
Nucledo como ARN.