La heterogeneidad molecular y celular: el sello de glioblastoma

El glioblastoma es el tumor cerebral maligno primario ms comn en los

adultos y sigue auguran un mal pronstico a pesar de dcadas de
investigacin.

Incluso con la reseccin agresiva seguida de quimioterapia concomitante y la

radioterapia, hay una alta tasa de recurrencia con la mediana de supervivencia
de menos de 15 meses. De hecho, menos del 5% de los pacientes sobreviven 5
aos. Extensa investigacin de la biologa celular y molecular de glioblastoma
en la ltima dcada ha identificado varias caractersticas histopatolgicas y
cromosmicas que han mejorado el diagnstico y la estratificacin clnica sin
una mejora significativa en el resultado global. Sin embargo, un enfoque
profundizar en las caractersticas moleculares del glioblastoma ha puesto de
manifiesto que este trmino histopatolgico comprende una serie de
enfermedades, algunas de las cuales tienen historias naturales divergentes. De
hecho, cada vez es claro que exhibe glioma maligno sorprendente
heterogeneidad celular y molecular no slo entre, sino tambin dentro
glioblasromas. De hecho, un paciente con glioblastoma probable alberga varias
enfermedades diferentes dentro del mismo tumor de tal manera que cada
tumor es en realidad una constelacin compleja y dinmica de cambios
celulares y moleculares que contribuyen a la patobiologa de la enfermedad.

Heterogeneidad celular y molecular no es nica para glioblastoma y ha sido

ampliamente estudiado en varios otros tumores slidos. la secuenciacin de
prxima generacin de las subregiones y las clulas individuales, incluso
dentro de mama, pncreas, prstata y cncer renal han demostrado extensa
clonalidad regional dentro de los tumores primarios, donde slo un tercio de
mutaciones, conocidos como fundador mutaciones, se producen de manera
ubicua en todas las clulas. Sorprendentemente, incluso subclones menores de
un tumor primario pueden convertirse en clones treatmentrefractory que
dorninate la recurrencia. Este concepto de evolucin clonal se ha establecido
firmemente en la leucemia mieloide aguda, donde la secuenciacin profunda
ha revelado que subclones que representan tan slo el 5% del total de clulas
tumorales pueden sobrevivir al tratamiento, adquirir nuevas mutaciones, y
llevar a una recada. En el contexto relacionado con la enfermedad
metastsica, secuenciacin profunda de mutaciones del conductor idemtified
en estudios de genmica de meduloblastoma revel que mientras que los
clones metastsicos distintas dentro de un paciente dado son genticamente
similares, que son divergentes desde el tumor primario, lo que sugiere
enriquecimiento subclonales y / o evolucin.
Est claro a partir de estos estudios en otros tipos de cncer y un cuerpo de
forma rpida acumulacin de la literatura en el glioblastoma que una mejor
comprensin de la heterogeneidad glioblastoma tiene importantes
implicaciones no slo para la direccin de futura investigacin cientfica, sino
tambin para el diagnstico clnico y el tratamiento del paciente. Aqu, se
revisa los temas ms destacados de la heterogeneidad del tumor en los niveles
molecular y celular y poner de relieve los estudios crticos pertinentes a los
neurocirujanos y neuro-onclogos que estn impulsando nuestra creciente
comprensin de que la diversidad y heterogeneidad en los gliomas malignos
son las reglas, en lugar de las excepciones ( Tabla 1).

La heterogeneidad molecular

Clasificacin molecular: la diversidad entre los tumores en el nivel de

ARN

Los subtipos Transcriptomic. El compromiso de los bilogos del cncer para

entender la base genmica de glioblastoma ha cedido imgenes cada vez de
mayor resolucin de los tipos de alteraciones que los glioblastomas puerto.
Estos estudios han estar en el centro de la revolucin en curso en la genmica
del cncer que se est revelando los orgenes moleculares de cada tipo de
cncer y el establecimiento de una nueva taxonoma de la enfermedad basada
en lesiones genmicas compartidos y / o recurrentes. En trminos generales,
este cambio radical en la genmica del cncer ha sido posible gracias a
nuestra capacidad para llevar a cabo a nivel de perfiles de ADN del genoma de
ARN del tumor y de una manera systernatic. En el caso de glioblastoma, quizs
una de las mayores influencias en nuestra comprensin temprana de la
heterogeneidad glioma fue la aplicacin de perfiles de transcripcin de
clasificacin tumor cerebral.

Perfil transcripcional, por primera vez por Golub et al. y Alizadeh y sus colegas,
han proporcionado una poderosa evidencia que demuestra la heterogeneidad
sorprendente que existe glioblastomas arnong que surgen en los distintos
pacientes. Entre muchos, 2 estudios en particular, han proporcionado nuestra
fundacin de trabajo de los subtipos de glioblastoma definido por la estructura
transcriptmica. Phillips et al. 3 subtipos identificados proneurales-
transcripcional, mesenquimal, y proliferativa-basan en los genes expresados
que fueron ms fuertemente correlacionados con la supervivencia. Como
complemento de este trabajo, Verhaak et al. agrupacin enfoques sin
supervisin empleadas para clasificar 200 glioblastomas en 4 subtipos-
proneural, mesenquimales, clsica, y neural, como se discute ms adelante,
estos subtipos tambin albergan alteraciones del ADN distintas, haciendo
hincapi adems heterogeneidad intertumoral y vas distintas de la evolucin
del tumor, de manera importante, aunque el nmero especfico de los subtipos
definidos por estos 2 estudios difiere, las clasificaciones proneurales y
mesenquimales parecen ser el ms robusto y concordantes. En concreto, los
dos estudios identificados, la expresin de los genes proneurales como DLL3 y
OLIG2 as como la expresin de clase mesenquimales de CD40 y CHI3L1 / YKL-
40. Trabajos adicionales han intentado desarrollar ensayos de pronstico en
base a un conjunto limitado de genes que Corre! Ates con la supervivencia, que
es convincente, pero an no se ha producido conjuntos de genes
completamente solapados entre los estudios. Sin embargo, el estudio de los
programas y las firmas de expresin gnica ha sido fundamental para la
evolucin de un marco conceptual que el desarrollo del glioblastoma es
variable de un paciente a otro -i.e., el "subtipo" heuristic- y seguramente
continuar impulsando conocimientos biolgicos clave. Aunque ms all del
alcance de esta revisin, tambin ha habido una oleada de inters en el paisaje
epigentico de glioblastoma, y una mayor comprensin de estos fenotipos
epigenticos estructurales probablemente dar pistas de importancia similar en
intertumoral la heterogeneidad y la historia natural.

Clasificacin molecular: la diversidad entre los tumores en el Nivel

DNA

La expresin del ARNm hito glioblastoma perfiles de estudios han sido

complernented por estudios de perfiles de ADN igualmente cruciales. Hasta la
fecha, el genoma glioblastoma es uno de los ms ampliamente comentada
entre todos los tipos de cncer, y el extenso trabajo en esta rea ha puesto de
manifiesto muchas de las vas recurrentes que son alterados en estos tumores.
A nivel del ADN, el glioblastoma es similar a otros tipos de cncer en los que
hay ganancias y prdidas de las regiones de genes y cromosomas enteros,
incluso; estas alteraciones del nmero de copias somticas (scnas) han sido
catalogados por una serie de grupos que utilizan metodologas
computacionales sofisticados como Genmica identificacin de objetivos
significativos en Cncer (logs-) y Genmica Scan topografa. En conjunto, estos
estudios identificaron genes amplificados comnmente como EGFR, MET,
PDGFRA, MDM2, PIK3CA. CDK4, CDK6 y como deIeted comnmente genes,
incluyendo el gen CDKN2A / B, PTEN, y RB1.

Adems de aclarar las ganancias y prdidas de segmentos de ADN, un trabajo

ms reciente se ha centrado en las alteraciones en el glioblastoma a nivel de
un solo nucletido utilizando enfoques de secuenciacin. No hay duda de que
la aplicacin de secuenciacin de prxima generacin se acerca al estudio del
cncer ha alimentado un salto puntuado en nuestra comprensin del paisaje
genmico en todos los tipos de cncer. Trabajo del grupo de Vogelstein y
Genoma del Cncer Atlas (TCGA) dernonstrated en primer lugar los tipos y
frecuencias de las mutaciones observadas en el glioma, aunque utilizando
enfoques distintos.

Mientras tanto la informacin proporcionada se solapan significativamente,

Parsons et al. mutaciones recurrentes identificadas en el gen Idh1, que era un
lo nding ssmica se discutir ms adelante, mientras que el trabajo del papel
TCGA tambin proporcion una prueba de principio que muestra que
sistemtica, perfiles multiplataforma de tipos de tumores fue posible. Estos
estudios fueron un preludio a la antologa amplia, casi enciclopdico del
genoma glioblastoma publicado por el grupo de trabajo TCGA en 2013. Este
estudio, el anlisis de ms de 500 glioblastomas, inforrnation integrada de la
secuenciacin, anlisis SCNA, anlisis de transcriptmica, perfiles epigenticos.
y los estudios de reordenamiento para proporcionar una imagen impresionante
molecular de estos tumores. mutaciones recurrentes fueron identitied en genes
tales como PTEN (31%), TP53 (29%), EGFR (26%), PIK3R1 (11%), PIK3CA (11%),
y IDHl (5%). Adems, las mutaciones ProMeter TERT se identificaron en la
mayora de los tumores evaluados por secuenciacin de todo el genoma, lo que
corrobora los resultados anteriores. Tambin se han detectado mutaciones en
genes novedosos tales como LZTR, SPTA1, y TCHH.

Lo ms importante, la sistemtica de perfiles TCGA de un gran nmero de

tumores activar la integracin de alto nivel de la informacin genmica
estructural que proporciona una imagen ms granular de heterogeneidad
intertumor. Especficamente, fue posible integrar alteraciones basadas en el
ADN con subtipos de ARN-definido. Por ejemplo, los tumores proneurales a
menudo albergan mutaciones en IDHI, TP53, y ATRX y pueden exhibir el glioma
CpG fenotipo isla methylator (G-C1MP); IDH1 tumores de tipo salvaje tienden a
ser G-CIMP amplificaciones negativo y el puerto de PDGFRA / CDK4. Por el
contrario, los tumores mesenquimales son de tipo salvaje Idh1 pero albergan
mutaciones NF1. Adems, los tumores clsicos ms con frecuencia albergan
mutaciones de EGFR, incluida la supresin intragenic EGFRvlll, en el marco de
amplificacin de alta Ievel EGFR. El trabajo adicional en este esfuerzo
proporcion informacin sobre nuevos cdigos genticos y epigenticos
paisajes tambin. En su conjunto, este estudio proporciona un anlisis de alta
resolucin de la diversidad molecular observado a travs de diferentes tumores
de glioblastoma. Esta informacin se puede acceder ya sea a travs TCGA
(http://cancergenome.nih.gov) oa travs de portales independientes que
permiten una rpida adhesin de los datos en formato visual (portal del
Instituto Broad TCGA en BTTP: // www. Broadinstitute.org/tcga y el Portal del
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center en CBio http://www.cbioponal.org).
La historia Idh1: No todos los gliomas son iguales

Si hay una sola mutacin que pone de relieve la idea de que no todos los
glioblastomas son iguales, es la mutacin encontrada en el gen IDH1. IDH1
codifica isocitrato deshidrogenasa 1, una enzima citoplsmica que cataliza la
descarboxilacin oxidativa de isocitrato a a-cetoglutarato y NAD + a NADPH.
mutaciones recurrentes en Idh1 se identificaron por primera vez por Parsons et
al. en 2008 en un estudio en el que 5 de 22 tumores en conjunto
descubrimiento del estudio albergaban una nica mutacin que codifica la
protena mutante IDH1R132H, el trabajo laborioso de muchos grupos desde
entonces ha demostrado cmo irnportant la distincin entre "mutante Idh1" y
"tipo salvaje Idh1" puede ser. En los tumores cerebrales, las mutaciones son
tpicamente IDH1 R132H (90%), aunque tambin se encuentran otras
sustituciones en la posicin R132. IDH1 mutaciones se identifican en el 60%
-80% de los astrocitomas de grado II y III, oligodendrogliomas, y
oligoastrocitomas. Mientras que el 5% -6% de los glioblastomas primarios
albergan mutaciones IDH1, la mayora de los glioblastomas secundarios llevan
esta mutacin. mutaciones similares en el gen IDH2 menudo vistos en la
leucemia mieloide aguda rara vez se encuentran en el glioma. Curiosamente,
las mutaciones en los genes IDH han sido as al identied en
colangiocarcinomas y tumores cartilaginosos.

La base de todos los esfuerzos para comprender la biologa Idh1 protena

mutante es el trabajo de Dang y sus colegas. Este estudio utiliz un enfoque de
espectrometra de metabolmica chromarography lquido / masa de descubrir
que las protenas mutantes IDH1-R132H adquieren una funcin neomorphic
que conduce a la produccin de altos niveles de la enantimero "R" de 2-
hidroxiglutarato (2-HG) que nunca se ven a niveles comparables en un entorno
de tipo salvaje Idh1 y puede ser detectado mediante espectroscopia por RM.
Dado que las clulas tumorales normalmente albergan una copia de Idh1
mutacin y no muestran la prdida de heterozigosidad en ese locus, estas
mutaciones es probable ganancia de funcin en la naturaleza. esfuerzo
significativo est en marcha para comprender las bases mecanicistas del
estado mutante Idh1.

Aunque 2-HG se ha demostrado que inhibe la superfamilia a-cetoglutarato

dependiente de dioxigenasas que afectan a las histonas y la metilacin del
ADN, probablemente contribuye al fenotipo G-CIMP, y tambin altera la biologa
HIF-la, es necesario seguir trabajando para aclarar la mecnica causal base de
la biologa IDH1 mutante.