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CURSO:
BIOLOGA MOLECULAR
DOCENTE:
JULIO CESAR DELGADILLO
ARONE
INTEGRANTES:
ARROYO ALIAGA, Jessenia Jhajahira
CCOICCA CASAVERDE, Briceth Lorena
CHAMBERGO MATUTE, Ingrid Madeleyn
ESCATE CORDOVA, Andres
ORTIZ CUNZA , Kathiuska Yolanda
RAMOS MENDEZ, Heidi vanesa
VILLALON LIAN, Diana Yamila
VILLANUEVA ABANTO, Jose Wilmer
YLLISCA CHIPANA, Sonia Sofia
TURNO: MB
SEDE: LIMA
CICLO: 2016
-I
cada da ms.
en las clases que nos ense y para poder presentar este informe.
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INDICE
INTRODUCCION.............................................................................................. 4
MARCO TEORICO............................................................................................ 7
CAPITULO 1................................................................................................. 7
Epidemias de dengue.................................................................................. 7
Epidemiologa.......................................................................................... 8
El vector y modo de transmisin del virus...............................................9
Clasificacin de la infeccin...................................................................10
Genmica y factores de virulencia del virus del dengue...........................10
Virus del dengue....................................................................................... 11
Protenas estructurales y no estructurales................................................12
Protenas estructurales..........................................................................13
Protenas no estructurales.....................................................................15
Serotipos del virus..................................................................................... 19
Clasificacin de la fiebre por dengue.....................................................19
Formas clnicas del dengue....................................................................20
Fiebre por dengue.................................................................................. 21
Dengue hemorrgico (FHD)...................................................................21
Sndrome de choque por dengue (SCD).................................................22
CAPITULO 2.................................................................................................. 23
Replicacin de ARN viral........................................................................... 23
Ensamblaje, maduracin y liberacin del DENV........................................24
Protenas estructurales..........................................................................25
Protena C.................................................................................................. 25
Protena precursora de membrana (prM) y protena de membrana (M)....25
Protena de envoltura E............................................................................. 26
Protenas no estructurales.....................................................................26
La NS1....................................................................................................... 27
La NS2A..................................................................................................... 27
La NS3....................................................................................................... 27
La NS5....................................................................................................... 28
Patogenia del dengue............................................................................ 29
Linfocito T................................................................................................. 29
CAPITULO 3............................................................................................... 32
REV CUBANA MED TROP 2011;63(3):211-9...............................................32
RESUMEN............................................................................................... 40
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ARTCULO ORIGINAL.................................................................................. 41
RESUMEN............................................................................................... 50
CONCLUSIONES............................................................................................ 51
BIBLIOGRAFIA............................................................................................... 53
ANEXOS........................................................................................................ 56
Epidemiologia en Per 2016..................................................................56
Mapa de incidencia de dengue por distritos Per 2016.............................57
Tendencia de Casos de dengue segn tipo de diagnostico por semana
epidemiolgica Per 2014 2016.............................................................58
Caractersticas epidemiolgicas de las muertes por dengue en el Per,
2016 SE8................................................................................................... 59
Ciclo de virus del dengue..........................................................................60
Dengue hemorrgico................................................................................. 60
INTRODUCCION
El dengue es una enfermedad viral de gran importancia en la salud pblica. El
virus del dengue (DENV) es el agente causal de la enfermedad conocida como
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el dengue, que es la principal enfermedad viral transmitida por artrpodos en el
mundo. El DENV pertenece al serocomplejo dengue, gnero flavivirus,
perteneciente a la familia flaviviridae. Este serocomplejo est conformado por
cuatro serotipos denominados: DENV1, DENV2, DENV3, DENV4. Los cuatro
serotipos circulan peridicamente en reas endmicas e hiperendmicas y si
distincin alguna, todos causan la enfermedad. El DENV ingresa por
endocitosis y se replica en el citoplasma de la clula infectada, originando tres
protenas estructurales y siete protenas no estructurales, sobre las cuales se
conocen solo algunas de sus funciones en la replicacin viral o en la infeccin.
El DENV es transmitido por mosquitos hembra del gnero Aedes (especie
aegypti albopictus), distribuidos actualmente en todos los pases tropicales y
subtropicales del mundo, lo que permite que circulen, cada vez con menos
restricciones ecolgicas, tanto el virus como el mosquito. La circulacin del
DENV entre los humanos y mosquitos se presenta cuando el mosquito se
alimenta con la sangre de un individuo virmico. As, el mosquito, al ingerir
sangre humana infectada, favorece la infeccin de las clulas epiteliales de su
intestino; las partculas virales producidas en estas clulas, son liberadas al
hemocele y hacia algunos rganos del mosquito, como las glndulas salivales,
las cuales se convierten en rganos reservorios para el virus. La infeccin en el
ser humano se presenta cuando este mosquito infectado pica nuevamente para
alimentarse, liberando saliva y virus. La infeccin ocasionada por el virus del
dengue es considerada hoy en da una emergencia epidemiolgica, debido, por
una parte, al incremento de las reas geogrficas endmicas y, por otra, a los
cambios que se han presentado en el patrn de presentacin de la infeccin, la
cual es cada vez ms agresiva, ya que es comn la presencia de hemorragia y
choque, lo que indudablemente incrementa el riesgo de morbilidad y mortalidad
de esta infeccin.
En Per, el aumento de casos por dengue en los ltimos 7 aos ha sido
considerable.
El Equipo de Enfermedades Metaxnicas Virales Instituto Nacional de Salud
reporto que para el ao 2015 reporto los departamentos ms afectados por la
enfermedad: Tumbes que tuvo ms presencia del serotipo DENV 2, Piura con
los serotipos DENV 1 2, Lambayeque con los serotipos DENV 1 2 3 4,
La Libertad con los serotipos DENV 1 2, San Martin con los serotipos DENV 2
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-1, Ucayali con el serotipo DENV 2, Hunuco con los serotipos 1 2 3,
Amazonas con el serotipo DENV 2, Junn con los serotipos DENV 1 2,
Ancash con el serotipo 1 y Cajamarca con los serotipos DENV 1 2 3. Esta
situacin pone de relieve que en nuestro pas el dengue sigue siendo una seria
preocupacin en salud, pues los factores que agudizan el problema estn lejos
de solucionarse.
En el Per, hasta la semana epidemiolgica (SE) 8, se han notificado 6254
casos de dengue al sistema de vigilancia, lo cual es un 82% ms casos que en
el mismo periodo de 2015 (3427). Se observa una tendencia pronunciada al
aumento de casos. El 30,0 % (1877) de los casos son confirmados y el 70,0 %
(4377) corresponden a casos probables. La distribucin de los casos desde el
punto de vista clnico es: 86,3 % (5399) son casos de dengue sin signos de
alarma, 13,3 % (830) de casos de dengue con signos de alarma y 25 (0,4 %)
casos graves. Los casos proceden de 16 de los 24 departamentos. El 89,1 %
(4 245) de los casos de dengue en este ao fueron notificados por los
departamentos de Ayacucho, Piura, Madre de Dios, Junn, Lambayeque, La
Libertad, Cusco, Tumbes, Hunuco y Loreto. La incidencia acumulada a nivel
del pas es de 19,8 casos por cada 100 000 habitantes. Los departamentos de
Madre de Dios, Tumbes y Ayacucho reportan las tasas de incidencias
acumuladas ms altas. El 89,1 % (4 245) de los casos de dengue en este ao
fueron notificados por los departamentos de Ayacucho, Piura, Madre de Dios,
Junn, Lambayeque, La Libertad, Cusco, Tumbes, Hunuco y Loreto. La
incidencia acumulada a nivel del pas es de 19,8 casos por cada 100 000
habitantes. Los departamentos de Madre de Dios, Tumbes y Ayacucho reportan
las tasas de incidencias acumuladas ms altas. La distribucin del riesgo por
distritos a nivel del pas, muestra una incidencia de ms de 30 casos por cada
100 000 Hab., en los distritos de los departamentos de la costa norte,
principalmente, Tumbes, Piura, en la regin nororiental selva central y sur.
Los casos de dengue se concentran, principalmente, en el grupo etario adulto
(38,0 %) y adulto joven (26,6 %). Asimismo, aunque en orden diferente, estos
son los grupos de mayor riesgo, porque el anlisis de la incidencia muestra que
los adultos jvenes tienen el mayor riesgo (24,5 por cada 100000 hab.),
seguido de los adultos (21,0 por 100 000 Hab). El 51,5 % (3220) de los casos
son varones.
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Entre estos factores, que hacen previsible la continuidad en el aumento de la
morbilidad y mortalidad, se cuentan por ejemplo, la infestacin del mosquito en
ms de 80% del territorio, el cambio climtico y la circulacin simultanea de los
cuatro serotipos. El aumento de los ndices de presencia de mosquitos podra
deberse a la resistencia que han venido adquiriendo los vectores al insecticida
temefos, y a al poco impacto que tienen las polticas de prevencin y control del
vector en las reas endmicas y en riesgo.
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MARCO TEORICO
CAPITULO 1
Epidemias de dengue
Las primeras epidemias informadas de fiebre del dengue ocurrieron en 1779-
1780 en Asia, frica, y Amrica del Norte; la ocurrencia simultnea de
erupciones en tres continentes indica que estos virus y su vector han tenido
una distribucin mundial en los trpicos. Durante ese tiempo, la fiebre del
dengue fue considerada benigna, con intervalos largos (10-40 aos) entre las
epidemias mayores. Una pandemia global de dengue comenz en el Sudeste
de Asia despus de la Segunda Guerra Mundial. Hasta la dcada de 1960, casi
todos los brotes de la enfermedad fueron a intervalos de uno o ms decenios y
posteriormente se acortaron. La primera epidemia de dengue clsico de las
Amricas documentada en laboratorios, fue con el serotipo 3 y afect a la
cuenca del Caribe y a Venezuela en 1963-1964. Anteriormente slo se haba
aislado el virus de dengue 2 en Trinidad en 1953- 1954, en una situacin no
epidmica. En 1968-1969 en otra epidemia en varias islas del Caribe se
aislaron los serotipos 2 y 3. En la dcada de 1970, Colombia se vio afectada
por brotes de los serotipos 2 y 3, que se hicieron endmicos en el Caribe.
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se encuentran en la misma situacin en que estaban hace dos o tres dcadas
varios pases asiticos: con epidemias a repeticin cada 3-5 aos y con un
progresivo aumento del nmero de casos de FHD, particularmente en pases
de Amrica central.
Epidemiologa
Una epidemia de dengue requiere la presencia de:
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mayor circulacin viral, a su virulencia y una mayor resistencia vectorial.
(Dengue y Dengue Hemorrgico Informacin para los Mdicos. Centro para el
Control y Prevencin de las Enfermedades de los Estados Unidos, 2004)
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exista antes del inicio de la campaa continental. La dinmica de transmisin
del virus est determinada por la interaccin entre el ambiente y que estn
presentes de forma simultnea: el virus, el vector y el husped susceptible.
(Seijo A. Dengue grave: generalidades e inmunopatogenia. En: Dengue grave)
Clasificacin de la infeccin
Segn la OMS, la infeccin por el virus de Dengue puede clasificarse en:
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manejar este virus en el nivel de bioseguridad 2 (BLS-2, por sus siglas en
ingls). (Dengue, 2004; Valle RP, Falgout B. Mutagenesis of the NS3 Protease
of Dengue Virus Type 2. J Virol 1998]
Los flavivirus tienen genoma ARN de cadena positiva y envoltura. Sin embargo,
los viriones de los flavivirus son ligeramente menores que los alfavirus
(dimetro de 37 a 50mn), el ARN no tiene secuencia de poliadenilato y el virus
carece de una estructura de cpside visible en el virin. La mayora de la
flavivirus estn serolgicamente interrelacionados y los anticuerpos frente a un
virus pueden neutralizar a otro. La adhesin y penetracin de los flavivirus se
produce por endocitosis mediada por receptores; a continuacin, la envoltura
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vrica se fusiona con la membrana del endosoma tras la acidificacin de la
vescula con el fin de introducir la cpside y el genoma en el citoplasma celular.
Una vez liberados en el citoplasma, los genomas de los flavivirus se traducen
en una fase precoz y una tarda. Los dos tercios iniciales el ARN se traduce y
dan lugar a una poliprotena que posteriormente ser escindida por las
proteasas de 4 protenas precoces no estructurales (NPSA1 a 4). Cada una de
estas protenas contiene actividad de proteasa y una polimerasa de ARN
dependiente de ARN. Se sintetiza un ARN de 40S de sentido negativo de
longitud completa como molde para replicar el genoma, y se producen nuevas
molculas de ARNm de 40S en sentido positivo. Adems, a partir del molde
tambin se transcribe un ARNm de 28S, correspondiente a un tercio del
genoma. El ARN 28S codifica las protenas de la cpside (C) y de la envoltura
(E1 a E3). Ms adelante, durante el ciclo de replicacin, el ARN vrico puede
representar hasta el 90% del ARNm de la clula infectada. La abundancia de
ARNm tardo hace posible la produccin de una gran cantidad de protenas
estructurales necesarias para el empaquetamiento del virus. Las protenas
estructurales se forman como consecuencia de la escisin por una proteasa de
la poliprotena tarda sintetizada a partir del ARNm de 28S. La protena C se
traduce en primer lugar y es separada de la poliprotena. A continuacin se
elabora una secuencia sealizadora que asocia el polipptido en formacin al
retculo endoplasmtico. Se traducen las glucoprotenas de la envoltura, las
cuales son glucosiladas y separadas de la porcin restante de la poliprotena
para producir las puntas glucoproteicas E1, E2, E3. Las glucoprotenas son
procesadas por la maquinaria celular normal en el interior del retculo
endoplsmico y el aparato de Golgi y tambin se acetilan y alquilan con cidos
grasos de cadena larga. (Patrick R. Murray at el Ken S. Michael A.
MICROBIOLOGA MDICA 5ta ed. Editorial 2006 Elsevier Espaa pag. 637
644).
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procesamiento postraduccional. Los genes que codifican las tres protenas
estructurales, ncleo (C), prM (el precursor a la membrana), membrana (M), y
envoltura (E), estn localizados hacia el extremo amino terminal (5) ocupando
la cuarta parte de la capacidad codificadora del ARN viral. Hacia el extremo
carboxilo terminal (3) se encuentran los genes que codifican la informacin de
las siete protenas no estructurales NS1, NS2a, NS2b, NS3, NS4a, NS4b, NS5.
El orden de las diferentes regiones del gene en el virus es el siguiente: 5'NTR-
C-prM(M)-E-NS1-NS2A-NS2B-NS3- NS4A- NS4B-NS5-3'.NTR. La ruptura de
las uniones C-prM, prM-E, ENS1, y NS4A-NS4B es realizada por la enzima
signalasa retculo endoplsmica. (Leitmeyer KC, Vaughn DW, Watts DM, Salas
R, Villalobos I, de Chacon, Dengue virus structural differences that correlate
with pathogenesis. J Virol 1999)
Protenas estructurales
El virin maduro contiene 3 protenas estructurales: C, protena de la
nucleocpside o ncleo; M, protena asociada a la membrana y E, protena de
la envoltura. Los virus inmaduros contienen una protena conocida por prM; que
es un precursor de M. La protena C es componente bsico de la
nucleocpside, el primer polipptido viral sintetizado durante la traduccin,
tiene un peso molecular de 13.5 kd. Es rica en residuos de lisina y arginina los
que le confieren un carcter altamente bsico que permite su interaccin con el
ARN viral, con el que forma la nucleocpside como componente estructural. La
prM (22 kb) es el precursor glicosilado de la protena estructural M (8 kb). La
separacin proteoltica de este precursor por una proteasa del aparato de
Golgi, durante la maduracin viral, es lo que da origen a la formacin de la
protena M. Esta escisin parece estar ligada a la liberacin del virus, pero no
ocurre necesariamente en todas las molculas proteicas presentes en la
membrana viral, ya que en ocasiones aparece la protena M junto a la prM en el
virin maduro. Anticuerpos contra prM pudieran mediar inmunidad de tipo
protectora, quizs por la neutralizacin de los viriones liberados que contienen
prM no cortada.
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Heterodimeriza con protena E: esencial para el propio plegamiento de
E.
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Protenas no estructurales
Las siete protenas virales no estructurales (NS) fueron identificadas y se
confeccionaron mapas del ARN viral deducido por la secuencia aminoacdica.
La primera protena no estructural (NS1), es una glicoprotena de 48 kD; que
contiene 2 seales del tipo Asn -X-Ser/Thr, usada para la adicin de
carbohidratos, estos sitios parecen estar conservados en todos los flavivirus.
Puede estar en forma secretada y no secretada. Es sintetizada en el retculo
endoplsmico rugoso como una protena monomrica y en un perodo corto se
une formando un homodmero. Esta forma es ms hidrofbica y se desconoce
si el incremento de la hidrofobicidad es un resultado de la dimerizacin o
alguna modificacin postraduccional. Una vez formado este dmero, la
glicoprotena es transportada al aparato de Golgi donde sufre modificaciones y
de aqu pasa a la superficie celular, liberndose al medio extracelular. Estudios
de mutagnesis en la regin C terminal de NS1, han demostrado que esta
regin es importante en la estabilidad y la secrecin del dmero. La funcin de
la NS1 en la replicacin viral no ha sido bien dilucidada. Se ha planteado que
posee un papel en la replicacin temprana. Basada en anlisis mutacional se
ha relacionado con la morfognesis viral. A su vez, mutaciones de esta protena
afectan la virulencia de la partcula viral. Tambin se relaciona con la respuesta
inmune especfica de serotipo. La clula infectada expresa la protena en la
superficie celular, siendo diana de la citlisis inmunolgica, resultando
interesante su uso potencial en la proteccin del hombre contra la infeccin por
flavivirus. (Parrish CR, Woo WS, Wrigth PJ.Dimerization of the NS1 glyprotein,
1991)
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inducidos por esta protena son esencialmente lticos en presencia del
complemento y dan la posibilidad de retardar la infeccin viral en los tejidos.
Por el contrario, la estimulacin de las clulas T citotxicas no ha podido ser
demostrada hasta el presente. Huang y colaboradores en 1999 demostraron un
reconocimiento cercano al 45 % por anticuerpos de pacientes a un pptido
sinttico de los 15 primeros aminocidos de la protena correspondientes a una
regin inmunodominante de la NS1. Durante un estudio dinmico, se pudo
constatar que a los dos das del comienzo de los sntomas en una infeccin
secundaria, es posible detectar anticuerpos contra este pptido. (Huang JH,
Wey JJ, Sun YC, Chin C, Chien LJ, Wu YC. J Med Virol, 1999)
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Las regiones hidrofbicas menos conservadas de la poliprotena son
procesadas en al menos 4 protenas no estructurales adicionales (NS2a, NS2b,
NS4a y NS4b). Poco se conoce de las funciones de estas en el ciclo de vida de
los flavivirus. Sin embargo, se conoce que la NS2b, de 27 kD, junto con la NS3
forma un complejo esencial para el procesamiento de todos los sitios de corte
de las protenas no estructurales y las estructurales. La ltima protena
codificada es la NS5, que es la ms grande de 103 a 104 kD, bifuncional y una
de las ms conservadas en los flavivirus. Es una protena bsica y se cree que
funciona como una ARN polimerasa dependiente del ARN, aunque no se ha
verificado directamente. Esto se basa en la presencia de una regin altamente
conservada (YF NS5 666- 668) caracterstica de este tipo de enzima presente
en los virus ARN con cadena positiva. Se ha sugerido que puede estar
involucrada en la metilacin de la estructura de la caperuza 5 terminal.
(Estructura del virus y ciclo de vida, 2004)
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Determinantes antignicos. Recientemente se ha propuesto un modelo basado
en la cristalizacin de la protena E del virus de la encefalitis transmitida por
garrapata, segn el cual, esta protena presenta una estructura inusual cuando
se compara con otras protenas. Uno de los aspectos ms relevantes, es que
este modelo permite esclarecer la presentacin de diversos eptopos con
importantes funciones biolgicas. De igual forma ha permitido establecer las
bases estructurales para explicar el cambio que sufre esta protena de una
estructura dimrica a una estructura trimrica, as como la importancia de este
fenmeno para el reconocimiento de la protena por diversos anticuerpos frente
a variaciones de pH. (Rey FA, Heinz FX, Mand L, Hamson JC. The envelope
glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2 resolution. Nature, 1995)
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b) Eptopos lineares o secuenciales, independientes de la estructura
tridimensional de las protenas que presentan una especificidad de complejo
reconocimiento de la secuencia en el extremo Nterminal y en el lazo del
dominio B del virus del Dengue. (Mason PW, Zgel MU, Semproni AR, Fournier
MJ, Mason TL. The antigenic structure of Dengue type 1 virus envelope and
NS1 proteins expressed in Escherichia coli. J Gen Virol, 1990)
Grado II: Grado I + sangrando espontneo (la piel, las encas, el tracto
digestivo). Tambin corresponde a la forma benigna.
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Grado III: Grado II + fallo circulatorio y agitacin. Corresponde a la forma
severa (puede expresarse como "Dengue Hemorrgico" (DHF) o como
"Sndrome de choque Hipovolmico por Dengue (SCD) que puede ser mortal.
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Fiebre por dengue
Se presenta un cuadro clnico caracterizado por aparicin repentina de fiebre
as como la presencia de signos y sntomas no especficos, incluyendo dolor
frontal de cabeza, retroorbital, articular y muscular, nuseas, vmitos y
debilidad, erupcin en la piel, molestia a la luz, enrojecimiento de la faringe,
conjuntivitis, dolor abdominal leve, nuseas, vmito, diarrea, alteraciones del
gusto, prurito generalizado, insomnio, temor, depresin, as como bradicardia
relativa y adenopatas. (Inmunopatologa (Grupo de consenso nacional para la
prevencin y control del dengue en Venezuela). Dengue, 2004)
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Sndrome de choque por dengue (SCD)
Es la forma ms grave de dengue, necesariamente requiere tratamiento
hospitalario, ya que el sistema circulatorio del paciente se ve muy
comprometido, aparecen signos de insuficiencia circulatoria, la piel se torna
fra, a menudo hay cianosis, pulso dbil y rpido, el paciente puede presentar
letargo, inquietud y luego entra en la etapa de choque que se caracteriza por
pulso acelerado y dbil, reduccin de la presin del pulso (20 mmHg o 2,7 kPa
o inferior) o hipotensin marcada con piel fra, hmeda y agitacin. Estos
pacientes estn en peligro de muerte si no se les administra enseguida el
tratamiento adecuado. La mayora se mantienen conscientes casi hasta la
etapa final. Esta etapa es corta, el paciente puede morir de 12 a 24 h o
recuperarse con rapidez despus del tratamiento; no corregido puede llevar a
la acidosis metablica, hemorragia grave del aparato digestivo o cualquier otro
rgano con un pronstico desfavorable. Puede aparecer tambin encefalopata
por alteraciones metablicas y electrolticas. La convalescencia en el FHD con
o sin choque suele ser corta, an en casos de choque profundo. Una vez
corregido ste, los pacientes se recuperan entre 48 a 72 h. (Ortega LM.
Dengue: un problema siempre emergente. RESUMED 2001)
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CAPITULO 2
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Ensamblaje, maduracin y liberacin del DENV
Los mecanismos que promueven, regulan y coordinan el ensamblaje del virus,
no son conocidos completamente. Sin embargo, por microscopa electrnica y
criomicroscopa, se ha sugerido que el proceso de ensamblaje de las partculas
del DENV sucede en distensiones del retculo endoplsmico denominadas
membranas convolutas (convolute), donde ocurre de forma simultnea la
traduccin de la protena y el ensamblaje del virus.
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Protenas estructurales
Protena C
La protena de la cpside, tambin conocida como protena core o de cubierta,
pesa 11 kDa, aproximadamente. Su estructura secundaria consiste en cuatro
hlices alfa que cumplen diferentes funciones: las hlices 3 y 4 son
hidrofbicas y anclan la protena a la membrana del retculo endoplsmico. La
hlice 1, ubicada en el extremo N-terminal de la protena y orientada hacia el
citoplasma, posee aminocidos de carcter bsico que se asocian y unen
fuertemente al ARN genmico recin sintetizado; de esta manera, se forma el
complejo riboproteico o nucleocpside que protege al ARN viral de la
degradacin y promueve la organizacin del ARN en el interior de la partcula
viral en formacin. La nucleocpside se estabiliza por la interaccin de varios
homodmeros antiparalelos de la protena C, que rodean con gran afinidad y
especificidad a la hebra de ARN viral. La hlice 2 posee una naturaleza muy
hidrof- bica que interviene durante el ensamblaje de la ribonucleoprotena y de
la partcula viral. En el primer caso, acta como una bisagra que favorece el
acercamiento del ARN viral al resto de la protena C anclada en la membrana
del retculo endoplsmico. Por otro lado, la hlice 2 recluta pequeas gotas
lipdicas (lipid droplets), presentes en el citoplasma, que promueven la
formacin de la partcula viral. Adems, la protena de la cpside anclada en el
retculo endoplsmico interacta con las protenas precursora de membrana
(prM) y de envoltura, para favorecer y completar el ensamblaje de las partculas
virales.
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de precisar la regin del ectodominio que induce apoptosis, mediante tcnicas
de biologa molecular, estos investigadores identificaron un pptido de nueve
aminocidos que corresponde a los residuos 32 al 40 del dominio externo, que
fue llamado ApoptoM, como el responsable de inducir la muerte de las clulas.
La seal proapopttica de ApoptoM se induce solamente cuando este dominio
es transportado por la ruta secretoria de la clula y se puede inhibir cuando el
ectodominio se ancla al retculo endo plsmico o cuando se le adiciona el
pptido seal KDEL, que marca a las protenas para ser devueltas al retculo
endoplsmico. Estos resultados sugieren que el pptido ApoptoM de la protena
M podra estar involucrado en la muerte celular y el dao tisular sufrido durante
la infeccin.
Protena de envoltura E
La protena de envoltura tiene un peso molecular de 50 kDa, posee tres
dominios denominados I, II y III, y se distribuye sobre la superficie del virus,
formando complejos homodimricos de tipo cabeza-cola. Los dominios II y III
de cada uno de las protenas del homodmero son determinantes para las
interacciones entre el virus y los receptores de las clulas vulnerables. Por otra
parte, la glucoprotena E es el principal inmun- geno del virus, por lo tanto
estimula la respuesta inmune del individuo e induce la produccion de
anticuerpos neutralizadores. La importancia funcional de la protena E radica en
que es la nica protena viral que interacta con las molculas receptoras de la
membrana plasmtica de las clulas vulnerables que favorecen la endocitosis
del virus. Por lo tanto, las mutaciones y modificaciones posteriores a la
transduccin que sufre esta protena en cada ciclo de replicacin, pueden
afectar directamente la eficiencia de la replicacin, la virulencia y el tropismo
del DENV, al igual que puede regular el establecimiento y el control de la
infeccin por parte del sistema inmunitario.
Protenas no estructurales
NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B y NS5. La funcin o funciones de cada
una de las protenas no estructurales (NS, non structural proteins) del DENV se
han definido parcialmente.
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La NS1
La protena NS1 (46 kDa) forma dmeros o hexmeros asociados a balsas
lipdicas (rafts) de la membrana plasmtica. Tambin, se puede hallar soluble
en el citoplasma y en el espacio extracelular; por esta razn, la NS1 puede
estimular al sistema inmunitario. Varios autores han demostrado en el suero de
pacientes infectados con DENV o con el virus de encefalitis japonesa (JVE), la
presencia de inmunoglobulinas dirigidas contra la protena NS1. Estos sueros
se han evaluado in vitro y se ha demostrado que las Ig contra la protena NS1
de ambos virus pueden estimular la lisis mediada por el complemento y
dependiente de anticuerpos, tanto en clulas infectadas como no infectadas.
Este ltimo fenmeno podra explicar, por lo menos en parte, los daos
funcionales del endotelio, que conducen al sangrado y a la extravasacin
plasmtica, como se ha demostrado en los pacientes con diagnstico de
dengue grave.
La NS2A
Es una protena de 22 kDa, aproximadamente, que in vitro promueve el
ensamblaje y la replicacin viral. Al parecer, la NS2A coordina de un modo an
no muy bien definido, si el ARN genmico producido en cada ciclo de
replicacin se utiliza como nueva plantilla para generar las formas replicativas y
los intermediarios replicativos o si se asocia dentro de la nucleocpside durante
el ensamblaje viral. Por su parte, la protena NS2B (14 kDa) posee una regin
hidrofbica que ancla a la membrana del retculo endoplsmico el complejo
NS2B/NS3 y luego, por un procesamiento proteoltico, un pequeo dominio
hidroflico de NS2B recin liberado interacta con el dominio proteasa de la
protena NS3 para actuar como cofactor de sta.
La NS3
Es protena (70 kDa) es una protena bipartita que posee en el extremo N-
terminal un dominio proteasa similar a la tripsina (NS3pro) y en el extremo C-
terminal posee un dominio con diferentes actividades enzimticas, que acta
como trifosfatasa de nucletidos estimulada por ARN (NTPase) y como
helicasa del ARN (NS3Hel); ambas funciones son indispensables en la
replicacin viral. El dominio NS3Pro acta hidrolizando los complejos
NS2A/NS2B, NS2B/NS3, NS3/NS4A y NS4B/ NS5 del polipptido.
DENGUE Pgina 27
Como se coment anteriormente, la funcin del dominio NS3Pro depende de
su asociacin con la protena NS2B, que le confiere estabilidad du rante su
actividad proteoltica, mientras que la funcin helicasa permanece inhibida. Ms
recientemente, se encontr que la protena NS3 es la encargada de generar el
ambiente lip- dico apropiado alrededor del retculo endoplsmico, al reclutar
enzimas celulares de la va de sntesis de lpidos (Fatty Acid Synthase), lo cual
garantiza el inicio del ensamblaje.
Por otra parte, se ha sugerido que la protena NS3 puede participar durante los
procesos de ensamblaje y de transporte intracelular de los flavivirus. Esta
funcin ha sido sugerida por Patkar et al. (2008), quienes demostraron que la
mutacin W349A en el dominio helicasa de la protena NS3 del virus de la
fiebre amarilla (YFV) afecta el ensamblaje de las partculas virales sin disminuir
la capacidad de replicacin del ARN. Por otro lado, Chiou et al, (2003)
evidenciaron que la protena NS3 del JEV se precipita simultneamente con la
protena TSG101 (Tumor Susceptibility Gene 101), que hace parte del complejo
ESCRT I (Endosomal Sorting Complex Required for Transport). Este complejo
se forma en el citoplasma y participa en la generacin de los cuerpos
multivesiculados de la clula, los cuales intervienen en procesos de reciclaje y
degradacin de protenas. La protena TSG101 ha sido reportada como una de
las principales protenas celulares que promueven el ensamblaje del virus de
inmunodeficiencia humana-1 (HIV-1) y el virus del bola. La otra funcin de la
protena NS3 es actuar como helicasa (NS3Hel), desenrollando las estructuras
secundarias que se forman en el extremo 3 del ARN viral, para favorecer la
unin de la polimerasa NS5 sobre el ARN y dar inicio a la replicacin.
La NS5
Es la protena ms conservada entre todos los flavivirus. Esta protena es
multifuncional, ya que el extremo N-terminal posee actividad enzimtica de
metiltransferasa y guanidiltransferasa, responsables del capping y la metilacin
del extremo 5 del ARN genmico, mientras que, en el extremo C-terminal, se
ubica el dominio de ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRps). Por lo
tanto, la protena NS5 acta como la nica polimerasa durante la replicacin y
transcripcin virales. Aunque estos procesos suceden exclusivamente en el
citoplasma de la clula infectada, se ha identificado una seal de localizacin
DENGUE Pgina 28
nuclear en la protena NS5 que facilita su importacin al ncleo; sin embargo, la
razn y la funcin de la NS5 en el ncleo no se conocen.
Linfocito T
Los linfocitos T desempean un papel preponderante en el establecimiento y
control de la respuesta inmunitaria frente al virus. Tanto los linfocitos CD4+
como los CD8+ estimulados por diferentes citocinas, como el IFN (tipo I y II) y
el factor de necrosis tumoral alfa (TNF), se activan y secretan citocinas que
pueden tener un carcter proinflamatorio o antiinflamatorio. En resumen, esta
respuesta inmunitaria es la que normalmente se presenta en los pacientes
infectados por primera vez que logran resolver la infeccin; sin embargo, en los
pacientes que sufren una nueva infeccin con un serotipo diferente al que
caus la primera (frecuente en zonas endmicas donde circula ms de un
serotipo de DENV), ocurre un fenmeno que estimula y exacerba la respuesta
inmunitaria del paciente, lo que aumenta las probabilidades de que desarrolle
dengue grave, con manifestaciones hemorrgicas o sin ellas. El desarrollo del
dengue grave y su asociacin con las reinfecciones est bien argumentada
clnica y experimentalmente. Una de las teoras ms aceptadas y polmica, se
denomina potenciacin de la infeccin dependiente o mediada por anticuerpos,
que se presenta cuando los anticuerpos producidos y dirigidos contra el
serotipo de DENV que caus la infeccin por primera vez, reconocen y forman
complejos con el segundo serotipo de virus causante de la reinfeccin. Estos
complejos virus-anticuerpos se unen a los monocitos y macrfagos mediante
los receptores Fc, favoreciendo la penetracin del virus. Este mecanismo
incrementa la proporcin de clulas infectadas, la viremia y la capacidad de
dispersin del virus en el organismo. Esto explica por qu algunos pacientes
con dengue grave poseen ttulos virales ms altos en comparacin con los
pacientes con dengue sin signos de alarma. Adems, el fenmeno de la
potenciacin de la infeccin dependiente o mediada por anticuerpos estimula la
activacin en clulas como linfocitos y macrfagos, induciendo la liberacin de
citocinas y otros factores solubles que alteran, entre otros aspectos, la fisiologa
del tejido endotelial, lo que facilita la extravasacin y la formacin de edemas,
petequias y hemorragias.
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La evidencia clnica de la potenciacin de la infeccin dependiente o mediada
por anticuerpos est dada por los cientos de casos de dengue grave con
manifestaciones hemorrgicas que se han descrito en Tailandia, donde el
dengue es hiperendmico y la poblacin ms vulnerable a la infeccin son los
menores de 15 aos quienes han sufrido por lo menos una infeccin por DENV
(70). Por otra parte, los menores de un ao que presentan signos de dengue
grave al ser infectados por primera vez por un serotipo de DENV, desarrollan
estos signos por la presencia de anticuerpos anti-DENV transmitidos
verticalmente por sus madres. Sin embargo, la literatura tambin reporta casos
de dengue grave con manifestaciones hemorrgicas en pacientes infectados
por primera vez. Esto sugiere que el desarrollo de estas manifestaciones puede
tener otras causas adicionales, como la edad de los pacientes, el sexo y
factores genticos del individuo, como la raza y algunos polimorfismos
asociados a los genes HLA, TNF-, y CD209. Por otra parte, el serotipo y el
genotipo del virus tambin pueden estar relacionados con la gravedad de la
enfermedad. Otro mecanismo que se ha asociado al desarrollo de dengue
grave, es la lisis de las clulas endoteliales, mediada por complemento y
dependiente de anticuerpos, especialmente aquellos dirigidos contra NS1, que
reconocen un antgeno an no identificada presente en la superficie del
endotelio. Esta interaccin activa el sistema de complemento que altera la
permeabilidad vascular, induce la disfuncin del tejido y lisis de las clulas
endoteliales. Por otro lado, la gravedad de la enfermedad puede deberse a las
grandes concentraciones y a la constante permanencia de algunas de citocinas
producidas y liberadas por clulas como linfocitos, macrfagos y endoteliales,
entre otras. Como se dijo anteriormente, las clulas infectadas y las no
infectadas, responden al estmulo inducido por IFN de tipo I y II que activan
sobre stas, la proliferacin, la diferenciacin y la apoptosis. Adems, pueden
estimular la expresin de algunas molculas de adhesin y de receptores que
promueven de nuevo la expresin de citocinas y otros mediadores solubles.
Esta activacin inmunitaria constante sostiene una sealizacin que afecta a
las clulas, alterando la funcin del endotelio, de los linfocitos y de los
macrfagos. Entre los mediadores solubles que se han detectado en pacientes
infectados con DENV, se encuentran citocinas de tipo Th1 y Th2 (T helper
lymphocytes) secretadas por linfocitos CD4+ o CD8+. En pacientes con
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diagnstico de dengue sin signos de alarma, se detectan citocinas de tipo Th1
como IFN e interleucina 2 (IL-2), mientras que, en los pacientes con dengue
grave, se detectan citocinas de tipo Th2, como las IL-4, IL-6, IL-8 e IL-10.
Particularmente, la IL-8 se presenta en grandes concentraciones en el suero de
estos pacientes y, en algunos casos, este incremento se asocia con un
aumento en la permeabilidad vascular, la efusin pleural y la muerte de los
pacientes. El otro grupo de molculas que se expresa en exceso en las clulas
infectadas y no infectadas, son las molculas de adhesin como ICAM-1,
VCAM-1, E, L y P-selectina, entre otras. Estas molculas facilitan el
reconocimiento, la unin y la posterior diapdesis de clulas como los
monocitos, que atraviesan la barrera endotelial y circulan en los espacios
intersticiales. Esto permite, por un lado, la propagacin del virus a otras clulas
y tejidos, y, por otro, el paso de lquido y mediadores solubles que estimulan los
procesos inflamatorios. En resumen, esta respuesta inmunitaria es la que
normalmente se presenta en los pacientes infectados por primera vez que
logran resolver la infeccin; sin embargo, en los pacientes que sufren una
nueva infeccin con un serotipo diferente al que caus la primera (frecuente en
zonas endmicas donde circula ms de un serotipo de DENV), ocurre un
fenmeno que estimula y exacerba la respuesta inmunitaria del paciente, lo que
aumenta las probabilidades de que desarrolle dengue grave, con
manifestaciones hemorrgicas o sin ellas
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CAPITULO 3
REV CUBANA MED TROP 2011;63(3):211-9
INSTITUTO DE MEDICINA TROPICAL PEDRO KOUR
Propiedades biolgicas de cepas de virus dengue
serotipo 2 aisladas durante la epidemia en Santiago de
Cuba, 1997
Dra. C. Rosmari Rodrguez-Roche,1 MSc. Liudmila Lpez Matilla,2 Dra. C. Mayling Alvarez Vera,1 MSc.
Luis Morier
Daz,1 Dra. C. Mara G. Guzmn Tirado1
INTRODUCCIN
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RESUMEN
D urante la epidemia cubana de
dengue, ocurrida en Santiago de
Cuba, 1997, se evidenci un
incremento de la severidad en el
tiempo en trminos y la proporcin
de casos graves y muertes por
dengue hemorrgico, que pudiera
estar dado por la aparicin de
mutantes de escape a la
neutralizacin, con mayor potencial virulento. El estudiar algunas propiedades
biolgicas de cepas aisladas en diferentes momentos de la epidemia de
Santiago de Cuba en 1997, se estudiaron 9 cepas de DENV-2, donde se evalu
el efecto citopatognico y el crecimiento viral en las lneas celulares C6/36 HT y
Vero, tamao de las placas virales, sensibilidad a la temperatura,
neurovirulencia en ratones lactantes y la influencia del pH en la unin del virus
a la clula, as como en el medio de multiplicacin.Las cepas del final de la
epidemia mostraron propiedades que las diferencian de las aisladas al inicio,
entre las cuales se encuentran un mayor efecto citopatognico en clulas
C6/36 HT, ttulos virales superiores y una mayor neurovirulencia en ratones
lactantes. Por otra parte, en la unin del virus a la clula las cepas del inicio de
la epidemia resultaron favorecidas por un pH cido mientras que a las cepas
del final de la epidemia las favoreci un pH bsico. Pudiendo asi demostrarse
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que adems de los cambios genotpicos observados, existen diferencias
fenotpicas entre las cepas de distintos momentos de la epidemia, que pudieran
estar asociados con diferencias en cuanto a la adecuacin viral de estas y en
su potencial virulento.
1
Viral Vector Core and Gene Therapy, rea de Neurobiologa Celular y Molecular, Grupo
de Neurociencias, Sede de Investigacin Universitaria SIU, Facultad de Medicina,
Universidad de Antioquia. Medelln (Colombia).
2
Grupo de Medicina Molecular y de Translacin, Facultad de Medicina, Universidad de
Antioquia. Medelln (Colombia).
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Los trpicos podran ser considerados esta forma es posible anticipar las
como los laboratorios evolutivos del medidas de control y tratamiento a la
mundo, y de forma experimental hemos poblacin afectada o potencialmente
sido testigos de la rpida diversificacin vulnerable ante el ingreso de un nuevo
del virus dengue (DENV) a nivel local serotipo.
(1,2).
Desafortunadamente, el aislamiento
El dengue es una enfermedad viral viral no permite realizar un diagnstico
transmitida por artrpodos en la fase aguda de la enfermedad,
predominante en pases tropicales y debido a que requiere ms de 7 das
subtropicales, con un estimado de 50 - para la obtencin de los resultados (11-
100 millones de casos y alrededor de 25 12). Por otro lado, aunque las pruebas
000 muertes cada ao a nivel mundial serolgicas permiten obtener datos en
(3). Esta enfermedad es causada por el menor tiempo, su uso se limita a la fase
DENV, un miembro del convaleciente y depende de la
gnero Flavivirus perteneciente a la capacidad de respuesta del sistema
familia Flaviviridae, conformada por inmune del individuo y el tiempo de
virus envueltos de estructura infeccin para poder obtener ttulos
icosahdrica con genoma ARN de detectables de anticuerpos (13-14),
cadena sencilla y polaridad positiva siendo an muy difcil serotipificar el
(ssARN+) 4. DENV debido a la posibilidad de reaccin
cruzada (15).
Existen 4 serotipos de DENV
estrechamente relacionados: DENV-1, Debido principalmente a la
-2, -3 y -4, los cuales ocasionan infraestructura, equipamiento y personal
diferentes grados de severidad de la requerido para la implementacin de
enfermedad (5, 6), haciendo necesaria tcnicas moleculares, el diagnstico de
su identificacin no solo para garantizar dengue se realiza principalmente a
un tratamiento oportuno previo al inicio partir de pruebas serolgicas y
de las complicaciones de la enfermedad, aislamiento viral en cultivos celulares,
sino tambin til en los programas de tcnicas que proveen informacin
vigilancia epidemiolgica. El DENV es el cuando los pacientes ya han pasado el
agente causal del dengue clsico (DF), cuadro clnico, limitndose su relevancia
as como de las manifestaciones a la vigilancia epidemiolgica y estudios
severas: el dengue hemorrgico (DHF) y virolgicos posteriores. Existe, por lo
el sndrome de choque por dengue tanto, una necesidad urgente de
(DSS) (6), ahora consideradas dengue implementar mtodos de diagnstico
grave (7). molecular para uso temprano en la
enfermedad, conducentes a la adopcin
Teniendo en cuenta la importancia de la de medidas adecuadas para el
potenciacin dependiente de tratamiento y manejo del paciente.
anticuerpos (ADE), como resultado de
infecciones secundarias con serotipos En pases como Colombia, donde la
heterlogos (8 - 10), se hace necesario investigacin y adquisicin de nueva
mantener y reforzar los programas de tecnologa han cobrado importancia, el
vigilancia epidemiolgica que permitan uso de tcnicas moleculares se
conocer la dinmica de circulacin de los convierte en una alternativa al alcance
distintos serotipos y, por ende, la no solo para el diagnstico temprano de
historia de retos inmunolgicos de las la enfermedad sino tambin para
diferentes poblaciones que las anlisis evolutivos y epidemiolgicos
predisponen a efectos adversos ante la (1,2, 16-19), derivando en nuevas
entrada de un serotipo diferente; de estrategias de prevencin y control. Las
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tcnicas de RT- PCR y PCR convencional, Seleccin de secuencias y
si bien requieren personal capacitado y procesamiento bioinformtico
adquisicin de equipos para su
implementacin en el laboratorio clnico, Por medio del programa ClustalW (24)
son una excelente alternativa de integrado al paquete MEGA versin 3.1
deteccin y tipificacin del DENV, debido (25) se realiz el alineamiento de la
a que permiten obtener resultados en regin C-PrM/M de las secuencias del
pocas horas, siendo su sensibilidad DENV correspondientes a los cuatro
mayor al detectar pocas copias del serotipos, disponibles en la base de
genoma viral en el suero del paciente, datos GenBank
inclusive provenientes de partculas (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/
virales inactivas o unidas a anticuerpos ) (Release 155.0), para posteriormente
(20).La Organizacin Panamericana de redisear los oligonucletidos y
la Salud (PAHO/OPS) recomienda el uso mejorarlos tericamente por
de la tcnica de Lanciotti y comparacin con los obtenidos por el
colaboradores (21), o su variante de programa HintPCR versin 3.0 (26).
Harris y colaboradores (22), para la
deteccin y tipificacin del DENV en A partir del alineamiento se analizaron
toda su rea de influencia (11). El las posiciones de los oligonucletidos
funcionamiento de estos previamente reportados (21) en el
oligonucletidos ha sido avalado durante contexto de toda la variabilidad
aos; sin embargo, debido a que el presente y se verificaron diferentes
DENV est constituido por un genoma parmetros: la posicin de codn en el
de tipo ARN, con una ARN polimerasa nucletido del extremo 3' de cada
dependiente de ARN carente de oligonucletido, respecto al marco de
actividad correctora (23), la lectura de la poliprotena del DENV, la
acumulacin de cambios, y por ende, la frecuencia de cada polimorfismo en el
desactualizacin de los oligonucletidos conjunto total de secuencias analizadas,
es relativamente rpida, lo cual conlleva Tm (temperatura de melting),
un incremento en la probabilidad de estructuras secundarias y especificidad
generar resultados falsos negativos por de secuencia.
ineficiencia en la hibridacin de
oligonucletidos con las secuencias de Muestras de virus
las cepas circulantes. En vista de ello,
este estudio pretende hacer uso de las Para realizar los ensayos de
herramientas bioinformticas actuales, estandarizacin de la RT-PCR y PCR
as como de la creciente disponibilidad anidada se utilizaron cepas
de secuencias de las cepas de DENV que correspondientes a los cuatro serotipos
circulan mundialmente, para el rediseo del DENV (M1, M2, M3 y M4),
racional de los oligonucletidos previamente crecidas en clulas de
convencionalmente usados en mosquito Aedes albopictus clon C6/36
diagnstico y tipificacin del DENV (21); (27).
as como la estandarizacin y evaluacin
de los oligonucletidos sobre muestras Muestras clnicas
de ARN obtenidas a partir de
sobrenadantes de cultivos celulares Se incluyeron en el anlisis un total de
infectados y en prueba piloto sobre 15 muestras clnicas (sueros) de
sueros de pacientes con diagnstico pacientes con diagnstico presuntivo de
clnico de dengue. dengue, las cuales fueron colectadas en
el rea metropolitana del Valle de
MATERIALES Y MTODOS Aburr entre 2005 y 2007. Por otro
lado, para soportar los hallazgos en la
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tipificacin molecular de DENV a partir de ADN durante la PCR anidada. La PCR
de ARN obtenido directamente de anidada fue realizada a partir de 1 L de
sueros y ARN extrado de sobrenadantes la dilucin, utilizando los
de cultivos de C6/36 inoculados con oligonucletidos D1_Modif, TS1_Modif,
dichos sueros se realiz intento de TS2_Modif, TS3_Modif y TS4_Modif. El
aislamiento viral e inmunofluorescencia volumen final de la reaccin fue 25 L.
a cada una de las 15 muestras en Se utilizaron 2.5 L de tampn Taq DNA
clulas C6/36 con 500 L de una polimerasa 10x, 1 mM de MgCl 2, 0.4 mM
dilucin 1/10 de cada muestra en D- de cada dNTP, 10 pmoles de cada
MEM y un periodo de incubacin de 9 oligonucletido y 1.25 unidades de la
das. Finalmente, los fragmentos enzima Taq DNA polimerasa
correspondientes a muestras positivas (Fermentas). El perfil trmico fue de 2
fueron purificados y secuenciados para minutos a 94C, 40 ciclos (30 segundos
corroborar nuevamente la a 94C, 1 minuto a 55C y 30 segundos
correspondencia de los serotipos. a 72C), finalizando con una extensin a
72C durante 5 minutos.
Extraccin de ARN viral
Anlisis de los productos
El ARN viral de las cepas de DENV-1 a amplificados
-4 y de las muestras de suero de
pacientes fue extrado usando el Para la visualizacin del producto de
estuche comercial QIAamp Viral RNA amplificacin del DENV (deteccin - RT-
minikit (Qiagen), siguiendo las PCR) y los productos correspondientes a
recomendaciones del fabricante. El ARN cada uno de sus serotipos (tipificacin -
extrado fue almacenado a -20C hasta PCR anidada) se prepararon geles de
su posterior utilizacin. agarosa al 1.5% en tampn TAE,
utilizando 10 L del producto obtenido
RT-PCR y PCR anidada de la RT-PCR y/o PCR anidada y
bromuro de etidio para la visualizacin.
La RT-PCR dirigida a la regin C-PrM/M Para diferenciar las bandas obtenidas en
se llev a cabo utilizando el estuche la RT-PCR (509 pb) y PCR anidada:
QIAGEN One-Step RT-PCR kit (Qiagen) DENV-1: 487 pb; DENV-2: 122 pb;
y los oligonucletidos D1_Modif y DENV-3: 299 pb y DENV-4: 391 pb, se
D2_Modif, diseados en este estudio utiliz un marcador de peso molecular
(Tabla 1). El perfil trmico consisti en de 100 pb (Fermentas).
un paso de transcripcin reversa a 41C
por 45 minutos, un paso de activacin RESULTADOS
de la Hot Start Taq DNA polimerasa a
94C por 15 minutos, 40 ciclos (94C
por 30 segundos para desnaturalizacin,
58C por 1 minuto para la hibridacin
de oligonucletidos y 72C por 30
segundos para la extensin), seguido
por una extensin final a 72C por 5
minutos. El volumen final de la reaccin
fue de 25 L. El producto amplificado
corresponde a un fragmento de 509 pb.
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Rediseo de oligonucletidos El oligonucletido D2_Modif fue
modificado en el extremo 3', de tal
En el diseo de los oligonucletidos forma que coincidiera con la primera
D1_Modif y D2_Modif para la RT-PCR se posicin de codn.
utilizaron 795 y 910 secuencias
obtenidas del GenBank El nucletido en el extremo 3` de los
respectivamente. Para el diseo de los oligonucletidos TS1, TS3 y TS4
oligonucletidos especficos de serotipo coincidi con la tercera posicin de
se utilizaron 85, 151, 335 y 201 codn, la cual presenta una alta
secuencias para TS1_Modif, TS2_Modif, variabilidad reflejada en los
TS3_Modif y TS4_Modif alineamientos (datos no mostrados).
respectivamente. Sus versiones aqu modificadas,
TS1_Modif, TS3_Modif y TS4_Modif, por
su parte, coinciden con la primera o
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segunda posicin de codn, interferir con la
garantizando su hibridacin con una correcta
mayor probabilidad. El oligonucletido serotipificacin
TS2_Modif fue modificado, de tal modo del DENV (datos
que su nucletido en el extremo 3` no mostrados).
coincidiera con la segunda posicin de Sin embargo, al
codn, la cual presenta hacer dilucin
significativamente menor variabilidad, 1/100 del
debido a que una sustitucin a este producto de la
nivel conllevara a un cambio de RT-PCR, bajo las
aminocido con importantes condiciones
implicaciones en el fenotipo del virus. normales de
reaccin, la
Una vez se obtuvo el rediseo tcnica mejor
preliminar de los oligonucletidos
basado en la variabilidad gentica
reflejada en los alineamientos, se
procedi a la evaluacin in silico de los
mismos, teniendo en cuenta algunos
parmetros termodinmicos
importantes (energa libre, formacin de
homodmeros, heterodmeros,
estructuras secundarias y temperatura
de melting), y se mejor tericamente
el diseo por comparacin con los
candidatos hallados por medio del
paquete HintPCR versin 3.0 (26) para
la misma regin, usando siempre una
secuencia (serotipo) como blanco y las
secuencias de los otros tres serotipos
utilizadas simultneamente durante la
bsqueda para excluir candidatos
presentes en al menos una de ellas. En
la tabla 1 se muestran en detalle las
modificaciones en cada uno de los
oligonucletidos luego de todo el
proceso de optimizacin.
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cuando se eliminaron los correspondiente (figura 2b-d). Los
oligonucletidos TS2_Modif, TS3_Modif controles negativos no mostraron
y TS4_Modif, con ausencia de bandas de amplificacin.
amplificacin del serotipo
DENGUE Pgina 45
Tipificacin de DENV en muestras permitieron la tipificacin de DENV
clnicas luego de la PCR anidada,
correspondiendo a los serotipos DENV-2
De las 15 muestras con diagnstico (#26) y -3 (#13 y #27) (figura 4b).
presuntivo de dengue incluidas en la Adicionalmente, 3 muestras positivas
prueba piloto, 2 pudieron ser detectadas pudieron ser detectadas nicamente al
directamente a partir del producto de evaluar la tcnica con ARNs obtenidos a
RT-PCR (#13 y #27) (figura 4a), 3 partir de sobrenadantes de clulas
C6/36 inoculadas con los sueros, modificaciones correspondientes. La
correspondiendo a los serotipos DENV-2 presencia de una nica banda en el
(#1291 y #28) y -3 (#25) (datos no producto de la RT-PCR de muestras de
mostrados). La correcta tipificacin fue los cuatro serotipos es una clara
confirmada por inmunofluorescencia evidencia de que la especificidad se
utilizando anticuerpos especficos para mantiene a pesar de las degeneraciones
cada serotipo y mediante secuenciacin (figura 1a). El extremo 3' de los
(datos no mostrados). oligonucletidos de D1_Modif y
D2_Modif coincide con la segunda y
DISCUSIN primera posicin de codn
respectivamente, por lo cual, los
En este estudio se muestra el rediseo frecuentes cambios en la tercera
de los oligonucletidos para la deteccin posicin de codn en las diferentes
y tipificacin del DENV con el propsito cepas no alteraran su hibridacin y
de aumentar la cobertura en la amplificacin.
deteccin, de acuerdo con la variabilidad
que han acumulado las cepas durante El extremo 3' de los oligonucletidos
un periodo de ms de 15 aos. Los especficos de serotipo TS1, TS3 y TS4
oligonucletidos reportados por Lanciotti descritos previamente (21) coincide con
y colaboradores (21) actualmente son la tercera posicin de codn, mientras
recomendados por la OPS, y su que TS2 hibrida en la primera posicin
desempeo en muestras clnicas ha de codn. Aproximadamente, el 30% de
demostrado su efectividad (28, 29). los cambios en la tercera posicin de
codn son no sinnimos, cambios en la
Aunque se han desarrollado diferentes primera posicin son no sinnimos en el
tcnicas con el mismo propsito, estas 96% de los casos y en la segunda
se basan en el uso de sondas, posicin de codn los cambios son
fluorforos y equipos de PCR en tiempo siempre no sinnimos, llevando, por
real (30-38), los cuales an no estn ende, a un cambio en el aminocido
disponibles en muchos laboratorios de codificado (40).
salud pblica. Por lo tanto, tcnicas
simples como la PCR convencional Los cambios de aminocidos pueden
continuarn demostrando su utilidad, tener un efecto en las propiedades de
sobre todo en pases en desarrollo, las protenas (fenotipo) y pueden estar
donde acceder a equipos de ltima sujetos a presin selectiva, lo que
tecnologa puede ser difcil. conlleva restricciones al cambio. Aunque
la regin utilizada (C-PrM/M) se
Estudios anteriores han realizado considera conservada, es una regin
modificaciones a los oligonucletidos codificante con un comportamiento
utilizados convencionalmente (22, 30, tpico, presentando alta variabilidad en
39), logrando incluso la deteccin y sitios sinnimos como son las terceras
tipificacin en el mismo tubo de posiciones de codn. El gen de la
reaccin y disminuyendo, por ende, la cpside, as como gran parte del
probabilidad de contaminacin (22); sin genoma de DENV, est sujeto a una
embargo, se hicieron necesarias fuerte seleccin negativa (purificadora)
modificaciones adicionales que (41), reflejada en pocos cambios en la
permitieran adaptarlos a las secuencias secuencia de aminocidos, sin que esto
actualmente circulantes a nivel mundial. impida la ocurrencia de cambios
sinnimos en la secuencia de
Los oligonucletidos D1_Modif y nucletidos. Los nucletidos en
D2_Modif mostraron un buen segundas posiciones de codn (y en
desempeo luego de realizarles las menor medida en primeras posiciones)
permanecen relativamente constantes a de 10 pmoles sin llevar al lmite la
travs del tiempo, lo cual puede ser tcnica.
evidenciado en los alineamientos de
cualquier regin codificante del genoma Por otro lado, el desempeo de la
viral. tcnica en la prueba piloto, al utilizar
ARNs provenientes de sueros, es similar
Los oligonucletidos fueron modificados al obtenido en el proceso de
de tal forma que el extremo 3' estandarizacin, validando, por ende, su
coincidiera con la segunda o primera utilidad en el diagnstico de la infeccin
posicin de codn, con respecto al por el DENV. El incremento en la
marco de lectura, logrando, de este sensibilidad, al realizar la RT-PCR con
modo, disminuir la probabilidad de ARNs obtenidos a partir de
incompatibilidad con secuencias de sobrenadantes de cultivos inoculados
cepas que posean alta variabilidad, con las muestras clnicas, es acorde con
representada principalmente en la el proceso de amplificacin que pueden
tercera posicin de codn; de esta sufrir los virus presentes en la muestra
forma, el extremo 3' de los luego de su inoculacin en la lnea
oligonucletidos TS1_Modif, TS2_Modif celular permisiva C6/36. La deteccin de
y TS4_Modif corresponde a la segunda 2 serotipos (DENV-2 y -3) en muestras
posicin de codn, quedando para clnicas de una misma rea geogrfica y
TS3_Modif en la primera posicin de tiempo es de gran relevancia si se tiene
codn por razones de estabilidad del en cuenta que las infecciones
oligonucletido. secundarias con serotipos heterlogos
podran ser responsables de la mayora
Como se esperaba, las modificaciones de casos severos (8-10). Este resultado
realizadas en estos oligonucletidos no es esperado en pases hiperendmicos
alteraron su desempeo en la como Colombia, donde es frecuente la
serotipificacin del DENV, logrando cocirculacin de serotipos en gran parte
amplificar especficamente la regin de del territorio (1, 2,41 - 43).
cada serotipo sin presentar reacciones
cruzadas entre ellos que conlleven a Tericamente, el rediseo tiene en
hibridacin de alguno de los cuenta la variabilidad acumulada en los
oligonucletidos con dos o ms ltimos 15 aos y la evaluacin
serotipos (figura 2a-d). experimental demuestra su correcto
funcionamiento sobre muestras clnicas.
Debido a que el tamao esperado del En estudios posteriores, sin embargo, el
producto amplificado correspondiente a uso de cepas altamente variables
DENV-2 es de 122 pb, la optimizacin (pertenecientes a los diferentes
de la cantidad de oligonucletidos en la genotipos dentro de cada serotipo)
reaccin es un factor decisivo, ya que la permitir determinar su ventaja en la
presencia de una banda a este nivel deteccin y serotipificacin respecto a
podra ser confundida con un exceso de los oligonucletidos usados
los mismos y/o la formacin de dmeros. convencionalmente. De igual forma, se
La concentracin final de abre una nueva oportunidad para la
oligonucletidos de 0,4 M (10 pmoles) implementacin de la tcnica sobre
permiti obtener una buena muestras de mosquitos como
amplificacin de la regin C-prM/M del complemento a los programas de
DENV, facilitando la identificacin de la vigilancia entomolgica con miras a
banda correspondiente a DENV-2. La determinar las zonas de mayor prioridad
correcta deteccin y tipificacin del para las fumigaciones e instauracin de
DENV utilizando 5 pmoles de cada programas de prevencin (44).
oligonucletido garantiza la utilizacin
A pesar de las limitaciones en cuanto al un total de 157 152 casos probables de
nmero de muestras clnicas analizadas, dengue, de los cuales 9482 casos fueron
la informacin obtenida con este trabajo clasificados como dengue grave (42), de
deja ver la importancia de la evaluacin acuerdo con la nueva clasificacin de
y seguimiento constante de las tcnicas casos avalada por la OMS (7). Esta
moleculares, ms aun cuando se trata situacin, sumada a la identificacin de
de identificacin de virus ARN, cuyas al menos dos serotipos en casi todo el
rpidas tasas de evolucin pueden llevar territorio colombiano, hace necesaria la
a la disminucin de la eficiencia de intensificacin de acciones de vigilancia
dichas tcnicas diagnsticas. epidemiolgica, donde el uso de
Adicionalmente, se convierte en un herramientas moleculares de rpida
modelo del diseo e implementacin de deteccin y tipificacin sera de rpida y
tcnicas similares para cualquier otro oportuna ayuda para la puesta en
tipo de virus, principalmente con marcha de planes de contingencia,
genomas ARN. dirigidos a organizar los servicios de
salud y brindar una atencin adecuada
Para 2010, en Colombia el Sistema de al paciente con dengue.
Vigilancia Nacional (SIVIGILA) report
RESUMEN
Al modificar los oligonucletidos comnmente utilizados para la deteccin y
tipificacin del virus dengue. A partir del alineamiento de secuencias
disponibles en el GenBank para la regin C-prM/M se determin la variabilidad
gentica dentro de cada serotipo del virus dengue, lo cual permiti realizar
modificaciones a los oligonucletidos convencionalmente usados en la
tipificacin. Tales modificaciones incluyeron la adicin y eliminacin de
nucletidos en el extremo 3', teniendo en cuenta la posicin del codn, as
como la inclusin de sitios degenerados en posiciones altamente variables. Los
oligonucletidos se evaluaron en diferentes concentraciones sobre ARNs
extrados, a partir de cultivos celulares infectados y posteriormente de sueros
de pacientes con diagnstico probable de dengue. Los oligonucletidos se
amplificaron especficamente en cada serotipo del virus dengue, tanto desde
sobrenadantes de cultivo como desde muestras clnicas en prueba piloto.
Dengue hemorrgico