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El cido ribonucleico (ARN o RNA) es un cido nucleico formado por una cadena de
ribonucletidos. Est presente tanto en las clulas procariotas como en las eucariotas, y
es el nico material gentico de ciertos virus (virus ARN). El ARN celular es lineal y
monocateriana (de una sola cadena), pero en el genoma de algunos virus es de doble
hebra.1
En los organismos celulares desempea diversas funciones. Es la molcula que dirige las
etapas intermedias de la sntesis proteica; el ADN no puede actuar solo, y se vale del
ARN para transferir esta informacin vital durante la sntesis de protenas (produccin de
las protenas que necesita la clula para sus actividades y su desarrollo). Varios tipos de
ARN regulan la expresin gnica, mientras que otros tienen actividad cataltica. El ARN
es, pues, mucho ms verstil que el ADN.
2. Un grupo fosfato
1. Adenina (A)
2. Citosina (C)
3. Guanina (G)
4. Uracilo (U)
ARN ADN
Los carbonos de la ribosa se numeran de 1' a 5' en sentido horario. La base nitrogenada
se une al carbono 1'; el grupo fosfato se une al carbono 5' y al carbono 3' de la ribosa del
siguiente nucletido. El pico tiene una carga negativa a pH fisiolgico lo que confiere al
ARN carcter polianinico. Las bases pricas (adenina y guanina) pueden formar puentes
de hidrgeno con las pirimidnicas (uracilo y citosina) segn el esquema C=G y A=U.13
Adems, son posibles otras interacciones, como el apilamiento de bases14 o tetrabucles
con apareamientos G=A.13 Muchos ARN contienen adems de los nucletidos habituales,
nucletidos modificados, que se originan por transformacin de los nucletidos tpicos;
son caractersticos de los ARN de transferencia (ARNt) y el ARN ribosmico (ARNr);
tambin se encuentran nucletidos metilados en el ARN mensajero eucaritico.
Apareamiento doble
Estructura secundaria
Regin incluida
Bucle en una hlice en
donde las bases
(ciclo, loop)
no estn
apareadas
Estructura en
donde regiones
cercanas de
bases
complementaria
Bucle en
s se aparean,
horquilla
separadas por
(tallo y bucle, una regin no
hairpin loop) apareada que
permite que la
secuencia se
doble para
formar una
hlice.
Estructura en
donde hay
regiones no
Bucle interno
apareadas en
(tallo, stack) ambos lados de
la hebra. Puede
ser simtrico o
asimtrico.
Estructura en
donde hay una
Protuberanci regin no
a apareada en un
solo lado de la
hebra.
Bucle
Regin en
mltiple
donde se juntan
(helical mltiples
junction) hlices.
Variacin de
bucle en donde
slo una parte
del bucle s est
apareada. El
Pseudonudo pseudonudo
ms simple
consiste de una
regin libre del
RNA apareada
con un bucle.
Genomas de ARN
El ADN es la molcula portadora de la informacin gentica en todos los organismos
celulares, pero, al igual que el ADN, el ARN puede guardar informacin gentica. Los virus
ARN carecen por completo de ADN y su genoma est formado por ARN, el cual codifica
las protenas del virus, como las de la cpside y algunos enzimas. Dichos enzimas
realizan la replicacin del genoma vrico. Los viroides son otro tipo de patgenos que
consisten exclusivamente en una molcula de ARN que no codifica ninguna protena y
que es replicado por la maquinaria de la clula hospedadora.
DNA comparada al ARN
La DNA se define como un cido nuclico que contenga las instrucciones genticas
usadas en el revelado y funcionamiento de todos los organismos vivos sabidos. Las
molculas del ARN estn implicadas en sntesis de la protena y a veces en la transmisin
de la informacin gentica.
El azcar de Deoxyribose en la DNA es menos reactivo debido a bonos del C-H. La DNA
es estable en condiciones alcalinas. La DNA tiene ranuras ms pequeas donde la
enzima perjudicial puede asociar que hace ms duro para que la enzima ataque la DNA.
cido desoxirribonucleico
Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular,
debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucletidos, ms cortos y con unas
unidades diferentes, llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactamente del
ADN mediante un proceso denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo
celular, las molculas de ARN pueden salir al citoplasma para su utilizacin posterior. La
informacin contenida en el ARN se interpreta usando el cdigo gentico, que especifica
la secuencia de los aminocidos de las protenas, segn una correspondencia de un
triplete de nucletidos (codn) para cada aminocido. Esto es, la informacin gentica
(esencialmente: qu protenas se van a producir en cada momento del ciclo de vida de
una clula) se halla codificada en las secuencias de nucletidos del ADN y debe
traducirse para poder funcionar. Tal traduccin se realiza usando el cdigo gentico a
modo de diccionario. El diccionario "secuencia de nucletido-secuencia de aminocidos"
permite el ensamblado de largas cadenas de aminocidos (las protenas) en el citoplasma
de la clula. Por ejemplo, en el caso de la secuencia de ADN indicada antes
(ATGCTAGCATCG...), la ARN polimerasa utilizara como molde la cadena
complementaria de dicha secuencia de ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para
transcribir una molcula de ARNm que se leera AUG-CUA-GAU-CGC-...; el ARNm
resultante, utilizando el cdigo gentico, se traducira como la secuencia de aminocidos
metionina-leucina-cido asprtico-arginina-...
Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que,
durante el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los organismos
eucariotas (por ejemplo, animales, plantas y hongos) almacenan la mayor parte de su
ADN dentro del ncleo celular y una mnima parte en elementos celulares llamados
mitocondrias, y en los plastos y los centros organizadores de microtbulos o centrolos, en
caso de tenerlos; los organismos procariotas (bacterias y arqueas) lo almacenan en el
citoplasma de la clula y, por ltimo, los virus ADN lo hacen en el interior de la cpside de
naturaleza proteica. Existen multitud de protenas, como por ejemplo las histonas y los
factores de transcripcin, que se unen al ADN dotndolo de una estructura tridimensional
determinada y regulando su expresin. Los factores de transcripcin reconocen
secuencias reguladoras del ADN y especifican la pauta de transcripcin de los genes. El
material gentico completo de una dotacin cromosmica se denomina genoma y, con
pequeas variaciones, es caracterstico de cada especie.
Estructura
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada por dos cadenas dispuestas de forma
antiparalela y con las bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructura tridimensional, se
distinguen distintos niveles:34 35
1. Estructura primaria:
2. Estructura secundaria:
o Es una cadena doble, dextrgira o levgira, segn el tipo de ADN. Ambas cadenas
son complementarias, pues la adenina y la guanina de una cadena se unen,
respectivamente, a la timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas son
antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5' de la homloga.
3. Estructura terciaria:
2. Estructura cuaternaria:
El ADN existe en muchas conformaciones.27 Sin embargo, en organismos vivos slo se han
observado las conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La conformacin que adopta el ADN
depende de su secuencia, la cantidad y direccin de superenrollamiento que presenta, la presencia
de modificaciones qumicas en las bases y las condiciones de la solucin, tales como la
concentracin de iones de metales y poliaminas.36 De las tres conformaciones, la forma "B" es la
ms comn en las condiciones existentes en las clulas.37 Las dos dobles hlices alternativas del
ADN difieren en su geometra y dimensiones.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la "B", con una hendidura
menor superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms estrecha y profunda. La forma "A"
ocurre en condiciones no fisiolgicas en formas deshidratadas de ADN, mientras que en la clula
puede producirse en apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN, adems de en complejos
enzima-ADN.38 39
Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas por metilacin pueden sufrir
cambios conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran
alrededor del eje de la hlice en una espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma "B"
ms frecuente.40 Estas estructuras poco frecuentes pueden ser reconocidas por protenas
especficas que se unen a ADN-Z y posiblemente estn implicadas en la regulacin de la
transcripcin.41
Estructuras en cudruplex
En los extremos de los cromosomas lineales existen regiones especializadas de ADN denominadas
telmeros. La funcin principal de estas regiones es permitir a la clula replicar los extremos
cromosmicos utilizando la enzima telomerasa, puesto que las enzimas que replican el resto del
ADN no pueden copiar los extremos 3' de los cromosomas. 43 Estas terminaciones cromosmicas
especializadas tambin protegen los extremos del ADN, y evitan que los sistemas de reparacin
del ADN en la clula los procesen como ADN daado que debe ser corregido. 44 En las clulas
humanas, los telmeros son largas zonas de ADN de hebra sencilla que contienen algunos miles
de repeticiones de una nica secuencia TTAGGG.45
Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar los extremos cromosmicos mediante la
formacin de estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro bases, en lugar de los pares de
bases encontrados normalmente en otras estructuras de ADN. En este caso, cuatro bases guanina
forman unidades con superficie plana que se apilan una sobre otra, para formar una estructura
cudruple-G estable.46 Estas estructuras se estabilizan formando puentes de hidrgeno entre los
extremos de las bases y la quelatacin de un metal inico en el centro de cada unidad de cuatro
bases.47 Tambin se pueden formar otras estructuras, con el juego central de cuatro bases
procedente, o bien de una hebra sencilla plegada alrededor de las bases, o bien de varias hebras
paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye con una base a la estructura central.
Adems de estas estructuras apiladas, los telmeros tambin forman largas estructuras en lazo,
denominadas lazos telomricos o lazos-T (T-loops en ingls). En este caso, las hebras simples de
ADN se enroscan sobre s mismas en un amplio crculo estabilizado por protenas que se unen a
telmeros.48 En el extremo del lazo T, el ADN telomrico de hebra sencilla se sujeta a una regin de
ADN de doble hebra porque la hebra de ADN telomrico altera la doble hlice y se aparea a una de
las dos hebras. Esta estructura de triple hebra se denomina lazo de desplazamiento o lazo D (D-
loop).46
La doble hlice es una espiral dextrgira, esto es, cada una de las cadenas de nucletidos gira a
derechas; esto puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo a arriba, en la direccin que siguen
los segmentos de las hebras que quedan en primer plano. Si las dos hebras giran a derechas se
dice que la doble hlice es dextrgira, y si giran a izquierdas, levgira (esta forma puede aparecer
en hlices alternativas debido a cambios conformacionales en el ADN). Pero en la conformacin
ms comn que adopta el ADN, la doble hlice es dextrgira, girando cada par de bases respecto
al anterior unos 36.50
Cuando las dos hebras de ADN se enrollan una sobre la otra (sea a derechas o a izquierdas), se
forman huecos o hendiduras entre una hebra y la otra, dejando expuestos los laterales de las
bases nitrogenadas del interior (ver la animacin). En la conformacin ms comn que adopta el
ADN aparecen, como consecuencia de los ngulos formados entre los azcares de ambas
cadenas de cada par de bases nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la superficie de
la doble hlice: una de ellas, la hendidura o surco mayor, que mide 22 (2,2 nm) de ancho, y la
otra, la hendidura o surco menor, que mide 12 (1,2 nm) de ancho.51 Cada vuelta de hlice, que es
cuando sta ha realizado un giro de 360 o lo que es lo mismo, de principio de hendidura mayor a
final de hendidura menor, medir por tanto 34 , y en cada una de esas vueltas hay unos 10,5 pb.
La anchura de la hendidura mayor implica que los extremos de las bases son ms accesibles en
sta, de forma que la cantidad de grupos qumicos expuestos tambin es mayor lo cual facilita la
diferenciacin entre los pares de bases A-T, T-A, C-G, G-C. Como consecuencia de ello, tambin
se ver facilitado el reconocimiento de secuencias de ADN por parte de diferentes protenas sin la
necesidad de abrir la doble hlice. As, protenas como los factores de transcripcin que pueden
unirse a secuencias especficas, frecuentemente contactan con los laterales de las bases
expuestos en la hendidura mayor.52 Por el contrario, los grupos qumicos que quedan expuestos en
la hendidura menor son similares, de forma que el reconocimiento de los pares de bases es ms
difcil; por ello se dice que la hendidura mayor contiene ms informacin que la hendidura menor