Bio Qui Mica

Talleres de Bioqumica 1 Luz B. Pardo R.
Biomolculas
Propsito
En esta unidad que el estudiante reconoce la naturaleza y propiedades de las

molculas pequeas que sirven de alimento a los seres vivos o que
constituyen las unidades bsicas de las cuales se construyen macromolculas
estructurales, de reserva energtica o de almacenamiento y procesamiento de
la informacin biolgica, as como las relaciones estructura funcin.
Demostrar su competencia en estos temas cuando:

1. Diferencia las molculas hidrosolubles de las no hidrosolubles
2. Reconoce las funciones oxigenadas y nitrogenadas, simples y
compuestas presentes en las biomolculas.
3. Explica por qu algunos azcares son reductores y otros no.
4. Transforma estructuras lineales de loa monosacridos en estructuras
cclicas y viceversa.
5. Enuncia las diferencias estructurales entre almidn, celulosa y
glucgeno,
6. Es capaz de mencionar las caractersticas de las molculas que los
permiten clasificar como lpidos.
7. Relaciona la estructura delos fosfolpidos con su papel en las
membranas celulares.
8. Enuncia la importancia de los isoprenoides en el funcionamiento de las
clulas y organismos.
9. Relaciona las caractersticas estructurales de las biomolculas con sus
propiedades biolgicas.
10. Menciona las caractersticas de los niveles de organizacin de las
protenas
11. Describe las caractersticas delos enlaces peptdicos y como los

ngulos de rotacin alrededor de ellos determinan el nivel secundario
de organizacin de las protenas.
12. Explica como estn constituidos los nucletidos y la importancia que
ellos tienen, tanto independientemente, como tambin al formar parte
de los cidos nucleicos.
13. Analiza el efecto del medio ambiente celular sobre el comportamiento
de las biomolculas.
Las molculas que se extraen de los organismos vivos estn constituidas unos
pocos tipos de elementos, de los cuales los ms frecuentes son C, H y O, pero
tambin pueden contener N, P y S.
Funciones qumicas
Las molculas orgnicas expresan sus propiedades mediante las llamadas
funciones orgnicas que son arreglos definidos de tomos de carbono,
oxgeno, hidrgeno, fsforo, azufre y nitrgeno. Las funciones orgnicas
pueden ser oxigenadas simples: alcohol, aldehdo, cetona, cido, azufradas
como tiol y nitrogenadas como las aminas; o pueden ser compuestas (ter,
ster, anhdrido, amida, tioster) que resultan de la combinacin de dos
funciones simples, generalmente por eliminacin de una molcula de agua.
Una sola molcula pude contener varias funciones, por ejemplo los azcares
contiene funciones alcohol y aldehdo o cetona, los aminocidos tiene
funciones amina y carboxilo y algunos en sus radicales pueden tener otras
funciones, algunos lpidos son esteres.
T1 Complete el siguiente cuadro relacionado con las funciones orgnicas presentes

en las biomolculas. (En las funciones compuestas incluya el nombre de las
funciones simples que las originan)
Funcin
Nombre Estructura
Simple Compuesta: formada por
Alcohol R-OH SI NO
Aldehdo
Cetona
cido
Amina
Ester NO Alcohol + cido
Anhdrido
Tioster
Ester fosfrico
Amida
Algunos de los compuestos que se extraen de las clulas son solubles en

agua, mientras que otros no lo son. La solubilidad de las molculas depende
de su naturaleza qumica, pero en especial de su polaridad. Cuando las
molculas qumicas contienen un tomo electronegativo unido a otro
electropositivo se generan dipolos, debido a que el tomo electronegativo
atrae los electrones del electro positivo como ocurre en la molcula de agua
En general, las molculas, o parte de ellas, se consideran polares cuando

adems de tomos electro positivos (C e H), contienen elementos electro
negativos (O, N, S).
T2. En el siguiente esquema seale mediante una elipse las regiones de las
molculas que tienen afinidad por el agua y mediante un rectngulo, aquellas que no
la tienen.
H3C
CH2
H2C
CH2
H2C
CH2
H2C
CH2
H2C
CH2
H2C
CH2
H2C
O CH2
CH2
O
CH2
O O CH OH H2
C C
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2C O P O C NH2
H2
H3C C C C C C C CH2
C C C C C C C O
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
Carbohidratos
De los compuestos hidrosolubles, un grupo muy importante presenta la

frmula general Cn(H2O)n. Este criterio se tomo durante mucho tiempo como
base para definir los carbohidratos A continuacin se muestran algunos

compuestos que tienen la composicin sealada anteriormente:
O
H2
C C OH
H2
O C HO C C
H2
C OH
H O
(1) (2)
O
H C OH
HO C H3C CH
O OH
(3) (4)
HO OH O OH
CH CH O C CH OH
H3C CH CH C HO CH2 CH CH2
OH HO OH HO
(5) (6)
HO OH HO
OH CH CH CH2
H2C CH O CH CH CH
HO HC O HO OH
(7) (8)
T3. Qu compuestos contienen contiene tantos hidroxilos como el nmero

de carbonos menos 1?
T4. Adems del criterio anterior qu compuestos presentan una funcin

aldehdo o cetona?
T5. Los compuestos que presentan estas dos caractersticas son

considerados como carbohidratos. Con base en estos criterios d una
definicin de carbohidrato.
Los carbohidratos contienen carbonos asimtricos o centros quirales.

T6. Quiral se deriva del griego Cul es el significado de este trmino?
Busque el significado y etimologa del trmino quiral en:
http://dicciomed.eusal.es/palabra/quiral
Un carbono asimtrico se caracteriza por tener los cuatro sustituyentes

diferentes entre si, como lo ilustra la figura siguiente:
T7. Seale los carbonos asimtricos que presentan los siguientes compuestos:
La presencia de carbonos asimtricos genera isomera geomtrica o de

posicin, por ejemplo, cuando el radical hidroxilo del ltimo carbono asimtrico
O O
C H C H
H C OH H C OH
H C OH H C OH
H C OH HO C H
H C OH H C OH
H H
D L
se encuentra localizado a la derecha se dice que es un ismero D, si se
encuentra localizado a la izquierda se dice que es un ismero L.
La nomenclatura D y L no tiene nada que ver con la isomera ptica dextrgiro
y levgiro, la cual solamente se puede observar mediante la utilizacin de un
el polarmetro y que se designa con (+) y (-) respectivamente.
El ngulo de giro del rayo de luz polarizada es proporcional a la concentracin

del carbohidrato y al espesor de la celda en que se coloca. La constante de
proporcionalidad es caracterstica de cada azcar y se designa como poder
rotatorio especfico ([] D20).
El ngulo de rotacin producido por una solucin de azcar es:
En donde c es la concentracin de azcar (g/mL) y L la longitud del tubo del
polarmetro en decmetros.
Tabla 9. Poder rotatorio de algunos azcares.

Azcar ([] D20).
Almidn + 196
D-fructosa - 92,4
D-galactosa +80,2
D-glucosa + 52,7
Lactosa + 55,4
Sacarosa + 66,5
Existe una enzima llamada sacarasa que hidroliza la sacarosa a glucosa +

fructosa. Con base en la tabla anterior cual es la razn para que a esta enzima
tambin se dedigne invertasa
La concentracin de sustancias pticamente activas se puede determinar

mediante un instrumento denominado polarmetro mediante la aplicacin de la
siguiente ecuacin
donde:
es el ngulo de rotacin obtenido en el polarmetro.

L es la longitud del tubo del polarmetro en decmetros.
c es la concentracin de la disolucin.
Qu concentracin tiene una disolucin de glucosa que produce un ngulo
de rotacin de +40 en un polarmetro de 10 cm?
Monosacridos
Los carbohidratos que estn constituidos por una sola molcula reciben el
nombre de monosacridos y se clasifican de acuerdo con el nmero de
carbonos que presentan y del grupo no alcohlico que los caracteriza.
Clasifique los siguientes monosacridos
Molcula Segn nmero de Segn funcin Clasificacin

N Carbonos
1 Triosa Cetosa Cetotriosa
2
3
4
5
6
7
Los monosacridos, adems de las propiedades qumicas de los alcoholes,

presentan las del grupo aldehdo o cetona segn el caso.
Entre las propiedades ms importantes del grupo aldehdo se encuentran:

Capacidad reductora y formacin de hemiacetales. Entre las de los alcoholes:
formacin de teres y de steres.
Represente la reduccin del reactivo de TOLLENS (Ag (NH3)2OH) por una

aldosa (reaccin del espejo de plata).
O
+ -
R C H + 2 Ag(NH 3)2 + 3 OH
Represente la reaccin de metanal con el etanol para formar un hemiacetal.
H C H + CH3 CH2OH
Represente la formacin de un ster fosfrico en la posicin seis de la
C H
H C OH O
HO C H + HO P OH
H C OH OH
H C OH
H C OH
H
glucosa.
Las aldosas pueden formar hemiacetales internos entre el aldehdo del

carbono uno y el alcohol del carbono cinco de las aldohexosas o el cuatro de
las aldopentosas. A continuacin se muestra la formacin del hemiacetal
correspondiente a la glucosa:
O OH
H
C H C
H C OH H C OH
HO C H HO C H O
H C OH H C OH
H C OH H C
H C OH H C OH
H H
Qu cambios se aprecian en los carbonos 1 y 5 al formarse el hemiacetal

interno?
Cuando se forma el hemiacetal interno la molcula del monosacrido adquiere

una conformacin heterocclica que puede asemejarse al pirano o al furano.
Los monosacridos que se asemejan al furano se denominan furanosas, y los
O O
Furano Pirano
que lo hacen al pirano, piranosas.
A qu familia pertenece el siguiente monosacrido?
CH2 OH
H H
O
H OH
OH OH
OH H
La proyeccin de Fischer para los monosacridos cclicos es poco real, por lo

tanto es preferible representarlos mediante la proyeccin de Haworth.
Posterior
O
Perpendicular al Arriba
plano del papel Abajo
Anterior
Para transferir la informacin de la proyeccin de Fischer a la Haworth se
H OH
C
H C OH
O
HO C H O
H C OH
H C
H C OH
H
procede como se muestra en el siguiente esquema:

La formacin de monosacridos cclicos genera un nuevo centro de asimetra
en donde se encontraba la funcin aldehdo o cetona. Este carbono de
denomina carbono anomrico y los ismeros que se generan se denominan
anmeros. Segn la posicin del OH del carbono anomrico en relacin con el
plano de la molcula, los ismeros se designan alfa o beta segn se muestra
en el siguiente esquema.
CH2OH CH2 OH b
H H H OH
O O
H OH H OH

OH OH OH H
OH H OH H
Generalice la regla para la transferencia de la proyeccin de Fischer a la de

Haworth.
Cuando un monosacrido adquiere estructura cclica se forma un nuevo

centro de asimetra en el carbono que portaba la funcin aldehdo o cetona
(carbono anomrico). Si el nuevo grupo OH queda por debajo del plano del
anillo, se designa, si queda por arriba, se designa.
Las cetosas con participacin de su grupo cetnico forman hemicetales en vez

de hemiacetales.
Dibuje la forma cclica correspondiente al siguiente monosacrido
H C OH
C O
HO C H
H C OH
H C OH
H C OH
H
La oxidacin de las aldosas puede producir tres tipos de cido:
O O
C H COOH C H COOH
CH2 OH CH2 OH COOH COOH
Aldosa Aldnico Urnico Aldrico
Represente y de nombre a los tres posibles cidos derivados de la glucosa.
C H C C C
H C OH C C C
HO C H C C C
H C OH C C C
H C OH C C C
H C OH C C C
El hidroxilo anomrico de los monosacridos cclicos puede reaccionar con

compuestos alcohlicos para formar glicsidos.
CH2 OH CH2 OH
H OH H O R
O O
H OH + HOR H OH
OH H OH H
OH H OH H
Forme un glicsido que involucre el hidroxilo 1 de una glucosa y el 4 de otra:

O O
+
Disacridos
Los disacridos corresponden a glicsidos (teres) de dos monosacridos. El
ter puede involucrar uno o ambos hidroxilos anomricos. Si se conserva uno
de los hidroxilos anomricos libre, el disacrido es reductor.
Para dar nombre a los disacridos reductores se tienen en cuenta las
siguientes normas:
Se considera como monosacrido principal al que conserva su hidroxilo
anomrico libre.
Se antepone como sustituyente, terminado en il (entre parntesis) el
monosacrido que utiliza su hidroxilo anomrico para el enlace.
El enlace formado se indica mediante el nmero del carbono seguido de la
letra O, por ejemplo 4-O
Tabla 10. Disacridos ms frecuentes:
Disacrido Estructura Fuentes

Celobiosa Glu Glu b 1-4 Celulosa
Isomaltosa Glu Glu 1-6 Almidn degradado
Lactosa Gal Glu b 1-4 Leche
Maltosa Glu Glu 1-4 Almidn degradado
Sacarosa Fru Glu b 2-1 Caa de azcar, remolacha
De acuerdo con las anteriores normas la maltosa ser: 4-O-(-D-

glucopiranosil)-D-glucopiranosa, o abreviadamente: G(1 4)G
La maltosa es un 1,4-b-glicsido [4-0 -(b-D-Glucopiranosil)-b-D-glucopiranosa]

Es un disacrido que se obtiene por hidrlisis enzimtica del almidn. Esta
constituido por dos glucopiranosas unidas por un enlace 1,4-b-glicosdico. Es
un azcar reductor por tener libre el hidroxilo anomrico del hemiacetal de la
glucosa de la derecha.
La siguiente estructura corresponde a la celobiosa
Cul es su nombre qumico?

Los disacridos no reductores pueden nombrarse como derivados de

cualquiera de los monosacridos.
Represente los siguientes disacridos: Ga(1b 4)G y G(1 2b)F. (el
smbolo se utiliza en los disacridos no reductores)
La lactosa presenta la siguiente estructura:
La lactosa es un 1,4-b-glucsido [4-0 -(b-D-Galactopiranosil)-b-D-

glucopiranosa] As como la celobiosa y la maltosa, la lactosa es un disacrido
reductor. A diferencia de la maltosa y la celobiosa, la lactosa esta conformada
por dos monosacridos diferentes, unidos mediante un enlace bglicosdico
entre C1 de la galactosa y C4 de la glucosa. Ocurre naturalmente en la leche
de los mamferos y es ampliamente usada en panadera y en las leches
infantiles.
Oligosacridos
Los oligosacridos son molculas formadas por la polimerizacin de unos
cuantos monosacridos, muchos de ellos se unen a protenas o a lpidos para
constituir glucoprotenas y glucolpidos Ejemplos de estas son los antgenos
que determinan los grupos sanguneos.
Fuc = fucosa, Gal = galactosa, GalNAc = N-acetil galactosa, Glc = Glucosa

Los prebiticos: son ingredientes no digeribles de los alimentos, que afectan
benficamente al hospedero, al estimular el crecimiento y actividad de un
nmero limitado de bacterias en el colon para mejorar la salud del hospedero.
Qu diferencia hay entre prebiticos y probiticos?

Polisacridos
Existen molculas de carbohidratos formadas por la polimerizacin de un gran
nmero de monosacridos llamados polisacridos. Los polisacridos pueden
ser lineales o ramificado, los ms abundantes son el glucgeno, la celulosa y
el almidn, todos ellos formados por polimerizacin de glucosa. La celulosa
es un polmero lineal formado por enlaces de tipo b 1-4, mientras que el
almidn y el glucgeno son polmeros ramificados con enlaces 1-4 y 1-6.
Almidn Glucgeno
Qu diferencias hay entre la molcula del almidn y la del glucgeno?

Qu ventaja representa para los animales almacenar glucgeno en vez de

almidn?
La molcula de celulosa tambin es un polmero de glucosa
Cules son las principales diferencias estructurales entre celulosa y almidn?
Por qu los rumiantes pueden utilizar la celulosa como fuente de energa y

los humanos no?
Lpidos
En contraste con los carbohidratos, no existe una definicin qumica adecuada
de lpido, puesto que en este grupo de sustancias se presenta variabilidad
estructural, y por ello se definen en trminos de solubilidad.
Solubilidad de algunas sustancias

Soluble Soluble en Presente en
Compuesto en solventes organismos Lpido
agua orgnicos vivos
Mantequilla No S S S
Azcar de mesa S No S No
Sal de cocina S No No No
Parafina No S No No
Aceite vegetal No S S S
Aceite lubricante No S No No
Cera de abeja No S S S
T1. A partir de la informacin contenida en el cuadro anterior, de una

definicin operativa de lpido en trminos de su solubilidad y origen.
cidos grasos
Muchos lpidos contienen en su estructura derivados de los cidos grasos. Los

cidos grasos pueden contener o no dobles enlaces (insaturados y saturados,
respectivamente). La estructura general de los cidos grasos saturados es:
R-(CH2)n-COOH
Principales cidos grasos saturados
cidos grasos saturados

# de
Nombre Ocurrencia o funcin
C
Frmico 1 Toma parte en el metabolismo de la unidad carbono
Actico 2 Producto final de muchas fermentaciones
Propinico 3 Producto final de la fermentacin en el rumen
Butrico 4
Presente en algunas grasas en pequeas cantidades
Valrico 5 (mantequilla). Producto final del metabolismo de
carbohidratos en el rumen.
Caproico 6
Caprlico 8
Presente en muchas grasas de origen vegetal
Cprico 10
Lurico 12 Presente en plantas aromticas (canela, laurel, coco)
Mirstico 14 Presente en frutos de palmas y nueces
Palmtico 16 Presente en casi todos los triglicridos animales y
Esterico 18 vegetales
Araqudico 20 Presente en grasa de man

Behnico 22 En semillas
Lignocrico 24 Cerebrsidos, aceite de man
Principales cidos grasos no saturados
Principales cidos grasos no saturados

N de C : N;
Seri
y posicin Nombre
e Nombre sistemtico Ocurrencia
de dobles comn
1
enlaces
Monoenicos
En casi todas las
16: 1; 9 7 Palmitoleico Cis-9-hexadecenoico
grasas
Posiblemente el
18: 1; 9 9 Oleico Cis-9-octadecenoico ms comn de los
cidos grasos
22: 1; 13 9 Ercico Cis-13-dococenoico Aceite de mostaza
24: 1; 15 9 Nervnico Cis-15-tetracosenoico En cerebrsidos
Dienicos
Maz, man,
18: 2; 9,12 6 Linoleico Cis.9,12-octadecadienico
algodn soya
Trienoicos
Cis-6,9,12-
18: 3; 6,9,12 6 Linolnico Algunas plantas
Octadecatirnoico
Tetraenoicos
Componente
20: 4; Araquidni Cis-5,8,11,14- importante de los
6
5,8,11,14 co Eicosatetraenoico fosfolpidos de los
animales.
Los cidos grasos pueden representarse abreviadamente como:

O OH
C
1 Indica la posicin del doble enlace a partir del ltimo carbono.

En donde cada vrtice representa un tomo de carbono con los hidrgenos

que posee.
Acilglicridos
Usualmente los cidos grasos se encuentran formando steres con el glicerol
(propanotriol) u otros alcoholes.
H2C OH
HO CH
H2C OH
Glicerol
T2. Dibuje el palmitil, oleil, linolenil glicerol.
Los steres de glicerol se designan con el nombre general de glicridos, los

cuales pueden ser mono, di o triglicridos, segn se haya esterificado uno,
dos o los tres hidroxilos del glicerol.
Fosfolpidos
Cuando el hidroxilo libre de un di glicrido se esterifica con cido fosfrico se
forma un compuesto llamado cido fosfatdico.
T3. Dibuje la estructura de un cido fosfatdico
El radical libre del cido fosfrico en un cido fosfatdico puede esterificar un

amino alcohol o un aminocido hidroxilo, para formar los llamados fosfolpidos.
Los amino alcoholes y el aminocido que se encuentran en los fosfolpidos
son:
O
CH3
H3 C H2
C OH
+ HO C
HO N
C NH2 H2N CH
CH3 H2
H2C CH2
H 2C OH
Colina Etanolamina Serina
T4. Represente un fosfolpido que contenga alguno de los amino alcoholes

mencionados.
Segn el amino alcohol que contengan, los fosfolpidos se designan lecitinas o

cefalinas.
T5. Qu amino alcohol se encuentra en las lecitinas y cul en las cefalinas?
Los fosfolpidos son molculas anfipticas (parte de la molcula es polar y otra

parte apolar).
T6. En el siguiente esquema de un fosfolpido seale las partes polares y

apolares,
O
O H2 C O C R1
R2 C O CH OH
H2 C O P O R+
Por ser anfipticos, los fosfolpidos pueden colocarse en interfaces lpido -

agua, lo que les permite ser componentes importantes de las membranas
celulares.
Adems de los lpidos que contienen glicerol hay algunos que no lo contienen,
o contienen adems un alcohol diferente del glicerol. Entre estos pueden
mencionarse las ceras, los esfingolpidos, los terpenoides y los esteroides.
Plasmalgenos
En los plasmalgenos el primer ster de un fosfolpido es remplazado por un

ter de un alcohol b insaturado que contiene de 13 a 15 carbonos CH3-
(CH2)n-CH=CH-CH2OH.
H2 H2 H2 H2 H2 H
C C C C C C
H3C C C C C C CH2OH
H2 H2 H2 H2 H
T7. Represente la estructura general de un plasmalgeno
Ceras
Las ceras son steres de cidos grasos y un alcohol diferente del glicerol. El
ms frecuente de los alcoholes presentes en las ceras es el alcohol cetlico
(16 C).
T8. Represente el palmitato de cetilo (una cera)
Esfingolpidos
Las esfingolpidos pueden considerarse como derivados de la esfingosina:

OH
H2 H H2 H2 H2 H2 H2 H2
C C C C C C C C
HO CH C C C C C C C CH3
H H2 H2 H2 H2 H2 H2
NH2
Abreviadamente se puede representar como:
Las ceramidas son amidas formadas por esfingosina y un cido graso.
Las esfingomielinas son esfingosinas esterificadas por cido fosfrico, al cual

se encuentra unido un amino alcohol.
Los cerebrsidos son teres de esfingomielina y una azcar (glucosa o

galactosa)
Esteroides
Los esteroides son molculas que en su estructura presentan cuatro anillos

que corresponden a la organizacin del ciclopentano perhidro fenantreno:
H2 H2
C C
H2 C CH
H2 C D CH2
C CH CH
H2 C CH C
H2
A B
H2 C CH2
C C
H2 H2
Los esteroides presentan radicales y cadenas alifticas en posiciones

caractersticas, as por ejemplo el colestano:
H3 C
26 CH
CH 27 3
25
CH2
H2C
H3C 21
CH2
H2 CH3 20
C 18
H2C 11 12 C
H2 CH3 CH2
C 19 CH 14 CH 15
H2C 1 C
10 8 CH H2
H2C 3 5 6 CH2
C C
H2 H2
T6. Dibuje la estructura del colesterol (3-hidroxi-5,6-colesteno)

Las hormonas esteroidales contienen estructuras cclicas semejantes a la del

colesterol pero con cadenas alifticas de menor tamao.
T7. Investigue y dibuje las estructuras de: Estrano, Androstano y Pregnano
Algunos ejemplos de hormonas esteroidales

Clase Nombre comn Nombre qumico
Andrgeno Testosterona 17-hidroxi-4-androsten-3-ona
Corticoide Cortisol 11,17,21,trihidroxipregn-4-en-3,20-diona
Progestgenos Progesterona 4-pregnen-3,20-diona
T8. Dibuje las estructuras de las hormonas incluidas en el cuadro anterior.
Eicosanoides
En muchos organismos se encuentran presentes una serie de sustancias

biolgicamente activas derivadas de cidos grasos poli insaturados de 20
tomos de carbono que se designan EICOSANOIDES. Dentro de estos
compuestos se encuentran las prostaglandinas, los tromboxanos y los
leucotrienos.
La estructura bsica de las prostaglandinas es el cido 15 hidroxi -
prostanico:
9 COOH
8
1
15
12
20
OH
El nombre de las prostaglandinas (PGXn depende de los sustituyentes e

insaturaciones en el anillo ciclopentano X = A, B, C, D, E, o F, y de la posicin
de dobles enlaces en las cadenas alifticas, n = 1, 2, o 3.
HO O HO
R1 R1 R1
D E F
R2 R2 R2
O HO HO
PG1 = trans 13 PG2 = cis 5, trans 13 PG3 = cis 5, trans 13, cis 17
T9. Dibuje las estructuras de las prostaglandinas PGD1, PGE3 y PGF2
T10.Cuales son las funciones e importancia biolgica de las

prostaglandinas, Tromboxanos y Leucotrienos.
Aminocidos y Protenas
Las protenas son la forma de expresin de la informacin gentica, como tal

desempean innumerables funciones en los organismos vivos. Las protenas
son polmeros de alfa aminocidos unidos entre s por enlaces peptdicos.
T1. Complete la siguiente tabla con ejemplos de protenas y sus funciones.

Protena Funcin
Hemoglobina Transporte de gases
Aminocidos
Los aminocidos que usualmente forman parte de las protenas son alfa-L-
aminocidos que difieren en la naturaleza del radical, el cual confiere las
propiedades especficas de cada aminocido. La estructura general de los
aminocidos es:
Clasificacin de los aminocidos segn la polaridad del radical
A continuacin se muestran los aminocidos usualmente encontrados en las

protenas
Constantes de los Aminocidos
Valores de pKa
ndice
Aminocidos
hidroptico *
COOH NH3+ Radical
Alanina (Ala, A) 2,3 9,7 1,8
Arginina (Arg, R) 2,2 9,0 12,5 -4,5
Asparagina (Asn, N) 2,0 8,8 -3,5
Asprtico (Asp, D) 1,9 9,6 3,7 -3,5
Cistena (Cis, C) 2,0 10,3 8,2 2,5
Fenilalanina (Fal, Phe, F) 1,8 9,1 2,8
Glicina (Gli, G) 2,3 9,6 -0,4
Glutmico (Glu, E) 2,2 9,7 4,3 -3,5
Glutamina (Glu, Q) 2,2 9,1 -3,5
Histidina (His, H) 1,8 9,2 6,0 -3,2
Isoleucina (Ile, I) 2,4 9,6 4,5
Leucina (Leu, L) 2,4 9,6 3,8
Lisina (Lis, K) 2,2 9,0 10,5 -3,9
Metionina (Met, M) 2,3 9,2 1,9
Prolina (Pro, P) 2,0 10,6 -1,6
Serina (Ser, S) 2,2 9,2 -0,8
Tirosina (Tir, Y) 2,2 9,2 10,5 -1.3
Treonina (Tre, T) 2,1 9,1 -0,7
Triptfano (Tri, Trp, W) 2,8 9,4 -0,9
Valina (Val, V) 2,3 9,6 4.2
Los valores negativos de ndice de hidropata muestran la tendencia a localizarse en regiones

acuosas, mientras que los positivos la tendencia a localizarse en regiones hidrofbicas.
Las propiedades de los aminocidos son las del grupo amino, las del carboxilo
y las propias de cada radical. Segn las caractersticas del radical de los
aminocidos, estos se clasifican como de radical apolar, polar ionizable y polar
NO ionizable
T2. Complete el siguiente cuadro que relaciona los nombres y estructuras de los
aminocidos y su clasificacin)
Clasificacin
Abreviatura Aminocido Nombre qumico
(PNI, PI, NP)
A, ala Alanina aminopropinico
R arg Arginina aminoguanidino-valrico
D asp Asprtico aminosuccinico
C cis Cistena aminobtiopropinico
F fal Fenilalanina aminobfenil propinico
G gli Glicina - aminoctico
E glu Glutmico aminoglutrico
H his Histidina aminobimidazol propinico
I ile Isoleucina aminobetilbmetil-propinico
L leu Leucina amino-- metil valrico
K lis Lisina diaminocaprico
M met Metionina aminometil-tiobutrico
P pro Prolina pirrolidin carboxlico
S ser Serina amino-bhidroxi propinico
Y tir Tirosina aminobparahidroxifenil propinico
T tre Treonina amino-bhidroxi butrico
W tri Triptfano aminobindol propinico
V val Valina amino-isovalrico
Algunos radicales presentes en los aminocidos
Guanidino Imidazol Indol Pirrolidin

Caractersticas de los aminocidos:
La hidrofobicidad relativa de los aminocidos se representa en el siguiente

esquema:
La naturaleza polar o apolar de los radicales de los aminocidos son una

fuerza importante en la organizacin de la arquitectura proteica. La figura
siguiente ilustra la secuencia dela hexoquinasa de levadura de cerveza.
1 5 10 15 20 25 30
AA S X D X S L V E V H X X V F I V P P X I L Q AV V S I A
31 T T R X D D X D S A A A S I P M V P G W V L K Q V X G S Q A
61 G S F L A I V M G G G D L E V I L I X L A G Y Q E S S I X A
91 S R S L A A S M X T T A I P S D L W G N X A X S N A A F S S
121 X E F S S X A G S V P L G F T F X E A G A K E X V I K G Q I
151 T X Q A X A F S L A X L X K L I S A M X N A X F P A G D X X
181 X X V A D I X D S H G I L X X V N Y T D A X I K M G I I F G
211 S G V N A A Y W C D S T X I A D A A D A G X X G G A G X M X
241 V C C X Q D S F R K A F P S L P Q I X Y X X T L N X X S P X
271 A X K T F E K N S X A K N X G Q S L R D V L M X Y K X X G Q
301 X H X X X A X D F X A A N V E N S S Y P A K I Q K L P H F D
331 L R X X X D L F X G D Q G I A X K T X M K X V V R R X L F L
361 I A A Y A F R L V V C X I X A I C Q K K G Y S S G H I A A X
391 G S X R D Y S G F S X N S A T X N X N I Y G W P Q S A X X S
421 K P I X I T P A I D G E G A A X X V I X S I A S S Q X X X A
451 X X S A X X A
T3. Una protena tiene la siguiente secuencia:

1 AAS X D X S L V E V H X X V F I V P P X I L Q A V V S I A
31 T T R X D D X D S A A A S I P M V P G W V L K Q V X G S Q A
61 G S F L A I V M G G G D L E V I L I X L A G Y Q E S S I X A
91 S R S L A A S M X T
Qu aminocidos tenderan a colocarse en la superficie y cules hacia el interior
de la molcula?
Exterior Interior
Los radicales polares ionizables de los aminocidos presentes, determinan el

comportamiento inico de las protenas y una serie de interacciones dbiles
necesarias para la funcin de una protena. Un aminocido de radical no polar,
segn el pH del medio, puede presentar uno de los tres estados inicos
siguientes:
H H H O
H O H+ H O
H+
N+ C C N+ C C N C
H KCOOH H K NH3+ H C O-
-
O H O
H R H R R H
pH<pK1 pH = pI pH>pK2
El punto isoelctrico ( pI )de un compuesto se define como el valor de pH en el

cual la suma de las cargas que presenta la molcula es cero. Recuerde que:
pKa = -logKa
El pI se estima mediante el punto medio entre los dos pK que delimitan la zona
de pK en que la molcula tiene carga cero.
Suponga que en un aminocido de radical apolarel pK del grupo carboxilo

es 3,0 y el del grupo amino es 9,0
pKa 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
COOH 3,0 0 0 0 - - - - - - - - -
+ 0 0 0
NH3 9,0 + + + + + + + + +
+1 +1 +1 0 0 0 0 0 0 -1 -1 -1
La carga
+1 0 -1
tiende a:
T4. Asuma que se ha aislado, por hidrlisis de la hexoquinasa el segmento 211 a

220 (S G V N A A Y W C D) Utilice los valores de pKa incluidos en la tabla de
constantes para determinar el estado inico del fragmento a los valores de pH
incluidos en la siguiente tabla. Determine el pI del pptido.
Aminocido N
211 212 213 214 215 216 217 218 219 220
COOH Carga
pK
pH
Estado inico de cada radical a los valores de pH indicados
2
4
6
8
10
12
Pequeos cambios en la secuencia de los aminocidos de una protena

pueden llegar a determinar grandes cambios en su funcin.
Algunas hormonas neuro hipofisiarias de diferentes organismos presentan las

siguientes secuencias
A) CIS-TIR-ILE-SER-ASN-CIS-PRO-GLN-GLI
B) CIS-TIR-ILE-SER-ASN-CIS-PRO-ILE-GLI
C) CIS-TIR-ILE-GLN-ASN-CIS-PRO-ILE-GLI
D) CIS-TIR-ILE-GLN-ASN-CIS-PRO-ARG-GLI
E) CIS-TIR-ILE-GLN-ASN-CIS-PRO-LEU-GLI
F) CIS-TIR-FAL-SER-ASN-CIS-PRO-ARG-GLI
G) CIS-TIR-FAL-GLN-ASN-CIS-PRO-LIS-GLI
T5. Qu hormonas, de las anteriores, espera Ud. que tengan el mismo

punto isoelctrico?
Pptidos
El enlace peptdico es la base de la estructuracin de las protenas.
O O O O
H2 N CH C OH H2N CH C OH H2N CH C OH H2N CH C OH
CH3 CH2 CH2 CH2
SH CH2 CH CH3
CH2 CH3
H2 O NH
C NH H2 O
H2O
NH2
O O O O
H H H
H2N CH C N CH C N CH C N CH C OH
CH3 CH2 CH2 CH2
SH CH2 CH CH3
CH2 CH3
NH
C NH
NH2
Si se tienen en cuenta los ngulos de valencia la organizacin espacial del

pptido sera:
Debido a la resonancia electrnica producida por el carbonilo del enlace

peptdico, coexisten dos posibles formas:
R2 R2
+
R1 HN CH R1 HN CH
CH C C OH CH C C OH
H2 N O O H2N O- O
por lo cual el enlace peptdico tuene carcter de parcialmente doble.
T7. Observe las dos figuras
Es posible que las dos esferas giren Es posible que las dos esferas giren
alrededor del eje? Por qu? alrededor del eje? Por qu?
T8. Que similitud encuentra Ud. entre los dibujos delos esquemas y las dos
posibles formas de los enlaces peptdicos?
T9. Es posible el libre giro del carbono carbonilo y el nitrgeno amino
alrededor del en lace peptdico?
Los tomos que conforman el enlace peptdico son coplanarias l
T10. De acuerdo con el esquema, qu son los ngulos (fi) y (psi) en los
grupos peptdicos y qu importancia tienen.

La organizacin secundaria de las protenas guarda relacin con la secuencia

y composicin de las cadenas polipeptdicas.
La estabilizacin de la organizacin proteica depende de interacciones dbiles

y fuertes establecidas entre los radicales de los aminocidos y de estos con el
medio ambiente.
T11. Indique los aminocidos que pueden generar las siguientes interacciones
ente sus radicales.
Interacciones de Van
Puentes de hidrgeno der Waals
Enlaces
electrostticos
Aminocidos
Aminocidos Aminocidos
Niveles de organizacin
Para describir la estructura de una protena es necesario recurrir a varios

niveles de organizacin.
.
Nivel Primario:
En un pptido no es lo mismo composicin que secuencia, la secuencia
indica el orden de los aminocidos en la cadena peptdica y esta
genticamente determinada, la composicin es la informacin sobre el
contenido de aminocidos del pptido.
De acuerdo con la unin de qumica pura y aplicada IUPAC en su pgina

http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/index.html o en la pgina de la IUBBM
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/: Nivel primario: es la secuencia de

aminocidos de una cadena polipeptdica, sin tener en cuenta el arreglo
espacial (excepto la configuracin en el carbono alfa).Esta definicin o incluye
la posicin de los enlaces di sulfuro.
T12. Una pptido contiene los siguientes aminocidos: ALA; CIS; LIS; VAL.
Cules son las posibles secuencias que puede presentar dicho pptido?
La secuencia de aminocidos constituye el nivel primario de organizacin de

las protenas, tambin llamada estructura primaria. Los enlaces peptdicos
son los responsables mantenimiento del nivel primario de las protenas.
Nivel secundario
Describe las relaciones entre un aminocido y sus vecinos inmediatos en la

secuencia mediante los ngulos de rotacin alrededor del carbono . De
acuerdo con la IUPAC y la pgina de la IUBBM: Nivel secundario: es el arreglo
local espacial de los tomos de su cadena principal sin tener en cuenta la
conformacin de sus cadenas laterales o sus relaciones con otros segmentos.
Los dos principales tipos de organizacin secundaria son: Hlice alfa y Banda
beta. Esquemticamente se pueden representar como se muestra a
continuacin
El nivel secundario de organizacin se mantiene gracias a los puentes de

hidrgeno que se forman entre el H no comprometido en el enlace peptdico
de los aminos alfa y el oxgeno carbonilo de los carboxilos comprometidos en
los enlaces peptdicos.
Ramachandran predijo las combinaciones de los giros de rotacin que

favorecan as diferentes conformaciones de nivel secundario en los pptidos.
Las tres conformaciones ms probables, de acuerdo con el sentido y magnitud

de los ngulos y son: hlice alfa, banda beta o sper hlice.
Ejemplos de organizacin secundaria de protenas
Alfa hlice : Banda beta: Sper hlice :

Lana Seda Colgeno
Los aminocidos que tienden a impedir la formacin de hlice alfa son:

Prolina, dos o ms residuos consecutivos de aminocidos con radical
ramificado (val, ile), por secuencias repetitivas de aminocidos con radical
ionizado de igual carga.
Las bandas beta son promovidas por secuencias repetitivas de gli, ser, ala.
La sper hlice colgeno requiere ngulos de torsin especficos y
aminocidos de radical pequeo.
T13. Qu aminocidos y por qu razn, permiten la conformacin de la

sper hlice de colgeno?
La estructura de la lisozima, una enzima, bactericida natural, se encuentra en

lgrimas, saliva y otras secreciones, as como en algunos virus. Su estructura
esquemtica (tomada de http://biol1medio.blogspot.com/2009/08/boca.html) es la siguiente:
La secuencia de la lisozima de del bacterifago T4 es la siguiente:
T14, En la secuencia anterior localice los aminocidos que posiblemente

forman parte de las regiones de hlice alfa y banda beta de la lisozima.
Los diferentes tipos de organizacin secundaria se ven favorecidos o

interrumpidos por algunos aminocidos
Caractersticas Aminocidos
Favorecen formacin de hlice alfa A, L, M, E, H, K, R
Interrumpen hlice alfa G, P, D, S
Favorecen banda beta Y, W, F, M, I, V, T, C
Favorecen sper hlice de colgeno G, A, P
Nivel terciario
El nivel terciario describe las relaciones espaciales entre aminocidos vecinos

pero distantes en la secuencia.
Segn la IUPAC: Nivel terciario: es el arreglo de todos los tomos en el
espacio sin tener en cuenta sus relaciones con otras sub unidades o
molculas vecinas.
Estructura terciaria, esquemtica, de una protena.
La organizacin terciaria de las protenas, es mantenida principalmente por

enlaces bisulfuro, puentes salinos, interacciones hidrofbicas y otras
interacciones dbiles
Nivel cuaternario
Describe el nmero de cadenas peptdicas y las relacione espaciales entre

ellas. La organizacin cuaternaria es mantenida por interacciones dbiles.
Segn las definiciones de la IUPAC: Nivel cuaternario es el arreglo de sus
subunidades en el espacio, el ensamblaje de ellas, los contactos entre
subunidades sin tener en cuenta la geometra interna de las sub unidades.
Organizacin supra secundaria

Las protenas no son tan diferentes entre s como se pensaba hace algn
tiempo. Presentan secuencias que se han conservado a lo largo de la
evolucin, as como regiones que son casi idnticas en protenas diferentes
que tienen funciones similares. Los niveles secundarios y terciarios de la
organizacin proteica toman conformaciones caractersticas que se
denominan motivos y dominios.
Consulte la siguientes URL:

http://temasdebioquimica.wordpress.com/2008/10/12/estructuras-
supersecundarias-motivos-y-dominios/
http://www2.udec.cl/~jmartine/Capitulo5.htm
T15. A qu se denomina Motivos en la estructura de las protenas?
.
T16. Identifique los motivos proteicos representados.
T17. Qu es un dominio proteico?
T18. Qu diferencias existen entre motivos u dominios proteicos?
Purificacin de protenas
La primera etapa en la purificacin de protenas es la obtencin del llamado

extracto bruto, que no es ms que un homogeneizado libre de clulas
Para conocer las propiedades estructurales de las protenas es necesario

aislarlas, purificarlas y en muchos casos determinar la secuencia de los
aminocidos que las conforman-. El aislamiento de una protena que se
encuentra mezclada con otras es una tarea que requiere cuidado y dedicacin
y que se basa en las posibles diferencias en varios criterios entre los cuales se
pueden mencionar:
Solubilidad
Diferencia en su punto isoelctrico
Tamao molecular
Afinidad
Procesos basados en las diferencias en solubilidad.
Cuando a una solucin de protenas en medio acuoso se adiciona una sal de

alta solubilidad en ese medio se presenta una competencia de solubilidad, en
forma tal que a medida que se aumenta la concentracin de sal en el medio se
produce una precipitacin diferencial de las protenas de la mezcla. Este
fenmeno se conoce en la literatura bioqumica con el nombre de "SALTING-
OUT". Algunas protenas aumentan su solubilidad a baja saturacin con la sal,
fenmeno que se conoce con el nombre de "SALTING-IN"
El esquema bsico de la precipitacin diferencial se muestra a continuacin
En la siguiente grfica se muestran unas curvas hipotticas de solubilidad de

tres protenas en funcin de la saturacin de la solucin con sulfato de
amonio.
EFECTO DE LA SATURACION CON SULFATO DE AMONIO

12 0
10 0
Proteina A
Proteina B
SOLUBILIDAD 80
Proteina C
60
40
20
0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 10 0
% SATURACION
Curvas hipotticas de solubilidad de tres protenas en funcin de la saturacin

con sulfato de amonio.
En la figura anterior se puede apreciar que al saturar la solucin que contiene

la mezcla de protenas hasta un 10%, se produce un ligero aumento de la
solubilidad de las tres protenas. Tambin puede observarse que a 30% de
saturacin ya se ha producido la precipitacin total de la protena C, mientras
que parte de A y B an permanecen en solucin. La protena B precipita
totalmente al 60% de saturacin y la A al 80%.
El sulfato de amonio necesario para precipitar diferencialmente las protenas

se puede adicionar ya sea slido en solucin saturada, si lo primero es
necesario controlar los cambios de pH ya que sta sal es de reaccin cida, si
lo segundo se corre el riesgo de diluciones excesivas de la mezcla de
protenas.
El volumen de solucin saturada de sulfato de amonio necesario para

conseguir un determinado porcentaje de saturacin, puede calcularse
mediante la siguiente frmula
S 2 S1
Y ml Vp
1 S2
en donde:
Y = volumen de sulfato de amonio necesario para conseguir el % de

saturacin deseado,
Vp = volumen de la mezcla de protenas que se utiliza en la precipitacin,
S2 = % de saturacin al que se desea llegar, expresado como fraccin (Ej.
20% se toma como 0,20)
S1 = % de saturacin inicial del cual se parte, expresado como fraccin (Ej. 5
% se toma como 0,05)
Los clculos necesarios se ilustran con el siguiente ejemplo. Se desea aislar

una protena que precipita entre el 30 y 35 % de saturacin con sulfato de
amonio. Se dispone de 200 ml de la solucin que contiene la mezcla de

protenas.
S 2 S1
Y ml Vp
1 S2
1. Calculo de lo ml de sulfato de amino necesarios para llevar la mezcla de
protenas de 0% a 30% de saturacin.
Vp = 200 ml, S1 = 0.0, S2 = 0.3
0.3 0,0 0,3

Y ml 200 200 85,7 ml
1 0,3 0,7
2. Agregar poco a poco los Y ml de solucin saturada de sulfato de amonio,

dejar en reposo 20 minutos y centrifugar a 5.000 r.p.m.
3. Tomar el sobrenadante (este tiene un 30% de saturacin con sulfato de

amonio. Medir el volumen (asuma que es 285 ml)
4. Calcular la cantidad de sulfato de amonio necesario para llevar 285 ml de

solucin saturada del 30 al 35%.
0.35 0,3 0,05

Y ml 285 285 219
, ml
1 0,35 0,65
5. Dejar en reposo 20 minutos, centrifugar, colectar el precipitado (este

contiene las protenas que precipitan entre 30 y 35% de saturacin.
La cantidad de sulfato de amonio slido necesario para producir una

determinada saturacin se calcula mediante la siguiente frmula:
50,5(S 2 S1 )
X gramos =
1 0,3S2
T19. Disee un protocolo para aislar la fraccin soluble entre el 40 y 60% de

saturacin con sulfato de amonio de una mezcla de protenas cuyo volumen
inicial es 250 mL. Tanto con solucin saturada, como con slido,
Procesos de separacin basados en diferencias en el punto isoelctrico de las

protenas.
Las molculas proteicas debido a las propiedades de los aminocidos que las
componen pueden adquirir carga elctrica en funcin del pH del medio en que
se encuentran.
Electroforesis.
La electroforesis es una tcnica analtica que permite separar molculas con

cargas elctricas diferentes al someterlas a un campo electromagntico.
La separacin electrofortica requiere de un soporte poroso impregnado de

una solucin de electrolito con pH constante (buffer).
Al cerrarse el circuito de corriente continua se establece una polaridad definida

en forma tal que uno de los extremos corresponde al polo positivo y el otro al
negativo. Si en el centro el soporte se coloca una mezcla de molculas que al
pH del medio tienen las cargas indicadas en la siguiente figura:
+ - o
A B C
+ -
La muestra a resolver en un sistema electrofortico se coloca sobre el soporte

poroso como indica el esquema anterior.
Despus de un tiempo de haber cerrado el circuito las molculas sufrirn los

desplazamientos indicados en el esquema siguiente:
Separacin electrofortica de una mezcla de tres sustancias con diferente

carga.
T20. Represente en el siguiente esquema el resultado de la electroforesis a

pH 8,2 de una mezcla de protenas cuyos pI son: A = 9,2; B = 5,4; C = 2,8; D
= 8,2.
Cromatografa de Intercambio inico
La cromatografa de intercambio inico es una tcnica preparativa basada en

la capacidad que poseen algunas sustancias ionizables, llamadas resinas, de
fijar molculas de carga contraria. Las resinas se ionizan en funcin del pH del
medio y segn adquieran carga positiva o negativa se designan como de
intercambio anicnico o catinico respectivamente.
La matriz de la resina puede ser de carcter hidroflicas o hidrofbicas, entre

las primeras las ms empleadas son las derivadas de celulosa y entre las
segundas las de poli estireno. Los grupos ionizables que usualmente se

encuentran en las resinas de intercambio inico se muestran en la siguiente
tabla.
Resinas de intercambio inico

Radical Grupo ionizable pK
CH2 SO 3 H Sulfometil 2,5
CH2 COOH Carboximetil 3,5
PO 3 H2 Fosfo 6,0
CH2 CH2 N(C 2H5 ) 2 Dietilaminoetil 9,5
Trietilaminoetil 10,0
Tanto la resina como las molculas a separar se equilibran con un buffer al pH

seleccionado para la operacin. La seleccin del pH es de gran importancia,
puesto que de l depende que la resina est correctamente cargada y que las
molculas a separar adquieran las cargas adecuadas para que aquellas que
se quieren purificar queden adheridas a la resina.
En el siguiente esquema se muestra como vara la carga de la resina y de las

molculas proteicas en funcin del pH. Se asume que las resinas son tiles
para la separacin una unidad o unidad y media de pH por debajo de su pK en
el caso de las resinas de intercambio aninico y una unidad o unidad y media
por encima en el caso de las de intercambio catinico. Deben evitarse los
valores extremadamente altos o bajos de pH donde puede ocurrir
denaturacin de las protenas que se estn separando.
Determinacin de la zona de pH til en la cromatografa de intercambio inico.
La seleccin de la resina y el pH al cual se realizara la cromatografa, sera

muy fcil si se conociese el punto isoelctrico de las molculas a separar y
estos fueran lo suficientemente diferentes para conseguir una adecuada
separacin.
En el caso del ejemplo la resina solo es til a pH por debajo de 7,5, y como las
protenas usualmente se desnaturan fcilmente a pH por debajo de 4,5, la
zona verdaderamente til de la resina esta entre pH 5 y 7. A pH 7,0 las
protenas A y C tienen carga negativa, mientras que la B y D tendrn carga
positiva. En consecuencia las protenas B y D por tener la misma carga de la
resina no se fijaran a ella, mientras que las A y C quedarn retenidas por tener
carga contraria a la de la resina. La protenas que se fijan a la resina
posteriormente sern eludas por remplazo con otros iones de mayor afinidad
por la resina (usualmente se emplea KCl).
Las resinas de intercambio inico permiten la purificacin de las molculas

que se fijan a ellas, sin embargo tal purificacin no es total puesto que al salir
de la columna an continan mezcladas con molculas de la misma carga. La
siguiente grfica muestra el perfil de elucin de la columna descrita
anteriormente. En ella puede observarse que se ha conseguido una
purificacin parcial de las protenas A y C. la cuales an salen en un solo
grupo, pero en todo caso se ha conseguido liberarlas de B y D.
Perfil de elucin en una cromatografa de intercambio inico

La separacin de molculas con carga del mismo tipo se consigue mejorar si

el electrolito de intercambio se agrega como un gradiente de concentracin,
con este sistema son eludas en primer lugar aquellas que estn unidas ms
dbilmente (las que tienen carga de menor magnitud por tener su pK ms
prximo al pH de elucin)
Perfil de elucin en una cromatografa de intercambio inico con gradiente de

KCl
T21. Dibuje los perfiles de elucin de una cromatografa de intercambio inico

en DEAE celulosa equilibrada a pH 7,5, con y sin gradiente de KCl 0 0,5M
de una mezcla de protenas cuyos pI son: A = 9,2; B = 5,4; C = 2,8; D = 8,2.
Separacin por tamao molecular

Para separar molculas con pesos moleculares suficientemente diferentes se
emplea la llamada filtracin molecular, de la cual es un buen ejemplo el
empleo de columnas de Sephadex .
El Sephadex es un polisacrido que se caracteriza por diferentes grados de

entrecruzamiento entre las cadena, lo que permite obtener diferentes grados
de porosidad. Si las molculas penetran al interior de los granos de gel
hidratado, sern retardadas en relacin con aquellas que son excluidas y que
por tanto saldrn ms rpidamente de la columna. El Sephadex y los geles
similares son adecuados para separar las molculas que son retenidas en el
interior del gel.
A continuacin se presentan algunas de las propiedades de los tipos de

Sephadex ms corrientemente empleados.
Propiedades de algunos tipos de Sephadex

Lmite de Agua Volumen
TIPO
exclusin retenida mL hidratado mL
G10 HASTA 700 1,0 2
G15 HASTA 1.500 1,5 3
G25 1000-5000 2,5 5
G75 3.000-80.000 7,5 15
G100 4.000-150.000 10,0 20
G150 5.000-400.000 15,0 30
G200 5. 000-800.000 20,0 40
Las protenas en solucin se rodean de molculas de agua para mantenerse

soluble, las sales altamente solubles compiten con las protenas por las
molculas de agua, por tanto al adicionar estas sales a las soluciones de
protenas, estas ltimas pierden solubilidad y precipitan.
T22.Disee un protocolo para separar, si es posible, las cuatro protenas

cuyas caractersticas con las siguientes:
% de saturacin en que
Protena Peso molecular pI
precipita
A 30 000 8,0 20 40%
B 80 000 5,4 30 - 50%
C 140 00 2,2 60 -8 0%
D 200 000 7,8 50 70%
Determinacin de la secuencia de aminocidos en pptidos y protenas
F, Sanger en 1958 fue galardonado con el premio Nobel de Qumica por la

determinacin de la secuencia de la insulina. La conferencia que l pronunci
en la ceremonia de entrega del galardn se encuentra en la
URLhttp://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1958/sanger-
lecture.pdf
La metodologa a la que el llamo de los pptidos sobrepuestos, consiste

fundamentalmente en producir rupturas especficas de los pptidos con
diferentes agentes proteolticos y deducir, a partir de la sobre posicin de

informacin, la secuencia del pptido.
Para comprender la metodologa se presenta el siguiente ejemplo:

Asuma que un pptido est compuesto por los siguientes aminocidos
Suponga que dispone de cuatro agentes proteolticos con la especificidad que

se muestra en el siguiente cuadro
Los resultados de los tratamientos proteolticos sobre el pptido se muestran

en los siguientes esquemas:
P 1.1 P 1.2
P 2.1 P 2.2
P 3.1 P 3.2
P 4.1 P 4.2
En los esquemas que se incluyen a continuacin, se emplean las siguientes

convenciones
Enlace peptdico correctamente localizado
Localizacin tentativa
Localizacin cierta
Para iniciar el anlisis, como una primera aproximacin, se ubican los

aminocidos en cualquier orden:
1 2 3 4 5 6 7 8 9
Luego se inicia el estudio de los resultados producidos por los diferentes

tratamientos.
En este ejemplo se suponen conocidos los terminales, por tanto estos se

ubican en sus respectivas posiciones, 1 y 9 respectivamente.
1 2 3 4 5 6 7 8 9
El fragmento P1.1 lleva el marcador izquierdo y el P1...2 el derecho, adems
esto se obtuvieron por un procedimiento que especficamente rompe por
, por tanto el pptido P1.1 se localiza al extremo derecho y la

secuencia de este fragmento debe ser:
por tanto los aminocidos que estaban en las posiciones 4 y 5 deben paras a
las posiciones 2 y 3.
En consecuencia, la secuencia establecida hasta este momento es:
1 2 3 4 5 6 7 8 9
El tratamiento con P2 produce dos fragmentos en donde el punto de hidrlisis
es: .
Como los componentes del fragmento P2.1 son:
los aminocidos que ocupan las posiciones 7 y 6 deben pasar a ocupar las
posiciones 4 y 5.
1 2 3 4 5 6 7 8 9
El tratamiento con P3 permite localizar en la posicin 6 el aminocido que

tentativamente se haba colocado en la 7, ya que ste aparece en el mismo
fragmento que los que ocupan las posiciones 1 a 5.
1 2 3 4 5 6 7 8 9
La secuencia definitiva puede establecerse mediante el tratamiento P4 al

confirmar que los aminocidos que ocupan las posiciones 7 y 8 estn
ubicados en el lugar correcto. Por tanto la secuencia definitiva es:
1 2 3 4 5 6 7 8 9
Especificidad de los tratamientos proteolticos utilizados en la secuenciacin

de aminocidos.
En la tabla de especificidad se utilizan las siguientes convenciones.

Ejemplo de secuenciacin
Secuencia definitiva I G M C R C M C F C F E L
T23. Determine la secuencia del pptido

Nucletidos y cidos nucleicos
cidos nucleicos
Nucletidos
Los nucletidos son el elemento estructural bsico de los cidos nucleicos,
pero tambin son compuestos de importancia por si solos.
Un nucletido est formado por una pentosa, un heterocclico nitrogenado

(base nitrogenada y cido fosfrico. Los heterocclicos pueden ser de la
familia de las purinas o de la de las pirimidinas, el azcar puede ser ribosa o
2-desoxiribosa.
En los nucletidos de los cidos nucleicos, las purinas se unen a la pentosa

mediante un enlace 1 9 N-glicosdico y las pirimidinas mediante un enlace
1 1 N-glicosdico. El azcar se une al fosfato mediante un ster 5-fosfato.
Dibuje un nucletido de purina con desoxirribosa y uno de pirimidina

con ribosa.
Los heterocclicos nitrogenados que pueden formar parte de los nucletidos

son:
Si el uracilo es 4,6-dioxopirimidina, Cul es el nombre qumico de las otras 3

bases?
En compuestos diferentes a los cidos nucleicos se pueden encontrar otros

heterocclicos:
Investigue en que compuestos se encuentran los dos heterocclicos

anteriores.
cidos nucleicos
Los cidos nucleicos so polmeros de nucletidos unidos mediante enlaces di
ster fosfrico.
Identifique cada uno de los nucletidos que se puede encontrar en lo

cidos nucleicos:
HO
H2 OH
HC CH
O C P
H2N C CH O
N CH O
1
1'
N C CH
CH
OH
O HO
HO OH
H
C H2 P
N N C
O O
O CH
C C
H2N C CH
N 1'
CH
9 OH
CH
N CH
HO
Las bases nitrogenadas tienen la capacidad de constituir pares especficos

mediante la formacin de puentes de hidrgeno como se muestra en el
esquema siguiente:
DNA
El DNA (cido desoxirribonucleico es una doble cadena anti paralela de
nucletidos unidos entre s por enlaces 1-3-dister fosfrico.
El modelo generalmente aceptado para el DNA es el propuesto por Watson y

Crick en 1963. El trabajo original de Watson y Crick sobre la estructura del
DNA se incluye a continuacin.
[Traduccin del trabajo original de Watson y Crick]2
[Versin original Aqu]
ESTRUCTURA MOLECULAR DE LOS CIDOS

NUCLEICOS
Una estructura para el cido Desoxirribonucleico
Deseamos sugerir una estructura para la sal del cido Desoxirribonucleico

(DNA.). Esta estructura tiene aspectos novedosos que son de un inters biolgico
considerable.
Una estructura para el cido nucleico ya ha sido propuesta por Pauling y Corey (1).
Amablemente han puesto el manuscrito a nuestra disposicin antes de su publicacin.
Su modelo consiste en tres cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la
fibra, y las bases hacia fuera. En nuestra opinin, esta estructura es poco satisfactoria
por dos razones: (1) creemos que el material del que se obtienen los diagramas de
rayos-X es la sal, no el cido libre. Sin los tomos de hidrgeno del cido no est claro
qu las fuerzas puedan mantener la estructura unida, especialmente porque los fosfatos
cargados negativamente cerca del eje se repeleran el uno al otro. (2) Algunas de las
distancias de van der Waals parecen ser demasiado pequeas.
Otra estructura en cadena triple ha sido sugerida por Fraser (en prensa). En su
modelo los fosfatos, estn hacia fuera y las bases hacia dentro, mantenindose unidas
por enlaces de hidrgeno. Esta estructura as descrita est ms bien mal definida por lo
que no la comentamos.
Deseamos ofrecer aqu una estructura radicalmente distinta para la sal del
cido desoxirribonucleico. Esta estructura tiene dos cadenas helicoidales cada vuelta en
torno al mismo eje (ver diagrama). Hemos hecho las suposiciones qumicas usuales,
ms especficamente, que cada cadena consiste en grupos fosfato-di ster uniendo
residuos de -D-desoxirribofuranosa con enlaces 3',5'. Las dos cadenas (pero no sus
2 Tomado de: http://www.bioxeo.com/adn.htm

bases) se relacionan por una dada perpendicular al eje de la fibra. Ambas cadenas
siguen una hlice dextrgira, pero debido a las dadas las secuencias de tomos en las
dos cadenas corren en direcciones opuestas. Cada una de las cadenas, por separado se
parece al modelo N 1 de Furberg (2); esto es, las bases estn sobre la parte interna de
la espira y los fosfatos en la externa. La configuracin del azcar y los tomos
cercanos se aproxima a la "configuracin estndar" de Furberg, el azcar se dispone
perfectamente perpendicular a la base adjunta. Hay un residuo sobre cada cadena cada
3,4 en la direccin-z. Hemos asumido un ngulo de 36 grados entre residuos
adyacentes en la misma cadena, para que la estructura se repita despus de 10 residuos
sobre cada cadena, esto es, despus de 34 . La distancia de un tomo de fsforo desde
el eje de la fibra es 10 . Como los fosfatos estn sobre la parte externa, los cationes
tienen fcil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua es ms bien
alto. Para nosotros, a contenidos bajos las bases se acercaran y la estructura sera ms
compacta.
El aspecto novedoso de la
estructura es la manera en
que las dos cadenas se
mantienen unidas por
bases pricas y
pirimidnicas. Los planos
de las bases son
perpendiculares al eje de
la fibra. Se renen en
pares, una base de una de
las cadenas unida
mediante enlaces de
hidrgeno a una base de
la otra cadena, y as las
dos se unen lado a lado
con idntica coordenada
z. Una del par debe ser
purnica y la otra
pirimidnica. Los enlaces
Esta figura es puramente
de hidrgeno se hacen
como se indica a
esquemtica. Las dos cintas
continuacin: purina en simbolizan las cadenas azcar-
posicin 1 con pirimidina fosfato, y las varillas horizontales
en posicin 1; purina en los pares de bases que sostienen
posicin 6 con pirimidina las cadenas unidas. La lnea
en posicin 6 [etc.] vertical marca el eje de la fibra.
Si se asume que las bases slo aparecen dentro de la estructura en la forma
tautomrica ms plausible (que es, con la configuracin ceto ms que con la enol) se
encuentran los pares especficos de bases que pueden unirse. Estos pares son: la
adenina (purnica) con timina (pirimidnica), y guanina (purnica) con citosina
(pirimidnica).
En otras palabras, si una adenina es uno de los miembros de un par, sobre una
cadena, entonces el otro miembro debe ser timina; algo similar ocurre para la guanina y
la citosina. La sucesin de bases sobre una cadena nica no parece estar restringida de
ninguna forma. Sin embargo, si slo pueden formarse determinados pares de bases, se
sigue que conociendo la sucesin de bases sobre una de las cadenas, entonces la
sucesin sobre la otra cadena queda determinada automticamente.
Se ha encontrado experimentalmente (3,4) que la relacin de adenina a timina, y

la relacin de guanina a citosina, estn siempre muy cerca de la unidad para el cido
desoxirribonucleico. Probablemente es imposible construir esta estructura con un
azcar ribosa en lugar de desoxirribosa, el tomo extra de oxgeno la hara demasiado
cerrada y formara un enlace de van der Waals.
Los datos de rayos-X anteriormente publicados (5,6) sobre el cido

desoxirribonucleico son insuficientes para una prueba rigurosa de nuestra
estructura. Hasta el momento lo que podemos decir es a grosso modo compatible con
los datos experimentales, pero debe observarse como improbado hasta que se haya
verificado con resultados ms exactos. Algunos de estos se aportarn en las siguientes
comunicaciones. Nosotros no ramos conscientes de los detalles de los resultados
presentados cuando ideamos nuestra estructura, que descansa principal aunque no
enteramente sobre datos experimentales ya publicados y argumentos estereoqumicos.
No se escapa a nuestra comunicacin que el emparejamiento especfico que

hemos postulado sugiere inmediatamente un mecanismo copiador para el material
gentico.
Todos los detalles de la estructura, incluyendo las condiciones presumidas para

su construccin, junto con un conjunto de coordenadas para los tomos, se publicarn
con posterioridad.
Estamos en deuda con el Dr. Jerry Donohue por las constantes crticas y
consejos, especialmente sobre distancias interatmicas. Tambin hemos sido
estimulados por el conocimiento general de la naturaleza y los resultados
experimentales inditos as como ideas del Dr. M.H.F. Wilkins, la Dra. R.E. Franklin y
sus colaboradores del King's College, en Londres. Uno de nosotros (J.D.W.) ha sido
subvencionado por una beca de la Fundacin Nacional para la Parlisis Infantil.
J.D. WATSON
F.H.C. CRICK
Medical Research Council Unit for the Study of the Molecular Structure
Biological Systems
Cavendish Laboratory, Cambridge
2 de Abril
(1) Pauling, L. y Corey, R.B., Nature, 171, 346(1953); Proc.U.S.Nat.Sci., 39,

84(1953).
(2) Furberg, S. Acta Chem.Scand., 6, 634 (1952).
(3) Chargaff, e. Para la referencia ver Zamenhof, S., Brawerman, G. y Chargaff, E.,
Biochem. et. Biophys. Acta, 9, 402 (1952).
(4) Wyatt, G.R., J. Gen.Physiol., 36, 201 (1952).
(5) Astbury, W.T., Symp.Soc.Exp.Biol. 1, Nucleic Acid, 66 (Cambridge University

Press, 1947).
(6) Wilkins, M.H.F. y Randall, J.T., Biochim. et Biophys. Acta, 10, 192 (1953).
Responda las siguientes preguntas de acuerdo con el trabajo de Watson y

Crick.
Cul era la opinin de los autores en relacin con lo postulado

por Pauling?
Qu aporto Rosalind Franklin al establecimiento de la estructura
del DNA?
Por qu no es compatible este modelo con la ribosa como azcar
de los nucletidos?
Qu geometra tienen los pares de bases en relacin con la fibra
del DNA?
La representacin de las molculas de los cidos nucleicos en trminos de los

nucletidos constituyentes sera muy difcil por eso se emplean formas
abreviadas de representacin. Una es mediante lneas verticales que
representan la molcula de ribosa o desoxirribosa, el extremo superior
corresponde al carbono 1 y el inferior al carbono 5; los enlaces di ster
fosfato, mediante lneas oblicuas que unen las posiciones correspondientes,
con una P en el medio que representa al grupo fosfato. La letra que
representa las bases se colocan en el extremo superior de la lnea.
Dos formas ms sencillas de representacin se muestran en el siguiente

esquema, en los cuales las letras no indican las bases sino lo nucletidos:
Descargue el siguiente archivo sobre la historia de la bsqueda de la

estructura del DNA:
http://dialnet.unirioja.es/descarga/articulo/719046.pdf
Responda las siguientes preguntas

Qu opinaba Aristteles sobre la herencia?
Qu dice la teora de la epignesis?
Quin fue el primero en aislar DNA?
Cul fue el aporte de Rosalind Franklin al conocimiento de la estructura

del DNA?
Quin oriento a Watson y Crick sobre la forma correcta de los puentes

de hidrgeno en el DNA?
El DNA como material gentico.
Muchos investigadores contribuyeron a demostrar que el DNA era el material

gentico. Algunos de los ms importantes se muestran en el siguiente cuadro:
Etapas en el establecimiento del DNA como el material gentico
Experimento y fecha Algunos detalles Conclusin

Bilogos del siglo XIX La remocin del ncleo Algo en el ncleo de la
produca la muerte celular, clula es responsable de
pero la remocin de la la supervivencia celular.
misma cantidad de
citoplasma no.-
Griffth (1929) Sepas virulentas muertas Algo se transfera de los
de neumococo podan organismos muertos que
transforma sepas no alteraba el fenotipo de las
virulentas en clulas vivas no
microorganismos letales. virulentas.
Avery y MacLeod (1944) Extrajeron DNA de las El DNA es responsable de
cepas virulentas de la transformacin del
neumococo, que al ser fenotipo.
transferido a clulas no
virulentas las
transformaban en
virulentas.
Hershey y Chase (1953) Infectaron E. coli con una El DNA es responsable de
sepa radiactiva de la transformacin del
bacterifago T2 en el cual fenotipo
El fsforo del DNA y el
azufre la protena de
cpsula tambin. Las
bacterias solo mostraban
fsforo radiactivo. Por
tanto solo entuba el DNA,
causante de la
transformacin.-
A continuacin, se muestra en forma grfica el experimento de Griffith.

En sus propias palabras haga una descripcin del experimento y las
conclusiones del mismo.
El siguiente esquema muestra los resultados del experimento de Avery et al:
En sus propias palabras haga una descripcin del experimento y las

conclusiones del mismo.
RNA
A diferencia del DNA el RNA es de cadena sencilla y contiene uracilo en vez
de timina. Su azcar es la ribosa. Hay varios tipos de RNA implicados en la
sntesis de protenas: El RNA mensajero (mRNA) que copia el cdigo gentico
contenido en el DNA, el RNA de transferencia (tRNA), que activa los
aminocidos y los lleva al ribosoma, y el RNA ribosomal (rRNA) que junto con
varias protenas forma le estructura del ribosoma.
El siguiente esquema compara la estructura del DNA y RNA.

RNA mensajero (m RNA)

En el ao 1977, dos grupos de investigadores descubrieron la existencia de
genes discontinuos. Estos genes discontinuos existen en los organismos
superiores, y son as porque la secuencia nucleotdica que codifica para
sintetizar una protena, EXONES no es continua sino que se halla
interrumpida por regiones nucleotidicas no codificantes llamadas INTRONES-
En la fase primaria se trascribe integralmente la secuencia nucleotidca del
DNA al RNA mensajero primario, es decir los INTRONES y tambin los
EXONES. Luego en una segunda fase, se cortan los INTRONES y los
EXONES son soldados de tal manera que se origina una molcula continua.
RNA soluble o de transferencia (s RNA o t RNA)
Hechos importantes sobre el tRNA
Tiene brazos y asas

Hay un tRNA para cada aminocido
Los aminocidos se unen al tRNA mediante enlaces Ester al 3OH del
tRNA
Los tRNA contienen nucletidos con bases raras
Estructura de los tRNA
Estructura primaria: Es una cadena corta de 73 a 93 nucletidos. En el

extremo 3 tiene una secuencia CCA que es reconocida por la enzima
que forma los complejos con los aminocidos.
Estructura secundaria: Tiene forma de hoja de trbol. Contiene tres
regiones (bucles) en que no hay apareamiento de bases. Uno de estos
bucles contiene el anti codn que permite la traduccin de la
informacin.
Estructura terciaria: Puede describirse como en forma de L. La
estructura se mantiene por apareamiento y empilamiento de las bases.
Bases raras que se pueden encontrar en los t RNA
NH2 NH2
H3C
N N
N N
N N
N N
Adeosina Ribosa 1-metiladeosina Ribosa
O
O
N
HN
N
HN H3C
N
N N
N
H2N N H3C Ribosa
Ribosa
Guanosina N2,N2-dimetil guanosina
H
O N O
C C
H2C N
H
O N O C Ribosa
H2
C C
Dihidrouridina
HC N H
C Ribosa O N O
H C C
Uridina N C
C Ribosa
Pseudouridina
RNA ribosomal (rRNA)
El r RNA constituye parte fundamental de la estructura de los ribosomas y en

la actualidad se le atribuye capacidad cataltica en la formacin de enlaces
peptdicos durante la sntesis de protenas.
Replicacin del DNA
MODELOS DE REPLICACIN PROPUESTOS: SEMICONSERVATIVO,

CONSERVATIVO Y DISPERSIVO
Modelo Semiconservativo: Cuando Watson y Crick (1953) propusieron el

modelo de la Doble Hlice indicaron que dicho modelo sugera una forma
sencilla de replicacin. El modelo de replicacin propuesto por Watson y Crick
supona que el ADN doble hlice separa sus dos hebras y cada una sirve de
molde para sintetizar una nueva hebra siguiendo las reglas de
complementariedad de las bases nitrogenadas. Dicho modelo recibi el
nombre de Semiconservativo, ya que las dos dobles hlices recin
sintetizadas poseen una hebra vieja (una mitad vieja) y otra hebra nueva
(mitad nueva).
Frente al modelo Semiconservativo propuesto por Watson y Crick (1953) se

postularon otros posibles modelos de replicacin del ADN, uno de ellos se
denomin Modelo Conservativo y otro Modelo Dispersivo.
Modelo Conservativo: cuando el ADN doble hlice se replica se producen

dos dobles hlices, una de ellas tienen las dos hebras viejas (esta se conserva
intacta) y la otra doble hlice posee ambas hebras nueva originadas por
sntesis.
Modelo Dispersivo: Cuando el ADN doble hlice se replica se originan dos

dobles hlices, cada una de ellas con hebras que poseen tramos viejos y
tramos de nueva sntesis en diferentes proporciones.
A qu modelo corresponde cada uno de los siguientes esquemas, explique por

qu?
Meselson y Stahl (1957) disearon un experimento para tratar de averiguar la

forma en la que se realiza la replicacin del DNA en E. coli. El experimento
consisti en marcar el DNA con nitrgeno pesado (N15), para ello hicieron
crecer las bacterias durante 14 generaciones en un medio que contena como
nica fuente de Nitrgeno N15. La densidad del DNA que crece en (N15) es
mayor del que crece en (N14).
Posteriormente pasaron bacterias que haban crecido en Nitrgeno pesado

(N15) las pasaron a un medio de cultivo que contena N14 (Nitrgeno normal) y
tomaron muestras a diferentes tiempos a distintos tiempos, media generacin,
una generacin, dos generaciones, tres generaciones de replicacin, de las
cuales extrajeron el DNA y lo sometieron a centrifugacin en gradiente de
densidad de CsCl. Los resultados de muestran en la figura siguiente3:
3 Figura tomada de:

http://pendientedemigracion.ucm.es/info/genetica/grupod/Replicacion/Replicacion.h
tm#ModelosReplica
Analice os resultados del experimento y presente sus conclusiones

argumentadas sobre el resultado del mismo.
Modelo bsico de la replicacin del DNA en eucarionticos
De acuerdo con el modelo presentado en el esquema anterior, describa en

sus propias palabras el modelo bsico de replicacin del DNA.
Ingrese a la pgina:
http://sites.fas.harvard.edu/~biotext/animations/replication1.html siga las
animaciones y haga un resumen del proceso de replicacin.
Enzimas implicadas en la replicacin del DNA
Enzima Actividad
Polimerasa, de sntesis en direccin
53.
Exonucleasa 35, remocin de
DNA polimerasa I (no polimeriza nucletidos errneos
DNA, est involucrada en formacin Exonucleasa, 53 que a partir de un
de primers) nick (rompimiento del enlace entre
dos nucletidos vecinos) re sintetiza
una porcin de DNA removiendo la ya
existente
DNA polimerasa II Exonucleasa 35 est involucrada
en procesos de reparacin de DNA.
DNA polimerasa III Es la enzima que realiza el proceso
replicativo, su funcin es la sntesis de
DNA. Tambin cuenta con actividad
revisora, 35 exonucleasa.
Girasa Desempaqueta el DNA, que en
eucariontes se encuentra unido a
protenas y sufre procesos de
enrollamiento que lo hacen
inaccesibles para la DNA Pol III, por
esta razn es necesario su des
enrollamiento para que la replicacin
se pueda llevar a cabo.
Primasa Es la encargada de la sntesis de los
primers. Inicia los fragmentos de
Okazaki.
Helicasa Est encargada de separar la doble

hebra de tal forma que se puedan
formar los primers y luego se lleve a
cabo la replicacin.
Ligasa Une los fragmentos de Okasaki.
En eucariontes la replicacin del DNA es semi discontinua y un direccional

como se muestra en el siguiente esquema:
Sobre el esquema anterior localice los sitios de accin de las enzimas

necesarias para la replicacin del DNA
Catlisis Biolgica
Propsito
En esta unidad el estudiante adquirir destreza en la clasificacin de las
enzimas, en la interpretacin de la cintica enzimtica y el efecto de los
factores qumicos y fsicos que afectan la actividad de las enzimas.
Reconocer las limitaciones dela teora de Michaelis y los aportes de Cleland
a la nueva concepcin de la cintica enzimtica.

1. Explica la diferencia entre reacciones catalizadas y no catalizadas.
2. Clasifica las enzimas de acuerdo con el tipo de reaccin que catalizan
3. Puede determinar los parmetros cinticos a partir de resultados
experimentales.
4. Reconoce el efecto que tiene sobre la actividad enzimtica la
concentracin del sustrato, concentracin de la enzima, presencia de
inhibidores, cambios en la temperatura y en la acidez del medio.
5. Utiliza adecuadamente la nomenclatura de Cleland.
6. Puede postular mecanismos cinticos para cualquier reaccin
enzimtica.
De acuerdo con: Diccionario de la lengua espaola 2005 Espasa-Calpe:

Catlisis es una transformacin qumica activada por cuerpos que al
finalizar la reaccin permanecen inalterados: Las enzimas son
catalizadores biolgicos de naturaleza proteica. Hay segmentos de RNA
con capacidad cataltica denominados Ribozimas.
El trmino enzima se deriva del griego:. .
T1. Qu significado (etimolgico) tiene el trmino enzima
T2. Qu significa catlisis (del griego ) y quin introdujo el

trmino?
Algo de historia
Gnesis 9:18-29
Y los hijos de No que salieron del arca fueron Sem, Cam y Jafet; y Cam es el
padre de Canan. Estos tres son los hijos de No, y de ellos fue llena toda la
tierra.
Despus comenz No a labrar la tierra, y plant una via; y bebi del vino, y
se embriag, y estaba descubierto en medio de su tienda. Y Cam, padre de
Canan, vio la desnudez de su padre, y lo dijo a sus dos hermanos que
estaban afuera. Entonces Sem y Jafet tomaron la ropa, y la pusieron sobre
sus propios hombros, y andando hacia atrs, cubrieron la desnudez de su
padre, teniendo vueltos sus rostros, y as no vieron la desnudez de su padre.
Y despert No de su embriaguez, y supo lo que le haba hecho su hijo ms
joven, y dijo: Maldito sea Canan; Siervo de siervos ser a sus hermanos.
Dijo ms: Bendito por Jehov mi Dios sea Sem, y sea Canan su siervo.
Engrandezca Dios a Jafet, y habite en las tiendas de Sem,Y sea Canan su
siervo.
Y vivi No despus del diluvio trescientos cincuenta aos. Y fueron todos los
das de No novecientos cincuenta aos; y muri.
Hay algo en esta historia narrada por Moiss, algo que pueda considerarse
relacionado con las enzimas?
Algunos hitos importantes en el conocimiento de las enzimas son los

siguientes:
Aunque la historia de las enzimas es muy reciente, algunos

de sus efectos han sido conocidos por la humanidad desde
hace mucho tiempo. En 1835 Berzelius, introduce el trmino
"catlisis" para describir la accin de algunas sustancias que
eran capaces de inducir cambios qumicos sin verse
afectadas o alteradas. Entre las sustancias consideradas
como catalizadores, Berzelius incluy los fermentos (primer
nombre que se les dio a las enzimas).
En 1836, Schwann aisl la pepsina a partir de jugo gstrico,

constituyndose esta en la primera enzima de origen animal
en ser conocida. Schwann y algunos otros afirmaban que la
levadura no era otra cosa que un microrganismo, mientras
que Berzelius lo negaba.
En 1854 Pasteur inicia estudios sobre la fermentacin y

postula errneamente que para este proceso son
indispensables microorganismos vivos.
Hasta 1860 las pocas enzimas conocidas eran de origen

extracelular y se les conoca con el nombre de fermentos
desorganizados; pero en este ao, Berthelot, por
maceracin de levadura y posterior precipitacin, pudo aislar

la "invertasa"(primera enzima intracelular en ser aislada).
En 1878, Khne quien haba aislado la tripsina introdujo el
trmino enzima (del griego: dentro de la levadura)
para los fermentos desorganizados.
Solamente hasta 1897, veinticinco aos despus de la

muerte de Liebing y dos despus de la muerte de Pasteur,
los hermanos Bchner, casualmente, demostraron que la
teora de Pasteur sobre la necesidad de los organismos
vivos para la fermentacin, no era correcta.
En 1933 Payen y Persos publicaron un trabajo en el cual

reportaron el aislamiento, por precipitacin alcohlica de la
sustancia responsable, en la malta, de la transformacin de
almidn en azcar. Aunque ellos no conocan exactamente
la naturaleza del proceso que permita la separacin del
azcar soluble, le dieron el nombre de DIASTASA (del griego
, separacin). Posteriormente la diastasa se
clasific como un "FERMENTO" por ser un compuesto

formado por un organismo vivo, con capacidad para
transformar una sustancia (almidn) en otra (azcar).
Paralelamente con el descubrimiento de las enzimas se

produjeron grandes cambios en la llamada qumica
orgnica. En 1828 Whler demostr que los compuestos
orgnicos se podan sintetizar en el laboratorio al obtener
urea partir de cianuro de amonio.
En 1838 el Holands Mulder le dio el nombre de protena

(del griego: principal, cambiante, variable) a los compuestos
de origen animal y vegetal que contenan grandes
cantidades de nitrgeno. En 1877 Traube propone una
teora de la accin de las enzimas que las asocia por
primera vez con su naturaleza proteica, pero hacia el final
del siglo (1890-1896) Jager y Arthus hacen cambiar el
pensamiento cientfico al negar la naturaleza proteica de las
enzimas. Barendrecht en 1904 sostena que las enzimas
eran compuestos radiactivos y que su accin era el producto
de las radiaciones emitidas.
La dificultad de aislar las enzimas, sin prdida de gran parte

de su actividad, retras enormemente el establecimiento
definitivo de la naturaleza qumica de las enzimas. En la
dcada de los veinte Wuilstater intent la purificacin de
algunas enzimas sin conseguirlo totalmente, llegando a una
conclusin errada, al decir que las enzimas eran
polisacridos.
Mientras que, muchas investigaciones dedicaron sus

esfuerzos al aislamiento de las enzimas, otro grupo no
menos importante estaba dedicado al estudio de las
velocidades de reaccin. En 1902, Brown, al estudiar la
hidrlisis del azcar por la sacarasa encontr que la rapidez
de transformacin era dependiente de la concentracin de
sacarosa y de la concentracin de enzima. En 1903, Henri
analiz matemticamente la rapidez de reaccin enzimtica,
en lo cual se basaron Michaelis y Menten para plantear en
1913 su teora cintica, que implicaba la formacin de un
complejo entre la enzima y el sustrato en condiciones de
estado estable y rapidez inicial.
La primera purificacin enzimtica realmente exitosa fue la

de la ureasa, conseguida por Sumner en 1926, quien
tambin estableci que su enzima cristalizada daba las
reacciones tpicas de las protenas.
En 1930 Northrop consigui cristalizar la pepsina, segunda

enzima en obtenerse pura y cristalina.
En 1966, Phillips, y sus colaboradores presentaron el primer

modelo tridimensional de una enzima, en este caso la
lisosima.
En1967 Cleland reformula la teora cintica sin la limitante

de rapidez inicial.
Cul fu el aporte de Schwann al conocimiento de las enzimas?
A quin se debe la introduccin del trmino enzima?
Payen y Perzos reportaron haber aislado de la malta algo a lo que llamaron

diastasa. Qu era?
Quin aisl por primera vez una enzima en forma cristalina? Cul fue la
enzima cristalizada?
Qu demostraron los hermanos Bchner que contradeca las teoras de

Pasteur?
Clasificacin de las enzimas

De acuerdo con las recomendaciones de la comisin de nomenclatura
enzimtica de la Unin Internacional de Bioqumica (1964) se estableci un
sistema de Numeracin de las enzimas que permite una clasificacin eficiente.
Cada enzima se designa con un cdigo de 4 nmeros separados por puntos,

de acuerdo con los siguientes principios.
El primer nmero indica a cual de las 6 principales divisiones pertenece la

enzima en cuestin. Los seis grupos son:
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Liasas
5. Isomerasas
6. Ligasas
Las liasas son enzimas que remueven grupos de sus sustratos (no por
hidrlisis), dejando dobles enlaces; o inversamente, agregan grupos a dobles
enlaces, las ligasas tambin conocidas como sintetasas, son enzimas que
catalizan la unin de dos molculas a expensas del rompimiento de un enlace
de alta energa.
El segundo nmero indica la subclase. En las oxidorreductasas indica el grupo

que sufre oxidacin (1. designa un grupo carboxilo, 2. un aldehdo o cetona,
etc.); en las transferasas indica la naturaleza del grupo transferido; en las
hidrolasas el tipo de enlace hidrolizado; en las liasas el tipo de enlace que
una el grupo removido; 'en las isomerasas la isomerizacin implicada y para
las ligasas el tipo de enlace formado.
El tercer nmero indica la sub-subclase. En las oxidorreductasas indica el

nmero de aceptor implicado (1. Indica una coenzima, 2. Un citocromo, 3. O 2
molecular, etc.). En las transferasas el tercer nmero subdivide los tipos de
grupos transferidos (indica si el grupo de un carbono es metilo, carboxilo, etc.);

en las fosfotransferasas indica el aceptor. Para la hidrlisis, especfica an
ms el tipo de enlace hidrolizado, para las liasas el grupo removido. En las
isomerasas la naturaleza de la transformacin y en las ligasas la naturaleza de
la sustancia formada. El cuarto nmero es el nmero de serie de la enzima en
su sub-subclase.
Para los detalles de las normas de clasificacin de las enzimas se puede

consultar
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html
Existen dos tipos de nombre para las enzimas, uno sistemtico y otro trivial. El
sistemtico se da de acuerdo con las reglas de nomenclatura que muestra la
accin de la enzima lo mas preciso posible y el trivial, lo suficientemente corto
para su uso comn.
A continuacin se mencionan las caractersticas de las 6 clases der enzimas

segn la UIBBM.
Clase 1 Oxidorreductasas
A esta clase pertenecen todas las enzimas que catalizan reacciones de oxido-
reduccin. El sustrato que se oxida es considerado como dador de
hidrgenos. El nombre sistemtico se dada como dador: aceptor
oxidorreductasa. El nombre trivial ser deshidrogenasa. En las enzimas que
tienen O2 como aceptor se utiliza el nombre oxidasa.
El segundo nmero en el cdigo, excepto si es 11, 13, 14, o 15, indica el grupo
dador que sufre oxidacin, por ejemplo 1 indica que dador es un alcohol, 2 un
aldehdo, cetona o cido, etc. El tercer nmero, en las EC 1.11, 1.13, 1.14 y
1.15 indica el tipo de aceptor: 1 indica NAD o NADP como aceptor, 2 un

citocromo, 3 oxgeno molecular, 4 un desulfuro, 5 una quinona, 6 un grupo
nitrogenado, 7 una sulfo o ferro protena, 8 una flavina
Clase 2 Transferasas.
El nombre sistemtico se forma de acuerdo con dador: aceptor grupo

transferasa. Los nombres comunes se forman mediante grupo dador
transferasa o grupo aceptor transferasa. El segundo nmero del cdigo indica
el grupo transferido. En EC 2.1 el grupo transferido es un grupo de 1 carbono,
en EC 2.2 un aldehdo o cetona, etc. El tercer nmero da ms informacin
sobre el grupo transferido, por ejemplo EC 2.1.1 es una metiltransferasa, EC
2.1.2 es hidroximetil o formiltransferasa. En la EC 2.7 el tercer nmero indica
la naturaleza del aceptor.
Clase 3 Hidrolasas
Estas enzimas catalizan el rompimiento hidroltico de enlaces C-O, C-N, o C-

C. El nombre sistemtico siempre incluye hidrolasa. El nombre comn
generalmente incluye el nombre del sustrato y el sufijo asa. El segundo
nmero en el cdigo indica la naturaleza del enlace hidrolizado, por ejemplo
3.1 son esterasas, 3.2 glicolsilasas. El tercer nmero generalmente indica la
naturaleza del sustrato. EC 3.1.1 son hidrolasas de esteres carboxlicos, EC
3.1.2 son tioester hidrolasas, etc.
Clase 4. Liasas
Las liasas son enzimas que rompen enlaces C-C, C-O. C-N u otros enlaces
por eliminacin de tomos o radicales, dejando dobles enlaces o lo contrario.
El nombre sistemtico se forma en la siguiente forma: sustrato grupo-liasa, el
guion es una parte importante del nombre, por ejemplo hidro-liasa. Los
nombres comunes usualmente incluyen los trminos: decarbolxilasa, aldolasa,
deshidratasa. El segundo nmero del cdigo indica el enlace roto. EC 4.1 son
carbn-carbn liasas, EC 4.2 son carbono-oxgeno liasas. El tercer nmero del
cdigo da ms informacin sobre el grupo eliminado. Por ejemplo CO 2 en EC
4.1.1, H2O en EC 4.2.1
Clase 5 Isomerasas
Estas enzimas catalizan cambios estructurales o geomtricos dentro de una

molcula. De acuerdo con el tipo de isomerismo se designan como:
racemasas, epimerasas, cis-trans isomerasas, tautomerasas, mutasas, o,
cicloisomerasas. Las subclases se forman de acuerdo con el tipo de
isomerismo y las sub subclases segn el tipo de sustrato.
Clase 6 Ligasas
Las ligasas son enzimas que unen dos molculas acompaada por la
hidrlisis de un enlace anhdrido de un nucletido trifosfato Se recomienda
evitar el uso del termino sintetasa y remplazarlo por X Y ligasa. El termino
sintasa se utiliza para reacciones complejas de sntesis que utilizan dadores d
energa diferentes a los nucletidos trifosfato
Para ver las normas completas sobre nomenclatura enzimtica consultar:

http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
Algunas definiciones importantes

En Enzimologa son de uso general algunos trminos que es conveniente

definir antes de profundizar en el tema.
Enzima: Una protena con propiedades catalticas debido a su capacidad de

activacin especfica.
Sustrato: Sustancia sobre la que acta la enzima y que es activada por sta.
Sitio activo: Lugar especfico de la enzima en la cual el sustrato se une y en

donde tiene lugar el proceso activacin y catlisis.
Contante de Michaelis: (Ka): Medida de afinidad entre la enzima y su sustrato

que numricamente es igual a la cantidad de sustrato que produce una
rapidez inicial (Vo) igual a la mitad de la rapidez mxima (Vm).
Inhibidor: Sustancias que sin tomar parte en la reaccin disminuyen su

rapidez.
Energa de activacin
Realizar una reaccin qumica usualmente requiere el suministro de energa

externa, es algo similar a lo que ocurre lo que se ilustra en el siguiente
esquema, cuando se quiere hacer llegar la piedra del punto A al punto B.
Existe una barrera que impide el libre paso de A a B, para poder hacerlo el
operario debe aplicar una fuera que permita llevar la piedra hasta la mxima
altura, desde la cual la piedra. Con igual probabilidad puede ir a B o regresar a
A,
Qu solucin propone usted para disminuir la energa necesaria para hacer
llegar la piedra de A a B?
Eh las reacciones qumicas el parmetro que se opone a que ocurran
libremente se denomina Energa de activacin
La diferencia energtica entre el nivel de los reactivos y los productos se

denomina cambio en energa libre (G). Las enzimas disminuyen la energa
de activacin necesaria para que la reaccin pueda ocurrir. Las enzimas
solamente alteran algunos parmetros de las reacciones catalizadas por ellas.
Segn La grfica anterior que parmetros modifican las enzimas?
Interpretacin de la constante de Michaelis
La rapidez y la velocidad tienen la misma definicin matemtica:
(1)
Qu diferencia hay entre velocidad y rapidez?
Qu termino debe aplicarse a las reacciones qumicas?
Bajo el supuesto que una enzima acta de acuerdo al siguiente modelo:

(2)
Para obtener una ecuacin para el comportamiento de las reacciones
enzimticas, Michaelis y Menten postularon la posibilidad de estudiarlas bajo
las condiciones de rapidez inicial y estado estable de la concentracin del
complejo enzima sustrato (EA).
Qu se entiende por Rapidez Inicial y por Estado Estable
Qu modificacin debe hacerse al mecanismo (2) para que rija la condicin

de rapidez inicial y por qu?
Bajo condiciones de estado estable y rapidez inicial, Michaelis y Menten,

dedujeron la siguiente ecuacin papa la rapidez de las reacciones enzimticas
(3)
Si se define rapidez mxima de la reaccin (Vm) como:

Vm = k3. Et (4)
Otra forma de expresar la ecuacin de Michaelis es:
(5)
Al representar Vo en funcin de [A], se obtiene una rama de hiprbola

desplazada al origen
A partir de la ecuacin (5) establezca el valor de Ka en la siguiente forma:
Ka.[A]=
Ka =
Cuando Vo = Vm
Ka =
Establezca definiciones operativas de Ka y Vm
Ka es:
Vm es:
Formule matemticamente la condicin de estado estable para la

concentracin del complejo enzima sustrato (rapidez de formacin = rapidez
de desaparicin). Recuerde que rapidez es igual a las constantes de rapidez
implicadas multiplicadas por los trminos de concentracin correspondientes
Vf de [EA] =
Vd de [EA] =
En estado estable de [EA]: Vf de [EA] = Vd de [EA]
Curvas de Progreso
La rapidez de reaccin se obtiene a partir de la pendiente de las tangentes a

curvas de progreso (cambio en concentracin de sustrato o de producto en
funcin del tiempo).
La grfica muestra las curvas de progreso para los siguientes resultados
experimentales
Tabla 18 Resultados experimentales de una curva de progreso

tiempo micro moles micro moles
segundos sustrato producto
0 100 0
5 90,0 10,0
10 81,0 19,0
15 72,9 27,1
20 65,6 34,4
25 59,0 41,0
30 53,1 46,9
35 47,8 52,2
40 43,0 57,0
45 38,7 61,3
60 34,9 65,1
Determine la rapidez inicial a partir de la curva de progreso (pendiente dela

tangente en el origen)
La nomenclatura de Cleland
De acuerdo con el sistema de nomenclatura de Cleland, los sustratos se

designan con las primeras letras maysculas del alfabeto: A, B, C, etc.
teniendo en cuenta el orden alfabtico para indicar el orden de adicin de los
sustratos a la enzima. Los productos se designan por las letras P, Q, R. etc.,
en donde el orden alfabtico indica el de liberacin de los productos.
Por formas enzimticas se entiende la enzima libre o asociaciones de la

enzima (Complejos) con sustratos, productos, sustratos y productos,
activadores e inhibidores. Las formas enzimticas corresponden a la enzima
libre o a diferentes designa como: E, E, E, etc., en forma tal que E designa la
forma ms simple o enzima libre.
Las formas enzimticas capaces de reacciones un moleculares con liberacin

de un sustrato o producto, o de isomerizarse a tales formas se designan como
complejos transitorios y se representan mediante las combinaciones
apropiadas de letras, tales como: EA, EAB, EQ, etc. Los complejos
transitorios que no pueden participar en reacciones bi moleculares y que
nicamente pueden sufrir degradacin un molecular para liberar sustratos o
productos, o de isomerizarse a tales formas, se designan complejos centrales
y se distinguen de los transitorios incluyndolos en parntesis, por ejemplo:
(EAB), (EPQ), etc.
El nmero de sustratos y productos determina en parte el nombre del sistema,
en tal forma que se emplearan los trminos UNI, BI, TER, etc., para designar
la participacin de uno, dos o tres sustratos o productos, en consecuencia la
designacin de un determinado mecanismo cintico podr ser: UNI-UNI, UNI-
BI, BI-UNI, BI-BI, etc.
En los mecanismos cinticos postulados por Cleland, la enzima se representa

como una lnea horizontal, los productos como flechas que llegan y los
productos como flechas que se alejan de esta lnea.
Cuando todos los sustratos se unen al sitio activo de la enzima antes de que
se libere alguno de los productos, se dice que el mecanismo es
SECUENCIAL; mientras que si es posible la adicin de sustratos y la
liberacin de productos en forma alternada, se dice que se trata de un
mecanismo PING-PONG, en este mecanismo la enzima oscila entre dos
formas enzimticas diferentes ( E ) y ( E ).
Los mecanismos secuenciales pueden ser ORDENADOS, cuando hay un
orden obligatorio en la adicin de sustratos, o ALEATORIOS cuando
cualquiera de los sustratos se puede unir primero a la enzima.
Mecanismo secuencial ordenado

Mecanismo secuencial aleatorio
Mecanismo ping-pong
De acuerdo con la nomenclatura de Cleland qu diferencia hay entre

complejos transitorios y centrales?
Con ejemplos reales ilustre los mecanismos cinticos tipo,
Uni-Uni Bi-Bi.
.
Represente los tres mecanismos cinticos que podra presentar la alanina:

oxalacetato aminotransferasa (Alanina + oxalacetato piruvato + aspartato).
Secuencial ordenado
Secuencial aleatorio
Ping-pong
De acuerdo con lo planeado por Cleland para un mecanismo Uni Uni, la

rapidez en cualquier momento de la reaccin esta dada por:
Determinacin de los parmetros cinticos de reacciones enzimticas
Los parmetros cinticos se pueden evaluar por diferentes mtodos grficos.

Los ms conocidos son:
Ecuacin Grfico
Sistema de Henri (Michaelis)

Vm . A
vo
Ka A
1
Sistema de LINEWEAVER - BURK vo
1 K 1 1
a
v o Vm A Vm
1
[A]
Sistema de HANES [A]
A vo
1 K
A a
vo Vm Vm
[A]
Sistema de HOFSTEE vo
vo
vo Ka Vm
A
vo
[A]
Sistema de
vo
EISENTHAL Y
CORNISH-
Vm
BOWDEN
Vm K a
1
v A
-[A] Ka
Cada recta se construye a partir de un par de puntos (-A y Vo). En este sistema la
constante de Michaelis y la rapidez mxima se estiman mediante la mediana de los estimativos de
estos parmetros (proyeccin de los puntos de corte de las distintas rectas sobre los respectivos
ejes). El nmero de posibles intersecciones en un grfico de Eisenthal es:
n
N int er secciones ( n 1)
2
Matemticamente se puede estimar los parmetros al resolver el siguiente sistema
de ecuaciones simultaneas:
1 1

v 2 v1
Ka
1 1 1 1
. .
A 2 v 1 A 1 V2
1 1

A 2 A1
Vm
1 1 1 1
. .
A 2 v 1 A 1 V2
Complete el siguiente cuadro relacionado con las ecuaciones resultantes de la

linearizacin de la ecuacin de Michaelis.
Mtodo Pendiente Interseccin Ka Vm
Lineweaver
Hanes
Hofstee
Determine los valores de Ka y Vm mediante los diferentes sistemas de

linearizacin de la ecuacin de Michaelis a partir de los siguientes datos:
A Vo 1/A 1/Vo A/Vo Vo/A

0 0,0
10 28,6
20 44,4
30 54,5
40 61,5
50 66,7
60 70,6
70 73,7
80 76,2
90 78,3
100 80,0
Inhibidores
Los inhibidores son sustancias qumicas que disminuyen la rapidez de las

reacciones enzimticas. Cleland clasifica los inhibidores de acuerdo con la
manera como el inhibidor se une a diferentes formas enzimticas, de acuerdo
con este principio hay tres tipos de inhibidores., Competitivo (se une a la
enzima libre), A competitivo (se une al complejo enzima sustrato), No
competitivo (se une tanto a la enzima libre como al complejo enzima sustrato)
Cleland establece dos reglas bsicas para la unin de ligandos a las enzimas:
Si el ligando se une a la misma forma enzimtica con la que lo hace la enzima,
se afecta la pendiente de las grficas de doble recproco; si se une a diferente
forma enzimtica, se afecta la interseccin vertical.
Inhibicin Competitiva
Inhibicin A competitiva
( EA EP ) E
E EA
EAI
I
Inhibicin NO competitiva
P
A
( EA EP ) E
EA
EAI
E EI
I
I
Represente los grficos de doble recproco de los tres tipos de inhibidor
TIPO DE GRFICO
INHIBIDOR
Competitivo
A competitivo
No competitivo
Complete el siguiente cuadro relacionado con las grficas de doble inverso de

los inhibidores enzimticos.
Tipo de inhibidor Pendiente Interseccin
Competitivo
A competitivo
No competitivo
Segn Cleland existen dos constantes de inhibicin: Kis (afecta la pendiente

de grficas de doble recproco y Kii (afecta la interseccin de grficas de doble
recproco). Las constantes de estiman mediante grficos de la pendiente o
interseccin de las rectas a diferentes concentraciones de inhibidor, en funcin
de la concentracin de inhibidor.
Las constantes de inhibicin (Kis (constante de inhibicin que afecta la

pendiente) y Kii (constante de inhibicin que afecta la interseccin) se calculan
a partir de grficas de pendiente o interseccin en funcin de la concentracin
de inhibidor. El punto de corte de la prolongacin de la recta con el eje
horizontal corresponde a Kis o Kii.
Determine el tipo de inhibidor y la(s) constante(s) de inhibicin a partir de los

datos contenidos en la tabla siguiente.
Tabla 19. Datos para el clculo del tipo de inhibidor

[I] nm
0 10 20 30
Vo moles / minuto
[A] mM V0 V10 V20 V30
0 0 0 0 0
1 100.0 66.7 50.0 40.0
2 133.3 88.9 66.7 53.3
3 150.0 100.0 75.0 60.0
4 160.0 106.7 80.0 64.0
5 166.7 111.1 83.3 66.7
6 171.4 114.3 85.7 68.6
7 175.0 116.7 87.5 70.0
8 177.8 118.5 88.9 71.1
9 180.0 120.0 90.0 72.0
10 181.8 121.2 90.9 72.7
Autorregulacin
No todas las enzimas siguen el comportamiento hiperblico descrito por

Michaelis y Menten Se ha encontrado que algunas enzimas tienen
comportamiento sigmoidea, similar a las curvas de saturacin de la
hemoglobina con el oxgeno. Estos fenmenos se denominan cooperativos en
la unin de ligandos. Una medida de la cooperatividad es el coeficiente de Hill.
Un coeficiente de 1 indica que no hay cooperatividad, si es mayor que 1 hay
cooperatividad positiva (es decir que la unin de un ligando facilita la uni de
mas ligandos)
Figura 53. Curva de disociacin de la hemoglobina
Los factores que inciden en la regulacin enzimtica se reflejan en los

trminos de la ecuacin de rapidez de las reacciones enzimticas.
Bajo el supuesto que la enzima se encuentre regida por la ecuacin de

Michaelis, los posibles factores que afectan la actividad son:
( 3 ) ( 4 ) (1)
k 3 Et . A

V

Ka A
( 2 ) (1)
Tabla 20. Factores que afectan la actividad de las enzimas

(1) Saturacin de la enzima
Sin cooperatividad
Autorregulacin
Con cooperatividad
(2) Afinidad de la enzima
Inhibicin competitiva isostrica con el
producto, regulacin alostrica tipo K
Modificacin fsica de la enzima Interaccin enzima iones inorgnicos
Interaccin enzima metabolito (efector)
Interaccin enzima protena
Modificacin qumica de la enzima Activacin Inactivacin
(3) Actividad de la enzima
Modificacin qumica de la enzima Activacin Inactivacin
Regulacin tipo V
Interaccin enzima iones inorgnicos
Modificacin fsica de la enzima
Interaccin enzima metabolito (
Interaccin enzima protena
(4) Concentracin de la enzima
Induccin por sustrato
Sntesis de la enzima
Represin por producto
Degradacin de la enzima Protelisis controlada
Modificacin de la enzima Protelisis limitada
Los componentes del orden de reaccin son diferentes en las reacciones

catalizadas por enzimas de cintica sigmoidea y de cintica hiperblica.
En contraste con la cintica hiperblica en que la reaccin en funcin de la

concentracin de sustrato se comporta inicialmente como de orden uno, luego
como de orden fraccionario y finalmente como de orden cero, existen enzimas
que presentan cintica sigmoidea cuyo comportamiento es orden cero, orden

fraccionario, orden uno, orden fraccionario y orden cero.
Si se tiene en cuenta el ndice de cooperatividad (n), que es una funcin del

nmero de sitios de fijacin o de subunidades, la ecuacin de rapidez puede
establecerse como:
k 3 Et
. A
n
V
K 0,5 n A n
La sensibilidad de las enzimas a la autorregulacin se expresa mediante el

valor R, definido como la cantidad de veces que hay que aumentar el sustrato
para pasar de un 10% de la rapidez mxima a un 90% de la rapidez mxima:
A 0,9 V
R
A 0,1V
La grfica y el cuadro siguientes, muestran los valores de R para enzimas con

diferente tipo de cooperatividad:
100
90
80
70
60
n=1
50
n=2
40 n=3
30 n=4
20
10
0
0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280
Tabla 21 Tipo de cintica enzimtica segn el ndice de cooperatividad y

sensibilidad de la enzima a la regulacin
Tipo de enzima n R
Hiperblica 1 81
Sigmoidea 2 9
Sigmoidea 3 4,3
Sigmoidea 4 3
De los datos anteriores es evidente que las enzimas de cintica hiperblica

son muy poco sensibles a la autorregulacin, puesto que mientras una enzima
sigmoidea con ndice de cooperatividad 4, solamente requiere triplicar la
concentracin de sustrato para pasar de una rapidez del 10% de la mxima a
una rapidez del 90% de la mxima, la de cintica hiperblica debe aumentar la
concentracin 81 veces.
En el ejemplo anterior la constante de Michaelis o la de semisaturacin (para

las sigmoides) es de 20 unidades de sustrato.
La zona ms sensible a la autorregulacin se encuentra en concentraciones

de sustrato comprendidas entre 0,5 y 1,25 Ka
En algunos sistemas enzimticos el producto ejerce una actividad inhibitoria

(competitiva) sobre la reaccin enzimtica (inhibicin isostrica).
Cuando el producto ejerce inhibicin competitiva sobre la enzima, en

presencia del sustrato es necesaria mucha mayor concentracin del sustrato
para conseguir la misma rapidez que en ausencia del producto, al disminuir la
afinidad entre la enzima y el sustrato.
Cuando la concentracin de sustrato (X) aumenta, la rapidez de reaccin

aumenta. Al aumentar la de producto (Y), la rapidez de reaccin disminuye, en
esta forma, el sistema se constituye en un circuito de regulacin sencillo.
Compuestos que no estn relacionadas estructuralmente con los sustratos

pueden modificar la actividad de las enzimas al fijarse en sitios diferentes al
sitio activo (sitio alostrico) y producir cambios conformacionales que afecten
la afinidad de la enzima y el sustrato (regulacin tipo K).
Los ligandos que modifican alostricamente la actividad de las enzimas

pueden hacerlo mediante un incremento de la afinidad (efectores positivos) o
mediante una disminucin (efectores negativos).
Cuando la concentracin de sustrato se mantiene constante la rapidez efectiva

de la reaccin se modifica grandemente en presencia de los efectores, ya
sean estos positivos ( + ) o negativos ( - ). Los positivos acercan el
comportamiento sigmoideo al hiperblico y los negativos incrementan la
sigmoideisidad.
Debido a la presencia simultanea de ATP y ADP en casi todos los sistemas

celulares la regulacin de la actividad de muchas reacciones depende de la
relacin entre ATP / ADP.
Atkinson postul como elemento de gran importancia en el control del

metabolismo la carga energtica, la cual defini como:
Carga Energetica
ATP 0,5ADP
ATP ADP AMP
El valor de la carga energtica vara entre 1, cuando solamente hay ATP y

cero cuando solamente se encuentra AMP.
Cuanto menor sea la carga energtica, mayor ser la tendencia a realizar

catabolismo y menor anabolismo y cuanto ms se aproxime a uno la carga
energtica, mayor ser el anabolismo y menor el catabolismo In vivo, cuando
la carga energtica es 0,8 se tiende al equilibrio entre anabolismo y
catabolismo.
Las enzimas regulables pueden ser modificadas qumicamente por otras

enzimas, caso en el cual, ms que la afinidad se afecta la actividad (regulacin
alostrica tipo V).
El efecto de la concentracin del efector sobre la rapidez de la reaccin puede

observarse en el siguiente grfico.
Como puede observarse, en ausencia del efector la reaccin prcticamente no

ocurre, pero a medida que se incrementa su concentracin, tiende a obtenerse
la rapidez mxima.
Algunas enzimas claves del metabolismo pueden ser reguladas por

modificaciones catalizadas por otras enzimas.
Los modelos de regulacin deben estar diseados para producir adaptaciones

rpidas o lentas. Las diferentes tareas de regulacin se cumplen mediante
diferentes estrategias. Los procesos para adaptacin inmediata generalmente
son de carcter fsico, mientras que los de adaptacin rpida o lenta lo son
qumicos.
ADECUACIN
Modificacin Modificacin Qumica
Fsica
Elemento de Inmediata Rpida Lenta
mando
[A] Autorregulacin
Proteo gnesis
[ Et ] Protelisis
controlada
Activacin -
Regulacin Inactivacin
K3
alostrica tipo V controlada por
enzimas
Regulacin
Ka
alostrica tipo K
En todo conjunto de reacciones coordinadas, existe por lo menos una enzima

limitante de la rapidez de la va, la cual usualmente es objeto de un proceso de
regulacin. Cuando un sustrato puede metabolizarse por dos vas diferentes, a
igualdad de actividad (Vm) la enzima con mayor afinidad (menor Ka)
metaboliza ms sustrato. A igualdad de afinidad, sintetiza ms sustrato aquella
con mayor actividad.
catalizadas por enzimas de cintica sigmoidea y de cintica hiperblica. En
contraste con la cintica hiperblica en que la reaccin en funcin de la
concentracin de sustrato se comporta inicialmente ( I ) como de orden uno,
luego ( II )como de orden fraccionario y finalmente ( III ) como de orden cero,
existen enzimas que presentan cintica sigmoidea cuyo comportamiento es
orden cero, orden fraccionario, orden uno, orden fraccionario y orden cero,
este comportamiento es tpico de as enzimas alostricas.
Subsistema Procesador
Propsito
En esta unidad el estudiante inicia el estudio del subsistema procesador,

comprender que los procesos metablicos siguen patrones caractersticos y
estn constituidos por modelos de reaccin que se utilizan en diferentes
procesos. Discutir los mecanismos de transduccin de energa tanto
oxignicos como anoxignicos y los modelos de biosntesis de molculas no
informacionales
1. Diferencia los procesos metablicos de otros que pueden ocurrir en los
organismos vivos.
2. Compara las caractersticas del anabolismo y catabolismo desde el punto
de vista energtico.
3. Describe los modelos de:
3.1. Activacin.
3.2. Oxidacin.
3.3. Transferencia de fosforilos.
3.4. Eliminacin de grupos amino.
3.5. Isomerizacin.
3.6. Ruptura de enlaces carbono carbono.
3.7. Formacin no oxidativa de dobles enlaces.
3.8. Utilizacin de unidades de un carbono.
3.9. Polimerizacin.
4. Combina apropiadamente los modelos de procesamiento para cumplir un
propsito metablico.
Generalidades
El metabolismo, (del griego. , cambio, e ismo), es el conjunto de
reacciones qumicas que ocurren en el interior de la clula para realizar las
transducciones de energa y las transformaciones de la materia necesarias
para el mantenimiento de la vida. En general se describen dos fases del
metabolismo: Anabolismo y catabolismo-
Observe las siguientes figuras, la primera se le puede describir con el termino
cata (del gr. ) y la segunda con ana (del gr. )
T1. De acuerdo con las figuras, Cmo interpreta usted los trminos
catabolismo y anabolismo?
T2. Los trminos anabolismo y catabolismo estn asociados con la

energa en los seres vivos, De qu naturaleza son estos cambios d
energa durante los dos procesos? Cul seria el cambio neto en
energa libre (G) en los dos procesos?
Las clulas realizan los procesos metablicos mediante un repertorio limitado

de reacciones qumicas, que organizadas adecuadamente constituyen las
llamada vas metablicas. El anlisis de los procesos metablicos ha permitido
establecer unos pocos modelos de procesamiento bioqumico que al
combinarse, con el fin de cumplir un objetivo especfico, permiten una gran

cantidad de procesos metablicos.
T3 De acuerdo con el esquema anterior Dnde estn involucrados el

anabolismo y el catabolismo?
Diseo de vas metablicas

El metabolismo no ocurre mediante reacciones aisladas, sino que son son
secuencias de reacciones, en las cuales el producto de una es el sustrato de
la siguiente. Diferentes autores han construido mapas de las vas metablicas,
unos relativamente simples como la;
http://home.wxs.nl/~pvsanten/mmp/main.htm , otras muy completas como la
que se encuentra en: http://web.expasy.org/pathways/ que incluye un buscador
por enzimas o compuestos. Un mapa de uso muy fcil lo encuentra en:
http://ull.chemistry.uakron.edu/Pathways/index.html presenta un men muy
simple con los nombres de los procesos, al hacer click sobre el nombre se
despliega el mapa correspondiente al proceso, y dentro del mapa al sealar
las flechas aparecen las reacciones detalladas.
Tipos de vas metablicas

Por la forma en que se inter relacionan las reacciones hay varios tipos de vas
principales:
Lineales, por ejemplo, la gliclisis, Tienen bien definido el sustrato
inicial y el producto final.
En espiral, por ejemplo la beta oxidacin de los cidos grasos. Varias
reacciones, catalizadas por las mismas enzimas, se repiten sobre
sustratos semejantes.
Cclicas, por ejemplo, el Ciclo de Krebs. Hay un compuesto que
abastece el proceso y un aceptor que lo recibe. Algunas reacciones
liberan productos y otras estn destinadas a regenerar el aceptor
En cascada, por ejemplo, las cascadas de regulacin de la
Glucogenognesis y glucogenlisis. El producto de una va tiene
capacidad para activar o inhibir una enzima de otro proceso diferente.
T1. De acuerdo con la informacin anterior, complete el siguiente cuadro

Representacin Tipo de va
En http://www.genome.jp/kegg/pathway.html encontrara una coleccin

completa de los mapas metablicos y gran cantidad de informacin
relacionada con las enzimas respectivas.
En: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2238879/ encontrara un

artculo sobre la utilizacin de la base de datos KEGG.
Cmo se disean las vas metablicas

Para disear una va metablica es necesario establecer claramente:
Objetivo general del proceso
Sustrato inicial con sus caractersticas en cuanto:
o Nmero de carbonos
o Estado de oxidacin
o Modelo de activacin o adaptacin a emplear
Producto final con sus caractersticas en cuanto:
o Nmero de carbonos
o Estado de oxidacin
o Presencia o ausencia del activador
Posibilidad de formacin de CO2
Tipos de oxidantes empleados (s estn involucrados procesos
oxidativos)
Mecanismos de recuperacin de oxidantes.
Tipo de va metablica ms conveniente
Procesos metablicos que deben ocurrir para cumplir el objetivo
Consulte con alguna de las referencias citada los siguientes procesos y
determine que tipo de va metablica siguen: Degradacin de glucgeno, Va
de las pentosas fosfato, Formacin de urea, Sntesis de cidos grasos.
Activacin
Para que los sustratos puedan ser utilizados por la clula como fuente de
energa, estos deben estar activos o adaptados.
Monosacridos
La reaccin de activacin pata la glucosa es la siguiente:
T1. Observe la reaccin y responda las siguientes preguntas:

En qu carbono de la glucosa ocurre el cambio?
Qu funcin aparece en la glucosa activada?
Qu tipo de alcohol era aquel donde ocurri el cambio?
A qu clase pertenece la enzima que cataliza la reaccin?
Cmo se forma el nombre corriente de la enzima?}
Cul seria el nombre sistemtico de la enzima y su nmero E.C.?
Si el monosacrido a activar fuera la ribosa.
Cul sera el producto activo?
Cmo se llamara la enzima activadora?
Cul seria el nombre corriente y el sistemtico de la enzima y cul su
nmero E.C.?
(Consulte: http://www.brenda-enzymes.info/)
El proceso de activacin se describe en trminos de sustrato a activar,
activador, enzima activadora y producto activo. Loa sustratos a activar son:
monosacridos, cidos grasos glicerol y aminocidos. Para cada uno de estos
sustratos existe un modelo de activacin especfico.
La activacin de los monosacridos procede de acuerdo con el siguiente

modelo:
Para la glucosa sera:

T2. Complete los siguientes esquemas de activacin

Heptulosa
Eritrosa
Glicerol (no es un monosacrido pero sigue el modelo de activacin de los

monosacridos)
Galactosa (el ster fosfrico excepcionalmente se forma en C1 y no en C6)
cidos grasos
La activacin del cido palmtico se muestra en el siguiente esquema:

T3. Observe la reaccin y responda las siguientes preguntas

En qu carbono del cido palmtico ocurre el cambio?
Qu funcin aparece en el cido palmtico activo?
Qu papel desempea el ATP en la reaccin?
A qu clase pertenece la enzima que cataliza la reaccin?
Cmo se forma el nombre corriente de la enzima?
Cul seria el nombre sistemtico de la enzima y su nmero E.C.? (Consulte:
http://www.brenda-enzymes.info/)
La enzima que activa los cidos grasos es inespecfica para el nmero de

carbonos del cido y funciona para cidos de 4 a 20 carbonos,
La activacin de los cidos grasos procede de acuerdo con el siguiente
modelo:
En el caso del cido palmtico el esquema sera el siguiente
La coenzima A es un derivado del cido pantotnico (vitamina B5)
H3C
CH3
HO C HN CH2 O
C
H2 CH C H2C C
HO O OH
cido pantotnico
H2
H C
O N
C SH
C H2
H2C
CH2 HO
CH CH3
HN
C C
O OH
H3C C
O H2 P
N CH
O O
H2N C N
O
P
C C O
O OH
N N CH2
CH CH
C
H
CH CH
HO OH
Coenzima A
T4. Complete el siguiente esquema para el cido dodecanoico
Aminocidos
Los aminocidos no tienen un proceso de activacin sino de adaptacin
consistente en la remocin del grupo amino y su remplazo por un grupo ceto.
Este proceso puede ocurrir en tres formas diferentes:
Transaminacin
Desaminacin oxidativa
Desaminacin no oxidativa
La adaptacin de los aminocidos al metabolismo se hace por remocin del

grupo amino y su remplazo con un grupo ceto
Represente las formas adaptadas al catabolismo de los aminocidos

NH2
H2
HO C CH OH
C C C
H2
O O
Glutmico -cetoglutrico
O
H2
C C OH
HO CH C
NH2 O
Asprtico Oxalactico
O
C OH
H3 C CH
NH2
Alanina Pirvico
Los aminocidos se pueden adaptar mediante diferentes modelos a saber:

Transaminacin, desaminacin oxidativa y desaminacin no oxidativa.
Transaminacin
Para el proceso de transaminacin es indispensable el fosfato de piridoxal,
derivado de la piridoxina (vitamina B6), el cual se transforma en fosfato de
piridoxamina
OH OH
HO P O HC N HO P O HC N
H2C C C CH3 O H2C C C CH3

O
C C C C
O CH OH H2N CH2 OH
Fosfato de piridoxal Fosfato de piridoxamina
aminocido 1 Piridoxal-P aminocido 2
Transaminasa
cetocido 1 Piridoxamina-P cetocido 2
T5. A qu clase pertenece la enzima que cataliza la reaccin?

T6. Utilice el modelo anterior para la transferencia del grupo amino de la

alanina al - cetoglutrico. Incluya la enzima correspondiente
Desaminacin no oxidativa
La desaminacin no oxidativa solo ocurre en hidroxi aminocidos y
ocasionalmente con la cistena. La desaminacin se hace mediante un
proceso de deshidratacin y rehidratacin dependiente de una liasa. El
proceso tiene como intermediario un aminocido con radical no saturado el
cual se transforma en iminocido- El iminocido se rehidrata, se forma un
cetocido y se elimina el grupo amino en forma de amoniaco-
:
T7. De acuerdo con el modelo anterior represente al desaminacin no
oxidativa de la treonina
O
C OH
H2N CH
CH CH3
HO
T8. A qu clase pertenece la enzima que cataliza la reaccin?

Desaminacin oxidativa
La desaminacin oxidativa ocurre nicamente con el cido glutmico este
proceso permite la eliminacin del grupo amino del glutmico en forma de
amoniaco. El agente oxidante es el NAD+ (nicotinamida adenina dinucletido)
derivado de la niacina (Vitamina B3). La enzima que cataliza esta reaccin es
la glutamato deshidrogenasa
N CH
H2N C N HO
OH
OH
C C CH CH O
CH CH H
N N OH O CH C C
CH CH C NH2
C HO O N+
H HO P
O CH O
HC CH
P O C
O
H
O
NAD+
La reaccin de desaminacin oxidativa del glutamato es:

HO HO
C O C O
NAD+ NADH + H+
H2N CH O C
CH2 CH2
H2C H2C
C O NH3 C O
HO HO
Glutmico -cetoglutrico
T9, A qu clase pertenece la enzima que cataliza la reaccin?

Cul seria el nombre sistemtico de la enzima y su nmero E.C.?
Qu reacciones deben acoplarse para la eliminacin definitiva, en forma de
amoniaco, del grupo amino de la alanina?
(Consulte: http://www.brenda-enzymes.info/)
Modelo de oxidacin biolgica

A pesar de que el termino oxidacin antiguamente se empleaba para indicar la
combinacin de un elemento con oxgeno, en la actualidad hace referencia a
la perdida de electrones de un compuesto. Un compuesto al oxidarse
transfiere electrones, el cual al recibirlos se reduce. Las formas oxidada y
reducida de un compuesto se denominan par redox.
A reducido B oxidado
A oxidado B reducido
Suponga que A en su forma reducida ( representa un electrn) va a ser
oxidado por el oxidante B oxidado, en la reaccin B se reducir al ganar el
electrn que estaba en A oxidado. Cuando estos electrones se transfieren al
aceptor final de electrones de la cadena respiratoria, se libera energa, parte
de la cual, puede ser utilizada para la formacin de ATP y el resto disipada en
forma de calor.
T1. De acuerdo con el esquema anterior, Cuntas molculas de B ox se

requieren para oxidar completamente 100 molculas de A red?
Si el modelo de oxidacin se limitara al descrito anteriormente para Ared, este

sera tremendamente ineficiente puesto que requerira tantas molculas del
oxidante como las que se quieren oxidar. La oxidacin en las clulas ocurre
mediante cadenas de reacciones que utilizan un oxidante final de bajo costo
energtico. (Cox en el siguiente esquema).
A reducido B oxidado Z reducido
A oxidado B reducido Z oxidado

T2. Cuntas molculas de B oxidado y de Z oxidado se requieren para
oxidar completamente 200 molculas de A reducido?
Los oxidantes biolgicos generalmente contienen en su estructura derivados

de vitaminas.
Potencial redox
El potencial redox mide la tendencia a ceder electrones. Un compuesto solo
puede oxidar a otro que tenga menor potencial redox (ms negativo o menos
positivo), y solo podr reducir a otro que tenga potencial redox menos positivo
o ms negativo.
La escala de potenciales redox tiene como referencia el par H / H+, al cual se

atribuye un potencial redox de 0,0 voltios En una cadena redox los pares se
organizan de potencial ms negativo a menos positivo al de potencial ms
positivo o menos negativo.
En la siguiente tabla se incluyen algunos de los potenciales redox de pares

biolgicamente importantes.
Tabla 1 Potenciales redox de algunos compuestos de importancia biolgica

Pares redox Eo Voltios
H2O / O2 0,82
NO2- / NO3- 0,42
Cit a Fe2+ /Fe3+ 0,29
Cit c Fe2+ /Fe3+ 0,22
Hemoglobina / metehemoglobina 0,17
Cit b2 Fe2+ / Fe2+ 0,12
Ubiquinona red / ox 0,10
Ascrbico / dehidroascrbico 0,08
Cit b Fe2+ /Fe3+ 0.07
Azul de metileno red / ox 0,01
FAD H2 / FAD - 0,12
Mlico / oxalactico - 0,17
Lctico / Pirvico - 0,19
Etanol / Acetaldehido - 0,20
Glutatin red / ex - 0,23
b hidroxibutrico / Acetoactico - 0,27
Gliceraldehido-3-P + Pi / 1,3 di-P-glicrico - 0,29
Lipico red / ox - 0,29
NADH + H+/ NAD+ - 0,32
cetoglutrico / succnico - 0,67
T2. Cul es mejor oxidante NAD o FAD?
T3. Sin tener en cuenta la especificidad de las enzimas, todos los sustratos
oxidables por NAD seran potencialmente oxidables por FAD? Todos los
potencialmente oxidables por FAD podran serlo por NAD?
Potenciales redox de los componentes de la cadena respiratoria

Reaccin E0
2 H+ + 2 e - H2 - 0.421
NAD+ + 2 H+ + 2 e- NADH + H+ - 0.320
Piruvato + 2 H+ + 2 e- Lactato - 0.185
Oxalacetato + 2 H+ +2 e-- Malato - 0.166
FAD+ + 2 H+ + 2 e- FADH2 -0.12
Fumarato + 2 H+ +2 e- Succinato - 0.031
Ubiquinona + 2 H+ + 2 e- Ubiquinol + 0.100
2 citocromo b (Ox.) + 2 e - 2 cit b (red.) + 0.030
2 citocromo c (Ox.) + 2 e - 2 cit c (red.) + 0.254
2 citocromo a3 (ox.) + 2 e - 2 cit a3 (red.) + 0.385
O2 + 2 H+ + 2 e- H2O + 0.816
Equivalencia E : G
Existe una equivalencia entre diferencias de potencial redox diferencias en el
cambio de energa libre la cual se establece mediante la ecuacin de Faraday.
Ecuacin de Faraday: G = -nFE
En donde n es el nmero de electrones transferidos en la reaccin y F la

constante de Faraday,
F = 96.500 Jouls.Voltios-1.mol-1 o 23.062 caloras. Voltios-1.mol-1.

La energa liberada en los procesos de oxidacin se puede utilizar para
realizar reacciones endergnicas, tales como, la de formacin de ATP
asociada con el transporte de electrones en la cadena respiratoria. Si la
diferencia de potencial entre pares consecutivos fuera directamente
responsable de la fosforilacin del ADP para formar ATP y la energa de

hidrlisis del ATP (en su fosfato terminal) a pH, 7,0 fuera de 8.500 cal /mol,
T4. Con los pares redox que se mencionan a continuacin, forme una cadena
de transporte de electrones que incluya a todos los pares mencionados.
A ox /red 0,82 V
B ox /red 0,00 V
C ox /red- -0,32 V
D ox /red -0,25 V
E ox /red 0,25 V
T5. Localice los pares redox en el diagrama siguiente. Determine los valores
de (G) asociado con la diferencia de potencial redox (E) entre los pares
consecutivos a de la cadena. Marque con () los sitios en los que
potencialmente se podra formar ATP
T6. Qu diferencia, mnima, de potencial debe existir entre dos pares

consecutivos de la cadena respiratoria para que all se pueda asociar la
fosforilacin del ADP a ATP?
T7. Qu cantidad de energa libre est disponible, cuando en la cadena

respiratoria se transfiere un par de electrones del NADH al FAD? (ver tabla de
potenciales redox)
T9. Suponga que una protena conjugada, un gas de fcil difusin y un

derivado de una vitamina tienen el mismo potencial redox, Cul de ellos
seria mas eficiente energticamente? Por qu?
El modelo general de oxidacin biolgica

En la oxidacin biolgica se recorren secuencialmente los estados de
oxidacin del carbono:
R1 R1 R1 R1
H C H C H H C H H C H
H C
H C H H C OH C
R2 R2 O
R2 R2
Saturado No saturado Alcohol Carbonilo
El modelo general de oxidacin biolgica es el siguiente:

Sustrato Enzima Oxidante Producto
CH3 R1
H3C C CH3 C H
Deshidrogenasa FAD
H3C C CH3 H C
CH3 R2
H2O
es una R1
R1
hidratacin H C H
C H
Hidratasa no una
H C H C OH
oxidacin
R2 propiamente R2
dicha
R1
R1
H C H
H C H
Deshidrogenasa NAD+
H C OH
C
R2 O
R2
Las enzimas forman su nombre a partir del sustrato que es oxidado, por
ejemplo si el sustrato es in acil-CoA, la enzima se nombrara como acil-CoA
deshidrogenasa.
T10. Aplique el modelo de oxidacin biolgica al cido succnico, en el

carbono sealado con la flecha.
O O
H2
HO C C HO
C C OH OH
H2
O O
O O
HO HO
OH OH
O O
Transferencia de grupos fosforilo

El cido fosfrico puede dar lugar a dos radicales:
OH
+
H
HO P O-
OH O
HO P OH Fosfato
O OH
HO P
OH -
O
Fosforilo
La economa energtica celular gira alrededor de la molcula de ATP

(adenosina tri fosfato)
O
O O
P
H O
C H2 P
N N C HO O
O P
O OH HO
CH
C C OH
H2 N C CH CH
N
CH OH
N
HO
Los grupos fosforilo, base de la en energtica celular, pueden transferirse

directamente desde compuestos forsforilados de alta energa o mediante
reacciones acopladas, ya sean oxidativas o no oxidativa. Se consideran
compuestos de alta energa los incluidos en la tabla 2.
Compuestos de alta energa

Tabla 2 Compuestos de alta energa de importancia biolgica
Compuesto Ejemplo G aproximado

Anhdridos de fsforo 1. ATP -8 Kcal/mol
Anhdridos mixtos 2. 1,3-bisfosfoglicerato -12 Kcal/mol
(acilo - fsforo)
Fosfatos de enoilo 3. Fosfoenol piruvato -15 Kcal/mol
Tiosteres de acilo 4. Succinil CoA -7 Kcal/mol
Fosfatos de guanidina 5. Fosfocreatina -10 Kcal/mol
Un Joul = 0,239 cal (caloras) lo que es lo mismo que 1 cal = 4,187 J
T1. Calcule el valor de G aproximado de los 5 ejemplos en J/mol

Compuesto G aproximado en J/mol
ATP
1,3-bisfosfoglicerato
Fosfoenol piruvato
Succinil CoA
Fosfocreatina
T2. Represente la estructura de los ejemplo 2 a 5 de la tabla 2.

Compuestos de baja energa

Los steres fosfricos con energas de hidrlisis entre -3 y -4 Kcal/mol se
consideran de baja energa.
T3. El siguiente compuesto contiene fosforilos que pueden ser de alta, o baja
energa. Identifquelos-
OH
O P OH
O O
C
OH
CH O
HO C P
H2 OH
O
Experimentalmente solo es posible determinar la energa de hidrolisis de un

compuesto. La energa de formacin de un compuesto es la misma que la de
hidrlisis pero con signo contrario.
T3. Suponga que en un calormetro se estim que la energa de hidrlisis de

la ribosa-5-P es de -3,5 Kcal/ mol, Cul es la energa de formacin de la
ribosa-5-P, expresada en cal/ mol y J/mol?
Prediccin de la reversibilidad de las reacciones

Las reacciones bioqumicas se pueden descomponer en reacciones parciales,
lo cual permite el anlisis de reacciones con dos o mas sustratos y / o
productos. El nico requisito para que el anlisis sea vlido es que la suma de
las reacciones parciales de como resultado la reaccin original. Esta tcnica
permite determinar si una reaccin puede ser o no reversible.
Recuerde que:
Si G es negativo la reaccin libera energa

Si G es positivo la reaccin requiere energa
Si G es cero la reaccin est en equilibrio
Por ejemplo: Determine si la reaccin catalizada por la hexoquinasa (Glucosa
+ ATP Glucosa-6-P + ADP)
Reaccin: Glucosa + ATP Glucosa-6-P + ADP

Se puede descomponer en:
ATP ADP + Pi G = -8,0 Kcal/mol
Glucosa + Pi Glucosa-6-P G = +3,0 Kcal/mol
_____________________________________________
Glucosa + ATP Glucosa-6-P + ADP G = -8,0 Kcal/mol + 3,0 Kcal/mol = -
5,0 Kcal/mol
En sentido inverso la reaccin requerira el suministro de 5 Kcal/mol, por tanto
es irreversible.
T4. Una reaccin de gran importancia en la gliclisis es la catalizada por la
piruvatoquinasa (P-enolpiruvato + ADP piruvato + ATP). Descomponga la
reaccin en reacciones parciales y determine si es o no reversible.
Posibles transferencias de grupos fosforilo:

De anhdrido a cido para formar otro anhdrido
De anhdrido a alcohol para formar ster
De ster a alcohol para formar otro ster
Isomerizacin
Los ismeros son molculas que tienen la misma frmula molecular pero
diferente frmula estructural.
En las biomolculas el isomerismo se genera alrededor de los carbonos

asimtricos. Un carbono se considera asimtrico cunado sus cuatro valencias
estn unidas a radicales diferentes.
Carbono asimtrico Carbono no asimtrico
El nmero de ismeros es: 2 , donde n es el nmero de carbonos

asimtricos del compuesto.
T1. Cuntos ismeros pueden presentar los siguientes compuestos?
Isomera de cadena
Corresponde a las sustancias cuyas frmulas estructurales difieren

nicamente en la disposicin de los tomos de carbono en el esqueleto
carbonado, por ejemplo:
H2 H3 C CH3
H3C C CH
C CH3
H2
CH3
n-butano 2-metil-propano (isobutano)
Isomera de posicin
En este tipo de isomera las frmulas estructurales difieren nicamente en la
posicin de su grupo funcional sobre el esqueleto carbonado, por ejemplo:
H H
H HO
H3 C C H3 C C
C CH2OH C CH3
H H
H H
Butanol Isobutanol
Isomera de funcin
La presentan sustancias que con la misma frmula molecular tienen distinto
grupo funcional, por ejemplo:
H2
C O
HO CH3 H3 C CH3
Etanol Metano-oxi-metano
Estereoisometra
Ocurre cuando dos molculas con con la misma estructura presentan diferente
distribucin espacial de sus tomos.
Isomera geomtrica
Se debe ala presencia de enlaces mltiples que imposibilitan la rotacin
alrededor de los mismos. Es caracterstica de sustancias que presentan un
doble enlace carbono-carbono.
O O CH3
H
C C C CH
HO C CH3 HO C
H H
Ismero trans (cido crotnico) Ismero cis (cido isocrotnico)
Isomera ptica
Existen sustancias que en disolucin producen el giro de un haz de luz
polarizada plana, si el giro es hacia la derecha se denominan dextrgiras y si
es hacia la izquierda de denominan levgiras. La causa de la actividad ptica
radica en la asimetra molecular, debida a la presencia de carbonos
asimtricos.
T2.A qu hacen referencia los siguientes trminos en los carbohidratos?

Epmeros, Ismeros funcionales, Enantimeros, Anmeros, Razmeros
(ismeros racmicos)
T3. En qu tipo de molculas de importancia biolgica se pueden encontrar

ismeros
cis trans?
T4. Complete el siguiente cuadro

Sustrato Enzima Producto
Ribulosa 5-P Epimerasa
Ribulosa-5-P Isomerasa
Gliceraladehido-3-P Isomerasa
Eritrulosa-4-P Eritrosa-4-P
Manosa-6-P
Ribosa-5-P Isomerasa
Ruptura y formacin de enlaces C - C

Existen varias formas de romper o formar enlaces C C. Algunos de estos
mecanismos son:
Aldolizacin; ocurre entre un aldehdo y un alcohol para formar un diol
o viceversa.
Transaldolizacin; Transfiere un radical de 3 carbonos de una cetosa a
una aldosa. Ningn producto puede quedar con menos de 3 carbonos
Transcetolizacin: Transfiere un radical de 2 carbonos en forma similar
a la trans aldolizacin, Ningn producto puede quedar con menos de 3
carbonos
Fosforlisis: Rompe un enlace glicosdico por adicin de un fosfato
para formar ster fosfrico
:Fosfocetolizacin: Rompe un enlace a continuacin de un grupo ceto
por transferencia de un grupo fosforilo para formar un anhdrido de
fosforo
Tiolisis: Rompe el enlace que antecede a un grupo ceto por adicin de
un tio derivado (Coenzima A) para formar un tioster.
Aldolizacin
T1. Que producto(s) se forma(n) en la siguiente reaccin?

O
HO
O C OH
P C CH O
O H2 OH
H2
OH CH C P
HO CH O Aldolasa
OH
OH
Transaldolizacin transcetolizacin
T2 Complete el siguiente cuadro (en caso de no ser posible la reaccin,

escriba en las casillas en blanco no se puede.
Dador Aceptor
Dador Aceptor Enzima transformado transformado
cetosa aldosa aldosa cetosa
5C 5C Transcetolasa 3C 7C
7C Transaldolasa 6C
4C 3C
4C Transcetolasa 5C
5C 5C Transaldolasa
Fosfocetolizacin
T3. Mediante un esquema represente la accin de la fosfocetolasa sobre la
xilulosa-5-P
OH O
HO
O CH C OH
P C CH C
HO H2 H2
O OH
Xilulosa-5-P
Tiolisis
T4. Cul es el efecto de la tirolesa sobre el siguiente compuesto?
O O
H2 H2 H2 H2 H2 H2
C C C C C C C C
H3C C C C C C C C S-CoA
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
Palmitil-CoA
Fosforlisis
T5 En la glucogenlisis se libera glucosa-1-P. Qu procedimiento de ruptura

de los enlaces 1-4, utiliza esta enzima?
T6 En un texto o en la internet (http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

),Consulte las reacciones de la Gliclisis, Ciclo de Krebs, Va de la pentosas
fosfato, Ciclo de Calvin, Glucogenlisis, y Beta Oxidacin de los cidos grasos
y determine si hay reacciones que sigan algunos de los modelos descritos
para la ruptura o formacin de enlaces C- C.
Obtencin de energa en absorcin

Durante la fase de absorcin se forman reservas y se obtiene energa
principalmente por oxidacin de glucosa a CO2.
Gliclisis
La gliclisis es una va metablica que permite la obtencin de energa bajo
condiciones anoxignicas. En ella las hexosas forman un cido de tres
carbonos que finalmente termina transformado en CO2 va ciclo de Krebs,
Objetivo general del proceso

Obtener energa mediante un proceso independiente del oxgeno
Sustrato inicial con sus caractersticas: Glucosa
Nmero de carbonos: 6
Estado de oxidacin: mnimo alcohol, mximo aldehdo
Modelo de activacin a emplear: Activacin de monosacridos
Producto final con sus caractersticas: cido pirvico
. Nmero de carbonos: 3
. Estado de oxidacin mximo: Carboxilo
Presencia o ausencia del activador: Requiere ATP
Posibilidad de formacin de CO2: NO
Tipos de oxidantes empleados: NAD+
Mecanismos de recuperacin de oxidantes: Reduccin del producto final
Tipo de va metablica ms conveniente: Lineal
Procesos metablicos que deben ocurrir para cumplir el objetivo (en orden
alfabtico, no en orden de secuencia)
Activacin de la hexosa
Convergencia a una sola va para la utilizacin de triosas
Formacin de un enol fosfato de alta energa
Isomerizacin a un compuesto que permita una segunda fosforilacin

Oxidacin de las triosas con formacin de un anhdrido de fosforo
Recuperacin del ATP gastado
Ruptura de un enlace C C en la hexosa
Segunda fosforilacin de la hexosa
La activacin de la hexosa se realiza de acuerdo con el modelo general de
activacin:
Sustrato: Monosacrido (Hexosa)
Activador: ATP
Enzima: Fosfotransferasa (quinasa)
Producto activo: Ester fosfrico del monosacrido
Convergencia en una sola va metablica: se presentan varias posibilidades:

Formacin de un enol fosfato de alta energa: Se hace a partir de un ster

fosfrico de baja energa mediante la transferencia del fosfato a un alcohol no
primario y la formacin de un doble enlace por deshidratacin.
Isomerizacin a un compuesto que permita una segunda fosforilacin

Para poder realizar la segunda fosforilacin es necesario generar un alcohol
primario en C1, ello se puede lograr mediante una isomerizacin de la aldosa
a una cetosa.
Oxidacin de las triosas con formacin de un anhdrido de fosforo

La funcin aldehdo de una aldosa se puede oxidar con NAD+ a un cido. La
energa del proceso de oxidacin es suficiente para transferir un fosforilo al
cido y formar el anhdrido. L enzima que cataliza el proceso es una
deshidrogenasa (NAD oxidorreductasa)
Recuperacin del ATP gastado

El ATP se puede recuperar a nivel de sustrato por transferencia del grupo
fosforilo desde un anhdrido de fosforo o un enolfosfato.
Ruptura de un enlace C C en la hexosa

Los enlaces C-C se rompen mediante aldolasas, transaldolasas,
transcetolasas, etc. En este caso el enlace que se desea romper corresponde
a un diol, y como no hay transferencia de grupo o radicales, la enzima que
realiza el proceso es una aldolasa
Segunda fosforilacin de la hexosa
La segunda fosforilacin se hace en el nuevo alcohol primario de la cetosa,

mediante una fosfo-X-quinasa (X es el nombre de la cetosa).
Las anteriores reacciones de organizan en una secuencia lgica para

constituir la va glicoltica como se muestra a continuacin
1. Activacin de la hexosa.
2. Isomerizacin a un compuesto que permita una segunda fosforilacin.
3. Segunda fosforilacin de la hexosa.
4. Ruptura de un enlace C C en la hexosa.

5. Convergencia a una sola va para la utilizacin de triosas.
6. Oxidacin de las triosas con formacin de un anhdrido de fosforo.
7. Recuperacin del ATP gastado por transferencia de un fosfato de alta
energa desde un anhdrido de fosforo mixto.
8. Primer paso de la formacin de un enol fosfato de alta energa: cambio
de posicin del enlace ster fosfrico.
9. Segundo paso de la formacin de un enol fosfato de alta energa:
Deshidratacin.
10. Recuperacin del ATP gastado por transferencia de un fosfato de alta
energa desde un enol-fosfato.
La va glicoltica se muestra en el siguiente esquema
T1. Qu carbono de la glucosa presenta el estado ms alto de oxidacin y

cul es?
Cul es el carbono mas oxidado del producto final de la gliclisis?
Cul es enlace C C que se rompe en la gliclisis y cules sus

caractersticas?
Por qu no se altera el estado de oxidacin cunado la glucosa-6-P se

transforma en fuctosa-6-fosfato?
Por qu dos de las estrategias posibles de utilizacin de las triosas son

antieconmicas metablicamente hablando?
Por qu en la oxidacin del gliceraldehido-3-P se emplea NAD+ y no FAD?
Qu caractersticas tiene el cido P-enol-pirvico que lo hacen semejante

energticamente a un anhdrido de fsforo?
T2. Complete el siguiente cuadro sobre las enzimas que participan en la

gliclisis
Clase Numero Nombre
Enzima
N EC sistemtico
Aldolasa
Enolasa
Fosfofructoquinasa
Fosfogliceratomutasa
Fosfogliceratoquinasa
Fosfohexoisomerasa
Gliceraldehido-3-P deshidrogenasa
Hexoquinasa
Piruvato quinasa
Triosafosfatoisomerasa
T3. Algunos microrganismos realizan un proceso denominado fermentacin.

De donde se origino este trmino y cual es su real significado bioqumico?
Qu ventaja le representa a las clulas anoxignicas la realizacin de la

reaccin anterior?
En qu reacciones de la gliclisis hay consumo o formacin de ATP?
Cul es la produccin neta de ATP, por molcula de glucosa, en la gliclisis?
En la tabla 2 se muestran los valores de G para las reacciones de la gliclisis

Tabla 2. Valores de G para las reacciones de la gliclisis
G0 4 G
Reaccin Enzima
(kcal/mol) (kcal/mol)
1 Hexoquinasa o Glucoquinasa - 4.0 - 8.0
2 Fosfoglucoisomerasa + 0.4 - 0.6
3 Fosfofructoquinasa-1 - 3.3 - 5.3
4 Fructosa-1,6-bis-fosfato aldolasa + 5.7 - 0.3
5 Triosa-fosfato isomerasa + 1.8 + 0.6
6 Gliceraldehdo-3-fosfato deshidrogenasa + 1.5 - 0.4
7 Fosfogliceratoquinasa - 4.5 + 0.3
8 Fosfogliceratomutasa + 1.06 + 0.2
9 Enolasa + 0.4 - 0.8
10 Piruvato quinasa - 7.5 - 4.03
T4. Las reacciones alejadas del equilibrio son los puntos ideales para ejercer
regulacin, Desde el punto de vista termodinmico, qu reacciones de la
gliclisis se consideran irreversibles?
Cul (es) reaccin (es) de la gliclisis sern las mas adecuadas para ser
objeto de regulacin? Por qu?
4 G es el cambio en la energa libre estndar, es igual al cambio en la energa libre

G, bajo condiciones estndar, es decir cuando los reactivos y productos estn a
una concentracin de 1,0 mol L-1 (1.0 M).
Beta Oxidacin de los cidos Grasos
En la beta oxidacin, la molcula de cido graso se transforma en varias

molculas de acetil CoA, cuyo nmero depende de la longitud de la cadena.
La activacin de los cidos grasos se lleva a cabo en el citoplasma, pero su
oxidacin en la mitocondria. Esto representa el problema adicional de hacer
que los acil CoA derivados de los cidos grasos traspasen la membrana
mitocondrial. El transporte esta mediado por una molcula llamada carnitina
OH O
H3C CH3
N+ CH C
H3C C C OH
H2 H2
El mecanismo de activacin y transporte a la matriz mitocondrial se muestra

en el siguiente esquema
T5. Si no se tiene en cuenta el grupo carboxilo, cual es el estado mximo de

oxidacin de los cidos grasos.
Cuntos carbonos tiene el producto final de la beta oxidacin de loas

cidos grasos de cadena par?
Qu tipo de va metablica es el ms adecuado para un proceso como la

beta oxidacin?
T6. En la beta oxidacin ocurren una serie de reacciones que tienen como
consecuencia la formacin de los intermediarios que se muestran en el
siguiente cuadro, de acuerdo con el modelo incluido para la primera reaccin.
Lugar en
Evento bioqumico Modelo la Enzima
secuencia
EC 6.2.1.3
NC5 AcilCoAsintetasa
Iniciacin del proceso Activacin 1 NS6 cido graso de
cadena larga: CoA
ligasa (AMP-
formadora)
EC
Aparicin de un alcohol NC
NS
EC
Formacin de acetil CoA NC
NS
EC
Formacin de doble enlace NC
NS
EC
Formacin de grupo ceto NC
NS
T7. Complete el esquema para el primer ciclo de oxidacin del cido palmtico.
Incluya las enzimas y otros sustratos necesarios-
5 NC = Nombre comn
6 NS = Nombre sistemtico
O
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
C C C C C C C C
H3C C C C C C C C OH
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
T8. Compare la beta oxidacin de cidos grasos saturados con 16 y 17

tomos de carbono. Indique en el nmero de molculas que se indican en los
recuadros de la derecha.
Ciclo de Krebs
Los objetivos del Ciclo de Krebs son:
Oxidar acetil~CoA a CO2
Generar equivalentes de reduccin (NADH y FADH2).
Suministrar intermediarios para la sntesis de otros compuestos
(Aminocidos, cidos grasos, Colesterol, Gluconeognesis, Porfirinas).
Vincular derivados de aminocidos al proceso terminal de oxidacin.
El Ciclo de Krebs es un proceso destinado a la transformacin de Acetil CoA

en anhdrido carbnico. Como en todo proceso cclico, el Ciclo de Krebs debe
incluir un aceptor y un abastecedor, por tanto debe comprender dos fases, una
destinada a la eliminacin del abastecedor y otra a la regeneracin del
aceptor, adems de una en la cual se libera energa suficiente para la
fosforilacin de un nucletido di fosfato a un tri fosfato de alta energa.
Las caractersticas metablicas del Ciclo de Krebs son:

Abastecedor: Acetil CoA (2C)
Aceptor : Oxalacetato (4C)
Otros sustratos: NAD, FAD,

Productos CO2, NADH, FADH2
Intermediarios de 4, 5 y 6 tomos de carbono.
Estado mximo de oxidacin del abastecedor: carboxilo
Estado mximo de oxidacin del producto anhdrido carbnico.
Lo que debe hacer el Cclo de Krebs
T9. A continuacin se muestran las reacciones del Ciclo de Krebs sin que
estn en orden secuencial. Atribuya a cada reaccin el puesto que ocupara en
una secuencia lgica y complete la informacin segn el ejemplo incluido.
Reaccin N del puesto en la secuencia
lgica y enzima que la cataliza
Numero en la secuencia = [ 1 ]
EC = 2.3.3.1
Nombre corriente =
Citrato sintasa
Nombre sistemtico =
acetil-CoA: oxalacetato C-
acetiltransferasa [tioester-
hidrolizante, (pro-S)-carboximetil
formadora]
Nmero en la secuencia = [ ]
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
EC=
Nombre corriente =
Nombre sistemtico=
En resumen las reacciones del Ciclo de Krebs son las siguientes:
Algunas plantas y hongos realizan una variacin del ciclo de Krebs

denominado ciclo del glioxilato, en l, el isocitrato no se descarboxila sino que
origina un intermediario de 4 carbonos del ciclo de Krebs, el glioxilato
reacciona con una molcula de acetil CoA, para generar el aceptor del ciclo de
Krebs
T10. Complete el siguiente esquema del ciclo del glioxilato
T11. Se sabe que los animales no pueden realizar gluconeognesis a partir de

cidos grasos. Puede afirmarse lo mismo sobre plantas y hongos? Por
qu?}
El Ciclo de Krebs adems de su funcin oxidativa terminal juega un papel muy

importante en la integracin metablica.
Fosforilacin oxidativa
La fosforilacin oxidativa ocurre asociada a una cadena de transporte de

electrones denominados, cadena respiratoria o cadena de citocromos.
Los componentes de la cadena respiratoria son:
Complejo I
Es conocido como NADH Ubiquinona reductasa.
Esta compuesto por 16 o ms cadenas polipeptdicas.
Tiene FMN como grupo prosttico.
Presenta de 5 a 8 centros ferrosulfurados (Fe S).
Es el complejo ms grande de la cadena respiratoria.
Complejo II
Recibe el nombre de Succinato: UQ reductasa.
Es la nica enzima del ciclo de Krebs unida a la membrana mitocondrial
interna.
Consta de 4 cadenas polipeptdicas, 1 citocromo, una molcula de FAD como
grupo prosttico, 2 a 3 centros Fe S.
Ubiquinona
Su funcin es recoger electrones de los complejos I y II. Es liposoluble, por lo
que puede desplazarse por el interior de las dobles membranas lipdicas, para
llegar al complejo III. Puede ser reversiblemente reducida o pasar por estados
de semi reduccin: UQ (Ubiquinona) - UQH (Semiquinona) UQH2 (Ubiquinol).
Se puede encontrar libre o asociada a protenas.
Tiene una cadena lateral isoprenoide: n= 6-8 en microrganismos. n=10 (Q10)
en mamferos
Citocromos
Son componentes de la cadena respiratoria: b y c.
C1 presenta movilidad a travs de la membrana llevando electrones del
complejo III al complejo IV

a y a3: Son protenas transportadoras de electrones. Contienen un grupo hemo
que puede estar oxidado o reducido. a3E es el nico que puede ceder
electrones al oxigeno.
Los citocromos actan en forma secuencial
El siguiente esquema muestra el flujo de electrones en la cadena respiratoria.
El siguiente esquema ilustra los potenciales redox delos componente de la

cadena respiratoria:
Formacin de ATP
El proceso de fosforilacin del ADP para formar ATP se realiza a expensas de
la llamada fuerza protomotriz que es generada por un gradiente de protones a
travs de la membrana interna de la mitocondria.
Los complejos de la cadena respiratoria bombean protones de la matriz
mitocondrial al espacio inter membrana. Los protones regresan a la matriz
gracias a la ATP sintasa, enzima que aprovecha la fuerza protomotriz para
formar el ATP.
Los potenciales redox delos componentes de la cadena respiratoria se

muestran en la siguiente tabla-
Tabla 3. Potenciales redox (pH 7,0) de los componentes de la cadena
respiratoria
Enzima respiratoria Par redox E (Voltios)
NADH deshidrogenasa NAD+ / NADH 0,32
Succinato deshidrogenasa FMN o FAD / FMNH2 o FADH2 0,20
Coenzima Q10 ox / Coenzima Q10 red +0,06

Complejo del citocromo bc1
Citocromo b ox / Citocromo b red +0,12
Citocromo c ox / Citocromo c red +0,22
Complejo IV Citocromo a red / Citocromo a red +0,29
O2 / HO- +0,82
El ATP es un compuesto inestable que no puede almacenarse por mucho

tiempo dentro de la clula, para la utilizacin posterior de la energa del ATP,
esta se almacena en forma de fosfato de creatina. La creatina se sintetiza a
partir de arginina glicina y metionina. La Fosfocreatina puede transferir al ADP
el fosfato de alta energa para regenerar ATP en el denominado ciclo del
fosfgeno especialmente til en la contraccin muscular en condiciones
anoxignicas.
T12. Un corredor de distancias cortas requiere gran disponibilidad de ATP

cuya energa se ha almacenado en fosfato de creatina, su dieta debe ser rica
en arginina, metionina y glicina. Qu alimentos son ricos en estos
aminocidos?
Consulte: http://www.rdnattural.es/plantas-y-nutrientes-para-el-organismo/
Obtencin de Energa
Propsito
Los organismos vivos obtienen su energa en una de tres formas: fosforilacin

a nivel de sustrato, fosforilacin oxidativa y fosforilacin fotosinttica. A nivel
de sustrato el ATP se forma por fosforilacin de ADP, ya sea mediante
reacciones acopladas o por transferencia directa de un fosforilo de alta
energa al ADP, u otro nucletido di fosfato. En la fosforilacin oxidativa y
fotosinttica, la diferencia de potencial genera gradientes de protones en las
membranas que permiten la fosforilacin del ADP. En la fosforilacin oxidativa
los electrones transportados provienen de los alimentos mientras que en la
fotosinttica provienen de la clorofila.
En esta unidad el estudiante se har competente en el diseo e interpretacin
de las vas metablicas, que en los organismos vivos, transducen la energa
para formar ATP.

Utiliza los procesos metablicos para ensamblar las diferentes vas
metablicas.
1. Enuncia los objeticos metablicos de las diferentes vas.
2. Establece la naturaleza y secuencia de reacciones necesarias para
cumplir los determinados objetivos metablicos.
3. Describe e interpreta las secuencias necesarias para obtener energa a
partir de monosacridos, cidos grasos y aminocidos.
4. Mediante los modelos de ruptura de enlaces carbono-carbono y
transferencia de radicales derivados de los monosacridos describe la
va de las pentosas y la fotosntesis.
El objetivo fundamental del catabolismo es la sntesis de ATP mediante la

utilizacin de la energa qumica almacenada en los compuestos que sirven
como alimentos.
T1. Complete el siguiente cuadro relacionado con los procesos de fosforilacin

Tipo de
Reaccin
transferencia
GTP ADP
Pi GDP ATP
Entre ms reducido sea un compuesto, ms energa se obtiene por su

oxidacin total.
T2. Investigue cuantas caloras se liberan por oxidacin total de un gramo de

carbohidratos, grasas y protenas.
T3. De los dos compuestos representados, glucosa y cido caproico

(hexanoico) tiene seis tomos de carbono. Cul de los dos compuestos
libera ms en energa al oxidarse completamente? Por qu?
HO OH HO
O
CH CH CH2 H2 H2
C C C
O CH CH CH HO C C CH3
H2 H2
HO OH
Metabolismo de los nucletidos

Los nucletidos no solo son importantes como componentes de los cidos
nucleicos, sino tambin individualmente, por ejemplo como: donadores de
energa, oxidantes biolgicos, activadores metablicos, etc.
T1. De ejemplos de nucletidos que funcionan como: donadores de energa,

oxidantes biolgicos, activadores metablicos
Origen de los tomos del anillo de las purinas se muestra en el siguiente

esquema
Sntesis de las purinas

El punto de partida para la sntesis de purinas comienza con la transformacin
del 5-fosfo--ribosil-1-pirofosfato (PRPP) en fosforibosilamina (PRA)
OH OH
HO
P Glutamina Glutamato HO
O P
O NH2
O O O
H2C O OH O
CH CH H2C
1 CH CH
P
CH CH O PRA CH CH
O
HO OH O HO OH
PRPP P
OH
HO
En las reacciones siguientes se utiliza: ATP, derivados del cido

tetrahidroflico (THF), glutamina, glicina y asprtico.
La PRA reacciona con glicina para formar glicinamida ribtido (GAR) con
energa proveniente del ATP.
OH
OH CH2 NH2
HO
P ADP + PI HO O C
O ATP P
NH2 O
O NH
O 2
H2C O O
CH CH H2C
CH CH
CH CH GAR
Glicina CH CH
HO OH
HO OH
Gar recibe un carbono del N-formil-tetrahidroflico para formar

formilglicinamida ribtido (FGAR)
OH CH2 NH2 H
N
HO O C
P CH2 CH
O OH
NH
O O N-formil-THF THF HO O C O
H2C P
CH CH O NH
O O
GAR CH CH H2C
3 CH CH
HO OH
FGAR CH CH
HO OH
FGAR recibe el nitrgeno amida de la glutamina en presencia de ATP para

formar foemilglicinamidina ribotido (FGAM)
H H
N N
CH2 CH CH2 CH
OH OH
HO O C O ADP + Pi HO C O
P ATP P
O O HN
NH NH
O O O O
H2C H2C
CH CH 4 CH CH
FGAM
CH CH CH CH
Glutamina Glutamato
HO OH HO OH
En una reaccin dependiente de ATP FGAM se cicla para formar 5-

aminoimidazol ribtido
H
N OH N
HC
CH2 CH HO CH
OH P
ADP + Pi O C
HO ATP N
C O O H2N
P HN O
O NH H2C
CH CH
O O
H2C 5 AIR
CH CH CH CH
FGAM HO OH
CH CH
HO OH
AIR fija un tomo de carbono proveniente del CO2 para formar

carboxiaminoimidazol ribtido (CAIR)
OH N HOOC
HC OH N
C
HO CH
P HO CH
O C CO2 P
N O C
O H2N N
O O H2N
H2C O
CH CH 6 H2C
CH CH
CH CH CAIR CH CH
HO OH HO OH
CAIR recibe un grupo amino del asprtico para formar 5-aminoimidazol-4-N-

succinilcarboxamido ribtido (SAICAR)
O O
C OH
HO C
H2C CH
HOOC
OH N
C NH
HO CH
P
O C O C NH2
N ATP ADP + Pi
O H2N
O C C
H2C O
CH CH O H2
7 N N C OH
CAIR CH CH P
CH CH Aspartico C O
H
HO OH CH CH OH
SAICAR
HO OH
SAICAR libera fumarato y se transforma en 5-aminoimdazol-4-carboxamida

ribtido (AICAR)
O O
C OH
HO C O
H2C CH H2N C
NH
C
Fumarato N
O C NH2
H2N C
C C CH
O O N
O H2 H2 O
N 8
N C OH HO C
CH CH P P CH CH
SAICAR C O O
H
CH CH OH HO CH CH
AICAR
HO OH HO OH
AICAR recibe u7n nuevo grupo formilo trasportado por el cido tetrahidro folico
y se transforma en 5-formaminoimidaxol-4-carboxamide ribtido (FAICAR).
O
O
H2N C
H2N C
C
N O CH C
H2N C Fumarato N
CH HN C
O N CH
H2 O N
C O H2
HO 9 O
P CH CH HO C
O P CH CH
CH CH O
HO
AICAR HO CH CH
HO OH FAICAR
HO OH
Finalmente, por dehidratacin FAICAR se transforma en inosina monofosfato

(IMP).
O
H2N OH
C
O CH C C
N
N H2O C N
HN C HC
CH C CH
O N N
H2 H2 N
O 10 HO O
HO C C
P CH CH CH CH
O P O
O
HO CH CH CH CH
OH
HO OH HO OH
FAICAR
IMP
T2. Las enzimas (se da el nombre en ingles para facilitar la consulta en

BRENDA) que catalizan la sntesis de purinas son:
adenylosuccinate lyase
aminoimidazole carboxamide ribotide transformylase
aminoimidazole ribotide carboxylase
aminoimidazole ribotide synthase
formylglycinamide synthase
glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase
glycinamide ribotide synthase
glycinamide ribotide transformylase
IMP cyclohydrolase
succinylaminoimidazolecarboxamide ribotide synthase
Qu enzima cataliza cada un de os pasos?

A qu clase pertenece?
Cual es su nmero EC?
T3. Cmo se forman los otros nucletidos?
Origen de los tomos del anillo de las pirimidinas

El origen de los tomos de las pirimidinas se muestra en el siguiente
esquema:
Sntesis del anillo de las pirimidinas

El anillo de las pirimidinas se sintetiza a parir de carbamoil fosfato, mediante la
siguiente secuencia de reacciones
Aspartico
Carbamoil-fosfato Carbamoil-aspartato
1
Pi 2 H2O
3
cido ortico cido dihidroortico
PRRP NADH + H+ NAD+

4
Pi
5
Orotidina -5-monofosfato Uridina monofosfato UMP
H2O HCO3-
T4, Las enzimas enzimas (se da el nombre en ingles para facilitar la consulta
en BRENDA) que catalizan las reacciones son:
1. aspartate transcarbamoylase, ATCase
2. carbamoyl aspartate dehydratase
3. dihydroorotate dehydrogenase
4. orotate phosphoribosyltransferase
5. orotidine-5'-phosphate carboxylase:
A qu clase pertenece?
Cual es su nmero EC?
Consulte la estructura de los intermediarios de la sntesis de las pirimidinas
Los nucletidos de pirimidina se forman a parir del cido ortico.

T5. Cmo se sintetizan los otros nucletidos de pirimidina?
Catabolismo de los nucletidos

Degradacin de nucletidos de purina

La degradacin de los nucletidos purnicos lleva a la formacin de cido
rico. La xantina es el precursor inmediato del cido rico y en ella deben
transformarse los otros nucletidos.
T6. Qu importancia tiene el cido rico?
El siguiente esquema muestra en forma resumida el catabolismo de las

purinas.
Degradacin de nucletidos de pirimidina
El catabolismo de las pirimidinas lleva a la formacin de beta aminocidos:

Formacin de reservas
Una de las caractersticas ms importantes de la fase de absorcin es la
formacin de reservas de glucosa en forma de glucgeno y de cidos grasos
en forma de triglicridos-
.
Glucogenognesis
El glucgeno se sintetiza mediante un modelo de polimerizacin si plantilla.

Utiliza como fuente de los monmeros al UDP-glucosa. En la sntesis
participan 3 protenas con capacidad cataltica: glucogenina, glucgeno
sintetasa y enzima ramificadora.
HO
HO CH2
H 6 O
2
1 H
C C 5
4
C C
H 3
C OH
H OH
H OH
-D-glucopiranosa
HO H2 CH
O C HC
O
P O CH C O
CH N
O
O CH C NH
CH
HO P O HO
O OH O
O
P
OH
HO
UTP
Represente la molcula de UDP-glucosa
Qu tipos se enlaces tiene el glucgeno? Selelos en el esquema que

representa un segmento del glucgeno.
HO
CH2 O
HO H H
C C
C C
H OH
C H O
H H
H OH C H2
H
C C O
H C O H2 C OH
C O C
HO
C C H
HO H H OH
HO C C C
H HO
O H H
HO
CH2 C H
H
O
C OH
C
OH H
HO C H
La glucogenina es una protena (glucogenina glucosiltransferasa, EC

2.4.1.186) que cataliza la transferencia de unidades de glucosa de la UDP-
glucosa a ella misma
La transferencia ocurre en la siguiente forma:
UDP-glucosa + glucogenina glucosil-glucogenina + UDP
UDP-glucosa + (glucosil)n-glucogenina (glucosil)n+1-glucogenina + UDP
(n = 4 - 15).
La elongacin posterior, de la cadena de glucgeno, la realiza la glucgeno

sintasa. Tango la glucogenina como la glucgeno sintasa forman enlaces
glicosdicos 1-4. La ramificacin de la cadena de glucgeno (enlace 1-6),
se hace por transferencia de una cadena de 7 unidades de glucosa al carbono
6 de una glucosa de la cadena principal cada 6 a 10 unidades.
Sntesis de triglicridos
La mayor parte de la energa se alacena en forma de triglicridos. Los cidos
grasos que forman parte de los triglicridos se sintetizan en citoplasma a partir
de acetil CoA. Metablicamente, el acetil CoA se origina en mitocondria por
beta oxidacin de los cidos grasos o por descarboxilacin de piruvato.
El acetil CoA citoplsmico se origina mediante la llamada lanzadera del citrato,

en ella participan citrato, oxalacetato y piruvato, La membrana mitocondrial es
impermeable al acetil CoA y a oxalacetato, pero permeable al piruvato y al
citrato. En el proceso participan dos enzimas mitocondriales, la citrato sintasa
y la piruvato carboxi liasa, y tres enzimas citoplsmicas: enzima mlica, ATP
citrato liasa y deshidrogenasa mlica
La primera etapa en la sntesis de cidos grasos es la formacin de malonil

CoA. En esta reaccin se aplica el modelo de transferencia de unidad carbono
de alto estado de oxidacin con utilizacin de biotina-
La primera reaccin es la formacin del carbamoil-P a partir de bicarbonato y
ATP.
El carbamoil fosfato transfiere el carbono proveniente del bicarbonato al

complejo biotil-enzima.
La carboxi biotil enzima cede el carbono a una molcula de acetil-CoA para

formar el malonil-CoA.
Las reacciones catalizadas por la sintasa de cidos grasos son las siguientes.
Paso Descripcin Enzima
Condensacin El primer paso es la b-cetoacil sintasa
transferencia del radical
acetilo al malonil-ACP7,
con formacin de
acetoacetil-ACP y
liberacin de CO2
Reduccin del En este paso, se reduce b-cetoacil-ACP
acetoacetil-ACP el acetoacetil-ACP reductasa
mediante e NADPH a
7 ACP es Protena transportadora de grupos acilo

hidroxibutiril-ACP
Deshidratacin En esta reaccin, el Hidroxiacil-ACP
hidroxibutiril-ACP es deshidratasa
deshidratado a butenoil-
ACP
Reduccin del enoil- En el ltimo paso, el Enoil-ACP reductasa
ACP butenoil-ACP es
reducido mediante
NADPH a butiril-ACP
Se repite hasta la formacin de palmitil-AC
El proceso se representa en los siguientes esquemas:

Sntesis de triglicridos
Los triglicridos se sintetizan a partir acil CoA y glicerol-P En el hgado el
glicerol-P se puede formar a partir de glicerol libre o por reduccin de la
dihidroxiacetona-P. En tejido adiposo no se puede formar a partir de glicerol
libre.
Qu enzima no se expresa el tejido adiposo?
Un glicerol esterificado por dos cidos grasos y un cido fosfrico se

denomina cido fosfatdico.
A partir de los compuestos mostrados construya una molcula de cido

fosfatdico
H2 C OH OH
HO CH HO P OH
H2 C OH O
O OH
C
H2 H2 H2 H2 H2 H2
H3C C C C C C C CH2
C C C C C C C
H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2
Para la sntesis de triglicridos se requiere glicerol fosfato y cidos grasos

activados con coenzima A.
Complete el esquema para la sntesis de un cido fosfatdico. Incluya las

enzimas
H 2C OH H2 C
HO CH CH
H 2C OH H2 C
O
C
R1 S-CoA
H2C H2C
CH CH
H2C H2C
O
C
R2 S-CoA
El cido fosfatdico es desfosforilado por una fosfatasa y por un mecanismo

semejante se agrega la tercera molcula de cido graso mediante la enzima
diacilglirol acil transferasa.
Obtencin de energa en postabsorcin
En la fase de postabsorcin, la mayora de los tejidos dejan de utilizar glucosa
como fuente de energa y comienzan a utilizar los cidos grasos que han sido
almacenados en forma de triglicridos, Los tejidos que requieren
permanentemente glucosa, la obtienen por degradacin de las reservas
hepticas de glucgeno o por gluconeognesis heptica a partir de

aminocidos, glicerol y lactato.
Glucogenlisis
Tanto el musculo como el hgado degradan su glucgeno en postabsorcin, La
glucosa obtenida en msculo debe ser utilizada all mismo, mientras que la
obtenida por glucogenlisis heptica puede ser exportada como glucosa libre
a otros tejidos.
Qu enzima est presente en hgado y no en musculo para que ocurra esta

diferencia de distribucin de la glucosa obtenida por glucogenlisis?
Dado que el glucgeno presenta dos tipos de enlace, alfa 1-4 y alfa 1-6, se
necesitan dos enzimas diferentes para su degradacin. La degradacin del
glucgeno comienza por los extremos no reductores mediante la enzima
glucgeno fosforilasa. Cuando quedan 4 residuos en la ramificacin, acta la
enzima desramificadora,
El siguiente esquema representa una parte de la molcula de glucgeno

El siguiente esquema muestra la accin de las enzimas glucgeno fosforilasa

y desramificadora. En cada paso incluya la enzima respectiva.
Basndose en el esquema anterior, haga una breve descripcin de la accin

combinada de las enzimas.
Gluconeognesis
La gluconeognesis es la formacin de carbohidratos a partir de sustancias
que no los son, como el lactato, el glicerol y los aminocidos glucognicos.
Utiliza las mismas reacciones de la gliclisis excepto tres.
El siguiente esquema representa el proceso de gluconeognesis:
Las enzimas propias de la gluconeognesis son:

Reaccin inversa de la hexoquinasa
Reaccin inversa de la fosfofructoquinasa

Reacciones inversas a la piruvatoquinasa
Los principales compuestos gluconeognicos se muestran en el siguiente

esquema;
Para que los aminocidos puedan utilizarse en la gluconeognesis deben ser

desaminados. El amoniaco liberado es transformado en urea para su
eliminacin.
Momentos metablicos
La disponibilidad de alimento es un factor de gran importancia en la

determinacin que toma la clula para seguir una determinada va metablica.
En funcin del disponibilidad de nutrientes hay dos momentos metablicos,
fase de alimentacin o absorcin y fase de hambre o postabsorcin. Sobre
estos dos momentos se puede sobreponer una fase de trabajo o de reposo.
Suponga que las fases de absorcin tienen una duracin de 2 horas despus
de terminar de comer.
T4. Suponga que Ud. Se levanta a las 6 de la maana, desayuna a las 7, va

caminado a la Universidad, tiene clases de 8 a 12, Almuerza a las 12 y 30,
tiene clases de 2 a 6, regresa a su casa, reposa hasta las 7 de la noche, come
a las 7, ve televisin de 8 a 9 de la noche, estudia de 9 a 11, se acuesta a
dormir a las 11 y 30.
En el esquema anterior coloque el nmero que identifica las siguientes
actividades que Ud. Realiza.
1. Hace ejercicio durante 30 minutos inmediatamente despus de levantarse
2. Ducha tan pronto termina el ejercicio
3. Desayuno
4. Va caminado a la universidad
5. 10 minutos de descanso antes de la clase de las 8
6. Clase de 8 de la maana
7. Clase de 11 de la maana
8. Descanso despus de almuerzo

9 Clase de 3 de la tarde
10. Regresa caminado a la casa
11. Antes de comer
12. ve las noticias de las 8
13. Estudio
14. 12 de la noche
15. 3 de la maana
En la fase de absorcin hay formacin de reservas (glucgeno, triglicridos y

protenas musculares de recambio rpido), en la fase de postabsorcin se
utilizan las reservas como fuente de energa. La cantidad de glucgeno
almacenada es relativamente baja en comparacin con la de triglicridos. La
dieta promedio de los colombianos incluye ms carbohidratos que lpidos y
protenas.
T5. Durante la fase de absorcin, Cul es el principal sustrato energtico?
T6. Cul debe ser el principal sustrato energtico en la fase de

postabsorcin?
T7. El cambio de patrones metablicos en funcin de la disponibilidad de

alimentos esta regulado por factores hormonales. Investigue que hormona(s)
es (son) predominantes (s) durante las fases de absorcin y postabsorcin.
Las siguientes grficas tomadas de: http://www.montignac.com/es/estudio-

cientifico-sobre-el-metodo-montignac/, muestran los niveles de glucosa e
insulina, En Varios tipos de dieta.
T8. De acuerdo con las grficas anteriores, Hay relacin entre los niveles de
glucosa y los de insulina? Estas relaciones, si las hay, varan en funcin de la
dieta seguida?
Funcin metablica de algunos rganos en vertebrados
T9. En el siguiente cuadro, atribuya a los rganos sus funciones principales

(pueden repetirse en diferentes rganos): Absorcin de O2, Aislamiento
trmico, Almacenamiento de energa (grasas), Almacenamiento de energa
(protenas), Biosntesis endocrinas, Biosntesis exocrinas, Control del
organismo, Degradaciones biolgicas, Digestin y absorcin de sustratos,
Elaboracin de seales, Excrecin de productos finales Excrecin de CO2,
Soporte y armazn, Suministro de energa, Trabajo, Transformacin biolgica,
Transmisin de fuerzas, Transporte de HCO3 -, Transporte de O2.
RGANOS FUNCIONES PRINCIPALES

1.
Intestino
2.
1.
2.
Hgado 3.
4.
5
1.
Tejido adiposo
2.
Msculo 1.
esqueltico 2.
M. Cardaco 1.
1.
Eritrocitos
2.
1.
SNC
2.
1.
T. conectivo
2.
1.
Rin
2.
1.
Pulmn
2.
Pncreas
Desde el punto de vista metablico, los diferentes rganos tienen funciones

especficas en cada uno de los momentos metablicos (Absorcin(A) y
Postabsorcin (P))
T10. Complete la siguiente tabla con los rganos que realizan las funciones
incluidas en ella.
rgano
Funcin
Absorcin Post Absorcin
Absorcin de glucosa Na+ dependiente
Absorcin e hidrlisis de disacridos
Cobertura de necesidades energticas
por oxidacin de glucosa
Cobertura de necesidades energticas
por boxidacin8
Formacin de amonaco
Formacin de cuerpos cetnicos

Formacin de quilomicrones
Formacin de reservas (protenas)
Formacin de urea
Glucogenognesis9
Glucogenlisis10 con glucosa libre
Glucogenlisis sin glucosa libre
Gluconeognesis11
Liplisis
Liponeognesis12
Oxidacin de cuerpos cetnicos
Transformacin de glucosa en lactato
8 Oxidacin de cidos grasos

9 Sntesis de glucgeno
10 Degradacin de glucgeno
11 Formacin de glucosa a partir de sustancias que no son carbohidratos
12 Sntesis de triglicridos a parir de compuestos que no son lpidos
El glucgeno se sintetiza mediante un modelo de polimerizacin sin plantilla.

La forma activa de la glucosa para la polimerizacin a glucgeno es la UDP -
glucosa que se forma a partir de glucosa-1-P.
T11. El modelo para la sntesis de glucgeno supone la participacin de las

siguientes enzimas: fosfoglucomutasa, UDPG pirofosforilasa, glucgeno
sintasa, amilotransglicosidasa (enzima ramificadora), siempre y cuando exista
un primer de glucgeno. Mediante un esquema organice la secuencia de las
reacciones de sntesis.
La glucogenina (pm = 37.000) funciona como primer para la sntesis del

glucgeno. La primera etapa es la unin covalente de una glucosa
194
(transportada en forma de UDP - glucosa) a una tirosina (tir ) de la
glucogenina. A continuacin se extiende la cadena de glucgeno naciente por
adicin secuencial de siete unidades ms de glucosa, cada residuo derivado
de UDPG. La adicin de las nuevas unidades de glucosa es autocatalizada
(actividad como glucosil transferasa) por la glucogenina. De este momento en
adelante el proceso de catlisis se hace dependiente de la glucgeno
sintasa, que junto con la enzima ramificadora completa la polimerizacin.
Durante todo el proceso la glucogenina permanece unida a la molcula de
glucgeno.
T12. Represente mediante un esquema la anterior descripcin de la sntesis
de glucgeno.
La formacin de los triglicridos requiere de la disponibilidad de glicerol-P. Los

triglicridos como tales se almacenan en tejido adiposo mas no en hgado. El
hgado exporta los triglicridos sintetizados en forma de Pre b lipoprotenas. El
glicerol-P se puede obtener por reduccin de la dihidroxiacetona-P o por
fosforilacin del glicerol
T13. Cules son los posibles orgenes del glicerol-P, qu enzimas se

requieren, y en qu tejidos ocurren cada uno de estos procesos?
Esquema general del metabolismo

En la pgina siguiente se muestra un esquema general del metabolismo.
T14. Mediante qu modelos de procesamiento procede cada una de estas

reacciones?
(Por ejemplo: Reaccin 1 = Activacin)
T15. En el esquema seale las reacciones que:

Requieren ATP.
Generan poder reductor (NADH o NADPH).
Llevan a la formacin de ATP a nivel de sustrato.
Ayuno
T16. Durante la fase de hambre el SNC y los eritrocitos requieren 180

gramos de glucosa, de estos el hgado aporta 70 gramos de sus reservas de
glucgeno. De donde proviene el resto de glucosa? Quin hace el mayor
aporte?
T17. En el ayuno el SNC disminuye su demanda de glucosa a 44 gramos.

Cul es el principal sustrato energtico para el SNC en esta fase?
T18.Durante el ayuno se produce una cetoacidosis que debe ser controlada
por el NH3, Qu cambios han de producirse en el patrn de gluconeognesis
para evitar la cetoacidosis?
T19.Suponga que un individuo tiene una reserva de grasa de 10 a 15 Kg, y de
2 Kg de protenas, para cuanto tiempo sern suficientes estas reservas?
En Evangelio segn San Mateo, se encuentra la siguiente narracin

1. En aquella sazn, Jess fue conducido del Espritu de Dios al desierto, para
que fuese tentado all por el diablo.
2. Y despus de haber ayunado cuarenta das con cuarenta noches, tuvo
hambre.
3. Entonces, acercndose el tentador, le dijo: "Si eres el Hijo de Dios, di que
esas piedras se conviertan en panes".
4. Mas Jess le respondi: "Escrito est: No slo de pan vive el hombre, sino
de toda palabra o disposicin que sale de la boca de Dios".
5. Despus de esto le transport el diablo a la santa ciudad de Jerusaln, y le
puso sobre lo alto del templo.
6. Y le dijo: "Si eres el Hijo de Dios, chate de aqu abajo; pues est escrito:
Que te ha encomendado a sus ngeles, los cuales te tomarn en las palmas
de sus manos para que tu pie no tropiece contra alguna piedra".
7. Replicole Jess: "Tambin est escrito: No tentars al Seor tu Dios".
8. Todava le subi el diablo a un monte muy encumbrado, y mostrle todos
los reinos del mundo y la gloria de ellos.
9. Y le dijo: "Todas estas cosas te dar si, postrndote delante de m, me
adorares".
10. Respondile entonces Jess: "Aprtate de ah, Satans, porque est
escrito: Adorars al Seor Dios tuyo, y a l slo servirs".
11. Con esto le dej el diablo; y he aqu que se acercaron los ngeles y le
servan.
De acuerdo con el versculo 2, Qu perdida de peso debi tener Jess?
Las reservas de un hombre de aproximadamente 70 Kg son:

Triglicridos 10 15 Kg
Protenas 2 Kg
Glucgeno 450 g (En ayuno desaparecen muy rpidamente, el heptico para
mantener el funcionamiento del cerebro y el muscular por actividad motora)
T20. Complete el siguiente cuadro para responder a la pregunta de la prdida

de peso.
LPIDOS PROTENAS
Demanda diaria 150 g 20g
Demanda en 40 das
Volumen hidrodinmico13 0,15 mL/g 8 ml/g
Peso agua perdida en 40 das
Perdida de peso por consumo de

reservas
Prdida de peso total
T21. Qu es el ndice glicmico de los alimentos y que importancia

tiene? Vea: http://www.nutrinfo.com/pagina/gyt/graficos/glyctabl.pdf
13 Volumen hidrodinmico es la cantidad de agua perdida, en mL, por gramo de

reserva consumido
Va de las pentosas fosfato

La va de pentosas es una va metablica de gran importancia, tanto en
absorcin como en postabsorcin, por su capacidad para generar NADPH
(poder reductor) y ribosa necesaria para la sntesis de nucletidos. La va de
pentosas es un proceso colateral a la gliclisis con las siguientes
caractersticas:
Sustrato inicial: Glucosa-6-P
Producto final: CO2 y varios monosacridos (7, 6, 5, 4, o 3 tomos de
carbono)
Estado de oxidacin inicial: Carbonilo
Estado final de oxidacin: CO2 y carbonilos
La forma en que posiblemente se originan estos intermediarios es:
T1. Qu modelo de procesamiento metablico est implicado en la

formacin del compuesto C5 en la va de pentosas?
Los otros compuestos pueden formarse de acuerdo al siguiente esquema:
y algunas otras posibilidades.

El esquema general de la va de pentosas, en cuanto al flujo de tomos de

carbono, puede ilustrarse en la siguiente forma:
T2. Cules son las caractersticas de las fases I y II?
T3. Qu modelos de procesamiento estn implicados en al fase II de la va

de pentosas?
T4. De acuerdo con los modelos de procesamiento bioqumico, la ruptura de

enlaces C-C con transferencia requiere un dador y un aceptor. Cules son
las caractersticas de dadores y aceptores?
La fase oxidativa de la va de las pentosas es dependiente del NADP.

El NADPH formado en la fase oxidativa de la va de pentosas es necesario
para la biosntesis de cidos grasos y el mantenimiento de la integridad de las
membranas y otras estructuras celulares.
La transferencia de carbonos en la va de pentosas puede organizarse en tal

forma que los productos finales se utilicen para la sntesis de nucletidos, la
generacin incrementada de NADPH, u otras actividades metablicas.
T5. Mediante esquemas ilustre cmo se organiza la va de pentosas para

incrementar la formacin de NADPH, y cmo para aumentar la disponibilidad
de ribosa?
Esquema de la va de las pentosas

Fotosntesis
La fuente primaria de la materia viva que existe sobre la tierra es la

fotosntesis.
La fotosntesis es el proceso bioqumico mediante el cual las plantas y algunos
microrganismos reducen el CO2 para formar precursores de carbohidratos.
Sustrato inicial: CO2

Producto final: Hexosa-6-P
Estado de oxidacin inicial: Mximo
Estado final de oxidacin: Carbonilos e hidroxilos
En la fotosntesis es necesario fijar 6 tomos de carbono, por tanto se

necesitan 6 molculas de aceptor, las cuales al final deben recuperarse.
6 CO2 + 5 Pentosas-P 1 Hexosa-P + 5 Pentosas-P
En la fotosntesis como lo demostr Calvin, aparecen compuestos de 3, 4, 5, 6

y 7 tomos de carbono. Antes iniciarse la fijacin de CO2 solo se encuentra
una pentosa. Si la primera reaccin es la fijacin de CO2.
Entonces lo posibles orgenes de los otros intermediarios seran:

Para la fotosntesis adems del CO2 es necesario ATP y poder reductor en

forma de NADPH. Estos dos ltimos se generan en reacciones dependientes
de la energa lumnica.
Fase lumnica
Los siguientes grficos ilustran los espectros de absorcin de algunos
pigmentos vegetales y el de accin de la fotosntesis.
T6. Cules son los pigmentos ms importantes en la absorcin de

energa lumnica en la fotosntesis?
El siguiente esquema muestra en forma resumida la fase lumnica de la

fotosntesis
PSI = Fotosistema 1, PS II = Fotosistema II
T7. En qu lugar del esquema anterior es posible acoplar la formacin de

ATP?
Fase oscura o Ciclo de Calvin
El aceptor del CO2 en la fase oscura (Ciclo de Calvin) es la Ribulosa-1,5-

bisfosfato (RUbP). La Ribulosa-5-fosfato se origina en la va de pentosas.
T8. Cmo es posible formar la Ribulosa-1,5-bisfosfato?

La fijacin del CO2 en la fotosntesis depende de la accin de una enzima

conocida como rubisco. Se cree que la rubisco es la protena ms
abundante en la naturaleza.
T9. Qu significado tiene el trmino rubisco?
La rubisco funciona tanto en el Ciclo de Calvin como en la foto oxidacin.

T10. Represente el resultado neto de la accin carboxilante de la rubisco
sobre la RUbP
T11. El compuesto que se forma por la escisin del compuesto inestable de 6

carbonos sufre una fosforilacin. Cuales son estos compuestos?
T12.
Uno de los productos de la fase lumnica es utilizado para la reduccin del
compuesto de 3 carbonos bis fosforilado. Cul es esta reaccin?
El producto reducido de 3 carbonos del ciclo de Calvin es el punto de partida

para las reacciones de transferencia de carbono que llevan a la formacin neta
de una hexosa. En la primera de ellas acta una Aldolasa.
T13. Qu debe ocurrir antes de que pueda actuar la Aldolasa? Qu

reaccin cataliza esta Aldolasa?
En la reaccin siguiente la hexosa formada en la reaccin anterior transfiere

carbonos a otra de las molculas aceptoras de 3 carbonos para formar una
tetrosa y una pentosa.
T14. Cules son: dador, aceptor y productos de esta reaccin?
En la reaccin siguiente. Una aldolasa une la tetrosa con una molcula de 3

carbonos.,
T15. Cul es el resultado de esta reaccin?
El producto de esta reaccin pierde un grupo fosfato por accin de una

fosfatasa. El producto desfosforilado reacciona con una triosa para formar
pentosas fosfato.
T15. Cuales son los sustratos y productos de esta reaccin?
El ciclo termia por la accin de isomerasas y epimerasas que transforman las

pentosas formadas en el precursor inmediato del aceptor de CO2.
Foto oxidacin
La Rubisco, alternativamente a la carboxilacin tiene capacidad para actuar
como oxigenasa, proceso al cual se denomina foto oxidacin
El resultado de la foto oxidacin se muestra en el siguiente esquema:
HO
CH CH2 O
HO C O P OH
O OH
O OH
C CH 3-P-glicrico
O CH2 CH CH2 O
HO
P HO O P OH O
OH O
O Ribulosa-bis-P OH O C
P C OH
HO H2
OH
P-glicolico
El cido fosfo-gliclico es desfosforilado a gliclico y este transferido del

cloroplasto al peroxisoma donde la oxidasa del gliclico es oxidado a cido
glioxlico. La serina y el glioxlico sufren transaminacin.
T16. Complete la reaccin de transaminacin

O O
C OH O C
C OH
H2N CH H
H2C OH
Transaminacin
Dos molculas de aminocido formado regeneran serina con evolucin de

CO2 y NH3. El cetocido resultante de la transaminacin es reducido a cido
glicrico, el cual puede ser fosforilado por ATP y entra al ciclo de Calvin.
T17. Represente las reacciones descritas anteriormente que llevan a la
formacin del 3-P-glicerato
Apuntes de clase de Bioqumica 249 Luz B. Pardo R.
Esquema de la fase oscura de la fotosntesis

Fotosntesis C4 y CAM
Si la fotosntesis C4 se realizara en un solo tipo de clula vegetal el proceso

sera como se muestra en el siguiente esquema
T18. En la fotosntesis C4, qu compuesto cumple una funcin similar a la

de la ribulosa bis fosfato? Qu compuesto es el dador de CO2 para el Ciclo
de Calvin?
Las plantas que realizan fotosntesis C4 son anatmicamente distintas de las

plantas C3, tienen hojas con dos tipos de clulas, las clulas del mesfilo, all
ocurre la fijacin del CO2 para formar cidos de 4 carbonos y clulas de la
vaina, en las que se descarboxilan los cidos C4 y se asimila el CO2 va ciclo

de Calvin.
En las plantas CAM, el CO2 es capturado de noche por carboxilacin del PEP
en el citosol. El malato formado se acumula en la vacuola. Durante el da, el
malato es transportado al cloroplasto donde se descarboxila. El CO2 liberado
es fijado por la rubisco. Los estomas de las plantas CAM abren de noche y
permanecen cerrados durante el da.
T19. El metabolismo CAM se realiza en cuatro fases diga cual es el

comportamiento de los estomas y los cambios en los Metabolitos de la
fotosntesis
Fase I Noche:
Fase II Amanecer:
Fase III Da:
Fase IV Anochecer
El siguiente esquema representa la fotosntesis CAM:

T20. Qu diferencia hay entre las fotosntesis C4 y CAM?
Tabla 4. Ejemplos de los tipos de fotosntesis

C3 C4 CAM
Trigo, cebada, Maz, sorgo, Pia, cactus
Plantas papa, tomate cana de
azcar
A Corte de la hoja de una planta que realiza fotosntesis C3. B Corte de la hoja
de una planta con anatoma Kranz (espiral en alemn) que realiza fotosntesis
C4. Tomado de:
http://books.google.com.co/books?id=30uScIaUo94C&pg=PA32&lpg=PA32&dq=anatomia+kranz+plantas&s
ource=bl&ots=uZmDOkRT5-&sig=C1yd-
YQ3_zlKzVpCYXMYT02caOI&hl=es#v=onepage&q=anatomia%20kranz%20plantas&f=false
La siguiente tabla resume algunas de las principales caractersticas de los tres

tipos de fotosntesis:
Tabla 5. Algunas caractersticas delos tipos de fotosntesis.
Tipo de fotosntesis
C3 C4 Cam
Enzima P- Rubisco y P-
responsable de la Rubisco enolpiruvato enolpiruvato
carboxilacin inicial carboxilasa carboxilasa
Anatoma Normal Kranz Suculenta
Tasa de
Media Alta Baja
fotosntesis
Inhibicin de la Si en el da, No en la
Si No
fotosntesis por O2 noche
reas
tropicales y
Hbitat Amplio Hbitat rido
hbitats
ridos
Subsistema regulador
El xito del metabolismo reside en el hecho de ser este un proceso muy bien
regulado, que puede cambiar fcilmente de un estado catablico a uno
anablico, en funcin de las necesidades el organismo.
La regulacin en general consiste se efecta a nivel de la actividad de las

enzimas. El modelo de regulacin puede ser por modulacin de la actividad de
la enzima, o por sntesis y degradacin de la misma.
Enzima inactiva
Efector Efector
Enzima activa
Regulacin por modulacin de actividad
No hay enzima
Proteolisis Proteosntesis
Hay enzima
Regulacin gentica por sntesis de la enzima
La regulacin por modulacin, por existir ya la enzima es de efecto ms rpido

que la regulacin gentica sucede de acuerdo con el modelo del opern
propuesto por Jacob y Monod, caso en el cual hay que sintetizar la enzima.
Comunicacin celular
Todo sistema de comunicacin cuenta con tres elementos indispensables
T1. De ejemplos de sistema de comunicacin en que Ud. participe como

emisor, como can al y como receptor
La comunicacin celular se efecta mediante seales qumicas producidas por

una clula y recibidas por otra. Las seales pueden ser hormonas o
neurotransmisores. En funcin de la distancia entre la clula emisora y la
receptora existen al menos tres modelos: comunicacin yuxstacrina,
comunicacin paracrina y comunicacin endocrina.
T2. A qu tipo de comunicacin corresponde cada uno de los esquemas

anteriores?
Regulacin por modulacin de la actividad

Es bien sabido que no todas las enzimas siguen el modelo hiperblico descrito
por Michaelis y Menten. Algunas enzimas llamadas alostricas siguen una
cintica sigmoidal.

catalizadas por enzimas de cintica sigmoidal y de cintica hiperblica.
Figura 2. Comparacin del orden de reaccin entre las enzimas que tienen
cintica hiperblica y sigmoidal.
En la tabla siguiente se muestra el comportamiento cintico de los dos tipos de

enzima en funcin de la concentracin del sustrato.
Comportamiento cintico de las enzimas hiperblicas y sigmoidales.

Orden reaccin por zonas
Tipo de cintica
I II III
[A]<Ka [A] Ka [A]>Ka
Hiperblica Orden 1 Orden fraccionario Orden cero
Sigmoidal Orden cero Orden 1 Orden cero
En algunos sistemas enzimticos el producto ejerce una actividad inhibitoria

(competitiva) sobre la reaccin enzimtica (inhibicin isostrica).
Cuando el producto ejerce inhibicin competitiva sobre la enzima, en

presencia del sustrato es necesaria mucha mayor concentracin del sustrato
para conseguir la misma rapidez que en ausencia del producto, al disminuir la
afinidad entre la enzima y el sustrato.
Puesto que la concentracin de sustrato aumenta la rapidez de reaccin y la

de producto la disminuye el sistema se constituye en un circuito de regulacin
sencillo, como ocurrira en el caso de la hexoquinasa
Glucosa + ATP Glucosa-6-P + ADP

Compuestos que no estn relacionadas estructuralmente con los sustratos

pueden modificar la actividad de las enzimas al fijarse en sitios diferentes al
sitio activo (sitio alostrico) y producir cambios conformacionales que afecten
la afinidad de la enzima y el sustrato.
Los ligandos que modifican alostricamente la actividad de las enzimas

pueden hacerlo mediante un incremento de la afinidad (efectores positivos) o
mediante una disminucin (efectores negativos).
Cuando la concentracin de sustrato se mantiene constante la rapidez efectiva

de la reaccin se modifica grandemente en presencia de los efectores
Ejemplo de este sistema de regulacin es la deshidrogenasa del cido

isoctrico:
Isocitrato + NAD+ cetoglutarato + NADH + CO2

ADP ATP
Debido a la presencia simultanea de ATP y ADP en casi todos los sistemas

celulares la regulacin de la actividad de la isocitrato deshidrogenasa
depender de la relacin entre ATP / ADP.
Atkinson postul como elemento de gran importancia en el control del

metabolismo la carga energtica, la cual defini como:
Carga Energetica
ATP 0,5ADP
ATP ADP AMP
El valor de la carga energtica vara entre 1, cuando solamente hay ATP y

cero cuando solamente se encuentra AMP.
Cuanto menor sea la carga energtica, mayor ser la tendencia a realizar

metabolismo energtico (hexoquinasa, fosfofructoquinasa, piruvatoquinasa,
isocitratodeshidrogenasa) y menor el de trabajo (citrato liasa ATP
dependiente, fosforribosilpirofosfato sintetasa), y cuanto ms se aproxime a
uno la carga energtica, mayor ser el metabolismo de trabajo y menor el
energtico. In vivo, cuando la carga energtica es 0,8 se tiende al equilibrio
entre metabolismo energtico y metabolismo de trabajo.
Algunas enzimas claves del metabolismo pueden ser reguladas por

modificaciones catalizadas por otras enzimas.
El circuito bsico de regulacin en muchos caso esta mediado por

modificaciones qumicas de las enzimas, usualmente mediadas por protena
quinasas. Para que el control sea efectivo, las enzimas anablicas deben
tener comportamiento contrario a las catablicas Un ejemplo de modificacin
qumica introducida por otras enzimas es la fosforilacin de grupos OH de
serina o tirosina, catalizada por proteinaquinasas. En dado sistema de
regulacin, si la forma activa es la fosforilada, la inactiva ser la no fosforilada

o viceversa. El regreso a formas no fosforiladas depende de la accin de
fosfatasas generalmente sensibles a hormonas o a ciertos metabolitos.
Sentido catablico Sentido anablico

Con el fin de amplificar las seales de control, frecuentemente, se utilizan
segundos mensajeros. Si la accin sobre el control del metabolismo fuese
directamente por las seales originales (primeros mensajeros), sera
necesario un gran nmero de molculas ya que la relacin entre seal y
enzima regulable sera de 1 : 1. Si el primer mensajero interacta con una
enzima modificadora, la enzima modificadora puede amplificar muchas veces
la seal, debido a su accin cataltica.
En todo conjunto de reacciones coordinadas, existe por lo menos una enzima

limitante de la rapidez de la va, la cual usualmente es objeto de un proceso
de regulacin. Cuando un sustrato puede metabolizarse por dos vas
diferentes, a igualdad de actividad (Vm) la enzima con mayor afinidad (menor
Ka) metaboliza ms sustrato. A igualdad de afinidad, sintetiza ms sustrato
aquella con mayor actividad.
La transduccin de seales en los circuitos de regulacin hormonal,

usualmente, esta mediada por las protenas G, reciben este nombre por
cambios estructurales inducidos por el GTP.
En estado basal las protenas G trimricas estn asociadas con GDP y el

efector se encuentra inactivo. El ligando se une al receptor especfico, el cual
sufre un cambio conformacional que induce el remplazo de GDP por GTP y la
separacin de la subunidad alfa, la cual se desplaza al efector inactivo
produciendo su activacin. Para regresar al estado basal, se hidroliza el GTP
a GDP y Pi. La subunidad alfa regresa a asociarse con las subunidades beta y
gama. Uno de los efectores mas utilizados es la adenil ciclasa. El modelo mas
frecuente de regulacin es el siguiente:
Regulacin de la Gliclisis
Debido a que la principal funcin de la gliclisis es la produccin de ATP, esta
va solo debe funcionar cuando Se requiere ATP. El sitio de regulacin ms
importante de la va es una enzima alostrica, la fosfofructoquinasa I.
Las enzimas alostricas pueden encontrarse en uno de dos estados
denominados R (relajado) y T (tenso). La forma R presenta ms afinidad por el
sustrato y por tanto muestra ms actividad. Hay compuestos que tienden a
estabilizar las formas R y construyen efectores alostricos positivos. Los que
se unen a las formas T, disminuyen la afinidad por el sustrato y por tanto la
actividad enzimtica, a estas molculas se les denomina efectores negativos.
La fosfofructoquinasa presenta dos sitios de unin para el ATP, uno es el sitio
de unin del sustrato y el otro el regulatorio. El ATP se puede unir al sitio
activo (sitio de unin) tanto en la forma T como a la R; mientras que solo se

puede unir al sitio inhibitorio cuando la enzima esta en la forma T, El otro
sustrato, la fructosa-6-fosfato, solo se puede unir a la forma R.
Las formas T y R se encuentran en equilibrio, concentraciones altas de ATP

desplazan el equilibrio hacia la forma T, lo cual disminuye la andinidad por la
fructosa-6-P.
La inhibicin se revierte por AMP, el cual se une preferentemente a la forma R.

Esto sucede en ejercicio vigoroso. La gran necesidad de ATP hace que este
se forme a partir de ADP mediante la adenilato quinasa que cataliza la
reaccin:
En el estado basal el ATP, ADP y AMP se encuentran en relacin 50:10:1. La

accin de la adenilato quinasa aumenta 400 veces la concentracin basal de
AMP.
Bajo condiciones aerbicas el piruvato derivado de la gliclisis entra a la
mitocondria, se transforma en acetil CoA y abastece el ciclo de Krebs. Cuando
el ciclo de Krebs esta saturado por la disponibilidad de gran cantidad de acetil
CoA, es necesario disminuir su concentracin. El exceso de citrato es
exportado al citoplasma y se convierte en modulador de la glicolisis al unirse
preferencialmente a la forma T de la fosfofructoquinasa I, lo cual inactiva la
enzima.
Otro regulador de la glicolisis es la fructosa-2,6-bisfosfato que se une a la

forma R de la fosfofructoquinasa, por lo cual funciona como efector positivo al
aumentar la afinidad de la enzima por la fructosa-6-fosfato. Este compuesto

disminuye la accin inhibitoria del ATP
La fosfofructoquinasa II (PFQ2) es una enzima bifuncional, en la forma
fosforilada acta como fosfatasa de la fructosa-2,6-bisfosfato y en la forma no
fosforilada como quinasa de la fructosa-6-P. El cambio de estado no
fosforilado a fosforilado esta< catalizado por una protena quinasa que a su
vez es activada por AMP cclico que es el segundo mensajero de la adrenalina
y el glucagn.
Proteina quinasainactiva
AMPc ATP ADP

Proteina quinasaACTIVA
PFQ2OH PFQ2P
Acta como Acta como
quinasa fosfatasa
Como puede verse en el esquema anterior la fructosa-2,6-bisfosfato, acta

como regulador tanto de la gluclisis al activar la fosfofructoquinasa como de
la gluconeognesis al inactivar la fosfatasa de la fructos-1,6-bisfosfato.
Regulacin de la glucogenlisis y glucogenognesis.

Para que el sistema de regulacin del metabolismo del glucgeno sea
eficiente es necesario que si las enzimas de la glucogenlisis se activan, las
de la glucogenognesis se inactiven y viceversa, todo bajo el mismo sistema
de control, es decir que con una misma seal se regulen los dos procesos,
La activacin e inactivacin de las enzimas del metabolismo del glucgeno
esta mediada por protenas quinasas cuyo papel se muestra en el siguiente
esquema.
En la glucogenlisis participan dos enzimas: la enzima desramificadora y la

fosforilasa. La desramificadora realiza dos procesos uno como glicosil
transferasa y otro como glicosidasa.
La fosforilasa rompe enlaces alfa 1-4 de las ramificaciones del glucgeno

hasta dejar 4 subunidades en la cadena
Cuando quedan 4 subunidades de glucosa en la ramificacin, la enzima

desramificadora transfiere 3 a otra rama de la cadena mediante su actividad
de glucosil transferasa y luego mediante su accin glicosidasa rompe el
enlace alfa 1,6 que una a la cadena principal la subunidad de glucosa
remanente de la ramificacin.
La glucgeno fosforilasa es un dmero de subunidades iguales que puede

presentase en estado Tenso (T, menos activo) o Relajado (R, ms activo) L
enzima fija el glucgeno cuando esta en estado R, esta conformacin se
favorece en presencia de ADP y se desfavorece en presencia de ATP o
glucosa-6-P. La enzima se modula por fosforilacin dependiente de la
fosforilasa quinasa
En la sntesis del glucgeno, adems de la glucogenina, participan 2 enzimas

tambin participan dos enzimas: la glucgeno sintasa y la enzima
ramificadora. La glucgeno sintasa la cual adiciona glucosas provenientes de
la UDP-glucosa al extremo no reductos de una cadena de glucgeno.
Las ramificaciones alfa 1-6 son catalizadas por la enzima amilo-(1,41,6)-

transglicosilasa, tambin denominada enzima ramificadora. Esta enzima
transfiere un fragmento terminal de 6 o 7 residuos de glucosa a una residuo
interno.
Regulacin gentica
La regulacin gentica funciona de acuerdo con los postulados de Jacob y

Monod conocidos como Teora del Opern. El Opern esta constituido por
tres tipos de genes: El Gene Regulador (GR) que se transcribe para codificar
una protena represora, el Gene Operador (GO) que contiene el sitio de
fijacin para la RN A polimerasa y uno o ms Genes Estructurales (GE) que se

transcriben a un mensajero policistrnico que codifica las enzimas reguladas.
Induccin
La protena represora normalmente se encuentra activa y se une a la regin
del operado con lo cual impide la fijacin de la RNA polimerasa y en
consecuencia no hay transcripcin y por lo tanto no se sintetizaran las
enzimas.
Cuando se hace presente el inductor, este se une a la protena represora que

ahora es incapaz de unirse al operador, en consecuencia la RNA polimerasa
se puede unir a esta regin y transcribir la informacin de los genes
estructurales para sintetizar las enzimas inducidas.
Represin
Tambin existe un modelo Opern para< explicar< la represin de la sntesis
de algunas enzimas.
T3. Con los mismos componentes empleados para la induccin enzimtica
describa como funcionara el modelo de represin enzimtica.
T4. Investigue y cite al menos dos ejemplo de induccin y represin

enzimticas

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