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Ingeniera en Biotecnologa
Microbiologa
Docente: Dr. ELAS OCTAVIO GMEZ MONTES.
CUATRIMESTRE: 17/01
GRUPO: 1220401
ndice
1. Introduccin
2. Metodologa
2.0 Bacteriologa
2.1 Taxonoma
2.2 Historia de la Taxonoma
2.2.1 Carlos Linneo
2.2.2 Charles Woese
2.2.3 Lynn Margullis
2.2.4 Thomas Cavalier
2.3 Objetivos de la taxonoma
2.4 Fases para aplicar la taxonoma
2.4.1 Clasificacin
2.4.2 Nomenclatura
2.4.3 Identificacin
2.5 Rangos de los grupos taxonmicos
2.6 Categoras de clasificacin Taxonmica.
3. Aplicacin de taxonoma
3.1.1 Ejemplo
4. Conclusiones
5. Referencias
Introduccin
Para poder lograr el estudio de tantas especies, los bilogos las han clasificado en
funcin de las caractersticas que comparten. Han existido muchas clasificaciones
de los seres vivos a lo largo de la historia. Cada una de ellas respondi a las
necesidades y conocimientos de la poca en que se llev a cabo, pero siempre se
ha buscado que la clasificacin cumpla con dos requisitos: que comprenda a todos
los seres vivos conocidos y que ninguno se pueda ubicar en dos categoras
diferentes.
2.0 Bacteriologa
Tambin gracias a estos estudios se conoce que la mayora de las bacterias estn
en el tracto intestinal, heces fecales, etc. Ya que son el lugar primordial para el
alberge de estos microorganismos.
2.1 Taxonoma
Clasificacin
Nomenclatura
Identificacin
2.2 Historia de la Taxonoma
(Padre de la taxonoma)
2.2.2 Charles Woese
1977 Woese, propuso la modificacin del Reino Monera. Por qu encontr que
las bacterias tienen diferentes tipos de metabolismo. Y propuso dividirlas en dos
grandes grupos, que nombr Bacteria y Archaea.
(1998) Reestructuraron el sistema de cinco Reinos para concluir que no hay tres
Dominios, sino dos Sper Reinos.
Establecen que el sistema de los tres dominios ignora el hecho de que los
eucariontes proceden de la simbiosis de dos procariontes y que se basa en
caractersticas no morfolgicas.
2.2.4 Thomas Cavalier
1998 Establece relaciones evolutivas entre los organismos con base en las
similitudes de su estructura celular.
2.4.1 Clasificacin
CRITERIOS FENOTPICOS
- Requerimientos nutricionales.
Morfologa microscpica.
Casi todas las bacterias son similares en morfologa y slo se pueden establecer
algunos grandes grupos (Ej.: cocos Gram positivos), por lo que no es un criterio
definitivo para el diagnstico. Se suele recurrir a la tincin de Gram o al examen
en fresco. Algunas bacterias se pueden identificar presuntivamente porque tienen
formas muy peculiares. Por ejemplo, Fusobacterium es un bacilo Gram negativo
fusiforme (muy alargado y fino con los extremos puntiagudos).
Morfologa macroscpica.
Las bacterias crecen en los medios de cultivo slidos dando colonias que son
clones de clulas provenientes de una bacteria originaria. El aspecto de las
colonias es de gran ayuda en la identificacin. Cada bacteria crece diferente,
formando colonias de distinto color, forma, tamao, textura, olor, brillo, etc. Existen
colonias ms o menos elevadas, con bordes enteros, estrellados, etc. Igualmente,
algunas bacterias producen pigmentos que tien el medio.
MORFOLOGA
Microscpica
Las bacterias pueden observarse sin tincin (examen en fresco) si se las coloca
en glicerol o soluciones no acuosas que aumenten el ndice de refraccin o con
tincin usando distintas coloraciones que mejoran su visualizacin ya que son
clulas incoloras. Dichas tinciones se basan en la afinidad que presentan los
colorantes por las estructuras bacterianas. Los colorantes catinicos, por ejemplo,
son atrados por los componentes de carga negativa como los cidos nucleicos y
los polisacridos. Ejemplo de este tipo son: el azul de metileno, el cristal violeta y
la safranina.
2.4.2 Nomenclatura
Descriptivo
Nombre de cientficos
Organizaciones
Afipia felis (Air Force Institute of Pathology)Cedecea spp. (Centers for Disease
Control)
Nomenclatura binaria
Escherichia coli
Bacilli (clase)
Actinobacteria (clase)
Firmicutes (filo)
coli
Reglas de Nomenclatura Taxonmica
Solamente el Gnero
El gnero puede escribirse con una inicial, pero pueden presentarse algunas
confusiones debido a que se pueden encontrar nombres similares para diferentes
microorganismos.
2.4.3 Identificacin
Se han utilizado una amplia variedad de genes como dianas moleculares en los
estudios taxonmicos o de filogenia en los distintos gneros y distintas
especies bacterianas, constituyendo el anlisis del ARNr 16S el marcador inicial
y en numerosas situaciones suficiente para realizar una identificacin precisa.
Sin embargo, en otras situaciones, la alta homologa gentica en determinados
gneros bacterianos o un reciente cambio en su asignacin taxonmica, no
permite utilizar el ARNr 16S como para la identificacin a nivel de especie (o
incluso de gnero). En estos casos, puede recurrirse a otros genes dianas.
MTODOS MOLECULARES IDENTIFICACIN BACTERIANA
Se han utilizado una amplia variedad de genes como dianas moleculares en los
estudios taxonmicos o de filogenia en los distintos gneros y distintas
especies bacterianas, constituyendo el anlisis del ARNr 16S el marcador inicial
y en numerosas situaciones suficiente para realizar una identificacin precisa.
Sin embargo, en otras situaciones, la alta homologa gentica en determinados
gneros bacterianos o un reciente cambio en su asignacin taxonmica, no
permite utilizar el ARNr 16S como para la identificacin a nivel de especie (o
incluso de gnero). En estos casos, puede recurrirse a otros genes dianas.
En todos los casos es preciso el previo aislamiento del germen en la muestra, para
proceder posteriormente a su identificacin. Los pasos a seguir para la
identificacin de una bacteria son:
En la taxonoma bacteriana los niveles o rangos utilizados son los siguientes (en
orden ascendente):
ESPECIE
GNERO
FAMILIA
ORDEN
CLASE
REINO
DOMINIO
Dominio: Categora taxonmica atribuida a cada una de los tres principales grupos
o taxones en que actualmente se considera subdividida la diversidad de los seres
vivos: arqueas (Archaea), bacterias (Bacteria) y eucariontes (Eukarya). As lo
propuso Carl Woese en 1990 al crear, aplicando la nueva taxonoma molecular, su
sistema de tres dominios. Estudios a nivel molecular de la estructura de los lpidos,
protenas y del genoma, y, sobre todo, la secuenciacin del ARN ribosomal 16s,
muestran que dentro de los procariontes, las arqueas son tan diferentes de las
bacterias como stas de los eucariontes.
Filo: El filo (phylum, plural phyla), tronco o tipo de organizacin es una categora
taxonmica situada entre el Reino y la Clase, y usada en el reino animal, reino
protistas y dominio bacterias. Al igual que ocurre con otros niveles en la taxonoma
de los seres vivos, y debido a la necesidad de que las clasificaciones reflejen con
la mayor fidelidad posible la filogenia, varios filos pueden agruparse en superfilos,
y los individuos de un filo puede organizarse en subfilos (y stos a su vez en
infrafilos).
Super familias
Familias
Subfamilias
3.1 Ejemplo
1. Se trata de una molcula muy antigua, presente en todas las bacterias actuales.
Constituye, por tanto, una diana universal para su identificacin.
6. Dado que resulta relativamente fcil secuenciar los ADNr 16S existen bases de
datos amplias, en continuo crecimiento.
4. Conclusiones