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Protenas
Biotecnologa
Universidad Nacional Pedro Ruiz Gallo
Los aptmeros son cidos nucleicos de cadena sencilla, ADN o ARN, que reconocen
una gran variedad de molculas. Cada aptmero posee una estructura tridimensional
particular que le permite unirse con afinidad y especificidad altas a la molcula diana.
Los aptmeros tienen propiedades de reconocimiento equiparables a las de los
anticuerpos; sin embargo, por la naturaleza de su composicin tienen ventajas
significativas en cuanto a su tamao, produccin y modificacin. Estas caractersticas
los hacen excelentes candidatos para el desarrollo de nuevas plataformas
biotecnolgicas. Todos estos avances ocurridos durante las dos ltimas dcadas
permiten anticipar el protagonismo que tendrn los aptmeros como agentes
diagnsticos y teraputicos en un futuro cercano. Los aptameros y los chips de
protenas se utilizan en el diagnostico y tratamiento de enfermedades.
Aptmeros y
Chips de
Protenas
Biotecnologa
APTAMEROS
DIFINICION
Los aptmeros
ARN,
que
Cada aptmero
que le permite
molcula diana.
Los
reconocimiento
embargo, por la
significativas en
cuanto
modificacin.
Estas
candidatos para
el
biotecnolgicas.
Se
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teraputicas
exitosamente
encuentran
aptmeros
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tratamiento por
estos
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permiten
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un
cercano.
futuro
posibilidad
diferentes a las
de
obtener
aptmeros
bajo
condiciones
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mediante aumento de la temperatura o del pH, pero luego pueden retornar a su estado activo
utilizando las condiciones ptimas de reconocimiento (buffer, temperatura, etc.). Todo lo anterior
contrasta con los anticuerpos en los que cualquier episodio de desnaturalizacin generalmente les
produce una prdida en la capacidad de reconocimiento y por lo tanto en su funcin en un sensor.
APTAMEROS 3
APTAMEROS 4
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Los aptmeros han tenido un gran impacto en el desarrollo de nuevas terapias; se destacan las
orientadas a las enfermedades hematolgicas, el cncer y la infeccin por VIH. En la revisin llevada
a cabo por Keefe y colaboradores, se recopilaron los aptmeros ms destacados en modelos
teraputicos. Los aptmeros se pueden usar en dos formas diferentes en el desarrollo de procesos
teraputicos: 1. Como molculas efectoras para reconocer un receptor y ejercer directamente la
funcin teraputica; 2. Como vehculos para la entrega de una molcula secundaria. En este caso, se
utiliza el aptmero nicamente como elemento
de biorreconocimiento, que es modificado con la molcula secundaria encargada de la accin
teraputica. Dada la facilidad de modificacin de los aptmeros, incluso en el proceso de sntesis,
actualmente estn compitiendo con pptidos y anticuerpos en el desarrollo de nuevos enfoques
teraputicos, lo que evidencia el notorio avance logrado durante los ltimos aos en este campo. En
la actualidad ocho aptmeros se encuentran en fase clnica y uno ya fue aprobado para uso clnico
(tabla 2). Este ltimo es el aptmero anti-VEGF (por la sigla en ingls de vascular endothelial growth
factor) y lo analizaremos ms detenidamente a manera de ejemplo.
APTAMEROS 6
CHIPS DE PROTEINAS
Para la deteccin de pptidos y protenas, adems de las tcnicas de electroforesis bidimensional y la
cromatografa lquida con espectrometra de masas.
Recientemente han aparecido al menos dos sistemas de biochips adaptados a la identificacin de
estas molculas, cuyo desarrollo promete abaratar y agilizar los procesos de caracterizacin de estos
biocompuestos.
Ambos sistemas se fundamentan en la especificidad de la unin entre protenas.
DEFENICION
APTAMEROS 7
Los arrays de protenas son una plataforma que permite el anlisis masivo, en paralelo y simultneo
de interacciones proteicas.
Hasta la fecha, se han desarrollado y empleado diferentes formatos de arrays de protenas en
distintas aplicaciones, donde se incluyen la identificacin de biomarcadores o el desarrollo de
vacunas. Los microarrays de ADN, que se han convertido en los ms utilizados microarrays.
CONSTITUCIN
El chip consta de una superficie de soporte tal como un portaobjetos de vidrio, membrana de
nitrocelulosa, perla o placa de microtitulacin, a la que una serie de protenas de captura es obligada.
de la sonda molculas, normalmente marcados con un colorante fluorescente, se aaden a la matriz.
Cualquier reaccin entre la sonda y la protena inmovilizada emite una seal fluorescente que es
ledo por un escner lser.
TIPOS DE MATRICES
1. Microarrays analticos conocidos como matrices de captura:
En esta tcnica, una biblioteca de anticuerpos, aptmeros o aficuerpos se visti sobre la superficie de
apoyo. Estos se utilizan como molculas de captura ya que cada une especficamente a una protena
particular.
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implican muestras complejas, tales como lisados de tejidos. Se aslan las clulas de diversos tejidos
de inters y se lisan. El lisado se visti sobre el microarrays y se sonde con anticuerpos contra la
protena diana de inters.
Diagnstico
implica la deteccin de antgenos y anticuerpos en muestras de sangre; la elaboracin de perfiles de
los sueros para descubrir nuevas enfermedades biomarcadores; la vigilancia de las enfermedades y
las respuestas a la terapia en la medicina personalizada; la vigilancia del medio ambiente y la
comida.
Caracterizacin de anticuerpos
est caracterizando reactividad cruzada, especificidad y cartografa eptopos.
La protemico
se refiere a la expresin de protenas de perfiles, es decir, que las protenas se expresan en el lisado
de una clula particular.
Anlisis funcional
La protena es la identificacin de las interacciones protena-protena (por ejemplo, identificacin de
los miembros de un complejo de protenas), las interacciones protena-fosfolpido, blancos pequeos
de molculas, enzimticos sustratos (en particular los sustratos de quinasas) y los ligandos del
receptor.
El tratamiento
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REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
1. Ellington AD, Szostak JW. In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands. Nature.
1990 Aug 30;346(6287):81822.
2. Tuerk C, Gold L. Systematic evolution of ligands by exponential enrichment: RNA ligands to
bacteriophage T4 DNA polymerase. Science (New York, N.Y.). 1990 Aug 3;249(4968):50510.
3. Renner S, Popov M, Schuffenhauer A, Roth H-J, Breitenstein W, Marzinzik A, et al. Recent trends
and observations in the design of high-quality screening collections. Future Med Chem. 2011
Apr;3(6):75166.
4. Wang RE, Wu H, Niu Y, Cai J. Improving the stability of aptamers by chemical modification. Curr
Med Chem. 2011 Jan;18(27):412638.
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