Lehninger PRINCIPIOS DE BIOQUIMICA (alrite meta (67 % DAVID L..NELSON MICHAEL M. COXxiv indice de mates Indice general Prilogo W 1 Fundamentos de bioquimica 1 VESTRUGTURAY CATALISIS 49 Elagua 47 ‘Aminodcidos, péptides y proteinss 75 Estructura tridimensional da las proteinas 135 Funcidn de las proteinas 157 Enzimas 190 Ghicidos y glucobiologia 238 Nulebtidos y deidos nucieicos 273 ‘ecnologias de la informacién basadas en el DNA 306 10 Lipidos 343 11 Membronas biolégicas y transporte 365 12 Blosefalizacién 428 weeseasen MW BIQENERGETICAY METABOLISMO 481 12 Principlos de bivenergética 489 14 Glucdlisis, giuconeogénasis y ruta de las pentosas fosfato 522 15 Principios de regulacién metabolica: lucesa y guedgeno 560 16 Eleico de Sci chico 01 37 Catabolism de los cides gases 621 ‘M8 Oxidacién de aminodcidos y produccién de urea 656 19 Fosforilacion oxidativa y fotofosforilacién 690 20 Biosintesis de ghicidos en plantas ybacterias 751 21 Biosintesis de lipides 787 22. Biasintesis de aminoacids, nucledtides ¥ moléeulas relacionadas. $39 223. Integaciény egulacién horonal det mictabolismo de los mamiferos. 881 Ill LAS RUTAS DE LA INFORMACION 921 24 Genes y cromasomax 921 25 Metabolismo del DNA 948, 26 Metabolismo del RNA 995 27 Metabolismo de las proteinas 1034 ‘26 Regulacién dela expresion génica 1081 ‘Apéndice A Areviaturas comunes on ta literatura centiica bionuimica &-1 ‘Apéndice 8 Soluclones abreviadas de los problemas SA-1 Glosario G1 Procedencia de tas lustracfones It Indice alfabético 11 _ INDICE DE MATERIAS _ 1 Fundamentos de bioquimica 1 ‘L.A Fandamontes calulares 2 Las calulas son las unidavtes estructurales y funeionsiles dle todos los organismas vivos 3 Las dimensiones celulares estén limitadas por la capacidad de difusiin del oxigen 4 Los sores vivos seclasifiean en trax dominion 4 Escherichia coli et la cétula procariétiea mejor estudtada 6 Las células eucariaticas paseen diversos orgmislas miembranosos que pueden aislaree para su estudio 6 El citoplasma se organiza gracias al eitoesqueleto yesaltamente dindmico 9 Jas células constrayen esinucturas supramaleculares 10 ‘Los estudlios in vitro podrian no detectar interaeciones importantes entre moléculas 11 4.2 Fundamentos quimicos 12 1s biomoléeulas son sompuestos de carbon con una diversidad de grupos furcionales 13 [Las macromoléenlas son los prineipales constituyentes de ls celulas 15 fRecuadro 1-1 Peso molecslar, masa molecular y tas unidades que doben utliearso 15 La estructura tridimensional se deseribe en términos de configuracién y conformacién 16 Recuadro 1-2 Louls Pasteary la actividad Optica: in vino veritas 19 Las interacciones entre Ins biomoléculas son estereoesnecificas 20 4.3 Fundamentesfisicos 21 Los onganismos vivos existen en un estado estaeionario dindmico y no st encuentran nunca en equilbrio con swentomo 31 ‘Los organismos transforman energia'y materia 22 BI flujo de electranes proporeiona energia para los organismos 22 (Crear y mantener el orden requleré trabajo y energia 23 El acoplamiento energgético eonecta las reacciones bioligicas 23 Recuadro 1-3 Entropia: as ventajas do estar desorganizade. 24 Koq¥ AG micden la tendencia de una reaccién Dara transcurrir esponténeamente 26 116s enattoas fecilitan las secwencias de reacciones quimnicas 26 | metabolsmo est regutado para conseguir equiibrio yecanomia 27 11.4 Fandamentos genéticos. 28 La continuldad genétiea reside en Ins maléewias de DNA 29 ‘La estructura del DNA hace posible eu replicacién y reparacion con fidelidad casi perfecta 29 a secuencia tinea del ENA codifica protefnas con estructuras tridimensionales. 29 4.5 Fundamentes evotutives 94 Los cambios en las instrueciones hereditarias hacen posible laevolucién 31 Las primeras biomeléculas aparecierom por evolucién quirica 32 ‘La evolucion quimica puede simularse en el laboratorio. $2 as primeros genes y eatalizaciores podrian haber sido rmoléculas de RNA a precursores relacionados 32 La evoluicién biol6gica emper0 hace ris de tres mil uinientos millones de afios 34La primera eélula fue probablemente quimicheterstrofa 34 Las células cucaridticas evolictonaron a partir de las procaridticas a través de diversas fases 96 La anatomia molecular revela relaciones evelutivas 36 La genomica funcional permite deduct Ia dorrespondencia entre genes y procesos ¢elulares especificas 35 ‘La comparacién de genomas tendr una importancia eada vex mayor en la biologia y mericina Iuuinanuss 38 I ESTRUCTURAY CATALISIS 45 2 Elagua 47 ‘2: Interneeiones débiles en ls sistemas acvoses 47 Los puentes de hidrdgeno confleren al agua sus propiadades extraordinarias 47 Bl agua forma puentes de hidréigeno con. las sotutos polares 49 Bl agua interacciona electrostdticamente eon los solutos cargados 500 Laentropis aumenta cuando ge disuelve una sustancia cristina BL Los gases apolares se disuelven mal en elagua 62 tos conpursslus apolares taerzan cambios destavarables ‘energ¢ticamente en la estruetura del agua 52 ‘Las interaotiones de van der Waals son atracciones Interatémicas débiles 64 [Las interaceiones debiles son cruciales para la estructura. y funeién dels macromoléculas St Las solutos afectan a las propiedades coligativag de lat Wsoluciones acwoear 56 Recuacro 2-1 Respnesta teil en plantar: um fondmene csmitico 58 2.2 lonlracién del aga, écidos débilesy bases débiles 60 El agua pura esta ligetamente ionizada. 60 [La ionizacién del agua se expresa mediante una constante de equilibria 61 {a escala de pH representa las eoncentraciones de HI yOH” 61 ecuaden 2:2 E producto ténice del gue: des prableenss Hustrativos. 62 Los fcidos y bases débiles tlenen constantes de disnciacién caracteristicas 63 ‘Las eurvas de titulactén proporcionan el pX de los cides debiles 64 2.3 Tamponamtontos contra cambios de pH on les sistemas biolégieas 65 Lostampones son mezelar de cides d6hiles y sus bases conjugadas 66 Una expresiGn sencilla relaciona pH, pit, y concentraeién detampén. 66 Lasdicidos o bases débiles tarsponan célulasy tejidos contra cambios de pl 67 Recuadro 2:3 Resolucton de problemas con la acuaclén \de Hendersen-Hassethalch 87 ‘Rocuadro 2-4 Sangre, pulmones y tarp: el sistema tampén ‘dal blembonats 69 2.4 El agua come reactivo 69 2.5 La adecuscige dl ambiente acuose a les organismos: Wes 70 Indice de mates ay 3 Aminodcidos, péptidos y proteinas 75. 31 Aminoseidos 75 [Las aminodcidos tienen caracter‘sticas estructurales communes 75 Los residuos aruinodeidas de las protetnas son ‘estercoisimeras TT Los aminodedsos se pueden dai segun su grupo Ke (8 tos amines no estandar ne también importantes funciones 80 Los aminodcides pueden actsar como dcirlos y bases 81 Recuadro 3-1 Absorcidn de ta luz per Iss moticulas: lay de Lambert eer 82 [Los aminodcios tienen curvas de titulacion earactersticas. 82 La curva de titulaeién predice la carga eléctrica de los aminnscidin 8d ‘Los aminodcidos differen en sus propiedades deido-base 84 3.2 Péptidesy proteinas 85 Los péptitios son cadenas de aminodeidos 85 Los péptidos pueden distinguirse por su eomportamiento de ionizaciin 86 Existen péptidos y polipéptides biolégicamente activos de una gran. dad de tamafios 86 Les polipéptcos tlenan una composicisn de anivusicilas caracteritiea 87 Algunas protefnas contienen grupos quimicos diferentes ‘los aminodcidas 88 Existen vuries niveles de estructura de las proteinas 88 ‘3.3 Trabajar con proteinas 89 Las proteias ce pueden separae y purificar 89 as proteinas pueden separarse y caracterizarse porlactroforecis 2 Es posible cuantificar las proteins no aisladas 94 ‘34 Estructura covtonte de las protoinas 96 ‘La funcién de una protaina depende de su socuencia de aminoécidos ‘0 Se ha determinada la secuencia de aminodeidos de millones de proceinas 06 Las pallpéptidos cortos se secuenclan utizando Droecdimientg wutemssticos 7 ‘Las proteinas grandes deben secuenciarse a partie ade fragmentos mas pequenos 99 ‘las secuencias de atninocidos se pueden deducir también mediante otros méidos 100 Recuadro 3-2 lvestigacién de 1a protsinas mediante ‘a nspectromitria de masas. 102 Pucden sintetizarse quimicamente péptices y peoteinas equesias 104 1a secuencin de aminodcidos proporeiona informacién bioguinica imporeante 106 3.5 Sncwoncias de proteinas y evelucién 106 {Las secucncias de proteina permiten deducir la historia dela vida en la Tierra 107 4 Estructura tridimensional de las proteinas 116 4.1 Visidn general sobre la estructura protolca 116, La conformaciin de una proteina esté estabilizada Drineipalmente por interacsiones débiles 117 Blenlace peptidico es plano y rigida 118avi Incice de materas, 4.2 Estructura secundaria de las proteinas 120 ‘Lali aes una estructura secundaria habitual fen proteinas 120 ‘La secuencla de aminodeidas afecta aa estabilidad delanelice a 121 Recwadra 4-1 Céme distngui dextrSghro de levgiro 122 Laconformacicn 6 organiza las cadenas polipeptidicas enforma dehaja 123 Los giros 6 son frecuentes en las protefnas 125 Las estructurns secundarias comunes tienen angulos de enlace y un contenido de aminadcides caracteristien 124 ‘53 strvctras teria ycuaternara de as proteinas 125 {las proteinas fibrosas estn adapiadas a una funcién estructural 128 RRecuaden 4-2 La ondsacKén permanente es un sjemple de Ingenieria tioquimica 127 En las protetnas globulares la diversidad estructural reieja la diversidad funcional 123 Recuadro 4-3 Razones para que los mariners, exploradores ‘sludlanies unlrersiaros consuman ruta yverdurasfreseas_ 120 La miogiobina proporcioné las primeras ciaves acerca dela ccomplejdad de las estructuras proteicas globulares 132 Las protesnas globulares tienen estructuras terciarias diversas 134 Rocuadro 4-4 Métodos para detsrminar ta estructura tridimensional de una protsina 138 Btandlsis de numerosas proteinas globulares revela patrones| estructurales communes. 139 Los motives proteicos constituyen Ia base dela elasiGearién estmctural de las proteinas. 14 Las estructuras cuaternarias de lat proteins comprendien doce dimeros sencillos hasta grandes complejes 144 ‘Bxisten limites al tamato delas proteinas 146 4.4 Desneluraliantin y plogamiente de proteinase 147 La périida de la estructura conduce ala périda de funcion 147 1a secuencia de aminodicidos determina la estructura terciaria 148 1s polipéptids s¢ pienan répidamente y sean wn proceso de varias etapas 148 ‘Recusdra 4-5 Musrt por un plegamlonta Incorrect: las ‘enfermedades widnleas 150 ‘Algunas proteinas sufren un plegamiento acistido 151 5 Funcién de las proteinas 157 ‘5.1 Uniden reversible proteina ligand: proteinas de unis a oxigeno 158 Bl oxigeno punde estar unida a un grupo prostético hemo 158 ‘La mioglobina tiene un inco sitio de fjacion para ‘sloxigeno 19 Las interacclones proteina-ligando se pueden describir: cuantilativamente 160 ‘a estructura proteica afecta al mado de union del ligando 162 El oxigen es transportado en la sangre por a tnioglobina 162 Lar eubunidades de la hemoglabina son similares estructuralmente a la mioglobina 163 Lahemoglobina experimenta un cambio estructural al unirse al oxigeno 164 Lahemoglobina une oxigeno de manera cooperativa 164 ‘La unin cooperstiva de ligands puede ser deserita cunntitativamente 167 Existen dos modelos que explican los mecanisios de Ia ‘unién cooperativa 187 Reouadro 5-1 Monixido de carbono: un asesio silencioso. 168, Lahemoglobina tarrbién transporta H" yO, 170 ‘La.unisn de oxigeno a la hemoglobina esta regzlada por el 2.s-bisfosfeghecerato 171 ‘La.anemia falciforme es una enfermedad molecular de la hhereoglobina 172 5.2 Interacclones complamentarias entre proteinasyligandos: ‘ol sistema inmwnitarioy las inmunogiobulinas 174 La respucsta inmounitaria os ol resultado de la seei6n de una serie de células y proteinas especialzadas 175 Las céluias distinguen To propio de lo ajeno exponiendo péntidos en su superficie 176 Los anticuerpas poseen das sitios idénticos de unién antigeno 178 Los nticuerpos se tunen fuertemente al antigeno de una manera especifiea 180 Las interaeciones antigeno-anticwerpo son la base de diversos pprocesos analiticos importantes. 180 5.3 latoracclones proteleas moduladst por energia quimies: actina, miosinay motores molecuiares 182 Las principales proteinas del misculo son la actina ylamiosina 182 tras proteinas adicionales organizan los flamentos delgado yy grueso en estructras ordenarlas 184 Los flamentas gruesos de riosina.se deslizan alo larga eos filamentos delgaddos de actina 185 6 Enzimas 190 6.1 Introduccién a ls ensimas 191 La mayorfa de enzimas son proteinas 191 Los enzimas se clasifican sein las reacclones que catalan 192 8.2 {Chime funcionan les enuimas? 199 Los encimas alteran las velocidades de reaccién pero nolos equilibries 193 Las velocidlades de reaccidn y lo equiibrios tienen. definiciones termodinsmicas precisas 195 Tinos pene principins explican el pnder eatalitien y la especificidad de los enzimas 136 Las interacciones débiles entre enzima y sustrato son dptimas en el estado de transicién 197 Los eraimas utilizan la energia de fjscion para proporcionar especificidad de reacciGn y catélisis 198 Grupos catalticos espectficos contnbuyen fal eatslisis 200 62 Lacinétles enrimétiea cama métade para camprendat ol mecanismo 202 La concentracion del sustrato afecta a la velocidad de las reacciones catalizadas por engimas 202, 1La relacion entre concentraciOn de sustrato y velocidad de reaccin se puede expresar dé wanera cuantitativs, 204 Para comparar las actividades enrimatioas se utilizan lox parimetres cinétieos 205 ‘Recuadra 6-1 Transformaciones de la ecuacién ‘de Michaelis-Menten: grifica de dobles reciproces 208, “Muchos enzimas catalizan reacciones en las que intervienen dos o mas sustratos 207 La cinética en el estado pre-estacionario puede aportar ‘pruebas sobre pasos especificas dela reaccién 208Los enimas estén sojetos a inhibicidn reversible ‘ireversibie 208 Recuadro 6-2 Pruebas cinéticas para determinar ls mecanismos de intibieién, 210 El pH afecta a la actividad enzimvitica 212 6.4 Ejemplos de escclones omvindticas 213 En el mécarismo de la quimotripsina se prodiuce la acilacién y desacilacién de un residuode Ser 213 ‘En la hexoquinasa se produce un encaje inducido durante Ta union del sustrat 218 El mecanismo de reaccidin de la enolasa requiere Ia presencia de tones metilicos. 219 Recuadro 6-3 Prucbas dela camplementariedad entre el encima Yol estado de transicin 220 El lisozima ubliza dos reacclones de desplazamientor nucleoffico sucesivas 222 65 Ensimasroguladores 225 Los enzimas alestéricas exnerimentan camnbiess canfarmarie- rales en respuesta la unign del modulador 225 En muchas rutas las etapas reguladoras estén catalizadas por enzimas alostéricos 226 ‘Las propiedactes cineticas de Ins enna alostéricosdifieren dol comportaniento de Michaelis-Menten. 227 Algunos enzimas regulndores experimentan modificaciones covalentes reversibles 228 Los grupos fosforilo afectan a la estructura y la actividad ccataifaca de las proteinas. 28 Las fosforilaciones miltiples permiten un exquisite control dela regulacidn 230 Algunos enzimas y otras proteinas con regutados mediante Ia robura proteotitica de un precursor ensimtico 2331 Algunos encimas reguiadores utilan varios mecanismos de regulacién 232 7 Glicidos y glucobiologia 238 1.1 Monosacdtidos yaissesridos 238 Las dos familias de moncescaridon: aldosas y cetoaas 239 Los monasacartos tienen centros asimétricos 239 Los monossicarios cormunes tienen estructura-cictica 240 Los onganismes contienen nurmetosos derivadiss de lax hexosas 243 Los monasacaridas sor-agentes reductores 244 Los disacaridos contionen tun enlace giueostdieo 245 7.2 Polsacdrides 247 ‘Algunos homopolisacdridos son formas de almacenaméento de combustible 217 Algunos polisacdridos tienen funcidn estructural. 248) Factores estéricos y los puentes-ce hidrégeno-contribuyen, al plegamienta de los hamopolisacdrides 250 ‘Las pareses celulares de algas y bacterias contienen, heveropolisacdridos estructuralas 252 Los ghucosaminnglucanos son heteropalisaciiidos de la matrizextracelular 253 7.4 Glueoconjugados: proteogiucanos, Sucoproteinas yecolipidos 255 ‘Los proteoglucanos son macromoléculas de la superficie colulary de la matria extracelular que contienen slucosiminoglucanss 256 Las glueoprotainas eontienen aligosaearicos uniclos covalentements 258 Los glucolipidos y los lipopolisacdrida’s son componentes de la membrana 260 Indica do mates ah 7 Los glieidos camo moléeules partadoras de informacisn: el cédigo de lox amtiearas 264 Las lectinas son proteinas que leen el cOdigo-de los xzicares, ® intervienen en muchos procesos bioldgieas 262 Las interacciones lectina-ghicido son muy fuertes y muy especificas 264 7.5 Anéiise de plieldos 267 8 Nucleétidas y dcidos nucleicos 273 ‘8.1 Algunos conceptes bisicas: 273 ‘Los nuclestidos y dicides nucleicos estén formados por bases Y¥ pentosas caracteristicas 273 [Los nuclestides sucesivos de los éeidos nucleleos estén unidos por enlaces fosfodiéster 276 Las propiedaces de los bases de Ine mnelectides indtuyen en la estructura tridimensional dé los dcidos mucleicas 278 8.2 Estructura doles deldos nuclleee 279 EI DNA almacena informacion genética 290 ‘Las moléculas de DNA tienen diferente composicidn cde bases 281 EI DNA es una doble hélice 282. ELDNA adopia diferentes forme tidimencionales 289 Algunas secuencias de DNA adoptan estructuras no abituales 285. Los RNA mensajeros codifican las cadenas polipentidicas 287 ‘Muchos RNA tienen estructura tridimensionales complejas 288 ‘8.3 Quimica de los acidos mucteices 281. ELDNAy el RNA de doble hdtice pueden desnaturazarse 201 Los cidos nusleicos de especies diferentes pueden formar Aubrides 292, [Los nueltidos y las citdos rusceicos experimentan Inansformarinnes na enrimétions 208 _Algunas bases det DNA eatin melladas 296 Es posible determinar la secuencia de largas cadenas de DNA 296 La sintesis quimica de DNA hasido automatizada 298 ‘8.4 Otras funciones de los nuciedtides 300 [Los nueledtides transportan energia quimica ‘enlas eélulas 300 ‘Los nuelestioa de adenina forman poste de muchos -coffactones enziméticos 201 Algunos nucledtidos son moléculas reguladoras 302 9 Tecnologias de la informacion basadas enelDNA 306 ‘9.1 Clonscidn del DNA: fundamentos 306 BLDNA recumbinante se produce con endonucleases de restriccién y DNA ligasa 307 Los vectares de elonacién permiten ta amplificacign de fragmentas de DNA insertados 311 La hibridaeton permite la deteccién de secuencias especifieas deDNA 314 La expresién de genes clonaros produce grancies cantidades de proteina 315, [is alteracién de los genes elonados produce protainas modlificadas 316 ‘9.2 De los genes 8 los genomes 397 as genotecas suministran catdlogos especializadlos de informacion gendtien 318vill ion de mateias 1a rearsiin en cadena dela potimarasa ampliiea secuencias de DNA especitioas 319 Seeueneiacion de genamas enteros 321 Recuadro 9-1 Un arma poderose para a medicina frenso 222 8.3 Datos genomas aos protessonas 225 ‘Las relaciones entre las secueneias o Jas estructuras dan informaclén sobre la fncién de las proteinas. 20 {Los patrones de exprosidn celular pueden revelar la funcién celularde un gen 226 1s deteccion de las interacciones proteina-protains es siti nel estudio de las funciones celulares y meleculares 327 8.4 Motificaclanes 4¢ les genomas y nuevos productos bictecnoligices 330 Un parisito bacteriano fueita la clonaeién en plaitas 920 ‘La manipalseién de los genomas animales suministra informacién sobre la estructura de los erormasonas ylaexpresidn génica 332 ‘Las nuevas teenologias pueden facilitar el descubrimiento de nuevos firmacos 935 Recuadro 9-2 € genoma human y a torapla gékes humana 296 [La tecnologia del DNA recombinante afrece nuevos productos y nuevas posibiidades 338 10 Lipidos 343 10.2 Lpides de stmaconamiente 242 [Las écidos grasos sun derivados de hidrocatburos. 43 Los tracligiceroles son ésteres de dcidas geasos yellcerol. 345 1Lostracilgliceroles aportan energia slmacenada Yaislamienio 346 Muchos alimentos contienen triacildiceroles 46 Recuadro 10-1 Cacholotes: caberones de ins profuncidates 347 tas core airven como almacens de exeeraiay como eubiertas impermeables al agua 348 102 Liphds ostrucurales de las membranas 348 ‘Los slicerofostatipidos son derivados del cia Tosfaidieo 240 Alguros fosfolipidos tlenen acids grasos unidas por enlace ter 340 los eloroplastos contienen galactalipides y sulfolipidas 361 [Las arquebacteriae contionen lipides de membrana particulares 352 114s esfingolipidos som detivados de laesfingosina 352 Los esfingolipidos de la superficie celular son sitios de recanocimiento hiligica 953 [Loo fesfolipidosy los estingolipidos se degradan en lisosomas 354 [Los esteroles tienen cusizo anillos hidrocarbonados fusionadas 354 Recuadro 10-2 Algunas enfermedades genticas humanas son eoneaevenels de wna acimulaelén anormal de lipides de wembrana 356 410.3 Lipkios come seiiales, cotactores yplgmentos 357 ‘Los fosfatidilinositoles son derivades de esfingosina que aetdan como seflales intracchulares 367 {Los icosanoides son portacores de mensajes a las céitias vecinas 358 ‘x hrtnonas esteroideas transportan mensajes entre tejidas 359) {Las plantas utilizan fosfatidilinostales esterotdes y ccompuestos tipa icasanoicde para enviar sefisles 360 Las vitaminas A yD son precurores hormonales 900+ Las vitaminas By Ky bss quinones pidieas son coractores ide onidacidn-reducciin 362 Los dolicoles aetivan precursores yluelices para Tnbiosintesis 363 WA Tiabojar con lipides 363, ‘La extracci6n de lipidas roquiere la tilizacién de disolventes ‘orgsnicos 384 La cramatografia de adsarcién separa los ipicies de polaridad diferente 365, La cromatografia gas-quido separa las mezelas de derivatlos Epldices volitiles 365 La hidrdliss espocificn ayuda a determinar bs estructura Upidien 365, La espectrometria de masas revela la estructura lipides completamente 265 11 Membranas biolégicas y transporte 369 11.1 Campostetén yarquitectura de las membranas 370 Gada tipo de membrana presenta una composicion de proteinas y lipides caracteristica 370 ‘Todas Is metnbrainas binl6gicas comparten ciertas propiedades fundamentales S71 Eelemento bésico estructural de las membranas €3 tuna bleep lipidiea 971 ‘as pentefnas periférias de membrana oe oolubiean féciimente 373 Muchas proteinas abarcan la bicapa lipidica 3173 Las protefnas integrates son sostenidas en la membrana or interaceiones hidrofSbieas con lipides 37 Puede predecirse la topologia de una proteina integral dicmembrana a partir de su secuencia 376 Lipidos unidos covalenterente anclan algunas proteins: demembrana 978 112 Dindmica de membranas 380 [Los grupos aco del interior de la bicapa estén ordenados en grados diferentes 380 El movimiento de lipidos transbicapa requiere eatélisis 381 Lipidos y proteinas difunden lateralmente en labicapa 382 Los esfingolinidos y el colesterol se agrupan eonjuntamente enbalsas de membrana 383, Recuadro 11-1 Wieroscopia de fuerza atémica pra vsualirar protoinas de membrana 388 Las caveolinas definen una clase especial de baloas demembrasia 385 ‘Gierias proteinas integrales favorecen las interacciones ‘ntercelulares y In achesién, 396 lbs Susicn de las membranas es crucial en muchas procesos bbioldgicns 387 11.3 Tansporte de solutos a través de membranss 389 Protease ureanbracm faclliian el transporte paaivo Jas transportaciores poesien agruparse en superfamtias sein Susestricturas 391 Fi transportadar de ghicosa de fos eritrocitos faciita eltransporte pasivo 38h Elintereambisdor de clorueo-bicarbonato cataliza ¢€1 cotransporte electroncutro de aniones a través, de a membrana erltrocitaria 395 ‘Recuadro 11-2 Tansporte defectunse de glucasa y de arua ‘4 dos Formas de diabetes 396 E! transporte activo da lugar al movimiento de soluts contra un ‘Sradiente de concentracion o gradiente electroquimnica S97 Las ATPasas experimentan fesforilaciin durante sus ciclos catalticos 338fnesce ce materi Las bombas de Ua tipo B mantienen una taj concentracion de calcio ene citosal. 400 Las ATPacas tipa F son bornbas de protones reversible Ampulsadlas por el ATP_ 401 Los transportadores ABC utlizan ATP para imputsar eltransporte activece una amplia gama de sustratos: 402 Los gradientes de iones proporcionan la eneraia para eltransporte activo secundano 402 Recuiadro 11.3 Un canal linica dafoctuasn en la beac swistica 403 Las acuaporinas forman canales transmembrana hideoiices para el paso deagua 406 Los carales selectivos de iones permiten el movimiento rapido de iones a través de Ins membranas. 408 lua funcidn det canal iénico se mide eléctricamente 409 [La estructura de un canal de K* muestra las bases de suespcifieidad 400 Bi canal de Na" neuronal es un canal vonteo ce compuerta requlatia porvaltaje 410 El receptor de acetilcotina es ua canal i6nicn de compucria requlasla porligando: 411 ‘Canales iénicas defeetuosos pueden tener consecuenchas Bsioligicns adversas 415 12 Biosefalizacién 421 12.1 Macanismes moleculares de transducelén do tofal 422 Recuadro 12-1 anilisis de Scatchard evantiiea la interacclon receptoriiganda 423 412.2 Canales inicos do compuertaregulada 425 Los carales inicas sone! fundamento de la sefulaaelén eléettica en ofilas excitables 425 El receptor nicotinica de acetileolina es un canal idnico de compuerta regulada por ligand 26 Los canales iénicos de compuerta regulada por voltaje ‘roducen potenciales de accion neuronales. 427 Las neuronas tienen canales receptores que responden ‘una variedad de neurotransmisores 428 12.3 Emimas receptores 425 El receptor de insulina es una proteina quinasa especficn de tirosina. 429 [Las guanill eiclasas de receptores generan el segundo mensajero eOMP. 133 412-4 Receptoves acoplades a proteina &y segundos mensajeras 435 El sistema receptor B-arirenéreico ac‘tia através del segundo ‘mensajerocaMP 435 El receptor P-adrenéreico se desensibiliaa poor fosforlacién 439 LAMP ciclico actita como seguncin mensajero ‘ara un conjunta de moléculas regulacioras. 441 [bos segundos: mensiyeros procerien le Fosfaticilinasitoles 42. El calcio es un segundo mensajero en muchas tranaducciones le seal 442 Reeuado 12-2 FRET: bioquimicavisualizada en una céula via 445 12.5 Proteinas de armazin polhalentes y balsas de membrana 448 ‘Médulos proteicos tunen residuns deTyx, Ser o Thr fosforilados de proteinas asoeindas 448 dhs bles de sncabrasy las caves pueden sere ‘proteinas de sefializaciin 451 126 Sefalizaci6n en microorganismes y plantas 452 ‘La sefializaciin bacteriana tmpone Is fasforilacicn, ‘en uinsisterna de dos componentes. 452 ‘Los sistemas de senallizacidn en plantas tenen algunos de los componentes utilizados por microbice ymuamiteros 452 Las plantas detectan etileno a través de un sistema, dé dos componenites y una cascada MAPK 454 ‘Proteins quinasa tipo receptor Lransducen seflales cde péptidos y brasinosteroides 455 12:7 Thansducciéa sensorial en ta vista et olfatoy el gusto 456 La lux hiperpolarion le canine y bastones del ojo, de vertebrados 456 La luz desencadena cambios de conformacion en el receptor de larodopeina 457 la rodopsina excitada actin a través de la protefna G ‘ransducina reduciendo la concentracionde cGMP. 457 [La amplificacién de Ia sefal vizual iene lugar en los bastories yeonos. 458 La. seral visual termina rapidamente 458 La rodopsina se desensibiliza por fosforilacién 459 ios conos estén especializades en la visién en color 460 El olfatoy el gusto en vertebradat ntizan mecanizmos similares al sisterna visual 460 Recuatira 12-3 Dattonésma: experiment de Jan Dalton desde ta tuniba 461 uns sistemas de receptores serpentina acoplados a protein G presentan caracteristicas conmines 462, La interruption en la seftallzacion par protefnas O pruvucas enfermedades 454 12.8 Regulacién de ta transcripcién por hormonas esteroideas 465 12.9 Repulacin del ciclo celular por proteinas quinasa 466 El cielo celular tiene cuatro tapas 465 Los niveles de las protetinas quinasa dependientes de ciclina ‘experimentan oscilaciones. 467 Las CDK regulan la divisién celular por fosforitacion ide proteinas lave 470 12.10 Oncogsnes, gones supresores de tumores y muerte celular progamada 471 [Los oncogenes son formas mutadas de genes de protetnas que regulan el cielocelalar 471 Defoctos en Jos genes supresorvs de tumores eliminan restricciones normales de la division celular 472 La apoptosis es cl suleidlo celular programarlo 473 Il BIOENERGETICAY METABOLISMO 481 13 Principios de bioenergética 489 13.4 Biocnersética ytormodinimica 490 lias transformaciones bialGwicas de energla obedecen las leyos-de la termodingmica 400 Las células nrecisan firentes de enersfa libre 491 Lia variaridn de enorgia ire estandar estd directamente ‘relaciorura con Ia constante de equilibria 49] La variacidn de energia libre real depende de-las concentraciones de reactivos y presiuetos 493 [uns variaciones de energia libre estndar son aditivas 494 13.2 Transferencia de crupes fostoriioyAIP 438 [un variacion de energia libre en ia hidrolisis del ATE es arandey negutiva 496 (O:ros compusestos fosforilades y tinésteres también tienen ‘eneraias libres de hirélisis elevadas 407 ‘Recuadra 13-1 Energia lee de Nidrélas del ATP dentro de las células: el caste eal de los procesos metabélices 498vx Indice de matiras a FLATP proporciona energla por transferencia de grupo. YY no por simple hidrdlisis 500 Fi ATP dona grupos fosforile, pirofostorilo y adenilila 502 ARocuradra 13:2 Los destetes de la lucérnaga: informes resplandecientes del ATP 503 {Ea formacién de macrormoléculssinformativas requiere ‘energia 504 {ELATP sporta energia para el transporte activo ylacontraccién muscolar 504 Las transfosforilaciones entre nucledtidos se dan en todos Tos tipas celulares 505 1 polifoststoinorganieo es un dador poteneial de grupos fosforlo 506 Las ecuaciones bioquimicas y quimicas noson Kénticas 505 12.3 Reaesiones do oxidacti-reduccién 507 El flujo de elecirones puede realizar trabajo biologico 507 Las reaceiones de oxidackin-reduccidn se pueden deseribir en forma de sereireacciones 608 nla oxidaciones biologieas interviene con frecuencia Tadeskidrogenacion 608 ‘los potenciales de redeem son una medida de Ia afinidad por los electrones 509 Los potenciales de reduccidn esténdar permite al caleulo “Ge la varlacinse energia bre 510 ‘La oxidacién celular de glucosa a didxide de carbone Trequiere transportadores de clectrones especiaizados 512 nos cuanios tipos de coenzimas y proteinas actian ‘como transportadores urivétsales de electrones 12 BINADHy ¢l NADPH setian con Is deshidrogenasas como transportadores salutles de electrones 612 La deficiencia en la dicta de niacina, forma vitaménica, ‘del NAD y del NADP, produce pelagra 14 Los nucleotides de flavina estén fuertemente unidos ‘en las favoprotesnas 515 14 Glucdlisis, gluconeogénesis y ruta de las pentosas fosfato 521 24,1 ciucotmte 322 : Una vishon global la gluccisis tlene dos fases_ i La fase preparatoria de la ghucélisis precisa ATP 625 Ta fase de Deneficios de Ia guests produce AXE yNADH 629° Bi balance global muestra una ganancia neta de ATP. 633 La ghucélisis est sometida a una regulacién estricta 533 El calabolistna de Ia glucosa esti alterada en el tejido canceruso 533 14.2 Putas alimentadoras cea puciiis 534 ‘Bl luesgeno y el almidén se desradan mediante osforous 4 ‘Los pollsedridos y dsarsride de la dita se hidrolizan ‘a monosacérides 595 Otros rmonosaedridos pueden entrar en diferentes puntos delarita gucoftea 636 443 Destinas del pinata en condiciones anaerébicas: termentaclin 538 El piruvato es ol aceptor electrénieo terminal nla. Terreiada Méctica 608 Eletanol es el producto reducido en la fermentacion alechilien 538 Recuadro 14-1 Atletas, calmanesy colacantos: a giedisls ‘en condiciones limitantes de organo 539 ‘La tiamina purofosfato transporta grupos aldehido activos” 540 -Algunas fermentaciones mictobianas dan ugar otros, productos finales eon valor comercial 541 ‘Recuadro 14-2 Elaboractin dela cervezs 542 144 Gluconeegénesis 543 La conversién dé piruvato en fosfoenoipiruvato requiere dos reapciones exergonicas 544 La conversion de la fruetosa 1,-bisfosfato cn fructosa 6-Losfsto constituye el segundo rodeo 47 La conversion de la ghucosa 6-fosfat en glucosa libre ‘constituye el tercer rodeo 67 La gluconeogénesis es enerpéticamente ena, pero es esencial S48 ‘Los intermediarios del cielo del écido ettrico y muchos ‘aminodcidos san ghicogénicos 548 a gliconcogtncaic ya glucélisis estan reguladas de forma. reeiproca 548 1145 Rutade las pentasas festato de oxidaciin deta gucosa 549 [La fase oxidativa produce pentosas fosfate y NADPH 550 FRecuadre 14-3 Pe qué na comia falafel Pitgpras?: Geficiencia de pucosa 6-fostato dachidregenasa S51 La fase no oxidativa recicla las pentosas fosfito « gluco Cefosfato 552 Elaindrome de Wernicke-Karsakoff estd exacerbada por in dlefecto en la transcetolasa BF-4 ‘La glucosa 6-fosfato se reparte entre la giuedisisy la ruta de las pentosas fosfato 554 15 Principios de regulacién metabélica: glucosa y glucégeno 560 15.1 Metabolismo del glueégens en animales 562 Uadegmdacion del gloctgeno est eatalizada ‘por nglucégenofostoriiasa 502 La lucona L-fosfato puede entrar en la gincitiss 0, ‘ene! higado, repaner la glucasa sanguinea, 563 El nucledtide-azdear UDP-ghueosa aporta glucosa paralasintesis de gucdgeno 665 “nseamore 19-1 Gan y Suny Gove onares 6A watt y las entermedades del giucdgeno 566 La ghicogenina incorpora los residuos iniciales de aziicar el gincogeno 568 16.2 Rogutacién do las ruts motabéices. 571 [as eélulas vivas mantienen un estado estacionario ‘dinamico 571 Los mecanismos reguladores se desarrollaron bajo fuertes presiones selectivas 671 Los enzimas regulaclores responden a eambios en ia ‘eoncertracson de metabolitos 672 Lis acliidaad enainsticn se puede alterne de diveroas rnaneras. 674 15.3 Regulacién coortnada dela hucisls la puconeogénesis 575 Tos isocimas de la hexoquinass ce mulscula y de higado ‘estan afectados de forma diferente por su producto, laglucasa 6fosfato 576 ‘Recuadro 15-2 lsozimas: proteinas diferentes que eatalizan amiome rsccién 877 1 foefofruetoquinase-1 se halla sometida # una completa Tegulacin alostériea O78 ‘La pinvvato quinasa es inhibidaalostéricamente porel ATP. 579(indice de materia Existen diversos puntos de control de Iagluiconeogeness ost La fructosa 2,6. bisfoafato es un regulador potente de la glucdlisis y de la ghuconeogénesis 581 4Son inatiles los cclog de sustratn? 583 ‘La ailulosa &-foefato es un regulador cave de los metabotismos ghicidice y lipidica 683 15.4 Regulacién coordinada de la sintesisy degradacion del guesgena 583, La slucageno fosfoniasa esta sipeta a control alosterien yhormonal 584 La ghucégeno sintasa tambidn estd regulada por fasforilacién. ‘Y¥desfosforilacién i [La slucdgeno sintasa quinasa3 interviene en las acciones dela insulina 586 La fostoproteina fosfatasa | #5 clave para el metabolismo del glnedgeno 58% Fl transporte al interiar de la oil timita a tizaciin de gincosa 588 El metabolisito ghucitlice esta coordinada por sefiales alostéricas y hormonales 588 ‘La insulina modifies la expresidn de muchos genes implicados en ef metabalismo de ghicidos y de tinidos 690 EI metabolismo de glicidos y de lipilos esta integradto ‘mediante mecanismas hormonales y slostéricat 691 16.5 Anise dl canta! metabllen 581 Se puede medir experimentalmente la eontribucion de cada enaima al fujo-a través de una ruta 692 El coeficiente de control euantifica el efeeta de un eambio fn una actividad enindtica sobre el flujo metabsticn através de una mata 582 El cosficiente de elasticidad esta relacionada eon li. sensibilidad de nn erimaa cambios en la concentracién ide metabolite 0 de reguiador 593 El coeficiente de respuesta expresa et efecto de un controlador extemo sobre el Miyo.a través dela ruta 508 EJ andlisis del control metalic se ha aplicaro al metabolismo glucidieo con resultados sorprencentes 50 [Recuocro 15-3 Andlisis del control motabélico: aspectos ‘cuantitathos 594 El andlisis del control metabslicn sugjere in método general para incrementarel inj a través de una ruta 598 16 El ciclo del dcido citrico 601 36.1 Producelin de aeotl-COA (acetato setae) 602 El piruvato se oxida aacetil-Gan y CO, 602 El complejo de ia piruvato cleshidrogenasa necesita cinco coerzirias 60% El complejo de la piruvato ceshirirogenasa est formado por trea ensimas diferentes 604 Bn Ia canalizacéin cle sustratos, ls intermediation nunca abancionan la superficie enzimatica 605 36.2 Reaecianes del cele del Seido etico 606 El clelodel dcidoeftricn tiene ocho pasos 608 Recuacro 16-1 Sintasasy sintetasas; igasasylssas; quinasas, {eefatasas y fosfoiiasas: 1s, na namenclatura confuse! 613 La energia de las oxidaciones del cielo se conserva eficientemente 614 Recuadro 16-2 Citrate: una molécula simética quo reacciona asimétricamente 614 Por qué es tat Contplicada la oxidacién del acetalo? G1G ‘Los componentes del ciclo del dei eftrica son importantes Intermestiarios binsinteticos 616 [Lag reacciones anapleriticas renonen los intermesiarios del Cielo del dcido citrico 616 Recuatro 16-3 Cltratosintaa,limonaday sumieistra mundial de alimentos. 6 ‘ta biotina de ta piruvato earboxilasa transporta grupos CO, 618 36,3: Regulacién del ciclo del éeldo citrica 624 La produccion de acetil-Coa por el complejo de la piruvato deshidrogenasa esta regularla por mecanismos slostéricns yoovalentes. G21 Elciclo del écido citico esta regnitaclo en sus tres etapas exergénicas 622 En el ciclo del écido eitrico puede dare la canalizacion de sustratos a través de complejos multienzimdtions 6222 164. El ciclo de giioxtato 623 El siule del xliunilaia produce compuestas de enatro carbonos a partir de acetato 623 Los eiclos del sicido-eitrico y det alioxilato tlenen una Fegulicign courcinada 624 17 Catabolismo de los dcidos grasos 631 417.1. Digestién, movltzacén y transporte de grasas 632 ‘Las grasas de la deta se absorben en el intestino delgado 692 {Las hormonas activan la raovizacion de tnacitgicerotes almacenados 634 Los ficidas grmsos son activaciosy transportados a interior de las mitoconeirias 635 17.2 Ouldaclén de los dcidos grasos. 637 La Broxidaciin de dcidas grasos saturacos se produce en cuatEO pasos bésicos G2 ‘Los cuatro pasos de la 8-oxidacion se repiten para generar acctubOvd.y ATP 099 Elacetil Goa puede continuar oxidéndasea través del ecto del acid eitrica 630 Recuadro 47-1 Los esos llevan a cabo la f-exidacién durante la hibernacién 640 ‘La oidaclén de Scklos grasos insaturados requiere das reacciones adicionales 41 {La axiniacidin de fics grasos de cariena impar requiere tres Feacclones adicionales 642 La oxidacidn de fcicios grasos est regulada 642 Defectas fensticos de las acil gras0-Coa deshidrogenasas pproducen enfermedades graves 645 Recuadro 17-2 El coensima B,,: na solucn radical dosconcertante. G44 ‘Los neroxisomas también llevan a cabo in B-oxiracion 616 Los proxisomas y glioxisomas de la plantas utilzan acetl- aA procedente te la B-oxidacién como precursor Diosintetico G47 Ls enzimas de In -oxidacion de diferentes organs han tenida una evoluciin diversente (47 Enel reticula endoplasinatico tiene Ingar la wnxiiac de los dcicos grasos 649 El deido ftdnico experimenta a-oxidacidn, enlos penoxisomas 619 17.3 Cuorpes ceténicos 650 Laos cuerpos cetdnicos formadas en et higado se exportan a ottos Sreanos come combustible 650 Durante la diabetes y en situaciones de inanicién se da luna sobrepmduceldn de euerpos cetéinicas. 652 Jn problemavail Indico da matonas —$—<—— ee ——— 18 Oxidacién de aminodcidos y produccién deurea 656 18.1 Destinos metabélicos do fos gupes amino 657 Tas protetnas de fa cieta se degradan ercimsticamente ‘aaminodeldas 658 El piridoxal fosfato participa en la transferenca de grupos ‘camino ala-cetogiutarata 660 Bl glutamate libera su grupo anno en forma de amoniaco enelhigado 661 La glutamina transporta amonfaco al higada 662 Fecustr 18-1 Determinselén do leshanes Uswlares 664. a alanina transporta emmoniaen deselos misculos ‘esquielétiens al higado G64 Blamontaco estéxien para los animales 085 48.2 Eneretn de nitSgone y csi do fa urea. 685 ‘Laurea se produce a partirde amonlaca en cineo pasos enamticos. 667 uta ciclos del ciclo eltrico y de In urea peden conectarse 068: 1a netividad de eet de Ia ures est regula dos riveles. 669 1s interconexiones entre rutas redducen ol enste energético del ciclode fs uren 669 efectos genéticos en el cela de ln urea pees serletales 069 48.3 fata de degradocin de os arinoéldas. 671 -Algunos aminodcidos se conerten en gincosa, otros en euerpos celinleas. 671 Varios cofactores enitndticosjuegan papeles importantes ence catabotismo de los aminaseldos 672 Sele aminosicids se degradan a piruvato 674 Siete amincicidos se degradan a avetl Co-A 677 En algunas personas el extaboliso ce I fendalsnina es penésicamante datectiinio 670 (Cinco aminedeidos se convierten en a-cetogiutarato 681 Cuatro aminosecos se convierten en sucinil Com, 682 [Los aminosidos de cadena ramificada no se degradian en el higado 83 Recuadeo 18:2 Dect conten rsuotren tn evimon misteriosa. 684 Ta osparawina y el espariato se degeadan oxalacersto 68S 19 Fosforilacién oxidativa y fotofosforilacién 690 [FOSFORILACION OXIDATIVA 694 19.1. Rescelones de tansterencte do oloctrones fen las mitocondrias 683 {Los electrones 30n.canalizados hacia transportadores univereales de electrones 682 Les eloctrones pasan a través de una serte de transportadores unidos amembrana 6% [Los transportadores ite electrones actsan en complejos ‘multienzimaticos 606 [La ener de la transferencia de electrones se conserva eficientemente en un gradiente de protones 701 {Las mitocondrias de plantas tienen mecanismos alternatives paraesidar el NADH 704 19.2 Sintesis de ATP 704 Recuadro 13-1 Calor, plantas maloitentesy rutas resplratarias alternativas. 706 La ATP sintasa est4 compuesta por dos dominios funcionales, By Fi 708 Ena superficie de; el ATP esti estabilizado frente alADP 08 El gravtiente de protons impulsa ts Uberackin del ATP de la superficie del enzima 709 Cada subunidad g de la ATP sintasa puede adopts tres conformaciones diferentes 709 [La catalisis rotarional es a clave en #] macanismode unién vy cambio de Ia sinbesis de ATP TLL Bl acoplamiento quimiosmético permite que las ‘estequiometrias del consumo de O, y dla sintosis de ATP zo se correspondan con nitmeros enteros 712 [us fuerza protén-motriz suministra energia para el transporte activo Td Sletemas de lanzadera envian indireetamente NADH ‘ehteadlico 4 las mitocondiéas parasu oxidacién 714 419.3 Regulackin de la fostorlacién exidatva 716 LL fostoniacion oxidativa vst negulacia por las necesidades ‘energétioas eelulares 718 ‘Una proteina inhibidora impide la hidrdlisis de ATP durante Iaisquemia 717 Las mitocondtise dlesacopladas del teido adipaso marrén. producen calor 717 Jas nutas de formacidn de ATP estin reguladas de forma ‘eoordinada 718 19.4 Gonos mltoconditaas: au organ y les efectos de mutacioors 719 Mutaciones en, genes mitocodinles pratucen enterredades jumanas 71 ‘Las mitucondrias evolucionaron 8 partir de bacterias endosimbiticas 721 49.5 Funclin de las mitocondrias ea in apoptests yen el ests aidatho 721 FOTOSINTESIS: CAPTACIGN DELA ENERGIA LUMMNOEA 722 19.6 Caracterieticas penerales dela fotofestoriacién. 723 [La fotnstntasis on plantas tian hugar en los ‘eltoplastos 724 La luz produce un Mujo-de eleccrones en los loroplasios 724 19.7 Abworeién dota hur 725, as clorofilas absorben energia luminosa ara ls fotosintesis 725 Los pigments accesories aumentan Is gama ds abscecidn deluhe 728 1a clorofla canaliza la energia absorbidaa centres de ‘eaccidn mediante transferencia de excitones 728 18.8 6. acontecimientefotoquimles contrat ol flujo elsctrsnlea lmputsade por ta tu 730 Tas bacterias ener uno de los dos tipas de centros de reaccién fotoquimicas individuales 730 Factores cinégticos y termodinamlcos évitat la disipacién de ‘energia por conversiin interna 782 Dos centros de reaccitin actnan en taéndean en plantas superiores. 733 Las clorofilas antena estén iniimamente asociadas a los transportadores electrénicos. 734 La separaeidn espacial de los futosistomas 1y Il evita el lateocinio de exetiones 738 Pl complejo del citacramo ba une los fatoatsternas My 737 Las clanobaeteriae utillzan el comple del eitocrom by yy el citaeramn ey tanto en la fosforituckin oxeotiva éono fen la fotofestorilacion 738 El agua es escindida por el complejo que desprencie oxigono 738,leice de meters xm 18.9 Sintese de AT por fototosforiacién 740 Un gradiente te protones acopia el tuo electronic. con ls Fostoria. 70 Se tia establecio la estequiometria apronimada de a fotofoaforlacion 741 lio lee de electtones reduce ATH, peo no NADPH ‘La ATP sintasa de tos loroplastos es camo la de las rmitnondiiae 742 Los cloroplastos evoluctonaren a partir de bacterias endosimbidticas 742 Diversns onganisinos fotosintticns utiliza dadones fie Nidrégena diferentes del agua 74) En las bacterias halofilas una tinica proteina absorbe luz ybombea protones nara imputsar la sintesis de ATP 743 20 Biosintesis de gilicides en plantas ybacterias 752 20.1 Sintesisfotosintétca de hides 751 Los plasticios son orgiruos propios de las células vegetales ye lus algax 752. [La azimineién del diéxido de earbono thenen lugar en tres fuses 75% (Cadi triosa fosfato sintetizada a partir de GOs cuesta seis NADPH ymueve ATP 702 Un sistema de transporte exporta triosas foefate desde el cloroplasto e importa fosfato 763 (Cuatro enzimas del eicio de Calvin 2m activadlos indirectamente porlaluz 764 20.2 Ftorwapiracin y rutas ©, y CAM 7 1a fotorrespiracién es el resultado de la activided onigenaset de la rubiseo 765, La ruta de recuperseiGn del foxfoglicslate ex costosa 07 En as plantas C,, la Bjackén del COs. la actiridad rubisco. cestin separadas espacialmente 769 En las plantas CAM, Ia caplacion de OO, ylaaceiin, de lt rubisoo esti separadas en.el tiempo 770 20.3 Blesintesis de almidény sacorosa 774 Ly ADP-glucosa es el sustratn deta sintests de almidon Cn los plastidios de las plantas y de la sintesis de glucigeno en as bacterias. 771 La UDP-glucosa es el sustrato-de la sintesis de sacarosa en ef eltosol de las células dehojss 771 ‘La conversidn de triosas fosfato en sararosa y almidéa est estrechamonte reguisda 772 20.4 Sintesis de polisaciridos de Ia pared collar: celulosa vegetal ypeptidaglucano bacteriano 774 La celulosa es sintetizada por estructuras supramoleculares en la membrana plasmitien TTS (Olijusatricus wna « pilus son precarsores-en ta sintests cde la pared celular bacteriana 777 ‘Recuadro 20-1 El proyeetil contra el chaleco antibalas:peniiina yéHactamasa 778 20.5 Integrctin dal metaboisma lucien en la cela vegetal 30 La gluconeogénesis convierte las grasas y protetas cen glucosa en las semillas en germinacion 780 Fondoe reservas de iniarryediarios comurtes unven ruta en diferentes orgénulos TRL 21 Biosintesis de lipides 787 21.1 Blosintosls do deidos pasos « lessnoides 787 E] malonil-CoA se forma & partir del aceti- CoA yidelbicarbonato 788 Lasintests de Sedos grasos tranweutre mediante tuna secuencia de reacciones repetidas PSH FB complejo de la rio praso sintasa tiene siete sltios actives diferentes, 789 Ladcida grasa sintasa recfbe los grupos acetilo. ymaonilo 790 [Las reacciones te lado graso sirtasn se repiten hasta orci palmtato” 70 [Laide graso sintasa de algunos organisinos esté eompucsta ‘Dor proseinas rnitiancionales 794 LLasinvess de deldos gracos ye produee en el etosal de nachos onganismos perw en lx plana tener hugar ‘ens cloroplastos TH lacetato salede a mitocondria en forma de ett 704 Labiorintoss de cides gsc exth estrechamente regulads 795 Los cis grasos de cadena larga se sintetizan a partir ie paltitato 787 [La dessturaci6n de los Seidos grasas necesita una onidasa, de funciin mixta 708 Recuadro 21-1 Oudasos de funede mica exigenaest yctocrems aso 798 Los icossnoides 9 forman a partir de dcidos grass toliinsaturados de 20 carboness 60% ocundro 21 2B remadi eat ena se (acto): asta ela cetontgonasay ta Bésgued de wna asplina mejor 202 21.2 Blsintosts de tacigicerotes 804 Los triaclliceroles y glicerofosfotipidos se sintetizan ‘partir de ins mists procursores 304 Lubiouintesis de traclgiceroles en Jos animales etd regulada por hormonas 804 Fl telldoadiposo genera ghicerol 9-fosfato mediante liceronengénesis 806 ‘21.3 Basins de festlipies do membrana. 808 [Las cGlulas tienen cos estrateslas para tnir grupos de cabeza dels fosfolipitns 808 Lasintess de fosfolipidosen & colt wien CDP -duacllglesrol 811 |Log rneariotassintetizanfosfolipides aniénicos a partir del CDP-iacilghoerol 811 ‘Las rutas oucarscicaa hasta la Fosttidrina, wsfotiikc alain y faidiblina ek interrelacionadias B12 [a sinesis de pasialkigeno requieré la formacion de un aleohol graso unido por enlace ster B13 leas sintesis de esfrwolipidas y ghicerofostollpidas comparten eecursores yalgunos meranines S13 Los lipicios polares est n destinados a membranas eelulares especifiens 814 244 Rlasiatonis de calestoralesterodose ieaprnoides 836 Eloolesteral se forma del acetil Goa en cuatro fases 816 Bl colesterol iene varies destinas. 820 Et colesteraly otros lipides son transportados por lipoprotetnas plasmsieas 820 ecuadro 21-3 Los asl deta apoE predican ta incidencla de a enfermedad de Atetmer “624 Los ésteres de colesteral entran en las células por endocitosis faciltada por receptor 824 Labiosintesis del-culesteval ct eubada divession niveles 825 Las hormionas esteroieas se forma por rofura de Ix eaten Tateraly oxidackn ced eokestarcl 827 Log intermediaros del sfntesis del colestral tienen michos ‘destinasalternativos 625xiv Indice de mateas 22 Biosintesis de aminodcidos, nucledtidos y moléculas relacionadas 833 122.1 Aspectos generals del metabolism dol nitrigena 834 El ciclo del nitrégeno mantiene una reserva de nitrigeno. disponible biolégicamente $04 Elnitrégeno es fijado por enzimas del complejo dela nitrogenasa S34 Blamoniaco se incarporm alas biamo¥éculas 4 través del glutamato yas glutamina 857 ‘La glutamnina sintetasa es un punto de regulacion principal ‘enelmetabolismo del niteSgeno 898 ‘Varios tipos tle reacciones tienen un papel especial en ix Diosintesis de aminadckdos y muclestides, #40 22.2 Blosintasls de los aminodchios. 84% Ele-eetoglutarato es precursor del glutamat, la glutamina, Ta protina y la arginina 842 ‘La serina la glcina y a cisteina proceden del-fosfoglicerato #42 “Tres aminndcidos no esenciales y seis arninodcidos esenctales se sintetizan a partir de oxalacetato y piruvato $45 28 coriamato es un intermedliaso clave en la sintesis de triptsfano, fenitalanina y tirasina #4 La biosintesis de Is histidino wtllza precursores de la biosintesis ce purinars RSI ‘La bivefnteels de los aminodedos se hala bajo control ‘lostético 951 ‘22.3 Moldculas dorivadas de aminodsidos 854 Laglicina es un precursor de is porfirinas, 854 El hemo ess fuente de los plgmentas bikares 854 Recuadra 2°1 Bioguimica de reyes y vampiras. 857 Labineintesis de I creatina y del putation ae roaliza a partie de aminndcidns 57 Lo. amninodicidos. se hallan hisicamente en las acterias 868 [Loe arninoscidos aromdticas son precursores de muchos -campuesios presentes en los vedetales 859 Los aminoécidas se corvierten en arias bidgenas por descarboxiineién 859 Laarginina es el precursor dela sintesis bioligica el dido mitrico 860 224 Biosintests y dogradaelén do les nuclostidas 862 Lasintesis de novo de los nucledtiios de purina empieza comel PREP 864 Labiosintesis de los nuclestidos de purina est regulada por retroinhibicién 866 Logmueledtidos de pirimicina se sintetizan a partir de aspartato, PRPP y carbarail fosfato 857 La biasntesia de low neclesticos de pirimdina etd regulada por retroinhibicion 888 ‘Los mucledsies monofosfatn se convierten en nucledsidos ‘rifostato B68 Los ribanucleétiios son los precursores ‘de los desoxirribonucleditides $89 El timidilatn se forma a partir de CDP y UMP 872 La degradacidn de las purinas y las piramidinas produce Scido trico y urea, respectivamente 873 Las bases puriniens y pirimidiniens ge recielan a través de rutas de recuperacion 875 Una sobreproduccion de deido iro esta causa de lagota 85 ‘Muchos agentes quimioterapéuticos acttian sobre enaimas de las rutas de biosfitesis de nuclestidos. 876 23 Integracién y regulacién hormonal del metabolismo de los mamiferos 881 23.4 Hormonas: estructuras diversas para funciones diversas 881. Eldescubrimiento y Ia purificacién de las hormonas requieren un bigensayo 882 Recuadro 23-1 ;Céma se descobre una hormana? El ardve ‘camino hasta ia insuina purficada 863 Las hormonas settian & través de receptores celulares, de elevada afinidad 884 Las hormonas son quimicamente diversas 586 la liberacién de hormonas estd regulsea por sofales neuranales y hormonales jeranquizadas 888 28.2 Motabotismo especifio de las tejidos: dvskin ‘ol tmbajo 892 Elhigado transforma y distribuye jos nutrientes 833 El tejide adiposo almacens y sumumustra acids grasos 897 El mdsculo utiliza ATP pars realizar trabajo mecinico $98. El cerebro emplea energia para a transmisidn cde fos impalsos eléctricas. 900 la sangre transporta oxigeno, metabolites y hormnonas 900 23.3 Regulacién hormonal del metabolismo enargético $02 El pancreas tecreta insulina o glucagén en respuesta ss eambiog en ln glucosa en sangre 902 La msuimna contrarresta la ghucosa sanguinea elevacla 904 El glueagein contrarresta los niveles bajos de glucasa, en sangre 904 Durante el ayiuno y la inanicidn el metabotisma se modifica ‘para proporelonar combustible para el cerebro 906, {a acrenalina es la seftalde una actividad inminente 908 Et cortisol indica esizés, ancluyendo los bajos niveles nde glucoga en sangre” 909 La diabetes e¢ 1m efecto en Ia previuccidn o-en laaccidm ‘dela naulina 909 23.4 Obesidady reguisein deta masa corporal $10 Les teoria lipastatica predce la regulacion ‘por retroalimentaciém del tejiro adipoco 9100 La leptina estimala la produccidn ce hormonas peptichcas -anorexigenicas 912 Laleptina desencasdena una cascada de sefalizaciin ‘que regula la expresion génica 913 Bl sistema de la leptina puede haber erolucionado para regular la respuesta alainanicién 913 La insulina acti en el nieleo atcuato pare regular la ingesta y la conservackin de energla. 814 Laadiponoctina acta # través de la AMPK: 14 Ladieta regula la expresidn de genes eruciales para ‘elmantenimiento de ia masa corporal 915 Lagrefinay la PYYp.g establecen Tos habitos de ingesta ‘seortoplaeo O16 Ill LAS RUTAS DE LA INFORMACION 921 24 Genes ycromosomas 923 24.1 Elementos cramostiicas $28 Ls genes son sexmentos de DNA que codifican cadienas Polipepthticasy RNA 024 Las moléculas de DNA son mucha ms largas que ls célubas que las contienen $25 Los genes y los eromosomas evearisticos son muy complejas. 928242 DNA 990, La mayor patte del DNA celular esti subenrollada 902 Elsubenrollamiento del DNA se define por el nuimera de enlace topologico 933 as topoisomerases catalizan cambios en el ntmero deenlace del DNA 935 Lacompactacion del DNA requiere uns forma especial de superenrallamienty 937 243 La estructura de jos cromosomas 938 Lacromatina esta compuesta por DNA y proteinas 998 [Las histonas sen pequefias protefnas basicas 939 Los nuclensomas son las unislades funcamentales de onpinizacion de la cromauina (40 {Los mueleosomas se empaguetan en sucesivos drdenes superiares de organizacién 942, Las estracturas de los cromasomas conienssdes ‘se mantienen mediante proteinas SMC 48 EI DNA bacteriano tambien se encuentra altamente ‘omwanizado 943, 25 Metabolismo del DNA 948 25.1 Repllcacin del DNA $50 |b replicacion del DNA estd gobernada por un canjunto de reglas fundamentales 960 BIDNAes degradado por auckawas 902 ELDNA cs sintetizado por DNA polimerasas 952 “La replieacién es muy precisa $64 coli posee al menoa cinco DNA pollmerasas 955 ‘a repllcacion del DNA requiere muchos ericimas y fuctares proteicos 957 Lea replcacin del cmmoooma de # coli procece por tapas 58 ‘La replicacién Dacteriana corre seared factors replicas ancladas en la membrana. 983 La rephcaciin en las eéulas euraroticas es ms ccompleja. 964 25.2 Reparacién 4e1DNA 966 {Las mutaciones estan relacionadas con eledncer 966 ‘Todas las eclulae tener miltipleskistethas de reparacié del DNA 967 ‘Recuadro 25-1 Reparaciin del DNA yedncer 970 [La interaceién de ls horsuillas de replicacién can lesiones {el DNA puede inducirsintesis de DNA propensa al error atrwés delalesiin 876 25.3 Recombinacin dol DNA 978 [La recorbinsedén gerética homdloga tlenen mitples fneiones 979 {La recombinacion durante la meiosis se iniela en rots de ble cadena 960 Les secennbinnclda requiere una mutta de enainas y otras proteins 962 ‘Tolos los aspects del metabolisma del DNA participan ‘entlareparacién de las hormuilas de replicacion bloquentas 984 Larecombinacién espeetia de sitio produce ‘worderamientoé precisos del DNA S85 La recombinacisn especifica de sitio puade sor nnecesaria para commpetar la replicacién del etomasoma 988 Los clementox genttions trangponibles se rieven dle un hgara ot 988 ‘Los genes tle las inmunogiobulinas se forman ‘por recombinaion 100 Indice de maletios am 26 Metabolismo del RNA 995 26.4 Sintesis de RNA dependionte do DNA 996 ELFINA es sintotizado por RNA palimerasss 996 La sinteais cel RNA.empleza en los promotores 908 La transcripci6n esta regulada 4 diferentes niveles 1001 Laterminacién de la sinvesis del RNA estd indicads ‘Por secuencias especificas 1001 Recuatiro 26-1 La RNA potimersa de su hulle ‘nun promotse 1002 1uas células eucariéticas tienen tres tipos de RNA polimerasas nnucleares 1003 La RNA polimerasa Il requiere otras amachos fectores pproteices para su actividad 1003 ‘LaRtNA polimerasa dopendientis de DNA es inhibida selectivamente 1008 26.2 Maduracién det RRA 1007 ‘Los mRNA eucarioticos evan un easquete enclextemo 5" 1008 ‘Tanto los introns como-los exones son transcritos del DNA alRNA 1008 EI RNA cataliz el corte y empalme de les intrones 1009 ‘Les mRNA eucariéticos lienen una estructura caracteristiea enelesiremod” 1011 La maduracidn diferoneia| del RNA da Iugar a miltiples Productora paitir dun gen 1014 Los RMA ribosdmices y tos tRNA también son modificades 1014 Alguns etapas dél metaboligmo del RNA estén catalizaras bot enaimas de RNA 1017 Los mRNA celulares se degradan a velocidaites diferentes 1020 La polinuclestido Fosforilasa forma polimeros de tipo RNA de secnencia aleatoria 1020 26.3 Sintsls do RNA y DNA dependiente de RNA. 1021 Ls transcriptasa inversa produce DNA a partir de RNA viico 1021 Algunos retrovirus provocan edinceey sida 1023 Muchos transpscones, retrovirus e itzones pueden tener uu origen evolutivo comin 1023 ‘Recundro 26-2 ratamianta del sida con laibheres i ts tronseiptieainersa del IH 1024 ‘Larelomerata es una transeripeasainversa sepecilizada 1026 Algnios RNA viricos se replican por medide una RNA Dolimerssa dependiente le RNA. 1027 Lasintesis de RNA ofrece pistas importantes sabre Jn evolucisn bisquimica LOZ? Recuadro 24-3 método SELEX para gonerarpotimeros de RMA ‘on miei fnciones 1030 27 Metabolismo de las proteinas 1034 27.1 Elcédigo genético 1034 El codigo genético fue descifrade mediante moldes de mRNA artificiales L035 El balanceo permite que algunos tRNA reconozeam més ‘de un codon 10519 Recuatra 27-1 Cambie de wchtura a modio camine: desplaramiento dal marco de traducclin y ediciéa del mRNA 1040 Rocundro 27-2 Excapciones que conan fa rea: varadiones naturals dl eign pence 1082 27.2 Sintesis de proteinas 1044 “La biosintass de ta protefnas tienen higar en cinco etapas 1044 EE ribosoma es una eompleja maquina supramolecular 1045,avi ncoe de mates [Rectidro 27:2 De we mundo de RNA a un munda de proteina 1048, Los RNiAde transferencia tienen rasgos estructurales earacteristicos 1049 Fase I: las aminoacll-RNA sintetasas uner los aminoscitos ‘enrrectos a.sustRNA. 1061 Fase 2: Ja sinteais de proteins empieza con un amtinoscido specifica 1064 Fisse 8106 enlaces peptidicos se forman durante la fase de elongacion 1055 ‘Fase d: la terminaeién de In sintesis de pelipéptidns requiere una sefial especifica 1081 Fase 5: plezamiento y modificaciin de las carters polipeptidicas reeién sintetizaas 1082 Recuadre 27-4 Varacién Inducida on el eédign genético: supresbin de mutaclones sin sentiia 1065 [ix sintesis de proteinas os inhibida por muchos antibiéticos vloxinas 1065 27.3 Destino y dagradacién de las proteinas 1068 a modificacién postraduccién de muchas proteinas ‘eucariticas empiezaen el reticuio endoplasmitico 1068 [a lucasilacion Juega un papel clave en el destino dees protefnas 1069 Las seewencias sonal pava el transporte nuclea® no son cortadas 1071 ‘Las bacterins también uilizan seruencias seial ‘para el destina de las protefnas L072 Las cétulas importan proteinas mediante encioctosis acilitada por receptores 1074 ‘Todas las células disponen de sistemas espectalizados de-degradscion de proteinas 1075. 28 Regulacién de la expresién génica 1081 2A. Procilos de engulackin gina 1082 La RNA polimerasa se une al DNA en los. “promnotores. 1082 El inicio de 1a transcripchin esta regulada por probeinas que se unen a los promatores.¢ cerca de ellos 1083. La mayorta de los genes procariaticos estan agrupades sree regulan en operons 1085 El opertn lac esta sujeto a regulacién negativa 1085, ‘Lax proteinas regulatoras tienen dominios indepencientes “de unignalDNA 1087 Tas proteinas reguladoras también tienen dominios le linteraccion protefmeproteina 1080 282 Regulocién de ia exprestn nica on fs procaratas, 1082 Elaperdn lac esté syjeto a regulaciin positiva 1009 ‘Muchos genes de los enairnas de la Wosintesia de amino ‘écins se regulan por atenuacion de la transcripcidn 1094 1a indnecién de a respuesta SOS requiere la destruccion de nrntesnas renresnras. 187 1a sintosis de proteinas ribosémicas esta enordinada con la sintesis de RNA 1098 Algurnos genes se regulan por recombinacién genética 1100 28.3 Rgulocién do ia exprestin nica en fs eucariotas 1102 [Ls cromatina transeripesonsimente activa es ‘stricturalmente diferente de la cromatina insetiva 1102 Ta cromatina se remodela por acetilacin ysesplazamientn elosmucleosomas 1103 Muchos promotores eucaridticns se retin posiivamente UM ‘Tranzactivadores y coactivadores que se unen al DNA facaitan ol ensambiaje de los factores de transeripeion generales 1104 Los genes del metabollsmo de la galactosa en las levaduras etn sujetos tanta a regulacidn positiva como negativa 1106 los transactivadores de union al DNA tienen una estructura modular 1106 La expresién génica eucaridtia puede cer regulada porsefiales intercelulares ¢ intracelulares 1108 La fosforilacion de los factores de transcripcidn muclesres puede contrabuira su regulacion, 1109 Muchas: miNA encariitcos esidn sometides a represiin traduceional 1108 El silenclamionto postranseriptional de os genes se produce porinterforeneia del RNA T1I0 ‘:desarroito esta consrotado por cascadas Ge proteinas rogulacoras 1111 ‘Apéndice A Abrevituras comunes en literatura cientifiea bioguimica At ‘Apéndice @ Soluciones abreviadas de los problemas SA-4 Glossiio G1 ‘ Pracedencia de lasiustraciones P-t fintice alfaltien 1capitulo FUNDAMENTOS DE BIOQUIMICA 1.1 Fundamentos celulares 2 1.2 Fundamentos quimicos 12 1.3 Fundamentos fisicos 24 1.4 Fundamentos genéticns 28 1.5 Fundamentos evolutives 31 Can el descubrimiento de la célula, fa biologia habia descubierto su atomo...A partir de entonces e! estudio de lo célulay el andlisis de su estwtura resuité esencial para le caracterizacién de la vida con el abjeto de identficar aquellas propiedades comunes y necesarias para la vida de cada una de las células y también, altemativamente, para identfcar diferencias asaciadas con a! desarrollo de ‘funciones especificas —Frangois Jaco, La lngique du vivant une histoire ‘de Mnétédit, 1970 Debemos recanocer, y asi me lo parece, que el hombre, ‘oon todas sus nobles cualidades.,. acarrea todavia en su ‘estructura fisica el sella indaleble de su humilde erigen, —Charles Danni, he Desoent of Man, 1874 His szesraiment aos quince a ins i tones de anos, e1 unsverso nae ae un catactismn exposteo que ‘apse particlas submidmieas exitemadamente aliens y rica en ener. En cuestion de sogunlos ce formaron fs ee zmentos mis sinles, Altiempo que el universo se expansia y eniriaba, se condensatsla materia bajo la indluencin de la gew ‘edad y se formaban las estress.Algunas de ellas se hicieron stores, explotaron en supemowas y liberaron la energia ne ‘cesaria para producir elementos ws eomplelos a parte la ‘isin de los rice amicos ms irples. De este melo ap ‘ectorun in Tierra y las elements quiriens que hoy 6 eneier- frame olla, La-vida apareeis hare unos cuntzo on ones de adios en forma de miieroorganismos sencilos dotacios dela ca- psidadl de exter energfia de Ios compuestos argnios 0 de la ‘ux solar Esta energia sievis pa sintetizar una amipla varietal do biomoléeulas 3 partir de los elementos y compuestos ris simples presentes en la superficie de la Terra La biomuimica se pregunta acerca del mode en que miles de diferentes moléculas inanimadas dierom lugar alas comple {as propledattes cle los organismos vivos. Cuando estas molé- elas se alsin y exarinan individualiente cixmplen tod las ‘eves fsicax y quimicas que cescriben el earnportamiento de It ‘materia inanimada, del mismo modo que eexre con todos los ‘procesos que tienen gar en organismos vives. El estudlo de 1 bioquimica muestra el modo en que las moléeulas inaniima- sas que conatituyen lus urganistius vivur inberacclonan para "mantener y perpelitr la vida, rigiéndase por lag misransleyes Aisicas.y quimicas que gobiernan todo e univers, A pear dello, ls onganismas poscen eualidacles qe los dlistinguen de otras agrupaciones de materia. ;Cusles son las ‘saracteristicas distntivas de los organismos vivos? Un elevado grado de complajidad qudinien ¥ de or- anizacién mieroseéplea, Lao intrineacan estructura Interna cehilares estén formadas por ales de moléesalea ferentes CFig, 1a), Cada una poses su propa secur ‘cla de subunidades caractorstien, una estructura tridie ‘mensional nik ¢ interacciona com na selecciin altamente eperifies de mniéeulas de la cule Sistemas para la extraccidn, transformacién y uso de energia del entorno (Fg, 1-1), que permiten alos Cofganistnas eanstruir y mantener sus camplejas estructu ras y llevar cabo trabajo meciniro, quimico, asmétieo y eléetrivo, Contrariamente, ls materia inanlmada tence adegradarse hacia un estado mds desordenado, ell ‘brandose con se entorno, ‘La capacidad para autorreplicarse y autosnsamblar se (Fig, 1-10). Unatiniea celula bacteriana colocaada en ‘un mestio nutriente estén puede generar mil millones de ‘cehulas “hijas”idéticas a ella en 24 hora. Cala contiene miles de moléculas diferentes, algunas de elias wr gran cornplejidul; 8 esse de ello, cata bacteria2 Copia 1 Fundamentes de bioquimica fe FFIGURA 1-1. Algunas caracteristicas de la materia viva, (a) fn esta seccién fina detejido muscular de veribrad, vista por is bated agent gates comple mira pica. (B) Un bales de as pradors se rurre mediante el consumo ce ‘un pequein para, (e+ La teprodvccin bilge tiene doi cast poeta es una copia fel del original y tara la informacion para su const tt contenida en el material genética de la ccéluta origina, M ‘antsmes par detectar y responder a lax altara- es eh su entorno, meriante unajuste comstante a ‘estos cambio: grack {én de sus process ‘qulimicos interios, La existencia de funciones definidas para cada uno: de sus componentes y la. regulacién de las interae- jones entre ellos. Esio cs cierto no tinicamente pa ectructuras macrososipleas come hojus ¥tallos oe ones son Y tos pulmones, sino también para estruetur crosoépicas iniracelulares¥ para campuestas quimicos Individuales. Raste unt relaeion divin entre Jos ccm ‘pontentes quimicns de un nryanismo vivo; ls eames er tino de los enenpone + protucen cambios Compensato- rios ervotro, de modo que el conjunte posee un carietor propio, mis all del ce cada tuna se sus partes indivcrua- les. Bl corjunto de moléeulas teva a exbo un programa tune como resultade final la reproduccién del mismo ¥ la perpetuacion de este conjunto de moléculas; en de nitiva, ef resultado final es la vida, ‘Una historia de cambio evolutive, Los oranisiwos ‘variun sus estrategias vitales heredaclas para sobevivir en sittuaciones nuevas, Bl resulasto de eones de anos ido evoluetén es una enorme cliversidad de foernas de ‘vida, superficiamente muy diferentes: (Fig. 1-2) pero relacionadas a través de sus ancestros comunes, care estas prapiestaces comunes de las que se de- ‘existe una. uniformidad funclamental en todas las staciones de la vida, existen nay pocas generalizaciones abgulutamente correctas pars todos los organisa jo todas las conaticiones, La diversidad es enorme. La n-que viven Jos arg fem Ia gun. igusimente arpa de aelaptaciones biequimiens es peeificis que tienen lugar em an entorno quimica comparti Con el objet de pritnar la claridad de expostldn, en este Mr uustremos algunas fencralizuciones que, aunqwe Wo pet resultan ities, con Frecuencia también comentarems algunas opciones que pueden ayudar a aclarar aquellas general clones eientifies, mos tiene su reflejo FIGURA 1-2 Organisms vivs dierentes camparien caracterisicas Ageiemieas comares. Psjaros, estas, plantas y microorganisms del suelo compaien con of hombre las misnas unidades estructurales Iniicat (cdo los tinned tas de macromoldcilas (DNA, RNA, proteinas) compuesas por los mismos tipos de aubunidades mano ‘mericas(rucledkidos, amino. liza los mismo mecanisas ‘site. do los componentes cellars, comparan el miss digo iendtica y desclender de Las mismes ancrstros evolutives, Dxtalle ‘el “Jardin det Elén” brace Jan wan esa aves (8626-1679.La bioguttaiea pretende deseribir en Uérminos molecutares aquellas estructuras, mecanismos ¥ procesos quimicos cam- ‘partides por tados las organismos y praporciona los principios de organizacign que subyacen en tadas las diversas formas de ‘vida, prineipios 2 los que nos referiremos eolectivamente como {a togica motecular de la vida. Aunque la bioquimica pro- ‘porciona conocimientas y aplicaciones pricticas, su preoeupa: ign iltiea es el prodigio de La vida misma Por tanto, en este capitulo introductario describiremos los fundamentas cefulares, quiimicos, fisicos (Lermodinimicos) y enéticos de Ia bloguimica y el prinelpio apneral de la erotueism: ‘el desarrollo de las propiedaces de ns edtulas viva lo langa de Jas generaciones, Durante lalecturade este libro puede resultar «itl referirse a este capitulo de vez en cuando can el objeto de refreseur la memoria sobre estas temas bisicos, 1.1 Fundamentos celulares 1a unidad y diversidad de los organismos es evidente incluso nivel celular, Los organismos mds pequefias son unicelulares y microseépicas, Los erganismos mayores contienen muchos ti- ‘pos de células de tamaito, forma y furciones diferentes. A pesat de estas diferencias obvias, todas las céllas comparten ciertas Dropicdades funeamertales, observables a nivel bloquimicn. Las células son las unidades estructurales ¥ funcionales de todos los organismos vivos ‘Todas tas células comparten eiertas eatacteristoas estrictur les (Fig. 1-9), La anembrana plasmttea define la periferia dle ln célula, separancio su contenido del medio extemo. Bsté.com- ‘puesta por moléculas de lipidas y de proteinas que forma ura barnera hidrofibica finay flexible, Actin como-una barrera a la libre eireulacisn de ianes inorganicos y de la mayor parte de ‘compuestos exrgados 0 polares, Las protefnas de transporte de Ja membrana plasmatica permiten el paso de ciertos iones y rmoéculas las receptoras transmiten seiales hacia el interior de la walla, por su parte, Ios enuimas de membrana participan en algunas reaceiones. Gracias ala interacckn no covalent entre las subunidades individuales de lipidos y proteinas de la mem- bbrana plasmtica, la estructura global tiene un elevado grado de flexibilidad que permite que se produzean cambios en la forma y el tamafio de fa célula, Al crecer la céluia se insertan en la ‘membrana mevas molécuias de lipido.y proteina recién sinteti- varias; a divisén cellar produce dos eélulas, eada una con su propia membrana. El crecimiento y la divisiin (fsién) colalar se producen sin pérdda de la integridad de la mesnbrana, El volumen interne limitado por la membrana e¢lita, citoplasma (Fig. 1-2), esd compuesto por una disolueisn acuoss, el eltosal, yuna vuriedad de particulas en suspension con funciones especificas. Bl citosnl es una solucién muy eon- entrada que contiene: enaimas ¥ las moléculas de RNA que Jos cordificat; las subuniitides monoméricas (aminadeidos ¥ rucle6tcins) a partir ce las cuales st forrnan estas macromolé- ceulas, centenares de pequetias molécuias orgénicass denomina: cas metabolites, intermediarios de las rutas biosintéticas y 1. Fundamentos celulares 3 ‘Nidcleo (eueariotas) Dimuslecide Goacterias) Gentiene material gendtieo: DNA potsinasasociadas, I neleo (t@ rodeade por una membrana. ‘Membrana plasmitica Bicapa lipidica resistente: y flexible. Selectivamente ‘permeable para sustancias Polares Tambicn inclaye ‘protainais de membrana que actiian en el transporte, ‘en Ia revepciin de sehales '¥ como enzimas, Citepiasma Contonide acuaso de ka célula y partieulas.y ‘organules suspendios fen el misma, } tietatelfeceioce inongiene 8 Pellet particlas yori Rios, grinules de almacenamient, mitocondrias, cloroplastos, lisosomas, reticulo endoplasmatica, FIGURA 1-3. Caracteristicas universales de las células vivas. Todas las cilulas tienen un niicleo 0 nucleside, una mernbrana plasmstica y Citoplasma EL etosol es la parted! citaplasma que permanace en el sabrenadante después de una cenutygacién del extracto celular a 150.000 durante 1 hora. degradativas; eoenzimas, compuestos esenciales en muchas reacciones catalizadas erceimticamente; jones inorganicos; y ihosomas, pequetas particulas compuestas por proteinas y RNA en las que tiene lusar la sintesis de prateinas, ‘Torlas las eelulas tienen, al menos durante una prarte de su cielo vital, un mieleo oun nueleoide, en el que se almacena y replica «l genom (el conjunto de genes, compuestos de DNA) El nucleoide bacteriano no se encuentra separado dal cito- plasma por una membrana, pero en los organismos superiores el miicleo contiene el material nuclear que se halla englobado ‘en el interior de una membrana doble, Ia envoltura nuclear, Las eélulas que pogeen envoltura nuclear se denominan euea- rlotas (del griexo eu, “verdadero*, y baryon, “micleo"); las ‘que no poseen envoltura nuclear “las o¢lulas bacterianas— se denominan procariotas (del griego pro, “antes"),‘ Capitulo 1 Fundamentos de bloquinica Las dimenstones celulares estan limitadas or la capacidad de difusién del exigeno Lamayor parte de células son de tamafio microscdpica, El did- ‘metro tiico de las estulas animales y vegetales es de unos 5 8 100 para, y anuchas bacterias tlenen una longinad de tan solo-1 2.2 jam (véase la contracublerta posterior para encontrar in- formacién sobre las unidades y sus abreviaturas). {Qué es lo que bimita las dimensiones de una célula? Blink inferiar vie fhe probablemente marcada por el nimere minimo de cada luna de las diferentes biomoléculas necesurias, Las células jcompletas mis pequefias, ls micophismas, tienen un didmeti de 260 nm yun volumen de aproximadamente 10-" mL. Un. solo ribesoma bactertano Lene una longitu de aprestmnad- ence 20 nm en su dimensién mis alargada, de mode que un equefio nimero de sibooomas ocupan ya una fracelsm signif cativa dal volumen de-una edula de meeps Elimite superior del tamano colular viene marcas pa la ‘velocidad de difusign de las moltirulas disueltas en sistemins choses, Por ejemplo, una célula hueteriana que depende de feacciones que consumen axigeno para la produccidn de su -energia debe obtener el onieaw mfecular de meilioen el que ‘5e encuentra mediante difisiin a través de su menbrans plas- ‘matics. La eélula es tan pequefia ya relacién entze el dren de ‘5u superficie y su volumen tan granite, que ¢10, aleanza con focildad todas las partes de su citoplasma por cifusién. Sin ‘embargo, aumentar el tamafio e la célula, desciende fa te Iacidn superficiehotumen hasta Negar al puri en que su me tabolismo consume Oy a una velocidad superior ala del sum nistro mediante difusién. En esta situacién, el metabolism ‘Que requiere Oy se hara imposible cuando el tamafo eolular crezea par encinvs de un determinade punto, que representard 1 tedrica limite superior del tamafo de Ia eétula, Los seres vivos se clasifican en tres dominios ‘Todos ls organismos vivos pertenecen a uno ce lo tres gran dies grupos (eis © dortinios) que represeritan ks tes amas de la evolueiin a partir ee un progenitor coma (Fig, 1-4), Desde un punto de vista biogutmico se puede distingulr entre ‘dos grandes grupos de procariotas: Ins arquebacterias (del _nrogo avohe, “origen*)y la: eubaetenlas (ie greg o2, "ver ddscero"). Las eubacterias habitan en el suelo, en las aguas ‘superficiales¥ en os tedos de otros arganismios vives o en descompoticiin, La mayor parte de Ins hacterias mejor estu- dlidas, inchuyendo 4 Eschoricihia coli, son cubacterbs, Iota arquebacteris se han descuierto mas recientemente y esin mucho menos caracterizades binquimicamente. La mayor parte de elas tabitan en medioe muy extremes. Las pruchas de que se dispone sugieren que las arquebacterias yas eubae- terias divergieron pronto ¥ constituyen das dominios ditintos, ltamadis también Archaea y Bacteria, Todos los arganismos frucariéticas, que conatituyen el tercer dominio, Bucarya, evo Uelonaron a partir deta msm rama que dio oigen a os Ar~ cchnea; las argucbacterias estan, por tanta, mds estrechamento "relacionadas con los eucatiots que con ins eubacterias, Han poe Plantas FIGURA 1-4 lagen de lo wos dominos def via, Ls relacone lgenicas susan a mena mediate un “ib! gna ete ‘ina, La elacie evo entre dos enpaninmos sera tanto mus ec canio menores sa os unis de amifeacén ene hosFIGURA 1-8 Lot organismos pueden clasiicane segin su fuente principal de enexgia luz solar © compuesto euimices oxidable)y su Fuente de earboon para la sntesie de materia cul. ‘Dentro de tos deminios de Bacteria y Archaea exisven sub- erapos que se distinguen por sus habitats, En los juabitats aeré- Dios com abunante oxigen, nachos onginismns resenting obtienen su energia mediante la transferencia de electrones desde las moléculas.de combustible al oxigeno. Otros ambken- tes sont anaerobicos, privailos de oxigen, lo que obligaa que tog mieroorganismos adaptive a ellos obtengan su enersin rdanve Ia transforencia te clectrones hase itrato (gene ‘rando Ne), sulfate (generando HyS) 0 COy (generando CH). Muchos de os organisms que han evolucionado en estos a= biontes san anaorobine obtigacos que ruarrian por exposi- sta oxigen Los orgnnismos pueden clasificarse a partir de su forma die abtoner In energy ol carbono que-necedtan para a sie sis de material celular (Fig. 1-6), Se pueden estabiecer dos amplias categorias-a partir de las fuentes de energin: los fote- ‘trofos (del greg (rope, “nuteetn") reenectan y siz ka luz solar, mientras que les quimidtrefos obtienen su energia partir de la oxidacién de combustibles quimicos, Todos los ‘quimiotrofos necesitan una fuente de mutrentes erginicos (puesto que no pueden Far COy en forma de compuestos orga= ticos ae fotérofoe uncon divide, a su ve, enine los ae pueden obtener toda el earbono necesario a partir de CO (autétrofos) ylos que emieren nutrentes ongnieas Chete- s6teofim, Nini quiniiey panshe uber sue Gana farbono exehisivamente dol CO, (es deci, no existen autatro= fosen esta categoria) pero los quimisitrafes pueden ser elasifi- ‘aos sein in enter cferent: sie] commasible que oxidan ‘ inneginien litetrofos)w orainico (organatratos).. 11 Fundamentos celulares 8 ‘sDacteriandel hon i La mayora de los onganismos conocides se eneuentean dentro de una de estas cusiro ampliss categorise -autstrofes 9 heterotrafos entre los organismos fotosintéticas;htotrafos ongandtrofas entre aquellos que oxidan compuestos quimt- 03>, Los procaritas dispanen de diversas alternativa gene- rales pata Is obvencién de casbono y energia, Por ejemplo, Escherichia eolt 8 un quimioorganaheterstrofa; necesita campuestas orinicos del mestio ambiente como combustible ¥ como fuente de carbon, Las eianabacterias son otclitaao= ‘rofis;illzan Ja huz solar como fuenie de enerpfay commenter #1 60, em biomoléeulas, Las indivi de ta especie Runa somos quinioongaswheterétratos, como B. colt Escherichia coli es la eélula procariética mejor estudiada Las e¢lulas bacterianas comparten ciertas earactertstieas es Lmcturales comunes, pero tambien presentan especializacio- nes especificas de grupo (Fig. 140). La oélula le £, coli tiene Aaproxirmdamente 2 jar de loryitudl yun poco menos de 1 ym de didimeteo, Posee una:merbrana externa protectora y tun ‘membrana plasmitica interna que engloba el citaplasraa y el rucleoide. Entre las membranas interna y externa se sitiia una capa Fina pero resistente de peptidagiicanes que proponciona vale clude au forme y sigides cuvtecrbieas, Loe mucus plastica y las eapassque Ia radean constituyen ta envottura celular, En cl dominio Archaea, la rigidex es conferida por una ppolimere diferente (peeuelopeptidaglucsino). Las membranas plasmndticas de eubsetorias consisten en una fina bieapa de‘Capiulo 1 Funcamentes de bioquimica Rubosomas Los riboesmnas hacterianos son mse pequetios ‘Que ls eucarssticos, pero llevan a cabo la misma funciin: sintesis de proteinas a partir de un FINA mensajero. Nucloside Contiens uns tonics y semple malecula nega 1yeiredlae de DNA. FIQURA 1-6 Caricteruthas estrictursles comubas de Las cules bactevianas. A causa de diferencias en I esructura de la enwolura c= lular, algunas eubacteriasretienen la tinciin de Gram (grane-postvas) Yyoras no (gram-negativas). Ecoles gramt-negatva. Las clanobacte= Fae son tambidn aubacteriss, pero se distinguen por au voluminoss Sika de membranas imternas, en el que se localizan los pigmentos Sovnindtaun Pow yur aw eulinas ella oe lan rnd y Las eubacteriasgram-ponitins parecen silanes al microncopia elec lrGnico, a esinctuea de las pias de membrana y de los polisacsni= dos de a envoltura celular son muy derentes en estos organismos ‘moléealas de ido en le que se insertan proteinas. Las meme Thranas arquichartertanas tienen wna arqultertaa sila, ait ‘que sus lpidas diteven de los peesentes en enbacteras, El eitoplasma de B. coli contiene unas 16.000 ribosomas, iniles die copins de cada uno te los miles de enaimas diferen- tos, nammerosos metabolitos y cofartores y una variedad de i nes inorginicos. El mucleoide eentiene una vnica molécula rrcular de DNA ye! eltoplasma enntiene uno o mde segmen- toa riculares de DNA de tamano mucho menor que recben el rromber de pldsauides. Bu ba waburalea, alias psu ‘configren resistencia a toxinas y antibiticos presentes en el medio: En el laboratorio, estos segmenios de DNA son muy addecuados para la manipulacién experimental y resultan de ‘extrema utilidad para el genético molecular La mayor parte de bacteria existen oomo ofan Jes, gunque en slgunas especies hacterianas tienden a asoeinrse fen racimos o filamentos ¢ incluso algunas {las mixobacterias) smusestrarn primitivo comportarrena octal. Las eélulas oucariéticas poscen diversos orgdnulos membranoses que pueden aislarse para su estudio ‘as cétulas eucariéticas ipicas (Fig. 1-7) son mucho mayores que las céluias procarsticas tienen normalmente un disme- ‘trode 5a 100 am y un volumen celnlar que es entre mil.y un milin de veces superior al de ls bacteria Las earacterist ‘cas dicintivas de Ios eueariogas som el nel y los orgénuloe rodleados de anembrana que llevan a cabo funciones espectfi- cai mitocondiae, retieulo endoplasmitico, complejos de Gol { lisosomas, Las eetulas wegetales contienen arlemas wacuolas ¥ Cloroplasies (Pig. 1-7) Bn el eitoplasma de muchas eels también se observan granulos 0 goliculas que contienen mu- trlantas de rasarva como almidéno grazan En Jo que constituyé un impertante avance bioquimica, ‘Albert Claude, Christian de Duve y George Palade desarrotla- ron métodos para la separacién de ongimulas citosdticas —un aso esencil para el aislamiento de bjomoléculas y otros com ponentes celulares ¥ para la investigacién de su estructura y funcién-, En un procedimiente de fraccionamiento celular ti- pico (Fig 1-8) se disgrogan estulas 0 todas en solucién me- Giante una homogencwaicion suave, que rornpe ia membrana celular pero respeta la integridad de la mayoria de los orgs nus. A continuacion se centrifuga el homogenada, proceso cenel que orsénulos como el ncleo, las mitoconatias os liso1 Fundamentos celulares (a) Célula animal Ribosomay: maquina intetizadoras de proteinas Gitorequeet: sparta strona de ar ella, Bef aimee de trsanaen Hinson eograda tas restarinteneetutares - Veuicula de transporte: transparta lipides 5 pratolnas entre el RE, complejo de Golgi y1a membrana plasmstien Nuadeol: lugar deta sinters ae BNA sano nvoltura nuclear: Jacromatina (DNA el eltaplaamn + proteina) Mombrana plaomsties: separa Ineélula do 20 entorns, el movimients ele materiales hack entre y fuera de In ella Cloroplvt almacena i enereia twlar produce ATPy gles ri i tan, temmpaal de glide product de la fetasintenis sa ‘Tilacoides: donde tisne lugar Insintesis de ATP que aprovecha Inenergia de Ia luz ‘ard celular confer ena 3 Tigiden, protege a ‘del hinchamiento osmtico Vacuia: degrada y reciela, ‘macromolfesiosy almacena Pred eolularde una oékala ‘Plsinedesmos: permite el paso entre das eslulas eee ‘vegetalen ‘Glioisoma contiene low enzimas ‘del ciclo del glioxilato FIGURA 1-7. Estructura de la célula euscariética, tlistracitin esquemstica de los Co) OAleba vegetal dos principales tipos de calls euesritiea! (a) na clus anda repeuentativa y (dy) una ceuia vegetal representa. Las ceulae uegetaes teen aproximadamence {entre 107 100 rn de didmetio son mis andes que las clulas animales, que resentan tipicamente un inervalo de 5 a 30 yumm. Las estructuras rotuladas en o}0 som exclusivas de eulas animales o de oélulas wepstales,8 Captule 1 Fundamentas de bloquimica soma sedimentan a velocidades diferentes a causa de sa dife- rente tematio, Altener diferente densidad espevifica “flotan” nivelesdlistintas en un gradiente de densidad lua centrifugacién diferencial permite obtener un fraccio- namienta grozero inicial del contenide elteplasmatics, que puede purificarse con mis precision mediante una centrifi: avidin isopfcnica (Cmisma densidad”). Mediante esta metodo Jngia, Jos orginules de densidad diferente (resultado de las (a) Centestugacion diferencial Homoueeciseie ‘lao Centsifagacin bjs velocidad (10004, 10m) diferentes relaciones entre cantidad de lipides y proteinas en cada clase de orginulo) se separan en un gradiente de densi- dad. Recogiendo cuidadosamento ol material de cada region dlet grauiente y observandolo al microscopio, e! bloguimico puede establecer la posicién de cada orginale y purificarlo ‘ara su estudio posterior. De esta manera se supo, por een ‘lo, que los lisosomas contfenen enzimas degradativos, que las mifocondrias contienen enzimas oxitlativos ¥ que los cloro FIGURA 1-8 Fracctnamientesubeeular de un ted, pies tre hamogenelaa meciniaront un tide, come po eemp st Iga, paca romper ls ls ycspersae su conenido‘en ur reso 2cuoso, El media de scarsa ane una preston cumin sma ab se lo ngs; cn exo evita la usin de agua hace terion de tos orgsnulos lo que provocais su hivehamiemt y exploit Las particule suspensié de dernte aria se pueden separa por ~entnfugacion a eerentes velocidad bien (be posible apie purculascon diferente dered nee centugaciin opera Es lacantingairopiiina ne Hen nd de uta en un slsolucido,cuye dersidad aumenta desde a supertcio hat ef fon- so; para prodocir ete adore de densidad se dsuclve un sou tl como sacaros a dierentes cancentaciones. Cuando se deport una smercla de rpinulos sobre ete gradient de densidad y se centiugn tubo a ata velocidad os orginlos individuals Seinertan hasta ‘que su densidad se correspond exactamente can la del sradiente. nconces punde recogors Cada cap separadoment 0) Centrifugneién isopienica (on peadients deoncareen)plastos contienon pigienitos fotosintétieas, 2) asta lun orgimuo enriquecidlo en un cierto enim suele ser el pei ‘mer paso en la purificarién ee dicho enaiima. El cltoplasina se organiza gracias al citoesqueleto yes altamente dindmico Lamicruscopia eloctrénica pernsite observar distinios tipos de flamentos de protefna que se entrecrazan en ta Célula et tic y formuan una tram tridimensional c interconectada, el citoesquelete. [xisten tres clasts principales de famentos citoplusméticos tos flamentos de swctina, los mierotibulos y los flarnentos intermertios (Fig.1-8)— que difieren en anchuara (enise @ y 22 mm), composicién y funcién especifica. Todos Ilse proporcionan estructura y organizacién al cibaplaama y mantienen ta forma de a célula, Low Mamentos de actin y Los mifcrotdialas colabaran también en el novimiento de las orgi- fnulos o en el movimiento cellar global ‘Cada tipo de componente cituesquelética ests compuesto por subvanidades simples de prota ay ‘mar flanentos de grosor unifoer polineerizan para for: Estos famentos 1 structures permanentes, sino que estn en constante fetta ign entre su forma monomeésiea y su forma estructurada en f lamentas. Su localiascién celular no esti jada rigidamente, sino que varia en gran medida churante la mitosis, la ciloquine- s wie 20. th ‘Aetina formande “ibeas de ectrés” co) FICURA-9 Los tes tipos de laments citaplasmiticas. Los pane 3 célulae epteliatesfotogratiadae depute de esto con amticuerpas que we unen ay ties expecticarnen- fe ta flamentas da activa que dam lugar 2 “Abas de estes", (4) mi ranibulos que iradian dese el eer dela cella (€) flamers inermedios qie 6 extienden par teks etaplaums, Las antleverpas LL Fundamentas cetulares 9 sic, el despiiaumiento ameboite-o a eausa de los cambios en in forma de la cehila La regutacén de la formaciin, disaregacion 1 lneallzacidn de los diversos tipos de flamentos corre a cargo dle otras proteinas enkcaxgaeas de uni o entrelazae los flame 09.0 de desplazar orgawules eitoplasmaéticns De este breve repaso dela wetructura celular povterios ex traer in idea general de que Ia cella eucaritica esta formacia por una trama de fibras estructurales.y un eomplejo sistema do compartimientos limitados por memibranas (Eig, 1-7). Los ‘ilumentos se slesagrewian para seestracturarse en otro Ingar dlistinto, Las vesiculas membranosas brotan cle wn orsaralo y se fusionan con otro. Los organules se mueven por el cite ‘plasma ao largo de flamentos de proteina gracias ala enensia dle mioiores proteleos, Blststema endomembranose searesn metabslican capecificns ¥ apeita las aupeicice en 1 ar ciertas reacckones enzimatieas, La exoci- tosis y la endocitesiny mecarismos de tranaporie (hacia el rig yl interior de Ins o€lulas, respectivamente) que: in plican fusion y Bist cle memnbranas, permiten ta comunicacion entre el ctoplasma¥ su medio extemo mediante la secrecién dle sustancins prodacisas en a célulay ls exptacién ele materia les extracelulares. 4 pesar dle su complelided, le onganizarkén del cltplasmaa st lejos de ser un producto del azat El movimento y la post con de tos que teconacen espeetfcaments aetna, tubulina proteinas de ia conte. Cuando se visualiza la célula af microscope de Murescencia, slo von visiles Las extructuras eis. panels inferiones rues: tran cada tipo de filamento a miceoseupia electninico de tansmision (2, b) odo bari (eh,10 Capito 1 Fundamentas ds blaquinvica ‘in sometids a.una estrecha regulacién y en el transcurso de Je vida de Ia cétula eucariotica se producen importantes reo ganizaciones finamente orquestadas, como Ia mitosis. Las interaceiones entre citoesquelefo y orgnulos son revereibles, de tipo no covalente y estan sujetas a regulacion en respuesta, 8 diversas sefiales intra- y extracelulares, {a} Algunos de los aminodeiias de las prateinas oo TNC Las eélulas construyen estructuras supramoleculares. as macromoléeuias y sus subunidades monoméricas son de tamano muy diferente (Fig. 1-10). Una moléeula de alanina, mide menos de 0,6 nm. La hemoglobina, proteina transporta- dora de oxigeno en tos erittocitos (gl4bulos ojos), eontiens ceereade 600 stibunidadee de aminoscido fowmando- caste l= «#18 cadenas que se pliegan de forma globular y se asoetan en, ‘estructuras de 5,5 nm de ditmatro. Las proteins son, a su ‘vez, mucho neniores que los ribosamas (cuyo diimetro es de ‘sproximadanente 20:nm), ongénulos de tamaio muy inferior al ‘de las mitocondrias, que miden aproximaclaments 1000 fim de stidmeteo, Existe, pues, una gran diferencia entre las biomolé- ‘las simples y las estructurae eelulages que pueden obser- ‘arse af microscopio Gplico, La Figura 1-11 Hustra ba Jeraiiguia estructural ena organizacién celular, FIGURA 1-10 Los compuestos arginicos a partir de los cuales se {focman la mayoria de fos componentes celulares: el ABC de la bio. qaimica. (a) Ses de los 20 aminascidas a paniede los cuss se cons ‘Muyen todas las proetnas as cadenas laterals se destaran en rosa (by Ins cinco bases itrogenadas, dos aiicares de cinco carbonos y el ‘ido fosforico a partir de ls cuales xe conctupen todos lox Scidos ‘ucleices:(€) cinco coayporenics de lipides de mernbaray cre ‘cova, andcar del cual se devivan la mayer parte de Tos glicidon. Ob- strvese que el Sido fositicn es un componente tanto te los Scidos ‘ucleioas como de fo lipides de membrana. (©) Algunos componentes de tos lipidos cr fe bon a. . a ae im co cay ~CH,CH,OH 3 oe Colina oe fs PF me £ & | fe dn foe* ‘FOURA 1-11. Jeramquia estructura en a oranizaciin molecular de fas clos Ene cls vegeta el riéleo «9 un egsnulo que con- Alene diveros pos da complejos supramolaculaes, ane eos lox “Gromosomas Los cromosomas estn formados por macromoléulas Eas subunidades monomévicas de protethas,dcitos nickel "sy polisacdrdas se unen mediante enlaces eovalentes. Sin _-szabargo, en complejas supramolecilares, las reacroraoléculas “se mantienen unidas mediante inkeracciones ma cuvalentes "tui mas ébles, individualmente, que ls enlaces covaten- ‘tes-. Entre las interacclones no covalentes se cuentan loenia= ‘208 de hidrogeno (ontre grupos polares}, las interacclones "cas (entre grupos cards), tas interaceiones Picratohleas "(entre grupos no polares en solueidn aeunsa) y las inceracclo- “es de van der Waals todas elas de energia bastante menor “quel de os enlaces covalentes (Tabla 1-1) nel Capitulo 2 “desert a naturale de ests interacclones no covalentes. Los "coinplejos supramnoleculares se estabilizan gracias af gran n- "mero cle interacciones na covalemies que ae establecen en ellos " queson ls responsable te sus estructuras Unies, Los estudios in vitro podrfan no detectar interacciones importantes entre moléculas. "Uno de los mstodos para entender wn proceso biolégica con _siste en el estudio de las moléeulas purifcaras in vitro (en et “Sierior del tubo cle ensayo), evitando la interferercia con obras Dresentes en la célula intacta ~es decir, in vivo _Apesar de que esta metndologia ha resultado muy i, debe "mos recordar que el ineriog de una ela es mary diferente de feniorio que pueda haber en un tube ce ensayo. Los compo- _nentes inlerforrntes” qne se eliminan mediante purifieaciom ‘resulta ertieos para ln fund oka 0 para la re- _suliciin de la actividad dela mokécala purincada, Por ejemplo, “Tes estudios in vitro de enzimas pros ae evan a-eabo normal- _foente a concentrariones muy bainsy ensoliciones aeogas en de DNA muchas mateinasdifewreies Cada tipo de macromoliens s construya a partir de subuniiades simples, camo peor ejemplo el DNA, que estéformada por nuckestidos (dewexiribonueledtides en realidad, -agiacion constante. En la célula, ol enima se encuentts dl suelio o suspendido en un citosol de textura parecida aun gel ‘¥ acompafatio de miles de proteinas diferentes, algunas de as ‘Cuties 30 unen al enzuina y varia su aetuvidad. Algunos engi mas formon parte de complejos multienctimditicos en los que los TABLA 1-1 Energias de enlace en blomoléculas ‘comunes Enerea da Fergie disaciacidn disociacién Tpode — delenlace* Tipode del enlace” enlace (xl/mol) enlace —_(ki/mal) laces shmples Enlaces dobles oO" 470 c=0 112 HoH 435 Coan 615 Po 41a cat Bit cH aia P=0 502 NH 389 co 352 Enlaces triples co 348 — 816 S-H 339 NSH 930 cn 293: cs 260 no 222 Sos 214 Sut nn ee eter oc tao, ee sani32 Capitulo! Fundamentes de bioquimica reactivas son canalizados de un engima.a otto sin que lleguen a tener contacto con el disolvente, La difusin se halla dismi- ruida en e! dense citesoly in composicion del mismo varia en, sus distintas regiones. Resumniendo, una molécuia determinada ‘puede setuar de modo muy diferente en la célula que in viteo. Uno de los retos de Ia bloquimica es compeender In influencia, ela orgarizacion celular y las asoeiaciones supranioleculares ‘sus funetén de enzimas y otras blomoléculas -comprender Ia funelon tanto in vive como in vteo, RESUMEN 1,1 Fundamentos celulares 1m Tors las colulas estin rodeadas por tnd membrana pplaamdtica, poseen un citosol que conten -metabolitas, cactus lunes inorganicns ¥ enimas ¥ Posen ur-canjunta de genes contenices en wn rnucleside (procariotas) o un miicleo (eucariotas). ‘& Los fotdtrofos unilizan la ux del so para realizar trabajo; los quimi6trofos axidan combustibles mediante la transferencia de electranes a buenas. aceptores electrénicos: compuesios inarginicos, ‘compusstor orginioos u oxdgena maleculst, (© Las céhulas bacterianas contienen un citasol, lun mucteoie y plismidos. Las cstulas euearidticas tienen un miicleo y estén multicompartimentadas, fn clettos process confinados en egies ‘especificos, los cuales pueden ser sepyatacios y eatuiados de modo aisdado. = Las protetnas sel sitoesyuelele se asocan formnando Jiargos flamentos que confleren Form y-iglez 8 las e6tulas y son el soporte para el movimiento de los orgémulos través de ls ila, ‘© Los complejos supramoleculares se mantenien stables mediante interacciones na covalentes y dan ‘ugar estructuras de diversas tamatios, algunas sle ellas visibles al microrcopia dptico, intersceiones ‘importantes en-el medo celular pueden perderse a ‘causa de la eliminacidn de motéeulss indvicuales de ‘estos complejos para su estudio in vitro. 1.2 Fundamentos quimicos ‘La bionuimiea tiene coma objetivo expliear en térmios quimi- 08 las estructuraa y unctones biloglcas. Una de los enfoques ‘que se han mostraco ms prociuctivos para la comprension de tos fenmenos biidgieas parts debs purieacion, « partir de ar- ‘zanistos vivos, de eomponontes quitnieas individuals, como Duedlen ser lg proteinas, para caracterizar sus propiedades ‘estrusturales y-quimicas. A finales de! siglo xv los quimicos Jlegaron.a ta coneusion de que la eemmposicién de Barnateria viva ‘ra 2orprendentemente diferente de-ta det swundo inanimaco, Antoine Lavoisier (1743-1794) observ la reltiva simplicidad uestos de carbono pura formar parte de la macuinaria mle cull de tas eélulas durante ol arigen y la evohucién de los Seres vivos, Ningiin otro elemento quimico puede forma me) Jéculas con formas y tama tan diferentes-9 con tanta varie dad de grupos funcionales. ‘Puode consiceraise yu la mayor parte ce las blomolsculas son detivacos de los hidtocarburos, cow stomos de hidrogeno Feemplazaclos por grupos funcionates pars dar hagar a tas dif ‘rentes familias de compuestar nrginicos. Las mét communes ‘on los alcoholes, eon uti o mais grupos hidroxilo, las aminas, ‘eon grupos artino, los aldlebidesy las eetones, con grupos car. bonito, fos deidos carboxilicos, con grapes carboxilo unides ‘Fig. 1-15), Muchas biomoléctas son polifuncionales y conti. ‘nen dos © 1 tipos de grupos funcdorales (Fig. 1-16), cata une con propiedaces quiimiens y resctivead prapias, La ‘personali- dat” quimica de cada cornpuesto viene determina por bs qui ‘ica de sus grapos funcomales y su disposieldn trickmensional14 Capiul1 Fundamenitos de bioquimniea aes “y Carbonile RGA Tinidazol (aldehido) Carbonilo Wt Sulthidrio {cotoma) Cartes RLGLO? Disulfre Hideo R-O-H Tiodster ‘elechel) Bur Roun Fosforila FIGLIRA 1-18 Algunos grupos famcionales comunas de les blomoldenlss. En extn i essence figura, as como en otra a argo de todo alibr, se utliza Ia R pa reprsentar un susttuyente cualquiera. Puree sr tan simple coma wn Stormo de Hedigen, pero ormalimente es un grupe carborado, AukAhtto ‘Cuando se represenian dos o mis (doe seid unliyentes en una meléeule, 2 emplen cnslvallies? el saperindice RY, R, et, \Las eélulas contienen un conjunto universal de moléculas pequenias En la fase acuosa de una oélula (citosol) se encuentran di- sueltas de 100 «200 pequetias moléculas orgénicas diferentes (M4, ~100 » ~200), que son tos inetabolitos-centaes de las 12- tas principales presentes en la practica totalldad de las célue las los metabolites y rutas que se han conservado a lo largo dela evoluelon- (En el Recuadro 1-1 se encuentra una expli- caciOn de las diversas maneras de referirse al peso molecular “i Re RP Anhidridomixto (ieida carbeasien 1 Acido ffrico, faabida Harada aell afats) de-una sustancia.) En este conjunto de moléculas se incluyen los aminoscids, muclebtides, aticaresy sus derivacios fosfei- lados y elertes deldos mono- diy trcarboxalions. Las moléeu- las son polares 0 cargacas, solubles en agua y'se encnentran, ‘en ooncenirackones que van desde micromolar a milimelar. Se rmantienen dentro de la eélula porque la membrana plasms thea es impermeable a ellas ~aunque alunos transportadores especiticos de membrana pueden catalizar €] rhovinienta de ciertas moléculas hacia ol interior 0 ! exterior te Ia cétula © entre compartimientos de las céhulas eucariticas. La presen1.2. Fundamentos quimicos 15 ion imideat = Ny 6 ry a Gia nsipa ial Ea Lfon m < sch seaman “ de—cht FROURA 118. Alguos rp fine comers o bu na inca Biorb. Eset cooncina A FOBEE ean (cominmenteabrevade acei-Can) es portdr de [pUpOE sce sls acciones ncinicas. ‘Aceti-eaenzima A ia universt! del mismo conjunto de conpuestos en las o&hi- las vivas es una manifostacicn de ta universalidad del diseio metablicey refieja la eonservacién evolutiva de las rutas me- tabolicas que se desarrellaron en las clus primitives, xisten otras biomoléculas de pequefia masa molecular aque son espectficas para certs tipas Ge cofulas 1 orgamsmnas. Por ejempis, las plantas wasculares contienen, adernés de los metabolites ya comentaios de earicterunivertal, otras molé- culas denominadas metabolites sceundarios, ue juesan un papel espeeifico en Ia vids de la planta, Entre estos metabo tos se inelayen compuestos que proporcionan a las plantas su aroma caractertatioo y otros como la morfina, quinn, nicotina ¥eafoina. El canjunto de pequefas moléculas de wea cétula dleterminaca ha recibido el nambre de metabaloma de lao. lula, sugiriendo wn paraleisme con el término “genomal" {det nido anteriormente y que se comentard més ampliamente en la Seccida 1.4), $i supiéramos la eomposieiéin del metaboloma de una réuls, serfanies capaces de predecir qué enaimas y ru tas metabolicas son actives en su interio. Las macromoléculas son tos principales constituyentes de tas eélulas Gran parte de las moléculss biolaieas son macromoléculas, polimeros de alta masa molecular consteuidoe 2 partir de pro urgores relativamente simples. Las proteinas, os ids ru dleicosy las polisnedrides son el resultado de la polimerizacin, de subunidattes relativamente pequeris de masa molecular telativa igual infer a SOM. BL nimero de unidaces pone rieadas puede vatiar entre decenss y millones. La sintesis de Imacromoléculas es tne de las actividades eelulares que mas enetgia consume, Las macromoliculas pueden formar ego es- Peso molecular, masa molecular y las unidades que deben utilizarse Existen dos maneras eomunes ¥ equivalentes de define rmnsa molecular y amas e utlizan en este texto, La primera eel peso molecular, o masa raolecida relatioa, represen tados por el simboto.,, peso molecular de una sustancia se define como la relacion enare la mais ce uma molecu ce feta sustancia y ln duodécima parte de la masa del cartono 12 (°C). Al definirse como una relacion entre des valores on las mismas unidades, AM no thene dimensiones -no tiene turidades asociadas-. La segunda es la masa molecular, Fepresentada por m. Esta es simplemente la masa de una rmnkécula, 0 a masa molecular dviita por el riimeto de Av ‘dro. La masa molecular, m, se expresa en daltons (abre- ‘aro Da), Un elaiton equivale a una duorlécima parte de la nasa del carbono-12; an kilodalton (kDa) equivale a 1000 daltons y un megadalton (MDa) a un millén de daltons. Considérese, por ejemplo, una risléeula de masa 1000 veces la del agua. De esta molécula podemos decir Io si- guitnte: Aly = 18.0009 mt ~ 18,000 daltons. También la po- domas deseribir ecmo “una moléenla de 18 kDa", Sin embargo, la expresion M, = 18.000 daltons es incoreeta Ota tnidad que sirve para escribir la masa le un tnico tomo o una tintea moléenla e¢ Ia undead de rasa atmen (anterformente rlenominada urna, abreviatura que ahora ha sido cambiada por u), Uni unidad de masa stiiica €1 u) se define como la duodécima parte He la masa de un stomio dle ccarbona-12. Puesto que la masa de un étomo de carbono-12 medida exnerimentalmente nn de 1.9626 % 10° g, Tu 41,6606 10" g, La uniend de masa atomica resulta ade cusda para deseribir, por ejemplo, lt masa de un pleo obger- ‘ado por espectrométria de masas (vase Recuadra 3-2) ae16 Capitulo 1 Fundamentes de bioquimica leuclaris supramoleculares, dando lugar 2 unidados Funciona- Jes tales como los ribosomgs, En la Tabla 1-2 se muestran las brincipales clases ce biomoléculas dol beter cot ‘Las prote!nas, lagos pollmeras ce aminodeidas, constita- ‘yen, exeluyenda a uy, faced celular mas importante. Ale ‘Suns protetnas tienen propieaes caalteas y actkin gom@ (raimas, otras srven como elementes estructurales, receptores ‘de sefales 0 transportatores que acarrean sustarviaa espe ‘cg hacia o desde el interior de las clus, Las proteinas son ‘ui ns biemotéculas mis versitile, Los deldow nucteicos, ‘DNA y RNA, son-poltmeras de muclestides. Almacenai ¥ trans miter lninformaciéin genética y algunas moléeulss de RNA de- sempefian papeles estricturales y cataliticos en complejos ‘upramolectiares. Los polisactrides, poimeros de aatcares “lmples como a glucos, tienen ces fnciones: sven como alma. sn de combustibles enengétis 9 cnuw elementos estructura Jes extracelutares que proporcionan site de fee eapecticas pare determinadas proteins. Los polimeros mas cartas de az cares (oligasaedndog)aetinn como sefiales expecificas cuando se presenian unidos a proeinas oipkiee cel saperfielecekla Los lipids, serivados grasos o aceitnsos de hidrocarburos, sirven como componentes estracturues dé las membrana, re serva de combustible rico en enerpla, pigientos y sefaleg in- tracelulares. En proteinas,dcidos nucleieos y poliaeaidos -uimero de subuniacles mononérieas e8 muy grande; a masa ‘molecular relative de las proteinas oscil entre 5000 y me le 1 millon, es de hasta varias niles de millones en dcidos nuclek os y det orien cle millones en polisusdrdes como el amid, [uns molésulas individuales de pido son mucho ms peqpieniag (Gf, 750.2 1500) y no se consideran macromolécals, Pero ln ssocinciin no eewalonte dosun gran niimero de ook he Dido: produce la formacin de estructuras de gran tama. Las ‘membranas celular 58 eonstruyen.a partir de enorme agrest- dos no cowlentes de mnie de pis ¥ de prottnas, Las protetnss y jos dcidos nucleicos son moléeulas in formativas: cada protetna y eads deido nucleica posee vine Secuencia caracteristica rica en informacién, Algunos oligosa- ‘ciridos de estructura ransificada y formados por seis 0 mas azticares diferentes son también moléculae partadores de Informacién y actilan en la superficie celular externa como Drocesos celulares (enmo se desceiird en al Capitulo 7). La estructura tridimensional se describe en términos de configuracién y eonformacién Ls enlaces eovalentes Ins raps farcéonales de las bioma- Ieulas son de importancia central ara su funciona gual que ln distebucisn de ls tomo ele a biomolécala an wl ecpacio tridimensional (su estereoquimica), Les campuestos de car- bono existen norimente como estereoisémeres,rolécu las que contienen los mismos enlaces quiimicos pero con wna eslereoquimica diferente, es decir, ent diferente eonfigura- idm o relaelon espacial enire sus élomos constituyentes. Las interacciones entre las biomoléeulis son invarilemente es- tereoespecifiens, lo quo implica que las moltculas gus inéer- acta deben tener una estereoquinica eoneret, 1a Figura 1-17 muestm tres formas ce ustrar la estruc- ‘ura estereoquimica de moléeulas simples. EL diagrivnn en (a) om FIGURA 1-17 Representaciin de moléculas, Ties maneras ce pce servarla estructura del aminoscilo slain, ta) Férmula estructural ‘en perspeciva; ol sibolo (representa un ence on of que el ‘somo sel exer ms acho proyets hacia lexi del plane sel pope y hacia lector el snbolo (=) representa enlaces o tin dig hacia spare poiteror de plana dl papel) Moo df bolas y varias, donde se observan las longitudes oats de fos enlaces y los inguis enlace e} Maelo espacial lem ne que ‘ada toro e presenta com su radio dt van der Waals.win ‘coon ‘coon, ‘Acido mallee écist Acido fomérieo trans? @ oH en Ea sae » | tte on 1 ete-Reinal » perspeetiva especifea la esterecquimica de forms no ambigus, ‘pero ls agulos y las distancias ce enlace se representan me jor con modelos dé bolas y Yarillas, En los modelos e=pacial- ‘ment lens el rio de cada tomo es proporcianal su radio. ‘de van der Wants y os contomas del modeln definen el espacio scupada por lo moléeula La comfiguracton es el resuitao de ka presenta de (1) en laces does, alrededor de los cuales no existe libertad de rota cn, 0 (2) centros quires, alrededor de Jos cuales Ios grupos ssustitnyentes se disponen sgn una secwencis espectfca. La caracteristica que identifica aos isdmeros confguractonales fos que no pueden ser interconvertidos sin romper teraporal- ‘mente uno a mas enlaces covalentes. La Figura 1-181 mnestra bas comfiguraciones del ido taleien de su isémero, el dcido fumsrien. Estos compuestos #00 ixGmerox geométricos 0 cls-trans; cileren en la disposiciin de sus grupos sustitiyen- tes con respecto al doble enlace que na pose capacicad de rotacion (del Intin cas, “a este Indo" tos grapos:se encuentran en el mismo lado del enlace dble;trazts, fal otra inka" los ‘rupos se hallan en Indes apuestos) El icido maleieo es el is6 mero cis yelscida fumarico es el trans; cada uno de ellos es un compuesto bien cefinido que puede ser nislade y purii- ceado, teniendo cada uno de ellos suo propins caxaeterintiens ‘quiimas. Un sitio de unién (por ejemplo, en un enzini) ave sea complementario para uni de e9tas molculas no We se ‘para Ia ota, o.cual expliea por qué estos dos Compuestos te= 12 Fundamentes quimicos = 17 FIOURA 1-18 Configuaciones de simerosgeométricos. a) Los soe eos cota ido maleieoy of deida fumirico ro pueden inter converte sn a otra de enlaces covalentes, proceso que coneure much eres. b) En a retina dels vericbradas, paso inicia de procero de detecciin de la hi ela absorclon de a luz visible por parte dol 11 retinal. La energfa de la hur absorbs apnontmada mente 250 Kol convene! H-ci-etinal en todorans retinal, lo ue produce variacionesecticas on las clas deta retina que dan lugar a impuleo rervovo. (Obstrvese que en fos madelos de bolas y ‘orilias de os retinas se omiten fos Stomox de hidrégen.) ‘nen papeles blokes diferates a psa de ser quimicamente immy parecidos.| ‘En el segundo tipo de isonverfa.configuracional, los cua tro sustituyentes diferentes unldos a un Stomo de carbon te traédrico pueden ondenarse en el espacio de doe maneras diferentes (Vener des configuraciones, Fis, 1-19), dando lugar 8 dos estereoisomeros con propicdades quimieas sirlares 0 ienticas, pero que difieren en algunas propiedaces Nseas y boldgieas. Sedice que un dlomo de carbon con cuatro susti- tuyentes diferentes es astmetrico y los carbonos asimetricos se denominan centros quirales (del greg crs, mano"). Una moléenta can un sole carbon qulral puede tener do tereoisomeros, mientras que puede haber 2" estereotsomerns ‘cuando los carbonos quirales son das 0 mas (1). Algunos exe- reoisGmenas son imsgenes especulares uno del oteo; son ot ‘tamados enantiémeros (Fig. 1-19). Las areas de estereo- Jscenoros que no en lnsgenes especularesenkre awe denomi- ‘nan diasteredmeros (Fis. 1-20) Tal cam obserwé Louis Pasteur (Recuadro 1-2), tos enan- tiomros tienen propiedad quindcas cast denies pena se d- fereoian en una propiedad kia earucterstca, su interneeion ‘can la ue polarzada. En solucionessearadas, ls das ena LiGmaros rotan el plane de Is hie polarizada en dltecctones opuestas nero soluciones equimolares de fox dos enantiome- fo (mezelas racémicas) no provocan rolacin dotica Los ccompuestos sin centras quiralos no rotan la hz podizada.18 Capitulo 1 Fundamentos de bioquimiea @ oy fy hake FIGURA 1-19 Asimetria molecular: moléculas quiralesy aquirales. {a} Cuando un Stamo de earboo tere custo sustcuyentes diferentes (4, 8,%,7), 6sos pueden disponerce de das maneras diferentes, quc don lugara-dos moléculas no superponibles, steno cada una de elias ‘a imagen especular de Ia ota (enantigmeros. Est tomes de car. bono. asimétrcos se denominan tomas quirales o centios quirales, (61 Cuando alrededor del toma de carhona tetradrco ve dcpanen Snicamerte tres sustnuyents elevates es dei, hay dos sustapemes quae, solamente es posible una configuracién espacial y la mol6- ula es simétrica 0 aquial. En este ease la moléela pede superpo ‘ows a Su imagen especular fa mokécula de la inquiry, rotanlo en sentido contrari a ls agujas del rele (euarido ye mira hacia abajo porel sje vertical que une Ay ©) da lugar a la molécula dl expo. ‘Dada la importancia de In éstercogutinica en las reaccio- nea entre biomoléeulas (comma se verd rués adelante), el bio- ‘gumico debe poder denominar y representar I estructura de Jas biomoléculas de modo que su estereoquimiea quede det- ida sin arbigidedad, El sistoma de nomenclatura RS es ol ms ‘tl para compuestios con mas de un centro quiral. En este sis ‘tema se asigna una priaridad a cada uno de los grupos unis ‘ unvearbono quia. La pmioridad para algunos sustituyentes communes e@ a sguionte, —OCH, > —OH > NH, —COOH> —CHO> —CHOH> —Cl > Seqan ol sistema RS, ol stomo quiral hs de mate de "oda que ol grupo de nriaridad més bapa C#en el dagrama cle 1a pagina siguiente) quede situado en diceorién nesta al b= servador. Ia prioridad de los ras tes grupos (La 9) dis huye segtin el sentido de las agujs del rela, ia contiguraein seré (2) (del atin rectus, “deneeha") yi vaen cones del en Enantidmeras(imdpones especulares) Cs cn, il Bogs in aon Prk" ‘Dinsterx6meros (imégensa na expeeularea) FIGURA 1-20 Los tpos Ue estereoiximeros, Hay custo butanos di erentes 25-bisstituldas (2 carbonos aslmdtricns, por consipicnte 2 = 4 extermossdmetos Cada uno de ellos se mucsea en un recur ‘dro como una érmula en perspective y caro un madelo de bolas y ‘arias el cual se ha voto para permits que elector vea toes los ‘rupas.Algunos pares de exerscisdnetat son imigenes expeclares ‘tno del oto, siendo por tanto enantidmeros. Otros aes no son in Benes especulares yrocibn al namre de diasterecmeros.Louis Pasteur y fa actividad dptica: In vino, verltas Louis Pasteur fue, en 1849, el primero en en- contrar una exphieaciin correcta para fender meno de la actividad éptica, Investigance sobre el sedimento eristaline que se acunulaba eniasharriles le wim Cur forma del cid tar> tésioo denominada dekde paratartico, tambien Ccanacide como dito racémico, det latin race- ‘mas “racimo de ura"). tid unas pinzas mary finas para separar dos tipas de eristales eva forma era idéntica pero de los que carla uno he ellos era la imagen especular del otro, Ambos pposeinn todas las propiedades quinieas del cid tartético pero, ol dsolvertos, une eke eos ‘ela tar luz polarizada hacia le ixquierda (levigiro) yet ‘tro hacia a derecha (dextrdgir). Pasteur describe inter~ ‘reid el experimento de eate modo: Enos euerpos isoméricas los elementos y las proporcio- nes en las que estén combinndas son los mismo, tan sho la dispnsickin de fos atomns es diferente... Salvennos, por tun ldo, que las dsposieiones moleculares de los dos ac- tos tariiricos son asimétricasy, por el otro, que estas ds- pasiciones son absolitanente ilénticas, a exeepetén de ‘que exten asimecria en, direceiones opnestas, ae en- ‘tientran ls dtomos del dcido dentro agnupados en farma ide una espiral dextrcgira, situndos en el épice de un te- ‘raedro irregular o bien ordenailas sean ésta 0 aquella, slisposicin asimnétria? No lo saberyoa.* Louis Pasour 1822-1895, 12° Fundamentos quimicas 19 Ahora podiemas dar ura respuesta, Los es fhdios crstalogrsicos con rayos X eonfiemaron fn LOBL que Ins forrnas lovégiea y dextregira dal Acide tartético son entze ells indigenes espec- lures y permitieron establecer Ia configuracion absolita de earla una de ellas (Pig. 1), Se hau lizado la misma metodologia para demostrar que, aunque ol aminoeido alarina existe en dos farinas enantioméricas (denoninadas my 1), en as proteins fs alanina ee presenta s6lo en una de las formas (el imero-t; véase Capi tale), HOOC! §COOH ‘Hooc! Ba Wg Yon wag Acido (2R,aR} tartarien Aoide (28,25) toxtérion FIGURA 1 Pasteur separdexstales de ds estereoicenenes del Seid tanarico y demoss que Ise dsslucionas de lot dot computor pr separa daban lugar al mitrno grado de wotacion de uz polar ada peta en dnecclones opucsts. As tarde se emostré que at formas dextidgira y lerdgira de Festeu correspon a is formas ikométieas (2) y (5,5) aqui mortradas. Eno texto se describe o sistema ge nomenctatura K. *Earaido de Iz eonfezoncis ee Patyur on ta Société Chimique do Pals en 1867, cada en OuBios (1976) touts Pestew: Free lance ef Science, p95, Challes Scvibaer’s Sons, New York. tido de las agujas del rela la configurucién send (S) (del latin sister, “iaquierta”). De esta manera cata carbon quiral es amado (2) 0 (S) y la presencia de esas designaciones en el nombre de] compuesto proporeions una deseripeldn inaqut- ‘voce de la estereoquimira de cada centro quiral &) S Daan nage is e En el Capitulo 9 se describe otro sistema de nomenctatura, el sistema y1, Una moléeula con un solo centro quirat (come el aliceraldehido) recibe un nombre no ambguo con eunlauiena de tos dos sisters, cHO CHO. woken = om, cae CHLOH,, Oiecnéio «amt Et concepto de conFormaciém molecular describe la dis poaiekon eepacial de los grupos sustituyentes que thenen ibe tad para adoptar diferentes. posiciones en el espacio sin necesidad de romper enlaces, gracias a su libertad de rotacin, Asi, enel etano, uit hidrocarbure sencilo, existe libertad casi total de rotackin alrededor cet enlace simple ¢arbono-carbono, Por lo tanta, son posiblas mucha eonformaciones dkferentes © nwerconvertibles de la motécula de etano, segiin el gratlo de miariin deleniaee (Fig. 1-20). Dns coifnemacines son de es pecial interés: Ia extendida, més estable que las demas y por tanto la predominate, y la forma eclipsada, ls menos estable. [No-es posible xislar ninguna de estes dee formas corformacis- rales puesto que se hallan en equilibrio y son interconverti-20 Capito 1 Fundamentos de biequimies ‘Berga potencial (lamol) FIGURA 1-21 Conformaciones. E etana iene muchas conformacio- ne ponies al enn Iibesiad we raat alreesar delenlace simple ‘arbono-carhona, En el modela de bolas y varias, cuando e Stoo {de carbone anterior desde-el punt de visa del ecto) sus es do ‘mos de hidrgeno rotan con relacia al diame de catbones poserex, la energfa potencial de la molécuta aumenta hasta un muiximo en ia conformacién completamente elipsada (ngules de tein de OP, 4 20f, etc) y disminuye hasta el minima en la conformacion comple- tamente extenc (ngulos de tors de 61%, BAP, ete). Las deren ‘cigs de eneggia son To sucientemente pequefae come pra peri |e pica intexcanversin de las dos formas, por lo que resale imposi= ‘le aisar las formas eclipsaday extend, hiles. Sin embargo, cumelo se reemplecan tino o ms Stamos de hidedigeno de cada tno de los earbonns-con grapor funcionalles ‘Yoluminosos cangados cléctricamente, la bertat de rotacion alrededor det enlace carbono-carbona queda restringidla, Po limita el ndimero de conformaciones estables de los derivado: del claro, Las interacclones entre las blomoléeulas ‘son estereoespecificas Las interaccionos inlogieas entre moléeulas son estereoespe~ ics: su "emcaje” debe nor correato estoreaquimieamente. Li ¢stuctura tridimensional de las biomoléculas grandes ¥ peque fas es de importancia primorcial en sus interacciones bioligi- ‘sr un reactivo con swenima, una hormarta pon. su receptor de membrana ocular, un antigeno-con su anticuerpo espectfice ‘son ejemplos de ello (Fig, 1-22), El estudio de la estereoqul- ‘nica biomolecular mediante métodas fisicos precisos consti- ‘tuye una parte importante de la moderna Investigacion sobre ‘estructum celular yfuncién bieguiricn, Las moléculas quirales de los erganiemns vivoe se en. ‘euentran generalmente presentes en sélo una de sus formas ‘quirales. Por ejemplo, los aminodcidos éstén presenies en Tas [proteinas solo como isimeras L; la giueasa, tan s6lo en forma de su isémero p, (Enel Capitulo 3 se describen tas conveneia. ‘nes para denominar los estereuisdmeras de los aminodeidos, lac correspondiontes a los gliridos 3¢ describen wn el Cap tulo 7; el aistema RS, descrito anteriormente, ae el mis dit para algunas blomoléculas.) En cambio, cuando un compuesto ‘que poste un taino de carbone avinysieien se sintetiza quinn FIGURA 1-22 Encaje complementaro de una macromoléeula y una rmoléeula pequefia La figura muestra un separ dé RNA de la ro {on reguladora TAK del genoma del vinw de la inmunodficleneia humana (en gris) unido a una molécula de argininamids. (en colo), Fepresentando un residuo ce una proteina que se une a esta rein, | acininamida se ajusia a una cavidad de la superficie del RNA y se martin en esa esgetacién mediante vars intetacciones no cova lentes con Ete. Est representaciin de la molécufa ce RNA esta gene tada com el programa informatica GRASP, que puede calcula la fora de la supericse externa de una mactomalgeula, detinida por los radios de van der Waals de todas los tomas de la molécula o por el “volumen de exciusin del solvente”, mis allé del cual no: puede penetrar una moléeula ce agua, camente en el iboratorio, la reaccidn suele producir todas tas formas quirales posibles, formanda, por ejemplo, una mezcla de formas ny 1. En las cdlulas vivas ee produce una sola forma ‘quirall gracias a.que los anainas que rintetizan las compucstos ‘quitales son también, a su ver, moléculas quirates. Laestereoespecifieidad, 0 capacidad dedistingwit entre estereoisimeros, ¢5 una propiedad de los enzimas y otras pro- telnas y un rasgo caracteristico de Ia légica molecular de las ccdulas vivas, Si! sitio de nnién en una protelna es comple mentario para un iscmero de un compuesto quiral, no sera complementario para el otro isémero, En la Figura 1-28 se ‘muestran dog notables eleanplos de la capacidad de los siste- ‘mas biolégicos para distinguir esteronisémeras, RESUMEN 1.2 Fundamentos quimicos \m Gracias au vensatiidad de enlace, el tomo de f:arbono puede produsie un ampliavariedad de esqueletos rarbono-carbora con diversidad de grupos funcionales; c¥tos grupos son los que conficren sit personalidad bioligica y quiniea a lus bomaléeulas tm Las células vivas contienen im conjunto casi universal Compuesto Por ulies Contenares de moléculas de baja rsa molectlar; las interconversiones de esias rmoléealas en Ing rutas mocabslieae centeatos ge han conservade-a lo lange de ka evolucién, 'm Las proteins y los dicidas nucleicos ton polimems lineales de subunidades monoméricas simples ssFIGURA 1-23 tstereoisomnerarditinguibles por _receptores sentoriales del gusto y ollato hamanas. {@) Dos extereoivimeros de la earvona:la(K)-earvona ‘aislada dol scvite de ments) pose la agancia “Caracterstica de la menta la (S}-carvona (dé aceite ert ‘de semis de alearavea huce alcove. (£1 ae aspartam, el edulcararte comercalizido con ls svambre de NuraSweet, se dstinguc ficimecte desu esterecscenero amargo, a pest de que es Bicarvona ‘eaniormaciones diferent slo en uno ds os oak) - dos dtomos do carbone quires a H o “oon, ecto cH cS “ocr, ‘OCH, lee BOT iis H ‘eAsparti-feilalanil mil éter ‘oAsparil->feilalaail mel éier (axpariamo) ules) ‘aasarge} secvencias eontienen ba informacién para definie su estructura tridimensional y sus funciones bioldgicas, lua nica manera de cambiar la configuracion ‘molecular es mediante a rotura de enlaces covalentes. $i un dtomo de carbon tiene cuatro sustituyentes diferentoo (un eartone quiral), ést08 pueden ardenarse de dos modes diferentes, ‘enerando estereoisémeros ¢on propiedaces diferentes, Sdlo uno de log estereaisdmeros es biolégicamente activa, La conformacion molecular es |wposieién de los stornos en el espacio resultante de I rotacion alrededor de enlaces simples-y sin que implique la rotura de enlaces covalentes, De modo prieticamonte invariable, ls interacciones ‘entre moléculas biokigicus son estereaespecificas: ‘Tequieren el encaje complementario entre las moléculas que interacttian, 1.3 Fundamentos fisicos ‘uns eéfulas y organismos deben realizar trabajo para mante- ‘nerse vivas y reproducirse. Las reactiones sintéticaa eelulares ‘eaitieren aporte de energia del mismo mode que los procesos sintéticos industriales, También se consume energia en el mo- ‘vimiento de una bacteria, en el destello de una hiciérnagao en Ja descarga eléctrica de una anguila. Ademsas, ¢! almscensle 4b expres de la informacitn tienen un noste energético, sin } cual ina estructura rica ex infurrnaeidn perderéan inevita blemente su orden y, por ence, su signifieada. Las células han desarrollado, a lo largo de la evalucién, ‘Mecanismos muy eficientes para. ol acoplamiento de la energia. wr ‘obcentda de taux solar 6 de las coribustibles com tmuchos pro- ‘cesos celulares que consumen ener, Una de his obijtivos de Ja bloquimica es ls comprension, en términos quimiensy cua ttativos, ele os mecanismos re extraccién, canalizaciiny cam. sumo de ln energin en las cSlulas vivas, Podemos consderar ls conversiones da la energia celular en el contento de las le yes dea termodindmica, Los organisimos vives existen en un estado estacionario dindmico y no se encuentran ‘nunca en equilibrio con su entorno ‘Las moléculasy os tones. contenides en wri anganiseno vevocifie- FerLem cuanto a tipo y concentracion dle les que se enewentraa en su entomo, Un Paramecium en una charca, tn eriteoerto. ‘er el torrente sanguineo human o un manzano en ttn jardin ‘son ejemplos de organismos que tienen wna eomposieldmn dito rente a la de su entamo y que, una vez maduros, rantienen (en tna primera aproximacicn) una compasicion cotstante a Desar de que su entorno cambie constantementa. A peaar de aur la enmpnsicién quimies carseterietica de un Drganismo varia poco a lo largo del tiempo, la poblacién de m= enlas ce una célula organism se encuentra bien lejos de ser ‘estitica, Contiuamente se sintetizan y se degradan pequentas ‘moléculas, macromoleulas y camplejcs supramoleeulares me- ante rencciones quimicas que necesitan de un flujo constante de masa y energia através del sistema. Las moléculas de hemo- f@lobina que eslan transportando en este momento oxigeno desde nuestros pulmones a-nuestro cerebro se sintetizaron el ‘mes pasado; dentro de un mes se habrain degradado y habran sido reemplazadas por nuevas moiéculas ce hermnglobina. La ‘lucosa que ingerimes en Ia ultima comida se encuentra ahora22 —Captule'1- Fundamentes de bioquirnica cérculando por nuestro torrente sanguineo; antes de que ver mnine ei dia estas mismas moléculas de glucosa se habran convertido en didxido de carbone o grasa y habriin sido reem- ‘losadas por un suminstro fresco de glucosa, de medo que ‘iyestra concentracién de glucosa en sangre $¢ mantenga mas 0 ‘menos constante a lo lange del dis. ‘La cantidad de hemoglobina 7 alucosn en sangre permanoce préeticamente constants Po jus ls velocidad de sites o ingestin de cada una de elias ‘compensa con exactitud la velocidad de su degrartacion, con ‘sumo o conversién en algiin otro producto. La constancia en la ‘concentracién €5 el resultado de un estado eslacionaria dind- ‘nieo, un estado estacionario que se encuentra jos del equ brio. El mantenimiento de ¢ste estado estacionario requiere el porte constante de ener; cuando la ona ya no e=capeé le idenerar enor, mere e micia su degrachcién hacia el equtt brio con su entorna. A continaackin vesernos qus.es fe que se canoce exactamente como “estado estacionaro”y “equlbio” Los organismos transforman energia y materia de su entorno Pars ls reacciones quimicas que tiench mgar en soluciOn, po- demos definir un sistema corn el conjunto de los reactevos y productos presentes, el disolvente que los contienre ya akm6s- fera circundante o, dicho de otro modo, tado aquelio que est inchuido en una regidn defini det expacio. El conjunto del ‘sistema y su entorno configura cl universa, Si el sistema no intereambia materia mi energéa con su entorne, #¢ denomina ‘alstado. 5i cl sistema intereambia enengia pero no materia Con SU eTtOrno es unaisteans cerrado} of intorcambia materia ‘yenergia, sun sistema ablerto. Un organisma vivo es um sistema abierto que intereambla materia y energia son su entorno, Los organlsmos vivos ex- ‘traen energla de su entomo de los maneras: (1) eaptan com- bustibles quimicos (como por ejernplo glucoss) cel entomo y ‘extraen enengia de au oxidacidn (véase Reewadro 1-3, Caso 2); 0 (2) ahsorhen enertis de Is Iz solar ‘Lapeimera ley de In termodinamica, desarrollada a partir de Ja fisica y de la quimica pero plenamente wéliia para sistemas bioldgicos, describe el principio de eonservacion de ln ence: en cualquier proceso fisieo o quimtco la cantidad de ener- (ofa total del eniverso permanece eonsiande, aunque forma puede variar: Las ofulas son consumatios traneductores ide enendia, capaces de interconvertir energia quimica, electto~ ‘magnética, mecdnica y osmottca con gran eftceaci (Tg 1-24). EI flujo de electrones proporciona energia para los organismos Practicamente todos los organisms vivos derivan su energia, directa o indirectamente, de Ia energia radiante de: ka luz solar ‘que proviene de tas reacciones de fasin termanuciear que be prodiucen en el so. Las céfulasfotosintéticas absorben Ia ener ‘gia lumminosa del sol y 1a utiliza para dirigir Jos electrones desde el agua sl didxido de carbono, dando lugar & compues- tos ties en energia tales coma ghicasa (CoH x04), almidén y sacarosa,y Hberando Op a la atmésfera: luz a 6C0, + 6H,0 —> Cell iaOe + 60 (reduce del COa par accién de In energin Tuminoss “Laedtulas y hos organismnos ino fatosintétiens obtienen energia para sus necesidades mediante la oxidaci6n de Jos proshctos i- ‘ons en enérgia de la fotoeintesis, traneportando elocttones hacia @ ‘Desceni en el desures Cemtropia} del wistems FIGURA 1-24 Algunasinterconversiones de energia en los organi snes vivos, Durante fs transdvciones metablicas de energie de onden del tema y lsu entrno (ene) arena a fa ver que kt ‘ererpla potencial dé ss moldenlas nutientes complejas disminuye, {a} Lor organisms vivos extra ener desu entorn, (cnet ‘ona pure della en form les para product trabajar (€) dewuelen tna pate al entero en forma de cal y (d) fibevan motéculas como rodcis finales menan onganiesst eset combusile vig, at frentande ls entropia del universo, Como consecuencia ce toda es tas tranefomaciones(eaumenta el orden (aiiminuye el desorden) en tl sisesma mediate la formacion de macromokBeulas comples. EL Capitulo 13 ace un tratamiento cuantitativo deta eetrope1}y atmostericn pars formar agua, ditxido de carbono y otros "productos finales, que son reciclados en el medio ambiente; CH ,gOg + 0; —+ 600, + 61840 + energia (rencein de oxidacién dea glucosa que produce eneraia) Practicamente todas las transdhcciones energéticas de las oé- Julas pueden entenderse como un fujo d= cleetrones desde ‘una molécula a otra, en un proceso “cwesta abajo” desde po- Aenciales electroquimnicos superiores a inferioves; siendo as, esto es formalmente andlogo al fhyjo de electrones enum cit- ‘uito eléetrico slmentado por una bateriaeléetriea. Tas las reaccones que implican un njo de electrones son reaccio- ines de oxidacién-redueclén: in reactivo se oxida (pierde ‘electrones) y otro se reduce (gana electrones), Crear y mantener al orden requlere trabajo y energia JELDNA, el RNA y las proteins son macrornoléculas informa ‘yes. Ademds do usar enerpia quitniea para formar os enlaves ‘eovalentes entre las subustidades de estng palimeras, bas céh- Jas eben invertir energis para ordenar las ubunidades en su -secneneia correcta Bs extremadamente improbable que los saminoicidoe de una neacla se condensen expontinaamenta ‘por formar una proteina de secuenctainica, Bo implicaria un -sumento ce orden en una poblaeién de moléeulas, lo que com trastaria com la segunda ley dela térmortinémica seztin la cual ‘a tendencia de cualquier proceso natural es lade incrementar fl desordien del univers: la.entropta total del universo ext “en comstante crecimiento, Para dar lugar a la sntesis de ma- rmmoléculas a partir de sus subunidades monorricas debe furnnstrarse energia bre al sistorma, en este cao, Is cs El desonien de los camponentes de un sisterna quire se exprest como entropia, $ (Recuatra 1-8}. Cualquier ve ‘iacidn en el grado de desorden Ge un sistema equivale a una vu riacién de entropia, AS, que, com. vencionalmente, adopia valores positives ewido aumenta el de- sorden. J Willard Gibbs, que desa- roll Ia tenrta de las variaciones cenergéticas durante las reaeciones aquiiicas, demastns que el sa tenido on onergia libre, G, 0° cualquier sistema cerralo puede dlfinirse a partir de tres magnita- dies: entalpin, 1, que refiela el rimera y el tipo de enlaces; en- tropia, $y la temperatura abesluta, 7 (en grados Kelvin), La iefinicion de energia Wbre es: G = 4 — TS, Siuna reaccton ‘quimica tiene Ingar » temperatura constant, la wartacidn de energia libre, AG, viene determinada por la watici de en- talpla, AH, que refleja lipo y la eantidad de enlaces quimicos fenteracciones no covalentoe que se rompen y format ya va- riacidn de entropia, AS, que describe e cambio en el grado de esorden del sistema: Willard Gibbs, 1939-1903, AG=aH-TAs betet PPP) Ridoa—Adenina mm OH FIGURA 1-25 Adenosina trfostat (ATP). La eliminacidn do fstata terminal de ATP (en rosat mediante rotura de un enlace fosfoanht- cdride as altamante exerpénica y's acopla a muchas rexcciones en- derginicas en la célula (corpo nel ejemplo de la Figura 1-26). Un proceso tionde a couirit espontincamente solo si AG esnegativa, No abstante, la funcéa celular depende prineipal- ‘mente ce moléculas tales como proteinas y dcidos nuclioas, pra las que la energin Ure de formacin es positiva: son me- nos estables y mas ordenadas que una mezcis de sus compo- nents monoméricas. Para llevar a cabo estas reacciones que require cuensia CenilergGueas), aha las aboph olsas que despreniden enetgia bre (reaeclones exergénteas), de modo que ef proceso sea globalmente exersinico: la suma de Jas varaclones de enna bre ¢8 negativa La fuerts habitus) ie energta libre en las reacciones bioligieas acopladas es la ‘ener lbeeada por la hides de enlaces fosfoarhidrio ta- Jes cono los que se encuentran en la moléenla de sdenosina trfostato (ATP; Pig. 1-25, vase tamblén Fig. 1-15). Aqui, cada (Prrepresenta un grupo fesforilo: ‘Aminoscidlos —» polimero AG; es positiva (endereénica) =—P-P——GH+ ©) AGyes negativa (exorginica) ‘Cuando estas reaeciones estén acopladas, la sumade AG) ¥ AG, es negativa (¢! proceso global es exergénico), Mediante ‘esta estrategia, la oélula puede sintetizar y mantener los poll ‘meros rieos en informacitin esenetales para la vida El acoplamiento energético conocta las reacciones biolégicas La cuestisn central dele Pfoonoryética 09 ef modo mediante et cual ia energin oerca de ta hx del metabolism de tos com Inmtibles ar aroplla a la eneraia raverida por las reacclones cslulaes, Para comprercler el acoplamient de la energie ins tructivo cansiderar un ejemplo mecsnica simple cama el mos frado en la Figura 1-260, Un objeto situndo en a pate superior ‘de un plano ineinade posee ura cierta cantidad de energia po- teal como resultado ce su elevacin. Tence a desizarse por «1 plano, perdiendo su enersia potencal al acercarse al elo, Si objeto deizante se le acopla, mediante un mecanisma te everday poles, un olyeto 1s pequen et movimento espon- tine hacia abajo det més grande puede hacer elevar al mas pequefio, reallzindoae trabajo, La eantidad ce energia trans formabe en tmbajoexia variacién en energia Bre, AG; este24 © Captulo 1 Fundamentos de blaquimica RECUADRO 1-3 BIOQUIMICA PRACTICA Entropia: las ventajas de estar desorganizado -Eltermin entropia, que litersimente significa "cambio en et interior", fue utalizado por primera vee en 1851 por Rudolf Clauss, uno de los autores que fornvulsron ts seaunda ley ‘de Ja termedtindtnie. La definicion cuantilativa riguroga dee ‘iventropia. impbea considlerariones estadisticas y probabilis- ‘leas. Mo obstante, se nude lustrar sx naturale de forma -cualittivi von tres elempies sencillas, cada uno de los cua- Jes muestra un aspecte de ly entrap. Los rasgos clave que sdeseriben faentropia son azar dessordien, que sc manilies- ‘an pn formias diversas. : ‘Caco A: La tetera y ta distribuciin olcateria el wslor Sabemon que el vapor que se genera a partir del agua en. ehulltelon puede realizar trabaje tit, Pero supongamos que apagamas el fosién debajo de una tetera Nena de agua 2 100°C (cI “sistema”) n Ls cocina (el “entarna"} y Ta deja- ios enfriar. A medida que se ena, no se produce trata, per el valor pasard de lteter al entarna, elevane la teen peratura del entomo (la cocina} en urta cantidad infinkes- malmente pequett hasta alcanzar el equillbeis completa. En este momento todas las partes de la tetera y de la eo- ina estardn exactamente a la misina temperatur, La ener ‘slalibre que en un momenta estaba concentrada en la tetera de agua caliente a 100 °C, potencialownte cupas de realie var trabajo, ha desaparecido, Su equivalenic en eneraia ca Jorica est win presente on la teicta + cucina, es decir, el “universe”, pern se ha disteibuide por completo aleatorin- mente en todo el (risioo, Beta energia yan sirve pam. rea bene trabajo poraue tia bay diferrncial de tempersinea cents de la eoeina, Ardemds, el aurmento de entropta de la cocina (elentomo) es irreversible. Sbemoe por experiencia que el calor nunes vuelve aunds espartianeamente descle ka co- cinva a Ta tetera para volver a elevar la tetnperatura del agua, 2100". ‘Caso 2: Oxidacidn de ta glucosa ‘La emitropia es un éitarlo no 36a de la eneraia sino también ‘de ln materia. Los organisms aerbions (hetenstafos) ex- hv valor seri siempre lgferamente inferior ala canta tedica de energia liberada, hablda cuenta de que una parte de la energia se disipa en forma de calor de friceiiin. Cuunta mayor sea la elevaciéin del objeto grande, mayor ser4 el cambio energética Al cesliganse hacia abajo (80) ¥ mayor sera la cantidad de (ra- bajo que precio resin iCual es el equivalence de este process en reaecianes quie Inicas? En sistemas cerrados, las reactions quimicns se pro- dicen éspontineamnente hasta que se aleanza el equilibrio, Cuando el sisters esta en equilibrio, la velocidad de farma- -odin de producto es exactammente igual ala velocitkad en que el Teacn energia libre de la whacosa ebtertida cet su entorne a través de la oxidaciéin de La glucosa com Ql, también obte- nido del entome. Less proiuctos finales de este nwetabo- listo oxidattvo, COs ¥ HaO, sam devuettos al entorno, En este proceso 41 entorno experiments un incrementor de en- Tupi, mientras que ol propin onfanisiuo permanece en e5- tao estacionasio » no experimenta ningtin cambio en sa orden interno. Aunque parte de In entrap sue do ia dist ‘pacidn de calor, la entropla también proviene de otre tipo de desorden, lustrado. por ba eeune#Gin dela osalaeién de li slacosa: CAO, +00, 80, | 61,0 ‘que podlemas representar de manera tsquemitica come Tmoldcutas 12 moléculag a 1 a * co a (ast + * ‘ hu (astlagh AK et ‘imide [Los slomos contenlidos en una molécnla de ghicosa més 8 ‘molkculas de oxtgeno, um total de 7 moléeuas, se dlspersan ids. al azar por la reacein de oxidaciéa y estén ahora pre ‘sentes en un fotal de 12 moloulas (600, + 6,0). Siempre que una teaceién quimica transeurre de modo ‘que huy Un aumento en el nimero de moléculas, o euanelo na eatancia eflida 00 sonviurie em productos Hau von Seog, que permniten ms libertad pars el movimiento mo- Teeular que un sélido, hay un incremento en. el deseden molecular y, por tanto, de encropéa, aso 3: Informacién y entropia El siguiente fragmento she Julio: César Acti IV, Escena 3, e8 ddectanao por Brita cuando se da cuenta de que se ha dle en fremar al eéreito de Marco Antanuo. Be un omeramiente no a] scar yeu en informncicin de 136 letras del alfabcto ingles. produto Se convierte en activo, Aqui na hay un eambio facto crs Contcentraciin de reactive y products ye ale un estado esfacionario, La variacidn ee enetgin que se pro \duee cuando sistema evnlnciona desile estado inicial al dle egullibte, int varianiones en Is presidin y la termperatura, nor Is uonucién, de oersia Keo, AG La rangrited de AG depend de la reaccidn quimica en particular y dé lo-Je~ jos que el sistema se encuentre inielalmenté del equilibria. Gada. uno de Jos compuestos implicados en una reaecién «gui- nica contiene nna cierta santidad de cneegia poteneial, que guarda relacion con el nomeva y el tipa de enlaces. En lasTete ste tn tue alfadrs cf cy BP) Whiet, taken at He Mood, jeucts an to fortune; Omitted, all the vorage of thede ie Fs bound in shallows ana it mise ‘Tlene muchos sigrahicacios escondidos ademas de lo que ex- Presa abjertamente, Refleja unos hechos, pero también se Ihave eco de as ideas desarrolladas en el drama sobre el cane flicto, la ambicion y las exigencins del lideraggo. Es muy rica en informacién. Pero al las 125 letras que forman esta cita se distribuye- Tan totalmente al ear, ee moda eadticn, como se muestra en el cuadro siguiente, no tendrian ning signilcado, “Asi, Ins 125 lotrao no spertarian ninguina informacion, © muy ‘Poca, pero serian muy ricas en entropia, Tides copsideracio- ‘nes confirman que la informacién es una forma de energa y se Ia ha denominmdo "entropia negative”. De hecho, la rama. de las matemdtiens denominada teria de la informacidn, que baisica para Ta owica de programacién de Jos anclenadores, ‘esta muy telacionada con la teoria termodinémica Log ora. nismos vivos son estrueturas tiny ardenacias, nol sa, in Thensamente ricas en informacién pero pabres en entiopia, ee mec ra hay nak pe, sn ‘ca leaner a ete pets ssp, {aa se ein i mec e jie amrgon. ‘Smeno, amg, Esteli, $A, Barina Sane Feacciones que ecurren esponténeamente, los productos tie ‘en menos energla Libre que las reactivas, cle manera que la r= aceidn libera uns cantiriad de energia Hbre que esti disponible ‘para realizar trabajo, Estas reacciones se denominan exengéni- eas via disminueién de energia libre de reactivos a procluctes se expresa con um valor negative. Las reaociones endersénicas requieren una apertacién de cneraia ¥ sus valores dle AG son ‘Positives, Silo una parte de Ia energia liberada en las réaccio nes biaguimicas exergonicas se mucde utilizar para produeir trabajo. En los sistemas vivos parte de la eneria se disipa en forma de calor o se plore incrementando la entropia. 1.3 Fundamentas fisicos (a) Bjempla mecinico AO SO emae re ately soo iEndergénico. th) Blemplo quimica Rewcsidn 2 aes Energi libre, Coordennda de reacedin FIGURA 1-26 Acoplamiento energética en procesos quimicos y me inicos. (3) EI movimiento descendemte de un objet tibera energia Potenclal capaz de praducie raboje mre-inive. La energia potencial Hoerada por ef mavimiemo descencienteespontines, un pieso exer nico tosa, puede acoplarse al movimiento endergénico ascentlen- te de otro objeto fazub. to) En la veaceién 1 Ia forrsicién de glucose 6 foto a pari de plucosay fosfato inorginico (Pda logar a un pro- ‘cto con una erergasupsisoe a fade las reactives. La MG es poxitiva Para esta reac endlergonica. En la reaceiGn 2, la eotura exergnica ‘de audenosina tifosisto (ATP) puede hacer posible una reacciéin ender fBonics cuando ambas estén seopladas, La teaccin exergdnica tlene ‘una varlacn de energia libre (Ga) grande y negativa, migntras que ‘Ia reacetin enderpéiica la variacin de enexgia libre (AC) es mis [pequefia y de-valor postvo. La tercera reaecin regrsenta la sama de ‘ss wacciones 1 y 2, y a variacién en su energia libre AC; ela surna ariemética de AG, y AG,. Dado que el valor de AG, cs nagativa, la re- ‘cidin ploba es exerginica y espantanea. ‘En too orguniamos vivos una reaceicn excrgéniea se puede ‘scoplar a na erdlergénica para hacer posibles clertas reaccio. ‘hes que de otro modo serian desfavorables. La Figara 1-260 ustra este principio para la conversion de glacnsa en glucosa ‘-fosfato, el primer paso de ia oxidacion de giucosa. El eamina ‘mas simple pore prodticir glucosa 6-fosfato es: Renecivin I: Glucosa +P, — gucoea 6-fosfnto (ondersiniea: AG positiva) (Pes la abrevinturs para él fosfaio inorginico HP ctibinemes ahora en detalle, sino mis adelante, Nodes- estmictura26 © Cagitulo 1 Fundamentes de bioquimica, de estos compuestos.) Esta réaccidn no ocurne espantiinéa- mente porque AG es positive, Une segunda reaccién muy exergoniee puede tener ingar en todas las oélulas; Resesim 2 ATP —+ ADP. (exergéinica; AG, es negativa) Eatas dos reacciones comparten un intermediario catuin, Py, ‘que 9e consume en Ia reacci6n | y se product en ta reaccidn 2 ‘Las dos reacciones pueden, por tanto, acoplarse en Ja forma de una terceta reaccion que se puede escribir como la suma de las reacciones 1 y 2, oritiendo el intermedtario eomtin, P, de los dos lads de ba ecuseion: Reaeciin &: Glocosn + ATP —s gineosa 6-fostato + ADP Puesto que se libera mis energia en la reaceién 2 que fa eon ‘surida en la reacciém 1, la variaciin de envergi libre en la reac- chin 3, AG), es nogativa, In que hare pacible que la sintaris de slucosa 6-fosfato transcurma a través de Ia reaccin 8, Bl acoplainiento de reacciones exergénicas con otras en- dergénicas a travis de un irtormediarie eampartide e basic para las intercamibios energéticas en los sistemas vivas. La hie drélisis del ATP (reaceién 2 en la Fig. 1-26b) es la reaccién lexergonica que proporeions la energta para la mayoria de pro- ‘cesus enderginices en las células. De hecho, el ATP es el prin- cipal tranportador de enengia quiinica ef hs céhula, Koq y AG° miden Ia tendencia de una reaccién para transcurrir esponténeamente lia tendencia de una reaccién quimica para Legar a su final puede expresarse en forma de una constante de equilfheo, Para la reseeion aA + 0B +004 aD 1a constante de equilibtio, Ky, viene dada por [Cogl*1D, nearer donde [A.,] e¢la concentracién de A, [Bq] 8 a eonsentracion de B, etc, cunrtdo el sistema ha. tlegada al equilibria, Un valor elevado de dy indica que la reaccién tiene lugar hasta ‘que los reactivos se han convertida east en preductas. Gibbs demostré que la AG de una reaccién quimica.cual- quiers es funcidn de ls vaviacién de eneraia Hbre estdn- dar, AG* Cuna constante earacterieticn de cada reaccién specifica) y de un tértina que express la concentracién ini- lal de renetivos y productos: +arig OMD AG = a" + RT In Te a) donde {es eoncentracidn inicia de Ay as sucesivamet, era constante de los gator y Teas temperium abssiuta, ‘Cuando una reacclén ha aleanzado el equllbrio no ner sible ninguna fern que lt induzea aren una crecctin w otra y no puede realizar trabajo: AG = 0. En esta situackin eon: (tela, [A = ch ¢t6, para todos fos reactivos y productos, y {CFD _ [CaghDagl* __ TAPE” TASB? Sustituyendo AG por 0 y {C,/D\ MATE)" por Keg eit la Bua ion 1-1, obtenemas la relacicn AG? = -RTIn Rog die la ue dediicinias qnie AG es tan sSlovma manera alterna {HWA Ky para expresar Ia cireceién de una reaecion, Gracias a poder medir K., experimentalmente disponemos de un modo dé determinar AG", la constante termodindmica caracte- ‘istiea de cada reaecin, AG" y AG se expresun amibas en joules par mot (0 calorias ‘por mel), Cuando Kay >> 1, AG" es grande -y negativa; cuando ‘Rug S< 1,46" es grande y positiva. Es posible deducir eon wn simple vistazo a una tabla de valores de X..,0 de AG” cuales son las reaeciones que tenderdn a praducirse y cuales no. Hay que decir que las constantes termod indmicas eoma AG? muestran dénde se halla el punto de equitibrio final de la ‘Teacclén, pero nada nos dicen acerca de la velocidad con que se alcanza (wéase Capitulo 8). Los enzimas facilitan las secuencias de reacciones quimicas ‘Todas las macromoldeulas bioldgieas son mucho muds inesta- ‘bes termodindenicamente que sus suburidacles monoméricas, aunque sean, 10 obstante, estables cindticamente: 9a degra sdaci6n eo eatatiaatda-ocurre tan lentamente que, en la eseala de tempo aplicable a los arganismns, estas moléculas son es ‘bles. i préeticamente todas las reacciones animes een yes tienen lugar a una velocidad significativa ee gracias a a smresenicia de enralmas ~biacatalizadores que provoran un grat ‘ncremento en la velocidad de reseciones quimicas especificas sin constmirse en el proceso. {Ea trayectoria de una reaccién entre reactivo(s) v produe~ to¢s) transcumre de manera practicamente invariable através de una barrera eneriética, denominada barrera de aetivaeién, {Fig 1-27), que debe ser superada para que tenga lugar la re- accion, Larotura y formackin de enlaces implica generalmente _¥ de manera previa la distorsiGn de los enlaces existentes, lo que enera un estado de transicién de mayor enezia libre que reactives © productos. El punto mas alto en un diagram de coordenarlas de react representa el estado ce transieién. ya dlferencia de energéa entre un reactive en su estado fun- ‘Gamental y en stestado de transicion se denomina eneraia de activacién, AG*, Les erimas eataliran teaceinnes pro Poreionando un entorno rss confortable para el estado de transicidn: una auperticle complementaria a su. estereoqul ‘mica, polatidad o carga. La unién dle un erima.al estado de transicién es exergénica ¥ la enerdialiberada por esa unin re- ‘duoe la energia de activacitin de la reaccién, incrementanda de modo muy importante su vebordad. Una contribucién adjicional ala catdlinis eure sande dos omds reactivos se unen 2 a superficie dll erzima en sitios ‘certanosy en una orientaciéin estereoapecifica que favorece Ia reaccidn. Gracias esta disposiesin se inererents envarios psc. p—+ p— F Troon ina, Tolaustas ‘Si una célula empieza a produeir mis isoleucine de ka necesa- i para la sintesis protejcs, I islewtina no uliizada ye wc mula este incremento en la concemtracién inhibe la actividad ¢alalitica del primer ensima de la rata, con lo que se frena ine ‘mediataments ta praduceién detgoleucina. Rata retreinkibi- cn manticnc e! equilibrio entre produccion y utilzacian de aida imermedtiario metabioo, A posar de que el coneapto de ruta disereta es it para la organizacidn y la comprensiin de] metabolisinn, constituye luna simpliieacisn. En Is céiuba existen tiles de intermesiarios metablicos, muchos de los cuales forman parte de mis de na ria. El metabolismo estaria mejor representado por una ved de mitas interconcciadas e interdepensientes. La variacién fen la eoncentracion de eualquier metaballto afectaria a otras ‘rulas, dando inicio a un efecto en cadena que inflirta en el fNujo de materiales a través de otros sectores de la economia del o@hula, La comprensién de estas camplejas interneetones entre intermedtiaeias y rutas en términos cuanttatives es una lurea ingente, pero hoy existon nuevas aproxtmiaciones expe- ‘imentales (véase Capitulo 15) que han empezado a nfrecer ‘uevos puntos de vista sobee In regulaeién. del evetabolist, {Las oélulas regulan también la sintesis de sus propios ca- tallandores, los enzimas, en respuesta a In variacisn en las ne ccesidadles cle un producto metabdilen (véase Capito 28). La expresiéin de los genes (la traduecién de la informacidin del DNA en proveinas celulares activas) y la sintesis de Ins enc ‘mus son otros niveles de control metabo. Todos eltos deben, ‘nclwirse al describir el control global cel metabolism, Offecer ‘una vision completa del moda en que la célula regula su aetivt- dud es una farea ingente que-no ha echo ms que empezar, RESUMEN 1.3 Fundamentos fisicos fm Las celulns vivus gan sisters whlertos que intercambian materia y ener con su entoeno, fextrayendo y eanalizando energia pora manteneese ce un estaro estacionario dindmicn distant del cequilibrio, La energia se obtiene de la lz solar de Jos combustibles, convirtianda la enargia de tun flyjo electrdnica en energia de los enlaces ‘quimsicos ded ATP, w Latendeneta ce una reaccion quimica para Hegar at equilib puede expresarse como la variactin en su ‘energia Uhre, 4G, que thene dos componente: variaciin de entalpia, Ay variaciin de entropia, AS. ‘Betas variables 2 relaeiottan entre ellis prot la cccuncion AG = AW Tas, 1 Cunndo la AG de una reaoriin es megativa, la reaceisin es excrgénica y tionde a legara.su fy, euinde AG es positiva, la reaccidn es endergénica y tlende aavancar en ln direeein opvesta, Cuando dos reaeciones se ‘suman pars dar lugar a una tercera reaeei6n, la 8G de lareaccin global es la sura de bas AG ee Jas ‘reaceicnos individuaies. De esta forma se produce elacaplamienta de reacciones, & Laconversign de ATP en P, ¥ ADP. altamenite exerginica (AG newativa y ce valor elevado) ‘muchas reacciones celulares endergénicas son posibles gracias al acoplamiento a asta resccsin, através de intermedaries comumes. La variacidn de energia libre estdndlat ce uit reaceisn, AG", es una canstante fsica retacionaa ‘con la constante de equiibrio mediante la ecuacii 4 Lamayor parte de ls reareéones colulares tiene higar ‘velocidad ites ongue eninbe esanuas qu hs ccataligan, Loe ervitnas aetitan er parte estabilieand elestado de transiciin, reduciendo la energia de activaciin, AG*,¢ incrementarude In velocidad de reacelin en muchos érdenes de magni, Lat actividad cataltioa de hes enmimmas en las coluls ests regula. ‘© El metabolismo es la suma de muchas secuencias de ‘esdelanes inleanectaddas en las que se intercomvier- ten metabolites cehulares. Cada secuencla esta regulada de manera que produces lo que ta e¢ult necesita.en cada momento y consuma sélo Ia energia necesarin, 1.4 Fundamentos genéticos ‘Posiblementa, la propieda mis notable de las eélulas y ong ‘nisms vivos es su eapacidad para reproducirse con Nidetidact Porfecta a lo largo de incantables generaciomes. Hata con ‘Unidad de raggos veredacos amples que Jo large de millones de afos, la estructura de las moiéculas que contienen la infor: :maeitin genotica ha debido permanecer constante. Muy pcs ‘huellas histGricas de la clvilizacion (FR. 1-291) han lagraclo so. ‘brevirir un mullar desing. Pero existen pruebas ennvancentes do que Jas instrucciones gendtieas de low organisms vives han permuanecida practicarnente inalteradas durante periecios "mucho ms largos; muchas tacterias tienen aprosimadarvente ‘el mismo tamana, forma y estmmetura interna, ¥ eontienen al@™ FIGURA 1-28 Dos escrituras antiguas. (2 [ prisms de Sonsquily srabado aproximadamente en 700 a, C. describe alguns bach ise ‘rico aeaecids durante el reinad del rey Senacuerby en caracteres ‘de to lengua asa, El risa contiene aproximadiamente 20.000 ca ‘aciores, pesa 50 hg y ha sebrevivido prictcamente ineicto durante 2204 anos. (b) La molecula unica oe DNA de ta thera Ecol, a ‘ensals durant a proces de iad hac ol estetior dela chal sada, es centenotes de-veces mnis larga que la célula misma y ‘ecrvions covfifeada tds Is inoomacin ncisania para expeciicar Ia ‘esructra y las fanciones de la esula,£} DNA bacwsiano contiene ipraximaclamente 10 millones de caraciers (nuclides), esa me pos de 10°! so ha suid cambios menones curate he altima millones de afos. (Los punts arsiillosy ls manchas oscuras-de la ‘icrogatla electronica colorizada som aneactos ef prepara cin tise tipo de:moléculas precursoras y eradimas, que las ae vi ‘ono hace cuntre mil mullanes de afos, Bi descubrinniento de la naturaleza quisnica y la estructura {wislimensional cel aberial genética, el eke desaxirribo- nucleico » DNA, se cuenta entre los hitos fundamentales de | biologin del siglo xx. La secuencia de sus suburudades mo- haméricas los nucledtides (o mis exactamente, los desoxiani- Donucledtidos) de este polimero lineal, Neva codifieadas las insimicciones para formar todos kes demvis componentes celu- lres y acta ademas como molde para la produccién de mole ‘elas ikénticas de DNA que seran distetbuldas ala progenie at ‘lvirse la cohula, La continuidad en la existencia de una es: pevie binlogien exige que su infarmacicn genética oe ratensn testable, se exprese correctamente en forma de productes gé= nicos y se reproduzca eon un minimo de errores. La corree> eiGn y efectividad én ef almacenamiento, la expresion y la roproduccién del mensaje genstion define a las especies, Its ddistrye de las demas y asezura su continusdad, La continuidad genética reside en las motéculas de DNA EL DNA.es un poliinern orginico largo ¥ delgada que tiene In ara propiedad de estar canstruldaa eseals mien ervuna dle rmensién Canchura) y a escala fumana en la otra Consitud), ‘Un espermatozoide © un évwlo humanos, que trasssportan Ii {incormacién hereditaria acumulada a lo laxga de miles de mi- 14 Fundamentos genétiess = 29 ones de afns de evolucién, transmicen esta Nerencia en forma de moltculas sde DNA en las que et mensaje genética 8th codificado en fa secueneia lineal de las subunidades de ido tnidas cowalontemente Cuando hablamos de ls nropiedaddes dé una especie: aut mica lems describi el comportaiento meio desun trseeo uy trande de molecu centicas, La predioeion del compar. tamient ee una moléeula individual en una cantidad de, por fJemplo, un pienmoldeum compuesto (en toeno 2 6 3 10!" mo. ules) resulta dif, nero es mis sencilla predecir el compar- tamiienio meria de las molgculas gracias al gran raimero de las que &s posbie analizar al mismo tierypa, En este aspect, eLDNA celular ¢s una excepciin notable. ELDNA se una oetula kde E.coli es una tiiiea motécula que contiene 4.04 millones de panes de nuciesticos y constituytndo su material gentico, Esta moltculatinioa debe repliearse perfectamente en todos susdetalles para que & coli genere una progenie ikémtiea me. liane In divisiGn celular; en este caso no-es, por tanto, posible beta fi un cormportarrienio melo, o estadistien. Le mismo ‘curr en tonas Bas cers céilas. Un espermacezoicle human porta al Gvulo que:Eeund una soln malécuia de DNA en ada tune de tos 23 eromosorias diferentes, que teu e2m usa sola molécala de DNA en eacta uno ce ls eromoscamas corres pomientes del Gvulo. ELresuliads de esta unin es ficlimente Dpredecibie- an embridn que contin ls totaad de sus 35.000 ene, forma por 3 mil millones ve pares de nuclestidas, ei act je sain quite increible La estructura de! DNA hace posible su replicacién yTeparacién con fidelidad casi perfecta ‘La capsid ie fas eens vivas de preservae su material gené- {eo y shuplicario para su transmision ala generacicin siguiente 9 el resullado de a complernentariedad estructural entre las ‘dos mitsales de la maléeula de DNA (Fig. 1-90), La unidad bé- sica del DNA es un polimero lineal forma por eustro suburi- darles monoméricas diferentes, or desoxirribonuclestides, ‘ordenaclos cn una seeuencia fined preest Er esta seeuencin I neal se encuenia codificaca la informacion genética. Dos le es- tas cailenas poliméricat se ervollan una sdbre la otra. para formar la doble helice dle DNA, en aque carla xubumnida rn0- rérica de una cadena queda espeeiicarente apareada cor uma Subunidad complementaria de la cadena opuesta, Antes de po- cdueirse la divikin celular, las cos eaclerus de DNA se separan y stan core mio putt le esis de otra cavlena coneplernen {aria nueva, eon lo que se generan dos moitctulas de deble he lice idéniticas, una para carla edtuls tj. St uma caslena resultase sdafaca, Ja continuidad de la informacién queda asegueada por informacion presente en la cadena complene:taria, que ac ‘tar come molds para la reparieisa cle a eski La secuencia lineal del DNA codifica proteinas con estructuras tridimensionales ‘Lainformacisn e2% eoificada en el DNA en su secsesca lineal {monodimensional) de unidades cesoxirrbonucleotidicns, pero Jnexpresidn de esta inforracién ta como resultavlo una oéia, (eidimensional La transicion entre una.y tree dimeruiones ocu-30 Capitulo Fundamentas de bioquimies Cadena T Cadena? — Cadena 1 Cadena 2 viga nueva nueva igia ‘IGURA 1-30 Complementariedsd ent ls dos caemas del DNA. FDA oun pimero eal da esto cubes, ae desonerbo- sueleitides deioxiaderilito (A, desasguaniato (G3, desonctlaro {© y devoxtimidiato (1, unidos coxatentamente. Cad uno de os rucletdos, gracias a su precisa exructura trdimersiaal, pose la ‘apacidad ininseca de asoeiase muy sxpeciicamente, porena de mado cavalerie, con ot de es muclckcos: Ase asc sep con 5 complementario Ty G siempre con C, En la mola de DNA de: Aloble cadena, la secarncia completa de racedtdos de una hat es comple tare le secur cela oa hebra. Las dos cadena del DNA, unidos por machos puentes de hitgenn nse vetcales at Jes) ent los pare de nutes complerentaio, se eovllan uns sob lt ora para form la dale hace dl DNA. a repicacion sel DNA, las dos cadena se separan ys sntetzan dos cadena as cada una con una secuenea complementaria ala de una de las cadens originales. El esullado son dos moliculas ca DNA en doble halice, cada ws ce lls idica al DNA orignal rre en das fases. Una secuencia lineal de desoxcintbamaclestdas del DNA codifica (a través de un intermedtario, el RNA) la pro- dueeion de una protein con otra secaencia lineal, en este caso sce amumoaciaos (rig. 8). La proteins se pega adoptardo una estructura tridimensional particular, detenminada por su secueneia de aminadcitos y estabiizada principalmente por intetacciones no eovalentes. Aunque forma final de a prote- 1a plegada viene dictada por su secuencia de aminodcidos, el proceso de pleganento rece I asistencia de “chaperonias mo: ecules", «jue caalizan ol proceso impiiendo vias incorrectas de plegamiento. La adopeidn de una eotructuratedimensiral precisa, 0 conformacién nativa, es crucial para la funesan de Ja proteina Una vesla proteina ha adoptando su eanformacitn nativa, puede asociarse de mado no covalente con otras proveinas, © bien con dias nucleiooso lisds, para formar complejos su pramoleculares como crortasomas, ribosomas y membranas, Gen 1 Gen2 Gon 3 = ez = & =<. z = =z =z 1 ae — aa xe za == == ‘Transeripcin de la secuencin de DNA enuna seeuencis de RNA oe % ‘Traduccién (en el ribosoma) de la seeuencia de RNA a seenencia de protefna y plogamionta de la proteins para adoptar su eonformacién naira SS @ & Proteina 1 Proteina 2 Proteina & sf Pormacion do un cursplejo supramolecular FIGURA 1-31 Del DNA al RNA ya las proteinas, Las secuencias ti neales de desaxiribonueledtidos enol DNA, dstbuidas en genes, 52 transcetben en moléculas de Sido ribonucleico (RNA) cuyas secuen- ‘clas de boaucledtidos le son complementariag, Las secuencias de RRNA se traducen en cadenas incales de pratoina, que se pliegan para _adoptar sus canformacionestidientionales mativas, «menudo can la ayuda de las chaperonas moleculares. Las proteinas ee asocian a "veees con atta proteinas para formar complejes supramolecular, ‘estabilizaios por interacciones dbs.Cada molécula de estos compleos posee sitios de union es- peciices y de aka afiniciad para i demés y puede formar es- ontneamente compicjos fincionates en el medi celular. ‘Apesarde que las secutncias proteicas contienven toda ka Inforrnacién nacesarin para el plegamiento-en el estado native, esto plegamiento solo puede productrse en el entomo ade- Ccundo, £1 automontaje reqmere, pues, una mtormacion co- recta (proporcida por la sectiehcin del DNA) ¥ in ettorno adecuada (el interior celular, porto que la seeuencia tle DNA no es capaz por af ola de dictar la Formacidin de una eélula. Como sijo Rudolph Vinehowy, el patélogo e lnvestigador pei- siano del siglo ax, “Omnis celiulae celhula tox céhula pro- viene de otra cia, RESUMEN 1.4 Fundamentos genéticos 1 La informacién genética esta eodificada en ia seeuen- cla Lineal de cuatsn desoxirsibomucledticos en el DNA, = La moléeula de DNA en coble héiew contiene un ‘olde interno que permite su propia replicacién y reparacién, ww La sectiencia lineal de amiaodeides de una peoteina, ‘codffends en el DNA del gen de esa proteina, da lugar ‘2 una estructura tridimensional proteiea que es ‘exclusiva para esa protefna. © Ciertas macromaléeula individuales eon aftdad ‘specifica pars con otras macromoléculas Forman ‘completos supeamoleeilares. 1.5 Fundamentos evolutives 31 1.5 Fundamentos evolutivos Nada tiene sentido en bialogia sino es ala luz dela evolucion Theodosius Dobzhanshy, The American Biology Teaches, ‘mare 1973 [Los grandes progresns de la bioquitnicay la biologia molecular desde que Dobehansky hizo esta cnntundemte generalizacidn ‘han contirmado su valida, Balto sire de similitud entre Eas Vias metabolleas y las secwencias génieas de organismos de to- dos las phyla es un robusta argumento a favor de la hipstesis: de que todos ls erganismos modems eqmparten un prose ‘or evohutive comin y eenvaron a partir de ela traves de una larga serie de penmieiios cambios (mulaciones) que conferian, fen cada caso, una ventaja seleetiva s un organisina dado env un richo ecaliico concreto. Los cambios en las instrucciones hereditarias hacen posible la evolucién ‘A pesar de a Nidetidadt casi perfecta de Ia replieaeién gers, ciertas ecrores may poco frecuentes que no han sido repara- dos durante In replicarién del DNA producen varlsclotves en Is ssceuencia nucleoticica del DNA, dando lugar una mutaciém (Pig, 1-22) que cambia las instrucciones para alguno de los ‘componentes celulares, Una reparaeton incorrecta de ana le- sidn en una de las carlenas de DNA tiene el mismo efecto, Las ‘mutaeiones en el DNA que se tranamite a los descendienites |IGURA 1-32. Papel de las mutaciones en Inevolucia, La aeurnulaciin gradual de _mutaciones 2 lo largo de un periods prolongado de tiempo da como resultado "pues especies biogas, cary um de sll con una sacuencia de DNA Gnica, Ia parte superior se rcs un seyrmente coro de un gen dew hipottico organism progenitor Coa el paso del tiempo, los ‘cambios en la seowencia muclectdica (routciones,inieadas pw eajat coloreadis), que afectan aan sal uci en cada ocrsin, goneran una "progeniescon secuecias de DNA diferentes, {ata progenie mustante también ste ‘mutacionesocasionalmentey da lugar unos descendientes que tian une «mi nucleic dlerenies en relacin con la secuancis progenitors, Use ata capacie aparece cuando dos linea han dived tanto en su acerva gendtica qua yan pueden aporearse. ate32 Capitulo Fundamentes de bioquimies truccen ser dafinas 0 incluso Ietales para el organism; pue~ den, por ejemplo, provocar lasintesis de un enaima defects incapaz de catalizar una reacciin metabolica esencial Sn em- batgo, una mutacin da lugar ocasionalmente a un organisma ‘mejor preparaio para sobrevivir en su entorno natural. Bl en- ‘ima mtante podria, en este caso, aber adquirido una. espe-

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