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Tecnologa mdica
Asignatura:
-
Mtodos de anlisis en
bioqumica
Integrantes:
-
Mara Aguilar
Ignacio Candia
Felipe Castillo
Marcela Castro
Vanesa Michaga
Docente:
-
TM Nilo Carvajal
Introduccin
Las enzimas son protenas de alto peso molecular con propiedades capaces
de cumplir funciones catalizadoras con el objetivo de acelerar reacciones en
el metabolismo del ser vivo. Son altamente especficas dado que poseen un
centro activo con los componentes responsables para cada catlisis. Por
esto, es fundamental estudiar el comportamiento de las enzimas a nivel del
organismo con el objetivo de comprender como este trabaja.
La cintica enzimtica es el mtodo ms antiguo para estudiar mecanismos
de reaccin enzimticos y consiste en la determinacin de la velocidad de la
reaccin y el modo en que sta cambia en respuesta a cambios en los
parmetros experimentales (Lehninger, 1223). Para que una reaccin se
lleve a cabo, se debe contar con sustrato, la enzima, un cofactor y la
formacin de producto.
Michaelis y Menten propusieron un modelo simple para explicar la mayora
de las reacciones catalizadas por enzimas. En este modelo la enzima se
combina reversiblemente con su sustrato para formar el complejo enzimasustrato (ES) que subsecuentemente se rompe para formar el producto,
hecho que regenera a la enzima.
Procedimiento
Para el estudio cintico (laboratorio n6)
1. Se preparan un tubo de volumen final 10 mL con los siguientes
componentes.
Enzima B-galactosidasa
Buffer fosfato 0.06 M, pH 7,4
Agua
2. Se prepara ONPG y una solucin blanco (sin sustrato) para uso
posterior.
3. Se pre incuba el tubo a 37C por 5 minutos.
4. Se prepara un set de 8 tubos con carbonato de sodio 0.2 M en
volumen final 2.5 ml, completando con agua destilada.
5. Se adiciona ONPG al tubo preincubado e inmediatamente se extraen
0.8 ml de este hacia el primer tubo del set con carbonato de sodio.
6. Luego de un minuto se adiciono 0.8 ml del incubado al siguiente tubo
del set hasta completar los 8 tubos.
7. Finalmente se midi la absorbancia el set de tubos a 405 nm.
Para la influencia del pH 8,5(laboratorio n7 parte 1)
1. Se preparan un tubo de volumen final 10 mL con los siguientes
componentes.
Enzima B-galactosidasa
Buffer fosfato 0.06 M, pH 8,5
Agua
2. Se prepara una solucin blanco (sin sustrato) y una solucin de ONPG
para uso posterior.
3. Se pre incuba el tubo a 37C por 5 minutos.
4. Se prepara un set de 8 tubos con carbonato de sodio 0.2 M en
volumen final 2.5 ml, completando con agua destilada.
5. Se adiciona ONPG 10 mM al tubo preincubado e inmediatamente se
extraen 0.8 ml de este hacia el primer tubo del set con carbonato de
sodio.
6. Luego de un minuto se adiciono 0.8 ml del incubado al siguiente tubo
del set hasta completar los 8 tubos.
7. Finalmente se midi la absorbancia el set de tubos a 405 nm.
Para la influencia de temperatura 56C (laboratorio n7- parte 2)
1. Se preparan un tubo de volumen final 10 mL con los siguientes
componentes.
Enzima B-galactosidasa
Buffer fosfato 0.06 M, pH 7,4
Agua
2. Se prepara ONPG y una solucin blanco (sin sustrato) para uso
posterior.
3. Se pre incuba el tubo a 56C por 5 minutos.
4. Se prepara un set de 8 tubos con carbonato de sodio 0.2 M en
volumen final 2.5 ml, completando con agua destilada.
5. Se adiciona ONPG al tubo preincubado e inmediatamente se extraen
0.8 ml de este hacia el primer tubo del set con carbonato de sodio.
6. Luego de un minuto se adiciono 0.8 ml del incubado al siguiente tubo
del set hasta completar los 8 tubos.
7. Finalmente se midi la absorbancia el set de tubos a 405 nm.
Resultados
LABORATORIO 6
anti log
[A]
[A] + [B] =
0,06 M
[A] + 3,8018[A]=0,06
[A] (1 + 3,8018) = 0,06 M
0,0124 M
[A] = 0,06 M
[A] =
4,8018
[B] + 0,0124 M = 0,06 M
0,0476 M
[A] NaH2PO4
156,01
Mol
0,0124 M =
[B]=
X= 0,9672 gr
[B] Na2HPO4
141,96
Mol
0,0476 M =
X= 3,3786 gr
R// Para preparar un Buffer Fosfato de Sodio 0,06 M a pH 7,4 se necesitan
0,9672 gr de NaH2PO4 y 3,3786 gr de Na2HPO4 para luego ser aforado hasta
los 500 mL con agua destilada.
1 mol
= 0.0025 mol
X
1000 mM
10 mM
0,01 M =
X
0,25 L
0,753 gr
0,2 M =
X
0,25 L
7 Tubos
Blanco
Solucin
madre
Tubos
1
2
3
4
5
6
7
Carbona
to de
sodio
(ml)
1
2
x
Agua
destilada
(ml)
Sustrat
o ONPG
(ml)
0,7
1
2
x
x
4
Enzima
galactosidasa
(L)
X
x
80
Buffer
(pH
7,4)
(ml)
x
2
4
Absorbancia
(415 nm)
1,9954
0
0
0
0
0
0
NOTA:
POR NO PRESENTAR ABSORBANCIAS EN LA MAYORIA LOS TUBOS,
DECIDIMOS CAMBIAR LAS PROPORCIONES DE ESTOS.
Tabla 2 (REPITICION DEL EXPERIMENTO)
8 Tubos
Tubos
Blanco
Solucin
madre
1
2
3
4
5
6
7
8
Carbona
Agua
to de
destilada
sodio
(ml)
(ml)
0,5
3,5
Solucin
madre
0,5
5
(ml) 5
x
(INCUBADO a 37
C)
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
Sustrat
o ONPG
(ml)
Enzima
galactosidasa
(L)
x
x
Absorbancia
x
10
(415 nm)
1,2
10
0,4558
0,8884
0,8566
1,0459
0,8868
0,8463
0,8331
0,8494
Buffer
(pH 7)
(ml)
X
3,8
3,8
Graficas
0.02
0.02
Absorbancia 0.01
0.01
0
0
0.01
0.01
0.02
0.02
0.03
0.03
Concentracin ONP / mM
Tubos
1
2
3
4
Cal. Concentracin
Con ecuacin punto
pendiente
0,4558= 0,9403x
0,8884= 0,9403x
0,8566= 0,9403x
1,0459= 0,9403x
Concentracin
mM
0,4847
0,9448
0,9109
1,1123
5
6
7
8
0,8868=
0,8463=
0,8331=
0,8494=
0,9403x
0,9403x
0,9403x
0,9403x
0,9431
0,9000
0,8859
0,9033
f(x) = 0.16x
R = 0.83
1
0.8
Concentracin (uM) 0.6
0.4
0.2
0
0
Tiempo (minutos)
anti log
[A]
[A] + [B] =
0,06 M
[A] + 47,86[A]=0,06
[A] (1 + 47,86) = 0,06 M
1,2279 x 10-3 M
[A] = 0,06 M
[A] =
48,86
[B] + 1,2279 x 10-3 M= 0,06 M
[B]= 0,0587 M
[A] NaH2PO4
= 1,2279 x 10-3 M =
156,01 g
Mol
156,01 g/mol
0,25 L
X= 0,0478 gr
[B] Na2HPO4
141,96
0,0587 M =
Mol
X= 2,0832 gr
R// Para preparar un Buffer Fosfato de Sodio 0,06 M a pH 8,5 se necesitan
0,0478 gr de NaH2PO4 y 2,0832 gr de Na2HPO4 para luego ser aforado hasta
los 250 mL con agua destilada.
Tabla 3
8 Tubos
Blanco
Solucin
madre
Tubos
1
2
3
4
5
6
7
8
Graficas
Carbona
to de
sodio
(ml)
0,5
0,5
x
Agua
destilada
(ml)
Sustrat
o ONPG
(ml)
3,5
5
5
x
x
1,2
Enzima
galactosidasa
(L)
x
10
10
Absorbancia
(415 nm)
0,1740
0,3885
0,6121
0,7852
0,8824
0,2999
0,9056
0,8988
Buffer
(pH
8,5)
(ml)
X
3,8
3,8
0.02
0.02
Absorbancia 0.01
0.01
0
0
0.01
0.01
0.02
0.02
0.03
0.03
Concentracin ONP/ mM
Tubos
1
2
3
4
5
6
7
8
Formula
0,1740=0,9403x
0,3885=0,9403x
0,6121=0,9403x
0,7852=0,9403x
0,8824=0,9403x
0,2999=0,9403x
0,9056=0,9403x
0,8988=0,9403x
Concentracin/ mM
0,1850
0,4131
0,6509
0,8350
0,9384
0,3189
0,9630
0,9558
f(x) = 0.13x
0.8
Concentracin (uM) 0.6
0.4
0.2
0
0
Tiempo (minutos)
Tabla 4
8 Tubos
Blanco
Solucin
Tubos
madre
1
2
3
4
5
6
7
8
Carbona
Agua
to de
destilada
sodio
(ml)
(ml)
0,5
3,5
0,5
5
xSolucin madre
5 (ml)
(INCUBADO 56 C)
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
0,8
Sustrat
o ONPG
(ml)
Enzima
galactosidasa
(L)
x
x
x
10
1,2
10
Absorbancia
(415 nm)
0,0043
0,0026
0,0034
0,0028
0,0030
0,0021
0,0003
0,0001
Graficas
0.02
0.02
Absorbancia 0.01
0.01
0
0
0.01
0.01
0.02
0.02
0.03
0.03
Concentracin / mM
Tubos
1
2
3
4
5
6
7
8
Formula
0,0043=0,9403x
0,0026=0,9403x
0,0034=0,9403x
0,0028=0,9403x
0,0030=0,9403x
0,0021=0,9403x
0,0003=0,9403x
0,0001=0,9403x
Concentracin mM
4,5730 x 10-3
2,7650 x 10-3
3,615 x 10-3
2,977 x 10-3
3,1904 x 10-3
2,2333 x 10-3
3,1904 x 10-4
1,0634 x 10-4
Buffer
(pH
7,4)
(ml)
X
3,8
3,8
f(x) = 0x
0
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Tiempo (minutos)
Discusin
En el laboratorio n6 se analiz la curva de progreso de la hidrolisis de ONPG
por la accin de la enzima B-galactosidasa (37C y PH 7.4), llegando al
resultado de que al transcurrir 4 minutos se alcanza la mxima actividad
cataltica de esta, habiendo utilizado 0.01 mg de enzima. Cabe recalcar que
las concentraciones de ONP fueron calculadas utilizando la curva de
calibracin a 405 nm en la experiencia prctica n3 de Laboratorio. Se
aprecia una curva hiperblica, la cual llegado el mximo punto de
concentracin desciende y comienza a tomar la forma de una constante
(Punto que indica la velocidad mxima). Esto puede deberse a razones
como: La creciente densidad de producto puede inhibir la actividad de la
enzima, el grado de saturacin de la enzima con sustrato disminuye por el
agotamiento del mismo a medida que progresa la reaccin o la reaccin
inversa se hace ms importante al aumentar la concentracin del producto.
En el laboratorio n7 se pone a prueba la actividad catalizadora de la
enzima frente a cambios de temperatura y grado de acidez. Utilizando un
pH de 8.5 se observa una curva de progreso regular, hiperblica,
alcanzando una actividad cataltica mxima a los 7 minutos. Puede
observarse que al minuto 6, la concentracin disminuye considerablemente,
esto se considera un error analtico que puede haber sido provocado por
haber agregado de manera inadecuada la alcuota de 0.8 ml al tubo n6 o
fuera del tiempo correspondiente. Sin embargo, analizando la curva puede
observarse un avance de la reaccin ms estable que a pH=7.4 retardando
el decaimiento de la actividad enzimtica, lo cual puede ser til para
prximas actividades prcticas en donde se requiera un tiempo de accin
mayor a 4 minutos. Esto puede deberse a que a pH 8.5 la enzima posee (por
arreglo espacial de grupos ionizados de la protena) un sitio activo distinto al
que contiene a pH 7.4, generando un lapso de tiempo entre uno y otra
molcula de sustrato, retardando la saturacin por sustrato o producto,
Anexo
N1)
N2)
N3)