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GENTICA

EVOLUTIVA

Gentica Evolutiva

Teoria da criao especial ou teoria fixista espcies


criadas independente e recentemente, e no mudam com o
passar do tempo

XIX - Teoria de Darwin da evoluo por seleo natural,


tambm conhecida como teoria da descendncia com
modificaes as espcies mudaram e continuam mudando
ao longo do tempo, descendncia de um ancestral comum
-

1838, viagem de cinco anos navio Beagle: geologia,


zoologia e botnica

Thomas Robert Malthus luta pela sobrevivncia

Evoluo dos seres vivos (mudana e adaptao) se d


principalmente pela ao da seleo natural sobre
variantes hereditrias (The Origin of Species 1859)

Gentica Evolutiva

XIX - Teoria de Darwin da evoluo por seleo natural,


tambm conhecida como teoria da descendncia com
modificaes as espcies mudaram e continuam mudando
ao longo do tempo, descendncia de um ancestral comum
-

nas populaes, os indivduos so variveis (variao gentica);

as variaes entre os indivduos so transmitidas, pelo menos


parcialmente, dos genitores para a prole;

em cada gerao, alguns indivduos so mais bem-sucedidos do


que outros na sobrevivncia e na reproduo;

a sobrevivncia e a reproduo no so aleatrias, esto ligadas


s variaes individuais indivduos com variaes mais
favorveis em sobrevivncia e reproduo so selecionados
naturalmente.

Gentica Evolutiva

Evoluo mudana (as espcies no so fixas; extino)

Teoria de Darwin da evoluo por seleo natural - falha


importante: no explicou a origem da variao entre os
indivduos e como as variantes eram herdadas

1900 - Redescoberta dos trabalhos de Mendel: as


caractersticas so determinadas por genes, que se
segregam em alelos diferentes, e os genes so transmitidos
para a prole em gametas produzidos por seus genitores; e
gentica de populaes (Wright, Fisher e Haldane)

1930 - Nascimento da Gentica Evolutiva, e tornou-se


a fundao da teoria darwiniana
Neodarwinismo ou teoria sinttica da evoluo

Gentica Evolutiva

Borges-Osrio, MR. Gentica Humana. 3 ed. Artmed, 2013

Processo evolutivo duas etapas:

1. variao gentica (mutao);


2. o aumento e a diminuio na frequncia de
variantes genticas (fatores evolutivos)

Gentica Evolutiva

Variao gentica em populaes


naturais (populaes polimrficas)

variao em Fentipos

populaes naturais exibem variao


morfolgica que devido a diferenas
genticas ou polimorfismos genticos

Gentica Evolutiva

Variao gentica em populaes


naturais (populaes polimrficas)

variao em Fentipos
Variao na estrutura dos cromossomos

Arranjos diferentes dos padres de bandamento: inverses

Gentica Evolutiva

Variao gentica em populaes


naturais (populaes polimrficas)

variao em Fentipos
Variao na estrutura dos cromossomos
Variao na estrutura de protenas (grupo sanguneo
ABO, Rh, MN; enzimas de metabolizao; HLA)

Eletroforese de
protenas em gel (separa
macromolculas com base
em tamanho e carga)

homozigotos
heterozigotos

Gentica Evolutiva

Variao gentica em populaes


naturais (populaes polimrficas)

variao em Fentipos
Variao na estrutura dos cromossomos
Variao na estrutura de protenas
Variao em Sequncias de Nucleotdeos (molecular)

- RFLPs
- VNTRs e STRs (indels)
- SNPs

1 a cada 1000 pb

PCR; enzimas de restrio, eletroforese em gel; Southern

Gentica Evolutiva

Herana co-dominante de um polimorfismo


de DNA autossmico causado por um
nmero varivel de repeties em tandem

Anlise de gmeos por meio de sondas


para VNTR em vrios loci (fingerprinting)

Gentica Evolutiva
Polimorfismo:

A ocorrncia conjunta em uma populao de dois ou mais gentipos


alternativos, cada um em uma frequncia maior do que aquela que
poderia ser mantida somente por mutao recorrente (frequncia
mnima de 1% da populao para o alelo polimrfico, 0,01, e o
heterozigoto pelo menos 0,02)

Marcadores genticos:
So caractersticas genticas que, pelo seu padro simples de herana,
fentipos

facilmente identificveis, frequncias relativamente altas de

seus alelos em diferentes populaes e por no sofrerem influencias


ambientais, so teis em estudos familiares, populacionais e de ligao

Gentica Evolutiva
Evoluo Molecular
Fsseis quadro incompleto do passado
Informao adicional: molculas informacionais
mudam com o tempo

evoluem

Evoluo molecular:
-Determinao e comparao dos genomas
- padro de bandamento cromossmico
- sequncias estruturais do DNA e protenas
informaes sobre correlaes filogenticas entre
organismos diferentes e sobre a histria evolutiva

Evoluo Molecular

ENFOQUE BASEADO NO FATO

sequncias de DNA em cidos nuclicos e aminocidos nas


protenas mudam com o tempo

MUTAES

Evoluo Molecular
MUTAES

quanto menos diferenas entre uma sequncia de um gene


ou protena em duas espcies, o mais proximamente
relacionadas as duas espcies devem ser

DIVERGIRAM MAIS RECENTEMENTE DE UM ANCESTRAL COMUM

(altamente improvvel que duas espcies no relacionadas tenham evoludo


exatamente a mesma sequncia de DNA ou aminocidos simplesmente por acaso)

Gentica evolutiva
Filogenias

Moleculares

- As relaes evolutivas entre organismos so resumidas em


diagramas chamados de rvores filogenticas ou filogenias

- rvores evolutivas ou cladograma: descreve o padro e a


cronologia dos eventos de diversificao, bem como as relaes
de proximidade ou distncia entre os organismos

- Cada bifurcao em uma rvore representa um ancestral comum

Gentica evolutiva
Filogenias

Moleculares

- Cada bifurcao em uma rvore representa um ancestral comum

Diferenas entre rvores filogenticas sem raiz (s mostra as relaes) e com raiz (mostra sua derivao)

Gentica evolutiva
Filogenias

Moleculares

Anagnese processo de
transformao de uma espcie em
outra, devido a mudanas
constantes nas freq. allicas; nunca
h mais de uma espcie presente

Cladognese processo onde uma


espcie se divide, dando origem a
duas espcies diferentes e
independentes
Borges-Osrio, MR. Gentica Humana. 3 ed. Artmed, 2013

Clado o conjunto de espcies descendentes de um ancestral comum

Gentica evolutiva
Filogenias

Moleculares

- Descendentes de uma sequncia ancestral de DNA ou protena so


ditos homlogos, mesmo que tenham divergido significativamente do
ancestral e sejam diferentes (funo); desenvolvimento embrionrio
semelhante; alelos similares

- Duas sequncias que se assemelham muito embora sejam derivadas


de sequncias ancestrais totalmente diferentes so ditas anlogas;
alelos e desenvolvimento embrionrio distintos

- rvores filogenticas (cladogramas) baseadas em homologias

3UTR
3UTR

Filogenias
Moleculares
Construo de filogenias, 4 caractersticas:
1. Alinhamento das sequncias para
comparao entre elas
2. Avaliao da quantidade de semelhana
(ou diferena)
3. Agrupamento das sequncias com base
na similaridade
4. Colocao das sequncias nas pontas da
rvore
Qual das rvores a melhor?

(a) Diferenas entre as sequncias de um gene de


quatro populaes (1, 2, 3 e 4). (b) rvore filogentica
mostrando as relaes evolutivas. (c) As 15 possveis
rvores mostrando como as 4 seq. esto relacionadas.

(c)

Filogenias Moleculares
Princpio

da parcimnia

- uma nica insero de TE


- uma nica deleo de par de bases
- e sete substituies independentes de pb
total de nove mutaes

Se as seq. 1 e 3 forem mudadas de


posies, necessrias 10 mutaes

Anlise de parcimnia uma rvore de parcimnia apresenta todos os dados com o


menor nmero de mutaes (mutaes so eventos raros) para explicar a evoluo
de todas as sequncias de rvores a partir de um ancestral comum.

Filogenias Moleculares
rvores filogenticas de homindeos construdas
pela anlise de uma seq. de 896 pb de DNA
mitocondrial (semelhanas e diferenas)

145 eventos
mutacionais

Diferenas encontradas em 283 das 896 posies


Princpio da parcimnia: trs rvores filogenticas
147 eventos
mutacionais

Anlise mais sofisticada, tcnicas estatsticas, (e


outras sequncias de DNA), favorece a rvore B

148 eventos
mutacionais

Gentica evolutiva
Relgios

Moleculares e Taxas de
Evoluo Molecular

Um relgio mede a passagem de tempo em um intervalo


especfico e constante de tempo (ponteiros, hora)

Uma molcula polimrica pode ser usada como um


RELGIO MOLECULAR: se seus blocos estruturais
forem submetidos a uma taxa conhecida e constante

os relgios moleculares aplicam taxas de mutao a escalas de


tempo para estimar quando dois indivduos ou tipos de
organismos mais recentemente compartilharam ancestrais

Relgios Moleculares e Taxas


de Evoluo Molecular
Dados moleculares

-globina: 141 aminocidos


16/141 = 0,11

68/141 = 0,48

Clculo da Taxa em que a -globina evoluiu:


nmero mdio de mudanas por stio de aa (0,11;
0,12)/tempo evolutivo total (2x80 = 160 milhes de
anos) = 0,74 x 10-9 mudana de aa por stio/ano

Filogenia de vertebrados representativos


construda a partir de registro fssil.

Relgios Moleculares e Taxas


de Evoluo Molecular

-globina: 141 aminocidos


16/141 = 0,11

68/141 = 0,48

Correo de Poisson: -globina evoluiu a uma


taxa constante (igual) em todas as linhagens
evolutivas analisadas, quase uma mudana de
aa por stio a cada bilho de anos (0,74 x 10-9)

Filogenia de vertebrados representativos


construda a partir de registro fssil.

Relgios Moleculares e Taxas


de Evoluo Molecular
Tempo em que os
organismos divergiram
de um ancestral comum

Taxa de substituies de bases por mutaes

Genes nucleares estudados em


humanos e chimpanzs: diferem em
5% de suas bases
Taxa de substituies:
1% por 1 milho de anos

divergncia
5 milhes de anos

Variao em Taxas
Evolutivas
A evoluo molecular pode ocorrer, sobre longos
perodos de tempo, numa taxa aparentemente constante

medidas de distncia (gentica ou imunolgica) iro se


correlacionar com o tempo desde a divergncia apenas se a
taxa de divergncia for aproximadamente constante

QUESTO
?????

As substituies de nucleotdeos
ocorrem ou no numa taxa constante

Variao em Taxas
Evolutivas
GENES E PROTENAS DIFERENTES
EVOLUEM COM TAXAS DIFERENTES

hiptese do relgio molecular: as mudanas nas sequncias


de genes particulares ocorrem em uma taxa constante

OCORRE MAIS RPIDO

sequncias que no sofrem seleo


purificadora: regies intergnicas,
ntrons, pseudogenes

OCORRE MAIS LENTAMENTE

sequncias que sofrem fortes restries


funcionais: sequncia de aa das
protenas, codificantes e regulatrias, nt
de 1a e 2a posies de cdons

Variao em Taxas
Evolutivas
Seleo purificadora: elimina indivduos portadores de mutaes que
interferem com funes genticas importantes

OCORRE MAIS LENTAMENTE

genes altamente conservados

os nicos que devem ser examinados quando


deseja-se traar as relaes familiares entre os
organismos relacionados mais distantemente
Fibrinopeptdeo (coagulao) 8 substituies de aa por stio / bilho de anos
Histonas 0,01 substituio de aa por stio / bilho de anos

Gentica evolutiva

Variao em Taxas Evolutivas

Variao em taxas evolutivas entre partes diferentes de genes.

Nucleotdeo: taxa de mutao 10-9/base/ diviso celular


gene: taxa mutao oscila entre 10-4 a 10-7/locus/diviso celular (tamanho do gene e seq.)

Gentica evolutiva

Variao em Taxas Evolutivas

Taxas de mutaes:
- Genes grandes, em razo do
seu tamanho, mais propensos
a mutaes
- pontos quentes de mutao
ilhas CpG metiladas (elevadas
taxas de mutao)
- distrbios de gene nico
aumento grande no risco de
mutao com avano da idade
paterna
- distrbios cromossmicos
risco aumentado de alterao
cromossmica com avano da
idade materna

Sndromes
cromossmicas

Distrbios
monognicos

Primatas

Ordem de mamferos que inclui os lmures, trsios, macacos e o homem

Relaes filogenticas

Registro dos fsseis


atribuio de idades aproximadas a fsseis:
observando em que camadas de rochas esto situados;
proporo de substncias radioativas

Evidncia molecular
comparaes de organizao de genomas:
padres cromossmicos, sequncias de genomas, genes,
DNA e protenas
pode preencher muitas lacunas em nosso conhecimento
do passado

Relaes filogenticas
Dados moleculares sobre sequncias de nucleotdeos + dados morfolgicos

Classificao dos primatas atuais


grandes macacos africanos tm um ancestral
comum com o homem, que mais recente do
que seu ancestral comum com os orangotangos

Divergncia de
linhagens

homem e chimpanz: 5,5 milhes de anos atrs


homem e gorila: 6,7 milhes de anos atrs
homem e orangotango: 8,2 milhes de anos atrs

Classificao dos primatas


atuais

Borges-Osrio, MR. Gentica Humana. 3 ed. Artmed, 2013

Filogenia dos primatas


atuais

Filogenia dos humanos e dos


hominoides com base em anlises
moleculares

Borges-Osrio, MR. Gentica Humana. 3 ed. Artmed, 2013

Evoluo gentica em
primatas
Comparando Genomas
Humanos, chimpanzs e bonobos (chimpanzs pigmeus)

compartilham 99,5%
genes que codificam protenas

Diferenas entre os humanos e chimpanzs


0,5%

????

Comparando Genomas
Caractersticas exclusivamente humanas: fala, raciocnio abstrato, polegares
opositores, lobos frontais maiores no crebro, exclusivamente bpedes

Podem refletir as aes de to poucos genes?

HIRSUTISMO

presena de pelos longos, duros e espessos

chimpanzs e gorilas

expressam um gene de queratina

humanos
Silenciado na condio de um pseudogene por uma mutao sem sentido

Comparando Genomas
FAMLIA GNICA DAS HEMOGLOBINAS

Primatas mais primitivos: no tm, ou tm pouca, hemoglobina fetal


(22)
Primatas mais desenvolvidos

presena de hemoglobina fetal aumentou o perodo fetal, maximizando o


crescimento cerebral, possibilitando novas capacidades

Genes nicos tambm podem contribuir com uma infncia e adolescncia


mais longas em humanos, em comparao aos chimpanzs

Comparando Genomas

Borges-Osrio, MR. Gentica Humana. 3 ed. Artmed, 2013

Comparando Cromossomos
Evoluo do caritipo em primatas
Cromossomos corados por meio da tcnica de banda G na prfase tardia:
possvel identificar um cromossomo especfico por seu padro de bandamento
Tcnica de FISH

Porcentagem de bandas
cromossmicas comuns
entre humanos e

Chimpanz: 99%
Gorila: 99%
Orangotango: 99%
Macaco verde da frica: 95%
Camundongo: 7%

Comparando Cromossomos
As principais diferenas entre os caritipos estavam em locais de heterocromatina

Alteraes mais comuns encontradas: inverses pericntricas

Homem e chimpanz: diferem apenas por nove inverses


pericntricas envolvendo os cromossomos 4, 5, 9, 12, 15 e 16
Homem e gorila: inverses peri e paracntricas no cromossomo 16
Homem e orangotango: inverses peri e paracntricas nos cromossomos 3 e 17
Cromossomo 7 do chimpanz e gorila diferem por uma inverso paracntrica

Comparando Cromossomos
Espcies

Homem X Chimpanz
Homem X Gorila
Homem X Orangotango

Nmero de cromossomos
relativamente idnticos
(13)
3, 6, 7, 8, 11, 13, 14, 19, 20, 21, 22 e XY
(10)
3, 6, 11, 13, 19, 20, 21, 22 e XY
(8)
5, 6, 12, 13, 14, 19, 21 e 22

Os padres de bandamento humanos so mais prximos dos


chimpanzs, depois dos gorilas, e ento dos orangotangos

Comparando Cromossomos

Evoluo do cromossomo 2 humano


(2n = 46)

Evoluiu por fuso de dois cromossomos de


primatas (ponto de fuso 2q13)
(2n = 48)

Comparando Cromossomos
Cromossomo 1 em humanos, chimpanzs, gorilas
e orangotangos corresponde ao de dois
cromossomos pequenos no macaco verde africano

Macaco verde africano ancestral dos outros primatas

Comparando Cromossomos
Semelhana entre o cromossomo 6
humano e seus ortlogos
Ortlogos do cromossomo 5
diferenas:
-inverso pericntrica no
chimpanz, com pontos de
quebras correspondentes ao 5p13
e 5q13 humanos
- ortlogo do gorila, sofreu uma
translocao recproca com um
chr correspondente ao 17 humano

Comparando Cromossomos
FISH feita em cromossomo de
gibo usando sondas preparadas a
partir de clones especficos de
cromossomos humanos 5 (laranja),
16 (verde), 17 (rosa) e 22 (amarelo)
Setas: cromossomo 8 de gibo, sinal
das 4 sondas dos 4 chr humanos

Cromossomos coloridos do macaco


verde africano com sondas
fluorescentes do cromossomo 4
humano (laranja) e um clone
especfico 4q1 (verde)
experimentos de Zoo-FISH

Comparando Sequncias de
Protenas
Todas as espcies usam o mesmo cdigo gentico para sintetizar protenas

Ancestral comum para toda a vida no planeta

Tipos diferentes de organismos usam as mesmas protenas, apenas


com pequenas variaes na sequncia de aminocidos

Semelhana nas sequncias de aminocidos nas protenas


humanas e de chimpanzs
Semelhante em 99% dos aminocidos
Vrias so idnticas

Comparando Sequncias de
Protenas
Semelhanas de seqncias de aminocidos de protenas
homlogas so uma medida da semelhana evolutiva

Duas protenas altamente conservadas


- Citocromo C
20 dos 104 aa ocupam posies idnticas no citocromo C de todos
os eucariotos

- Protenas Homeobox
fator de transcrio que controla a ordem na qual o embrio ativa os
genes partes anatmicas se desenvolvam nos locais apropriados
humanos: 39 genes HOX

Comparando Sequncias de
Protenas
Semelhanas de sequncias de aminocidos
para a protena respiratria citocromo c em
humanos e outras espcies traam um paralelo
do grau de correlao entre elas

A protena citocromo c humana


idntica do citocromo c do chimpanz

Comparando Sequncias de
Protenas

Comparando Sequncias de
Protenas
Hemoglobinas

Sequncias de aminocidos das cadeias e


do homem e chimpanzs so idnticas
Gorila: difere em apenas um aminocido em e

Comparando Sequncias de
DNA
Avaliar semelhanas nas seqncias de DNA entre duas espcies

um nico gene

genoma total
trecho de DNA

Tcnica de comparao

hibridao de DNA

Comparando Sequncias de
DNA
Pareamento complementar de bases

Estabilidade trmica

estimar o quanto so semelhantes os genomas de duas espcies

Desnaturao da dupla hlice de DNA de duas espcies


e mistura para posterior hibridao

heteroduplex

A taxa de formao de heteroduplex uma medida


indireta da semelhana em seqncias

Comparando Sequncias de
DNA
Quanto mais rpido ocorrer a
formao do heteroduplex

Mais compartilham seqncias e


mais prximas elas so

Heteroduplex de DNA humano e de


chimpanz indica que somente 1,1% dos
pares de bases diferem nos seus genomas
- em 2,3% do DNA de gorila
- em 3,7% do DNA de orangotango

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