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Carmona Salazar, Gavilanes Ruz, Maya Ampudia, Plata Ramos.
Compendio de Bioqumica.
I. ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS PROTENAS

Para entender las funciones de las protenas, antes hay que conocer su diseo estructural, ya
que las protenas estn formadas de aminocidos, primero se revisar este tema.
AMINOCIDOS.- Funciones:
1) Molculas formadoras de las protenas.
2) Precursores de vitaminas.
3) Intermediarios en las sntesis de otros aminocidos.
4) Presentes en compuestos de las paredes celulares de bacterias.
5) Como neurotransmisores.
6) Abundantes en plantas con funciones diversas.
20 son los ms comunes y son los que se encuentran formando parte de las protenas,
pero hay alrededor de 150 no proteicos.
Los que son parte de las protenas son las formas L que son los ismeros pticos resultantes
de la presencia del C asimtrico.
ESTRUCTURA GENERAL DE AMINOCIDOS PROTEICOS.

H
Carbono o Carbono asimtrico o centro quiral
R C COOH
NH3
Los aminocidos proteicos se clasifican segn las caractersticas de su grupo R:
Hay 20
GRUPOS R
Tienen diferentes
tamao, forma,
o
CADENAS
carga y por tanto,
LATERALES
o
propiedades.
SUSTITUYENTES
-
1) NO POLARES O
HIDROFBICOS.
2) POLARES NO CARGADOS.
3) POLARES CON CARGA
POSITIVA.
4) POLARES CON CARGA
NEGATIVA.
(Ver hoja anexa de estructuras de los 20 aminocidos)

PROPIEDADES DE LOS AMINOCIDOS
1) Sus pesos moleculares estn entre los 57 y los 186 Daltones (un peso molecular promedio es
110 daltones)
2) Los a.a. como cristales tienen altos puntos de fusin ( 250 C)
3) Bastante solubles en agua e insolubles en solventes no polares
4) Pueden tener carga elctrica (dependiendo del pH)
5) Algunos (triptofano, fenilalanina y tirosina) pueden absorber fuertemente la luz ultravioleta (280
nm)
6) Pueden protonarse o desprotonarse, por lo que pueden actuar como donadores o aceptores de
H+, o sea pueden actuar como cidos o como bases y se comportan como iones dipolares o
zwitteriones en solucin acuosa
PROPIEDADES CIDO-BASE DE LOS AMINOCIDOS
Las propiedades cidobsicas de los a.a. son importantes, porque:
Determinan muchas propiedades de las protenas.
Ayudan a separarlos, identificarlos y cuantificarlos.
1
LOS 20 AMINOCIDOS ESTN AGRUPADOS EN 4 CLASES SEGN SU GRUPO R

Con grupo R hidrofbico
LOS 20 AMINOCIDOS DE
LAS PROTENAS TIENEN
GLICINA
ALANINA
VALINA
GRUPOS R O CADENAS
FENILALANINA
LATERALES QUE SON

DIFERENTES EN TAMAO,
TIROSINA
TRIPTOFANO
Con grupo R polar, cargado +
PESO, FORMA, ESTRUCTURA
LEUCINA
METIONINA
QUMICA, CARGA ELCTRICA
ISOLEUCINA
Con grupo R polar, no cargado
Y POLARIDAD.
AQU SE LES PRESENTA
LISINA
SERINA
TREONINA
CLASIFICADOS SEGN
HISTIDINA
ARGININA
CISTENA
Con grupo R polar, cargado -
SU POLARIDAD/CARGA
PROLINA
ASPARAGINA
GLUTAMINA
AC. ASPRTICO
Forma que predomina

abajo del pKR
El valor de
pK nos ayuda Aspartato
a saber el
estado de
Glutamato
protonacin
y la carga del
grupo R a
cierto pH.
Histidina
Cistena
Arginina
3.9
CH2 COOH
4.1
CH2 CH2 COOH

H
+
N
C
H2
6.0
NH
8.4
CH2 SH
Tirosina
Lisina
pKR
CH2
CH2
Forma que predomina

por arriba del pKR
CH2 COO-
H+
CH2 CH2 COO-
H+
H+
H+
H+
H+
H+
N
C
H2
NH
CH2S-
10.5
OH
CH2
CH2
10.5
NH3
+
NH2
CH2 CH2 CH2 NH
C
NH2
2
12.5
AC. GLUTMICO
OCH2
CH2
CH2
CH2
NH3
NH
CH2 CH2 CH2 NH
C
NH2
En la curva de titulacin de la ALANINA que se presenta a continuacin, se puede ver como los
dos grupos ionizables de la alanina que son el amino y el carboxilo del C alfa, pueden ganar o perder
H+ dependiendo del pH y del pK de cada grupo.
Todos los aminocidos tienen
los grupos amino y carboxilo y
por
tantotodos
tienen
la
capacidad de protonarse y
desprotonarse
en
esos
grupos
BAJO pH
pH NEUTRO
COOH
NH3
COO-H+
+H+
Carga = + 1
Forma no disociada
ALTO pH
NH3
COO-H+
+H+
NH2
Carga = - 1
Forma disociada-
Carga = 0
Zwitterion o In dipolar
-
13
(Sin embargo, hay aminocidos

que tienen un tercer grupo
disociable (ubicado en el
grupo R) y por tanto tienen un
pK adicional)
H NCHRCOO
11pK2 =9.69
pH 10Curva de titulacin
9 - ----- ---------de la alanina.
8H3N+CHRCOO+
H2 NCHRCOO7 - 3N CHRCOOH
6 - - - - - - - - pH1=6.02 H N+CHRCOO3
H
5| +
4pK =2.34 +
CH 3 C NH3
3
H3NCHRCOOH
|
2H3N+CHRCOO1COOH
0.5
1.0
1.5
Equivalentes OH
PROTENAS
Funciones biolgicas
a) Enzimas.- Actividad cataltica
b) Hormonas.- Actividad de mensajeros
c) Anticuerpos.- Defensa
d) Receptores en membranas.- Deteccin de seales y mensajes fsicos y qumicos
e) Unin de alguna especie para transportarla.-Oxgeno, cidos grasos, etc.
f) Acarreadores en membranas:- Transporte de solutos y a menudo, actividad cataltica
g) Estructurales.- Formacin de andamios
moleculares.
Estructura
TODAS las protenas tienen estructura
primaria, secundaria y terciaria. Algunas,
adems tienen cuaternaria. En una
protena activa, todas los niveles de
estructura co-existen simultneamente.
2.0

NIVELES DE ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS:
PRIMARIA SECUNDARIA TERCIARIA
CUATERNARIA
Estructura primaria
1. Cadena lineal de aminocidos, cadena no ramificadas
2. Posicin especfica de cada aminocido en la cadena: secuencia especfica
3. Unin covalente aminocido aminocido: enlace peptdico
4. La cadena de aminocidos tiene dos extremos: uno amino, otro carboxilo
Formacin de uniones peptdicas entre 4 aminocidos:

R1
NH2 CH
R2
COOH
R3
NH2 CH
COOH
NH2 CH
R4
NH2 CH
COOH
COOH
Ejemplo de 4 Aminocidos unidos por enlaces peptdicos

R1
NH2 CH
NH
R2
CH
NH
R3
CH
R4
NH
Extremo amino
CH
COOH
Extremo carboxilo
Enlaces peptdicos
Aminocido

Estructura secundaria
1) Arreglo peridico.
2) Especialmente la cadena no est estirada.
3) Promovida y estabilizada por puentes de H.
hlice
plegada
Giros o vueltas
* Cadena helicoidal
* 3.6 aminocidos por vuelta (5.4Ao)
-hlice
* Los grupos R se encuentran hacia fuera de la hlice

* Enrolladas hacia la derecha
* Formacin de puentes de hidrgeno con periodicidad
entre el hidrgeno del NH y el oxgeno del C=O de los enlaces
peptdicos
-hlice
Hoja - plegada
Es una forma de estructura

secundaria de las protenas
Tiene una disposicin planar en el

espacio
Est estabilizada por puentes de
hidrgeno entre el grupo amino y
carboxilo de los a.a
Las cadenas pueden correr en forma

paralela o antiparalela
Los grupos R se encuentran hacia

arriba y hacia abajo del plano
Cadenas paralelas
5
Cadenas antiparalelas
Vueltas o giros
Estructuras secundarias en forma de U.
Estabilizadas por puentes de H en sus extremos.
Formadas por tres o cuatro residuos
Se localizan en las superficie de las protenas
generalmente.
Forman un doblamiento acentuado de la cadena
polipeptdica que la reorienta hacia el interior.
Prolina favorece las vueltas o giros as como glicina
Sin estas vueltas, las protenas seran largas
cadenas de aminocidos extendidas (aunque con
-hlices o -plegadas), y no seran estructuras compactas.
Estructura terciaria
1) Es el plegamiento que adopta la cadena polipeptdica (incluyendo sus estructuras 1 y 2) en el
espacio.
2) Es la forma con la que hace su actividad biolgica (estructura nativa).
3) Est dada por la manifestacin de las interacciones entre los grupos R de los aminocidos:
a) Interacciones hidrofbicas.
b) Interacciones electrostticas.
c) Puentes de hidrgeno.
d) Puentes disulfuro.
4) Es una consecuencia de la estructura primaria y es por tanto, especfica.
5) Es estable, pero dinmica dado que puede cambiar la posicin en el espacio de los tomos de los
aminocidos que la conforman, con ligeros movimientos reversibles
6) Los grupos polares tienden a estar en la superficie
7) Los grupos hidrofbicos tienden a mantenerse internamente
8) Es muy compacta
ELECTROSTTICAS
INICAS/SALINAS
PUENTES DE HIDRGENO
HIDROFBICAS
ELECTROSTTICAS
INICAS/SALINAS
HIDROFBICAS
PUENTES DE
HIDRGENO
PUENTES
DISULFURO
Ilustracin de una protena plegada en su forma nativa y en la que se puede apreciar una sla cadena
polipeptdica, por lo cual esta protena no tiene estructura cuaternaria. Tambin se notan 8 -hlices y
varios giros o vueltas (estructuras secundarias). De canto, se puede notar un grupo prosttico que es
un grupo hemo con una geometra planar.
Estructura cuaternaria
Es la estructura que se forma cuando dos o ms polipptidos se unen entre s para formar una
protena con una funcin biolgica.
* Los polipptidos que forman una protena se llaman subunidades u oligmeros. stos pueden ser
idnticos o diferentes.
* Las interacciones que unen a los oligmeros pueden ser hidrofbicas o puentes de hidrgeno o
inicas o enlaces S S.
* Si los monmeros que forman un dmero son iguales, se forma un homodmero, por ejemplo y si son
diferentes se forma un heterodmero
* Puede haber protenas dimricas, trimricas, tetramricas, etc., que estn formadas por dmeros,
trmeros, tetrmeros, etc.
* Las protenas con estructura cuaternaria pueden ser: GLOBULARES O FIBROSAS (aunque
tambin las protenas con slo estructura terciaria pueden serlo).
TRMERO
DMERO
PENTMERO
TETRMERO
Desnaturalizacin. Es la prdida de la estructura nativa de una protena y por tanto de su

funcionalidad.
Estado
nativo
Estado
desnaturalizado
Actividad biolgica
Conformacin termodinmicamente
ms estable.
Prdida de la estructura
terciaria, y en las que la tienen,
de la cuaternaria
Sin actividad
Los agentes desnaturalizantes ms usados en el anlisis de protenas son:
pH
TEMPERATURA
SOLVENTES
ALTAS FUERZAS INICAS
DETERGENTES
AGENTES REDUCTORES DE GRUPOS S-S como el mercapto etanol
Todos ellos perturban las estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria de las protenas, pero nunca
alteran la estructura primaria, ya que estos agentes slo rompen interacciones no-covalentes
(excepto los agentes reductores de S-S como el mercapto etanol)
FUNCIONES DE PROTENAS. EJEMPLOS

A) FUNCIN ESTRUCTURAL.- PROTENAS FIBROSAS.
Molculas largas (forman asociaciones de fibras alargadas).
Gran cantidad de estructura secundaria.
Funcin celular estructural.
Tienen gran fuerza de tensin.
Ejemplos: queratina, fibrona de la seda, elastina, colgena.
El colgeno se origina por una protena precursora (monmero) llamada tropocolgeno que
mide alrededor de 300 nanmetros de largo y 1,4 nm de dimetro. El tropocolgeno est
formado por tres cadenas polipeptdicas llamadas cadenas alfa (no hlices alfa). Cada cadena
esta constituida por un polipptido, formado por una repeticin en tndem de tres
aminocidos siendo muy ricas en prolina o hidroxiprolina y glicina, las cuales son
fundamentales en la formacin de la superhlice. La hidroxiprolina constituye alrededor de un
10 a 12 % de todos los resduos aminoacdicos del colgeno, dependiendo dicho porcentage
del tipo de colgeno. Gracias a su estructura anular rgida, la prolina estabiliza la conformacin
helicoidal en cada una de sus cadenas ; La glicina, sin embargo, se sita ocupando un lugar
cada tres residuos localizndose a lo largo de la regin central, debido sin duda a su pequeo
tamao, y favoreciendo al denso empaquetamiento de las tres cadenas , de configuracin
levgira, necesario para la formacin de la superhlice de colgeno. Las tres cadenas se
enrollan y se fijan mediante enlaces transversales para formar una triple hlice dextrgira. La
triple hlice se mantiene unida entre si debido a puentes de hidrgeno, que no afectan a todas
las tres cadenas, sino aproximadamente a 2/3 de cada cadena alfa. Adems, los
tropocolgenos se unen entre si por medio de enlaces entre algunos aminocidos, llamados
"crosslinkings".
B) FUNCIN DE UNIN DE LIGANDOS.- MIOGLOBINA Y HEMOGLOBINA (QUE UNEN

OXGENO).
El oxgeno tiene una baja solubilidad en agua, pero ste tiene que llegar a los tejidos aerobios
La mioglobina y la hemoglobina de los vertebrados tienen una alta afinidad por el oxgeno
La mioglobina est en las clulas musculares y la hemoglobina en los eritrocitos
Ambas tienen un grupo hemo que es un grupo prosttico que est en la protena, pero que no es de
naturaleza proteica y que es un tetrapirrol que en su centro tiene un tomo de Fierro, al cual se une el
oxgeno.
La hemoglobina tiene estructura cuaternaria, pues tiene 4 subunidades, 2 alfa y 2 beta. Cada
una tiene un grupo hemo que une un tomo de oxgeno. Los sitios de unin de los O2 en los 4 hemos
estn alejados entre s. Sin embargo, la unin del primer O2 facilita la entrada del 2 y la de ste, la
del 3 y la de ste, la del 4, o sea que cooperan entre s, a sto se le llama cooperatividad de unin
del oxgeno y esta caracterstica hace que la Hb sea ms eficiente en su funcin.
Esto se explica porque hay cambios conformacionales que conectan a los 4 grupos hemos, a esto
se le llama alosterismo
MIOGLOBINA
HEMOGLOBINA
Conformacin de las dos cadenas

y las dos cadenas en una
molcula de hemoglobina
FUNCIONES DE PROTENAS. EJEMPLOS.

C) FUNCIN CATALTICA.- ENZIMAS
1) Son protenas que catalizan reacciones qumicas con gran rapidez y
especificidad
2) Son regulables
.
3) Son los catalizadores
de las reacciones qumicas celulares, acelerando reacciones por
factores de al menos un milln de veces
.
Enzimas
(la mayora son
protenas)
Protenas
(a.a.)
In
Cofactor (no en todas las enzimas)

Estables al calor
Derivados de
Molcula
Orgnica vitaminas
Funcin de los cofactores. Contribuyen con

. uno o ms grupos qumicos funcionales a la
catlisis llevada a cabo por la enzima
CARACTERSTICAS DEL SITIO CATALTICO
* Regin tridimensional de la protena

* Es una regin pequea comparada con la magnitud
total de la protena
* Es una hendidura en la estructura de la enzima,
localizada ms o menos superficialmente en el
cuerpo de la enzima
* Une al sustrato especficamente, mediante un
reconocimiento estructural complementario
Contiene a los grupos catalticos y a los cofactores,
si los hay
La interaccin de ste, con el sustrato es no covalente,
y es reversible
* Es hidrofbico, aunque puede tener a.a. polares y
an cargados
* Tiene capacidad de orientar al sustrato
Cada enzima tiene un sustrato especfico, aunque un sustrato puede ser actuado por varias enzimas.
FACTORES QUE AFECTAN LA ACTIVIDAD ENZIMTICA.
Estos no son factores fisiolgicos siempre, pero los podemos usar en el laboratorio para medir
actividades enzimticas a ms altas velocidades o para caracterizarlas. Estos factores son:
Temperatura, pH, fuerza inica, solventes
10
LAS ENZIMAS FACILITAN LA FORMACIN DEL ESTADO DE TRANSICIN, LO CUAL RESULTA

EN UNA DISMINUCIN DE LA ENERGA DE ACTIVACIN DE LA REACCIN QUE SE VE
REFLEJADO EN UN AUMENTO EN LA VELOCIDAD DE LA MISMA
(Proporcionan una superficie complementaria a su estereoqumica, polaridad o carga)
Estado de transicin
Energa
libre
Reaccin catalizada no enzimticamente
Reaccin catalizada enzimticamente
G
Estado inicial
(reactivos)
Estado final
(productos)
Progreso de la reaccin
Estado de transicin.
Una situacin en la que hay alta probabilidad de que
las molculas de enzima o catalizadores puedan formar o romper enlaces
del sustrato para formar el producto.
Colisiones efectivas entre molculas especficas y orientadas
[molculas en edo. de transicin ] ~ Velocidad de la reaccin
CINTICA ENZIMTICA
La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones y los factores que la afectan.
Las enzimas tienen constantes cinticas que son parmetros que no varan en condiciones
constantes de T. Estas constantes son la Km, la Vmax, la Kcat y las ctes. de inhibicin de
compuestos.
La Km es la concentracin de sustrato a la cual la enzima alcanza la mitad de su velocidad mxima.
Es una forma de estimar la afinidad de la enzima por su sustrato.
La Vmax es la velocidad que la enzima alcanza a concentraciones saturantes de sustrato.
La kcat es el nmero de recambio y equivale al nmero de ciclos catalticos por sitio activo por
segundo.
Un gran nmero de enzimas tiene una cintica Michaeliana que da una grfica hiperblica, la cual
puede convertirse a una forma lineal, graficando los mismos los inversos de los valores de velocidad
y [sustrato]
Grfica directa de los valores experimentales
Grfica de dobles inversos
V Vmax
e
l
o
c Vmax/2
i
d
a
d
1/V
Km/V
Lineweaver Burk
-1/Km
Km
[S]
11
1/Vmax
1/S
INHIBICIN ENZIMTICA
Las enzimas pueden ser inhibidas por compuestos celulares o por compuestos exgenos como
frmacos o toxinas que pueden ser irreversibles o reversibles. El tipo de inhibidor puede
identificarse de acuerdo a los cambios en los valores de Km o Vmax, cuando se grafica la
velocidad de la reaccin vs. concentracin de sustrato:
Inhibicin competitiva
1/V
Inhibicin a-competitiva
1/V
+ INHIBIDOR
+ INHIBIDOR
-INHIBIDOR
- INHIBIDOR
1/ Vmax
1/Vmax
Vmax no cambia
-1/Km
1/V
Km se hace mayor
La Vmax disminuye
1/S
Km disminuye
Inhibicin no-competitiva
+ INHIBIDOR
1/vmax
- INHIBIDOR
-1/km
La V max disminuye
Km no cambia
1/S
CATLISIS ENZIMTICA
Proteasas de serina.
Son enzimas que rompen enlaces peptdicos en sitios
especficos de la secuencia de aminocidos de
sus sustratos (que son otras protenas). Las
proteasas de serina tienen prcticamente el mismo
mecanismo cataltico y se llaman as porque contienen
una serina en el sitio cataltico que participa en el
mecanismo de rompimiento del enlace peptdico.
Adems, participan otros aminocidos que forman
la trada cataltica: Ser, Asp, His. Tres ejemplos de
proteasas de serina son:
TRIPSINA rompe despus de una Arginina o Lisina
QUIMOTRIPSINA rompe despus de un aminocido
con R hidrofbico
SUBTILISINA rompe despus de un aminocido con
un R pequeo no polar
En la Figura de la derecha se presenta el sitio
cataltico de la Quimiotripsina con la trada cataltica y
otros aminocidos importantes en la catlisis. Se
indica la formacin de un estado de transicin que es
uno de los pasos dentro del ciclo cataltico.
12
1/S
REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA

Mecanismos fisiolgicos para aumentar o disminuir la actividad enzimtica
a) HOMOTRPICO
* ALOSTERISMO
b) HETEROTRPICO
MODIFICACIONES
SOBRE LA ENZIMA
EXISTENTE
*REGULACIN COVALENTE
a) FOSFORILACIN
b) PROTELISIS
*ISOENZIMAS
a) EXPRESIN DEL GENE
MODIFICACIONES
PARA CAMBIAR
LA CANTIDAD DE
ENZIMA
b) SNTESIS DE LA PROTENA
EN EL RIBOSOMA
* SNTESIS
* DEGRADACIN
DIFERENTES MECANISMOS
DOS EJEMPLOS DE FORMAS DE REGULACIN DE LA ACTIVIDAD DE LAS ENZIMAS:

FOSFORILACIN Y ALOSTERISMO
REGULACIN POR MODIFICACIN COVALENTE :
La actividad de la enzima se regula, ya sea +o por la adicin o
substracci n covalente de un grupo qumico o de una parte de la
mol cula de enzima.
a) Fosforilacin (regulacin reversible) :
ATP
ADP+ Pi
CINASA o
FOSFORILASA
Pi
ENZIMA
DEFOSFORILADA
ENZIMA FOSFORILADA
ACTIVA
Pi
FOSFATASA
REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA

ALOSTERISMO
INACTIVA
LA REGULACIN ALOSTRICA
EFECTOR
ALOSTRICO
+ -
SITIO CATALITICO
SUSTRATO
Pi
Sitio de fosforilacin
(Ser, Treo,Tyr)
ENZIMA
Sitio Regulador
Ligando o
Regulador o
Efector alostrico
(especfico)
Actividad enzimtica
Sitio alostrico
(es especfico)
Actividad enzimtica
INDUCCIN DE
CAMBIO
CONFORMACIONAL
TRANSMISIN A TRAVS
DE LA ENZIMA HASTA
EL SITIO CATALTICO
Ligando o efector o regulador

alostrico + o -
Sitio alostrico
(es especfico)
UNIN A LA ENZIMA
(SITIO ALOSTRICO)
EXPRESIN DE
LA ACTIVIDAD
DE LA ENZIMA
(CATLISIS)
13
MODIFICACIN + CAMBIO EN LA
DE LA AFINIDAD POR
ESTRUCTURA DEL
EL PRODUCTO, CAMSITIO CATALTICO.
BIO REACTIVIDADES
DE RESIDUOS CRTICOS
EN LA CATLISIS.
II. ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS MEMBRANAS

Funciones
Las clulas procariontes y eucariontes estn delimitadas por una membrana lipdica que acta
como una barrera de permeabilidad selectiva a solutos. En los procariontes esta estructura slo
acta como una barrera fsica entre la regin externa e interna de la clula, en cambio en las clulas
eucariontes tambin es responsable de la compartamentalizacin interna de procesos fisiolgicos
especficos (ejemplo: Ciclo de Krebs y Fosforilacin Oxidativa se realizan en mitocondria). Son
relevantes para la comunicacin inter e intracelular, organizan secuencias complejas de
reacciones y son de importancia para la conservacin de la energa.
Composicin de las membranas biolgicas
Aunque las membranas biolgicas despliegan diferentes funciones, todas tienen una estructura
comn basada en una bicapa de molculas lipdicas (3-5 nm de grosor total), con protenas
unidas a ella por interacciones no covalentes. La diversidad molecular de la membrana integrada por
los lpidos y protenas le dan ciertas caractersticas fisicoqumicas que determinan su funcionalidad.
Los lpidos que conforman la mayora de las membranas celulares son de tres tipos:
glicerofosfolpidos, esfingolpidos y esteroles. Los glicerofosfolpidos y los esfingolpidos tienen
en comn la presencia de cidos grasos en su estructura.
cidos grasos.- Son cidos carboxlicos con cadenas hidrocarbonadas y pueden presentar
diferencias en el nmero de tomos de carbono (longitud), en el nmero y tipo de sustituyentes, as
como en el grado de instauracin.
Glicerofosfolpidos.- Lpidos en los que dos cidos grasos estn unidos por enlace ster al primer
y al segundo carbonos del glicerol y un grupo polar o cabeza unido por enlace fosfodister al tercer
carbono.
14
Estructuras de glicerofosfolpidos:
Fosfogliceridos
enlace tipo ester

glicerol
Unidad
fosfato
Unidades de
c. graso
grupo
alcohol
Fosfatidilserina
Fosfatidilcolina
Fosfatidiletalonamida
Fosfatidilinositol
Fosfatidilglicerol (cardiolipina)
Esfingolpidos.- Lpidos en los que un cido graso esta unido por un enlace amida a una base de
cadena larga (base esfingoidea) y un grupo polar o cabeza est unido al primer carbono de la
base esfingoidea.
15
Estructuras de esfingolpidos:
Esteroles.- Estn formados por un ncleo de ciclopentanoperhidrofenantreno, una cadena lateral

y un grupo polar (hidroxilo en la posicin 3).
16

Lpido
Glicerofosfolpidos:
Esqueleto de
unin
Glicerol
Esfingolpidos:
Base esfingoidea
Esteroles (Colesterol)
Ncleo
esteroideo
Grupos de la
parte polar
1 fosfato
Grupos de la
parte no polar
2 ac. grasos
Propiedades a la
membrana
Favorece
la
formacin de la
bicapa lipdica
Favorece
la
formacin de la
bicapa lipdica
1 ac. Graso
1carbohidrato
(glucosa,
galactosa)
Cadena
ramificada
de
carbohidratos
Da rigidez a la
1 Hidroxilo
Ncleo
esteroideo
y membrana
cadena lateral
La estructura membranal consiste de

una doble capa lipdica o bicapa a la que
se asocian protenas en diversos
grados. Los lpidos membranales son
anfipticos: tienen una parte hidrofbica,
formada por cidos grasos de cadena larga
(saturado o insaturado) unidos a una
molcula de glicerol o a una base
esfingoidea y otra regin hidroflica, la
cual est conformada por un grupo fosfato
enlazado a otra molcula polar.
La propiedad anfiptica de los lpidos
membranales favorece la formacin de la
bicapa lipdica. Los grupos hidrofbicos
estn orientados hacia el centro y los
grupos hidroflicos hacia las partes
externas de la bicapa lpidica. Las
protenas se integran a la bicapa lipdica dependiendo de sus propiedades de hidrofobicidad.
protena
transmembranal
o integral
17
Las protenas que penetran en la regin hidrofbica de la bicapa de la membrana celular son
conocidas como protenas integrales (o intrnsecas). stas pueden atravesar una o las dos
monocapas (las ltimas son protenas transmembranales) gracias a que poseen en su estructura
varias regiones de hlices de aproximadamente 20 aminocidos o bien de -plegadas, las cuales
tienen grupos R hidrofbicos en su gran mayora. A estas regiones se les conoce como regiones
transmembranales. Las protenas que slo tienen contacto con la superficie membranal (que es polar)
son denominadas protenas perifricas (extrnsecas) son hidroflicas en su superficie y por ello se
asocian a las membranas a travs de interacciones electrostticas y por puentes de hidrgeno, en
particular se unen a protenas integrales o a la parte polar de los lpidos. Este arreglo espacial de
lpidos y protenas es conocido como el modelo del mosaico fluido, propuesto por Singer y Nicolson
en 1972.
Fluidez membranal
Los cidos grasos que estn
presentes en las membranas
pueden
ser
saturados
e
insaturados. Las insaturaciones por
ser estructuras planares y rgidas
permiten espacios vacos en el
centro
de
la
membrana,
favoreciendo la fluidez membranal,
ya que permite el movimiento de
otras molculas, situacin contraria
Fosfolpido con
ac. graso saturado
Fosfolpido con
ac. graso insaturado
Difusin lateral
rotacin
Flip-flop
flexin
sucede con los cidos grasos saturados, los cuales

compactan ms dando rigidez la membrana.
Movimiento de lpidos membranales
Los lpidos presentan varios tipos de movimiento lo que le da
dinamismo a la membrana. Estos movimientos pueden ser
rpidos (difusin lateral, rotacin y flexin) o lentos (flip-flop).
TRANSPORTE TRANSMEMBRANAL. Una funcin de las
membranas.
La permeabilidad de las bicapas lipdicas a molculas
grandes y polares es muy limitada, por lo que el paso de
Electrodo
estas molculas est facilitado por

protenas integrales. Al paso de
molculas a travs de la membrana
sin la intervencin de protenas
transportadoras se le conoce como
Compartimentos
difusin simple.
Bicapa
Acuosos
Lpidica
Las protenas presentes en la
Triptofano
membrana
tienen
diversas
K+
H2O
Urea
Indol
+
Cl
Na
Glucosa
funciones, entre ellas permitir el
Glicerol
paso de iones y otros sustratos a
travs de la membrana de forma
controlada y selectiva.
Clasificacin
del
transporte
Permeabilidad creciente
transmembranal de solutos
Hay una gran variedad de protenas que mueven sustratos a travs de la membrana, en general las
podemos dividir en dos:
18
a) CANALES y
b) TRANSPORTADORES
Estas protenas se clasifican dependiendo de su gasto energtico, velocidad y direccin del
transporte y si generan o utilizan un cambio en el potencial de membrana.
Termodinmica del transporte transmembranal de solutos

El movimiento de un in o molcula a travs de la membrana depende su naturaleza qumica:
Molculas sin carga.- Su movimiento depende de su gradiente de concentracin (gradiente
qumico).
Molculas con carga.- Su movimiento depende tanto de su gradiente de concentracin como de su
gradiente elctrico (potencial de membrana) por tanto, depende de su gradiente electroqumico.
A su vez, el movimiento de una molcula a
Molcula sin carga
travs de protenas membranales puede
[C2]
requerir un gasto de energa o no, lo cual
G= 2.303RT log
[C1]
depender de la concentracin de la
molcula a transportar en cada una de las
regiones separadas por la membrana. En
el caso de las molculas que pasan de
Relacin de concentracin C2/C1
una zona de alta concentracin a otra de
baja concentracin, al transporte se le
Molcula con carga
conoce como difusin facilitada o
[C2]
transporte pasivo. Las molculas que se
G= 2.303RT log
+ZF V
mueven en contra de su gradiente de
[C1]
concentracin y carga requieren de
energa; a este tipo de transporte se le
Potencial de membrana (mV)
conoce como transporte activo. Como se
observa en las ecuaciones, la energa libre necesaria para mover una molcula es directamente
proporcional a la relacin de la concentracin de la molcula entre las dos regiones que separa la
membrana y en el caso de molculas ionizadas, tambin se considera el tipo de carga y el diferencial
del potencial de membrana.
CARACTERSTICAS GENERALES DE LOS CANALES INICOS

Todos generan una corriente inica, por tanto, pueden cambiar el potencial de membrana.
19
Pueden tener una o varias subunidades proteicas, una de ellas por donde pasa la molcula
ionizada, es conocida como poro del canal, las otras subunidades por lo general regulan la
actividad del mismo.
Su capacidad de transportar un in es mayor que la de un transportador.
Son especficos para el in que transportan.
Tienen dos estados: abiertos o cerrados.
Ambos estados estn regulados por la unin de ligandos o por el voltaje transmembranal.
Los estados abiertos del canal generalmente se convierten espontneamente a un estado

cerrado.
CARACTERSTICAS GENERALES DE LOS TRANSPORTADORES
Clasificacin por requerimiento energtico
Transportadores primarios o Bombas o bombas primarias.- Utilizan energa para
transportar molculas en contra de su gradiente de concentracin.
Transportadores secundarios.- Utilizan el gradiente de iones y/o elctrico generado por los
transportadores primarios para mover a las molculas.
Clasificacin por carga inica
Electroneutros.- El balance neto de las cargas de las molculas ionizadas transportadas es
cero.
Electrognicos.- El balance neto de las cargas de las molculas ionizadas transportadas es
mayor o menor de cero.
20
COMUNICACIN CELULAR. Otra funcin de las membranas.

Otro grupo de protenas que integran la membrana
Seal de transduccin
celular, son las que facilitan la comunicacin celular
seal
y estn ntimamente relacionadas con la transduccin
receptor
de seales. Los sistemas de transduccin de seales
son
reacciones
secuenciales
organizadas,
especficas, rpidas y efectivas que las clulas
tienen para detectar cambios en su medio y
convertirlos
y
transmitirlos
en
trminos
Transmisin
moleculares para generar una respuesta que
Modulacin
afronte los cambios percibidos en su entorno.
por otros
factores
Las molculas seal (primeros mensajeros), que

inician
la transduccin de seales son las hormonas y
Divergencia a
mltiples dianas
neurotransmisores que se unen a su protena blanco
o receptores. Los receptores son especficos para
los ligandos, su afinidad por el ligando es muy alta;
en general, son protenas transmembranales que se
Regulacin
Regulacin de
Cambios en
localizan en la membrana plasmtica. En el caso de
de la
una va
citoesqueleto
expresin
metablica
las hormonas, los receptores de membrana son del
gnica
tipo tirosina cinasa o receptores que se unen a
protenas G. Las hormonas esteroideas por ser liposolubles atraviesan la membrana y
reconocen a su receptor en el citoplasma o en el ncleo. Los neurotransmisores tienen como
protenas blanco a canales inicos.
Amplificacin
En la transmisin de seales, tambin participan compuestos orgnicos e inorgnicos conocidos

como segundos mensajeros cuyas concentraciones aumentan de manera sbita y controlada
como forma de transmitir una seal. El papel de los segundos mensajeros es activar a una
serie de protenas citoplasmticas; entre ellas algunas cinasas de protena (cinasas de tirosina,
cinasas de protena A, cinasa de protena
Segundos mensajeros
C) o fosfatasas, las cuales modifican el
estado de fosforilacin de las protenas
blanco modificando as la actividad de estas
protenas.
cAMP, cGMP
Ion calcio
Los segundos mensajeros y las protenas

cinasas
y
fosfatasas
amplifican
intracelularmente la seal original para
generar una fase de respuesta, que consiste
en producir cambios metablicos en la
clula con el fin de responder al estmulo.
Para ello, se encienden genes en el
ncleo que codifican a protenas necesarias
para contender con el estmulo y se
fosforilan enzimas que modifican su
actividad para producir el producto necesario
ante la situacin avisada por la seal.
Actualmente se conoce que hay una red muy
compleja de comunicacin intracelular en las
que diferentes vas de transduccin de
seales estn interrelacionadas.
Inositol 1,4,5-trifosfato (IP3)
Diacilglicerol (DAG)
21
III. INTRODUCCIN AL METABOLISMO

Generalidades
Los seres vivos adquieren y utilizan la energa libre que requieren a travs del metabolismo para
realizar sus funciones. Por tanto, los objetivos del metabolismo son:
Obtener energa qumica a partir de la captacin de la energa solar (organismos auttrofos) o
degradando nutrientes ricos en energa obtenidos del ambiente (organismos hetertrofos).
Convertir molculas nutrientes en las molculas caractersticas de la propia clula.
Polimerizar los precursores monomricos en macromolculas.
Sintetizar y degradar biomolculas requeridas en funciones celulares especializadas.
Definicin del metabolismo
Es la suma de todas las transformaciones qumicas que se producen en una clula u organismo, a
travs de una serie de reacciones catalizadas enzimticamente que constituyen las rutas o vas
metablicas.
Caractersticas de las rutas metablicas

9 Serie de reacciones en una secuencia especfica que globalmente resultan termodinmicamente
favorables.
9 Algunas reacciones de las vas requieren de un aporte de energa, mientras que otras pueden
liberarla.
9 Las vas pueden estar compartamentalizadas sub-celularmente y tambin asignadas a tejidos
especficos.
9 Las reacciones son catalizadas por enzimas.
9 Las vas son regulables. No todas las reacciones se pueden regular.
9 Existen diversos mecanismos de regulacin: por cantidad o disponibilidad de sustrato
(recambio, localizacin), por regulacin enzimtica (alosterismo, modificacin covalente,
localizacin subcelular, etc.), hormonalmente, entre otros.
9 Las vas en su conjunto son reversibles, pero tienen por lo menos un paso irreversible (paso
limitante).
22
ORGANIZACIN DEL METABOLISMO

CATABOLISMO.- Conjunto de reacciones que convierten molculas
(como si fueran combustibles) en energa utilizable (producen energa)
Vas catablicas: son de tipo degradativo.
Qumicamente son procesos oxidativos.
Suelen producir energa
METABOLISMO
ANABOLISMO.-Conjunto de reacciones que requieren energa para
producir molculas complejas
Vas anablicas: son rutas de biosntesis.
Qumicamente son procesos reductores.
Requieren un aporte de energa externo.
Ambos tipos de metabolismo mantienen una relacin energtica, donde las rutas catablicas
suministran energa qumica (en forma de ATP, NADH, NADPH y FADH2) que es utilizada en las rutas
anablicas con objeto de convertir molculas precursoras pequeas en macromolculas celulares.
23
TIPOS DE REACCIONES QUMICAS DEL METABOLISMO

Dentro de una clula se llevan a cabo muchas transformaciones qumicas. Sin embargo, la mayora
de estas reacciones se encuadran en seis categoras generales:
TIPO DE REACCIN
DESCRIPCIN
Oxidacin-reduccin
Transferencia de electrones
Formacin de enlaces con

Formacin de enlaces covalentes (ej. C-C)
requerimiento de hidrlisis de ATP
Isomerizacin
Reorganizacin de tomos para formar ismeros
Transferencia de grupos
Transferencia de un grupo funcional de una

molcula a otra
Hidrlisis
Rompimiento de enlaces con intervencin del

agua
Adicin o eliminacin de grupos

funcionales
Poner grupos funcionales a dobles enlaces o

eliminacin para formar dobles enlaces
Existen 4 molculas fundamentales en las reacciones metablicas. Su importancia radica en

que son molculas que actan como vehculos de grupos o tomos o electrones:
Coenzimas transferidoras o vehculos de electrones.- Utilizados durante la oxidacin de
combustibles, como el dinucletido adenina de nicotinamida (NAD+) que es un aceptor de
electrones, donde la parte reactiva es el anillo de nicotinamida. Su forma reducida es el NADH. El
dinucletido adenina de flavina, FAD (forma oxidada) y FADH2 (forma reducida) cuya parte reactiva
es el anillo de isoaloxazina.
Utilizados para la biosntesis reductora, como el dinucletido adenina fosfato de nicotinamida
(NADPH) que es un donador de electrones. El NADPH es exclusivo para biosntesis reductoras,
mientras que el NADH se utiliza principalmente para la generacin de ATP.
Coenzimas transferidoras o vehculos de fragmentos de dos carbonos.- La coenzima A, es un
transportador de grupos acilo. Su parte reactiva es el grupo sulfihidrilo terminal del CoA. Los grupos
acilo se unen a la CoA mediante un enlace tioster, donde el derivado se llama acil-CoA.
Coenzimas transferidoras o vehculos de grupos fosforilo.- Como el ATP.
24
Termodinmica de los seres vivos

Las clulas vivas realizan trabajo constantemente. Necesitan de energa para mantener sus
estructuras altamente organizadas, sintetizar sus propios componentes celulares, entre otros
procesos. Las transformaciones biolgicas de energa obedecen las leyes de la
Termodinmica.
Todas las reacciones qumicas estn influenciadas por dos fuerzas:
La entalpa (H).-Es el contenido calrico del sistema reaccionante. Indica el nmero y clase de
enlaces qumicos en los reactivos y productos. Si una reaccin libera calor es exotrmica (el
contenido calrico de los productos es menor que los reactivos). Los sistemas que toman calor del
entorno son endotrmicos.
La entropa (S).- Expresa el desorden de un sistema. Si los productos de una reaccin son menos
complejos y ms desordenados que los reactivos, se dice que la reaccin transcurre con ganancia de
entropa.
Los sistemas biolgicos tienden a adquirir el estado de enlace ms estable y mayor grado de
desorden.
La fuerza impulsora neta de una reaccin es G, la variacin de energa libre, que representa el
efecto neto de las dos fuerzas descritas anteriormente: G= H- T S.
Las reacciones de una va metablica se pueden ver segn sus necesidades termodinmicas:
G GRANDE Y NEGATIVA La reaccin transcurre en el
sentido (EXERGNICAS)
G=0
EL SISTEMA EST EN
EQUILIBRIO
G GRANDE Y POSITIVA La reaccin transcurre en el

sentido opuesto
(ENDERGNICAS)
REACCIONES CERCANAS AL EQUILIBRIO (G cercano a cero).- Son consideradas
reversibles, la actividad de las enzimas que catalizan estas reacciones es alta y dependen de la
relacin de las concentraciones de sustrato y producto, por tanto, la direccin de la reaccin
depende de los cambios en las concentraciones de sustrato y producto. La mayora de las
reacciones de una va metablica se encuentran cercanas al equilibrio. Este tipo de reacciones no
suelen ser el paso limitante de la va metablica.
REACCIONES CON G GRANDES Y NEGATIVOS.- Son irreversibles, las enzimas son
alostricas y poco sensibles a los cambios en las concentraciones de sustrato y producto. Las
reacciones alejadas del equilibrio suelen ser las que regulan la va metablica.
Las variaciones de energa libre son aditivas; la reaccin qumica neta que resulta de dos
reacciones sucesivas que comparten un intermediario comn tiene una variacin de energa libre
global que es la suma de los valores de G de las reacciones individuales.
25
Termodinmica de los compuestos fosforilados

El ATP constituye un compuesto que es generado o usado por el catabolismo y anabolismo,
respectivamente. Es considerado la moneda energtica de la clula.
La hidrlisis de ATP o de un compuesto fosforilado es una reaccin comn para obtener energa. La
variacin de energa libre en la hidrlisis del ATP es grande y negativa. La base qumica de
sto obedece a que la hidrlisis es favorable, porque los productos son ms estables (menor
contenido de energa) que los reactivos. De acuerdo a esto, los compuestos fosforilados son
compuestos fosforilados de alta energa.
Adems de los compuestos fosforilados, los tiosteres tambin presentan un alto valor de G de
hidrlisis. Cada compuesto celular fosforilado posee un valor de G de hidrlisis diferente,
siendo el ms grande y negativo el correspondiente al fosfoenolpiruvato.
Importancia de los diferentes valores de G de los compuestos fosforilados. A partir de la aditividad

de las variaciones de energa libre de las reacciones secuenciales, cualquier compuesto fosforilado
puede sintetizarse acoplando esa sntesis al rompimiento de otro compuesto fosforilado con una
energa de hidrlisis ms negativa.
26
IV. GLUCLISIS
Los carbohidratos (hidratos de carbono) son aldehdos o cetonas con dos o ms grupos hidroxilos
(C-H2O)n. Los carbohidratos forman la mayor parte de la materia orgnica de los seres vivos y
participan en una amplia diversidad de funciones celulares; entre ellas, como fuente y reserva
importante de energa. La energa de los carbohidratos se obtiene a partir de su oxidacin, de
este proceso se obtienen molculas con alto contenido energtico como es el ATP. Tal es el caso
de la glucosa, en la va catablica conocida como gluclisis.
La gluclisis es la oxidacin parcial de la glucosa hasta la obtencin de piruvato (VA
CATABLICA).
En condiciones aerobias, se realiza la oxidacin total de la glucosa hasta obtener CO2 (respiracin
celular). Para dicho proceso se necesitan tres vas: gluclisis, Ciclo de Krebs y fosforilacin
oxidativa. Con la oxidacin total de la glucosa durante la respiracin celular se obtiene un gran
nmero de molculas de ATP. En condiciones anaerobias, el piruvato se reduce a lactato o a
etanol.
A la gluclisis la podemos resumir en la siguiente ecuacin:
Glucosa + 2ATP + 4ADP + 2Pi + 2NAD+ 2 cido pirvico + 2ADP + 4ATP + 2NADH + 2H+ +
2H2O
En sta observamos que hay una produccin de 4 ATP por cada glucosa, sin embargo hay que
considerar que se necesitan 2 molculas de ATP para activar e iniciar la gluclisis, por lo tanto que la
ganancia neta real de la oxidacin de la glucosa a piruvato es de 2ATP.
La gluclisis se lleva acabo en el citosol y consiste en 10 reacciones enzimticas agrupadas en 2
fases:
FASE I.- Activacin de la glucosa por fosforilacin. En esta etapa se invierte energa (2
molculas de ATP) y sucede la hidrlisis de una hexosa (fructosa) para la formacin de dos triosas
fosfato (gliceraldehdo fosfato y dihidroxiacetona fosfato).
FASE II.- Sntesis de molculas con alto contenido energtico. En esta etapa se forma energa
(ATP; 1,3-bifosfoglicerato; fosfoenolpiruvato). Especficamente, en esta etapa se llevan a cabo dos
fosforilaciones a nivel de sustrato (reacciones 7 y 10), las cuales se basan en obtener molculas de
ATP a partir de compuestos de elevado contenido energtico (el 1,3-bifosfoglicerato y el
fosfoenolpiruvato) que se sintetizaron en la va metablica. Los G de hidrlisis de los grupos
fosfato contenidos en 1,3-bifosfoglicerato y fosfoenolpiruvato son mayores (-11.8 kcal/mol y 14.8 Kcal/mol respectivamente) a la del ATP (-7.3 kcal/mol); esta propiedad hace
termodinmicamente favorable que a partir de estos compuestos se transfiera un grupo fosfato al
ADP y produzca ATP.
27
La gluclisis est integrada por 10 reacciones catalizadas enzimticamente. Las estrategia de la va

es la de ir extrayendo secuencial y exhaustivamente electrones de la molcula de 6 carbonos que es
rica en hidrgenos (la glucosa). Los electrones son aceptados por la coenzima NAD+. Acopladamente
a estas oxidaciones se lleva a cabo primero la inversin de energa suministrada en forma de ATP,
misma que luego es recuperada con un incremento. Al final se generan dos molculas de 3C muy
oxidadas.
28
El NADH formado en la gluclisis debe ser regenerado a NAD+, para reciclarse, pues es una
coenzima que se utiliza activamente en mltiples reacciones del metabolismo.
Esta regeneracin puede ocurrir en dos condiciones:
Condicin Aerbica.- Durante la fosforilacin oxidativa.
Condicin Anaerbica.- en la fermentacin lctica (en mculo, eritrocitos o bacterias) o en la
fermentacin alcohlica (en levadura y otros microorganismos)
Piruvato
PIRUVATO
DESCARBOXILASA
Acetaldehdo
DESHIDROGENASA
LCTICA
Alcohol
deshidrogenasa
Etanol
29
La gluclisis se regula por la funcin de 4 enzimas. Tres de ellas: hexocinasa, fosfofructocinasa

1 (PFK1) y piruvato cinasa, sintetizan metabolitos que son parte de la va metablica y una cuarta
enzima bifuncional conocida como fosfofructocinasa 2/fosfofructosa bisfosfatasa 2
(PFK2/FBPasa2) que sintetiza a la fructosa 2,6-bisfosfato, un regulador alostrico.
Enzimas
reguladoras
de
la gluclisis
Sustrato
Hexocinasa
(todos los
tejidos)
Glucosa
Producto
Regulador
alostrico
positivo
(incrementa
la actividad de
la enzima)
Glucosa 6-fosfato
Glucocinasa
(slo
hgado)
Fructosa 6-fosfato
Fosfofructo
cinasa 1
(PFK1)
Piruvato
cinasa
Fructosa 1,6bifosfato
Fosfoenolpiruvato
Regulador
alostrico
negativo
(reduce la
actividad de la
enzima)
Glucosa 6fosfato (la
glucocinasa
No se inhibe
por su
producto)
Regulacin
por
fosforilacin
Fructosa 2,6- ATP, citrato

bifosfato*,
AMP
Fructosa
bifosfato
1,6- ATP, alanina
S; reduce su
actividad.
Piruvato
* Es el producto de la actividad de la Fosfofructocinasa 2 (PFK2).
La formacin de fructosa 2,6-bisfosfato por la PFK2/FBPasa2 favorece la gluclisis, ya que este
metabolito es un regulador alostrico de la fosfofructocinasa 1 . Asimismo, la PFK2/FBPasa2 se
regula por modificacin covalente, la fosforilacin del dominio de cinasa resulta en la inhibicin
del enzima ; por tanto, no se genera fructosa 2,6-bisfosfato y se inhibe la gluclisis.
Las condiciones energticas de la clula tambin determinan el grado de actividad de estas
enzimas, ya que el incremento de molculas con alto contenido energtico como ATP, citrato o
alanina llevan a cabo un efecto inhibitorio sobre la actividad de las enzimas que regulan la gluclisis
(ver Tabla).
30
V. GLUCONEOGNESIS
La gluconeognesis es la va metablica que se encarga de sintetizar glucosa a partir de
componentes carbonados diferentes a los carbohidratos como glicerol, aminocidos, cidos
grasos y lactato.
La va de la gluconeognesis a partir de piruvato tiene 13 reacciones enzimticas, 7 de las
enzimas que participan en esta va tambin son parte de la va de la gluclisis y 4 son exclusivas de
la va: piruvato carboxilasa, fosfoenolpiruvato carboxicinasa, fructosa 1,6-bisfosfatasa y
glucosa 6 fosfatasa.
La ecuacin estequiomtrica de la gluconeognesis es la siguiente:
2 piruvato +4ATP + 2GTP +2NADH +6 H2O glucosa + 4ADP +2GDP + 6Pi+ 2NAD+ + 2H+
Hay que recordar que en la va de la gluclisis existen tres enzimas (hexocinasa,

fosfofructocinasa 1 (PFK1) y piruvato cinasa) que hacen reacciones irreversibles e impiden que
la sntesis de glucosa se lleve a cabo a travs de ellas (ver gluclisis pasos 1,3 y 10). Por lo tanto,
para la sntesis de glucosa son necesarias las enzimas piruvato carboxilasa, fosfoenolpiruvato
carboxicinasa, fructosa 1,6 bisfosfatasa y glucosa 6 fosfatasa, que a su vez son las responsables
de las reacciones limitantes de la gluconeognesis, ya que tres de las reacciones irreversibles de
la va estn dadas por estas enzimas (pasos 1,11 y 13).
31
A diferencia de la gluclisis, en la cual todas las reacciones se llevan a cabo en el citosol, en la

gluconeognesis algunos de los pasos se realizan en mitocondria y en retculo endoplsmico,
especialmente dos de los pasos que regulan a la va (paso 1 y 13).
REGULACIN DE LA
GLUCONEOGNESIS
La gluconeognesis y la gluclisis
Glucosa
estn coordinadas recprocamente,
Gliclisis
Gluconeognesis
de modo tal que una de las vas est
parcialmente inactiva mientras que la
Fructuosa 6-fosfato
otra est a su mxima actividad.
+ F-2,6-BF
- F-2,6-BF
AMP
Al igual que en la gluclisis existen
+
Fructuosa
- AMP
Fructuosa
varios
metabolitos
que
regulan
quinasa
1,6 bisfofatasa
- Citrato
+ Citrato
alostricamente a las enzimas clave
- ATP
de la gluconeognesis, ya sea para
H+
Fructuosa 1,6 bifosfato
activar (citrato, acetil-CoA) o reducir
la funcin (ADP, AMP) de esta va.
Es interesante hacer notar que los
ADP fosfoenolpiruvato
componentes que activan a las
+ F-2,6-BF
Fosfoenolpiruvato
piruvato carboxicinasa
enzimas
reguladoras
de
la
Oxalacetato
- ATP
quinasa
gluconeognesis
inhiben
a
las
enzimas
piruvato
Alanina
reguladoras de la gluclisis (fructosa
carboxilasa Acetil-CoA +
piruvato
ADP 2,6-bisfosfato, citrato). Por ejemplo la
fructosa 2,6-bisfosfato, producto de
la PFK2, inhibe la funcin de la fructosa 1,6 bisfosfatasa (gluconeognesis) e incrementa la
funcin de fosfofructocinasa (PFK1), de esta manera se favorece la produccin de fructosa 1,6bisfosfato, a la vez que se evita la degradacin de sta molcula, siendo una estrategia que acta a
favor de la gluclisis.
Tambin los metabolitos que regulan la actividad de las enzimas limitantes de la gluclisis y
gluconeognesis estn relacionados con las condiciones energticas de las clulas. Es decir en
presencia de metabolitos energticamente ricos, como es el ATP y alanina, reducen la funcin
de la gluclisis, indicndonos que
en la clula el aporte energtico
EN EL HGADO
EN EL MSCULO
est cubierto y no es necesario
Glucosa
Glucosa
producir ms de estas molculas.
De igual forma metabolitos que
2-P
S
indican
una
baja
en
la
6-P
concentracin de molculas ricas
A
de energa (AMP y ADP) bloquean
N
la
sntesis
de
glucosa
Piruvato
Piruvato
G
(gluconogenesis), indicando que
en esos momentos la clula no
R
necesita almacenar compuestos
E
con alto contenido energtico, sino
al contrario necesita usarlos para
Lactato
restablecer su equilibrio energtico.
Regulacin reciproca de la gluconeognesis y gliclisis en hgado
Lactato
Por otra parte, en condiciones de

alta demanda energtica, como es
hacer un ejercicio extremo, el
msculo cubre sta demanda por la rpida formacin de molculas de ATP al transformar la
glucosa a piruvato y ste a lactato. Para recuperar la energa almacenada en el lactato, ste sale
del msculo esqueltico a torrente sanguneo para llevarlo al hgado, en donde el lactato ser
32
retransformado a glucosa por medio de la va de la gluconeognesis. La glucosa formada en el

hgado ser liberada nuevamente a torrente sanguneo para abastecer nuevamente las necesidades
energticas del msculo a este proceso se le conoce como Ciclo de Cori.
En el ser humano as como en diferentes especies animales, la gluclisis y gluconeognesis estn
reguladas por transduccin de seales inducidas por insulina y glucagon, con la finalidad de
mantener los niveles de glucosa en sangre adecuados, ya que es utilizada para abastecer las
demandas energticas de los diferentes rganos.
Efecto de la insulina en la concentracin de glucosa en sangre:

Captacin de glucosa y almacenamiento como triacilglicridos y
glucgeno.
Efecto Metablico
Protena Blanco
Captacin de Glucosa (msculo, adipocitos)
Transportador de glucosa GLUT4
Captacin de Glucosa (hgado)
Aumento de la expresin glucocinasa
Sntesis de glucgeno (hgado y msculo)
Glucgeno sintetasa
Degradacin de glucgeno (hgado, msculo)
Glucgeno fosforilasa
Gluclisis, acetil-CoA (hgado y msculo)
Fosfofructuosa 1 (PFK-1) y PFK2

Piruvato deshidrogenasa
Sntesis de cidos grasos (hgado)
Acetil-CoA carboxilasa
Sntesis de triglicridos (tejido adiposo)
Lipoproten-lipasa
Efecto del glucagon en la regulacin de la concentracin de

glucosa en sangre: Produccin y liberacin de glucosa del hgado
Efecto Metablico
Protena Blanco
Degradacin de glucgeno
(hgado)
Glucgeno fosforilasa
Sntesis de glucgeno (hgado)

Gluclisis (hgado)
Gluconeognesis (hgado)
Movilizacin de cidos grasos
Efecto en el metabolismo
de glucosa
Glucgeno sintetasa
PFK1
Fructuosa bisfosfatasa-2
Piruvatocinasa
Fosfoenolpiruvato
carboxicinasa
Glucgeno
Glucosa
Glucosa almacenada como

glucgeno
Glucosa usada como fuente de
energa en el hgado
Aminocidos
Glicerol
glucosa
Oxalacetato
glucosa usada como fuente de
energa en el hgado
Triacilglicero lipasa
Cetognesis
Acetil-CoA carboxilasa
33
Provee fuentes de energa

alternativas a la glucosa
VI. VA DE LAS PENTOSAS FOSFATO

La va de las pentosas fosfato provee a la clula de ribosa y nicotinamida adenina dinucletido
fosfato (NADPH) necesarios para varios procesos celulares biosintticos o de desintoxicacin.
NADPH R= PO32NADH
R= H
Vas metablicas que requieren NADPH
Sitio reactivo
Sntesis (anabolismo)
Biosntesis de cidos grasos
Biosntesis de colesterol
Biosntesis de neurotransmisores
Biosntesis de Nucletidos
Desintoxicacin
Reduccin de glutatin oxidado
Citocromo P450 monoxigensas
Esta va est formada por 7 reacciones enzimticas, las cuales las podemos dividir en dos fases: fase
oxidativa y no oxidativa.
En la fase oxidativa se lleva a cabo la oxidacin de glucosa perdiendo un carbono como CO2 y
dando como producto final a la ribulosa-5-fosfato. Durante esta fase se obtienen 2 molculas de
la coenzima reducida NADPH.
En la fase no oxidativa se obtiene ribosa-5-P, carbohidrato importante para la sntesis de cidos
nucleicos, as como dos de los intermediarios de la va de la gluclisis: fructosa-6-fosfato y
gliceraldehdo-3-fosfato.
A continuacin se ilustra el esquema de la va completa.
34
VA DE LAS PENTOSAS FOSFATO. Se indican las fases oxidativa y no oxidativa
La va de las pentosas fosfato es muy verstil, de tal forma que se puede llevar a cabo en
modalidades que favorecen la sntesis de algunos de sus productos sobre la de otros, lo cual est
directamente relacionado con las necesidades metablicas celulares. En forma general trabaja en 4
modalidades que se resumen en la siguiente figura:
35
Modalidad 1
Modalidad 2
Glucosa
6 fosfato
Se requiere ms ribosa 5
fosfato que NADPH.
Las necesidades de ribosa y NADPH estn equilibradas

fructuosa
6 fosfato
Divisin celular, sntesis

de nucletidos
Ribosa
5 fosfato
2NADP+
fructuosa
1,6 bifosfato
2NADPH
Glucosa
6 fosfato
Ribulosa
5 fosfato
CO2
Dihidroxiacetona
fosfato
5 Glucosa 6P + ATP
6 Ribosa 5P + ADP + H+
2NADP+
Modalidad 3
sntesis de
cidos grasos
5 Glucosa 6P + 2NADP+ + H2O
2NADPH
2NADPH
Ribulosa
5 fosfato
Glucosa
6 fosfato
CO2
fructuosa
6 fosfato
Ribosa 5P + NADPH + 2H+ + CO2

2NADP+
Modalidad 4
Ribulosa
5 fosfato
Glucosa
6 fosfato
Se requiere ms
NADPH que
ribosa 5 fosfato.
Ribosa
5 fosfato
Gliceraldehdo
3 fosfato
Se requiere ms
NADPH y ATP
Ribosa
5 fosfato
fructuosa
1,6 bifosfato
CO2
fructuosa
6 fosfato
Ribosa
5 fosfato
fructuosa
1,6 bifosfato
2 ATP
Dihidroxiacetona
fosfato
Glucosa 6P + 12 NADP+ + 7H2O
Gliceraldehdo
3 fosfato
Dihidroxiacetona
fosfato
6 CO2 + 12NADPH + 12H+ + Pi
3 Glucosa 6P + 6 NADP+
+ 5NAD+ + 5Pi + 8ADP
Gliceraldehdo
3 fosfato
Piruvato
5 piruvato + 3 CO2 +
6 NADPH + 5NADH +
8 ATP + H2O + 8 H+
El paso limitante de la va es la oxidacin de la glucosa-6-fosfato a 6-fosfogluconato--lactona por la

enzima glucosa 6 fosfato deshidrogenasa. Dicha enzima se regula por la relacin en la
concentracin de la coenzima oxidada y reducida del nicotinamida adenina dinucletido fosfato
(NADP+/NADPH); favoreciendo a la va las altas concentraciones de la coenzima oxidada (NADP+).
El efecto inhibidor por las bajas concentraciones de NADP+ se ve potenciado por la competencia del
NADPH al sitio de unin del NADP+ en la glucosa 6 fosfato deshidrogenasa. El control de la etapa
no oxidativa de la va depende de la disponibilidad de sustratos.
36
VII. CICLO DEL CIDO CTRICO (CICLO DE KREBS O CICLO DE LOS CIDOS
TRICARBOXLICOS)
El Ciclo del cido ctrico oxida al acetil-CoA hasta dos molculas de CO2 conservando la energa
libre para la generacin de ATP a travs de la formacin de 3 NADH, 1 FADH2 y 1 GTP. Este ciclo
se lleva a cabo dentro de la mitocondria de organismos eucariontes y en el citosol de los
procariontes.
El acetil-CoA que alimenta a este ciclo proviene de la degradacin de los carbohidratos, de los
cidos grasos y de los aminocidos. El acetil-CoA es un compuesto de alta energa que se
genera a partir del piruvato (producto de la gluclisis) a travs del complejo multienzimtico de la
piruvato deshidrogenasa (PDH). La PDH cataliza la oxidacin y descarboxilacin del piruvato.
Esta reaccin es muy exergnica, por lo que est altamente regulada. La PDH se inhibe por sus
productos: el NADH y el acetil-CoA. En eucariontes, la PDH tambin se inhibe por la fosforilacin
catalizada por la PDH cinasa.
TIOSTER
Piruvato
+ CoA -SH + NAD
ENTRA A MITOCONDRIA
POR SIMPORTE PIR-H+
Acetil -S -CoA + NADH + H+ + CO 2

PirDesh (mit)
Complejo multienzimtico
+
OXIDACIN DESCARBOXILACIN
G0= -33.5 kJ mol-1

El Ciclo de Krebs se integra por 8 reacciones enzimticas:
La citrato sintasa condensa el acetil-CoA (2C) y el oxaloacetato (4C) para generar un

compuesto de 6C, el citrato. El citrato se isomeriza en isocitrato por medio de la aconitasa, que
es un compuesto que se oxida con mayor facilidad. La isocitrato deshidrogenasa cataliza la
oxidacin del isocitrato a -cetoglutarato (5C) junto con la primera descarboxilacin y
generacin de NADH del ciclo. El -cetoglutarato sufre una segunda oxidacin y
37
descarboxilacin catalizada por la -cetoglutarato deshidrogenasa y se genera succinil-CoA

(4C). La succinil-CoA sintetasa hidroliza al succinil-CoA y cataliza la fosforilacin a nivel de
sustrato del GDP en GTP, liberando CoA. La succinato deshidrogenasa con FAD como
cofactor oxida al succinato en fumarato. ste se hidrata por la fumarasa para formar malato.
Finalmente, la malato deshidrogenasa oxida al malato en oxaloacetato y genera la ltima
molcula de poder reductor, el NADH. El oxaloacetato (4C) vuelve a iniciar el ciclo condensndose
con otro acetil-CoA.
BALANCE DEL CICLO DE KREBS.
El balance de sustratos y productos del Ciclo de Krebs por cada molcula de Acetil-CoA que entra
al Ciclo es:
Acetil-CoA +3H2O +3NAD+ +FAD+ ADP +Pi

2CO2 +3NADH +3H+ +FADH2 +ATP +1CoA-SH
Se puede observar que es un proceso que contina la oxidacin de molculas como la glucosa,
en el que los Carbonos se pierden en su forma totalmente oxidada como CO2. En el transcurso de
las reacciones de la va, los electrones se recuperan como poder reductor (NADH y FADH2), se
gana ATP y se regenera a la coenzima ACARCTER ANFIBLICO DEL CICLO DEL CIDO CTRICO
Piruvato
aa
AcetilCoA
1. Ac. Grasos
Colesterol
Oxaloacetato
3. Glucosa
Citrato
Malato
Asp,
Phe,
Tyr
isocitrato
Fumarato
NAD+
Succinato
4. porfirinas
Succinil-CoA
NADH
oxalosuccinato
Iso, Met, Val

Ac. Grasos (non)
CO2
NADH
NAD+
CoASH
-cetoglutarato
CO2
2. aa
El ciclo del cido

ctrico es catablico
porque incluye
reacciones de
oxidacin y
conservacin de la
energa en forma de
poder reductor
(NADH y FADH2). Sin
embargo, el Ciclo
provee intermediarios
para sostener la
biosntesis de
molculas (indicadas
en rojo en la figura).
Por lo que tambin es
un ciclo anablico.
Por lo tanto, el ciclo
del cido ctrico se
considera anfiblico.
Las reacciones anaplerticas son aquellas que reabastecen al Ciclo de aquellos intermediarios
que han sido utilizados. Por ejemplo:
Piruvato + HCO - +ATP

3
oxaloacetato
+ADP+ Pi +H +
Piruvato carboxilasa
PRINCIPALES INTERMEDIARIOS DEL CICLO DE KREBS QUE SON UTILIZADOS EN LA

BIOSNTESIS DE OTROS COMPUESTOS
Estos intermediarios son: citrato, -cetoglutarato, oxaloacetato ymalato. Se revisa a continuacin
cada caso.
El citrato es el precursor de la sntesis de los cidos grasos y del colesterol. La sntesis de estos
compuestos inicia en el citosol con acetil-CoA. Por sto, el citrato primero debe salir de la
mitocondria.
38
1. Ac. Grasos
Colesterol:
Citrato (mitocondria)
Citrato(citosol) + ATP +CoA
ADP + Pi +oxaloacetato+ AcetilCoA
ATP-citrato liasa
Despus, la ATP-citrato liasa cataliza la ruptura del citrato. Los productos son oxaloacetao y acetilCoA. El ltimo se utiliza para iniciar la sntesis de los cidos grasos y el colesterol.
El -cetoglutarato y el oxaloacetato son precursores biosintticos de diversos aminocidos. Por
ejemplo, el glutamato proviene de la aminacin reductora del -cetoglutarato por la glutamato
deshidrogenasa.
-cetoglutarato + NADPH + NH4 +
Glutamato deshidrogenasa
Glutamato + NADP+ + H20
Asimismo, el -cetoglutarato y el oxaloacetato pueden generar diferentes aminocidos por

transaminacin.
ccetoglutarato + alanina
glutamato + piruvato
transaminasas
oxaloacetato + alanina
aspartato + piruvato
El malato es un precursor gluconeognico. Primero debe salir de la mitocondria al citosol. Aqu, la

malato deshidrogenasa citoslica lo transforma en oxaloacetato, que alimenta a la va
gluconeognica.
Malato ( mit )
Malato( cit )
oxaloacetato
Glucosa
Malato
GLUCONEOGNESIS
deshidrogenasa
REGULACIN DEL CICLO DEL CIDO CTRICO
En la figura anterior se muestran las enzimas reguladoras del Ciclo del cido ctrico. Todas estas
reacciones tienen un G negativo, que en conjunto con las dems reacciones le confieren al
Ciclo un G global de -40 kJmol-1. Estas enzimas se regulan:
por disponibilidad de sustrato
acetil-CoA y oxaloaxetato para la citrato sintasa
por inhibicin por producto
Citrato para la citrato sintasa, NADH y succinil-CoA para

la -cetoglutarato deshidrogenasa
por retroinhibicin competitiva
Succinil-CoA compite con el acetil-CoA por la citrato

sintasa
por alosterismo
El ADP activa a la isocitrato deshidrogenasa

39
40

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I. ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS PROTENAS

ESTRUCTURA GENERAL DE AMINOCIDOS PROTEICOS.

(Ver hoja anexa de estructuras de los 20 aminocidos)

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LOS 20 AMINOCIDOS ESTN AGRUPADOS EN 4 CLASES SEGN SU GRUPO R

LATERALES QUE SON

Con grupo R polar, cargado +

PESO, FORMA, ESTRUCTURA

QUMICA, CARGA ELCTRICA

Con grupo R polar, no cargado

AQU SE LES PRESENTA

Con grupo R polar, cargado -

Forma que predomina

CH2 CH2 COOH

Forma que predomina

CH2 CH2 COO-

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(Sin embargo, hay aminocidos

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PRIMARIA SECUNDARIA TERCIARIA

Formacin de uniones peptdicas entre 4 aminocidos:

Ejemplo de 4 Aminocidos unidos por enlaces peptdicos

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* 3.6 aminocidos por vuelta (5.4Ao)

* Los grupos R se encuentran hacia fuera de la hlice

Es una forma de estructura

Tiene una disposicin planar en el

Las cadenas pueden correr en forma

Los grupos R se encuentran hacia

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Desnaturalizacin. Es la prdida de la estructura nativa de una protena y por tanto de su

Los agentes desnaturalizantes ms usados en el anlisis de protenas son:

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FUNCIONES DE PROTENAS. EJEMPLOS

B) FUNCIN DE UNIN DE LIGANDOS.- MIOGLOBINA Y HEMOGLOBINA (QUE UNEN

Conformacin de las dos cadenas

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FUNCIONES DE PROTENAS. EJEMPLOS.

Cofactor (no en todas las enzimas)

Funcin de los cofactores. Contribuyen con

* Regin tridimensional de la protena

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LAS ENZIMAS FACILITAN LA FORMACIN DEL ESTADO DE TRANSICIN, LO CUAL RESULTA

Reaccin catalizada no enzimticamente

Reaccin catalizada enzimticamente

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REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA

DOS EJEMPLOS DE FORMAS DE REGULACIN DE LA ACTIVIDAD DE LAS ENZIMAS:

REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA

Ligando o efector o regulador

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II. ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS MEMBRANAS

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enlace tipo ester

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Esteroles.- Estn formados por un ncleo de ciclopentanoperhidrofenantreno, una cadena lateral

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La estructura membranal consiste de

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