Mestrado em Informtica Mdica - FMUP / FCUP

TRACTOGRAFIA
POR RESSONNCIA
MAGNTICA
- Processamento de Sinal e Imagem -

Ana Filipa Dourado

Vtor Silva
- 6 Junho 2008 -

Outline / Sumrio:
Introduo ao Tema;
Breve abordagem antomo-fisiolgica cerebral;
Princpios de formao de imagem por RM;
Conceito de Difuso;
Tensor de Difuso por RM;
Tcnicas de Processamento de imagem para
visualizao do tensor difuso e Tractografia;
Aplicaes;
Concluso.

Introduo:
O estudo das vias nervosas presentes na substncia
branca so essenciais para o diagnstico e o entendimento
de patologias como por exemplo: distrbios da linguagem,
da aprendizagem e da fala;
Recentemente surgiu uma tcnica de imagem de estudo
destas vias (primeiro estudo por Basser, 1994), no
invasiva, que tem motivado neurologistas, neurocirurgies e
neurocientistas para um maior entendimento do
funcionamento cerebral. Trata-se da imagem por tenso
difusional ou DTI;
Esta aplicao tambm tem sido usada recentemente na
avaliao das fibras do miocrdio.

Introduo ao Tema:
A tcnica de tractografia por ressonncia
magntica avalia as fibras nervosas
atravs dos traos da difuso da gua
representada por um tensor, com a unio
de pontos e formando a imagem de uma
via nervosa;

A tcnica de tractografia por RM no

demonstra fibra a fibra mas sim um
conjunto delas, indicando possveis
trajectos nervosas pela substncia branca.

Anatomia Cerebral:

Imagens retiradas de Virtual Hospital (www.vh.org)

Crebro Humano:
Crebro humano imvel e representa 2% do
peso corporal;
Tem 2 hemisfrios (corpo caloso a dividi-los);
Composto por milhes de neurnios;
Distino de substncia cinzenta (crtex
cerebral - neurnios) de substncia branca (esta
composta pelas fibras dos axnios);
Dividido em lobos cerebrais.

Neurnio:
Corpo celular (um nico
ncleo);
Dendrites (numerosos,
curtos, ramificados, no
tm bainha de mielina);
Axnio
(extenso
citoplasmtica
alongada);
possui
mielina.

Camada de Mielina:
Hiptese preferida para explicar a
anisotropia da difuso em tecidos
cerebrais.
Tem
permeabilidade
limitada,
restringindo a difuso perpendicular
direco das fibras;

Aumentou o interesse em estudos

relacionados
a
doenas
(desmielinizao) e maturao da
substncia branca;
Como consequncia,
mielinizadas
devem
isotrpicas;

fibras
ser

nomais

Princpios Fsicos da RM:

Mtodo de imagem que consiste em gerar
imagens seccionais do corpo humano;
Tem como base a interaco de um elevado
campo
magntico
com
pulsos
de
radiofrequncia e com os ncleos dos tomos
que constituem o corpo humano.

Princpios Fsicos da RM:

Os ncleos em IRM, devem possuir
um momento angular , ou spin
diferente de zero;
Na presena de um campo
magntico, o ncleo em causa
descrever um movimento de acordo
com este - precesso;

O ncleo de hidrognio a base da

IRM, no s pela sua elevada
abundncia no corpo humano , mas
tambm
porque
tem
elevada
sensibilidade magntica.

http://static.hsw.com.br/gif/mri-top.gif

Princpios Fsicos da RM:

Aps a colocao do paciente
num
campo
magntico
externo, potente e uniforme, os
protes de hidrognio tendem
para se orientar:
Paralelamente ao campo ( estado
de equilbrio);
Anti-paralelamente ao campo
(estado de excitao).
http://static.hsw.com.br/gif/mri-difference.gif

Formao da Imagem:
O sinal de ressonncia magntica,
captado pelas antenas, vai ser localizado
e codificado atravs dos gradientes, no
espao K (representao dos dados
brutos);
Posteriormente, o sinal recontrudo
atravs da transformada de Fourier em
imagem.

Difuso:
Fenmeno de transporte
movimentao molecular;

ocasionado

por

Esta movimentao causada pela energia

cintica das molculas;
influenciada por vrios factores: temperatura,
peso molecular, meio, presena de barreiras;
A sua restrio capaz de fornecer informaes
estruturais sobre o meio.

Difuso:
Responsvel
pelo transporte
passivo entre as
membranas
celulares.

http://www.passeiweb.com/na_ponta_lingua/sala_de_aula/biologia/imagens/impulso_nervoso.jpg

Movimento /
Difuso Browniana:
A agitao molecular aleatria, irregular e contnua
ocasionada por colises entre as molculas;
Este movimento microscpico d origem ao fenmeno
macroscpico da difuso.

Movimento /
Difuso Browniana:
Difuso molecular tem como base os
movimentos
brownianos
das
molculas (energia trmica do
sistema).
ONDE:
D = coeficiente de difuso;

t = tempo permitido para a

difuso.

Tipos de Difuso:
ISOTRPICA

ANISOTRPICA

Estrutura e propriedades da
difuso so as mesmas em
todas as direces;
Probabilidade difuso a
mesma
em
todas
as
orientaes;
Exemplos: copo de gua,
substncia cinzenta cerebral.

Na presena de barreiras, as
propriedades da difuso so
dependentes da direco em
que so medidas;
Exemplos:
cristais,
fibras
nervosas.

Anisotropia da Difuso nos

Tecidos Biolgicos:
Movimento da gua nos tecidos;
Mais rpida numas direces que outras;

Anisotropia: taxa da difuso depende da direco.

Esta pode indicar tractos (fibras) nervosas.

Coeficiente /
Anisotropia da Difuso nos Tecidos
Biolgicos Cerebrais:
Valor do coeficiente de difuso depende
directamente na direco relativa das fibras e
campo magntico usado, conhecida como
difuso anisotrpica;
Difuso da gua isotrpica na substncia
cinzenta;
Pelo contrrio, na substncia branca
extremamente anisotrpica, dependendo da
orientao das fibras nervosas e na direco
de gradiente aplicada em cada localizao
espacial da imagem;

in
Denis Le Bihan et al.
Diffusion and Perfusion Magnetic Resonance Imaging, Applications to
Functional MRI
Editor: Denis Le Bihan; Raven Press 1995

Parece que os coeficientes de difuso

diminuem significativamente quando as fibras
de mielina so perpendiculares direco do
gradiente usado para medir as movimentaes
moleculares.

Imagem
Tensorial da Difuso:
Difuso local representada
distribuio Gaussiana em 3D;

por

uma

Tensor um modelo matemtico da anisotropia

direccional da difuso;
Determinado em cada voxel, resolvendo um
sistema de equaes;
DTI mede o Coeficiente Aparente de Difuso
em, pelo menos, 6 direces diferentes e
calcula o tensor de difuso.

Tensor Difuso:
Abstraco
matemtica das
elipsides
chamada de tensor.
Tensores
expressam
quantitativamente o
deslocamento
mdio das
molculas de gua
nas vrias
direces.

Imagem Tensorial da Difuso

(DTI):
Dxx Dxy Dxz
Representado por
uma matriz
simtrica 3x3

Atravs do tensor, pode-se calcular:

-Direco da melhor difuso;
-Grau de anisotropia;
-Constante / Coeficiente de Difuso
em qualquer direco.

Este tensor difuso definido para

cada voxel numa base 3D.

Dxy
Dxz

D yy
D yz

D yz
Dzz

Tensores
de Difuso e Anisotropia:
DTI permite quantificar a difuso da gua no tecido cerebral.
A difuso em voxel descrito por
3 vectores perpendiculares.

2
3
3
Difuso Anisotrpica
Ocorre quando o
movimento da gua est
restrito a uma direco
primria (fibras
mielinizadas)

Difuso Isotrpica ocorre

quando no h restrio no
movimento da gua
(ventrculos, LCR).

Tensor Difuso das Molculas de

gua:
Difuso Isotrpica vs. Anisotrpica
Difuso mais rpida ao longo das fibras
mais perpendiculares ao campo magntico;
Anisotropia usada para traar as fibras,
estimando a integridade da substncia
branca cerebral.

(v ,
(v ,

Modelo Tensor
vi : Principais direces de difuso
Eigenvector

(v ,

Difuso
Isotrpica

Difuso
Anisotrpica

i : difusividades associadas
Eigenvalue

 DIAGONALIZAO DO TENSOR DIFUSO

Fornece 3 vectores de difuso (eigenvector) com 3 valores
correspondentes (eigenvalue)

Transformar essas equaes em imagens:

Tensor Difuso:
Um tensor composto por 3 vectores;
Pensar num vector como uma seta num espao
3D, que aponta numa direco e tem um
comprimento.

O primeiro vector o mais longo

(aponta no eixo principal);
Os segundo e terceiro so ortogonais
ao primeiro.

Tensor Difuso 3D:

esfrica

linear

planar

ELIPSIDES:representao Gaussiana em 3D; melhor modelo para

representar o tensor difuso.

a imagem de uma esfera unitria sob uma matriz de tensor de difuso.

Em DTI, a anisotropia representada por uma elipside, com um formato
e orientao.

 Mdia de Difusividade (MD):

MD
Tamanho
do
Tensor
3
1

Subst. Branca

Propriedades /
ndices Escalares:

Anisotropia Fraccional (FA):

FA

1
2

LCR

Elevada

)2 (

)2 (

)2

Forma do Tensor

Isotrpica

Baixa

2
1

Difuso
Direccional

Mapas /
ndices Escalares DTI:

Ponderao T2

In:
T2* & FA: Moseley et al. (2002) Brain & Cognition; 50;396-413.
Trace: Molko et al. (2001) Stroke: 32(9) 2049-54

Mapa FA

Mapa Trace
(difusividade)

Propriedades / ndices
Escalares:
MD: magnitude de difuso num voxel;
FA: extenso na qual a difuso est
restringida (avalia a integridade das
fibras).
Substncia Branca Lesionada

Aumento da difuso (MD)

Diminuio da Anisotropia (FA)

DTI elipside
no mnimo 6 direces de difuso
z

Ausncia
de difuso

Elipside representa a magnitude de difuso em todas as

direces.
Direces pela sua distncia do centro da elipside at
periferia.

Tensor Difuso:
Os aparelhos de RM produzem, para um exame de DTI,
uma imagem de referncia e um conjunto de no mnimo
6 imagens correspondentes a diferentes direces de
difuso;
Estas imagens no determinam directamente o tensor
de difuso; os elementos da matriz do tensor de difuso
precisam de ser calculados a partir das imagens
adquiridas. Dos tensores de difuso podem-se construir
alguns tipos de mapas, que so teis para a
interpretao dos exames.

Ferramenta
Aplicacional do DTI:
Referncia Anatmica:
Visualizao 2D e 3D (permitir
reconstruo de imagens)

Ferramenta Aplicacional
Maior
FA
do DTI (ndice
Mtodos
2D:
de

um s corte;
difcil para percepcionar
estruturas como crebro
(volume 3D).

Colorcoding
(Codificao de Cores):
relacionada com os
ndices de anisotropia
(valores escalares):
tabelas LUT (look up
table)

anisotropia)

Menor FA

Ferramenta Aplicacional
do DTI Mtodos 2D:
Colorcoding direco
principal da difuso:
mais usado na prtica
clnica; codificao de
acordo com a direco
do vector principal de
difuso e FA;
Valores absolutos x, y, z
usados com cores
vermelho, verde e azul,
respectivamente (modelo
RGB).

A
H
R

F
P

Ferramenta Aplicacional
do DTI Anlise Quantitativa do DTI:
Permitir visualizar mapas escalares de Anisotropia
Fraccional (FA) e Mdia de Difusividade (MD) e
Coeficiente Aparente de Difuso (ADC).

Ferramenta Aplicacional
do DTI Glyphing:
Os glyphs so cones que representam a informao local
do tensor de difuso.
2D glyphs: podemos ter a impresso que as regies esto
unidas (mas estas conexes s podem ser visveis em 3D)

Ferramenta Aplicacional
do DTI Glyphing:
Dois tipos de glyphs:
- Elipsides;
- Cubides.

Ferramenta Aplicacional
do DTI Mtodos 3D - Glyphing :

PROBLEMA: orientao das fibras no to linear,

podendo haver pontos de bloqueio quando aplicados
em 3D;
Pode-se no avaliar todas as fibras ao aplicar um
nico glyph.

Ferramenta Aplicacional
do DTI Fiber Tracking ou
Streamlines - Tractografia:
Fiber tracking simplifica o campo tensorial a um campo
vectorial de acordo com a direco do vector principal;
Este campo vectorial tornado contnuo pela tcnica de
interpolao;
Traado tangente ao campo vectorial e a trajectria
delineada a fibra ou via nervosa.

Imagem da Elipside
Informao disponvel atravs do DTI

Fibra

Pierpaoli and Basser, Toward a Quantitative Assessment of Diffusion Anisotropy, Magn. Reson. Med, 36, 893-906 (1996)

Ferramenta Aplicacional
do DTI Fiber Tracking Tractografia:
O traado (tracking) pode ser resolvido pela
seguinte integral:

x (t )

e1 (t )dt
t

Para resolver essa integral, utiliza-se a integrao

de segunda ordem de Rugen Kutta.

Ferramenta Aplicacional
do DTI Fiber Tracking :
Direco da
difuso principal

Mori et al, 1999

Ferramenta Aplicacional do DTI

Fiber Tracking, Seed Points (ROI):
Definio manual do ROI, onde as fibras comeam;
Comeo do traado em todos os vxeis, conectando-se estes
entre si aos vizinhos;
Iro unicamente entrar fibras dos ROIs seleccionados
previamente;

Ferramenta Aplicacional do DTI

Fiber Tracking, Seed Points (ROI):

Fiber Tracking
Tractografia:
DT-MRI

Seed Point
ROI

Ferramenta Aplicacional do DTI

Fiber Tracking Tractografia:
CRITRIOS DE PARAGEM:
Quando a anisotropia muito baixa
a definio do vector principal da
difuso no definido com clareza
(pode-se recorrer tcnica de
tresholding do FA, por exemplo,
retirando os valores mais baixos).
Outro critrio pode ser a angulao
das diferentes fibras Tench et al.
definem 10 por 1mm no mximo,
pois poder provocar rudo de
imagem e volume parcial.

VOLUME PARCIAL

Ferramenta Aplicacional
do DTI HyperStreamlines
Tractografia:
Extenso do traado das fibras: tambm demonstram a
direco dos outros dois vectores e no s o principal.

Codificao de cores segundo FA

reas com baixo FA (anisotropia)
so mais grossas, enquanto as que
tm elevado FA so mais finas.

Clustering das Fibras:

Tcnica de processamento de imagem usado nesta modalidade
de imagem, que permite separar determinadas fibras umas das
outras, agrupando-as de acordo com a sua similaridade;
Esta baseada na forma e posio das fibras;
Para calcular a similaridade das vias nervosas a distncia mdia
entre os vizinhos mais prximos, em termos da direco de
difuso dos vectores e ndices escalares, como a FA (encaixe
espectral).

Clustering das Fibras:

Ferramentas
automticas
(aplicao) separam
as fibras com base
na sua forma e
projeco.

Tractografia
das Fibras
Fiber Tracking

Clustering das
Fibras
Fiber Clustering

Paciente normal
As fibras nervosas so representados por faixas de
cores, codificado para indicar a direco da difuso
anisotrpica em feixes nervosos:
Vermelho = esquerda para a direita.
Azul = cima para baixo.
Verde = anterior para posterior.

DTI Volume Rendering:

Sub-rea da
computao grfica.

Gera imagens a partir

de dados
volumtricos.

Efectuado atravs do
mapa FA: torna
possvel a anlise de
dados, para mostrar
informaes do
interior dos volumes e
no apenas das
superfcies.

Aplicaes:
Dimetro e visualizao das fibras nervosas cerebrais
e sua densidade;

Estado da mielinizao na neurognese (recmnascidos);

Grau de (des)mielinizao ao longo da idade e em
casos de doena;
Estudos pr e ps operatrios cerebrais;
Esclerose Mltipla;
Desordens psiquitricas: Esquizofrenia;
Estudo do miocrdio (msculo cardaco).

Aplicaes:

Vista superior das

fibras nervosas
cerebrais

Vista lateral das fibras

nervosas cerebrais

Aplicaes:
Recm-nascidos:
O aumento da anisotropia verifica-se na substncia
cinzenta cerebral;
A anisotropia diminui progressivamente durante os
primeiros meses de vida.

Aplicaes Tumor
Cerebral:
Oligodendroglioma occipital ,
homem com 49 anos.
Imagem superior: hipersinal
acentuado no lobo occipital
esquerdo correspondente ao
oligodendroglioma, com o
edema envolvente.
Imagem Inferior: falta de
difuso
anistropica
e
reconstruo do tracto das
fibras.

Aplicaes Metstases
Cerebrais:

Recuperao da direco do
tracto das fibras nervosas
num homem de 53 anos com
metstases
occipitais
bilaterais antes (a) e aps
tratamento com quimioterapia
(b).

Aplicaes
Esclerose Multipla:

A - Crculos correspondem a regies de interesse onde tem nicio a reconstruo do

tracto da fibra nervosa.
B - Sobreposio da reconstruo do tracto das fibras.
Nota: reduo da reconstruo do tracto da fibra da substncia branca lesada, em
especial para conexes visuais occipitais, em comparao com o hemisfrio contralateral.

Aplicaes Tumor
Cerebral:

Paciente com dfices neurolgicos do lado direito

A) Imagem anatmica cerebral visualizao de massa tumoral;
B) Mapa de cores da anisotropia direccional distoro e colorao alterada (relativamente ao lado
contralateral) na regio tumoral;
C) Tractografia 3D sobreposta a uma sequncia de imagens 3D demonstra um cut-off das fibras
cortico-espinais esquerdas

Ruptura completa do tracto das fibras nervosas (feixe corticoespinal esquerdo), muito bem demonstrado
pela Tractografia.

Aplicaes - Miocrdio:
CORAO (Miocrdio):
Em reas isqumicas:
As paredes do msculo ficam
mais finas;
Aumento da anisotropia;
Orientao das fibras aleatrias.

Tcnicos
Matemticos

Aquisio de dados
Imagens de difuso
Imagem do tensor de difuso

Amostras

Aplicaes
Anatomia da substncia branca
Estrutura Muscular
Aplicaes Clnicas

Dados

Bilogos
Mdicos
Neurocientistas

Computao e visualizao
Cintistas computacionais
Nmeros

Matemticos

ndices
Tracking
Glyphs
escalares Clustering

Concluses:
DTI possibilita a visualizao detalhada da substncia
branca cerebral e fibras musculares do miocrdio (mais
recentemente);
Deteco precoce de patologias para delinear um
tratamento mais eficaz (eficcia na prtica clnica);
Permite a demonstrao de uma variedade de
perturbaes cerebrais, como a esclerose mltipla e
doenas degenerativas;

Concluses:
Melhorias nas tcnicas de imagem e seu processamento
possibilitam novas formas de analisar imagens de RM, como
por exemplo RM funcional;

Concluses:
Maior sensibilidade e especificidade que a imagem de RM
convencional para visualizao da integridade das fibras nervosas;
Contribuio para o planeamento de cirurgias em neuro-oncologia e
epilepsia;

Poder vir a ser uma ferramenta til na investigao da relao

entre estruturas e funes cerebrais;
Ainda uma tcnica em crescimento e desenvolvimento, tendo de
ultrapassar certas limitaes, tanto na aquisio como no
processamento das imagens, como por exemplo, na angulao das
fibras nervosas (para um melhor processamento) e em regies com
baixa anisotropia.

Um Vdeo

Referncias Bibliogrficas:

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