La vida y su diseo molecular

Todos los seres vivos estn construidos a nivel qumico de acurdo a un

esquema bsico comn, comparten propiedades en su composicin qumica
y organizacin. Usan un mismo lenguaje qumico.
La clula viva se puede pensar como una fbrica qumica bastante compleja
y bien organizada que toma de su entorno diferentes molculas que
constituyen sus nutrientes. Mediante reacciones qumicas, las degrada en
unidades ms pequeas que luego reacomoda y re combina para hacer
otras molculas que se ajustan a sus necesidades.
Los elementos que se encuentran en mayor proporcin en los seres
vivos, no son los mas abundantes de la corteza terrestre.
Los elementos fueron seleccionados en el curso del tiempo
evolutivo, no por su disponibilidad en el entorno sino tambin
teniendo en cuenta sus propiedades.
(H, C, N, O, P, S). El (H, O, N, C) Constituyen ms del 99% en peso de
la materia viva, estos son los tomos ms pequeos y alcanzan una
configuracin electrnica estable. Compartiendo 1, 2, 3 y 4 pares
de electrones respectivamente.
LAS UNIONES QUIMICAS: SON UNA FUERZA DE ATRACCION
ELECTROSTATICA QUE MANTIENE UNIDOS A LOS ATOMOS (CARACTERISTICA
LA FUERZA), Cuanto mayor es la energa que se libera, mayor es la
fuerza de la unin; (Mayor es la cantidad de energa que hay que
administrar al sistema para romper las uniones)
Existen dos tipos de enlaces,
Covalentes (se forman cuando se comparten uno o ms pares de
electrones para alcanzar cada uno de ellos la configuracin
electrnica ms estable).
Inicos (se forman cuando el resultado de la atraccin entre iones
de carga opuesta); El enlace inico depende del medio en el cual se
encuentra el par cargado

Cuanto ms polar es el medio, mas

dbil es la unin.
EL CARBONO:
Todas las molculas, organizadas alrededor del tomo de carbono
constituyen los compuestos orgnicos. Dado su reducido tamao,
forma uniones covalentes muy fuertes entre s y con tomos de
otros elementos como hidrogeno, oxigeno, nitrgeno y azufre, lo
que da origen a diversos grupos funcionales.

Posee la capacidad de establecer enlaces simples, dobles y triples

con otros atomos de carbono formando cadenas y anillos de
diversos tamaos. Esto le confiere una gran versatilidad y la
posibilidad de participar en la formacin de una enorme diversidad
de compuestos a causa de su configuracin electrnica tetradrica.
NINGUN OTRO ELEMENTO PUEDE FORMAR MOLECULAS ESTABLES Y
TAN DIVERSAS EN CUANTO A FORMA Y TAMAO.

Los grupos funcionales: la mayora de las bio-moleculas son derivados de

los hidratos de carbono, estos compuestos tienen un esqueleto de tomos
de carbono unidos covalentemente, a los que solamente se unen tomos de
hidrogeno, estos hidrgenos pueden ser reemplazados por otros grupos de
tomos. Esto le confiere a la bio-molecula distinta propiedades.
El resto de elementos, por ejemplo, el oxigeno se une formando molculas
de O2, que al ser parcialmente solubles en agua estn en todos los
organismos. Es muy electronegativo.

LA DISTRIBUCION DE MOLECULAS DENTRO DE LA

CELULA NO SE REALIZA AL AZAR:
El ordenamiento de las molculas dentro de las clulas tiene que estar
controlado por uniones diferentes a las covalentes, mucho ms dbiles, que
se establecen entre tomos de las mismas o diferentes molculas. Las
uniones dentro de la misma molcula contribuyen a darle forma y la
flexibilidad de las que depende su funcin.
Estas uniones intermoleculares dbiles participan en el reconocimiento de
los componentes celulares (interaccin enzima-sustrato) y la formacin de
organelas (membranas). Es indispensable.
LAS UNIONES DEBILES SE ROMPEN Y SE FORMN CONSTANTEMENTE A
TEMPERATUR FISIOLOGICA.
Estas uniones dbiles tienen una energa de unin ligeramente mayor que la
energa cintica de las molculas a temperatura fisiolgica (1.7Kcal/mol), la
vida media de dichas uniones es muy corta (una fraccin de segundo) solo
basta que los tomos involucrados se acerquen lo suficiente y se
encuentren en la posicin adecuada.
TIPOS DE UNIONES DEBILES:
UNIONES DE VAN DER WAALS: Son uniones totalmente inespecficas y
operan tanto en polares como en no polares. La distancia entre los dos
tomos es un factor primordial. Es 100 veces menor que una unin
covalente, para que los tomos puedan interactuar deben encajar
perfectamente (forma espacial complementaria, ejm: unin enzimasustrato).

UNIONES PUENTE DE HIDROGENO: Se forma cuando un tomo de hidrogeno

esta enlazado covalentemente con un elemento muy electronegativo
(oxigeno, nitrgeno) este ser el que atraiga el electrn de enlace ms
cerca de el. Causando que el tomo de hidrogeno adquiera una densidad
de carga positiva, y es atrado electrostticamente por otros tomos o
grupos de carga negativa. Es 10 veces mas dbil que el enlace covalente
pero 10 veces mas fuertes que las fuerzas de van der waals.

EN UN MEDIO ACUOSO LA UNION DE UN SOLO ENLACE DE

HIDROGENO VA A SER MUY DEBIL, DEBIDO A QUE LAS MOLECULAS
DE AGUA COMPITEN PARA ESTABLECER UNIONES DE HIDROGENO
CON LAS MOLECULAS DE SOLUTO.
CUANDO SE ESTABLECEN ENLACES DE HIDROGENO ENTRE DOS
MOLECULAS O PORCIONES DE MOLECULAS, SE PRESENTA UN
EFECTO COOPERATIVO (la formacin del primer enlace aumenta la
probabilidad de formacin del segundo y as sucesivamente) Esto
es una caracterstica de las protenas y los cidos nuclecos.
Los enlaces de hidrogeno se rompen y se forman sistemas acuosos
mucho mas rpido y con menos gasto de energa que las uniones
covalentes.
EN LOS PROCESOS METABOLICOS (que deben ser producidos a gran
velocidad), SE BASAN EN RECONOCIMIENTO DE ENTRE MOLECULAS
(este reconocimiento exige un perfecto encaje entre las molculas
implicadas - COMPLEMENTARIDAD ESTERICA- Y estabilizacin por el
mayor numero de uniones dbiles)

EL AGUA:

La vida se origino en el agua, el agua es el componente ms

abundante en los seres vivos y es una molcula polar. Constituyen el 70% a
90% de estos. Es muy estable y no es considerado un lquido inerte. El
agua tiene propiedades singulares diferentes a la mayora de compuestos
del mismo tipo (H2S, NH3) o aun de otros lquidos (ter, acetona,
benceno).
El agua y sus productos de disociacin (H+ y OH-) influyen profundamente
en Las Bio-moleculas (lpidos, protenas, glcidos, cidos nucledos). En
otros solventes estas sustancias tendran distinta estructura y se
comportaran de manera diferente en otros solventes.
LAS PROPIEDADES FISICO-QUIMICAS SON UNICAS. (Punto de fusin,
calor de vaporizacin, capacidad calorfica, punto de ebullicin y tensin
superficial). Son ms elevadas que los otros hidruros (SH2, NH3) debido a
las fuerzas de atraccin que se establece entre las molculas del agua.
El Angulo de unin es de 105, su forma no es lineal.

Experimenta propiedades de COHESION (unin entre molculas de agua,

ejm: agua de las races a las hojas por la capilaridad) y ADHESION (unin
de la molcula de agua con otras molculas polares, ejm: adhesin de las
molculas a los tubos conductores).
EL AGUA ES UNA MOLCULA POLAR, Y SUS MOLECULAS TIENDEN A
ELEGIRSE ENTRE SI. ESAS UNIONES SON EXTREMADAMENTE
CORTAS, SE ROMPEN Y REFORMAN CONSTANTEMENTE. ES
IMPOSIBLE INSERTAR UNA MOLCULA ORGANICA NO POLAR.

Las interacciones hidrofobicas: establizan la

estructura de las protenas y de los acidos nuclecos.

Las sustancias anfipaticas:

El grupo carboxilo polar puede establecer puentes de
hidrogeno con el agua, la cola hidrocarbonatada no
polar no se disuelve, tiende a agregarse a las colas
hidrofobicas. Este agregado tiende a mantener
uniones estables de van der waals.
Como causa del doble compartimento se forman
MICELAS (poseen superficie con carga negativa que
se suspende por las fuerzas de repulsin que se
establece entre cargas.

TODOS LOS SERES VIVOS ESTAN COMPUESTOS POR LAS MISMAS

CLASES DE BIOMOLECULAS.
GLUCIDOS: derivados de los monosacridos, tienen en comn un
grupo aldehdo o cetona y alcoholes.
LIPIDOS: son insolubles en solventes polares.
PROTEINAS: hay millones, todas formadas por los mismos 20
aminoacidos.
ACIDOS NUCLEICOS: responsables de nuestra identidad, resultado
de la combinacin de cuatro nucletidos diferentes.

ESTRUCTURA DE LOS AMINOACIDOS Y DE LAS PROTEINAS.

Macromolculas ms abundantes de las clulas, son el 50% del

peso seco de ellas.

Cumple funciones DINAMICAS (especialmente las globulares,
reconocen especficamente y la unin es rgida), (tambin hay
protenas transportadoras como la hemoglobina),
(inmunoglobulinas que actan como defensa del organismo) y
ESTRUCTURALES (protenas fibrosas), (por ejemplo el colgeno,
que suministra la matriz extracelular para los tejidos conectivo y
seo), (la tubulina si bien es globular se polimeriza formando
estructuras fibrosas, ejm: cito-esqueleto, cilios, flagelos)
(queratina).

LOS AMINOACIDOS SON LAS UNIDADES ESTRUCTURALES DE LAS

PROTEINAS.
se comportan como anfolitos, para cada aminocido existe un PH
(al cual se encuentran exactamente equilibradas, por lo tanto su
carga es neta) ese PH corresponde al grupo isoelctrico.
Hay aminocidos esenciales y otros que deben incorporarse en la
dieta diaria, ya que los organismos son incapaces de sintetizarlos.