BIOMARKERS BIOMARCADORES

MARCADORES BIOLOGICOS
Las molculas orgnicas (fsiles qumicos) son abundantes en muchos
sedimentos y rocas sedimentarias, y se denominan marcadores
biolgicos "biomarker". Su estudio e identificacin requieren tcnicas
sofisticadas de toma de muestra y anlisis. Conservan un registro muy
detallado de la actividad biolgica del pasado y estn relacionados con
molculas orgnicas actuales. Las posibles fuentes de marcadores
biolgicos en muestras geolgicas son tantas como molculas se
conocen en los organismos.
Muchos compuestos orgnicos juegan un papel importante en
investigaciones sobre exploracin y produccin de petrleo. A estos
compuestos orgnicos se les denomina "marcadores biolgicos,
biomarcadores o fsiles qumicos". Dos reas principales en las cuales
los Biomarcadores tienen gran impacto son la exploracin y la
caracterizacin qumica de nuevas fuentes de petrleo.
Es trascendental, en las investigaciones sobre biomarcadores, precisar el
origen qumicos o sustancia precursora, su estructura qumica actual y la
relacin precursor/producto. Es de especial importancia esta relacin,
porque permite inferir hiptesis sobre la formacin de aceites y crudos,
que cobran importancia desde la ptica de la geologa econmica.
Estos compuestos se encuentran en extractos de petrleo, en
concentraciones muy bajas, asociados con muchos otros compuestos
orgnicos, lo que dificulta su separacin e identificacin. Por fortuna, los
qumicos utilizan mtodos cientficos apropiados para separarlos e
identificarlos.
Para estas mezclas complejas de compuestos, encontradas en muestras
de aceites fsiles, se hacen importantes las tcnicas de separacin, tales
como al cromatografa lquida de alta presin (HPLC), cromatografa de
columna, cromatografa en fase gaseosa (GC), separaciones
gravimtricas y las extracciones con base en mezclas de solventes
orgnicos. Una vez separados y purificados los componentes, son
tambin muy importantes las tcnicas instrumentales de identificacin,
tales como la espectrometra de masas, espectrofotometra infra-roja,
espectrometra ultravioleta y visible, resonancia nuclear magntica de

Carbono

resonancia

nuclear

magntica

de

Hidrgeno.

El estudio de este tipo de sustancias y su aplicacin, es parte de una

rea nueva en geologa, la geoqumica orgnica.

CROMATOGRAFIA LIQUIDA DE ALTA PRESION (HPLC)

La cromatografa lquida de alta
presin es una tcnica de
separacin
basada
en
la
distinta
retencin
de
los
componentes de una muestra
disueltos en la fase mvil al
pasar por la fase estacionaria.
Se caracteriza por la elevada
presin de operacin necesaria
para conseguir una velocidad
ptima de la fase mvil. La interaccin entre el soluto de la fase mvil y
la fase estacionaria puede ser modificada eligiendo diferentes
disolventes y fases estacionarias, siendo en consecuencia una tcnica
de gran versatilidad.
Su aplicacin es de separacin, identificacin, purificacin
cuantificacin de una gran variedad de compuestos qumicos.

Cromatografa en columna
La cromatografa en columna
utiliza una columna de vidrio
vertical que se llena con un
soporte slido adsorbente (fase
estacionaria: los ms utilizados
son gel de slice (SiO2) y almina
(Al2O3)). La muestra que se
quiere separar se deposita en la
parte superior de este soporte. El
resto de la columna se llena con
el eluyente (disolvente que
constituye la fase mvil) que, por efecto de la gravedad, hace mover la
muestra a travs de la columna. Se establece un equilibrio entre el
soluto adsorbido en la fase estacionaria y el disolvente eluyente que
fluye por la columna. Debido a que cada uno de los componentes de una

mezcla establecer interacciones diferentes con la fase estacionaria y la

mvil, sern transportados a diferentes velocidades y se conseguir su
separacin. As, de manera similar a otros tipos de cromatografa, las
diferencias en las velocidades de desplazamiento a travs del medio
slido se corresponden con diferencias en los tiempos de elucin por la
parte inferior de la columna para cada uno de los componentes de la
muestra original, que se recogern en fracciones diferentes.
La polaridad del eluyente afecta las velocidades relativas con las que los
diferentes componentes de la mezcla se mueven en la columna. Los
disolventes polares compiten ms eficientemente con las molculas
polares de una mezcla por los lugares polares del adsorbente. Por lo
tanto, un disolvente polar desplazar las molculas, incluyendo las ms
polares, rpidamente a travs de la columna. Si el disolvente es muy
polar la elucin ser muy rpida y generalmente habr poca separacin
de los componentes de la mezcla. Si por el contrario el disolvente es
muy apolar, no eluirn los compuestos de la columna. Por lo tanto, la
eleccin del eluyente es crucial para el xito de la cromatografa en
columna. A menudo se utiliza un gradiente creciente de polaridad para
la elucin. La CCF se utiliza para determinar y elegir el sistema solvente
adecuado para cada separacin.
En
1978
se
introdujo
una
versin
modificada
denominada cromatografa en columna rpida. La diferencia con la
cromatografa en columna tradicional es que en la tcnica rpida el
disolvente se hace atravesar la fase estacionaria aplicando una presin
positiva. Esto hace que las separaciones mejoren en resolucin y se
pueda disminuir el tiempo de elucin, por lo cual constituye un mtodo
de eleccin.

Cromatografa en fase gaseosa (GC)

Extracciones
orgnicos

con

base

en

mezclas

PROCEDIMIENTO

de

solventes

QUE ES UN BIOMARCADOR?
Los trminos "marcadores biolgicos" o "biomarcadores" permiten pensar en otro trmino
apropiado para el fenmeno de su conservacin: "fsiles qumicos". Este trmino enmarca los
compuestos orgnicos encontrados en rocas antiguas, que pudieron derivar de material
orgnico depositado en sedimentos.

Son fsiles, por haberse preservado en estos

sedimentos, tal como los fsiles clsicos conocidos. (McCaffrey, 1994).

Los Biomarcadores son compuestos orgnicos presentes en la geoesfera, cuyas estructuras
qumicas estn ntimamente relacionadas con las estructuras de las sustancias precursoras,
que a su vez provienen del material fuente del petrleo fsil (McCaffrey, 1994). Los cambios
estructurales de estos compuestos son mnimos durante la sedimentacin, en las diferentes
etapas de los procesos geolgicos sedimentarios. Quiz las modificaciones sean tpicas de
cambios estereoqumicas, en las cuales una sustancia virtualmente no cambia de composicin
qumica, pero si la forma espacial de distribuir los tomos en el espacio (Fessenden, 1984)
Para muchos biomarcadores la relacin precursor/producto y el mecanismo de reaccin de
conversin, han sido plenamente establecidos. Es el caso de los Esteroles que se convierten
en Esteranos. En otros casos, no resultan claros los procesos de transformacin. Muchos
trabajos de investigacin estn orientados a encontrar la relacin precursor/producto, y otros a
la identificacin de los biomarcadores o sustancias qumicas actuales (Killops, 1991).
Tres aspectos han contribuido al incremento en las investigaciones sobre biomarcadores: los
avances en la capacidad analtica instrumental, comprensin de mecanismos de
transformacin de precursores y el incremento en el nmero de grupos interdisciplinarios
dedicados a investigarlos.

Cuando en 1930 Treibs aisl porfirina de una muestra de combustible, contribuy a que los
medios cientficos aceptaran el origen biognico del petrleo. Este hecho aceler el estudio
de los biomarcadores en muestras de crudo, shale y carbones.
La comprensin de los mecanismos de transformacin de unas sustancias orgnicas en otras,
fue otra razn que contribuy al incremento en el nmero de biomarcadores identificados.
Con esta base mecanicista, se explicaron los precursores de los biomarcadores identificados y
con la misma base, se pudieron predecir los productos conociendo precursores de diferente
fuente (vegetal, bacterial, etc.).
Muchos biomarcadores son hidrocarburos saturados que provienen de compuestos
oxigenados o insaturados, que en los procesos de diagnesis y maduracin de los
combustibles fsiles, encontraron medios y condiciones favorables de transformacin y su
presencia se detecta como fsiles qumicos.
Dentro de los biomarcadores reportados en la literatura, se encuentran los n-Alcanos,
Hidrocarburos ramificados, Isoprenoides, Sesquiterpenos, Diterpenoides, terpanos tricclicos y
tetracclicos, Esteranos, Hidrocarburos aromticos y Porfirinas (Demaison, 1991). Todos ellos
provenientes de una inmensa variedad de metabolitos primarios y secundarios de origen
vegetal,

de

hongos,

algas,

lquenes

bacterias,

que

han

sufrido

ciclizaciones,

fraccionamientos, condensaciones, reducciones, sustituciones qumicas, saturaciones y

alargamientos estructurales (Nakanishi, 1974).

EXTRACCIN
Paralelamente con el avance en la perfeccin de las tcnicas cromatografas y de
espectrometra, se descubrieron nuevos biomarcadores, y se confirmaron las estructuras
qumicas de los ya analizados por otras tcnicas qumicas elementales. En las primeras
etapas del desarrollo de la cromatografa, fue muy til la cromatografa de columna (columnas
empacadas), seguida de tecnologa de alta resolucin, baja actividad y que acompaada del
incremento en las mejoras de las tcnicas de masas, facilitaron la identificacin de los
biomarcadores e increment la posibilidad de identificar ms cantidad de biomarcadores
posibles en estas mezclas de hidrocarburos.
La extraccin de los marcadores biolgicos est prcticamente determinada por el tipo de
muestra, que hace diferir el esquema de extraccin. Por lo general, consiste en el empleo de
solventes orgnicos que arrastran los componentes por una columna cromatografa, para
obtener compuestos puros, los cuales se someten a anlisis espectromtrico de masas, Infrarojo y de resonancia nuclear magntica de Carbono o de Hidrgeno. (Esquemas grficos).

Bibliografa

https://es.wikipedia.org/wiki/F
%C3%B3sil#Procesos_fosildiag.C3.A9nicos

http://compumet-mininggeology.blogspot.pe/2013/09/biomarkers-biomarcadoresmarcadores.html

http://pendientedemigracion.ucm.es/info/iqpapel/equipos/c
romatografia.htm

http://www.ub.edu/oblq/oblq
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http://www.mncn.csic.es/docs/repositorio/es_ES/investigaci
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http://www.fbqf.unt.edu.ar/institutos/quimicaanalitica/Anali
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