Estudo dirigido

Aminocidos e Protenas
1) Quais aminocidos apareceriam mais facilmente no exterior de uma cadeia
proteica inserida em soluo aquosa? Por qu?
2) Por que os anticorpos produzidos contra uma protena na forma nativa s
vezes no se ligam a ela quando est desnaturada?
3) A queratina constitui a principal protena do cabelo, sendo caracterizada por
alto teor de cistina. Por que a queratina forma uma alfa-hlice? Se ela usada
para formar um fio, por que no simplesmente esticar a molcula o mximo
possvel ao invs de gastar aminocidos a cada volta da hlice?
4) Por que existe uma organizao peridica de aminocidos hidrofbicos em
um dmero de queratina?
5) O uso indiscriminado de anticidos de ao local ou sistmica interfere no
processo digestivo? Explique.
6) Relacione o tipo de ligao presente em cada nvel estrutural das protenas.
7) As misturas de aminocidos so analisadas pela separao de seus
componentes por meio da cromatografia de troca inica. Em uma resina de
troca catinica que contm grupos sulfonatos os aminocidos fluem ao longo
da coluna em velocidades diferentes devido a dois fatores que retardam seu
movimento: (1) atraes inicas entre os resduos SO3- na coluna e os
grupos funcionais carregados positivamente nos aminocidos e (2)
interaes hidrofbicas entre as cadeias laterais dos aminocidos e o
esqueleto fortemente hidrofbico da resina. Para cada par de aminocidos
listados a seguir, determine qual membro ser eludo primeiro de uma coluna
de resina de troca inica por um tampo de pH 7.
a) Asp e Lys
b) Glu e Val
c) Ser e Ala
8) Um peptdeo apresenta a seguinte sequncia:
Glu His Trp Ser Gly Leu Arg Pro Gly
Qual a carga lquida da molcula em pH 3, 8 e 11? (Utilize os valores de pK a,
para as cadeias laterais e grupos amino e carboxiterminais).
9) Um mtodo para separar os polipeptdeos faz uso de suas diferenas em
solubilidade. A solubilidade dos grandes polipeptdeos em gua depende da
polaridade relativa dos seus grupos R, particularmente do nmero de grupos

ionizados: quanto maior for o nmero de grupos ionizados, mais solvel ser
o polipeptdeo. Qual dos seguintes pares de polipeptdeos mais solvel em
pH 7.
a) (Gly)20 ou (Glu)20
b) (Ala-Ser-Gly)5 ou (Asn-Ser-His)5
10) Algumas protenas naturais so muito ricas em pontes dissulfeto e suas
propriedades mecnicas (resistncia tenso, viscosidade, dureza) esto
correlacionadas com o contedo dessas pontes. Por exemplo, a glutenina,
uma protena encontrada no trigo e rica em cistina, responsvel pelas
caractersticas elsticas e coesivas da cola feita com farinha de trigo. De igual
maneira, a natureza resistente e dura da casca de tartaruga devida ao alto
contedo em cistina de sua -queratina. Qual a base molecular da
correlao entre o contedo em pontes dissulfeto e as propriedades
mecnicas de uma protena?
11) Condicionadores de protenas tm se tornado bastante populares, pois do
volume, brilho e tornam o cabelo mais fcil de ser penteado. O xampu mais
caro que existe feito a partir de caviar, mas o mesmo resultado pode ser
obtido usando ovos comuns ou cerveja (escura) no cabelo. Propagandas
deste tipo de condicionador prometem reparar o cabelo, principalmente os
condicionadores que usam solues de queratina, alegando que a queratina
em soluo ir ligar-se queratina do cabelo, reparando o cabelo danificado.
Quais so os erros destas propagandas?

12) Para inibir a liberao de neurotransmissores do neurnio na clula

muscular, a toxina botulnica precisa entrar no citosol, onde se encontra sua
protena alvo. No existem estudos que expliquem perfeitamente como a
cadeia leve da toxina botulnica consegue atravessar a barreira hidrofbica
da vescula e no a membrana plasmtica da clula nervosa, porm alguns
modelos foram propostos. Uma das hipteses explicaria tal passagem por
mudanas conformacionais das cadeias leve e pesada da toxina. A vescula
contendo a toxina exposta a um pH mais baixo devido fuso com
lisossomos da clula. Este pH cido promove a mudana conformacional das
cadeias expondo assim alguns fragmentos hidrofbicos das protenas. Isto
permite que a cadeia pesada forme um tnel na membrana das vesculas. A
diminuio do pH causa tambm o desdobramento da cadeia leve, permitindo
que esta atravesse o poro formado pela cadeia pesada. Em contato com o
pH neutro do citosol, a cadeia leve se dobra novamente em sua forma ativa
e as pontes dissulfeto entre a cadeia leve e pesada so reduzidas, liberando
a toxina no citosol.
a) A capacidade de se desdobrar e se dobrar novamente na correta
conformao, faz com que a toxina botulnica consiga sobreviver
passagem pela acidez do estmago e cause o quadro de intoxicao
alimentar. Explique como as interaes qumicas entre os aminocidos
de uma protena so alterados pela mudana do pH.

b) Quais seriam os aminocidos mais afetados pela mudana do pH?

Explique.
13) Alm de realizar quase todo o transporte de oxignio, requerido pelas
clulas, dos pulmes aos tecidos, a hemoglobina transporta dois produtos
finais da respirao celular H+ e CO2 dos tecidos aos pulmes e rins, onde
so excretados. O efeito de pH e concentrao de CO 2 sobre a ligao e
liberao de oxignio pela hemoglobina chamado de efeito Bohr. Explique
sucintamente esse efeito.
14) Descreva sobre as diferenas observadas na afinidade/associao do
oxignio na hemoglobina e mioglobina.

Estudo dirigido
Enzimas

15) Quais so as vantagens da catlise enzimtica comparada catlise qumica

ordinria?
16) O que so coenzimas e cofatores e qual a funo destes compostos na
catlise?
17) Como as enzimas aceleram a velocidade das reaes? Explique os
mecanismos envolvidos no processo de catlise?
18) Explique as seguintes relaes grficas:
a) Velocidade da reao X concentrao de substrato

b) Qual a vantagem deste sobre o grfico anterior?

c) Velocidade de reao X tempo de reao

Velocidade

Tempo
19) Quais so os fatores que interferem na atividade enzimtica?
20) Qual a diferena entre as enzimas ditas michaelianas e as enzimas
alostricas? Qual a importncia das enzimas alostricas para o
metabolismo celular?
21) Quais so os tipos mais importantes de inibio enzimtica? Explique cada
um considerando o efeito sobre a velocidade mxima e Km. D exemplos.