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on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Reduciendo la Dimensionalidad
Escalamiento Multidimensional
IN1089C An
alisis Multivariado
Alba Martnez-Ruiz
Departamento de Ingeniera Industrial
Universidad Cat
olica de la Ssma. Concepci
on
Concepci
on, Chile
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Contenido
Introduccion
Escalados Metricos
Medidas de Ajuste
Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Metodo
Matriz
Dimensiones
Analisis de
Componentes Principales
(PCA)
Componentes
principales
Analisis de
Correspondencias
(CA)
Matriz de frecuencias
Investigamos la estructura de la matriz
de frecuencias relativas (I J)
Variables categoricas
Dimensiones
o factores
Escalamiento
Multidimensonal
(MDS)
Matriz de distancias
Investigamos la estructura de la matriz
de distancias entre individuos (n n)
Alba Martnez-Ruiz
Coordenadas
principales
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Escalados m
etricos, cuando la matriz D es de distancias o
similaridades. Tambien se llama analisis de coordenadas
principales.
Escalado no m
etrico, cuando se usa el orden de las medidas
de distancias originales y no sus magnitudes.
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Ancud
0
2494.16
3186.77
2691.22
648.05
81.72
252.65
715.02
714.57
Antofagasta
2494.16
0
711.49
215.94
2012.05
2570.56
2741.48
1780.98
1877.29
Arica
3186.77
711.49
0
593.33
2704.66
3263.17
3434.09
2473.59
2569.9
Calama
2691.22
215.94
593.33
0
2209.11
2767.62
2938.55
1978.05
2074.36
Alba Martnez-Ruiz
Ca
nete
648.05
2012.05
2704.66
2209.11
0
724.45
895.38
232.92
134.76
Castro
81.72
2570.56
3263.17
2767.62
724.45
0
171.67
791.41
790.97
Chaiten
252.65
2741.48
3434.09
2938.55
895.38
171.67
0
962.34
961.9
Chillan
715.02
1780.98
2473.59
1978.05
232.92
791.41
962.34
0
98.16
Concepci
on
714.57
1877.29
2569.9
2074.36
134.76
790.97
961.9
98.16
0
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Hitler
0
3
4
7
3
8
3
4
8
9
4
7
Mussolini
Churchill
Eisenhower
Stalin
Attlee
Franco
DeGaulle
MaoTse-Tung
Truman
Chamberlin
Tito
0
6
8
5
9
2
4
9
9
5
8
0
4
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3
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8
6
6
6
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7
0
7
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4
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3
0
7
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5
2
0
4
9
4
0
5
5
0
7
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introduccion
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
Spp =
X0 X
n
Matriz de covarianzas
Alba Martnez-Ruiz
Qnn = XX0
Matriz de productos cruzados,
matriz de similitudes
(covarianzas) entre individuos.
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
Qnn = XX0
x11
x21
Q= .
..
xn1
q11
. . . x1p
x11 x21 . . . xn1
. . . x2p .
..
.. = q21
..
.
.. ..
.
..
.
.
..
.
.
x1p x2p . . . xnp
qn1
. . . xnp
. . . q1n
. . . q2n
..
q
.
ij
. . . qnn
qij = q21 =
Pp
Pp
= x0i xj
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
Producto escalar: x0 y = kxkkykcos
Tenemos entonces:
x0i=2 xj=1 = x02 x1 = kx02 kkx1 kcos21 = q21
Si cos21 1, peque
no, q21 grande
y 2 y 1 son individuos similares.
Si cos21 0, grande, q21 peque
no
y 2 y 1 son individuos muy distintos.
Entonces Qnn es una matriz de similitudes entre individuos!. A
partir de esta matriz podemos construir una matriz de distancias
eucldeas.
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
Construyamos una matriz de distancias eucldeas al cuadrado entre
dos individuos:
P
P
d2ij = d221 = ps=1 (xis xjs )2 = ps=1 (x2s x1s )2
=
Pp
2
s=1 xis
Pp
2
s=1 xjs
Pp
Pero:
qij = q21 =
Pp
Pp
= x0i xj
Por lo tanto:
d2ij = qii + qjj 2qij
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
1
Es posible obtener Q, pero de Q no es posible obtener exactamente X ya que Q es invariante ante rotaciones
de las variables. Esto es Q = XX0 = XAA0 X0 para cualquier matriz A ortogonal.
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Escalados metricos
El objetivo es representar D mediante un conjunto de variables
ortogonales y1 , ..., yp llamadas coordenadas principales (p < n)
tal que las distancias eucldeas entre las coordenadas de los
elementos respecto a estas variables sean iguales (o lo mas
proximas) a las distancias de la matriz original.
d11
..
D= .
dn1
. . . d1n
..
..
.
.
. . . dnn
y11
..
Y= .
yn1
. . . y1p
..
..
.
.
. . . ynp
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Q =
Pp
Q =
Pp
i=1 i vi vi
i=1 yi yi
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
3 Obtener las
coordenadas de los puntos en las variables
mediante vi i , donde i es un valor propio de Q y vi su
vector propio unitario asociado. Esto implica aproximar Q
por:
1/2
1/2
Q (Vr r )(r Vr )
y tomar como coordenadas de los puntos las variables:
1/2
Yr = Vr r
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Medidas de ajuste
Pm
Pm
i
= Pni=1
i=1 i
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Medidas de ajuste
Otra medida de cercana o de ajuste, denominada stress (S), se
obtiene al minimizar las diferencias entre las distancias derivadas
de las coordenadas principales, dij , y las similitudes de partida ij ,
PP
es decir, minimizar
(ij dij )2 para todos los terminos de la
matriz.
Esta cantidad se estandariza para favorecer las comparaciones.
P
S2
i<j (ij
dij )2
2
i<j ij
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Medidas de ajuste
Bondad de Ajuste
Pobre
Casi bueno
Bueno
Excelente
Perfecto
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Ancud
0
2494.16
3186.77
2691.22
648.05
81.72
252.65
715.02
714.57
Antofagasta
2494.16
0
711.49
215.94
2012.05
2570.56
2741.48
1780.98
1877.29
Arica
3186.77
711.49
0
593.33
2704.66
3263.17
3434.09
2473.59
2569.9
Calama
2691.22
215.94
593.33
0
2209.11
2767.62
2938.55
1978.05
2074.36
Alba Martnez-Ruiz
Ca
nete
648.05
2012.05
2704.66
2209.11
0
724.45
895.38
232.92
134.76
Castro
81.72
2570.56
3263.17
2767.62
724.45
0
171.67
791.41
790.97
Chaiten
252.65
2741.48
3434.09
2938.55
895.38
171.67
0
962.34
961.9
Chillan
715.02
1780.98
2473.59
1978.05
232.92
791.41
962.34
0
98.16
Concepci
on
714.57
1877.29
2569.9
2074.36
134.76
790.97
961.9
98.16
0
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
7.01E-01
3.14E-02
9.14E-03
3.25E-03
Valores propios
2.10E-01 7.45E-02 4.73E-02
1.71E-02 1.37E-02 1.29E-02
8.99E-03 7.77E-03 6.61E-03
2.83E-03 1.67E-03 1.40E-03
3.54E-02
1.09E-02
4.15E-03
3.09E-17
Rango(Q) = n 1 = 19.
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
v1
0.2095
-0.3499
-0.4234
-0.3768
0.1292
0.2172
0.2287
0.0943
0.1081
0.0661
-0.2238
-0.1363
0.2433
0.0414
-0.4051
0.0703
0.1133
0.0609
0.1483
0.1846
v2
-0.2522
-0.0831
-0.1822
-0.1165
0.1516
-0.2933
-0.3592
0.2099
0.2066
0.2652
0.0627
0.1408
-0.4496
0.2448
-0.1562
0.2420
0.1971
0.2478
0.0504
-0.1266
v3
0.0111
-0.1132
0.4005
0.0151
0.2088
-0.0197
-0.0823
0.0895
0.1626
0.0085
-0.5299
-0.5377
-0.1897
-0.0834
0.2451
0.0071
0.1799
-0.0243
0.1673
0.0847
v4
0.2390
0.1392
-0.1999
0.0885
0.2123
0.1625
-0.0603
-0.0579
0.0472
-0.2570
0.2026
0.0941
-0.5547
-0.2405
-0.0819
-0.2087
0.0877
-0.2406
0.3007
0.3275
v5
0.2790
-0.2890
0.3212
-0.2721
-0.3047
0.2554
0.0839
-0.0454
-0.2248
0.1197
-0.0223
0.1589
-0.4374
0.2094
0.0764
0.1260
-0.2674
0.1715
-0.1173
0.1791
v6
-0.1319
-0.3935
0.4170
-0.4336
0.2197
-0.1332
-0.0653
-0.0183
0.1146
-0.1761
0.2378
0.3553
0.1894
-0.1605
0.0651
-0.1562
0.1532
-0.1807
0.1411
-0.0438
v7
-0.0837
0.0040
-0.0166
0.0402
-0.0597
-0.2589
-0.3812
-0.0784
-0.2853
-0.0568
-0.1033
0.0408
0.2589
0.1579
0.0046
0.0615
-0.3126
0.1026
0.5099
0.4561
v8
-0.0110
-0.0827
-0.0341
0.3040
0.0586
0.0255
0.0723
-0.0297
0.0226
-0.0897
-0.6614
0.6494
-0.0348
0.0326
-0.0452
-0.0686
0.0430
-0.0547
-0.0092
-0.0866
v9
-0.0029
0.1068
-0.4568
-0.3897
0.0092
0.0029
0.0116
-0.0054
0.0012
-0.0141
-0.1173
0.0978
-0.0051
0.0077
0.7771
-0.0097
0.0042
-0.0070
0.0025
-0.0131
Alba Martnez-Ruiz
v10
0.2634
-0.0170
-0.0107
0.0202
-0.2139
0.0152
-0.5353
0.1724
0.2191
0.0066
-0.0407
0.0740
0.1859
-0.1553
0.0122
-0.0099
0.1970
-0.0752
-0.5030
0.3950
v11
-0.1188
0.0570
0.0183
-0.0428
-0.3515
-0.0613
0.1720
0.5785
0.1271
-0.6489
-0.0068
-0.0177
-0.0476
0.0892
-0.0228
0.1804
-0.0190
0.0286
0.0830
0.0032
v12
-0.0184
-0.7267
-0.2223
0.5256
-0.0327
-0.0101
0.0261
0.0489
0.0059
-0.0321
0.2282
-0.0960
-0.0071
-0.0108
0.2795
0.0243
-0.0098
0.0078
0.0171
0.0028
v13
-0.3892
0.0100
0.0020
-0.0052
-0.1290
-0.3464
0.4870
-0.0032
0.0635
0.2641
-0.0201
0.0515
-0.1099
-0.2507
-0.0028
-0.0079
0.0396
-0.0442
-0.1530
0.5439
v14
0.0725
0.0080
0.0012
-0.0031
-0.2333
0.1038
-0.0928
0.2803
0.0082
0.3399
-0.0300
0.1043
0.0172
-0.6879
-0.0018
0.2252
-0.1884
0.0011
0.3138
-0.2382
v15
-0.0107
-0.0003
0.0000
0.0001
-0.5566
0.0359
-0.0133
-0.0722
0.3994
0.2516
0.0033
-0.0220
0.0014
0.2867
0.0000
-0.4605
0.1092
-0.2011
0.3276
-0.0784
v16
0.6649
0.0000
0.0000
0.0000
-0.0079
-0.7094
0.1830
0.0074
0.0100
0.0073
0.0000
-0.0003
-0.0153
0.0049
0.0000
-0.0116
-0.0085
-0.0060
0.0223
-0.1410
v17
-0.0064
0.0000
0.0000
0.0000
0.2878
0.0046
-0.0010
0.6316
-0.2083
0.2568
0.0008
-0.0083
0.0001
0.1763
0.0000
-0.4196
-0.3300
-0.2800
-0.1188
0.0147
v18
-0.0003
0.0000
0.0000
0.0000
0.0120
0.0001
0.0000
-0.0891
0.0795
0.0858
0.0003
-0.0053
0.0000
0.2130
0.0000
0.5672
-0.0937
-0.7761
0.0039
0.0030
v19
-0.0023
0.0000
0.0000
0.0000
0.1980
0.0004
0.0000
-0.1373
0.6662
-0.0908
0.0000
0.0006
0.0000
-0.0312
0.0000
-0.0064
-0.6765
0.1450
-0.0963
0.0305
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
y1
0.1755
-0.2931
-0.3546
-0.3155
0.1082
0.1819
0.1915
0.0789
0.0906
0.0553
-0.1874
-0.1141
0.2038
0.0347
-0.3393
0.0589
0.0949
0.0510
0.1242
0.1546
Alba Martnez-Ruiz
y2
-0.1155
-0.0381
-0.0835
-0.0534
0.0694
-0.1343
-0.1645
0.0961
0.0946
0.1215
0.0287
0.0645
-0.2059
0.1121
-0.0715
0.1109
0.0903
0.1135
0.0231
-0.0580
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Caete
0.05
Coquimbo
Copiap
0.00
Nueva Imperial
Antofagasta
Calama
Osorno
0.10
Iquique
Arica
Ancud
Castro
Chaitn
0.20
Coordenada principal 2
0.10
Constitucin
Maule
Curic
Linares
Chilln
Concepcin
Lota
Coyhaique
0.4
0.3
0.2
0.1
0.0
0.1
0.2
0.3
Coordenada principal 1
Alba Martnez-Ruiz
Introducci
on Escalados M
etricos Medidas de Ajuste Relaci
on entre Coordenadas y Componentes Principales Ejemplo
Alba Martnez-Ruiz