ECOLOG

Sistema Gerenciador de Banco de Dados para

Levantamentos Ecolgicos de Campo

MANUAL DO USURIO
VERSO 5.0

Copyright (C) 1990-2016 Mauro J. Cavalcanti

Ecoinformatics Studio
Caixa Postal 46521
20551-970, Rio de Janeiro, RJ

SUMRIO
APRESENTAO...................................................................................................4
DESCRIO DO SISTEMA..................................................................................5
1.1 Caractersticas....................................................................................................5
1.1.1 Aplicaes...............................................................................................6
1.1.2 Histrico.................................................................................................6
1.1.3 Casos de Uso..........................................................................................7
CONFIGURAO...................................................................................................9
INSTALAO........................................................................................................10
3.1 Instalao.........................................................................................................10
3.2 Desinstalao....................................................................................................11
ENTRADA DE DADOS.........................................................................................13
4.1 Planilha de Coletas............................................................................................14
4.2 Planilha de Variveis Ambientais.....................................................................15
4.3 Planilhas do Google Docs.................................................................................16
OPERAO...........................................................................................................17
5.1 Projeto..............................................................................................................17
5.1.1 Novo (Ctrl+N)......................................................................................18
5.1.2 Abrir (Ctrl+O).......................................................................................19
5.1.3 Modificar..............................................................................................20
5.1.4 Recarregar.............................................................................................20
5.1.5 Fechar...................................................................................................20
5.1.6 Adicionar..............................................................................................20
5.1.7 Remover................................................................................................20
5.1.8 Importar................................................................................................20
5.1.9 Exportar................................................................................................23
5.1.10 Sair (Ctrl+Q).......................................................................................25
5.2 Dados...............................................................................................................26
5.2.1 Ordenar (Ctrl+S)...................................................................................26
5.2.2 Pesquisar (Ctrl+F)................................................................................26
5.2.3 Filtrar....................................................................................................26
5.3 Relatrios.........................................................................................................28
5.3.1 Catlogo................................................................................................29

5.3.2 Etiquetas...............................................................................................30
5.3.3 Geral.....................................................................................................31
5.3.4 Estatsticas............................................................................................31
5.3.5 Nomenclatura........................................................................................37
5.3.6 Geocodificao.....................................................................................38
5.4 Anlises............................................................................................................39
5.4.1 Diversidade...........................................................................................39
5.4.2 Agrupamento........................................................................................39
5.4.3 Ordenao.............................................................................................40
5.5 Janela................................................................................................................45
5.5.1 Prxima.................................................................................................45
5.5.2 Anterior.................................................................................................45
5.5.3 Em Cascata...........................................................................................46
5.5.4 Lado a Lado Vertical.............................................................................46
5.5.5 Lado a Lado Horizontal........................................................................46
5.5.6 Fechar...................................................................................................47
5.6 Ajuda................................................................................................................47
5.6.1 Contedo (F1).......................................................................................47
5.6.2 Sobre ECOLOG....................................................................................47
5.6.3 Sobre Qt................................................................................................47
GNU FREE DOCUMENTATION LICENSE......................................................50
A.1 Licena de Documentao Livre GNU...........................................................55

APRESENTAO
Bem-vindo ao ECOLOG!
Este programa distribudo como software livre, de cdigo aberto, sob a
Licena Pblica Geral GNU da Free Software Foundation (GNU GPL) e pode ser
copiado e distribudo nos termos desta Licena; nenhum usurio est autorizado a
vender, modificar ou usar o software com finalidades comerciais ou de fins lucrativos.
Notificaes de erros, comentrios, sugestes, declaraes de amor, ameaas de
morte, etc., so bem-vindas e, na medida do possvel, sero consideradas para incluso
nas prximas verses. Encaminhe-as ao Autor, no endereo abaixo:
Mauro J. Cavalcanti
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CEP 20551-970,
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E-mail: maurobio@gmail.com
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garantida a permisso para copiar, distribuir e/ou modificar este documento sob os termos da GNU Free
Documentation License, verso 1.1 ou qualquer outra verso posterior publicada pela Free Software
Foundation; sem obrigatoriedade de Sees Invariantes na abertura e ao final dos textos.
Uma cpia da licena deve ser includa na seo intitulada GNU Free Documentation License.

Captulo 1
DESCRIO DO SISTEMA
O ECOLOG um sistema gerenciador de bancos de dados mult-plataforma, projetado
para o manejo de dados sobre locais, espcies, indivduos e variveis ambientais obtidos
em levantamentos ecolgicos de campo e inventrios de biodiversidade.
O principal objetivo do ECOLOG tornar os dados obtidos dos levantamentos
de campo prontamente acessveis e teis, tanto para taxonomistas quanto para notaxonomistas, podendo fornecer listas de espcies coletadas numa rea de estudo e
tambm informaes sobre abundncia ou raridade de uma espcie em particular,
dominncia, etc., de grande valor potencial para estudos ecolgicos e de conservao.
O ECOLOG prope-se tambm a contribuir para o estabelecimento de um
padro mnimo para a coleta e o intercmbio de dados de levantamentos ecolgicos de
campo e inventrios de biodiversidade, evitando a duplicao de esforos um diferentes
instituies e projetos de pesquisa e gerenciamento ambiental.

1.1 Caractersticas
O ECOLOG oferece, entre outras caractersticas:
Facilidade de uso por pessoal sem conhecimento tcnico ou experincia prvia
em computao, utilizando planilhas eletrnicas comuns para consulta, incluso
e edio de dados.
Definio interativa de filtros para seleo de registros; qualquer atributo ou
combinao de atributos pode ser usado como critrio de recuperao de
registros, inclusive campos baseados em texto.
Relatrios pr-definidos, com sada com sada em formato HTML, incluindo a
emisso de listas de espcies e etiquetas de coleta, possibilitando a produo
automtica de pginas de apresentao na Web a partir do contedo do banco de
dados.
Gerao de estatsticas do banco de dados e grficos, clculo de ndices de
diversidade e curvas de acumulao de espcies (curva do coletor).
Armazenamento de variveis ambientais e descritores morfolgicos e
biomtricos definidos pelo usurio.
Suporte ao armazenamento e anlise estatstica de sequncias curtas de genes
para utilizao em inventrios de biodiversidade usando cdigos de barras de
DNA (DNA barcoding)
Importao/exportao flexvel de dados em vrios formatos diferentes para
intercmbio com outros programas e fontes de dados
Integrao com Google Earth1, para plotar mapas de distribuio de espcimes a
partir dos dados armazenados no banco de dados, exportados no formato KML2.

1
2

http://earth.google.com
http://earth.google.com/kml

Descrio do contedo, contexto, qualidade, estrutura e acessibilidade dos

conjuntos de dados (metadados) com base no padro de metadados ecolgicos
EML3
Mtodos de anlise multivariada de dados ecolgicos (ndices de similaridade,
anlise de agrupamentos, mtodos de ordenao).
Verses em Ingls, Francs e Espanhol, dirigidas a outros pases da Amrica
Latina, Caribe e frica;

1.1.1 Aplicaes
Algumas aplicaes potenciais do ECOLOG incluem, entre outras:
Levantamentos florsticos e faunsticos de campo;
Planejamento para conservao, auxiliando na indicao de espcies raras em
uma determinada regio e que, portanto, necessitam de medidas de conservao
apropriadas;
Manejo de reservas naturais e reas protegidas; a informao mantida pelo
sistema sobre as espcies que ocorrem em unidades de conservao pode ser
usada para aprimorar o manejo dessas reas;
Avaliao de impacto ambiental, facilitando o planejamento e a implementao
de projetos que minimizem os danos ao meio ambiente, embasando estudos e
relatrios de impacto ambiental;
Programao de excurses de coleta, pela anlise de dados fenolgicos e
reprodutivos dos coletas; o sistema permite programar adequadamente
expedies cientficas para coleta e material, de forma a abranger localidades,
habitats ou pocas do ano onde grupos importantes tenham sido pouco
coletados, contribuindo para um melhor conhecimento da composio e
diversidade da flora ou da fauna dessas reas ou habitats, assim como de sua
variao temporal.

1.1.2 Histrico
A primeira verso do ECOLOG foi desenvolvida em 1990 com apoio das Linhas de
Ao em Botnica do Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientfico e
Tecnolgico4, Programa Mata Atlntica do Jardim Botnico do Rio de Janeiro/IBAMA 5,
Instituto Brasileiro de Pesquisas e Estudos Ambientais (Pr-Natura), John D. &
Catharine T. MacArthur Foundation6 e Shell do Brasil para o Projeto Banco de Dados
da Mata Atlntica. Esta verso foi utilizada at 1991, quando foi substituda por outra
verso, incorporando diversos aperfeioamentos a nvel de projeto fsico do banco de
dados e interface de usurio (Cavalcanti, 1991; Cavalcanti, 1993).
As primeiras verses do ECOLOG foram desenvolvidas com o compilador
Clipper verso Summer 87 da Nantucket Corporation, para uso em microcomputadores
compatveis com o IBM-PC XT/AT, sob o sistema operacional MS-DOS 3.0 ou
superior.

3
4
5
6

http://knb.ecoinformatics.org/software/eml
CNPq proc. #402372/89-1//FV
CNPq proc. #407809/84.4
proc. #8900-527 Environment

A partir de 2003, a demanda por uma ferramenta de software especializada para

atender s necessidades de manejo de dados sobre locais, espcies e indivduos obtidos
no inventrio de biodiversidade do Lago Tup, na Amaznia Central, conduzido pelo
Instituto Nacional de Pesquisas da Amaznia (Projeto Biotup), despertou novo
interesse pelo desenvolvimento de uma verso atualizada do ECOLOG (Cavalcanti,
2005).
Em sua verso 4.0, liberada inicialmente em 2009, o ECOLOG foi inteiramente
re-projetado como uma aplicao multi-plataforma para os sistemas operacionais
GNU/Linux, MS-Windows e Mac OS X, utilizando a linguagem de programao
Python, a biblioteca de interface grfica de usurio wxPython e o motor de banco de
dados SQLite (Cavalcanti, 2011).
No incio de 2014, aps um longo perodo em que o desenvolvimento do
software permaneceu dormente, foi iniciado o desenvolvimento da atual verso 5.0.
Nesta nova verso, foram introduzidas muitas mudanas e aperfeioamentos em relao
a todas as verses anteriores:
A estrutura de dados baseada em uma biblioteca de banco de dados relacional foi
substituda inteiramente por planilhas eletrnicas comuns, que o usurio pode criar e
editar em seu programa favorito (Microsoft Excel, LibreOffice Calc, Gnumeric, etc.) e
utilizar diretamente no ECOLOG. Isto elimina a necessidade de "importar" dados para o
ECOLOG e torna a entrada e edio de dados muito mais rpida e amigvel para o
usurio j acostumado com planilhas eletrnicas.
A interface de usurio do ECOLOG foi re-implementada utilizando a biblioteca
Qt, em substituio biblioteca wxWidgets utilizada anteriormente. Isto permite
oferecer uma interface mais uniforme em todos os sistemas operacionais suportados e
facilita a instalao e utilizao do programa no GNU/Linux, pois automaticamente
todas as distribuies baseadas no ambiente grfico KDE (Kubuntu, OpenSUSE, Fedora
KDE, Mint KDE) so suportadas (j que o ambiente KDE baseado na biblioteca Qt).
Alm disso, a nova interface utiliza o modelo de interface mltiplos documentos (MDI),
possibilitando a visualizao simultnea dos dados de coletas e variveis ambientais em
janelas separadas) e tem menus simplificados, com termos familiares e opes que
refletem de forma mais "natural" o fluxo de trabalho do pesquisador.
Por fim, foi implementada a integrao do ECOLOG com as bibliotecas
numricas e cientficas da linguagem Python (NumPy, SciPy, Matplotlib), assim
tornando possvel no apenas armazenar e gerenciar os dados oriundos dos
levantamentos ecolgicos de campo, mas tambm analis-los diretamente a partir do
prprio ECOLOG. Esta estratgia tem a grande vantagem de possibilitar ao ECOLOG
executar vrios tipos de anlise de dados ecolgicos, ao mesmo tempo evitando a "reinveno da roda" e a re-implementao desnecessria (e ineficiente) de mtodos e
algoritmos j disponveis e testados.

1.1.3 Casos de Uso

Programa Mata Atlntica do Jardim Botnico do Rio de Janeiro/IBAMA, que

organizou uma base de dados com cerca de 20.000 registros de espcimes e
2.000 registros de espcies de plantas coletadas na Reserva Ecolgica de Maca
de Cima, Municpio de Nova Friburgo, Rio de Janeiro (Dalcin et al., 1997) e
outra com cerca de 600 indivduos e 140 espcies vegetais da Estao Ecolgica

Estadual do Paraso, Municpio de Cachoeiras de Macacu, Rio de Janeiro (Kurtz

& Arajo, 2000).
Projeto Levantamento Biolgico Integrado da Reserva Ecolgica Estadual de
Jacarepi, Municpio de Saquarema, Rio de Janeiro, da Fundao Estadual de
Engenharia do Meio-Ambiente do Rio de Janeiro (FEEMA), que organizou uma
base de dados com cerca de 300 indivduos e 200 espcies de plantas da rea (S
et al., 1991).
Projeto Biotup, do Instituto Nacional de Pesquisas da Amaznia (INPA/MCT),
Municpio de Manaus, Amazonas, direcionado ao gerenciamento e anlise dos
dados sobre a biodiversidade da Reserva de Desenvolvimento Sustentvel do
Lago Tup (Cavalcanti, 2005).

Captulo 2
CONFIGURAO
A

configurao

7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22

mnima

para

utilizao

do

ECOLOG

consiste

de:

Microcomputador compatvel com IBM-PC ou Apple Macintosh, com um disco

rgido com pelo menos 100 Mb disponveis.
Memria RAM mnima de 1 Gb Mb (2 Gb recomendado! ).
Sistema operacional GNU/Linux (KDE/GNOME), MS-Windows
(XP/Vista/7/8/10), ou Mac OS X.
Interpretador Python7 verso 2.7 ou superior (includo no pacote de instalao).
Bibliotecas de interface grfica de usurio Qt8 verso 4.1 e PyQt9 verso 4.8 ou
superior.
Biblioteca de formulrios formlayout10 verso 1.0 ou superior.
Biblioteca numrica NumPy11 verso 1.4 ou superior.
Biblioteca cientfica SciPy12 verso 0.10 ou superior.
Biblioteca grfica Matplotlib verso 0.9813 ou superior.
Biblioteca cientfica auxiliar scipy-cluster14 verso 0.20 su superior.
Biblioteca de comparao de cadeias de caracteres FuzzyWuzzy15 verso 0.10 ou
superior.
Biblioteca de acesso a servics Web SOAPPy16 verso 0.12 ou superior.
Biblioteca de geocodificao geopy verso 0.917 ou superior.
Biblioteca de acesso a arquivos Excel 97/2000/2003 xlrd18 verso 0.7 ou
superior.
Biblioteca de acesso a arquivos Excel 2007/2010 openpyxl19 verso 2.0 ou
superior.
Biblioteca de acesso a arquivos ODF ezodf20 verso 0.2 ou superior.
Biblioteca de acesso a planilhas do GoogleDocs gspread21 verso 0.2 ou
superior.
Biblioteca de acesso a arquivos dBase dbfpy22 verso 2.0 ou superior.

http://www.python.org/
http://qt-project.org/
http://www.riverbankcomputing.com/software/pyqt
http://code.google.com/p/formlayout
http://www.numpy.org/
http://www.scipy.org/
http://matplotlib.org/
http://code.google.com/p/scipy-cluster/
http://github.com/seatgeek/fuzzywuzzy
http://pywebsvcs.sourceforge.net/
http://github.com/geopy/geopy
http://www.python-excel.org/
http://openpyxl.readthedocs.org/en/2.0
http://pythonhosted.org/ezodf
http://burnash.github.com/gspread
http://dbfpy.sourceforge.net/

Engenho de banco de dados SQLite23 verso 3.0.

Todas as bibliotecas necessrias, bem como o interpretador Python, esto

includas no pacote de instalao do ECOLOG.

23 http://www.sqlite.org/

Captulo 3
INSTALAO
O ECOLOG distribudo atravs da sua pgina na Internet em
http://ecolog.sourceforge.net.
Para efetuar a instalao, baixe o pacote de distribuio de acordo com o seu
sistema operacional e proceda da seguinte maneira:
GNU/Linux
Entre no Gerenciador de Arquivos, v para a pasta onde estiver salvo o pacote de
instalao e d um duplo-clique sobre o arquivo ECOLOG-5.0.x-Linux-x86Install (onde x corresponde ao nmero da verso atual). Siga as instrues que o
programa de instalao apresentar.
MS-Windows
Abra em Meu Computador a pasta onde estiver salvo o pacote de instalao e
d um duplo-clique sobre o arquivo ECOLOG-5.0.x-Setup.exe (onde x
corresponde ao nmero da verso atual). Siga as instrues que o programa de
instalao apresentar.
MacOSX
Um pacote de instalao ainda no est disponvel. Entretanto, o programa pode
ser executado nessa plataforma diretamente a partir do cdigo-fonte, uma vez
instaladas e configuradas as dependncias necessrias.

3.1 Instalao
Ao executar o arquivo de instalao, um quadro de dilogo de confirmao ser
apresentado (Figura 3.1).

Figura 3.1: Tela Inicial de Instalao

Para prosseguir com a instalao, siga as instrues das telas seguintes,

pressionando o boto Avanar aps fornecer as informaes solicitadas pelo programa
de instalao.
Aps confirmar a instalao, a tela da Figura 3.2 ser apresentada.

Figura 3.2: Tela de Seleo da Pasta de Destino

Caso haja espao suficiente no disco, o programa de instalao criar

automaticamente uma pasta chamada ECOLOG no disco rgido do seu computador e,
em seguida, copiar para esta pasta os arquivos necessrios execuo do sistema. O

programa de instalao tambm criar um cone para o programa e adicionar o novo

grupo barra de tarefas. Aps executar este procedimento, a instalao do ECOLOG
estar completa (Figura 3.3).

Figura 3.3: Tela de Concluso da Instalao

3.2 Desinstalao
Para desinstalar o ECOLOG (na muito improvvel hiptese de que voc deseje
faz-lo! ), deve-se acessar o menu de Aplicaes no Linux ou o boto Iniciar no MSWindows e selecionar a opo Desinstalar ECOLOG no sub-menu ECOLOG. Um
quadro de dilogo de confirmao ser apresentado (Figura 3.4). Clique no boto Sim
para efetuar o processo de desinstalao do programa.

Figura 3.4: Dilogo de Confirmao da Desinstalao

Terminada a desinstalao, ser apresentada uma tela de informao indicando o

fim do processo (Figura 3.5).

Figura 3.5: Tela de Concluso da Desinstalao

Captulo 4
ENTRADA DE DADOS
Esta verso do ECOLOG oferece muito mais flexibilidade na leitura de dados de
levantamentos, pois toda a entrada, edio ou eliminao de registros de coletas e
variveis ambientais efetuado e gerenciado externamente, utilizando qualquer
programa de planilha eletrnica padro (Microsoft Excel, LibreOffice Calc, Gnumeric,
etc.).
Os tipos de arquivos de planilha que podem ser lidos pelo ECOLOG so: Texto
CSV (".csv"), Texto TSV (".txt"), Microsoft Excel 97/2000/XP/2003 (".xls"), Microsoft
Excel 2007/2010 (".xlsx") e Planilha ODF (".ods"). Arquivos do tipo Texto CSV ou
Texto TSV (ou Texto Delimitado) contm somente caracteres, espaos e quebra de
linha, sem cdigos de controle, formatao, etc., com cada dado separado por um
caractere (tabulao, vrgula, etc.) e dados de texto colocados entre aspas simples
(texto) ou duplas ("texto"). Arquivos do tipo Microsoft Excel so arquivos no formato
nativo da planilha eletrnica Microsoft Excel, verso 97 ou posterior. O ECOLOG
pode ler somente planilhas simples, com os nomes das colunas (variveis, descritores)
na primeira linha e os nomes dos objetos (amostras ou locais) na primeira coluna, e o
resto da planilha contendo dados numricos ou de texto. Note que o ECOLOG no
capaz de interpretar corretamente planilhas que contenham mais de uma linha de
cabealho, clulas fundidas, frmulas ou qualquer formatao mais sofisticada. Se o
arquivo contiver mltiplas planilhas de dados, o ECOLOG ir procurar
automaticamente a primeira planilha contida no arquivo (Figura 4.1).

Figura 4.1: Planilha de Coletas no LibreOffice Calc

A leitura e visualizao das tabelas de dados, porm, feita diretamente pelo

ECOLOG, atravs de uma interface semelhante a uma planilha eletrnica comum
(Figura 4.2). Utilizando esta interface, vrios registros podem ser visualizados por vez.
Como as tabelas de dados so maiores que o tamanho das janelas, o editor mostra
apenas os campos que nela couberem; voc pode usar o mouse ou as teclas de
movimentao para cima ou para baixo, para a esquerda ou para a direita, a fim de
mover o cursor entre os campos (colunas da tabela) e registros (linhas da tabela).

Figura 4.2: Visualizao de Planilhas de Dados no ECOLOG

4.1 Planilha de Coletas

O formato das planilhas de coleta bastante flexvel. Cada linha deve se referir a um
indivduo (registro). A primeira linha da planilha deve conter os nomes das colunas
(campos); os campos (ttulos das colunas) podem ter qualquer nome (por exemplo,
"Amostra" ao invs de "Parcela", "Nome cientfico" ao invs de "Espcie", etc.) mas
deve ser mantida a ordem das colunas, pois o ECOLOG utiliza a ordem das colunas
na planilha e no seus nomes para encontr-las e utiliz-las na gerao de relatrios e
arquivos de sada.
Nem todas as colunas so estritamente obrigatrias, apenas as quatro primeiras
na planilha de coletas. A lista de campos bsicos, requeridos ou opcionais em qualquer
planilha de coletas do ECOLOG a seguinte:
1. (Amostra) Identificador nico para a amostra, parcela, estao, etc. onde foi
coletado ou observado o indivduo. No caso de coletas aleatrias, esse cdigo
arbitrrio mas deve ser indicado!
2. (Indivduo) Identificador nico para o espcime, indivduo, lote, subamostra,
etc. que identifique cada espcime coletado em cada amostra.

3.

(Famlia) Famlia qual pertence o indivduo. Se a famlia no estiver

determinada, pode ser introduzida a abreviatura INDET.

4.

(Espcie) Nome cientfico (Gnero e espcie) do espcime; o nome do autor

pode ser includo mas opcional. seguido, se for o caso, do ano de publicao do
nome. Para mais de dois autores, deve ser utilizado et al.; use & no lugar de
e e procure lanar mo sempre das abreviaturas mais curtas (como L. ao
invs de Linn.). Somente o nome vlido mais recente deve ser utilizado. Se o
nome especfico no puder ser determinado, deve ser introduzida a abreviatura
sp. O nome pode conter tambm a categoria infraespecfica (subespcie,
variedade), qual pertence a espcie. Somente o nome vlido mais recente deve
ser utilizado, podendo incluir as abreviaturas ssp. ou var..

5.

(Coletor/Observador) Nome da pessoa primariamente responsvel pela coleta

ou observao do indivduo, consistindo das iniciais seguidas do sobrenome, e,
se necessrio, do nome do coletor secundrio, separado do nome do coletor
primrio por um espao; se houver mais de dois coletores deve-se usar et al.

6.

(Nmero do Coletor) Nmero da coleta/observao para o coletor/observador.

Esta informao impressa em etiquetas de coleta.

7.

(Data/Hora) Data da coleta/observao do indivduo, com base nos dados de

campo do coletor. Deve ser entrada no formato DD-MM-YYY e no no formato
"Data" do Excel/Calc! Se tambm for tomado o horrio da observao, este deve
ser inserido aps a data, separado por um espao, no formato HH:MM:SS

8.

(Observaes) Texto livre, contendo quaisquer informaes adicionais sobre

outros aspectos significantes relacionados ao indivduo, local e mtodo de coleta,
ambiente (observaes, comentrios, notas, etc.). Esta informao impressa em
etiquetas de coleta.

9.

(Localidade) Nome do local de coleta.

10.

(Latitude) Latitude do local de coleta, em graus decimais (ou "coordenada-X"

em levantamentos fitossociolgicos utilizando o mtodo de ponto-quadrante).

11.

(Longitude) Longitude do local de coleta, em graus decimais ("coordenada-Y"

em levantamentos fitossociolgicos utilizando o mtodo de ponto-quadrante).

12.

(Elevao (unidade)) Altitude ou profundidade do local de coleta. Onde for

dada por um intervalo (ex. 500-800 m), pode-se usar o prprio intervalo ou o
valor mdio (neste caso, 650 m). A unidade de medida deve ser indicada aps o
nome da coluna, entre parnteses.

Apenas as colunas 1 a 4 so indispensveis em qualquer planilha; as colunas 5 a

12 so necessrias para a gerao de etiquetas e catlogos de coleta, alm de alguns
relatrios. Por enquanto, o programa no verifica se todas as colunas esto presentes,
mas isso poder ser tratado nas prximas verses.

Alm dessas colunas bsicas, podem ser includas outras, contendo descritores
biomtricos ou variveis categricas definidas pelo usurio; para os descritores
biomtricos, a unidade de medida deve sempre ser indicada entre parnteses, aps o
nome da coluna. Para descritores numricos (contnuos ou discretos), no caso de valores
mltiplos (por exemplo, vrios ramos no mesmo indivduo, dos quais se mediu o
dimetro ou permetro), devem ser inseridos os valores individuais separados por um
sinal de +. Para sequncias de DNA do espcime deve ser utilizado o formato
FASTA24.

4.2 Planilha de Variveis Ambientais

O formato das planilhas de variveis ambientais ainda mais simples, com cada
varivel ocupando uma coluna da planilha (Figura 4.3). Os campos bsicos da planilha
de variveis so os seguintes:

Figura 4.3: Tabela de Variveis Ambientais no LibreOffice Calc

1.

(Amostra) Identificador do local de coleta onde foi medida a varivel.

2.

(Data/Hora) Data/hora de medio da varivel. Introduza o dia, ms e ano,

separados por barras (/) e a hora, minuto e segundo, separados por dois pontos
(:). Este campo opcional.

As demais colunas dessa planilha correspondem s variveis ambientais medidas em

cada amostra.

24 http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_list2.shtml

4.3 Planilhas do Google Docs

Esta verso do ECOLOG tambm permite a leitura direta de planilhas eletrnicas
armazenadas na Web atravs do servio Google Docs/Google Drive.
O procedimento para utilizao dessas planilhas em projetos do ECOLOG um
pouco mas elaborado, uma vez que as mesmas esto armazenadas em um servidor
remoto e no no disco rgido local, o que torna necessrio indicar ao programa a sua
localizao.
Os passos necessrios para incluir uma planilha do Google Docs em um projeto
do ECOLOG so os seguintes:
1. Acesse o Google Docs/Google Drive e localize a planilha a ser includa no
projeto (Figura 4.4); obviamente essa planilha j dever estar armazenada e
disponvel no servidor remoto.
2. No Bloco de Notas do MS-Windows ou no GEdit/KEdit do GNU/Linux crie um
arquivo de texto simples contendo na primeira linha o nome da planilha tal como
aparece no Google Docs/Google Drive (neste caso, Exemplo de Planilha
simples); o nome deve ser digitado exatamente como apresentado no Google
Docs!
3. Salve o arquivo com uma extenso qualquer que permita caracteriz-lo (por
exemplo, .docs)
4. No ECOLOG, abra um projeto existente ou crie um novo projeto e selecione a
opo Adicionar uma planilha de dados ao projeto. Selecione o arquivo
.docs criado na etapa anterior. O programa ir solicitar o nome de usurio e
senha para sua conta no Google Docs/Google Drive (Figura 4.5). O ECOLOG
no armazena o nome de usurio e senha, portanto a cada sesso que utilize
planilhas do Google Docs/Google Drive ser necessrio fornecer essa
informao.
5. Uma vez estabelecida a conexo com o servidor remoto, a planilha ser
automaticamente carregada na rea de trabalho do ECOLOG e poder ser
utilizada para emisso de relatrios, anlises, etc.
Um aspecto interessante desta funcionalidade que a utilizao de planilhas
armazenadas remotamente torna possvel que usurios diferentes trabalhem de forma
colaborativa com a(s) mesma(s) planilha(s) de dados e/ou variveis ambientais,
independentemente da localizao geogrfica de cada usurio, como j havia sido
antecipado por Cavalcanti (2005, p. 209).

Figura 4.4: Planilha do Google Docs/Google Drive

Figura 4.5: Quadro de Dilogo de Autenticao do Usurio

Captulo 5
OPERAO
Para executar o sistema, d um duplo-clique sobre o cone do programa na rea de
trabalho. O programa apresentar a tela inicial, conforme a figura abaixo (Figura 5.1).

Figura 5.1: Tela Principal do ECOLOG

A tela principal do ECOLOG composta de um menu de barras na sua parte

superior. As opes do menu podem ser selecionadas atravs das teclas de
movimentao do cursor (seta esquerda ou seta direita) ou utilizando o mouse. Para
ativar uma opo, d um clique sobre a mesma, ou pressione a tecla [ALT] juntamente
com a letra em destaque da opo (geralmente a primeira).

5.1 Projeto
Este menu oferece operaes para criar um novo projeto, abrir um projeto existente e
modificar os dados associados ao projeto (metadados), importar dados de fontes
externas e exportar dados para outros programas.
O ECOLOG utiliza arquivos de texto (com extenso ".yml", que
automaticamente inserida pelo ECOLOG) na linguagem de marcao simplificada
YAML25 para armazenar os dados do projeto. Esses arquivos podem ser abertos e
25 http://www.yaml.org/

modificados com um editor de textos simples (como o Bloco de Notas do MS-Windows

ou o KEdit/GEdit do GNU/Linux), porm isto no recomendvel e todas as alteraes
nos arquivos de projeto devem ser efetuadas mediante o prprio ECOLOG para evitar
que os dados do projeto sejam inadvertidamente corrompidos.
Os arquivos de projeto e as planilhas de dados utilizadas pelo ECOLOG podem
ter qualquer nome compatvel com o sistema operacional. Os nomes dos arquivos de
planilhas associados cada projeto so armazenados junto com os dados do prprio
projeto. Isto permite que os dados sobre diferentes grupos taxonmicos (por exemplo,
Orqudeas de Jacarepi) ou diferentes reas de levantamento (por exemplo, Flora de
Maca de Cima) sejam mantidos em separado na mesma pasta ou unidade de disco do
computador, sem qualquer confuso entre si. Usando pastas ou discos separados, um
nmero ilimitado de diferentes projetos pode ser criado e mantido pelo sistema.

5.1.1 Novo (Ctrl+N)

Esta opo permite criar um novo projeto.
Inicialmente, ser apresentado um quadro de dilogo padro, onde dever ser
inserido o nome do arquivo que armazenar o banco de dados do novo projeto (Figura
5.2).

Figura 5.2: Quadro de Dilogo Salvar Projeto

Em seguida, ser exibido um formulrio (Figura 5.3) para a incluso e/ou

alterao de dados sobre o projeto (metadados), incluindo ttulo do projeto, pas,
estado, municpio, localidade, pessoa responsvel e dados de contato, etc. Estes dados
podem ser adicionados ou modificados a qualquer momento aps a criao do projeto,
atravs da opo Modificar do menu Projeto.

Figura 5.3: Tela de Dados do Projeto

Os campos do formulrio de dados do projeto so os seguintes:

Ttulo Ttulo do projeto. Este ttulo ser impresso nas listagens de relatrios.
Responsvel Nomes do(s) responsvel ou responsveis pelo projeto. Tambm
impresso nas listagens.
Descrio Texto descritivo do projeto.
Mtodo Metodologia de coleta de dados utilizada no levantamento.
Tamanho Tamanho da unidade amostral utlizada no levantamento, com indicao da
unidade de medida.
Pas Nome do pas no qual est situada geograficamente a rea do levantamento.
Estado Unidade federativa (Estado, Provncia, Departamento) na qual est situada a
rea do levantamento. Entre o nome por extenso ou a sigla oficial, no caso dos
Estados brasileiros. Os nomes dos estados ou provncias de outros pases devem ser
introduzidos por extenso.
Municpio Nome completo da unidade administrativa (Municpio, Condado), em cuja
rea geogrfica est situada a rea do levantamento.
Localidade Nome completo da localidade em que est situada a rea do levantamento.
Latitude Latitude geogrfica da rea do levantamento, em graus decimais.
Longitude Longitude geogrfica da rea do levantamento, em graus decimais.
Altitude Elevao da rea do levantamento, com indicao da unidade de medida entre
parnteses.
Funo Funo ou papel principal do responsvel pelo projeto.
Instituio rgo ou instituio responsvel pelo projeto.

Setor Departamento ou setor institucional ao qual est vinculado o responsvel pelo

projeto.
Endereo Endereo postal do responsvel pelo projeto.
Cidade Cidade onde se localiza a instituio do responsvel pelo projeto.
Estado Nome por extenso ou sigla oficial da unidade federativa onde se localiza a
instituio do responsvel pelo projeto.
CEP Cdigo de endereamento postal do endereo do responsvel pelo projeto.
Telefone Nmero do telefone de contato do responsvel pelo projeto.
Fax Nmero do fax de contato do responsvel pelo projeto.
E-mail Endereo de correio eletrnico do responsvel pelo projeto.
Website Endereo da pgina do projeto na Internet, se houver.
Apoio Agncia de fomento ou patrocinador do projeto.
Clique em "OK" para salvar os dados ou Cancelar para cancelar as alteraes
efetuadas.
Aps o preenchimento do formulrio, ser exibido um quadro de dilogo de
confirmao (Figura 5.4), indagando se deseja adicionar agora as planilhas de dados
e/ou de variveis ambientais ao projeto. Estas planilhas podem ser adicionadas a
qualquer momento aps a criao do projeto, atravs da opo Adicionar do menu
Projeto.

Figura 5.4: Quadro de Dilogo para Adio de Planilhas ao Projeto

5.1.2 Abrir (Ctrl+O)

Esta opo permite descarregar os dados de um projeto e recarregar o sistema com os
dados de outro, sem que seja preciso sair do ECOLOG. Ao ser selecionada, ser
apresentado um quadro de dilogo padro para a escolha de um projeto j existente
(Figura 5.5).

Figura 5.5: Quadro de Dilogo Abrir Projeto

5.1.3 Modificar
Permite a alterao dos dados relativos ao projeto em uso no momento (Figura 5.3).
Clique em "OK" para salvar os dados ou Cancelar para cancelar as alteraes
efetuadas.

5.1.4 Recarregar
Permite recarregar o sistema com os dados do mesmo projeto, sem que seja preciso sair
do ECOLOG. Esta opo til quando so efetuadas modificaes
(incluso/excluso/alterao) nas planilhas de dados utilizando um programa externo de
planilha eletrnica, possibilitando a visualizao imediata das alteraes realizadas nos
dados originais.

5.1.5 Fechar
Esta opo permite fechar todas as planilhas de dados em uso e retornar tela principal
do programa.

5.1.6 Adicionar
Esta opo permite adicionar uma planilha de dados de coleta ou planilha de varaveis
ambientais ao projeto atual.

5.1.7 Remover
Esta opo permite remover uma planilha de dados de coleta ou planilha de varaveis
ambientais do projeto atual.

5.1.8 Importar
Esta opo permite importar dados de diversas fontes externas para planilhas eletrnicas
que podem ser utilizadas pelo ECOLOG.
Ao acionar este comando, ser apresentado inicialmente apresentado um quadro
de dilogo para a seleo de um projeto para qual os dados externos sero importados
(Figura 5.6). Os dados externos s podem ser importados para um projeto vazio (que
pode ser criado no momento da importao).

Figura 5.6: Quadro de Dilogo para Importao de Dados

Aps a criao do projeto que receber os dados importados, ser apresentado

um quadro de dilogo com as opes de importao (Figura 5.7), incluindo o formato
de entrada (fonte de dados externa) e o formato de sada (tipo de planilha eletrnica em
que os dados importados sero armazenados).

Figura 5.7: Tipos de Dados para Importao

Ao ser escolhida a opo que indica o formato de arquivo usado para importao
de dados, o programa apresentar um quadro de dilogo padro para selecionar o
arquivo a ser importado (Figura 5.8).

Figura 5.8: Quadro de Dilogo Importar Dados

Ao final do processo a tela da Figura 5.9 ser apresentada, indicando que o processo
de importao foi concludo.

Figura 5.9: Dilogo de Concluso da Importao de Dados

5.1.8.1 GBIF
Esta opo permite importar dados a partir de um arquivo externo obtido do portal do
GBIF (Global Biodiversity Information Facility)26.
5.1.8.2 OBIS
Esta opo permite importar uma planilha simples obtida do portal do OBIS (Ocean
Biogeographic Information System)27, no formato de texto delimitado por vrgulas.
5.1.8.3 TEAM
Esta opo permite importar uma planilha no formato utilizado pelo projeto TEAM
(Tropical Ecology Assessment & Monitoring Network)28, que tem como objetivo gerar
dados em tempo real para o monitoramento da biodiversidade tropical atravs de uma
26 http://www.gbif.org/
27 http://www.iobis.org/
28 http://www.teamnetwork.org/pt-br/

rede de estaes de campo situadas nas Amricas do Sul e Central, frica Oriental,
Madagascar e Indonsia.
O TEAM utiliza diferentes protocolos de monitoramento ("Aves", "Borboletas",
"Primatas", "Vegetao", "Clima"), portanto as planilhas de dados apresentam algumas
diferenas nos campos para cada protocolo. Consulte a documentao do protocolo do
TEAM, correspondente aos dados a serem importados, para maiores detalhes.
A figura abaixo (Figura 5.10) mostra um exemplo de uma planilha do protocolo
de Vegetao do TEAM no Microsoft Excel.

Figura 5.10: Planilha TEAM (Protocolo Vegetao) no Microsoft Excel

5.1.8.4 VertNet
Esta opo permite importar uma planilha simples obtida do portal VertNet29 no formato
de texto delimitado por tabulaes.

5.1.9 Exportar
Esta opo permite exportar dados do ECOLOG para arquivos externos em diversos
formatos que podem ser utilizados por outros programas.
Ao acionar este comando, ser apresentado um menu com as opes de
exportao (Figura 5.11).

29 http://www.vertnet.org/

Figura 5.11: Tipos de Arquivo para Exportao

Ao ser escolhida a opo que indica o formato de arquivo usado para exportao
de dados, o programa apresentar geralmente um quadro de dilogo padro para indicar
o nome do arquivo a ser exportado, de acordo com o formato de arquivo selecionado
(Figura 5.12).

Figura 5.12: Quadro de Dilogo Exportar Arquivo

Em geral, o ECOLOG tenta adivinhar a extenso apropriada para cada tipo de

arquivo e, portanto, no necessrio digitar a extenso. Alis, alguns programas (como
Google Earth, por exemplo) requerem o uso de uma extenso especifica (neste caso,
.KML) e no aceitam outras extenses. Portanto, recomendvel utilizar as extenses
fornecidas pelo ECOLOG e no alter-las.
Para alguns formatos, o ECOLOG necessita de informaes complementares e
mostrar um menu de opes antes de iniciar a exportao.
5.1.9.1 EML
Exporta os metadados do projeto para um arquivo no fomato EML (Ecological Markup
Language)30.

30 http://knb.ecoinformatics.org/software/eml/

5.1.9.2 FITOPAC 1
No caso do formato FITOPAC 1, ser exibido um quadro de dilogo simples para
indicar o nome-base para os arquivos de dados (Figura 5.13), j que nesse formato so
gerados dois arquivos diferentes (um com os nomes das famlias e espcies e o outro
com os dados numricos do levantamento), ambos com o mesmo nome mas com
extenses diferentes (.NMS para o arquivo de nomes) e (.DAD para o arquivo de dados
numricos). Consulte a documentao do FITOPAC 1 (Shepherd95) para mais detalhes.

Figura 5.13: Dilogo Exportar Arquivo para o Fitopac 1

5.1.9.3 FITOPAC 2
Exporta os dados de coleta para o formato FPD (FitoPac Dados) do programa
FITOPAC 2 (Shepherd, 2006).
5.1.9.4 KML
Exporta os registros de localidades, com suas coordenadas geogrficas, para o formato
KML (Keyhole Markup Language)31 utilizado pelo programa Google Earth32.
5.1.9.5 Shapefile ESRI
Esta opo permite exportar dados de coordenadas geogrficas para o formato
shapefile33 no padro definido pelo Environmental Systems Research Institute (ESRI),
que compatvel com todos os sistemas de informao geogrfica (SIG) disponveis
atualmente (ArcView/ArcGIS, QuantumGIS, DivaGIS, etc.).

31 http://code.google.com/apis/kml/documentation
32 http://earth.google.com/
33 http://shapelib.maptools.org/dl/shapefile.pdf

5.1.9.6 RDE/BRAHMS
Esta opo permite exportar dados para o formato RDE (Rapid Data Entry) utilizado
pelo sistema de pesquisa botnica e organizao de hebrios BRAHMS (Botanical
Research and Herbarium Management System)34 de Filer08. Estes so arquivos de
dados independentes, no formato DBF (FoxPro), que podem ser lidos e manejados
atravs do gerenciador de bancos de dados do BRAHMS.
5.1.9.7 CEP
Formato condensado utilizado pelos programas produzidos pela Universidade de
Cornell (DECORANA, TWINSPAN)35 e pelo programa CANOCO36. Para detalhes
deste formato, veja Hill79 ou terBraak88.
5.1.9.8 MVSP
Formato utilizado pelo programa para ecologia numrica e anlises multivariadas
MVSP37 (Kovach, 2007).
5.1.9.9 Fitopac
Formato FPM (FitoPac Matriz) utilizado pelo programa FITOPAC 2 (Shepherd, 2006).
5.1.9.10 CSV
Arquivos simples, contendo somente nmeros, com espaos entre os nmeros essencialmente uma matriz de dados sem qualquer outro tipo de informaes. Diversos
pacotes estatsticos ou planilhas eletrnicas conseguem ler este tipo de arquivo, e
arquivos neste formato tambm podem ser importados pela maioria dos processadores
de texto.
Para arquivos em formato de matrizes (MVSP, FPM, CSV), o programa
apresenta um quadro de dilogo solicitando o tipo de dados da matriz (Figura 5.14). No
caso de uma matriz tipo presena/ausncia, o programa atribui o valor "1" s clulas da
matriz onde uma espcie ocorre e "0" s clulas onde essa espcie no ocorre. Para
matrizes de nmero de indivduos, o programa efetua uma contagem e atribui s clulas
da matriz o nmero de indivduos onde uma espcie ocorre e 0 s clulas onde essa
espcie no ocorre.

34 http://herbaria.plants.ox.ac.uk/bol/
35 http://www.ceh.ac.uk/products/software/cehsoftware-decoranatwinspan.htm
36 http://www.wageningenur.nl/en/Expertise-Services/Research-Institutes/plant-researchinternational/show/Canoco-for-visualization-of-multivariate-data.htm
37 http://www.kovcomp.com/mvsp/

Figura 5.22: Tipos de Dados para Matrizes

5.1.10 Sair (Ctrl+Q)

Para sair do sistema, selecione a opo Sair do menu principal e clique OK (ou
tecle [ENTER]) sobre a opo Sim do quadro de dilogo de confirmao (Figura
5.15). Neste instante a janela do programa ser fechada e o controle retornar ao sistema
operacional.

Figura 5.15: Dilogo de Confirmao de Sada

5.2 Dados
Este menu contm comandos para ordenar e pesquisar registros no banco de dados e
filtrar dados.

5.2.1 Ordenar (Ctrl+S)

Seleciona uma nova ordem para a exibio e consulta dos registros, de acordo com as
opes apresentadas em um menu; a ordem de apresentao dos registros permanece
alterada at que seja novamente pressionada a combinao de teclas [CTRL+S],
retornando os registros ordem original.

5.2.2 Pesquisar (Ctrl+F)

Esta opo mostra, ao ser selecionada, uma janela onde deve ser fornecido um valor do
campo a ser pesquisado na tabela de dados, independentemente da ordem de
apresentao dos registros que estiver ativa no momento (Figura 5.16). A busca
automaticamente efetuada a partir do incio da tabela de dados, em direo ao final da
mesma.

Figura 5.16: Tela de Pesquisa de Registros

5.2.3 Filtrar
A seleo dos registros que sero includos em um relatrio ou exibidos para alterao e
consulta feita de forma amigvel atravs da tcnica QBE (Query By Example),
permitindo ao prprio usurio definir uma expresso lgica que limitar a populao de
registros que sero pesquisados (Date, 1985). Esta expresso definida por uma ou
mais combinaes de campos, conectados por E e OU.
Em linhas gerais, o procedimento consiste em:
1. Ativar, atravs da opo "Filtro" do menu, um quadro de dilogo com os campos
de uma determinada tabela, cada um dos quais podero ser selecionados para
compor a expresso.
2. Selecionar, a partir de uma lista de opes, os operadores lgicos de comparao
(maior, menor, igual, diferente, etc); a Tabela 5.1 mostra uma relao de todos os
operadores vlidos.
3. Entrar a informao para comparao no campo apropriado e clicar no boto +
para adicionar a expresso lista de expresses; as expresses j definidas
podem ser excludas da lista com os botes - (para excluir uma expresso
selecionada) ou X (para excluir todas as expresses da lista).
4. Selecionar, nos botes de rdio, os conectores (E e OU) para nova combinao
ou clicar em OK para indicar o trmino da definio da expresso.
DESCRIO FORMATO
Maior

A> B

Maior ou Igual

A >= B

Menor

A<B

Menor ou Igual

A <= B

Igual

A=B

Diferente

A <> B

Contendo

A$B

No Contendo

!(B $ A)

Tabela 5.1: Operadores Lgicos

Com os operadores lgicos do sistema, torna-se possvel fazer praticamente

qualquer tipo de consulta s tabelas de dados, por mais complicada ou complexa que
parea. Por exemplo, digamos que voc queira listar todas as espcies pertencentes
famlia MYRTACEAE armazenadas no banco de dados. Poderamos compor a
seguinte expresso (Figura 5.17):

Figura 5.17: Filtro para o campo FAMLIA

Para limitar mais ainda os registros listados, poderamos incluir a condio

apenas as pertencentes ao gnero Myrcia. A expresso ficaria ento (Figura 5.18):

Figura 5.18: Filtro para os campos FAMLIA e GNERO

Terminada a definio do filtro, a planilha de dados passar a exibir apenas os

registros que atendam condio de filtragem. Para cancelar um filtro, em qualquer
instante, selecione novamente a opo "Filtro" e feche o quadro de dilogo sem definir
nenhum critrio de filtragem.

5.3 Relatrios
Os relatrios do sistema possibilitam a recuperao de registros do banco de dados com
base em diversos atributos ou combinaes de atributos, totalmente escolha do
usurio. Todos podem ser impressos diretamente na impressora ou gravados em arquivo
de texto, no formato-padro ASCII (texto simples) ou HTML (os relatrios gravados em
disco recebem a extenso .HTM ou .TXT, de acordo com o formato escolhido).
A opo de Salvar Como apresentar um quadro de dilogo padro para salvar
arquivos, onde dever ser fornecido o nome do arquivo em que o relatrio ser gravado
(Figura 5.19). Se o arquivo de sada j existir, ser exibido um quadro de dilogo, onde
voc poder optar por regravar o arquivo ou, ento, cancelar a operao e fornecer o
nome de um novo arquivo.

Figura 5.19: Dilogo de Gravao de Arquivo de Relatrio

Esta opo til se voc desejar gravar um ou mais relatrios para impresso
posterior, quiser editar um relatrio atravs de um processador de textos ou, ainda,
quiser publicar um relatrio na Web, em formato HTML.
Qualquer processador de textos que permita a manipulao de arquivos de textos
em ASCII pode ser utilizado para editar e/ou imprimir um arquivo de sada do
ECOLOG, incluindo Microsoft Word, LibreOffice Writer e AbiWord, entre outros.
Para cada relatrio que for solicitado ao sistema, ser sempre solicitada uma
confirmao para filtragem dos registros (Figura 5.20).

Figura 5.20: Dilogo de Confirmao de Filtragem de Registros

5.3.1 Catlogo
Esta opo prepara um catlogo (checklist), a partir dos registros de locais, espcies e
coletas armazenados no banco de dados.
Cada catlogo gerado apresenta os txons em ordem alfabtica de famlias,
gneros e espcies. Abaixo de cada txon, so listadas as coletas, precedidas pelo
municpio, altitude (ou profundidade), localidade e nome do local de coleta.
A figura abaixo (Figura 5.21) fornece um exemplo de um catlogo produzido
pelo sistema.

Figura 5.21: Catlogo de Coletas

5.3.2 Etiquetas
Permite a emisso de etiquetas de coleta padronizadas para as coletas, com
especificao de critrios para a seleo de registros.
O gerador de etiquetas permite selecionar, atravs de um quadro de dilogo, o
formato de exibio das datas de coleta nas etiquetas (Figura 5.22). Esto disponveis as
opes Padro (por exemplo, 16/06/1990), Romano (por exemplo, 16-IX-1990) e
Extenso (por exemplo, 16 de Junho de 1990).

Figura 5.22: Quadro de Dilogo para Escolha de Formatos de Datas

As etiquetas podem ser enviadas diretamente para a impressora ou armazenadas

em arquivo de texto, no formato-padro ASCII ou HTML, para posterior impresso.
Abaixo apresentado um exemplo de etiqueta gerada pelo sistema (Figura 5.23).

Figura 5.23: Etiquetas de Coleta

Embora no possam ser armazenados no banco de dados, os campos

Determinador e Data da Determinao so impressos nas etiquetas, permitindo seu
posterior preenchimento, aps a identificao de cada espcime.

5.3.3 Geral
Produz uma listagem contendo as famlias, gneros e espcies em ordem alfabtica de
nomes. Esta opo til quando se deseja apenas uma relao dos nomes dos txons
presentes no banco de dados.
A figura abaixo (Figura 5.24) fornece um exemplo de um relatrio taxonmico
geral.

Figura 5.24: Relatrio Geral de Espcies

5.3.4 Estatsticas
Produz contagens estatsticas do nmero de espcies por grupo, nmero de espcies por
famlia, nmero de espcies por gnero e nmero de coletas por espcie, incluindo
tambm o clculo de ndices de diversidade (Magurran, 1988; Ludwig & Reynolds,
1988), frequncia e dominncia (Dajoz, 1978).
A escolha do tipo de relatrio estatstico desejado feita atravs de um quadro
de dilogo (Figura 5.25).

Figura 5.25: Opes de Relatrio Estatstico

5.3.4.1 Estatstica de Famlias

Apresenta uma listagem do nmero de espcies por famlia.

A figura abaixo (Figura 5.26) fornece um exemplo de um relatrio estatstico de

famlias.

Figura 5.26: Relatrio Estatstico de Famlias

5.3.4.2 Estatstica de Gneros

Apresenta uma listagem do nmero de espcies por gnero.
A figura abaixo (Figura 5.27) fornece um exemplo de um relatrio estatstico de
gneros.

Figura 5.27: Relatrio Estatstico de Gneros

5.3.4.3 Estatstica de Espcies

Apresenta uma listagem do nmero de indivduos por espcie, frequncia e dominncia,
incluindo tambm o clculo de ndices de diversidade.
As espcies so categorizadas como Constantes, Acessrias ou Acidentais
a partir dos valores das respectivas frequncias relativas, conforme proposto por Dajoz
(1978).
Os ndices de diversidade (Magurran, 1988; Ludwig & Reynolds, 1988)
calculados pelo sistema so os seguintes:

ndice

Frmula

ndice de Margalef

D1 = (S 1) / ln N

ndice de Menhinick

D2 = S / N

ndice de Simpson

C = 1 - pi2

ndice de Shannon-Weaver

H' = - pi ln pi

ndice de Hurlbert

PIE = (N / N 1) / 1 - pi2

ndice de Berger-Parker

d = Nmax / N

ndice de Macintosh

M = N - ( ni2) / (N - N)

Equitabilidade (Shannon)

J = H' / ln S

Tabela 5.2: ndices de Diversidade

onde S = nmero total de espcies, N = nmero total de indivduos, pi = (ni / N),

proporo de indivduos da i-sima espcie (ni) em relao ao nmero total de
indivduos, Nmax = nmero de indivduos da espcie mais abundante, ln = logaritmo
natural (base e). As figuras abaixo (Figuras 5.28 e 5.29) fornecem exemplos de um
relatrio estatstico de espcies, com a anlise de diversidade.

Figura 5.28: Relatrio Estatstico de Espcies

Figura 5.29: Anlise de Diversidade

Os relatrios estatsticos de famlias, gneros e espcies permitem, tambm, a

gerao de grficos de barras verticais, a partir de valores numricos de famlias,
espcies e coletas obtidos do banco de dados, com legendas e escala automtica.
A figura abaixo (Figura 5.30) ilustra um grfico gerado pelo sistema, a partir das
estatsticas de espcies.

Figura 5.30: Grfico de Frequncia de Indivduos por Espcie

5.3.4.5 Estatstica de Locais

Apresenta uma listagem do nmero de espcies e de indivduos por local.
A figura abaixo (Figura 5.31) fornece um exemplo de um relatrio estatstico de
locais.

Figura 5.31: Relatrio Estatstico de Locais

Permite tambm a gerao da curva do coletor, que torna possvel avaliar se o

nmero de espcies amostradas representa o verdadeiro nmero de espcies existente na
rea.
A figura abaixo (Figura 5.32) ilustra a curva do coletor.

Figura 5.32: Curva do Coletor

5.3.4.6 Estatstica de Descritores

Produz um resumo estatstico dos valores dos descritores observados nos indivduos. A
sada fornece, para cada carter, o respectivo tipo, o nmero de registros (indivduos)
em que o descritor codificado. Caracteres numricos inteiros e reais so resumidos
pela mdia e desvio-padro, bem como pelos valores mximos e mnimos.
A figura abaixo (Figura 5.33) fornece um exemplo de um relatrio estatstico de
descritores.

Figura 5.33: Relatrio Estatstico de Descritores

5.3.4.7 Estatstica de Variveis

Produz um sumrio estatstico das variveis ambientais. Para cada varivel, so
computadas a mdia, desvio-padro, coeficiente de variao, valor mnimo e valor
mximo, alm do nmero de registros codificados.
A figura abaixo (Figura 5.34) fornece um exemplo de um relatrio estatstico de
variveis.

Figura 5.34: Relatrio Estatstico de Variveis

5.3.4.8 Estatstica de Sequncias

Vrias estatsticas tambm podem ser computadas para as sequncias de DNA
armazenadas no banco de dados. Para cada sequncia, so computadas as frequncias
absoluta e relativa das quatro bases (A, T, C, G), bem como o total geral e a
porcentagem C-G de cada sequncia. So tambm computadas as frequncias de cdons
para cada sequncia.
A figura abaixo (Figura 5.35) apresenta um relatrio estatstico de sequncias.

Figura 5.35: Relatrio Estatstico de Sequncias

5.3.5 Nomenclatura
Verifica a consistncia taxonmica do banco de dados, indicando a classificao
taxonmica de cada espcie e autores das mesmas e listando eventuais sinnimos e
inconsistncias nomenclaturais. A verificao realizada com referncia ao ndice
taxonmico online do Catlogo da Vida do Projeto Species 200038, por isso
necessria uma conexo Internet para a emisso deste relatrio.
Esta opo gera uma lista de nomes vlidos e sinnimos para cada espcie, com
os respectivos nomes dos autores, conforme mostrado na figura abaixo (Figura 5.36).
O relatrio tambm inclui uma lista de "nomes suspeitos", que so casos onde os
nomes das espcies tm pronncias muito parecidas mas ortografias diferentes por
exemplo "Myrcia" e "Myrsia". Em muitos casos, estes nomes devem ser idnticos e a
diferena se deve apenas a um erro de digitao.
Um "ndice de qualidade taxonmica" includo ao final do relatrio, calculado
como a razo entre o nmero de nomes na planilha e o nmero de nomes vlidos
(verificados junto ao Catlogo da Vida); este ndice varia entre 0 e 1 e pode ser utilizado
como indicador quantitativo do grau de consistncia taxonmica de um levantamento.

38 http://www.sp2000.org/

Figura 5.36: Relatrio de Verificao de Nomenclatura

5.3.6 Geocodificao
Permite efetuar o georreferenciamento retrospectivo, isto , atribuir coordenadas
geogrficas (latitude, longitude) aos registros que no possuam essa informao, a partir
do nome da localidade. A verificao das coordenadas utilizando o servio Google
Maps V339, por isso necessria uma conexo Internet para a emisso deste relatrio.
Esta opo gera uma lista de localidades para cada registro, com os respectivos
nomes e coordenadas geogrficas (em graus decimais), conforme mostrado na figura
abaixo (Figura 5.37).

39 http://maps.google.com/

Figura 5.37: Relatrio de Geocodificao

5.4 Anlises
Este menu apresenta opes para realizar diversas anlises de dados, a partir do
contedo das planilhas includas em um projeto.

5.4.1 Diversidade
Efetua o clculo de ndices de diversidade com base nos "nmeros de Hill" (Magurran,
1988; Ludwig & Reynolds, 1988) para cada amostra presente na planilha de dados de
coleta (Figura 5.38)

Figura 5.38: Anlise de Diversidade

5.4.2 Agrupamento
Executa a anlise de agrupamentos (Clifford & Stephenson, 1975; Ludwig & Reynolds,
1988; Legendre & Legendre, 1998) para uma matriz de similaridade, distncia ou
correlao, compreendendo os seguintes mtodos: ligao nica (SLM), ligao
completa (CLM), mdia ponderada (WPGMA), mdia no-ponderada (UPGMA),
centroide (UPGMC), mediana (WPGMC) e mtodo de Ward (varincia mnima).
Os resultados so apresentados graficamente como um diagrama em forma de
rvore (dendrograma) que mostra a relao, em graus de similaridade ou distncia, entre
amostras ou grupos de amostras, arranjadas hierarquicamente (Figura 5.39).

Figura 5.39: Dendrograma da Anlise de Agrupamentos

Os coeficientes de similaridade, distncia e correlao calculados pelo sistema

so os seguintes:

Coeficiente

Frmula

Distncia de Bray-Curtis

dij = |xik xjk| / (xik + xjk)

Mtrica de Canberra

dij = 1 / N |xik xjk| / (xik + xjk)

Distncia Manhattan

dij = 1 / N |xik xjk|

Distncia Euclideana simples

dij = (xik xjk)2

Distncia Euclideana normalizada

dij = (xik xjk)2 / N

Distncia Euclideana quadrada

dij = (xik xjk)2

Distncia de Morisita-Horn

Cij = 2 niknjk / ( + ) NiNj

Correlao de Pearson

rij = (xik Xi)(xjk Xj) /

(xik Xi)2(xjk - Xj)2

Similaridade de Jaccard

Sij = a / (a + b + c)

Similaridade de Dice-Sorenson

Sij = 2a / (2a + b + c)

Similaridade de Kulczynski

Sij = 1 / 2 [a / (a + b) + a / (a + c)]

Similaridade de Ochiai

Sij = a / [(a + b) (a + c)]

Tabela 5.3: Coeficientes de Similaridade, Distncia e Correlao

5.4.3 Ordenao
Efetua a ordenao das amostras por anlise de componentes principais, anlise de
coordenadas principais, escalonamento multidimensional no-mtrico, anlise de
correspondncias, anlise de redundncias e anlise de correspondncia cannica.
Os resultados das tcnicas de ordenao so apresentados graficamente em
diagramas de disperso bidimensionais (Figura 5.40), para representar mais claramente
os padres de relaes entre as amostras e/ou as espcies analisadas.

Figura 5.40: Diagrama de Disperso de Ordenao

5.4.3.1 Anlise de Componentes Principais

Efetua a anlise de componentes principais para uma matriz de correlao ou
covarincia entre as espcies, fornecendo os autovalores e autovetores, bem como uma
lista dos componentes principais com as varincias percentuais devidas cada uma
(Figura 5.41).

Figura 5.41: Anlise de Componentes Principais

Opcionalmente, permite centrar, estandartizar ou transformar a matriz de dados

(Figura 5.42). As transformaes disponveis so: logaritmo comum (base 10),
logaritmo natural (base e), raiz quadrada e arcosseno.

Figura 5.42: Opes da Anlise de Componentes Principais

5.4.3.2 Anlise de Coordenadas Principais

Efetua a anlise de coordenadas principais para uma matriz de distncia entre as
amostras, fornecendo os autovalores e autovetores, bem como uma lista das
coordenadas principais com as varincias percentuais devidas cada uma (Figura 5.43).

Figura 5.43: Anlise de Coordenadas Principais

Opcionalmente, permite transformar a matriz de dados (Figura 5.44). As

transformaes disponveis so: logaritmo comum (base 10), logaritmo natural (base e),
raiz quadrada e arcosseno.

Figura 5.44: Opes da Anlise de Coordenadas Principais

5.4.3.3 Escalonamento Multidimensional No-Mtrico

Efetua o escalonamento multidimensional no-mtrico, que permite posicionar as
amostras em um espao de dimenses reduzidas, de modo a obter a menor tenso
(stress) entre a configurao das amostras e a matriz de distncia original (Figura 5.45).

Figura 5.45: Escalonamento Multidimensional No-Mtrico

Opcionalmente, permite transformar a matriz de dados, definir o nmero de

interaes para minimizar o nvel de stress e a configurao inicial da anlise, que pode
ser aleatria ou obtida de uma anlise de coordenadas principais efetuada
automaticamente (Figura 5.46).

Figura 5.46: Opes do Escalonamento Multidimensional No-Mtrico

5.4.3.4 Anlise de Correspondncias

Efetua a anlise de correspondncias (mdias recprocas) para uma matriz de associao
de qui-quadrado, computada simultaneamente entre as espcies e as amostras, sendo os
valores resultantes ajustados em percentagens (Ludwig & Reynolds, 1988; Legendre &
Legendre, 1998), fornecendo os autovalores e autovetores, bem como uma lista dos

componentes principais com as varincias percentuais devidas cada uma (Figura

5.47).

Figura 5.47: Anlise de Correspondncias

Opcionalmente, permite transformar a matriz de dados. As transformaes

disponveis so: logaritmo comum (base 10), logaritmo natural (base e), raiz quadrada e
arcosseno.
5.4.3.5 Anlise de Redundncias
Efetua a anlise de redundncias (Legendre & Legendre, 1998) com o objetivo de
maximizar a varincia na matriz de dados de abundncia de espcies, em funo de uma
combinao linear das variveis contidas na matriz de variveis ambientais
Opcionalmente, permite transformar a matriz de dados. As transformaes
disponveis so: logaritmo comum (base 10), logaritmo natural (base e), raiz quadrada e
arcosseno.
Para executar esta anlise, o nmero de linhas da matriz de dados de abundncia
de espcies no pode ser menor do que o nmero de colunas da matriz de variveis
ambientais.
5.4.3.6 Anlise de Correspondncias Cannica
Efetua a anlise de correspondncias cannica (Legendre & Legendre, 1998), cujo
objetivo tambm produzir uma combinao linear dos escores das espcies, amostras e
variveis ambientais (Figura 5.48).

Figura 5.48: Anlise de Correspondncia Cannica

Esta anlise produz escores em escalas diferentes que melhor representam as

amostras ou as espcies. O programa oferece os dois tipos de escore como opes
(Figura 5.49)

Figura 5.49: Opes da Anlise de Correspondncia Cannica

Opcionalmente, tambm possvel selecionar apenas algumas variveis

ambientais para incluso na anlise, atravs de um quadro de dilogo (Figura 5.50).
Clique em "OK" para incluir automaticamente todas as variveis disponveis na anlise.

Figura 5.50: Quadro de Dilogo para Seleo de Variveis Ambientais

Para executar esta anlise, as matrizes de abundncia de espcies e de variveis

ambientais devem ter o mesmo nmero de linhas (amostras).

5.5 Janela
A interface de usurio do ECOLOG baseada no padro MDI (Multiple Document
Interface Interface de Mltiplos Documentos), permitindo exibir simultaneamente
diferentes tipos de planilhas (coletas e variveis ambientais). Neste tipo de interface,
todas as janelas ocupam a rea principal da aplicao e podem ser movidas e
redimensionadas livremente, mas apenas uma janela est ativa por vez.
Este menu apresenta a lista de janelas abertas e opes bsicas para organiz-las.

5.5.1 Prxima
Move o foco para a prxima janela na lista de janelas (se houver).

5.5.2 Anterior
Move o foco para a janela anterior na lista de janelas (se houver).

5.5.3 Em Cascata
Organiza as janelas da aplicao uma sobre a outra (Figura 5.51).

Figura 5.51: Janelas Organizadas em Cascata

5.5.4 Lado a Lado Vertical

Organiza as janelas da aplicao uma ao lado da outra, verticalmente (Figura 5.52).

Figura 5.52: Janelas Organizadas Verticalmente

5.5.5 Lado a Lado Horizontal

Organiza as janelas da aplicao uma ao lado da outra, horizontalmente (Figura 5.53).

Figura 5.53: Janelas Organizadas Horizontalmente

5.5.6 Fechar
Fecha a janela que tem o foco atual.

5.6 Ajuda
Esta opo oferece ajuda de contexto em campos especficos das planilhas de entrada e
edio de dados e exibe informaes gerais sobre o programa.

5.6.1 Contedo (F1)

Ativa a ajuda de contexto (se houver) para o campo da planilha de edio de dados
sobre o qual estiver posicionado o cursor.

5.6.2 Sobre ECOLOG

Exibe um quadro de dilogo com informaes sobre o tipo de plataforma, bibliotecas de
interface e banco de dados, nmero da verso e autoria do ECOLOG (Figura 5.54).

Figura 5.54: Informaes sobre o ECOLOG

5.6.3 Sobre Qt
Exibe um quadro de dilogo com informaes sobre a biblioteca de interface Qt (Figura
5.55).

Figura 5.55: Informaes sobre a biblioteca de interface Qt

Referncias Bibliogrficas
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Apndice A
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the GNU General Public License, to permit their use in free software.

A.1 Licena de Documentao Livre GNU

Esta uma traduo no oficial da Licena de Documentao Livre GNU em Portugus do
Brasil. Ela no publicada pela Free Software Foundation, e no se aplica legalmente
distribuio de documentos que usem a GNU LDL apenas o texto original em Ingls da GNU
FDL se aplica. Contudo, esperamos que esta traduo ajude os falantes desta lngua a entender
melhor a GNU GFL.
NOTA DO TRADUTOR
Traduo: Norton T. Roman ([1])
Reviso: Joo S. O. Bueno Calligaris ([2])
ltima Atualizao: 01 de Maio de 2005.
Cpias exatas e distribuio deste documento so permitidas em qualquer meio desde que a
nota de direitos autorais (copyright) e esta nota sejam preservadas.
Licena de Documentao Livre GNU Verso 1.2, Novembro de 2002
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Boston, MA 02111-1307 USA.
permitido a qualquer um copiar e distribuir cpias exatas deste documento de licena,
embora no seja permitido alter-lo.
0. PREAMBULO
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funcional e til seja livre, garantindo a todos a liberdade efetiva de copi-lo e redistribu-lo, com
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mesmo tempo, considerados responsveis por modificaes feitas por outros.
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derivados do documentos devem, por sua vez, ser livres no mesmo sentido. Ela complementa a
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independentemente do assunto ou se publicado como um livro impresso. Ns recomendamos
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Esta licena se aplica a qualquer manual ou outro trabalho, em qualquer meio, que contenha
uma nota introduzida pelo detentor dos direitos autorais dizendo que o documento pode ser
distribudo sob os termos desta. Tal nota garante uma licena mundial, livre de royalties, de
durao ilimitada, para usar este trabalho sob as condies aqui colocadas. O Documento,
abaixo, se refere a qualquer tal manual ou trabalho. Qualquer membro do pblico um
licenciado, e ser tratado por voc. Voc aceita a licena se copiar, modificar ou distribuir o
trabalho de um modo que necessite de permisso de acordo com a lei de direitos autorais.

Uma Verso Modificada do Documento se refere a qualquer trabalho contendo o

Documento ou uma parte deste, quer seja copiado sem modificaes, quer com modificaes
e/ou traduzido para outra lngua.
Uma Seo Secundria um apndice com nome ou uma seo inicial do Documento que
trata exclusivamente da relao dos editores ou autores do Documento com seu assunto geral
(ou temas relacionados) e no contm nada que possa estar diretamente dentro do assunto geral.
Assim, se o Documento em parte um livro- texto de matemtica, uma Seo Secundria no
pode explicar nada de matemtica. Tal relao pode ser uma conexo histrica com o assunto ou
com temas relacionados, ou tratar de questes legais, comerciais, filosficas, ticas ou polticas
com relao a eles.
Sees Invariantes so certas Sees Secundrias cujos ttulos so designados como
sendo de Sees invariantes na nota que afirma que o Documento publicado sob esta Licena.
Se uma seo no se encaixa na definio acima de Secundria, ento no se permite que seja
designada como Invariante. O Documento pode no conter nenhuma Seo Invariante. Se o
documento no identificar quaisquer Sees Invariantes, ento no h nenhuma.
Textos de Capa so certas passagens de texto que so listada como Textos de Capa
Frontal ou Texto de Quarta Capa, na nota que afirma que o Documento publicado sob esta
Licena. Um Texto de Capa Frontal pode ter no mximo 5 palavras, e um Texto de Quarta Capa
pode ter no mximo 25 palavras.
Uma cpia Transparente do Documento significa uma cpia que pode ser lida pelo
computador, representada em um formato cuja especificao esteja disponvel ao pblico geral,
que seja apropriada para a imediata reviso do documento usando-se editores de texto genricos
ou (para imagens compostas de pixeis) programas grficos genricos ou (para desenhos) algum
editor de desenhos amplamente disponvel, e que seja apropriado para incluso em formatadores
de texto ou para traduo automtica para uma variedade de formatos apropriados para incluso
em formatadores de texto. Uma cpia feita em outro formato de arquivo Transparente cuja
marcao, ou ausncia desta, foi manipulada para impedir ou desencorajar modificao
subseqente pelos leitores no Transparente. Um formato de imagem no Transparente se
usado em lugar de qualquer quantidade substancial de texto. Uma cpia que no
Transparente chamada Opaca.
Exemplos de formatos apropriados para cpias Transparentes incluem ASCII puro sem
marcao, formato de entrada Texinfo, LaTex, SGML ou XML usando um DTD publicamente
disponvel, e HTML padro simples, PostScript ou PDF projetados para modificao por
humanos. Exemplos de formatos de imagem transparentes incluem PNG, XCF e JPG. Formatos
Opacos incluem formatos proprietrios que podem ser lidos e editados somente por
processadores de texto proprietrios, SGML ou XML para os quais o DTD e/ou ferramentas de
processamento no so largamente disponibilizadas, e HTML, Postscript ou PDF gerados
automaticamente com propsito apenas de sada por alguns processadores de texto.
Pgina de Ttulo significa, para um livro impresso, a prpria pgina do ttulo, alm das
pginas subseqentes necessrias para conter, de forma legvel, o material que esta Licena
requer que aparea na pgina do ttulo. Para trabalhos em formatos que no tm uma pgina de
ttulo assim, Pgina de Ttulo significa o texto prximo ocorrncia mais proeminente do
ttulo do trabalho, precedendo o incio do corpo do texto.
Uma seo Intitulada XYZ significa uma sub-unidade com nome do Documento cujo
ttulo ou precisamente XYZ ou contm XYZ em parnteses seguindo o texto que traduz XYZ
em outra lngua. (Aqui XYZ representa o nome de uma seo especfica mencionado acima, tal
como Agradecimentos, Dedicatria, Apoio, ou Histrico.) Preservar o Ttulo de uma
seo assim quando voc modifica o Documento significa que ela continua sendo uma seo
Intitulada XYZ de acordo com esta definio.
O Documento pode incluir Notas de Garantia em seguida nota que afirma que esta
Licena se aplica ao Documento. Estas Notas de Garantia so tidas como inclusas por referncia

nesta Licena, mas somente com relao s notas de garantia: qualquer outra implicao que
estas Notas de Garantia possam ter anulada e no tem efeito algum no contedo desta Licena.
2. COPIAS LITERAIS
Voc pode copiar e distribuir o Documento em qualquer meio, comercialmente ou nocomercialmente, desde que esta licena, as notas de direitos autorais (copyright), e a nota de
licena afirmando que esta Licena se aplica ao Documento sejam reproduzidas em todas as
cpias, e que voc no inclua outras condies, quaisquer que sejam, s condies desta
Licena. Voc no pode usar de medidas tcnicas para obstruir ou controlar a leitura ou cpia
futura das cpias que voc fizer ou distribuir. Contudo, voc pode aceitar compensao em troca
das cpias. Se voc distribuir um nmero suficientemente grande de cpias, voc deve tambm
respeitar as condies na seo 3.
Voc pode tambm emprestar cpias, sob as mesmas condies acima mencionadas, e voc
tambm as pode mostrar publicamente.
3. COPIANDO EM QUANTIDADE
Se voc publicar cpias impressas (ou cpias em um meio que normalmente tem capas
impressas) do documento, em nmero maior que 100, e a nota de licena do Documento requer
Textos de Capa, voc deve encadernar as cpias em capas que carreguem, de forma clara e
legvel, todos estes Textos de Capa: Textos de Capa Frontal na capa frontal, e Textos de Quarta
Capa na quarta capa. Ambas as capas devem tambm identificar, de forma clara e legvel, voc
como o editor das cpias. A capa frontal deve apresentar o ttulo completo com todas as palavras
deste igualmente proeminentes e visveis. Voc pode adicionar outro material nas capas. Cpias
com mudanas limitadas s capas, desde que preservando o ttulo do Documento e satisfazendo
estas condies, podem ser tratadas como cpias literais em outros aspectos.
Se os textos necessrios a qualquer uma das capas so demasiado volumosos para serem
includos de forma legvel, voc deve colocar os primeiros listados (quantos couberem
razoavelmente) na prpria capa, e continuar o resto nas pginas adjacentes.
Se voc publicar ou distribuir cpias Opacas do Documento em nmero maior que 100,
voc deve ou incluir uma cpia Transparente legvel por computador juntamente com cada
cpia Opaca, ou dizer em, ou juntamente com, cada cpia Opaca um endereo de rede a partir
do qual o pblico geral possa acessar e obter, usando protocolos de rede pblicos padro, uma
cpia Transparente completa do Documento, livre de material adicionado. Se voc decidir pela
segunda opo, voc deve seguir passos razoavelmente prudentes, quando comear a distribuir
as cpias Opacas em quantidade, para garantir que esta cpia transparente permanecer
acessvel no local indicado por pelo menos um ano aps a ltima vez que voc distribuir uma
cpia Opaca (diretamente ou atravs de seus agentes ou distribuidor) desta edio ao pblico.
solicitado, mas no exigido, que voc contate os autores do Documento muito antes de
redistribuir qualquer nmero grande de cpias, para dar a eles uma chance de lhe fornecer uma
verso atualizada do Documento.
4. MODIFICAES
Voc pode copiar e distribuir uma Verso Modificada do Documento sob as condies das
sees 2 e 3 acima, desde que voc fornea a Verso Modificada estritamente sob esta Licena,
com a Verso Modificada no papel de Documento, permitindo assim a distribuio e
modificao da Verso Modificada a quem quer que possua uma cpia desta. Alm disso, voc
deve executar os seguintes procedimentos na Verso Modificada:
* A. Use na Pgina de Ttulo (e nas capas, se alguma) um ttulo distinto do ttulo do
Documento, e dos de verses anteriores (os quais devem, se houver algum, ser listados na seo
Histrico do Documento). Voc pode usar o mesmo ttulo que uma verso prvia se o editor
original daquela verso assim o permitir.
* B. Liste na Pgina de Ttulo, como autores, uma ou mais pessoas ou entidades
responsveis pela autoria ou modificaes na Verso Modificada, juntamente com pelo menos
cinco dos autores principais do Documento (todos seus autores principais, se houver menos que
cinco), a menos que estes lhe desobriguem desta exigncia.

* C. Mencione na Pgina de Ttulo o nome do editor da Verso Modificada, como seu

editor.
* D. Preserve todas as notas de direitos autorais (copyright) do Documento.
* E. Adicione uma nota apropriada de direitos autorais para suas modificaes, adjacente s
outras notas de direitos autorais.
* F. Inclua, imediatamente aps as notas de direitos autorais, uma nota de licena dando ao
pblico permisso para usar a Verso Modificada sob os termos desta Licena, na forma
mostrada no Adendo abaixo.
* G. Preserve naquela nota de licena a lista completa de Sees Invariantes e Textos de
Capa requeridos dados na nota de licena do Documento.
* H. Inclua uma cpia inalterada desta Licena.
* I. Preserve a seo intitulada Histrico, preserve seu ttulo, e adicione a esta um item
mencionando pelo menos o ttulo, ano, novos autores, e editor da Verso Modificada conforme
includo na Pgina de Ttulo. Se no houver uma seo intitulada Histrico no Documento,
crie uma mencionando o ttulo, ano, autores e editor do Documento como mostrado na Pgina
de Ttulo, em seguida adicione um item descrevendo a Verso Modificada como mencionado na
sentena anterior.
* J. Preserve o endereo de rede, se algum, dado no Documento para acesso pblico a uma
cpia Transparente deste e, da mesma maneira, os endereos de rede dados no Documento para
verses prvias nas quais este se baseia. Estes podem ser colocados na seo Histrico. Voc
pode omitir um endereo de rede para um trabalho que foi publicado pelo menos quatro anos
antes do Documento em si, ou se o editor original da verso qual o endereo se refere der
permisso.
* K. Para qualquer seo intitulada Agradecimentos ou Dedicatria, preserve o ttulo da
seo, e preserve dentro da seo toda a substncia e tom de cada um dos agradecimentos e/ou
dedicatrias l mencionados.
* L. Preserve todas as Sees Invariantes do Documento, inalteradas no seu texto e ttulos.
Nmeros de seo ou o equivalente no so considerados parte dos ttulos das sees.
* M. Apague qualquer seo intitulada Apoio. Tal seo no ser includa na Verso
Modificada.
* N. No modifique o ttulo de qualquer seo a ser intitulada Apoio ou que resulte em
conflito com ttulo de qualquer Seo Invariante.
* O. Preserve quaisquer notas de garantia.
Se a Verso Modificada incluir novas sees iniciais ou apndices que sejam qualificados
como Sees Secundrias, e no contiver material copiado do Documento, voc pode, a seu
critrio, tornar algumas dessas ou todas essas sees em invariantes. Para fazer isso, adicione
seus ttulos lista de Sees Invariantes na nota de licena da Verso Modificada. Estes ttulos
devem ser distintos de quaisquer outros ttulos de sees.
Voc pode incluir uma seo intitulada Apoio, dado que ela contenha nada alm de apoio
recebido para sua Verso Modificada por vrias fontes por exemplo, notas do revisor ou de
que o texto foi aprovado por uma organizao como a definio autoritativa de um padro.
Voc pode adicionar uma passagem de at cinco palavras como Texto de Capa Frontal, e
uma passagem de at 25 palavras como Texto de Quarta Capa, ao fim da lista de Textos de Capa
na Verso Modificada. Somente uma passagem de Texto de Capa Frontal e uma de Texto de
Quarta Capa pode ser adicionado por (ou atravs de arranjos feitos por) uma entidade qualquer.
Se o Documento j incluir um texto de capa para a mesma capa, previamente includo por voc
ou por arranjo feito pela mesma entidade em cujo nome voc est agindo, voc no pode
adicionar outro; mas voc pode substituir o antigo, com permisso explcita do editor anterior,
que o incluiu.
O(s) autor(es) e editor(es) do Documento, por esta Licena, no do permisso para seus
nomes serem usados para publicidade ou defesa ou apoio implcito para qualquer Verso
Modificada.

5. COMBINANDO DOCUMENTOS
Voc pode combinar o documento com outros documentos publicados sob esta Licena, sob
os termos definidos na seo 4 acima para verses modificadas, desde que voc inclua na
combinao todas as Sees Invariantes de todos os documentos originais, sem modificaes, e
as liste como Sees Invariantes de seu trabalho combinado, na sua nota de licena, e que voc
preserve todas as Notas de Garantia.
O trabalho combinado somente precisa conter uma cpia desta Licena, e mltiplas Sees
Invariantes idnticas podem ser substitudas por uma nica cpia. Se houver mltiplas Sees
Invariantes com o mesmo nome, porm com contedos diferentes, torne o ttulo de cada uma
destas sees nico, adicionando ao fim dele, entre parnteses, o nome do autor ou editor
original desta seo, se conhecido, ou ento um nmero nico. Faa o mesmo ajuste nos ttulos
de seo na lista de Sees Invariantes na nota de licena do trabalho combinado.
Na combinao, voc deve combinar quaisquer sees intituladas Histrico nos vrios
documentos originais, formando uma seo intitulada Histrico; do mesmo modo, combine
quaisquer sees intituladas Agradecimentos, e quaisquer sees intituladas Dedicatria.
Voc deve apagar todas as sees intituladas Apoio.
6. COLEES DE DOCUMENTOS
Voc pode fazer uma coleo consistindo do Documento e outros documentos publicados
sob esta Licena, e substituir as cpias individuais desta Licena, nos vrios documentos, por
uma nica cpia a ser includa na coleo, desde que voc siga as regras desta Licena para
cpias literais de cada documento em todos os outros aspectos.
Voc pode extrair um nico documento desta coleo, e distribu-lo individualmente sob
esta Licena, desde que voc insira uma cpia desta Licena no documento extrado, e siga esta
Licena em todos os outros aspectos com relao cpia literal do documento.
7. AGREGAO A TRABALHOS INDEPENDENTES
Uma compilao do Documento ou seus derivados com outros documentos ou trabalhos
separados e independentes, dentro de ou junto a um volume de um meio de armazenagem ou
distribuio, configura um agregado se os direitos autorais resultantes da compilao no
forem usados para limitar os direitos legais dos usurios desta alm do que os trabalhos
individuais permitem. Quando o Documento includo em um agregado, esta Licena no se
aplica aos outros trabalhos no agregado que no forem, por sua vez, derivados do Documento.
Se o requerimento do Texto de Capa da seo 3 for aplicvel a estas cpias do documento,
ento, se o Documento for menor que metade do agregado inteiro, os Textos de Capa do
Documento podem ser colocados em capas que encerrem o Documento dentro do agregado, ou
o equivalente eletrnico das capas se o Documento estiver em formato eletrnico. Do contrrio,
eles devem aparecer como capas impressas que envolvam o agregado inteiro.
8. TRADUES
Uma traduo considerada como sendo um tipo de modificao, ento voc pode
distribuir tradues do Documento sob os termos da seo 4. A substituio de Sees
Invariantes por tradues requer permisso especial dos detentores dos direitos autorais, embora
voc possa incluir tradues de algumas ou todas as Sees Invariantes juntamente s verses
originais destas. Voc pode incluir uma traduo desta Licena, e todas as notas de licena no
Documento, e qualquer Nota de Garantia, desde que voc tambm inclua a verso original em
Ingls desta Licena e as verses originais das notas de licena e garantia. Em caso de
discordncia entre a traduo e a verso original desta Licena ou nota de licena ou garantia, a
verso original prevalecer.
Se uma seo no Documento for intitulada Agradecimentos, Dedicatria, ou
Histrico, o requerimento (seo 4) de Preservar seu Ttulo (seo 1) tipicamente exigir a
mudana do ttulo em si.
9. TERMINO
Voc no pode copiar, modificar, sub-licenciar, ou distribuir o Documento exceo do
modo expressamente provido por esta Licena. Qualquer outra tentativa de copiar, modificar,

sub-licenciar ou distribuir o Documento anulada, e implicar em trmino automtico de seus

direitos sob esta Licena. Contudo, as partes que receberam cpias, ou direitos, de voc sob esta
Licena no tero suas licenas terminadas enquanto tais partes permanecerem em total acordo
com a Licena.
10. REVISES FUTURAS DESTA LICENA
A Free Software Foundation pode publicar novas verses revisadas da Licena de
Documentao Livre GNU de tempos em tempos. Tais verses sero similares em esprito
verso presente, embora possam diferir em detalhes para abordar novos problemas ou questes.
Veja http://www.gnu.org/copyleft/.
A cada verso da Licena dado um nmero de verso distinto. Se o Documento especificar
que um nmero de verso particular desta Licena ou qualquer verso posterior se aplica a
ele, voc tem a opo de seguir os termos e condies ou da verso especificada ou de qualquer
verso posterior que tenha sido publicada (no como rascunho) pela Free Software Foundation.
Se o documento no especificar um nmero de verso desta Licena, voc pode escolher
qualquer verso j publicada (no como rascunho) pela Free Software Foundation.
ADENDO: Como usar esta Licena em seus documentos
Para usar esta Licena em um documento que voc escreveu, inclua uma cpia desta no
documento e adicione as seguintes notas de direitos autorais e licena logo aps a pgina de
ttulo:
Copyright (c) ANO SEU NOME.
garantida a permisso para copiar, distribuir e/ou modificar este
documento sob os termos da Licena de Documentao Livre GNU (GNU
Free Documentation License), Verso 1.2 ou qualquer verso posterior
publicada pela Free Software Foundation; sem Sees Invariantes,
Textos de Capa Frontal, e sem Textos de Quarta Capa. Uma cpia da
licena includa na seo intitulada GNU Free Documentation
License.
Se voc tiver Sees Invariantes, Textos de Capa Frontal e Textos de Quarta Capa, substitua
a linha sem Sees...Capa. por isto:
com as Sees Invariantes sendo LISTE SEUS TTULOS, com os Textos
de Capa Frontal sendo LISTA, e com os Textos de Quarta Capa sendo
LISTA.
Se voc tiver Sees Invariantes sem Textos de Capa, ou alguma outra combinao dos trs,
mescle estas duas alternativas para se adequar situao.
Se seu documento contiver exemplos no-triviais de cdigo de programao,
recomendamos publicar estes exemplos paralelamente, sob a licena de software livre que voc
escolher, como por exemplo a Licena Pblica Geral GNU (GNU General Public License), para
permitir seu uso em software livre.