Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
Metabolomics
5 | 2002
Y. R . A b d e l Fa t t a h 2 )
R . D. S c h m i d 1 )
S. L a n g e 1 )
1)
Universitt Stuttgart
2)
B4.13
Molekulargenetische Untersuchungen
zur Detektion eines
Tryptophan-5-Halogenasegens
S. Z e h n e r *
K.H. van Pe
TU Dresden
B5. Metabolomics
Metabolic Profiling:
Linking Gene to Function Directly
Es konnten zahlreiche Arten grampositiver und
gramnegativer proteolytischer und fermentativer Mikroorganismen zeitabhngig bestimmt werden. Der besondere
Stellenwert der zu bestimmten Zeiten in sehr starkem Mae
nachweisbaren Enterococcen als Zeigerorganismen wird
gegenwrtig genauer untersucht. Das gleiche trifft fr die
Organismengruppe der Methanogenen zu.
R . Tr e t h e w e y
metanomics GmbH & Co. KGaA, Berlin
B4.11
D r. i r. A . L o m m e n *
D r. i r. J. J. M . V e r v o o r t
D r. M . W . F. N i e l e n
D r. H . P. J. M . N o t e b o r n
1)
2)
B4.12
5 | 2002
comparison of complex data (NMR and full scan MS) is becoming feasible despite problems in data alignment. With
the automation advance made in Wageningen compounds of interest can be selected through empirical analysis of data acquired on standard NMR and LC-MS. LC-MS
combined with this metabolomics strategy finds certain
masses at certain elution times, which could be of importance. Once tracked, these compounds can be further characterized. Interestingly, modern LC-NMR-MS is equipped to
automatically transfer a mass-detected compound to the
NMR. It therefore is highly probable, that LC-NMR-MS could
be ideally suited for identification within this metabolomics
strategy. This avenue of research will be pursued in the near
future in Wageningen. A wide range of research can benefit
from this approach, such as for instance the fields of genomics, authenticity, food safety.
Metabolomics
Dipl.-Chem. A. Buchholz
P r o f. C . W a n d r e y
D r. R . Ta k o r s
Forschungszentrum Jlich GmbH, Institut fr Biotechnologie 2, Leo-Brandt-Strae, D-52425 Jlich.
Quantitative Untersuchungen des mikrobiellen Stoffwechsels, beispielsweise durch Anwendung der schnellen Probennahmetechnik mit nachfolgender in vivo-Verfolgung der
intrazellulren Stoffwechseldynamik, erfordern die parallele Messung einer Vielzahl von Metaboliten und deren
gleichzeitige Quantifizierung. Dabei kann es sich sowohl um
chemisch differente (z. B. Zuckerphosphate, Aminosuren)
als auch sehr hnliche Substanzen (z. B. Glucose-6-Phosphat (G6P), Fructose-6-Phosphat (F6P)) handeln. Zwar bietet die Verwendung (bekannter) enzymatischer Assays den
Zugang zu einigen Zentralstoffwechselmetaboliten, doch
lsst sich diese Technik nur bedingt auf interessierende Biosynthesewege (wie z. B. Aromatenbiosyntheseweg) wegen
mangelnder Enzymverfgbarkeit bertragen. Darber hinaus bestehen enzymatische Methoden oftmals aus kaskadierten, Fehler behafteten Messschritten, die vergleichsweise groe Probenmengen bentigen und damit die
Datendichte unntig verringern. Daher ist es Ziel der LCMS/MS-Metabolitquantifizierung, ein mglichst universelles, hoch-paralleles Messsystem zu entwickeln, dass die
Messung vieler Metabolite aus einer vergleichbar geringen
Probenmenge mit hoher Messgenauigkeit erlaubt. Wegen
des wissenschaftlichen und industriellen Interesses steht
neben dem Zentralstoffwechsel auch der Aromaten-Biosyntheseweg im Mittelpunkt der Untersuchungen.
Die Kopplung der HPLC mit einem massenspezifischen Detektor (z. B. ESI-LCQ, Finnigan) erffnet eine
neue Mglichkeit fr die Identifizierung und Quantifizie-
697