BIOINFORMTICA

Biologia Marinha e Biotecnologia/ESTM

3Ano

Aula n4

Patrcia Abrantes
patricia.abrantes@estm.ipleiria.pt
Gabinete 18
Segunda-feira: 11h00-12h00
Quinta-feira: 11h 13h00

ORF: Open Reading Frame Putative proteins

Regio codificante
a) Inicia-se num ATG (metionina) e termina num codo STOP
b) Pode ser igual a um gene no caso de. no ocorrer splicing de mRNA

Uma regio hypothetical ORF uma ORF de um genoma

sequenciado, qual no foi atribuda nenhuma
identificao funcional.

Atribuio de identificao a uma hypothetical ORF

Uma regio ORF passa a ser identificada desde que:
1. Um gene tenha sido sequenciado experimentalmente e
submetida base de dados.
2. A sequncia tenha homologia com genes conhecidos,
identificados em outros organismos.

Entrez Gene para o gene GLO1

Entrez Gene para o gene AKR1B1 humano

Entrez Gene para o gene AKR1B1 humano

Estrutura do pr-mRNA e do mRNA em clulas eucariotas

superiores:

e.g.
Para o ALDOSE REDUTASE HUMANO:

Gene 16782 bp

mRNA

CDS

1416 bp
951 bp

Entrez Gene para o gene RCA de Arabidopsis

Entrez Gene : links rpidos para sequncias

mRNA

Gene

Protena

Entrez Gene : links rpidos para sequncias

Gene do Aldose Redutase Humano:

mRNA do Aldose Redutase Humano:

CDS do Aldose Redutase Humano:

CDIGO GENTICO