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ENZIMAS
Las enzimas son protenas con funcin cataltica
Las enzimas son catalizadores biolgicos que permiten que las reacciones metablicas ocurran
a gran velocidad en condiciones compatibles con la vida.
En las clulas, la actividad secuencial de muchas enzimas permite que las molculas se
degraden, o bien se formen molculas de mayor tamao a partir de molculas sencillas.
Desde el punto de vista qumico, las enzimas son protenas globulares, algunas de ellas con
estructura cuaternaria. Para cumplir su funcin requieren conservar su estructura nativa, en
particular se destaca una regin conocida como sitio activo, que es responsable de catalizar la
reaccin.
Las enzimas se clasifican de acuerdo al tipo de reaccin que catalizan
Las enzimas pertenecen a seis grupos que aparecen a continuacin:
1.Oxidoreductasas, actan en reacciones de oxidoreduccin y se las llama tambin
deshidrogenasas.
2.Transferasas, transfieren grupos funcionales de un compuesto a otro. Las quinasas
representan un grupo especializado que transfiere grupos fosfato.
3.Hidrolasas, rompen un enlace adicionando una molcula de agua.
4.Liasas, rompen enlaces por mecanismos distintos a la hidrlisis o la oxidacin. Las
decarboxilasas y aldolasas son ejemplos de liasas.
5.Isomerasas, catalizan reacciones de interconversin de ismeros.
6.Ligasas, unen molculas utilizando energa proveniente del ATP. Tambin se llaman sintetasas.
El nombre de cada enzima hace referencia al sustrato y al tipo de reaccin que cataliza. La
denominacin sistemtica de una enzima se realiza segn reglas nomenclaturales mediante
cuatro nmeros precedidos de la abreviatura E.C. (Enzymatic Code). Por ejemplo, la enzima
que reduce el nitrgeno atmosfrico a amonio en los rizobios, la nitrogenasa, es la E.C.1.18.6.1.
Hay enzimas que para actuar necesitan un componente no proteico
Algunas enzimas para actuar requieren un componente adicional que se llama cofactor. Los
cofactores pueden ser inorgnicos (Fe+2, Mn+2, Zn+2, etc.) o molculas orgnicas complejas
llamadas coenzimas. Las coenzimas derivan de vitaminas o son la vitamina misma.
Las enzimas son protenas eficientes, especficas y regulables
Las enzimas son catalizadores biolgicos que, como los catalizadores qumicos, aceleran
reacciones y no se consumen durante la reaccin, por lo que pueden intervenir muchas
veces catalizando la misma reaccin: son molculas eficientes. A diferencia de otros
catalizadores, las enzimas tienen un sitio activo que les permite unir y orientar las molculas
que intervienen en la reaccin y de esa forma maximizan la posibilidad de formacin o ruptura de
enlaces necesarios para la obtencin de productos.
El interior de la clula es denso y, aunque los sustratos y las enzimas estn en nmero
relativamente pequeo, se pueden encontrar y dar lugar al complejo ES porque estn en
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continuo movimiento. Las enzimas se mueven ms lentamente que los sustratos y la velocidad
de encuentro va a depender de la concentracin de sustrato presente.
El sitio activo tiene una forma determinada por el ordenamiento espacial de los -R que es nica y
que es reconocida por su sustrato. Esta es la base de otra de las caractersticas de las
enzimas que es su especificidad.
En el sitio activo los grupos -R estn prximos debido a los plegamientos originados por las
estructuras secundaria y terciaria, a pesar de que estn alejados en la estructura primaria de la
enzima. Estos -R participan en la reaccin, algunos uniendo y orientando el sustrato y otros,
formando o rompiendo enlaces.
Algunas enzimas presentan especificidad absoluta porque la topografa del sitio activo adems de
ordenada es rgida lo que se ha esquematizado con el modelo de llave-cerradura. Sin embargo,
muchas enzimas presentan especificidad relativa porque pueden catalizar el mismo tipo de
reaccin con ms de un sustrato estructuralmente similar o permitir la unin de un sustrato
no complementario que igual permita la formacin de productos.
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partir de los datos de esos primeros minutos, es lo que llamamos velocidad inicial (Vo) y este
es el trmino al que nos referiremos de ahora en adelante cuando hablemos de velocidad.
La velocidad (Vo) de una reaccin enzimtica se puede medir por la variacin de la cantidad de
sustrato transformado, o la cantidad de producto formado por unidad de tiempo. En algunas
reacciones en las que intervienen coenzimas, la velocidad puede medirse por la cantidad de
coenzima transformada por unidad de tiempo en lugar de medir el sustrato o el producto.
Las reacciones catalizadas por enzimas tienen cintica de saturacin
Cuando se miden las velocidades iniciales (Vo) de una reaccin enzimtica con distintas
concentraciones de sustrato [S] en las mismas condiciones de pH y temperatura y manteniendo
constante la concentracin de enzima [E], se obtiene una curva como se representa a
continuacin:
Para valores bajos de [S] la vo aumenta en forma directamente proporcional a la [S]. En ese
tramo, cada vez ms molculas de S forman el complejo ES y la reaccin tiene cintica de primer
orden. En este caso la reaccin se representa como Vo k [S] 1 A determinada [S], todas las
molculas de S estn formando ES y entonces la vo se hace independiente de la [S], la cintica
de la reaccin es de orden 0 y se alcanza la Vmx. En este caso la reaccin se representa como
vo k [S] 0. La reaccin en presencia de mayor [S] no produce mayor velocidad porque todas
las molculas de enzima estn saturadas con sustrato.
La relacin entre la Vo y [S] se puede expresar cuantitativamente
La cintica de las reacciones esquematizadas anteriormente fue caracterizada por los
investigadores Michaelis y Menten. La ecuacin de Michaelis-Menten es:
Vo = Vmx . [S]
(1) Km + [S]
Esta ecuacin es una descripcin cuantitativa de la relacin entre la velocidad (vo) de una
reaccin catalizada por una enzima, la concentracin de sustrato [S] y dos constantes Vmx y
Km (constante de Michaelis). Esta ecuacin es una hiprbola equiltera con coordenadas vo
y [S] y donde Vmx es la asntota de la grfica.
La ecuacin puede ser usada para demostrar que la concentracin de sustrato
necesaria para alcanzar la mitad de Vmx, es numricamente igual a Km.
Las unidades de Km son, por lo tanto, unidades de concentracin, usualmente molaridad. Km
puede definirse como la [S] a la que la enzima alcanza la mitad de su velocidad mxima o la [S] a
la que la mitad de las molculas de enzima estn formando ES.
En condiciones definidas de pH y temperatura, los valores de Km y Vmx son las constantes
cinticas de una determinada enzima frente a su sustrato.
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Vmx
La representacin grfica con coordenadas 1/vo y 1/[S] es una recta. El corte de la recta con el
eje de las ordenadas permite calcular Vmx y el corte con el eje de las abscisas permite calcular
Km.
Inhibicin competitiva
Cuando un inhibidor competitivo (Ic) y un sustrato S estn en presencia de una enzima, compiten
entre s por ocupar el sitio activo de la misma. El inhibidor competitivo tiene generalmente una
estructura similar a la del sustrato por lo que tiene posibilidad de formar un complejo EIc que no
permite formar el complejo ES. El complejo EIc no da productos y disminuye el nmero de
molculas de E libres en condiciones de interaccionar con el S. Por eso la cantidad de
producto formado con la misma cantidad de sustrato es menor en presencia de inhibidor
competitivo. La unin del inhibidor competitivo a la E es reversible y por eso se puede aumentar
el nmero de molculas de E libre aumentando la [S].
Las sulfas que inhiben pasos metablicos exclusivos de bacterias y el fluoruracilo que se usa
para tratar el cncer, son ejemplos de inhibidores competitivos. A nivel de bioregulacin se puede
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citar como ejemplo la inhibicin por producto cuando se empieza a acumular el producto de una
reaccin.
En la figura se esquematizan la interaccin enzima sustrato y el mecanismo de accin de dos
tipos de inhibidores.
Inhibicin no competitiva
Enzimas alostricas
La mayora de las enzimas que catalizan reacciones sucesivas en las vas metablicas tienen
cintica de Michaelis Menten. Sin embargo la regulacin de la va est a cargo de enzimas
alostricas que tienen una cintica distinta.
Las enzimas alostricas catalizan pasos ubicados al principio de la va o en puntos de
ramificacin de la misma y su actividad est modulada por la unin de molculas
fisiolgicamente importantes que se conocen como efectores o moduladores.
Adems del sitio activo, estas enzimas tienen sitios alostricos a los que se unen los
moduladores alostricos. La unin del modulador al sitio alostrico origina cambios
conformacionales que se trasmiten a travs de la molcula de la protena hasta el sitio activo
alterando las propiedades catalticas de la enzima. Los que incrementan la actividad cataltica,
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se conocen como moduladores positivos. Los que reducen o inhiben la actividad cataltica son
moduladores negativos.
Modificaciones covalentes
Existen enzimas que se regulan por el pasaje de una forma activa a inactiva debido a la
formacin o rotura reversible o irreversible de enlaces covalentes. En muchos casos no es
suficiente la modulacin alostrica para la regulacin de todas las vas metablicas. Por eso
algunas enzimas tienen un mecanismo rpido de regulacin que permite el pasaje de una
forma activa a una forma inactiva. Un ejemplo de este tipo de regulacin es la unin de un
grupo fosfato a un OH de un residuo de aminocido de la molcula de enzima que permite
la transformacin de una forma en otra. Esta es una modificacin covalente reversible.
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