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BIOLOGA CLULAR Y MOLECULAR

TEMA 4
RICHARD BEDN
TECNLOGO MDICO
SERVICIO DE ANATOMA PATOLGICA
HOSPITAL VRG

OBJETIVOS
Identificar

los cidos nucleicos

Reconocer

las estructuras de los cidos nucleicos

Comprender

como se combinan las bases nitrogenadas que


componen los cidos nucleicos

Identificar

los mecanismos de duplicacin, transcripcin y


traduccin del DNA.

APTITUDES
EL

ALUMNO AL FINAL DE LA CLASE DEBE DE ESTAR EN LA


CAPACIDAD DE ELABORAR UN MAPA CONCEPTUAL O
ESQUEMA SOBRE LOS CIDOS NUCLEICOS.

ESTRUCTURA DE LOS CIDOS NUCLEICOS

INTRODUCCIN:

El DNA y el RNA son qumicamente muy similares, estructura primaria de ambos son
polmeros lineales compuestos de monmeros:
NUCLEOTIDOS

RNA celular posee longitud que va desde menos de cien hasta varios miles de nucletidos

Molculas de DNA celular ser tan largas como varios cientos de millones de nucletidos,
asociadas con las protenas, se tien con colorantes y visualizar en el microscopio ptico
como cromosomas

UNA HEBRA DE CIDOS NUCLEICOS ES UN POLMERO


LINEAL CON DIRECCIONALIDAD DE UN EXTREMO A OTRO

El DNA y el RNA constan, cada uno, de slo cuatro nucletidos distintos

Todos los nucletidos tienen una base orgnica unida a un azcar de cinco carbonos que
posee un grupo fosfato unido al carbono 5

En el RNA, el azcar es ribosa; en el DNA, desoxirribosa

Nucletidos utilizados en la sntesis de DNA y RNA contienen cinco bases diferentes. La


bases adenina (A) y guanina (G) son purinas, que contienen un par de anillos fusionados;
las bases citosina (C), timina (T) y uracilo (U) son pirimidinas, que contienen un nico anillo.

DNA como el RNA contienen tres de estas bases: A, G y C; sin embargo, T slo se
encuentra en el DNA y U slo en el RNA..

EL DNA NATIVO ES UNA DOBLE HLICE DE HEBRAS


COMPLEMENTARIAS Y ANTIPARALELAS

James D. Watson y Francis I l. C. Crick propusieron que el DNA tiene una estructura de
doble hlice (rayos-X) - comprensin actual de la forma de funcionar del DNA como
material gentico.

DNA consta de dos hebras de polinucletidos asociadas que se entrelazan entre s para
formar una doble hlice. Los dos esqueletos de azcar-fosfato se ubican en la parte
exterior de la doble hlice y las bases se proyectan hacia el interior

La orientacin de las dos hebras es antiparalela; es decir sus direcciones 5 - 3' son
opuestas.

formacin de pares de bases entre las dos hebras: A est aparcada con T a travs de dos
enlaces de hidrgeno y G est aparcada con C a travs de tres enlaces de hidrgeno

EL DNA NATIVO ES UNA DOBLE HLICE DE HEBRAS


COMPLEMENTARIAS Y ANTIPARALELAS

La presencia de miles de enlaces de hidrgeno en una molcula de DNA contribuye en


gran medida a la estabilidad de la doble hlice.

En el DNA natural, A siempre se une mediante enlaces de hidrgeno con T y G con C,


formando pares de bases A-T y G-C. Estas asociaciones entre una purina ms grande y
una pirimidina ms pequea son a menudo denominadas pares de bases de Watson y
Crick.

La mayora del DNA en las clulas es una hlice con giro hacia la derecha, las bases
apiladas estn separadas por un espacio regular de 0,36 nm a lo largo del eje de la hlice.

La hlice da un giro completo cada 3,6 nm; por lo tanto, hay alrededor de 10,5 pares por
giro, la forma normal presente en la mayora del DNA celular, Esto se denomina:
La forma B del DNA

EL DNA NATIVO ES UNA DOBLE HLICE DE HEBRAS


COMPLEMENTARIAS Y ANTIPARALELAS

En la parte exterior en la forma B del DNA de forma B, los espacios entre las hebras
entrelazadas forman dos hendiduras helicoidales de distinto ancho, descritas como
hendidura mayor y hendidura menor.

Las protenas de unin al DNA pueden "leer" la secuencia de bases en el DNA bicatenario
contactando los tomos en cualquiera de las hendiduras mayor o menor.

Se describieron tres estructuras adicionales de DNA. Dos de estas se comparan con el


DNA B. Con muy baja humedad, la estructura cristalogrfica del DNA B cambia a la forma
A; las hlices RNA-DNA y RNA-RNA existen en esta forma en las clulas e in vitro

EL DNA NATIVO ES UNA DOBLE HLICE DE HEBRAS


COMPLEMENTARIAS Y ANTIPARALELAS

Las molculas cortas de DNA compuestas de nucletidos alternados purina y pirimidina


(especialmente G y C) adoptan una configuracin alternativa con giro hacia la izquierda en
lugar de la hlice normal con giro hacia la derecha. Esta estructura se denomina:
DNA Z

Las molculas cortas de DNA compuestas de nucletidos alternados purina y pirimidina


(especialmente G y C) adoptan una configuracin alternativa con giro hacia la izquierda en
lugar de la hlice normal con giro hacia la derecha. Esta estructura se denomina:

modificaciones ms importantes en la estructura de la forma B estndar de DNA son


consecuencia de la unin de protenas a secuencias especficas de DNA

La torsin es crtica para lograr el empaquetamiento denso del DNA en la cromatina, el


complejo protenas-DNA, como se presenta el DNA nuclear en las clulas eucariontes

LAS HEBRAS DEL DNA PUEDEN SEPARARSE DE MANERA REVERSIBLE

Durante la replicacin y transcripcin del DNA, las hebras de la doble hlice deben
separarse para permitir que los bordes internos de las bases puedan formar pares con las
bases de los nucletidos a ser polimerizados en nuevas cadenas de polinucletido

El proceso de desenrollar y separar las hebras de DNA, se puede inducir


experimentalmente al incrementar la temperatura de una solucin de DNA, denominado:
desnaturalizacin, o "fusin

Aumento resultante en el movimiento molecular rompe enlaces de hidrgeno y otras


fuerzas que estabilizan la doble hlice; las hebras se separan, alejadas por repulsiones
electrostticas del esqueleto de desoxirribosa- fosfato cargada negativamente de cada
hebra

LAS HEBRAS DEL DNA PUEDEN SEPARARSE DE MANERA REVERSIBLE

Molculas con gran proporcin de pares G-C requieren temperaturas ms altas para su
desnaturalizacin los tres enlaces de hidrgeno en los pares de GC hacen a estos pares
de bases ms estables que los pares A-T, que tienen slo dos enlaces de hidrgeno

Las molculas de DNA monocatenario, o hebra simple, resultante de la desnaturalizacin,


forman ordenamientos al azar sin una estructura organizada. Disminuyendo la temperatura,
aumentando la concentracin de iones o neutralizando el pH, las dos hebras
complementarias se reasocien en una doble hlice perfecta, depende del tiempo, de la
concentracin de DNA y de la concentracin inica, este proceso es:
RENATURALIZACIN

Desnaturalizacin y Renaturalizacin de DNA son la base de la hibridacin de los cidos


nucleicos, una tcnica poderosa utilizada para estudiar la relacin de dos muestras de DNA
y para detectar y aislar las molculas especficas en una mezcla que contiene numerosas
secuencias diferentes de DNA

MUCHAS MOLCULAS DE DNA SON CIRCULARES

Muchos de los DNA genmicos procariontes y muchos DNA virales son molculas circulares

Molculas circulares de DNA tambin se hallan en las MITOCONDRIAS


que estn presentes en casi todas las clulas eucariontes
y en los CLOROPLASTOS
que se encuentran en las plantas y en algunos Eucariontes unicelulares.

Cada una de las dos hebras en una molcula circular de DNA forma una estructura cerrada
sin extremos libres, desenrollamientos localizados de una molcula circular de DNA, que
aparecen durante la replicacin.

MUCHAS MOLCULAS DE DNA SON CIRCULARES

las clulas eucariontes y bacterianas contienen topoisomerasa I, que puede aliviar


cualquier tensin de torsin que se desarrolle en las molculas de DNA durante la
replicacin u otros procesos, esta enzima se une al DNA en sitios al azar y rompe un enlace
fosfodister en una hebra, tal rotura de una hebra en el DNA se denomina muesca

la topoisomerasa II, realiza cortes en ambas hebras de un DNA bicatenario, luego vuelve a
ligarlas. Como resultado, la topoisomerasa II puede aliviar las tensiones de torsin y unir dos
molculas circulares de DNA como los eslabones de una cadena.

DNA nuclear eucarionte es lineal, largos bucles de DNA son fijadas en su lugar dentro de los
cromosomas. As, las tensiones de torsin y la formacin consecuente de
superenrollamientos tambin pueden suscitarse durante la replicacin del DNA nuclear.

MUCHAS MOLCULAS DE DNA SON CIRCULARES

Igual que en las clulas bacterianas, la abundante topoisomerasa I en el ncleo Eucarionte


alivia cualquier tensin de torsin en el DNA nuclear que se puede desarrollar en ausencia
de esta enzima.

LOS DIFERENTES TIPOS DE RNA EXHIBEN DIVERSAS


CONFORMACIONES RELACIONADAS CON SUS FUNCIONES

La estructura primaria de RNA es similar a la del DNA con dos excepciones: el componente
azcar del RNA, la Ribosa, tiene un grupo hidroxilo en la posicin 2' y la Timina en el DNA
es reemplazada por uracilo en el RNA.

RNA es un largo polinucletido que puede ser bicatenario o monocatenario, lineal o circular.

Las diferencias en los tamaos y conformaciones de los distintos tipos de RNA les permiten
llevar funciones especficas en la clula. Las estructuras secundarias ms simples en los
RNA monocatenarios estn formadas por apareamiento de bases complementarias.

Las "horquillas" se forman por apareamiento de bases separadas por 5-10 nucletidos entre
una y otra, y los "tallos y bucles", por apareamiento de bases separadas por > 10 a vrios
cientos de nucletidos.

Estos plegamientos simples pueden cooperar para formar estructuras terciarias ms


complicadas, una de las cuales se denomina "seudonudo".

LOS DIFERENTES TIPOS DE RNA EXHIBEN DIVERSAS


CONFORMACIONES RELACIONADAS CON SUS FUNCIONES

Molculas de tRNA adoptan una arquitectura tridimensional bien definida en solucin, que es
crucial en la sntesis de protenas

Molculas de tRNA adoptan arquitectura tridimensional definida en solucin, crucial en


sntesis de protenas, dominios plegados de las molculas de RNA no slo tienen una
analoga estructural con las hlice alfa y las hebras beta halladas en las protenas, sino que
en algunos casos tambin tienen capacidad cataltica. Estos RNA catalticos son llamados
RIBOZIMAS

Ribozimas generalmente asociadas con Protenas que estabilizan la estructura ribosmica,


es el RNA el que acta como un catalizador. Algunas ribozimas pueden catalizar eliminacin
de intrones, proceso en el cual se corta y elimina una secuencia interna de RNA y luego se
ligan las dos cadenas resultantes

LA RNA POLIMERASA TRANSCRIBE UNA HEBRA


MOLDE DE DNA PARA FORMAR UNA HEBRA
COMPLEMENTARIA DE RNA

La definicin ms simple de un gen es una unidad de DNA que contiene la informacin para
especificar la sntesis de una nica cadena polipeptdica o RNA funcional

La gran mayora de los genes contienen informacin para construir molculas proteicas; las
copias de RNA de tales genes codificadores de protenas constituyen las molculas de
mRNA de las clulas

Las molculas de DNA de pequeos virus contienen slo algunos genes, mientras que la
molcula de DNA en cada uno de los cromosomas de los animales y plantas superiores
puede contener varios miles.

TRANSCRIPCIN DE GENES
CODIFICADORES DE PROTENAS Y FORMACIN DE RNA MENSAJERO
FUNCIONAL

Durante transcripcin de DNA, una hebra de DNA acta como un molde o patrn,
determinando el orden en que los monmeros de ribonuclesido trifosfato (rNTP) son
polimerizados para formar una cadena complementaria de RNA.

Las bases en la hebra patrn de DNA forman pares de bases con los monmeros de rNTP
complementarios entrantes, luego se unen en reaccin de polimerizacin catalizada por
RNA polimerasa

Da lugar a la formacin de un enlace fosfodister y liberacin de un pirofosfato (PP,). Como


consecuencia, las molculas de RNA siempre se sintetizan en la direccin 5--->3'

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIN

Para llevar a cabo la transcripcin, la RNA polimerasa desempea varias funciones distintas:

PASO 1: Durante la iniciacin de la transcripcin, la RNA polimerasa reconoce y se une a


un sitio especfico, denominado promotor, en el DNA de hebra doble.

Las RNA polimerasas nucleares requieren factores proteicos: factores de transcripcin


generales, para localizar los promotores e iniciar la transcripcin.

Unidos al promotor, la RNA polimerasa disocia las hebras de DNA para que las bases en la
hebra molde estn disponibles para apareamiento con las bases de los ribonuclesidos
trifosfatos que se polimerizarn.

PASO 2: Las RNA polimerasas celulares disocian 14 pares de bases de DNA alrededor del
sitio de inicio de la transcripcin, en la hebra molde dentro de la regin del promotor

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIN

PASO 3: La iniciacin de la transcripcin se ha completado cuando los dos primeros


ribonucletidos de una cadena de RNA estn unidos mediante un enlace fosfodister.

PASO 4: Despus de que varios ribonuclesidos han sido polimerizados, la RNA polimerasa
se disocia del DNA promotor y de los factores de transcripcin generales. Durante etapa de
elongacin de las hebras, la RNA polimerasa se mueve a lo largo del DNA molde de a una
base por vez, abriendo el DNA doble hebra delante de su direccin de movimiento e
h1bndando las hebras detrs de s.

Durante la elongacin de la hebra, ejecutada por la polimerasa, ribonudetidos se aaden


uno por uno al extremo 3' de la cadena creciente (naciente) de RNA. La enzima mantiene
disociada una regin de 14 pb, denominada:
BURBUJA DE TRANSCRIPCION

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIN

Aprox. ocho nucletidos en el extremo 3 de la hebra de RNA en crecimiento permanecen


apareados por sus bases a la hebra molde de DNA en la burbuja de transcripcin.

El complejo de elongacin, comprendidos por la RNA polimerasa, el DNA molde y la hebra


creciente (naciente) de RNA es extraordinariamente estable.
RNA polimerasa
DNA molde
La hebra creciente (naciente)

el complejo de elongacin es extraordinariamente estable y debe permanecer intacto por


ms de 24 horas; para asegurar la sntesis ininterrumpida del RNA.

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIN

PASO 5: Durante la terminacin de la transcripcin, la etapa final sntesis de RNA, la


molcula completa de RNA transcripto primario, se libera de la RNA polimerasa y se
disocia del DNA molde

Secuencias especficas en el DNA molde le sealan a la RNA polimerasa implicada que


termine la transcripcin. Una vez liberada, la RNA polimerasa est libre para transcribir de
nuevo el mismo gen u otro.

ESTRUCTURAS DE LAS RNA POLIMERASAS

RNA polimerasas bacterianas estn compuestas de dos grandes subunidades relacionadas


(beta y beta), dos copias de subunidades ms pequeas (alfa) y una copia de una quinta
subunidad (delta) no esencial para la transcripcin o viabilidad de la clula, pero estabiliza la
enzima y da asistencia en ensamblaje de sus subunidades.

las RNA polimerasas de eucariontes tienen varias subunidades pequeas adicionales


asociadas con este complejo central, los diagramas esquemticos del proceso de
transcripcin muestran la RNA polimerasa unida a una molcula de DNA desdoblada.

LOS PRECURSORES DE RNA MENSAJERO EUCARIONTES SON PROCESADOS


PARA FORMAR LOS RNA MENSAJEROS FUNCIONALES

En clulas procariontes, que carecen de ncleo, la traduccin de un mRNA en una protena


puede comenzar desde el extremo 5' del mRNA incluso mientras el extremo 3 est aun
siendo sintetizado por la RNA polimerasa.

En los procariontes la transcripcin y la traduccin pueden suceder al mismo tiempo.

En las clulas eucariontes, no slo el ncleo est separado del citoplasma donde ocurre la
traduccin, tambin los transcriptos primarios de los genes codificadores de protenas son
precursores de los mRNA (pre-mRNA), que deben atravesar varias modificaciones,
denominadas en su conjunto procesamiento del RNA , para producir un mRNA funcional
Este mRNA debe ser exportado luego al citoplasma antes de que pueda ser traducido a
protena. As, la transcripcin y la traduccin no pueden ocurrir simultneamente en las
clulas eucariontes.

LOS PRECURSORES DE RNA MENSAJERO EUCARIONTES SON PROCESADOS


PARA FORMAR LOS RNA MENSAJEROS FUNCIONALES

Este mRNA debe ser exportado luego al citoplasma antes de que pueda ser traducido a
protena. As, la transcripcin y la traduccin no pueden ocurrir simultneamente en las
clulas eucariontes.

Todos los pre-mRNA eucariontes se modifican en los dos extremos y son retenidas en los
mRNA. A medida que el extremo 5' de una cadena de RNA naciente emerge de la superficie
de una RNA polimerasa II, es influido por varias enzimas que en conjunto sintetizan el
casquete 5', un 7-metilguanilato es unido al nucletido terminal del RNA por una unin
inusual 5',5' trifosfato.

El casquete protege al mRNA de la degradacin enzimtica y contribuye a su


desplazamiento hacia el citoplasma. Al casquete tambin se une un factor proteico
necesario para comenzar la traduccin en el citoplasma.

LOS PRECURSORES DE RNA MENSAJERO EUCARIONTES SON PROCESADOS


PARA FORMAR LOS RNA MENSAJEROS FUNCIONALES

El procesamiento en extremo 3' de un pre-mRNA incluye escisin por accin de una


endonucleasa para producir un grupo hidroxilo libre 3' al que una enzima denominada poli(A)
polimerasa le agrega, uno por uno, una hilera de residuos de cido adenlico.

La cola poli (A) resultante contiene 100-250 bases y es ms corta en levaduras e


invertebrados que en vertebrados. La poli (A) polimerasa es parte de un complejo de
protenas que pueden localizar y escindir un transcripto en un sitio especfico y luego
agregar el numero correcto de residuos A, proceso que no requiere un molde.

LOS PRECURSORES DE RNA MENSAJERO EUCARIONTES SON PROCESADOS


PARA FORMAR LOS RNA MENSAJEROS FUNCIONALES

El paso final en el procesamiento de muchas molculas distintas de mRNA eucariontes es el


corte y empalme: splicing del RNA: la escisin interna del transcripto para eliminar los
intrones, seguida por la ligacin de los exones codificadores.

El mRNA eucarionte funcional producido por el procesamiento de RNA retiene las regiones
no codificantes de cada extremo, denominadas regiones no traducidas 5' y 3'

GRACIAS

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