Por lo tanto tenemos 5 fosfato y 3OH y se unen por el enlace fosfodiester siempre (muy importante) siempre

en un extremo 5 y en el otro 3 OH, porque cuando se hace la elongacin ya se del ADN o del RNA la
cadena se alarga siempre sobre 3 OH, excepto en un caso que se ver ms adelante (siempre el
crecimiento se da sobre 3 OH). Entonces decimos que estructura la primaria est formada por una
cadena del poli nucletido unidas por enlaces fosfodiester.
5.- Si bien es una cadena lineal tambin pueden ser cadenas largas que por afinidad podran formar una
especie de estructura secundarias y tridimensionales que van a venir de la afinidad que tengan los nucletidos
entre s, entonces en general esta estructura tridimensional en los RNA s es compleja y nica para cada tipo
de RNA y resulta de la combinacin de las estructuras secundarias locales, que estn estabilizadas por
enlaces o puentes de H ( se puede dar estructuras secundarias, a su vez esta va a poder plegarse y volverse
tridimensional , que va a depender de la estructura secundaria que va a ser estabilizada por puentes de
hidrogeno que se da entre las bases y por la afinidad hidrofobica de las misma bases )y por interacciones
hidrofobicas de apilamiento de bases.
Ahora veremos algunas caractersticas que se pueden observar en las estructuras tridimensionales que se
dan gracias a la estructura secundaria:
En el RNA, podemos ver cadenas simples, burbujas, salientes que quedan de nucletidos sin aparear, ese
lugar se llama tallo y el otro burbuja interna que se da cuando los nucletidos no se unen a su a pareja tienden
a repelerse (la adenina no se unir nunca a otra adenina, la adenina es con la timina entonces cuando se
repelen se produce la burbuja interna) luego vamos a tener otra vez un tallo y tambin una doble hlice,
hairpin ( horquilla) con bucle , entonces en esta imagen se puede ver algunas caractersticas de las
estructuras tridimensionales.
Esto solo se presenta en el ARN ribosmico y en el ARN de transferencia, no en el ARN mensajero, el ARN
mensajero normalmente es lineal.
6.- MUY IMPORTANTE. Cuantos tipos de ARN existen tanto en eucariota como procariotas. Tabla (podemos
observar la clase de ARN, la ubicacin celular, la cantidad en %, Svedbergs una unidad de centrifugacin
coeficiente de sedimentacin), n de nucletidos y caractersticas particulares, que iremos viendo.
Hay tres tipos principales de ARN: ARN mensajero, ARN de transferencia y ARN ribosmico, hay varios tipos
de ARN ribosmico.
En el caso de RNA mensajero se ubica tanto en eucariotas como procariotas en el citoplasma, es el que est
en menor porcentaje 5%, el nmero de nucletidos es muy variable de 600- 3000 que depende de la
informacin que lleve, cuantos ms nucletidos tenga dar lugar a una protena ms grande, porque como es
un mensajero lleva los codones para la sntesis de protenas por lo tanto es muy variable. COMO ES SU
ESTRUCTURA? Es de estructura sencilla y lineal.
RNA de transferencia: es el que participa en realidad en la sntesis de las protenas, este se encuentra en un
porcentaje pequeo 20%, (los tres tipos de RNA se ubican en el citoplasma pero en las eucariotas no se
sintetizan en el citoplasma aqu sino dentro del ncleo). Es bastante pequeo solo de 75 a 95 nucletidos la
fusin que tienen es ms o menos en los RNAs de transferencia hay aprox.entre 50 y 60 diferentes tipo de
RNAs de transferencia que son especficas para los A.A, porque llevan al AA al lugar de la sntesis de
protenas.
RNA ribosmico: hay diferentes tipos de RNAs ribosmicos, varan en las eucariotas y procariotas pero en
ambas se encuentran en el citoplasma.
PROCARIOTAS: en este tenemos 3 tipos de RNAs ribosmico.
16s: tiene 1500 nucletidos y forma parte de la subunidad menor del ribosoma
23s: 2900 nucletidos y forma parte de la subunidad mayor del ribosoma
5 s: 120 nucletidos y forma parte de la subunidad mayor del ribosoma

En el caso de las clulas EUCARIOTAS hay 4 tipos de RNAs

18s: 1900, forma parte de la subunidad pequea del ribosoma
28s- 5,8s- 5s: con 4700, 160 y 120 respectivamente forman parte de la subunidad mayor del ribosoma.
Esta parte es importante y se entender mejor cuando se vea la parte de la estructura del ribosoma.
Adema encontramos:
El hnRNA (heterogneo nuclear) se ubica dentro del ncleo, normalmente son molculas muy grandes y son
precursores del RNA mensajero de las eucariotas, puede tener desde 200 hasta 30000 nucleotidos se los
conoce como transcritos primarios.
El snRNA se encuentra en el nucleo, puede tener de 100 a 300 y forma parte de las ribonucleoproteinas, estas
ribonucleoproteinas son molculas que van a participar normalmente en la maduracin del RNA mensajero.
scRNA (short) se refiere al RNA pequeo pero citoplasmtico
mtRNA: este es mitocondrial (se encuentra en la mitocondria, ya que aqu tambin se realiza la transcripcin)
S= coeficiente de sedimentacin que se mide en svedbergs, de que depende este coeficiente: cuanto ms
nucleotidos, mayor coeficiente de sedimentacin.
7.- RNA mensajero.- CUAL ES LA CARAVTERISTICA? en el ao 1965 Jabob- Monod indicaron que haba
una molecula encargada de transferir el mensaje gentico. Estudio que les permiti ganar un premio nobel,
indicando que haba un RNA lineal que llevaba el mensaje gentico, que llevaba los codones para la sntesis
de protenas. Se encuentra en el citoplasma de todas las clulas a una baja proporcin de 5% respecto al
ARN total y por supuesto con una vida media muy corta porque este RNA sirve para llevar el mensaje para
que se sintetice una protena ( una vez, dos , tres veces, etc.)una vez que ha cumplido su funcin se degrada .
Tienen diferente tamao ya que puede llevar el mensaje para una protena grande o pequea, tienen una
estructura muy sencilla generalmente lineal no adopta estructura secundaria o terciaria, y normalmente solo
est formada por los 4 nucleotidos bsicos: adenina, uracilo, citosina y guanina .Es reflejo del ADN molde de
donde procede.( si nosotros tenemos un cadena molde de ADN que tenga :
ACGA
T---G----C---T Este es el ADN dice que ser su composicin de base el reflejo de la cadena molde de donde
procede y va a llevar una secuencia similar a la cadena codificada entonces la timina va dar lugar a que
siempre se forme de manera complementaria y siempre de 5 a 3, la T se une a la A, G a C, C a G y T a A .
Esta se parece o es casi idntica a la cadena codificante, por eso dice es reflejo de la cadena molde y tiene
una secuencia similar a la cadena codificante.
8. ARN DE TRANSFERENCIA: francis Crick haba indicado que haba una molecula adaptadora que poda
participar en la sntesis de protenas, esta poda interactuar con el ARN mensajero, es ah donde encontraron
que la molecula que interacciona con el ARN mensajero llevando los AA era el RNA de transferencia
( molecula intermediaria o adaptadora).
Entonces actan como adaptadores en la sntesis de protenas por un extremo la molecula se une al AA para
llevarlo hasta el lugar de la sntesis y por el otro extremo se va a unir al RNA mensajero. Es una molecula
adaptadora por un lado que sera su anti codn se va a unir al codn, y la secuencia que lleva RNA de
transferencia se llama anticodon. Entonces por un lado se une al RNA mensajero(codn)y por el otro lado al
AA. Esta es su caracterstica que tiene el RNA de transferencia , como participa transfiriendo los AA para
formar la cadena peptdica .
9.- Este RNA t es una molecula pequea ,aprox 70 nucleotidos . puede haber 60 diferentes tipos de RNAs de
transferencia normalmente hay mas de 1 para el mismo AA va ha haber digamos un RNA de t para la

metionina puede haber 2 tipos de RNA t para la alanina entonces hay diferentes tipos de RNA t que hasta la
fecha se conoce aprox. 60 .
Otra caracterstica que adems de tener :U ,A, G , C tiene otros tipos de nucleotidos que se encuentran en
aprox un 10% este otro tipo de nucleotidos se los conoce como nucleotidos infercuentes que va a estar
presentes en en RNAt
10.- se ha dado dos tipos de estructura puede tener la forma de Linvertida o la forma de un trbol. (imagen:
por un lado se une al AA (3) y por otra regin se une al RNA m , se tiene el codn y RNA t el anticodon, para
poder ceder el AA para que se vayan formando los enlaces peptdicos.
IMAGEN ? Se puede apreciar algunas estructuras secundarias. Hebra simple, horquillas , bucle , saliente se
puede ver un tallo, etc.) entonces como podemos ver en RNAt puede asumir estructuras tridimensionales
debido a que va a ver interacciones pero es una sola cadena en un extremo 5 o 3 y en otro 5 es una sola
cadena que se ha plegado en s misma .
11.- tiene algunos nucleotidos infrecuentes aqu vamos a ver algunos, vamos a ver por ejemplo la
metiladenosina donde vemos que en el N1 hay un grupo metilo , se va a formar el dimetiladenosina, serian
algunos de los nucleotidos infrecuentes .
La inosina que se parece un poco al uracilo solo que esta tiene un carbonilo menos.luego tenemos la
metilguanocina dimetilgunociana., la metilcitidina, metiluridina. Todos estos son ejemplos de nucleotidos
infrecuentes que van a estar presentes en la ARNt pero tambin los vamos a encontrar en el RNAr.
12.- lo mismo q 11.
13.- se observa otros dos ms: la dihidrouridina y pseudo uridina seran otro tipo de nucleotidos poco
frecuentes que pueden estar presentes en el RNAt o RNA r.
14-15.-RNA ribosmico: solo est en los ribosomas, es el soporte estructural y componente principal de los
ribosomas, es el que se encuentra en mayor % ya que representa el 75%.
Como todo ARN est formado por una sola hebra pero debido a que la cadena es un poco larga va a formar
una serie de estructuras secundaria y tridimensional debido a la interaccin que va a ver en los nucleotidos
dar lugar a estas estructuras ms complejas.
Normalmente como tiene que unirse a las protenas, porque los ribosomas estn formados solo por protenas
y RNA, entonces tiene que formar muchos repliegues , muchas hendiduras, para que puedan acomodarse las
diferentes protenas, generalmente el ARNr representa el 65% del total del ribosoma y tan solo el 35% por
protenas,
Entonces forma una estructura bastante plegada sobre s misma y al igual que el RNAt presenta tambin un
% de nucleotidos infrecuentes.
Va a formar una serie de estructuras muy plegadas como si fuera un armazn para que entren las protenas y
dar lugar a los ribosomas, que son elementos esenciales para la sntesis de protenas.
16.-Se puede ver un ejemplo sencillo, el RNAr 5S (de E.coli y el encontrado en la rana)
17.-16S. Tiene una gran cantidad de estructuras secundarias y tridimensionales.8 hay burbujas, horquillas,
salientes, tallos super burbujas etc.) Lo ms interesante es ver esos repliegues que forma son bastante
complejos y forman como un armazn para que puedan entrar las protenas para dar lugar a los ribosomas.
Por lo tanto el % mayoritario de un ribosoma es el RNA no la protena.
18.- RIBOSIMAS: las ribosomas es un RNA con propiedades catalticas que posiblemente fueron las primeras
molculas catalticas en la naturaleza antes que aparecieran las protenas.
El ARN es una enzima o fue una enzima o tiene propiedades enzimticas? Esto no es correcto por que las
enzimas son protenas, este es un RNA con propiedades catalticas, no enzimticas.

Por qu puede tener esta funcin? Se ha encontrado en los RNAr especialmente y en algunos intrones esta
propiedad cataltica justamente porque como puede adquirir estructuras tridimensionales, va a poder formar
como sitios activos donde va a poder unirse a su sustrato pero normalmente no se une a cualquier sustrato va
a actuar sobre s mismo o sobre otro RNAt y se ha visto que tiene la propiedad de escisin es decir de cortar
enlaces fosfodiester y tambin de formar nuevos enlaces fosfodiester.
19.-pueden cortar pero tambin pueden formar algunos enlaces peptdicos justamente en lo que es la
traduccin, la sntesis de protenas se ve la accin del RNA r 16s para formar enlaces peptdicos en las
protenas.
Funcionan en la eliminacin de intrones pueden eliminarse a s mismos o eliminar una regin durante su
proceso de maduracin.
20.-Veremos un ejemplo de cmo pueden escindirse sobre s mismos, como puede elimar una regin y luego
pueden unirse:
Este es el caso del RNAr inmaduro en un insecto y se ve que el RNAr inmaduro tiene intron y tiene exn
,normalmente durante la maduracin elimina los intrones que es la parte que sirve y se tiene que quedar con
los exones entonces se ve q el RNA precursor ribosmico puede escindirse a s mismo, va a liberar el intron
pero una regin que tiene un exn puede unirse a otro exn para dar lugar al RNAr maduro y la parte que se
ha eliminado del intron es el que tena la funcin cataltica.
El RNA precursor tiene accin cataltica pero su sitio activo est en el intron.
Como se pudo verificar esto.-se utiliz al intron liberado para hacer un estudio, se utiliz dos sustratos
sintticos (ribo nucletidos 2 diferentes) se ha podido observar con la accin del intron: cortar y unir (realizado
por ataques nucleofilicos), se han tomado 2 sustratos, se tena 1 ribo nucletido con 5 nucleotidos, el intron
corta un nucletido (escindido) rompe el enlace fosfodiester pero ese nucletido lo pega al otro, formando un
nuevo enlace fosfodiester.
Esa es la accin cataltica que tiene una ribosina: romper enlaces y formar enlaces de RNA con preferencia
pero tambin lo puede hacer con algunas protenas.
En nuevos estudios se ha visto que la propiedad de las ribosomas podra ser utilizada en la terapia gnica. En
algunos casos de forman protenas patolgicas, protenas que podran provocar algn dao celular o
protenas que estaran implicadas en casos de cncer.
Para que se forme una protena debe haber un RNAm, este es de hebra simple un extremo 5 y 3 si a este se
unira una ribosoma que tenga tambin 5 y 3 se va a unir primero formando un dplex de RNA :
1. este dplex de RNA no puede transcribirse
2. esta ribosoma puede cortar el RNAm y este RNA cortado no puede dar origen a una protena.
21.-la ribosima tiene la propiedad de cortar y as el RNA m cortado ya no servir.
22.- RIBOSOMAS: cuando se habla de los organelos celulares tanto en procariotas como en eucariotas
decimos que los ribosomas son un organelo celular, pero no es un verdadero organelo ya que para que este
sea un organelo debe estar cubierto por una membrana, los ribosomas solo son estructuras plurimoleculares o
macromoleculares.
Son partculas ribonucleoproteicas por lo tanto estn formadas solo por ARN y protenas. Son de gran tamao
que se encuentran en el citoplasma de todos los organismos vivos.
Normalmente en el caso de las clulas eucariotas estos ribosomas estn asociados al retculo endoplasma
tico rugoso en las clulas procariotas se encuentran libres tambin existen ribosomas en cloroplastos y las
mitocondrias.

Una caracterstica importante es ver la diferencia de tamaos normalmente el RNAr en procariotas,

mitocondrias y cloroplastos son del mismo tamao (pequeos) , en cambio en las clulas eucariotas son ms
grandes . La caracterstica que podemos ver sub unidad mayor y sub unida menor.
23.-estructuralmente son conjuntos plurimoleculares de protenas y ARNr (35% de protenas y 65 de
RNA), qumicamente son nucleoprotidos es decir solo estn formados por protena y ARNs.
Se localizan en el citosol, en la matriz mitocondrial y en el estroma de cloroplastos y citoplasma de
procariotas.
Pueden encontrarse libres como ribosomas o unidos en cadena formando poli ribosomas o polisomas
24.-minuto 54(imagen: resumen de todas las caractersticas de los dos tipos de ribosomas: ribosoma
bacteriano o procariota y ribosoma eucariota) el ribosoma completo con la subunidad mayor y menor: la
subunidad mayor est arriba y la subunidad menor tiene como forma de mano. El peso molecular es de 2,7 x
10 a la 6 daltons y su coeficiente de sedimentacin es de 70s. del ribosoma completo este ribosoma se divide
en 2: subunidad mayor y menor, se puede ver
________________________________________________________________________________________
________________________________________________________________________________________
______________________________________??????????
Juegan un rol muy importante en la traduccin no podra llevarse a cabo una traduccin si no existieran los
ribosomas, porque los ribosomas tienes sitios activos por donde van a unirse el RNAm, adems tiene
regiones que van a reconocer el codn de inicio para que comience por ejemplo la traduccin.
Qu tamao tendr el ribosoma procariota y cul sera su coeficiente de sedimentacin mitocondrial? Es 70
s.

Tema 5

ORGANIZACIN DEL GENOMA

1,-GENOMA viene de la palabra GEN= A ORIGEN gnesis, es el patrimonio gentico de un organismos

codificante o no codificante, nuclear o extra nuclear
Todo el material gentico constituye el genoma, la mayora de los seres vivos tienen un genoma constituido
por DNA, solo algunos virus que no son verdaderos tienen su genomas constituido por RNA
2.-De todo el material Gentico especialmente en el ser humano la mayor parte es no codificante, solo una
pequea cantidad minoritaria del ADN es codificante es decir solo una cantidad pequea va a llevar
informacin para la sntesis de protenas y para los RNAs ribosmicos y de transferencia
Por eso se dice que los productos gnicos son RNAs Y protenas.
Esta parte minoritaria la parte codificante es responsable de toda la informacin celular, de todas las
caractersticas morfolgicas, responsable de la caracterstica externa y de muchas de las claves del
comportamiento de un organismo.
3.- el genoma de procariotas o eucariotas siempre cumple la misma funcin es un deposito explicativo de la
informacin, puesto que en el genoma esta toda la informacin de lo que somos.
4.- genoma de las clulas eucariotas y procariotas:
En las eucariotas tenemos genoma nuclear (cromatina que es un genoma nuclear) y extranuclear (se
encuentra en mitocondrias en clulas animales y mitocondrias y cloroplasto en clulas vegetales, este
genoma es circular)
En el caso de las bacterias tenemos un solo cromosoma, es circular y grande y se encuentra sumamente
enrollado, pero adems del genoma cromosmico, se encuentra el extra nuclear que se encuentra en forma
de plsmidos que es un DNA extranuclear que es circular y pequeo y tambin tiene informacin.
La informacin que se encuentra en la parte codificante es minoritaria.
5.-Que es un gen?
Antiguamente: es la unidad elemental hereditaria, es la regin funcional y fsica del ADN que controla una
caracterstica hereditaria concreta que controla una caracterstica: color de ojos, cabello etc.
Pero cul es la definicin molecular de gen:
Un gen es el conjunto de secuenciaos de ADN de todo tipo, estructura que est formada por intrones y
exones, y la regin reguladora necesarios para codificar un producto gnico ya se una protena o un RNA
ribosmico o de transferencia, va dar lugar a un RNA maduro de cualquier tipo o una protena funcional.
6.-gen.- conjunto de secuencias de todo tipo, estructurales formado por intrones, y exones, est formado por
una regin estructural y una reguladora. La regin estructural tiene intrones y exones.
Entonces el gen constituye la regin estructural que lleva la informacin, sino tambin su regin reguladora
que tambin es parte del gen.
Cuando hay un proceso de transcripcin, cuando a partir del DNA de la regin estructural se transcribe un
RNA por un proceso de transcripcin se transcribe solo la regin estructural no se va a transcribir la regin
reguladora y da lugar al RNA heterogneo nuclear que es RNA primario este RNA heterogneo nuclear va a
tener intrones y exones ,este madura y elimina a los intrones para dar lugar aL RNAm maduro , este proceso
de maduracin se lleva a cabo dentro del nucleo en eucariotas, una vez maduro sale al citoplasma para que
se lleve la traduccin dando como producto una protena.

Hay genes para cada tipo de RNA es por eso que los productos gnicos son los 2 : protena y RNAs.
7-es el genoma sencillo simple, est libre de protenas, es circular, y solo tiene origen de replicacin, como es
circular solamente va a tener un punto de donde va a partir la replicacin de otro ADN.
8.-El cromosoma bacteriano se encuentra super enrollado (enrollamiento negativo) es tan pequeo
que puede entrar en una clula pequea, el ADN de E.coli media 1mm y tiene que entrar en una clula
de 2 um y esto lo hace gracias al supe enrollamiento
9, 10,11.-el cromosoma bacteriano tiene ausencia de un complemento diploide de genes.
Tienen tendencia de presentar genes codificando funciones relacionadas agrupados en unidades
policistroniocas(es decir en forma de operones)
Los genes estn organizados en operones y al operon se lo conoce como unidad de transcripcin, la
transcripcin es polisistronica.
Pocos nucleotidos separan a los genes, puede haber superposicin de gens y tenemos unidades genticas
accesorias en forma de plsmidos.
Un solo origen de replicacin este se conoce como: Ori C
Tiene una regin de determinacin el cromosoma bacteriano es considerado un nico replicn porque va a
partir de un solo origen de replicacin, por eso se dice que se replica con un solo replicn.
Codifica productos gnicos (RNA y protenas)
Tiene secuencias de insercin y transposones. Que son elementos genticos mviles que tienen secuencias
que van a ir saltando de un lugar a otro, estos tienen que ver mucho con la resistencia a los antibiticos
Tenemos un Ori C que es un solo punto de replicacin, podemos ver que es circular y las posiciones de los
diferentes genes.
12.- los genes de los organismos procariotas estn en genes agrupados, para hablar de esto hay que hablar
de lo que es el operon, generalmente las bacterias se pueden presentar los operones, en las clulas
eucariotas no tenemos operones solo en las procariotas los genes de los organismos procariotas estn en
operones:
Un operon es un conjunto de genes con funciones relacionadas, regulados por mecanismos que involucran un
solo promotor, un operador y un terminador, o se va a tener una regin reguladora y varios genes para varias
protenas pero que van a estar regulados por una sola regin reguladora en el caso de las eucariotas no, es
para una protena una sola regin reguladora.
Operon= varios genes y una sola regin reguladora, que viene a ser la unidad de transcripcin de las
bacterias
13.- operon LAC est involucrado en el metabolismo de la lactosa, tenemos 3 genes el gen Z-regin
estructural, GAMA y A.
La regin Z codifica para la B- galactosidasa, la regin gamma para la permeasa y la A para la acetilasa,
estos 3 regulados por una sola regin reguladora.
Si una regin se transcribe se llama transcripcin polisistronica, porque est llevando la informacin para ms
de una protena.
Entonces tenemos un transcrito un RNA m que durante la traduccin este RNA m va dar lugar a la
galactosidasa, la permeasa y a la acetilasa. (Funciones relacionadas)
14.-para ver la ubicacin de los operones . Se ve el cromosoma de E.coli que tiene 4.7 millones de pares de
bases y 1mm de longitud se ve el operon lac= metabolismo de la lactosa, operon gal= metabolismo

galactosa, cys= metabolismo de la cistena, etc. Como son operones cada uno va a llevar la informacin de 3
o 4 proteinas.
15.- genes solapados o superpuestos.- esto se da solamente en proteinas a veces en algunos virus ,
procariotas la presencia de genes solapados: el ADN tiene 2 hebras una hebra que va de 5 a 3 y la otra que
va de 3 a 5, las dos hebras de ADN , una puede ser codificante en u n momento y la otra no codificante o al
revs ambas hebras pueden ser codificantes en diferentes momentos porque nunca se van transcribir ambas
hebras al mismo tiempo , este es un ejemplo de una hebra siempre va la lectura de 5 a 3 ,se tiene un gen en
una de las hebras (hebra codificante), la otra hebra en el otro sentido siempre va de 5 a 3 ahora la inferior
ser la codificante .
En el gen 1 la superior es codificante y en el gen 2 la inferior es la codificante este es un ejemplo de genes
no solapados porque estn separados, ahora cuando hay solapamiento de genes? Cuando una regin es
compartida,(ver figura) hay genes super puestos.
Si tengo genes solapados, ser que ambos genes se pueden transcribir simultneamente? No, se puede! Si
son solapantes no se puede
Hay otra forma de ser solapantes puede ser en hebras complementarias o el solapamiento se va a dar
tambin en la misma hebra.(super posicin de genes en la misma hebra)
El solapamiento se puede dar en hebras complementarias o en la misma hebra, esto se da en bacterias o en
virus no se da en procariotas.
.