Unidad I

OBJETIVO TERMINAL:
Analizar la dinmica y regulacin de las
rutas metablicas en un individuo sano.

Conceptos bsicos de termodinmica aplicada a los

sistemas biolgicos
Metabolismo
Ruta metablica
- Clasificacin segn su objetivo
Catablica
Anablica
Anfiblica

Energa libre de Gibbs

Conceptos bsicos de termodinmica aplicada a los

sistemas biolgicos

Metabolismo
(Del - gr. , cambio, e -ismo): conjunto de
reacciones qumicas que efectan constantemente las
clulas de los seres vivos con el fin de sintetizar
sustancias complejas a partir de otras ms simples,
o degradar aquellas para obtener estas

Metabolismo intermediario
Destino de los componentes de la dieta despus de la
digestin y absorcin
-

Se denomina metabolismo intermediario, debido a que el

metabolismo procede de modo escalonado a travs de
muchos intermediarios
-

Estudia:

Rutas metablicas

Relaciones entre estas

Mecanismos que las regulan

Ruta o va metablica
Secuencia de reacciones qumicas consecutivas
catalizadas enzimticamente y encaminadas a
alcanzar una
TRANSFORMACIN QUMICA ESPECFICA

E1

E2

E3
B

S: sustrato

P: producto

A y B: intermediarios

Ruta o va metablica

El P de una reaccin es el S de la siguiente

-

Son sistemas termodinmicos abiertos

-Hay reacciones prximas al equilibrio y alejadas
de ste

E1

E2

E3
B

S: sustrato
- P: producto
- A y B: intermediarios
-

Ruta o va metablica

TRANSFORMACIN QUMICA ESPECFICA:

Desdoblamiento de grandes molculas en otras

ms pequeas

Catablicos

Degradativos

Oxidacin

Sntesis de molculas mayores o ms complejas a partir

de las molculas ms pequeas
-

Anablicos

Sintticos

Reduccin

-Clasificacin de las de vas metablicas,

segn su objetivo:

Catablicas:
Vas de oxidacin

Producen

energa

Anablicas:
-

Vas de sntesis
-

Consumen

energa

Anfiblicas:
-

Vas mixtas (tienen ambas funciones)

Encrucijadas metablicas

Rutas anablicas y catablicas ocurren:

De manera paralela
Son reguladas de manera independiente y
Usualmente en compartimientos celulares diferentes

Conceptos bsicos de termodinmica

Energa libre de Gibbs:

-

Energa libre estndar

Energa libre estndar fisiolgica

-

Energa libre real

Energa libre real en condiciones fisiolgicas

Gibbs

Conceptos bsicos de termodinmica

Ciencia que estudia los cambios energticos que

acompaan los cambios fsicos y qumicos
Bioenergtica o termodinmica bioqumica:

Termodinmica:

Ciencia que estudia los cambios energticos que

acompaan a las reacciones bioqumicas

Permite explicar por qu unas reacciones pueden

producirse y otras no

Conceptos Importantes
1. Sistema:
-

Aquella parte o porcin

del universo bajo estudio
2. Frontera:

Separa el sistema de los

alrededores o del ambiente

3. Ambiente o alrededores:
-

El resto del universo.

FRONTERA
UNIVERSO
SISTEMA
AMBIENTE

Conceptos Importantes
4. Tipos de sistemas:
-

Sistema aislado:

Aquel sistema donde no existe intercambio de

masa, ni de calor entre el sistema y el ambiente a
travs de la frontera

Sistema cerrado:

Hay intercambio de calor (o energa), pero no de

masa

Sistema abierto:

Hay intercambio de masa y de calor (o energa)

Tipos de Sistemas

Conceptos Importantes
5. Estado: es la condicin de un sistema

Esta condicin se describe por un conjunto de propiedades

macroscpicas.

Estas propiedades, son necesarias para definir completamente

el sistema
-

Temperatura
-

Presin
n [moles]

Estado fsico

Conceptos Importantes
6. Funcin de estado (o variable de estado): son las propiedades
de un sistema que dependen nicamente del estado inicial y final
del sistema
-

El cambio en esa funcin de estado, X, est dado por:

X = X2 - X1

Siendo:

X1: estado inicial y

-

X2: estado final

Conceptos Importantes
Las funciones de estado son variables termodinmicas y son las
siguientes:
-

Entalpa: se define como el cambio calrico a presin

constante (calor liberado o absorbido)
Entropa: se define como una medida de desorden
molecular de un sistema

Energa interna: suma de la energa de translacin,

rotacin y vibracin de las molculas.
-

Energa libre: energa til para realizar trabajo

Leyes de la Termodinmica
Los sistemas biolgicos cumplen con las leyes
generales de la termodinmica

Primera Ley
Ley de Conservacin de la Energa

La energa no se puede crear ni destruir sino que solamente se

transforma
La energa del universo es constante (no se pierde ni se gana)
La energa total de un sistema ms la de su entorno permanece
constante
La energa puede ser transferida en forma de trabajo o en forma
de calor
Cuando un mol de sustancia A, se transforma en B, el cambio de
energa qumica es igual al calor producido (o consumido), ms el
trabajo realizado en (o por) la reaccin

Primera Ley
Ley de Conservacin de la Energa

ENTALPIA (H)
-

El cambio de entalpa para un proceso a presin constante,

se define como el calor liberado o absorbido por el
sistema en el proceso qumico
-

Calor producido (o absorbido) en una reaccin cuando no se

realiza trabajo en ella

H de una reaccin viene determinada por la siguiente

frmula: H= q - w

Donde:
-

q: calor

w: trabajo

Primera Ley
Ley de Conservacin de la Energa

ENTALPIA (H)
Si el sistema pierde calor:

H 0 (negativo) y

el proceso es exotrmico
X = X2 - X1 = 5-10 = -5
-

X2= 5 (H: estado final)

X1 = 10 (H: estado inicial)

Una reaccion exotrmica no necesariamente es espontnea

Primera Ley
Ley de Conservacin de la Energa
ENTALPIA (H)

Si el sistema gana calor:

H 0 (positivo) y

el proceso es endotrmico
X = X2 - X1 = 10-5 = 5
-

X2= 10 (H: estado final)

X1 = 5 (H: estado inicial)

Una reaccion exotrmica no necesariamente es espontnea

Segunda ley
de la
Termodinmica
Los cambios
fsicos y
qumicos
espontneos
tienen una
direccin que no
puede ser
explicada por la
primera ley de la
termodinmica

Segunda Ley

La segunda ley de la termodinmica identifica un factor que

explica procesos espontneos
Este factor se conoce como ENTROPA:

La ENTROPA (S) se define como una medida

de desorden molecular de un sistema

Segunda Ley

En un proceso espontneo la entropa del Universo aumenta

En equilibrio la entropa se mantiene constante

Para decidir si una reaccin es o no espontnea, hay que tomar en

consideracin el cambio en entropa total (Stotal)

Stotal = Ssistema + Sambiente

Donde:
-

Ssistema: cambio de entropa del sistema

Sambiente: cambio de entropa del ambiente

Segunda Ley

Los criterios de espontaneidad son:

Stotal > 0 espontneo (irreversible)

Stotal = 0 equilibrio (reversible)

Entropa como criterio de espontaneidad:

-

Es til en sistemas aislados

En sistemas que no estn aislados, no es til pues debemos

tomar en cuenta el cambio en entropa del sistema y del
ambiente.

Como la mayora de los sistemas de inters en qumica no estn

aislados, es difcil evaluar el cambio total en entropa

de manera prctica, NO se podr usar la entropa

como criterio de espontaneidad

Surge entonces una nueva propiedad termodinmica que combina la

1era y la 2da ley de la termodinmica:

Energa Libre de Gibbs, (G)

Energa Libre de Gibbs

Energa libre de Gibbs

Es una funcin de estado

En la que se combina:
la entropa

la entalpa y

tiene las mismas unidades que estas

Se utiliza para predecir si una reaccin es espontnea

o est en equilibrio
-

Est definida como : G = H -TS

ENERGA LIBRE DE GIBBS

G = H TS
G: variacin de energa (se expresa en caloras)
H: variacin de entalpa (se expresa en caloras)

T: temperatura absoluta (25C o

298K)
-

S: variacin de entropa (se expresa en caloras/K)

ENERGA LIBRE DE GIBBS

El cambio de energa libre (G):

-

Es la porcin del cambio de energa interna, de un sistema

que est disponible para realizar trabajo.

Es la fraccin de la variacin total de energa que es capaz

de efectuar trabajo a medida que el sistema tiende al
equilibrio a temperatura, presin y volumen constantes.
-

Es la energa til tambin conocida en los sistemas

qumicos como potencial qumico.

Energa Libre de Gibbs

H
H = G + TS
G = H - TS

Si G para una reaccin a T y P constante es:

Negativa:la reaccin puede ocurrir espontneamente con

prdida de energa libre y es llamada EXERGNICA

G < 0

Si adems es de gran magnitud la reaccin es

esencialmente irreversible

Positiva: la reaccin no ocurre espontneamente, solo se

realizar si gana energa y es llamada ENDERGNICA
-

G > 0

Es cero: la reaccin est en equilibrio y ningn cambio neto

tiene lugar y es reversible. Una vez alcanzado el equilibrio,
no hay energa disponible para realizar trabajo.

G = 0

Reaccin
exergnica

G = G productos - G reactivos 0

Reaccin
endergnica

G = G productos - G reactivos 0

ENERGA LIBRE DE GIBBS

Los sistemas vivientes se encuentran alejados del equilibrio
para poder realizar trabajo

Cuanto ms alejado est el sistema del equilibrio, ms

trabajo podr realizar

Los seres vivos mantienen los procesos permanentemente,

alejados del equilibrio, en lo que se conoce como el estado
estacionario

Equilibrio

Conceptos bsicos de termodinmica

Energa libre de Gibbs:

-

Energa libre estndar

Energa libre estndar fisiolgica

Energa libre real

Energa libre real en condiciones fisiolgicas

Energa libre estndar (G)

Esta es una constante cuyo valor es caracterstico para una

reaccin qumica determinada
Constituye una medida del descenso de energa libre de la
reaccin, cuando se permite que tenga lugar en condiciones
estndar, es decir cuando la concentracin de sustratos y
productos es 1 M

Estas condiciones estndar se definen :

-

concentracin 1M

298K (25 C)

1 atm de presin

Si hay protones en la reaccin, el pH= 0

Energa libre estndar fisiolgica (G')

Todas las concentraciones son 1 M, exceptuando la
concentracin de protones, que se establece como [H +]= 10

-7

Si en la reaccin considerada no intervienen los protones,

entonces G = G'

Energa libre en condiciones no estandar (G real)

Es la suma de dos trminos:

Concentracin de reactivos y productos al inicio de la reaccin

G es funcin del G y de las

concentraciones de reactivos y productos

Energa libre real en condiciones fisiolgicas

(en condiciones no estandar)

Es la suma de dos trminos:

Concentracin de reactivos y productos al inicio de la reaccin

Sin embargo, en las condiciones celulares, las [S] y de [P],

permanecen practicamente constantes

Como pueden medirse las variaciones de energa libre (G)

La reaccin dada puede transcurrir hasta el equilibrio.

En el equilibrio G real= 0 y el sistema ya no es capaz de realizar trabajo

Como pueden medirse las variaciones de energa libre (G)

Keq =

concentracin de reactivos y
productos en el equilibrio

Cuando G real = 0, la variacin de energa

libre depende de la concentracin de reactivos
y productos en el equilibrio

Como pueden medirse las variaciones de energa

libre (G)

Variacin de Energa libre estndar (G)

-

Se puede calcular a partir de la constante de

equilibrio:

G= - R.T. ln Keq o tambin

G= - 2,303.R.T. log Keq

Donde:

Constante de los gases R= 1,987 cal.mol-1.K-1

-

Temperatura absoluta T= 298 K o 25 C

Ln Keq = logaritmo neperiano de la constante de

equilibrio
-

Se expresa en caloras/mol

Como se logran los procesos endergnicos????

Si en la clula la manipulacin de concentraciones es limitada,

entonces como se logran los procesos endergnicos????
-

Se logran por acoplamiento a procesos exergnicos

-

Procesos que liberan energa se usan para llevar a cabo

procesos que requieren energa
-

El cambio neto es exergnico

Acoplamiento de reacciones
Glicerol-3-P + H2O
ATP

Glicerol + Pi

Glicerol + Pi
ADP + Pi

Glicerol-3-P + H2O

G1 = - 2,2 kcal/mol
G2 = - 7,3 kcal/mol

G1 = + 2,2 kcal/mol

Acoplamiento de reacciones
Glicerol + Pi
ATP
Glicerol + ATP

Glicerol-3-P + H2O
ADP + Pi

G1 = + 2,2 kcal/mol
G2 = - 7,3 kcal/mol

Glicerol-3-P + ADP

G = G1 + G2
G = + 2,2 Kcal/mol + (- 7,3 Kcal/mol)
G = + 2,2 Kcal/mol - 7,3 Kcal/mol)
G = - 5,1 Kcal/mol

Acoplamiento de reacciones
Eficiencia del acoplamiento
Glicerol + ATP

Glicerol-3-P + ADP

G = - 5,1 Kcal/mol de la reaccin acoplada

Energa utilizada = 2,2 Kcal/mol
Energa disponible = 7,3 Kcal/mol
7,3 Kcal/mol

100%

2,2 Kcal/mol

X
X=30,14%

Importancia de las concentraciones para las

reacciones qumicas biolgicas
ATP + H2O
CREATINA + ATP

ADP + Pi

G = -7,3 Kcal/mol

CREATIN FOSFATO + ADP

G = + 12 Kcal/mol

Esta reaccin es endergnica y no espontnea en condiciones estndar, pero

debido a que en condiciones reales las concentraciones intramitocondriales
de ATP son muy altas y las de creatina fosfato son relativamente bajas, la
reaccin en condiciones biolgicas ocurre hacia la derecha.

La concentracin intracelular de los metabolitos tiene un

efecto drstico en la energa libre de una reaccin.
reaccin

Conceptos bsicos de termodinmica aplicada a los

sistemas biolgicos

Estado de equilibrio vs estado estacionario

Reacciones reversibles vs reacciones irreversibles

Reacciones cercanas al equilibrio vs reacciones alejadas

del equilibrio

Ruta metablica
-

Secuencia de reacciones qumicas consecutivas

catalizadas enzimticamente
-

El P de una reaccin es el S de la siguiente

-

Son sistemas termodinmidos abiertos

Hay reacciones prximas al equilibrio y alejadas de

este

E1
S

E2
A

E3
B

Estado de equilibrio

El equilibrio qumico es un estado del sistema en el que

no se observan cambios a medida que transcurre el
tiempo

La velocidad de la reaccin directa es igual a la

velocidad de la reaccin inversa

Reaccin directa

B
Reaccin inversa

Estado de equilibrio
Las reacciones qumicas pueden alcanzar un
estado de equilibrio que se caracteriza porque
las concentraciones de los reactivos y de los
productos permanecen inalteradas a lo largo del
tiempo.

No hay interconversin neta entre los reactivos

Estos sistemas no pueden realizar trabajo til

(G = 0)
GAME
OVER

Estado estacionario

Se dice que un sistema fsico est en estado

estacionario cuando las caractersticas del
mismo no varan con el tiempo, pero se
encuentran alejadas del equilibrio

VIDA

La velocidad de transformacin de S a P es
constante

Para efectos del organismo como un todo, la

composicin del medio interno permanece
constante. Esto corresponde a la definicin
de HOMEOSTASIS

aA + bB

cC + dD

Reacciones reversibles
Una reaccin reversible es
una reaccin qumica que
se efecta en ambos
sentidos es decir los
productos reaccionan
entre s y regeneran a los
reactivos

G 0

aA + bB

cC + dD

Reacciones irreversibles
Una reaccin irreversible
es una reaccin qumica
que se verifica en un
solo sentido, es decir,
se prolonga hasta agotar
por lo menos una
de las sustancias
reaccionantes
-

<<<

Espontneos

 Reacciones cercanas al
equilibrio
G 0

Velocidad de las reacciones directa e inversa similares y

muy superiores al flujo global de la va

Permiten fcil inversin de la va

Dependen de la relacin entre [S] y [P], es decir

pequeos cambios en la concentracin de estos,
modifican el flujo

NO regulan las vas metablicas

EQUILIBRIO

 Reacciones alejadas del

equilibrio
G 0 (muy alto y negativo)

Velocidad de reaccin directa mucho mayor que la de la

reaccin inversa (mas de 10 3 veces)

Determinan la direccionalidad de la va

No dependen de la relacin entre [S] y [P]

REGULAN las vas metablicas

EQUILIBRIO

Elige un trabajo que

te guste y no tendrs
que trabajar ni un da
de tu vida.
Confucio (551 AC-478 AC) Filsofo chino